5IM9A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 49
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5im9A00
4HJMA 19GSA 2P0GA 5H5SA 5KN1A 4GSNA 3P90A 5FT3A 2MBTA 1KBNA 3Q6OA 4AJ7A 3KTLA 3QDNA 3C8EA 1FVJA 3IAM2 4EO3A 1VF2A 1XPVA 4X1UA 1GSEA 4Z7XA 2B5EA 3DYRA 2GZZA 4I2TA 4D73A 3QCPA 3D6IA 2VL3A 3IC4A 1V9WA 1PKWA 5ID2A 2DMMA 3KP8A 3ZIVA 4BWQA 2VL2A 2JACA 2K8VA 2E0QA 4NWYA 4PUFC 3V1WA 3F6FA 1VRSD 1O73A 5CRDA 3GH9A 2AHEA 4J57E 2CQ9A 3TOTA 1JHBA 3HJOA 3UARA 2YWMA 2H66A 4ECIA 2F8FA 2H6YA 4JEDA 3GFKA 2B1LA 2LKUA 1SYXA 5C04A 3JCML 3BBYA 1AC1A 4MJEA 3HKRA 4ZL9A 3EVIA 3KH7A 1TP9A 1GTBA 4RQRA 3ZIJA 1VF4A 3QAGA 3MDKA 4OMVA 2GSQA 5D9VA 6GSSA 4DSQA 3UEMA 4ID0A 2PU9C 2GDRA 2OE3A 3KP9A 3IBHA 2VCQA 1LJRA 4IVFA 3GV1A 3F0IA 1SU9A 5DVBA 3AY8A 4PXOA 4ZBBA 1U87A 2CAQA 3RBTA 4HUAA 1X5DA 3GX8A 1F9MA 4XRAA 4TW5A 3RHCA 1ERTA 2CT6A 1KNGA 3F3QA 1TK0B 3BOAA 3KMOA 3H79A 4L8EA 3Q19A 2RIIA 2YZUA 5J4UA 3ME7A 4JU5A 4MMMA 4PQIA 3VPQA 4AJ6A 1NSWA 3APQA 2LRNA 1JLWA 2VLUA 2LJRA 2CVKA 2CVDA 3M0FA 5F0GA 1WOUA 1XW5A 3A5WA 3KGKA 1WMJA 2LQOA 2P5QA 4XTSA 3G7IA 2L4CA 5F8BA 1SJIA 3VLNA 4TXVA 3ZREA 1BX9A 3GA4A 2WFCA 3EYTA 2YWIA 2AV4A 1GWCA 5ECQB 5CAXA 1XXUA 4G10A 3M1GA 1N8JA 1E2YA 3E3EA 3IE3A 1XIYA 5LCZA 2VIMA 5D9XA 1DE1A 3GKMA 2E2MA 3GKXA 1RW1A 1OAZA 2RUEA 3WYWA 5IPHA 3UMAA 3ME8A 4HS1A 4KDXA 3EU4A 4QL9A 2ZUPA 3ERGA 5D73A 4ACSA 3DVWA 4PUAA 3SWLA 1SENA 4KUNA 1YQ1A 2PUKC 1TXXA 4MPFA 3D4MA 1F6MC 2AB6A 4IW9A 4KSOA 3RAZA 4WEYA 4EE0A 4WKWA 2D2ZA 1FG4A 4I6XA 2GQKA 2VLVA 2H1AA 2FD3A 2JSYA 3TRQA 2IN3A 2HI7A 4RI7A 1ZYEA 2HE3A 5ECPB 3W8SA 1A2LA 2PVOC 4EF0A 3UVTA 2IIYA 2OBKA 4IP1A 4RQXA 1Y6EA 3TB2A 4TRXA 2VOCA 2G2QA 2IPAA 2VCZA 5IMAA 4BVXA 3UOMA 2TRXA 2XC2A 4LL1B 3ERWA 3F63A 3KH9A 4IGJA 4WXTA 4KW6A 5CRGA 3KMNA 3D0ZA 3ZTLA 1MD3A 3DIEA 4ZBDA 2A2RA 1B8XA 1YJ6A 3CYNA 3R2QA 2ON5A 1MD4A 2CAIA 4FO5A 2LJKA 1TOFA 5IO2A 4MF7A 2NVLA 2X99A 4K1FA 1B9XC 5IMCA 2GLRA 