5IM9A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 49
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5im9A00
3VWWA 2LRTA 4PXOA 2HRNA 2C3NA 1SU9A 2OKAA 3EC3A 2VO4A 2HYXA 1PL2A 4MZCA 1R26A 5DCGA 2AUVA 2K9FA 2GGTA 4JBBA 1GSSA 4KCEA 1TRSA 1XBSA 3LGCA 1UVZA 2OA7A 3EINA 1QQ2A 2DJKA 4EO3A 1GTUA 1O6JA 1U6TA 2VD0A 5ENUA 3CSIA 4MK3A 5L71A 2HT9A 2N5AA 3DXBA 5J3RA 3TRQA 2XC2A 4Q5RA 3CTGA 2NBSA 4RQRA 4V1Ag 3GMFA 4NPBA 1R4WA 3TRXA 4ZILA 2GQMA 1OAZA 3HJMA 1I5GA 4BA7A 2CAQA 2AJQB 3IK7A 3U6VA 17GSA 3P90A 3ME7A 4TR1B 2HLSA 3D4TA 1UA5A 4WF5A 3FR6A 2LQQA 3HXSA 1X9SB 1BYEA 4KB3A 3PH9A 1XW9A 1GTAA 1PN9A 5AIXA 1AC1A 4L5OA 4QL9A 4ISDA 5J41A 4XTSA 4IBPA 5A4WA 4DSSB 1SYXA 3KMNA 2PBJA 5D93A 4LMVA 4DVCA 2VL2C 1SKRB 3C7MA 3DD3A 1AW9A 3PGTA 1A0RP 2HSYA 1BJXA 2LQOA 4RI7A 3MSZA 4TR1A 1NSWA 5KEJA 1AXDA 4RUVA 2GLRA 3GKMA 4MH3A 2RIIA 3F3RA 4V1Ap 1AQXA 4MF5A 1X9MB 4OMVA 4KUNA 5FHIA 2DIZA 4K7NA 2C8UA 3C1RA 2NDOA 1YDKA 2H70A 1EZKA 2L6DA 3F8UA 1C72A 5ECLB 4PQIA 3EYTA 1TOFA 5AISA 2GT5A 2LSTA 3TRPA 3I43A 4WXTA 2H76A 5JCWA 2FWFA 3A2VA 1AIUA 1ZMAA 1X0RA 1FW1A 4O32A 5A5KA 3H1NA 1EP8A 5IO2A 4IHUA 2L5LA 2R4VA 4IS0A 2FY6A 3KM6A 3MNGA 2EIQA 1FO5A 3N5OA 3HKRA 4MJBA 4KH7A 4V2LA 2FGXA 4I8BA 2B5XA 3L9UA 1HNCA 1XWCA 3CRUA 1E2YA 3ZIVA 1K0BA 1KTEA 3QFAC 4ZB9A 5IMCA 3GH6A 1W89A 2I3YA 4FO5A 4XCSA 5B7CA 3DGQA 3LYKA 3LXTA 3APQA 1T4ZA 2B7JA 5B6MA 1MEKA 1XVQA 1TW9A 1VRSD 4DEJA 1TKDB 2VLTA 4LL1B 5D8IA 2F8FA 3KCMA 4LA1A 3LWAA 1U87A 5D9VA 3CRTA 2C3TA 1R7HA 2MMZA 1T00A 3J7Yk 2F9SA 4K0GA 4GF0A 1VF2A 2LUSA 4IP6A 3A5WA 3I6AA 3W8SA 3GH9A 2CX4A 5KN3A 1K0DA 1W4VA 1KBNA 1K3YA 1AQVA 3CYNA 4TR3A 4V2NA 3GV1A 1M2DA 5IMAA 2DIYA 4I2TA 5GAPD 2L57A 2E7PA 5F8BA 4ECCA 1ERVA 2LNTA 4G10A 4F0CA 3F3QA 4WBRD 5GAND 3W8JA 5B8AA 2LS5A 2VCWA 4WR5A 3BD2A 4YQMA 3HVVA 4G19A 4XHMA 1A2JA 3F4SA 3MDKA 2YNXA 3F4RA 3CSHA 2QGVA 2I1UA 2J23A 4OD7A 3Q74A 3VPQA 1ILOA 3G7JA 4WETA 4WR4A 3PINA 4MJCA 