5IM9A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 49
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5im9A00
4BA7A 5JWOB 2M46A 1JLVA 4V2MA 1F6MC 5A4WA 2EIOA 2GT6A 3JCML 3DVWA 1HQOA 4Q5RA 3C71A 4K6XA 2IMIA 2FLSA 3VPQA 3EYTA 1YY7A 4I8BA 4NMUA 1GSDA 4G10A 3VK9A 4V2LA 5J5NA 2LJKA 1UVZA 3TCOA 2R37A 3UJ1A 1CQGA 2PVOC 1UA5A 5IIZA 2XPDA 3ERWA 2PMTA 2NDOA 4XHMA 1EV4A 3F3QA 2WDUA 3W6GA 5KN1A 2LNSA 1YZXA 1XPVA 4HOJA 3J7Yk 2VL3A 3H79A 2B5EA 2GTUA 2P5RA 6GSSA 2P0GA 3KJYA 4KDYA 1K0MA 1BX9A 2CAIA 3TOTA 1X9WB 3I43A 4KB3A 3VFIA 7GSSA 1OE8A 1ACVA 4IKHA 3QPMA 3IPZA 2VCQA 5ECSA 1KEBA 1T00A 1RQMA 4OWYA 4NHZA 1GLPA 2ALBA 4YAVA 4V2NA 3QOUA 2JU5A 2RUEA 1DE2A 2IIYA 3IA1A 2DJKA 5H5SA 2HRFA 1T4YA 3FY7A 1R26A 1K0DA 1K0CA 4XS1A 5KN3A 2I1UA 2FWFA 5G2ZA 1EOHA 1U87A 17GSA 4PX1A 4OO4A 4TOPA 2G2QA 1OAZA 4OFNA 3LORA 5H5RA 5HR1A 3A2XA 4YH2A 5EVOA 2GZZA 2E0QA 2VCTA 2V2GA 2HLSA 4K7IA 1PSQA 4TRXA 1E2YA 4DSRA 4IHUA 4POMA 19GSA 2L6CA 3TJJA 1EGOA 3HJMA 2JZTA 4LMVA 2YJ7A 1OKDA 2FHEA 4N11A 4MJAA 1T7PB 1J08A 4G2EA 3UEMA 3D4MA 3KH9A 3KZQA 2K8VA 3QAGA 2ZNMA 4XRAA 3MNGA 2L6DA 1IYHA 1LJRA 3CYNA 2V1MA 4L0WA 4POKA 3ZITA 4TXOB 1B4PA 3CSJA 3G9BA 5D93A 3DMLA 4KNDA 3D4TA 4L0UA 1O85A 2O7KA 2K9FA 1XWKA 1V57A 5DJLA 2BMXA 4O5RA 5HFIA 1JZRA 4TR1B 4ML1A 5F07A 3ZMKA 5ABRA 1A8LA 3IBHA 5ECLB 4POBA 1VF3A 4QL7A 5G1KA 4GWRA 5A5KA 3DVXA 3VI7A 1AC1A 1AQVA 2LEGA 4AF2A 3KTLA 1I9DA 1A8YA 3TJKA 1PA3A 6GSXA 5D9XA 5G30A 1N2AA 2CVKA 2CVDA 2H73A 4X43A 2CX4A 2O85A 4KE3A 3EMPA 2H1DA 5B7CA 3SWLA 3HZ8A 3HJOA 2HFDA 4MZBA 2EC4A 1MEKA 3ZTLA 1K3OA 1O7UA 1V2AA 5DAKB 3VWUA 1YF1A 3F63A 1Z9HA 3KMOA 4FYBA 2DIYA 4TKYA 1UN2A 1B9XC 3DKSA 1GULA 1ABAA 4WBJA 1PL1A 2HSHA 2C4JA 3UBKA 3VI5A 1H4OA 4EXJA 5AN1A 2GQLA 3L9VA 4K9ZA 1X0RA 4DVCA 3CMIA 1X9MB 3F0IA 1J0FA 1TK0B 3J7Yb 1TU8A 5IMDA 2WFCA 2VIMA 3L9UA 3D6IA 2CA8A 2PUKC 3GNJA 2IFQA 5ECIB 1ERWA 3BOAA 5G31A 3ZL5A 4O32A 4ECIA 4I5QA 3WYWA 4TR4A 4EDZA 2B1LA 3O6TA 4K1FA 5GZZB 2H0HA 2DJ0A 2V6OA 2VCZA 3A3TA 5ECQB 