1G6WA 1AUCA 3M9KA 1IYHA 1OYJA 4AJ8A 1QGVA 3DRNA 5G31A 4HEA2 1EEMA 5G5EA 1PX7A 5CO3A 3ERFA 3TKSA 3DXBA 2HNLA 3ZL5A 3FR3A 5AN1A 2PPTA 4JZQA 5IIZA 4KCEA 2K18A 5CRWA 1AW9A 3GSTA 1SK0A 1WP0A 4YAPA 1ZCPA 4N11A 4ML1A 4HI7A 2DBCA 2LEGA 2J23A 1PQNA 1VF3A 2ES7A 4GWRA 3RPPA 1TRVA 4O5RA 4XS4B 2L59A 1X5EA 4PURA 2P5RA 2C4JA 4YQUA 1PKZA 3BJ5A 3F4SA 3IK7A 5D9TA 1XBSA 2NBSA 1XCCA 1ML6A 4G2EA 2DJ3A 1GLPA 2C0GA 1J9BA 3GL3A 2MMAA 4KE3A 2K6VA 2JU5A 1PX6A 2C3TA 3ZRDA 1SK2A 5LD0A 2C1YA 1K0CA 1TK8B 2IFQA 4XIHA 2LNTA 4I97A 3F4TA 1X9WB 1GUHA 1XW9A 2HZEB 4V2MA 4TR4A 4D73B 3EU3A 5H5QA 4GLTA 1K3LA 1J08A 2YV7A 1G0TA 2FGXA 1BYEA 1S3DA 3QD9A 3TOUA 3TKQA 1F3AA 4EKZA 1BEDA 4GXZA 4JRRA 2R5GA 4DVCA 2FY6A 1A24A 5J5NA 2CV4A 2ALBA 2VL2C 3F3RA 1EWXA 3QAWA 3TUEA 2L6DA 4HJ2A 1WIKA 3VWXA 1ABAA 3I6AA 2N5AA 2GT5A 3HY2A 3HZ4A 3L9UA 5IMFA 3DMLA 4TOPA 2RUFA 3CSHA 1WJKA 3WT1A 3G7YA 3KXOA 4OFTA 1T4YA 1Z7RA 3TJJA 2CX4A 1YEPA 1TI1A 1NHYA 4IQAA 4DSSA 2H70A 2H01A 3FK8A 2F9SA 2EIRA 1QMVA 1M2AA 4HQZA 1USBA 1TU8A 2AAWA 3BD2A 3VWUA 4TR3A 4BA7A 2N5FA 2F51A 4POLA 4MZCA 4OFMA 3A2XA 5F06A 3HA9A 4E8EA 5L71A 6GSYA 4GSTA 1C72A 1OC8A 3C1SA 3HDCA 3UJ1A 4N10A 4BL7A 1DBYA 3TCOA 4AGSA 2I9HA 2V1MA 2DSAA 1HD2A 3RHBA 4EC0A 1BQ7A 3LG6A 4LMWA 4IP6A 2X64A 4NV2A 3PGTA 3A2WA 2GSSA 2YN1A 3ZYWA 1BAYA 4GQFA 5B6NA 1GH2A 1GL8A 1MDIA 4K7IA 2OJLA 2H71A 1V2AA 2HZEA 4WETA 1TTZA 1SJ6A 3L9SA 1WPIA 1R5PA 4ZXGA 1GSUA 2BMXA 4N0VA 4MZWA 2O87A 3FZ9A 5IPGA 3RPNA 3L9VA 2YPMA 4OCFA 3HZ8A 1EV4A 2KUCA 3UVHA 3HXSA 4ZB9A 3GKNA 4ZILA 3TJBA 3HJMA 5KN3A 1OE7A 1GSSA 4MZBA 2E2GA 3US3A 5KN2A 5HQPA 2AUVA 2WZ9A 5IOXA 3H4KA 2YNXA 1Z3EA 2H72A 5CREA 3KCMA 3EURA 4PGTA 3VWWA 4FYCA 5IOWA 1PN9A 3A2VA 2AYTA 3DGQA 3ZFBA 3CBUA 2REMA 2H6XA 8GSSA 2YV9A 1FW1A 4F0CA 3FKFA 1G7EA 2WULA 4EDZA 1J0FA 1TU7A 3KJYA 3CSJA 3LJRA 2AJQB 5HFIA 3HYPA 4LA1A 3TKSE 4G19A 2C0FA 3KM6A 2GQLA 4FYBA 3LEFA 2I1UA 1PRXA 2KOKA 1T3BA 5DAKA 1U3AA 2PMTA 