5ID2B

Asymmetry in the active site of mycobacterium tuberculosis ahpe upon exposure to mycothiol
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
HPMVMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Redox chemistry of Mycobacterium tuberculosis alkylhydroperoxide reductase E (AhpE): Structural and mechanistic insight into a mycoredoxin-1 independent reductive pathway of AhpE via mycothiol
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis h37rv
molecule keywords Putative peroxiredoxin Rv2238c
total genus 54
structure length 157
sequence length 157
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5id2B00
3C1SA 4K7IA 1ZCPA 5HFKA 2H30A 4N30A 3E3EA 3KZQA 5E4WA 5AISA 4ECIA 1MDIA 1O73A 4WXTA 4GWRA 1K3OA 3O3TA 6GSWA 3TRQA 1JLVA 4L8EA 4KAEA 4K7OA 2HSHA 1GSFA 4IHUA 4K8MA 4XIHA 2FGXA 5KN2A 3LSZA 5D8IA 3C7MA 2CT6A 5D9VA 1WIKA 4LL4B 5ECPB 5J3RA 4N10A 5HR1A 3O76A 4GF0A 2VLTA 3I9V2 5IPGA 2YWNA 4BVYA 3FZ4A 4F0CA 3TRXA 1M2AA 1EOHA 5IQYA 1O6JA 2V2GA 1T8EB 2VL2A 3QOUA 5IMZA 4OMVA 5GSTA 4H86A 1C72A 2K6VA 1NM3A 3L4NA 3GH9A 4ZL7A 1AW9A 1JZOA 2DC5A 2VCXA 2ES7A 3RAZA 1K0MA 2B7JA 5DJMA 1B8XA 2PERA 4CDOA 1M0UA 4EL1A 1U6TA 4CHSA 5CRDA 2FHEA 1JZWA 3P90A 2LSTA 4IBPA 3EU4A 2A4VA 4IJIA 5CRGA 3N5OA 1OKDA 1XIYA 4ZB6A 5F8BA 3J7Yb 2GDRA 1GTIA 2CVKA 2K8SA 4WEYA 4ZB8A 5ECNB 1BYEA 2VCWA 4KNDA 2HI7A 5B6NA 4POLA 3RDWA 5IMFA 2GZPA 2VM1A 1I9DA 1KBNA 3IOSA 3L78A 5IMDA 3PR8A 2H6XA 4TVEA 1X5EA 1TRUA 2RIIA 2WDUA 3PH9A 3ZIJA 3KEBA 5ECMB 2GSRA 2NTOA 4XS4B 2KLXA 1GSUA 2CX3A 3KCMA 1PMTA 4E8EA 3TDGA 3R2QA 4Q5RA 2L6DA 1X0RA 3KGKA 3ED3A 1YKAA 4KUNA 4F82A 4OWYA 5E59A 2H0IA 5DQYA 2MMOA 3VFIA 1DBYA 4TXOA 2MMNA 4NHZA 4P3YB 5ECHB 4KW6A 1OC8A 1TK8B 1MEKA 2IIYA 1A0FA 1OE7A 1TRWA 4OCEA 1DE2A 5AIVA 4IGJA 5G5FA 1UVZA 2TIRA 1TK0B 4ZBAA 1ZMAA 1BJXA 3BJ5A 3HA9A 2DJ3A 4LA1A 2B5YA 3VK9A 3AY8A 3VWWA 3DIEA 4IP1A 1XFLA 3WD6A 4TR1A 2HFDA 4ZIJA 2R2JA 4JBBA 3IHQA 1XCCA 4DSQA 1WPIA 4GSTA 4IW9A 3FZAA 3I69A 3UARA 3D4MA 2B6MA 5KN0A 5B8BA 6GSUA 3ME7A 4K9ZA 5A4VA 