2OACA 5ELAA 4ZBBA 2PGTA 4JRRA 2HT9A 2C1YA 5ECPB 1PMTA 2CQ9A 5FT3A 3DRNA 4IQAA 2YV7A 1ZGNA 3CXGA 3HDCA 5IMFA 1TOFA 2IL3A 1F9MA 2GSTA 2IJYA 4HJ2A 1XOAA 1X5DA 2LQOA 2DBCA 1R4WA 2GT5A 4KAEA 4ULXA 4HS1A 1GTAA 4N30A 2K8SA 1NW2A 3L9SA 3I69A 3H4KA 3QFBC 5ID2A 3IHQA 5HFKA 2CZ3A 2H76A 3CSIA 4POLA 1XCCA 3CTFA 1G6YA 4OMVA 1S3DA 3GKKA 3US3A 4Q5QA 3DYRA 3UMAA 2TRXA 4O7HA 2OBKA 3C1RA 4XS6A 2VD1A 3LSZA 1OC3A 2N5AA 8GSSA 3FRCA 2L59A 3TRXA 5GSSA 3EWLA 2N5FA 4MPFA 3F3RA 5CRHA 2H1AA 4E8HA 2H1GA 1X9SB 1PKZA 3ERGA 2LRNA 5AGYA 3GTUA 2FY6A 3GH6A 3IR4A 3ME7A 1W4VA 2WB9A 4XIHA 4FO5A 2VLUA 4KW6A 3HVVA 3L4NA 4OFTA 3TB2A 3IK7A 4TVEA 4KDXA 2KP2A 3M9KA 3IRAA 1GP1A 4YQMA 4BWSA 3ED3A 2VL2A 1XW6A 4NV2A 4F2IA 3F6DA 3KP8A 2AHEA 4MK3A 2IPAA 2FNOA 5F05A 4F0CA 1EOGA 4ML6A 1EV9A 1TRUA 3IAM2 1A24A 2PN8A 3ZIVA 4Q5NA 5CO3A 4TXVA 2JZRA 4PQHA 4TR3A 4WR4A 3P8WA 1HNCA 3O3TA 1ST9A 2AJQB 1JZDA 2BJXA 3F4RA 2GDRA 3RPNA 4DSSA 2YWMA 4MH2A 1N8JA 4RI6A 2CVBA 2NTOA 2I9HA 1F2EA 3GIXA 4JR4A 4KUNA 4IP1A 1R7HA 2RLIA 2DSAA 3CRUA 1ZMAA 2X8CA 5DALA 1ZOFA 5GAND 1TI1A 2JSYA 1PX7A 4IJIA 3QAWA 1JHBA 2GSSA 2OADA 2VLVA 3WGDA 3LXZA 5IMAA 3GKXA 3QR6A 4N0VA 1FG4A 1F3BA 1A2MA 1U3AA 2YV9A 1TK5B 3FZAA 4LL4B 4MP4A 2H0IA 4NAXA 2AB6A 3GN3A 2C3NA 5IPHA 5F8BA 2DJJA 3C73A 2V6KA 4HUAA 3ZFBA 3G7YA 2QC7A 5C04A 9GSSA 1SKSB 4PXOA 3W8JA 5GAPD 1SU9A 2E2MA 3KMNA 3IK9A 4MH3A 3KH7A 3KIJA 2PWJA 3PGTA 3M3MA 1OC9A 1EEJA 4KDUA 18GSA 4ID0A 1GTUA 1MD3A 1DE1A 3PH9A 1YKAA 2ZUPA 3FEUA 2P31A 3D21A 3VLNA 22GSA 4IQ1A 4EE0A 2DLXA 4CDOA 4J57E 3UVHA 4OCFA 2D2ZA 2A4VA 5ENUA 3ZYWA 1EEMA 4F9ZA 3M8NA 1NM3A 3LEFA 4HEA2 4F0BA 1EP8A 2K18A 5D9TA 3WGXA 4LLRA 1PQNA 1XOBA 3EU3A 5ECMB 5J3RA 2VM2A 1M2AA 2CAQA 1HNBA 1TKDB 3IXRA 4CW9A 5IM9A 2VCWA 1PN9A 4EDYA 3HKRA 4X1UA 4RI7A 1XFLA 1FO5A 1ZCPA 3GV1A 1Q4JA 5CRWA 2FGXA 3QDNA 4IS0A 3QCPA 2IN3A 3EVIA 4TR0A 5E59A 3PR8A 4E8EA 1TP9A 2VL9A 2FA8A 3H1NA 1QMVA 2XBQA 1UC7A 2B5XA 4N0ZA 2LSTA 3V1WA 5IOXA 1W89A 1XWCA 4LMWA 1R5PA 1ZYEA 4ECJA 12GSA 1T4ZA 4Q5FA 