1G7OA 2VD0A 2IMFA 3HJPA 1X9MB 4KCAA 5DCHA 2J9HA 2PWJA 1YF0A 3OR5A 2V6OA 4EL1A 1HNAA 5ECHB 4V1Ag 5DQSA 3I69A 3O3TA 3WGEA 1U88A 1W4VA 1Z7PA 3C73A 3DVXA 3IV4A 1SD9A 6GSUA 2C3QA 2WGRA 4NMUA 4O92A 4BWSA 3LQ7A 3D21A 3L4NA 3EMXA 1TKDB 3VK9A 1GTAA 2H0GA 2IWTA 3QFAC 2QGVA 2IMEA 1A8LA 3CMIA 1K0AA 2OA7A 1QFNA 4JR4A 5J41A 3E9JB 2FWFA 1ERWA 2WDUA 6GSXA 1HNBA 4FIWA 4WF5A 1OC9A 1TRWA 3GMFA 4TN8A 3PH9A 1GSFA 2KLXA 4L5LA 4IHUA 4O7HA 1VGLA 5IMVA 1ZYQB 3TKSC 3APOA 2HRFA 4POKA 2OBIA 1PL2A 3BCKA 4K8MA 4HZ2A 3QOUA 5HR3A 1FHEA 2MZCA 3CTFA 2FHEA 3QR6A 2M80A 4ULXA 1Z6NA 1TI3A 5INYA 4OFNA 3IDVA 2VCTA 1FOVA 4QL7A 1V58A 1NHOA 1XOAA 4I5QA 5LNKe 4QQ7A 2C3NA 1AAZA 4MPGA 2HFDA 1VF1A 1UA5A 5EL8A 4KDYA 3VI5A 1XWCA 1XVQA 1V40A 4WR4A 3WD6A 1O81A 2RLIA 4IQ1A 4OD7A 4DSRA 1ACVA 3LYKA 1X9SB 2R2JA 1AQXA 3W8JA 20GSA 3IPZA 2FA8A 3KD0A 2LSTA 1NM3A 4PQ1A 2IFQB 2H0IA 3K8NA 1PMTA 1EGOA 1O8WA 1PD21 5C00A 3FR6A 1O8XA 2YWOA 5DDLA 1R7HA 1HYUA 3FR9A 3FZ5A 4L0WA 1SL2B 4MABA 3VFIA 1X0RA 1YEXA 1YKCA 3TGZA 5HFGA 1NW2A 2CZ2A 2ZCTA 3DKSA 1DE2A 1M99A 3FRCA 1R5AA 1E6BA 1W89A 3HD5A 1K0OA 4ECJA 4YQVA 3N5OA 3NOFA 1X5CA 2OE0A 1M2BA 3FY7A 3GL5A 2TRCP 1T8EB 4I8BA 1GSYA 1R4WA 22GSA 3N9JA 5D9WA 2CA8A 2H0HA 3GIXA 3LWAA 5DALB 4DEJA 1THOA 1QQ2A 4GQCA 4DSSB 5IQYA 1OE8A 5G1KA 3UAPA 1M9AA 1OKTA 2YCDA 4JE1A 3C7MA 3TJGA 3IOSA 2EIQA 3H1NA 3GKKA 2L5LA 4ZB8A 1SD8A 5ECIB 1TJDA 4XHMA 2OACA 4ILFA 4MA9A 3IA1A 2H76A 2XHFA 2I3YA 1ILOA 4XS1A 5HR2A 2RM6A 2K9FA 1GSQA 2HRNA 5CRHA 1EGRA 1JZRA 2KP2A 4Q5FA 4MJBA 3FEUA 5ECRB 1OVNA 4GTUA 1TK5B 4JR6A 1SL0B 3MAKA 2H73A 4NHWA 1I9DA 2HZFA 3D22A 2LS5A 1SKWB 4TKYA 1EP8A 3F6DA 4Q5QA 3M3MA 3VWVA 2LTKA 2L5OA 1Z9HA 2TIRA 3TDGA 2MMNA 2HT9A 5KN0A 1GULA 1YF1A 4KAEA 3ISOA 3VPTA 1URMA 2VCWA 4IKHA 2CX3A 4J56E 4FYUA 1T4ZA 2O85A 1AIUA 3CRUA 3U6VA 5COHA 1AQVA 6GSVA 5JCGA 4LLRA 1S3CA 4XCSA 1BJXA 1PA3A 5E59A 1Z5YE 2QKEA 3KIJA 2LRCA 4ZIJA 1XOBA 5IMDA 5J3RA 2L6CA 5AISA 1V57A 