3CYNA 1Z5YE 3GIXA 2F9SA 2I81A 2DJ0A 3HVSA 2PBJA 1Z7PA 3WYWA 1A0RP 2FA8A 5DAKA 2B5EA 2NPBA 5F07A 2LJAA 5AIXA 4KSMA 5HR2A 5LD0A 3TB2A 2VOCA 1YEPA 1FHEA 2H75A 2HT9A 4GQCA 1X9SB 2CZ3A 3US3A 5HR0A 3F63A 1V57A 4K1FA 3ZL5A 4TXOB 1XXUA 1PX7A 1O8WA 4KA0A 5CAXA 3ERFA 2JSZA 3GV1A 2JZSA 4IQAA 2YNXA 3UAPA 3DRNA 2GT6A 2I9HA 4K2DA 19GSA 2EIQA 5ECLB 2E2GA 1TTZA 2PMTA 4FYUA 5KN1A 3GL5A 5L71A 3TGZA 1J08A 5DVBA 1XW6A 4TR1B 1VGLA 1A2LA 2LEGA 4BL7A 4CW9A 3BD2A 3ZIVA 1GSDA 2E7PA 2B1LA 4WR4A 2C3QA 3TKSA 1HNCA 1JZRA 4V2LA 22GSA 2C3TA 4JR4A 1W89A 1XWBA 3FR9A 4MK3A 1PL1A 1G6WA 4TN8A 3FZ9A 1SJ6A 2C0FA 5B6MA 2PVQA 5DAKB 2N5BA 1TOFA 1XWCA 2LUSA 3NZNA 2H1DA 2DSAA 1G6YA 1Q4JA 4F0BA 1WMJA 1E2YA 4D73A 2YV9A 1DUGA 3KP9A 1I5GA 4TXVA 3PGTA 2H73A 3MSZA 4X43A 4FH8A 4MJAA 4KDYA 1OC9A 3KH7A 3EU3A 4TW5A 4L0WA 4G19A 1Z6MA 1SL1B 1SK1A 1F2EA 5INYA 1TW9A 2L6CA 2YWIA 4GQFA 2L57A 2VCZA 4Z7XA 3P8WA 4MJBA 2CQ9A 1H75A 2GQMA 3QD9A 3KD0A 5AN1A 2RM6A 5IMAA 3IA1A 2YJ7A 4OFTA 4KCAA 2WS2A 1FB6A 5G30A 4WKWA 2WCIA 4BWQA 3Q74A 4HQZA 1ML6A 2P0GA 1KTEA 4V2MA 2ON7A 1O85A 3TUEA 1AIUA 4ULXA 2L5OA 4NV5A 1ZZYA 3D6IA 4KSOA 1FAAA 2HE3A 4FO5A 4NV2A 3VI7A 2HLSA 3WGXA 5D9XA 1EGRA 2JU5A 3I43A 4GCIA 3IAS2 1Q98A 4IELA 5ENUA 4D73B 3CRTA 1BEDA 2IMEA 3KMNA 3QFBC 5CNWA 1THXA 2C1YA 2H6YA 4WR5A 5KEJA 4IN0A 4ML6A 2OE0A 2OJLA 2QSIA 2F51A 5D9WA 1FO5A 1QFNA 2PU9C 4MMMA 4TRXA 1T3BA 3HVVA 2DJ2A 2VM2A 2AAWA 3G9BA 4EDYA 1Z6NA 1WE0A 4DVCA 4I2TA 2V6OA 2LRTA 3DWVA 4LLRA 3BCIA 5ECQB 3EMXA 1MDJA 5IMCA 3ZMLA 4LMVA 4RI6A 1PD21 1ZGNA 4XHMA 3LG6A 2R6KA 1SK2A 3VWVA 4MZWA 2B5XA 2H0HA 2YZUA 2OBIA 3BOAA 3CSJA 3E0UA 4WBRD 2HRNA 4ZB9A 3JCML 5J4UA 1V58A 1A2JA 2K8VA 3A2XA 2WULA 5DCGA 2HXKA 2P5RA 5JWOB 1HYUA 3M9KA 5J41A 1V40A 4MJEA 4WETA 2AJQB 4KDUA 2WRTA 2YJHA 5FT3A 4MPGA 2X64A 1URMA 4Q5NA 4ZL8A 1F3BA 2BMXA 14GSA 2GLRA 2C80A 5DALB 2DJ1A 1B9XC 1R7HA 2LJKA 3L0HA 3VI5A 4ECCA 4MH2A 1QQ2A 1LJRA 4GRFA 4XS4A 1ERWA 2F8AA 3QFAC 4RQRA 4PNFA 4LMWA 4EO3A 5A4WA 1PKZA 3GSTA 4NAXA 2NVLA 4KGIA 3W8SA 4E8HA 2LTKA 1PX6A 2GGTA 