3EMXA 4HI7A 3TKSC 1QK8A 2RM5A 4HQZA 2B6MA 3UAPA 1EZKA 3MSZA 4GLTA 3GH9A 2IMEA 2L5LA 4BWQA 5H5QA 4LA1A 4GCIA 2H71A 4K0GA 2DJ1A 2M72A 5IPGA 1A23A 3BJ5A 2OBIA 3IOSA 4ZB8A 1SYRA 4L8EA 1I5GA 3KTBA 5CP1A 1CQHA 2I3YA 2H66A 4WR5A 1SL0B 4MDCA 3GHAA 6GSTA 2XC2A 2Z9SA 2R5GA 3VWVA 2E7PA 1A0RP 2VCVA 4RUVA 2R3XA 5AIXA 3IC4A 1SJZA 2GGTA 2HSYA 1S3AA 4K7NA 4MPGA 1FW1A 1V98A 4I2TA 3S9FA 2F51A 5G1LA 2DC5A 4PURA 4IGJA 1Z3EA 3RDWA 3D5JA 3UBLA 4BVYA 1TRWA 1PKWA 3R2QA 5B6MA 2B7JA 3DIEA 3P7XA 2GS3A 1WWJA 3FR6A 2HZEA 4WETA 3C8EA 1K0AA 2NBSA 1U6TA 1ML6A 2BTOT 2NVLA 3TKSA 3MWHA 2C8UA 1X5CA 4JBBA 3QFAC 4EC0A 2WRTA 2H6XA 2IFQB 1SENA 3PINA 2PERA 2LQQA 2DIZA 1AUCA 4NWYA 1LBKA 1GUHA 3C1SA 2MBTA 4WXTA 3GMFA 5GSTA 2HI7A 1EGRA 1E6BA 1XW5A 2JZSA 2L4QA 1QQ2A 2GQKA 1O81A 2QSIA 4NHWA 5J41A 3N9JA 2KP1A 3GUSA 2WULA 3UOMA 2X8HA 2L5OA 3GURA 4ZL8A 2H19A 4XTSA 1Z7RA 1SL1B 2VM1A 4JZQA 3Q74A 1SYXA 3F6FA 5D9WA 1GSUA 1NHYA 3E0UA 1V9WA 1F37A 5HFGA 3I9V2 2MMOA 1RW1A 4GQCA 5EL8A 1GLQA 2VLTA 5DJMA 2C3QA 2L57A 1R5AA 2G0FA 2CT6A 4LL1B 1GSFA 3UARA 3APOA 4PNFA 4XCSA 5ECHB 4K8MA 4FYUA 4ZL9A 5D96A 1WP0A 1YJ6A 3D22A 1T3BA 5ID2B 1M2DA 4I6XA 1RK4A 3ZLPA 1SD8A 2H75A 3L78A 3FR9A 2H70A 3ZVJD 3HYPA 4HZ4A 1C72A 3APQA 5E4WA 3H93A 4K0NA 1OYJA 3WT1A 2C0EA 3SBCA 3APSA 3IDVA 2VL2C 2OE0A 2ES7A 4YAPA 1FAAA 1Y6EA 3FZ4A 1PX6A 3DGQA 3LQ7A 1AQXA 3DXBA 1K0OA 3GTUB 2FCHA 1Z7PA 5CAXA 4IVFA 3GKNA 2R2JA 4AJ6A 1TRSA 3Q18A 1SKRB 5IMCA 16GSA 1B48A 3RHBA 4MLYA 2PU9C 1GUKA 3U6VA 4ECCA 2IWTA 1BG5A 3FR3A 3E3EA 3GL3A 2C0DA 2M80A 2NPBA 1SK2A 1SL2B 5DDLA 1HYUA 1MDKA 1GL8A 2MMAA 5IOWA 2GLRA 3KXOA 3GFKA 4D73A 5L71A 4NV5A 2C3TA 2YOIA 3CTGA 4DEJA 3KM6A 1TRVA 1GH2A 2YWOA 3TRQA 3ME8A 1K0BA 3TRPA 2JSZA 2P5QA 2OE3A 2F3MA 2IMDA 5CYYA 3E9JB 2AV4A 5DBQA 2WCIA 3VWXA 3HHVA 1GRXA 1SK1A 5B8AA 4DSSB 1XW9A 3N5OA 5A4UA 1OKTA 1B4QA 2LKUA 1MDJA 5F06A 5HR2A 5F0GA 3K8NA 3BD2A 1QXHA 2RUFA 1B8XA 5DALB 2VO4A 1FB0A 2F8AA 3F4SA 4V1Ap 1BJXA 4GQFA 2B3SA 1MTCA 4GRFA 5B8BA 4WF4A 4PNGA 2H6YA 2PBJA 