2HSHA 4JR4A 2GQKA 4GRFA 1JZOA 3CTFA 2H75A 1GSYA 4IKHA 1B4QA 2K8VA 6GSYA 1YKCA 1ZCPA 1K0AA 1WIKA 2H19A 3QPMA 3EVIA 3GKKA 4OFTA 2HE3A 1TDIA 2DJ3A 1Z6MA 3P2AA 3RDWA 3DKSA 5HFIA 4F9ZA 3APSA 5H5SA 5JWQB 1J0FA 4HUAA 4JE1A 4H86A 3GHAA 3HY2A 2WDUA 4OO4A 4POKA 1CQGA 2DSAA 3HDCA 1S3AA 1SENA 3ERFA 1THOA 5J9CA 3CMIA 22GSA 2D2ZA 1Y25A 2VUPA 1TP9A 2VCZA 2BMXA 1OC8A 1N2AA 2GS3A 2H74A 5DAKB 2RM5A 4HU9A 3TJBA 3F6DA 4KGIA 1SJIA 2IMFA 1ZZYA 1TK8B 3KMOA 2YZUA 4RI6A 4NV5A 3M8NA 4MZWA 1BG5A 4KW6A 5DJLA 4EDYA 1SKWB 2GZZA 4AJ8A 5D9WA 5G5FA 4ML6A 2A4VA 2PVOC 2OACA 2H0GA 2KUCA 4WBJA 3GSTA 5DAKA 1B9XC 1M99A 3HA9A 3NIVA 1ZL9A 4L5LA 1F37A 3KP9A 1UN2A 3UIWA 2YWOA 4MJAA 1YEPA 1DE2A 4NWYA 1DSBA 3F9UA 4POBA 1S3CA 1Z3EA 3FK8A 5J5NA 5DBQA 3Q6OA 3HYPA 3K8NA 5ECIB 5CRHA 3QAWA 1V57A 2VCVA 3EWLA 3M1GA 3TJKA 2MMNA 1Z6NA 3C73A 2DMLA 2H01A 1SK0A 3PR8A 4MABA 4YH2A 5IQYA 2KOKA 3UOMA 1XCCA 2EC4A 6GSWA 2G0FA 3ZITA 4CDOA 4HEA2 2DMMA 5B8BA 2OBKA 16GSA 5KN1A 4PGTA 4TKYA 13GSA 5ECQB 1MDIA 2H6XA 2C0FA 3VWUA 11GSA 1JHBA 4GSTA 1XW6A 1ERUA 1V2AA 5CYYA 2WJUA 4CW9A 3HVXA 4LL4B 4L0UA 3IBHA 3RBTA 19GSA 5KN2A 3L78A 1ZOFA 4KDYA 2CT6A 4GWRA 2FA4A 3VPTA 2G2QA 3DRNA 1GUHA 3GRXA 3UARA 5IMZA 1ON4A 2LRCA 2JACA 3L4NA 5JCGA 2X64A 2EIOA 4KDXA 3FYGA 1O81A 2CVBA 5FWGA 2N5FA 1V58A 1WE0A 3J7Yb 3UL3A 4WKWA 1ST9A 3NZNA 1F9MA 3KXOA 5H5QA 2IMIA 1EP7A 4EE0A 1H4OA 1PKZA 3HHVA 1MD4A 1PL1A 1A8YA 3IXRA 2VL2A 4KX4A 3P7XA 3TJGA 3IRAA 2V6KA 2PMTA 1WWJA 2P0GA 3ZMKA 3KJYA 1XWAA 2OE1A 1TI1A 2CVDA 5F06A 2K6VA 2BJXA 3ZVJD 3V1WA 5ECRB 2VD1A 1HD2A 2K18A 2H30A 3ZZXA 1ZYQB 2X99A 1USBA 5IPGA 1GSDA 1IYHA 3ZRDA 2REMA 1GULA 2H6YA 2H1DA 5ECPB 4Q5FA 2V1MA 5CAXA 1OYJA 1EV4A 2O7KA 3HJOA 1U88A 3WT2A 1XIYA 1WRYA 5F05A 1AUCA 4PNGA 2YPMA 3M3MA 1OKTA 2CV4A 4HU7A 3KZQA 2DJJA 3IV4A 4ZIJA 4I97A 1X5EA 5IMFA 1YEXA 1GP1A 4ECIA 5DVBA 2L6CA 3QCPA 4F2IA 2O8VB 3GTUB 2WS2A 3GFKA 5DJMA 3VK9A 4HJMA 1EOGA 1FAAA 3QMXA 2YZHA 