3H4KA 2FUG2 2DLXA 1A2MA 4POBA 3J7Yk 1GUHA 3H8QA 1B4QA 1K3LA 4I8BA 1K0OA 1GP1A 4WF4A 3VWUA 2VAFA 4OFNA 5C00A 1TDIA 4YH2A 4BPYA 4MF6A 3MDKA 3GTUB 3KTBA 1SENA 1SJIA 2FY6A 3GNJA 3TKPA 4F9ZA 5JWRB 2E0QA 8GSSA 4GSNA 2H74A 2YPMA 3M8NA 2DBCA 2IPAA 3KM6A 1WP0A 3M0FA 1AC1A 4G2EA 1V2AA 3TKQA 2LQOA 1TRSA 5ID2B 3ZREA 2GSQA 5CP1A 2H1GA 1OKTA 1T00A 1WJKA 1PRXA 1LU4A 2CV4A 1TU7A 2KP1A 2VO4A 2JSYA 1RK4A 2WB9A 1GSEA 2L59A 3QAWA 3ZFLA 2WGRA 1SD9A 1GUMA 1SK0A 3DMLA 4RI7A 5FHIA 4HJ2A 4MCUA 2FWHA 3GFKA 3EVIA 1A8LA 4F03A 3ERGA 2YWOA 4BWSA 2AYTA 3HD5A 1K0AA 3KTLA 2J9HA 1RQMA 5IO0A 2VLVA 3FHKA 1ERVA 2MZCA 2AB6A 3O6TA 4NXIA 3DEXA 2LQQA 1WRYA 2X8CA 4J56E 1H4OA 1WWJA 4MDCA 5IO2A 2CAIA 2RUFA 3DVXA 4IP6A 2GQKA 4X0XA 2GZZA 3OR5A 2K9FA 4OD7A 3EINA 1FVKA 4V2NA 1SD8A 4GTUA 4HZ2A 1Y6EA 3IK9A 2H70A 4K7NA 1K0DA 1QUWA 7GSSA 4JR6A 4XS1A 3LXTA 4NPBA 4PGTA 4DSRA 4BA7A 3RPNA 3HJOA 1K0BA 4ACSA 4MZCA 4AJ7A 1Z7RA 1XWKA 2IJYA 2XHFA 3M9JA 4YAVA 3IV4A 4WF5A 4EUYA 4KH7A 2HYXA 5HQPA 2E2MA 2OKAA 5A5KA 3Q19A 5HFIA 12GSA 2O89A 3ZITA 2JADA 1AQVA 1TJDA 2C0EA 4IS0A 4K0NA 4TR3A 1JZDA 4JRRA 2XBIA 3U5RE 1KEBA 1LBKA 2ZNMA 3FW2A 2LNTA 1EP8A 2OE3A 2CZ2A 4XS6A 3RBTA 3GN3A 2B1KA 4POKA 1NW2A 2IWTA 3QAVA 1ZYEA 3BBYA 5G5EA 2X99A 2AUVA 4OFMA 2EC4A 3I6AA 2FLSA 3TRPA 3GA4A 4LL1B 4ML1A 1M9AA 1ERUA 1M7TA 1XOBA 3H79A 2OACA 6GSTA 4DSSB 2IMIA 1GH2A 1XWAA 2QKEA 6GSYA 1R26A 4KDXA 2AV4A 1MDKA 1HQOA 1ZYQB 5ECRB 3NIVA 1PN9A 1HD2A 1A23A 2HSYA 1ON4A 2QGVA 1E6BA 5GZZB 3CBUA 4MF7A 1CQHA 4XRAA 4ZBDA 1EEMA 2C8UA 2R37A 1U88A 2DIZA 4NWYA 3C1RA 1NHYA 3IPZA 3TJFA 1EWXA 5D93A 3ISOA 1K3YA 3TJGA 3HZ4A 1Z3EA 2PN8A 2RUEA 1YJ6A 5IMVA 3V1WA 3HKRA 3U6VA 3HHVA 3D0ZA 2DMLA 3KP8A 2H1AA 3KXOA 2H1BA 4GXZA 4TR0A 1X5DA 1YEXA 2NBSA 2A2SA 1GWCA 2BTOT 1GLQA 3TKSE 3QR6A 4MA9A 2KUCA 1OAZA 1TXXA 4I2UA 2D2ZA 1B4PA 5F0GA 4TR4A 4ZILA 3ME8A 1YF0A 1RW1A 1Z9HA 5C04A 3G7YA 2N5AA 3CTGA 4HU7A 2YCDA 3DYRA 3TJKA 1F3AA 3TCOA 3GMFA 2LRNA 1N2AA 2L5LA 5G1KA 4ECJA 11GSA 2H0GA 5EY6A 4ZXGA 1PGTA 1FG4A 2YOIA 1SL2B 3GX8A 2XBQA 16GSA 1YDKA 