2WB9A 4EVMA 2BJXA 4LMVA 1EOGA 1G6YA 3W6GA 5ECOB 1F2EA 3VI7A 2KHPA 5DJLA 2GQMA 2DC5A 2YP6A 3SBCA 2JZSA 5GSSA 1HNCA 5H5RA 2YJHA 3GN3A 2O8VB 4H86A 1Q98A 2GGTA 5B8AA 1XVWA 2GZPA 2QSIA 5HFKA 5JWQB 2VM1A 1B48A 3GTUB 5DALA 1GP1A 2OADA 1ZGNA 2V41A 2H19A 2H1GA 2XBIA 1GLQA 4GCIA 1A2JA 3ZMKA 5JCWA 4N30A 2IJYA 3GX0A 3C71A 4OWYA 2JADA 3HVVA 1AQWA 1TW9A 3FW2A 4WBJA 3QAVA 2GSRA 3PR8A 1UC7A 2A2SA 2V32A 2I4AA 1M7TA 3EMPA 3DWVA 2NPBA 4KH7A 5ECLB 2K8SA 5HR1A 5DAKB 3A3TA 1TDIA 2FUG2 4K9ZA 1A0RP 3O6TA 1YZXA 2HSYA 5F05A 1LU4A 2P31A 4HDEA 4F0BA 2MMOA 5ECMB 3HVSA 3CXGA 4KDUA 4NAXA 2VCXA 1GRXA 2OE1A 3TJFA 4WBRD 1JZWA 1XFLA 4POBA 3TJKA 2MBSA 2M72A 1BG5A 6GSTA 3TKRA 1SKSB 5FWGA 2WS2A 3KZQA 1ST9A 4MCUA 4WR5A 5ABRA 3F9UA 4KB3A 4XS6A 2B6MA 1EV9A 3HCZA 1AXDA 1OC9B 3MSZA 3DEXA 3GURA 3I9V2 4IS0A 4F2IA 5J9CA 2GS3A 2V2GA 2WRTA 3ZZXA 3CTGA 2KP1A 1DSBA 2GVPA 3P8WA 3UBLA 1GUKA 1Z6MA 1EEJA 2N5BA 4F9ZA 1XWGA 3ZLPA 4K7OA 4OO4A 3LORA 4G9HA 5A5KA 1WE0A 1CQGA 2QC7A 4BPYA 3WGXA 3D4TA 2GT6A 2HSHA 4K6XA 1O6JA 3BCIA 2DMLA 4IJIA 2DJJA 6GSWA 3FYGA 4IN0A 2WJUA 4CHSA 3LXTA 3GTUA 5ELGA 1KTEA 4MH3A 4YAVA 1DUGA 1FAAA 5IMZA 1B4QA 1PGTA 2PVQA 4MK3A 1WWJA 1N2AA 4PQHA 2DJ1A 4HZ4A 1GSDA 1GTUA 4Q5NA 3H8QA 1T7PB 2LV3A 3UL3A 1JFUA 1OKDA 4TR1A 3ZMLA 1A23A 3KEBA 2WCIA 4HU7A 1ZMAA 2DLXA 2L4QA 2PBJA 2FWHA 1PSQA 3LXZA 4ML6A 1YDKA 1K0DA 4MJAA 5DBQA 2IL3A 5CYYA 2LQQA 4ECCA 4K2DA 2VCVA 1Q4JA 2B3SA 1QXHA 2FWEA 2V6KA 4TXOA 1B4PA 2FCHA 1V98A 5JWRB 1EOHA 1A0FA 5ECNB 4O32A 1A2MA 1O7UA 4KNDA 4Q5RA 2XPDA 5A4VA 2XBQA 5GAPD 3RDWA 5DJMA 2GTUA 2A4VA 4I2UA 5AIXA 2Z9SA 2IMDA 5ECSA 4EXJA 3GRXA 2LUSA 5ELAA 1Y25A 4L5OA 4WF4A 2H74A 4ZL7A 2B5YA 4X43A 3TRPA 3LYPA 1M0UA 4NV5A 5G5FA 2R37A 3GSSA 4F82A 4K0GA 1OC3A 3UBKA 2MYGA 3P7XA 4MDCA 3GUSA 2DIZA 2H75A 14GSA 2DIYA 4PNGA 1K3OA 3IHQA 5E4WA 3KTBA 3EC3A 4POMA 2OKAA 4KX4A 2JZRA 2C0DA 3O76A 1XZOA 1A8YA 2ON7A 3GHAA 3Q74A 3GH6A 5B6MA 4KSMA 3J7Yb 5IM9A 