4G2EA 3C8EA 4V2MA 1FB0A 3TB2A 4WEYA 2X8GA 3VURA 2V32A 3TKSC 4RQXA 4KSOA 1YJ6A 1XPVA 2WB9A 4FIWA 2P5RA 6GSVA 3EMPA 1U3AA 1JZWA 3HCZA 4HS1A 1O7UA 4CHSA 1O8XA 2LEGA 5LD0A 3GTUA 1GLQA 3CBUA 2CX3A 2B7KA 1GRXA 1QUWA 2XBIA 1WOUA 2EIRA 4YAPA 3TOTA 5HFKA 2C4JA 2AAWA 1F3BA 2FWHA 2H0HA 1X9WB 4LMWA 1OE8A 5G1KA 4MA9A 4N10A 1TK5B 1SK2A 4GCIA 3GYKA 3ME8A 1G6YA 2OADA 5ELAA 4I2UA 4K7IA 4MLYA 4ECJA 1K0CA 2HZEB 1HYUA 2OE0A 1VF3A 3IAM2 2KLXA 3VI7A 3UAPA 4BVYA 3RAZA 4JRRA 4TXVA 3GX0A 4FYCA 2FWGA 1WMJA 2MBTA 3TOUA 4PX1A 5AGYA 1SKSB 2H1BA 5IM9A 2FUG2 5H5RA 3ISOA 2HRFA 2ON5A 2QSIA 2LRNA 5F0GA 2FNOA 1ERWA 2HZEA 2VAFA 3W6GA 4AGSA 3CSJA 3D5JA 2NPBA 4OWYA 5F07A 2WRTA 1K0OA 5CRDA 3ZMLA 1TJDA 2LJAA 1PQNA 4O5RA 1R5PA 4GXZA 3LFLA 2VL9A 2PUKC 2V2GA 4K2DA 3GUSA 3ZFBA 1OC3A 1FVJA 3GA4A 4XRDA 2B5EA 3LYPA 2B1KA 4BWSA 1TU8A 3UEMA 1THXA 2GQLA 2HXKA 2GSRA 1HNAA 1M2AA 3FR9A 3GNJA 2B6MA 5IPHA 2P31A 2RUFA 3HZ4A 4TRXA 1QK8A 4FYBA 4ID0A 3QAVA 4PQHA 4HQZA 2L5OA 1H75A 1XXUA 1S3DA 2JZSA 1RK4A 3APOA 1XOAA 4DSQA 3UVHA 2R6KA 3EURA 2GZPA 3TUEA 2CAIA 1ACVA 2J9HA 3BOAA 2FCHA 4YQUA 1Z7RA 1NW2A 1T1VA 2FA8A 5ECHB 1OVNA 5D96A 3H4KA 4X0XA 1XWKA 4N0VA 3MAKA 1XZOA 5G31A 1PGTA 2MMOA 4AF2A 3L0HA 3EU4A 3G7IA 2GDRA 4HJ2A 3WGEA 2MBSA 1TI3A 2YWMA 2IL3A 1EV9A 2LTKA 3FZ9A 2GTUA 5DCHA 2F3MA 3H79A 1VF1A 2YN1A 4KDUA 4XS6A 1JLVA 5HR0A 3BJ5A 1EEJA 3QR6A 1JLWA 4Q5NA 1WJKA 3KP8A 3ZIJA 2X8HA 4EUYA 5C04A 2HZFA 3LG6A 4K7OA 5ELGA 4J2FA 4IJ3A 5D9XA 2DJ2A 1OKDA 1X5DA 4Z7XA 1Q4JA 3GIXA 1F6MC 4BVXA 3HJPA 2HFDA 3G7YA 5CREA 4K1FA 1BAYA 2R37A 2FD3A 3HZ8A 4HDEA 1YY7A 4HI7A 3FZ5A 5DDLA 1IYIA 1KEBA 1FB6A 1GNWA 3I9V2 1QMVA 1J08A 3SWLA 1Z7PA 2TRXA 4PQ1A 4ULXA 4GSNA 4QQ7A 4KCAA 3ZLPA 1MDJA 3GSSA 4IP1A 3M0FA 1PKWA 1T4YA 2K8SA 4J57E 3O6TA 2IPAA 1I9DA 4XRAA 4MMMA 1XW5A 1SJZA 1B9YC 3IE3A 5D73A 2O87A 4J56E 4YAVA 2IMDA 5G2ZA 3BCKA 1MD3A 3LORA 4GQCA 2TIRA 2RM6A 2FLSA 3RHBA 4K9ZA 1JFUA 2LJKA 5JWOB 2WCIA 2CQ9A 