1FB0A 2H72A 3KIJA 4JE1A 3C8EA 1EOGA 2HZEA 3F9UA 4EVMA 3L9SA 4HI7A 5JWQB 2QC7A 5H5RA 1EZKA 3IRAA 3DKSA 2CVBA 3LORA 17GSA 5GAPD 2XC2A 1X5CA 2JACA 3F3QA 1GULA 4J57E 3HCZA 2I1UA 3F3RA 3N9JA 2FD3A 5FWGA 5F05A 4AJ6A 3P2AA 3IE3A 3HYPA 5LCZA 1SL0B 3WT2A 2V41A 3ZLPA 2FWGA 1G7EA 2KHPA 4NMUA 1S3CA 3QDNA 3FR3A 3ZTLA 1OE8A 3EYTA 1K0NA 1YF1A 3S9FA 2VCVA 1TI3A 3VPQA 2RM5A 3F4SA 1GTAA 2P5QA 1EV9A 3VURA 3D21A 1BQ7A 3EMPA 4K6XA 3FEUA 5DALA 1EV4A 5DQSA 1KNGA 5EPFA 3ZVJD 2OA7A 2Z9SA 2I3YA 5CREA 6GSXA 1GNWA 4OCFA 4HDEA 5IOWA 2GT5A 1TK5B 1V98A 1NHOA 3VWXA 4HOJA 1VF2A 4K0GA 2X8HA 4JZQA 1WOUA 3UBKA 3KH9A 2I4AA 1GTBA 5CYYA 1X9WB 1T1VA 4OO4A 3VLNA 2HZEB 3HZ8A 4HQSA 2LRCA 2LV3A 1OVNA 2VCTA 4O5RA 4PQHA 2X8GA 3TOTA 1XZOA 2NDOA 3GTUA 4ECBA 1AUCA 1TI1A 4IQ1A 5ELAA 2FWFA 2OADA 1SYRA 2IL3A 20GSA 2EIRA 3WGDA 3TJBA 2GVPA 2M80A 1M99A 1GTUA 1Y25A 3FYGA 2YP6A 3FRCA 1M9BA 1F9MA 3CSHA 2DJKA 5ID2A 3BCKA 2MBTA 2IFQB 3G7IA 2O7KA 1YZXA 4NHWA 2TRXA 5GAND 1T4ZA 1XPVA 5JCGA 3GURA 4O92A 3W6GA 3ERWA 2FA4A 3ZRDA 4I6XA 1N8JA 1OYJA 5AGYA 3L9VA 2GZYA 3EC3A 1X9MB 1VF1A 1XVWA 3IXRA 2IMKA 3TOUA 2DJJA 2OE1A 2R5GA 1O8XA 1R5AA 3L9UA 2G0FA 1EGOA 4POMA 2R3XA 1IYIA 1U3IA 2LS5A 3WGEA 1AAZA 5J9BA 1ABAA 2GS3A 1XBSA 3UOMA 5H5SA 5HR3A 1GL8A 4HUAA 1MTCA 4ZBBA 1XW9A 1SKSB 4KX4A 3GH6A 1MD3A 2V32A 1O81A 2KOKA 3APSA 3PINA 4EC0A 3A2WA 2CAQA 3M1GA 5D96A 3LQ7A 1TU8A 4MH3A 4YQUA 2PVOC 1THOA 3HY2A 2G2QA 1B48A 1UN2A 1O7UA 2C0GA 3H1NA 2VIMA 3C73A 3H93A 4I97A 1VF4A 4AF2A 4XTSA 3SWLA 3CTFA 4N0ZA 1ACVA 3F0IA 2CX4A 5D9TA 2FNOA 3CMIA 4L0UA 3D4TA 4JU5A 1S3DA 3F4RA 3CXGA 1GUKA 3M3MA 4PNGA 5DCHA 1XWGA 3GKXA 2CVDA 4EE0A 2VUPA 1GSYA 6GSSA 5GSSA 2H66A 2H8LA 2V1MA 4PUFC 3EURA 10GSA 1ILOA 1AXDA 4EKZA 3GUSA 1TKDB 2VCQA 1FOVA 4MPFA 4DSSA 3DGQA 4FYBA 4KCEA 4G9HA 4EDZA 2JZRA 2M46A 3IAM2 3LJRA 4HZ4A 4TOPA 1FW1A 2YZHA 5CRHA 1ST9A 3GX0A 2TRCP 3KJYA 2O87A 3NOFA 3A3TA 3IBHA 3EE2A 4L5LA 1SYXA 4WBJA 1PSQA 5ECIB 4KB3A 4EF0A 5KN3A 5G31A 3FY7A 2C0DA 3FK8A 4GLTA 3MNGA 3EWLA 2C3NA 2LKUA 3QCPA 1T4YA 4V1Ag 2JL4A 