3APSA 1B9YC 2NDOA 3G9BA 2DJKA 4RI6A 4IELA 2F3MA 1ZZYA 2F8AA 5D96A 1IYIA 3EINA 4P3YB 5KEJA 2H8LA 2FWGA 3EE2A 2LRTA 2G0FA 4N0ZA 1JZDA 1T1VA 4HU9A 9GSSA 2C80A 5CNWA 1MEKA 3PINA 1K3YA 1YY7A 1GTIA 2GSTA 3I43A 3WGDA 2IMKA 3QMXA 2CVBA 4NPBA 1K0NA 1SK1A 2H6ZA 4LL4B 5AGYA 4GRFA 3VURA 4XRDA 2B1KA 5EY6A 3IAS2 1I5GA 3P2AA 4MLYA 3LSZA 2H1DA 3DD3A 3QPMA 4E8HA 18GSA 13GSA 1JZOA 1MDKA 1SYRA 1FVKA 1O85A 2NTOA 5B7CA 4HQSA 3MWHA 2DJ0A 3IXRA 1RK4A 5DCGA 3UIWA 4V2NA 3IR4A 3ZFLA 2X8GA 2FLSA 2H1BA 4ECBA 5ENUA 1M9BA 5G2ZA 2VL9A 5D8IA 1WRYA 3LGCA 1M2DA 2C0EA 4V1Ap 4GF0A 5A4UA 1XWAA 2EIOA 3D5JA 4BVYA 1K0BA 2X8CA 2E7PA 4ZB6A 3ZVJD 2IMIA 4CW9A 2JZTA 3ED3A 3GNJA 2L57A 4GSSA 3FZ4A 11GSA 3GYKA 4ZBAA 2X8HA 1FB6A 5FHIA 4IBPA 2M46A 2B7KA 4NHZA 4X0XA 5IO0A 1RQMA 2H30A 1ERUA 2LJAA 2XPEA 2HYXA 1ON4A 5HR0A 3WT2A 2DJ2A 2LNSA 1ZOFA 3ZITA 2FA4A 4OCEA 1EZKA 4TR0A 3U5RE 4EDYA 1T00A 4ISDA 4K7NA 1FB0A 3F8UA 5G30A 1FO5A 3IRAA 1EP7A 5G1LA 1GUMA 3NZNA 3FZAA 4F03A 1SL1B 5D93A 1S3AA 3IK9A 4ZL8A 3CRTA 4YQMA 5JWOB 1UN2A 1ERVA 5J9BA 3HVXA 5EVOA 3H93A 4NXIA 3HHVA 3C1RA 1YKAA 4L0UA 2O7KA 1MTCA 1XWBA 12GSA 2B5XA 2BTOT 3LFLA 1JLVA 1TRUA 4MH2A 4MF5A 1MDJA 3TRXA 4HOJA 3FHKA 2B7JA 2R4VA 2C8UA 3J7Yk 2FNOA 5ID2B 4RUVA 2I81A 2VM2A 3M8NA 2JL4A 1XW6A 1SKRB 1CQHA 3QFBC 5CP1A 5EPFA 4JBBA 4CDOA 2VD1A 4PX1A 3M9JA 3L78A 2EC4A 5ECKB 1U3IA 3NIVA 10GSA 2VUPA 2YWNA 4K0NA 5A4WA 4TVEA 4FH8A 3EWLA 1PL1A 5JCUA 1F3BA 16GSA 3MNGA 4MF6A 1LBKA 1F37A 4OO5A 4V2LA 2RM5A 4J2FA 2YJ7A 1TRSA 2ZNMA 3G7JA 4IJ3A 4KA0A 2HXKA 2PN8A 4EUYA 4YH2A 2O89A 1H4OA 5B8BA 2PERA 2VLTA 1GNEA 4AF2A 2R6KA 4PNFA 1UVZA 3Q18A 4KGIA 2HLSA 3CSIA 4TR1B 1THXA 5GAND 5GSTA 3TKPA 2R3XA 1KEBA 17GSA 2JSZA 1U6TA 2VAFA 2VO4A 3E0UA 1H75A 4MP4A 1XWKA 3F4RA 7GSSA 5DQYA 5GZZB 1R26A 2PGTA 4TXOB 2MMZA 3L0HA 2YANA 1QK8A 4XS4A 5AIVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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