2RLIA 4NMUA 1GTBA 3FW2A 2NVLA 4MZBA 3EMXA 3FKFA 4IQ1A 3I69A 2IJYA 3KD0A 1HQOA 20GSA 3A3TA 3VI5A 4TOPA 3UMAA 3LEFA 1RQMA 3WGXA 5IOWA 3TKSE 1GTIA 2VM1A 5CP1A 1G7OA 1PMTA 5DQSA 4POLA 3L9SA 2LNSA 1J9BA 2GT6A 4Q5QA 1OC9B 5EPFA 1Q98A 2ON7A 4G9HA 1V9WA 2DC5A 1M7TA 3TDGA 3BBYA 5EL8A 2XPEA 4HQSA 5JWRB 1HNBA 1OE7A 1YKAA 1N8JA 3KH7A 4AJ7A 4MCUA 2BTOT 2PERA 5EY6A 3FR3A 3MWHA 2B1LA 1YZXA 1OC9A 1M0UA 5CRWA 3G9BA 3LQ7A 2DJ1A 3IA1A 3GL5A 1EWXA 2IIYA 3GURA 4LLRA 4NHZA 4BL7A 2AYTA 3Q19A 3UBKA 3TKRA 3QAGA 2JSYA 2R2JA 3ERGA 1SD8A 1V98A 1T8EB 1PA3A 3US3A 2PVQA 3IR4A 1NM3A 4TN8A 1FOVA 2KP1A 2C80A 2VIMA 4TW5A 3AY8A 2WULA 3FY7A 4ZB6A 5GSSA 6GSUA 1TXXA 1ZGNA 2XPDA 2L59A 1SL1B 5LNKe 2MMAA 3TCOA 1MDKA 1YF1A 3TKSA 3DYRA 2IWTA 2M80A 2JL4A 3IOSA 2HI7A 1B8XA 3BCIA 1PX7A 4KE3A 2GSQA 2YJ7A 2NTOA 3GKXA 3OR5A 3SBCA 2Z9SA 5COHA 2LV3A 3F0IA 1O73A 2CVKA 3WT1A 3D21A 2N5BA 1QXHA 4MPFA 2CA8A 3ZYWA 4PURA 4BWQA 1ABAA 3DWVA 3ZFLA 5ECSA 1GSEA 10GSA 2YJHA 3DIEA 4K8MA 1URMA 3DMLA 2LKUA 2VLUA 3D0ZA 4JEDA 2H72A 1NHOA 2VCTA 6GSXA 3KEBA 4ZBBA 2IMKA 3RPNA 1EOHA 4F03A 5GSTA 18GSA 4IJIA 2VLVA 1GUMA 2GSSA 1TK0B 2CZ2A 2GSTA 3GX8A 2YV7A 3M9KA 4K0NA 1B48A 5IO0A 4NHWA 2M46A 3D4MA 4X1UA 2H8LA 2RUEA 1G0TA 2KHPA 3U5RE 1EGRA 1BQ7A 4OO5A 2ZCTA 2F8AA 5HR3A 1A8LA 1SL0B 1Y6EA 3JCML 4GLTA 5E4WA 2I81A 1VGLA 2VOCA 1JZRA 3P8WA 4EXJA 2P5QA 1PRXA 3IAS2 3H8QA 1TU7A 1T3BA 1DBYA 3F63A 2H1GA 3FEUA 3O76A 4QL7A 4EF0A 3UVTA 1PX6A 5J4UA 1YQ1A 1FVKA 4OCEA 5AIVA 1A23A 2L4QA 3NOFA 5DQYA 4PUAA 3VLNA 3WGDA 5JCUA 3GL3A 4ILFA 3VWVA 4X43A 3E0UA 3LSZA 3KTLA 2DJ0A 1SK1A 3F4TA 1K3LA 4XS1A 2A2SA 5EVOA 5A4VA 4DSSA 4BPYA 4IQAA 3IC4A 1Z5YE 4P3YB 14GSA 2MYGA 3C1SA 3KTBA 3M9JA 5CNWA 1XVWA 1T7PB 3FZAA 5ABRA 1ERTA 4IN0A 4NAXA 3ZL5A 2E2MA 3ZVJA 2TRCP 4E8EA 3LXZA 1PD21 1XWBA 2AV4A 4NXIA 2AB6A 2I9HA 4HZ4A 2JZRA 4O92A 1EGOA 3R2QA 4L8EA 5LCZA 4TXOB 2H0IA 4N0ZA 2YWIA 4MF7A 3ERWA 2JSZA 3IHQA 2ZNMA 2DBCA 3EE2A 