3F6FA 5EL8A 1GSQA 1G7OA 3HXSA 2HNLA 1TP9A 3HJMA 18GSA 3P7XA 5JCWA 2MMZA 5HFGA 2GTUA 2MYGA 1XW5A 1B9YC 2ALBA 4GSSA 5CO3A 1T7PB 4QQ7A 2AHEA 3LFLA 2V6KA 4I5QA 4G10A 9GSSA 5DBQA 3DXBA 1GSSA 2CA8A 5ECKB 1K0CA 2L4QA 2H19A 4IJ3A 2ZUPA 2N5FA 3IK7A 4OO5A 4ZL9A 4MP4A 3IC4A 1DE1A 2B7KA 2XPEA 2EIOA 2PWJA 3ZZXA 4PURA 4MJCA 2L4CA 3LYKA 1M2DA 3FKFA 3GL3A 5IM9A 1U3AA 3HVXA 2VD0A 3MWHA 4MZBA 4KE3A 4RQXA 2VL2C 4QL7A 3D5JA 3DD3A 1ERTA 4JEDA 1A24A 2GQLA 4N11A 2LJRA 1PQNA 3TJJA 3FZ5A 1QMVA 3KMOA 1J9BA 5B7CA 4O7HA 4L5OA 5COHA 4YQMA 6GSVA 2K18A 2RLIA 3APOA 1YQ1A 4V1Ap 1EP7A 4Q5QA 2R4VA 1XVQA 2A2RA 3D22A 3SBCA 3K8NA 5G2ZA 4MABA 2H01A 5ECSA 3HDCA 5IOXA 3W8JA 1GNEA 2P31A 1AQWA 3GKNA 1SKRB 5LNKe 4HEA2 2VD1A 4PXOA 1XOAA 2F8FA 4X1UA 1NSWA 4XRDA 1V9WA 1VF3A 3ZVJA 2GSSA 2C4JA 3FR6A 2DMMA 2YV7A 1SJZA 2MBSA 3DVWA 5IIZA 1CQGA 3LXZA 5G1LA 2ON5A 2F3MA 3UVTA 1HNBA 3F8UA 3TKRA 1SKWB 2M72A 4PX1A 3E9JB 1R4WA 1A8YA 1F6MC 1J0FA 1GLPA 1U87A 1QGVA 2WJUA 2PPTA 4HU9A 5JCUA 3LEFA 1IYHA 4PUAA 1SU9A 5B8AA 1USBA 1GRXA 1S3AA 3F6DA 1UA5A 4MF5A 2H76A 4DEJA 5H5QA 4Q5FA 3QMXA 5IPHA 2IN3A 4ILFA 4PQIA 2HRFA 2O85A 2DIYA 5ECOB 4J2FA 2BJXA 1HNAA 2J23A 5A4UA 4AGSA 1AQXA 2H71A 13GSA 4QL9A 1EEJA 1G0TA 3LYPA 2KP2A 2IFQA 1W4VA 4FYCA 3CSIA 4IKHA 1FVJA 3IR4A 5J5NA 4O32A 5EVOA 1UC7A 4FIWA 2PGTA 3UEMA 1BX9A 2YWMA 2XPDA 3MAKA 4MLYA 2OBKA 1BAYA 2H6ZA 4YAPA 3ZFBA 3IDVA 5F06A 2VLUA 2HZFA 5CRWA 2MMAA 1JFUA 4IVFA 2IMDA 1PA3A 4PQ1A 1OC3A 2IMFA 4ISDA 3APQA 1YKCA 3ZYWA 1TRVA 2GSTA 2VL3A 4RUVA 1JHBA 5ABRA 1OC9B 5ELGA 3WT1A 3UVHA 3F4TA 5DJLA 3ZMKA 3QPMA 3G7JA 3HJPA 3A5WA 4F2IA 5D73A 3VPTA 2O8VB 4ID0A 4AJ8A 1BG5A 2FWEA 3A2VA 4YQVA 2LNSA 3GRXA 2YN1A 2REMA 1QK8A 3GHAA 2ZCTA 5DDLA 2WFCA 1ZOFA 3RHBA 3UMAA 2FCHA 1M2BA 3LGCA 4N0VA 3LWAA 3GSSA 3CRUA 1MD4A 2JZTA 2YANA 3Q18A 4TKYA 1JLWA 3GKKA 4BVXA 1VRSD 3Q6OA 3UL3A 4HS1A 2PUKC 2B3SA 3C71A 3QAGA 1QXHA 5J9CA 3UJ1A 1DSBA 2WZ9A 1PL2A 2VL9A 3GKMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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