4ML1A 1F2EA 4KNDA 3FRCA 1F3AA 1JZDA 2OJLA 4L0WA 5HR1A 1EEMA 2V41A 2YCDA 4I5QA 8GSSA 1A0FA 6GSSA 3RPPA 3EU3A 3GKNA 4TXOA 1ZYEA 6GSTA 2XBQA 4E8HA 3WD6A 1NHYA 4POMA 3DEXA 4EC0A 4PUFC 2VCXA 5ECOB 7GSSA 4YQVA 4EDZA 2YOIA 3KH9A 1TTZA 4TR4A 4EL1A 3IPZA 5IOXA 3TGZA 2H6ZA 2JADA 3A2WA 1K0MA 3QD9A 3S9FA 4KAEA 5HQPA 4ZL8A 1RW1A 4HZ2A 2R5GA 2C0DA 3VFIA 1WP0A 4XIHA 3UJ1A 1WPIA 5IMVA 4AJ6A 2A2RA 4ZL7A 5ECNB 4K6XA 2O85A 2JZTA 4F82A 2ALBA 4I6XA 1GWCA 4GSSA 1DE1A 3KGKA 4KA0A 4JR6A 2C0GA 2L4CA 4TVEA 5GZZB 4MDCA 4ZL9A 3L9VA 1G6WA 2MZCA 3WYWA 1X5CA 5AN1A 4IELA 5C00A 2V6OA 2HNLA 1E6BA 1XWGA 2LJRA 1R5AA 5DALB 1FG4A 2B5YA 3KIJA 4N30A 2H71A 4IGJA 2C3QA 3QDNA 2H1AA 2XHFA 3UBLA 5IIZA 1G7EA 2ES7A 5G1LA 3IDVA 4ZB8A 4EVMA 1SJ6A 2WFCA 2VM2A 3FHKA 1UC7A 1AQWA 1M9AA 4GTUA 2KP2A 4EKZA 4OCFA 4JZQA 3D6IA 5DALA 4ZBDA 3GN3A 1GLPA 2H73A 4O7HA 4HOJA 3RHCA 4MF6A 2DLXA 1K3OA 2YP6A 3Q18A 1VF4A 2E2GA 1LJRA 2WGRA 2X8CA 3E3EA 1GH2A 4NV2A 1BX9A 2GZYA 4MH2A 5G5EA 3FZ4A 1KNGA 3TJFA 1MTCA 2E0QA 4WF4A 4D73B 2O89A 3HD5A 3O3TA 2GVPA 2PN8A 1GSUA 2PPTA 5FT3A 3N9JA 2F51A 1BEDA 1XFLA 1Z9HA 5IMDA 1SL2B 3A2XA 3H93A 1SYRA 5G30A 1M2BA 4KSMA 3IK9A 5HR2A 2R3XA 2PU9C 12GSA 3F6FA 2PWJA 5KN0A 4D73A 1XOBA 5A4UA 1GNEA 4IVFA 4ACSA 3QFBC 1QFNA 2WZ9A 3ED3A 2C0EA 1TRVA 4PNFA 1GL8A 1CQHA 1DUGA 2QKEA 3VWXA 3D22A 1K0NA 4OFMA 4FYUA 1O8WA 2VCQA 2JU5A 1AAZA 2VL3A 4GQFA 4TR0A 4ZXGA 5D9TA 1GSQA 5ID2B 5J9BA 2FHEA 4DSRA 2YV9A 1SD9A 3TKQA 5CO3A 3ZREA 1TRWA 1YF0A 4ZBAA 4MP4A 1FHEA 5HFGA 1B4PA 2I4AA 4JU5A 2C1YA 5B6NA 4XS4B 2M72A 4OFNA 3TKPA 1QGVA 1A2MA 1V40A 2IN3A 2YANA 1PSQA 2IMEA 5ID2A 3C71A 1LBKA 2CZ3A 3TJJA 4IW9A 1LU4A 1TRUA 1U3IA 5ECMB 2PGTA 1A2LA 2IFQB 2YWNA 2H66A 3DVWA 2OBIA 3CXGA 5CRGA 2AHEA 3HVSA 5ECKB 4ECBA 4N11A 2QC7A 5E59A 3LJRA 4XS4A 2ZUPA 2B3SA 4MPGA 1M9BA 1A24A 3E9JB 3ZTLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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