2H72A 2YNXA 3LYKA 3TKSE 3NIVA 2LRCA 1GWCA 4IJ3A 3D0ZA 4DSQA 1A0FA 4MMMA 4G9HA 4IP6A 1WE0A 4AGSA 1A2JA 3TJFA 3G7JA 3LJRA 2X8GA 3I6AA 4ZBAA 20GSA 2AYTA 5JCUA 3M1GA 2DMLA 1GSSA 1SJ6A 1XVWA 3TKPA 4HU9A 3TJGA 4ACSA 1AW9A 4EO3A 3ZFLA 3CSHA 2XBIA 3HY2A 5LNKe 3A2WA 1T8EB 3CRTA 4KCAA 2FWEA 2PVQA 1OC9B 3GX0A 3GSSA 5G5FA 2C0FA 5G5EA 1BEDA 2XHFA 1YF0A 3VURA 1WPIA 4HDEA 1GTIA 4F03A 4OFMA 4MABA 5ECRB 1GSYA 2HYXA 1KBNA 4QQ7A 4AJ7A 3ERFA 2WGRA 1JLWA 3WGEA 1WJKA 3GL5A 2ON7A 2YP6A 5COHA 1SKWB 4PQIA 4EKZA 2A2RA 1ERVA 5A4VA 1QUWA 4MCUA 1G7EA 1TJDA 1Y25A 2MYGA 1MD4A 3H8QA 4MZWA 5AIVA 3G7IA 3Q6OA 1OE7A 4GSNA 3Q19A 4EL1A 6GSUA 4X0XA 3EC3A 3P2AA 1XZOA 2YJHA 5HR3A 2WZ9A 3UIWA 1J9BA 4PUAA 1XWAA 3RHCA 3NOFA 3ZVJA 3KCMA 4BVXA 4L5OA 3HJPA 3TGZA 4PQ1A 1FB6A 4XS4A 2DJ2A 2HXKA 5ECOB 4EUYA 4J2FA 1SJIA 4MZCA 1ZYQB 3KD0A 3GSTA 3F8UA 4F82A 1WOUA 4K7OA 4ECBA 3DEXA 4YQUA 3GA4A 5IQYA 4OCEA 4G19A 2O89A 1USBA 1HD2A 2FWGA 4MJBA 2TIRA 2IMFA 2H30A 1TU7A 4IELA 1GSEA 4ISDA 1Z5YE 2O8VB 3QAVA 3HD5A 2DMMA 4J56E 1T1VA 4N10A 2HE3A 2LV3A 4I97A 2H6ZA 4YQVA 4ILFA 1BAYA 2WJUA 1AIUA 1O8WA 3RPPA 5DQYA 6GSWA 2B5YA 2AUVA 2YWIA 1IYIA 3WD6A 3ZZXA 4PUFC 5ECKB 1VF2A 2J9HA 1G6WA 3HXSA 3AY8A 2LUSA 2KHPA 3M0FA 1EP7A 3ZRDA 1JZOA 2X99A 2N5BA 4NPBA 3MDKA 3GRXA 2GQMA 5FWGA 2VAFA 1GSQA 3BBYA 1THOA 5HQPA 2H01A 1KTEA 5D73A 11GSA 4IBPA 3FKFA 2AAWA 2RM6A 4XRDA 1K0NA 1O73A 1VF4A 1GTBA 4EVMA 1ZZYA 2XPEA 3U5RE 4MF5A 1THXA 1ERUA 1XWGA 5FHIA 2ON5A 14GSA 3IAS2 3LYPA 2VUPA 4WBRD 5EY6A 2LJAA 1XVQA 3CBUA 3KGKA 4KSOA 4EF0A 5DCGA 2R4VA 1HNAA 1TI3A 1FVKA 2HZEB 1SD9A 1M9AA 2KOKA 5DCHA 3F4TA 3RBTA 2VOCA 1KNGA 4HU7A 4TN8A 2OE1A 1M99A 2YANA 1OVNA 3EU4A 1M9BA 3A5WA 2L4CA 1H75A 2PPTA 2MMNA 1S3CA 2YZUA 2GVPA 4MF6A 1K3LA 1B9YC 3VPTA 4AJ8A 3TKQA 2LNTA 3QMXA 1V58A 3IE3A 3LGCA 2V32A 2LRTA 3FHKA 3DD3A 2B7KA 4BPYA 5LCZA 10GSA 4NXIA 3TDGA 1YEXA 1M7TA 2IMKA 3DWVA 2I4AA 4HZ2A 2B1KA 3FK8A 4FIWA 1QGVA 2YPMA 3TKRA 1VRSD 1SK0A 4HQSA 4MF7A 4GSSA 5CRDA 2CX3A 1VF1A 4CHSA 3HVXA 2EIRA 3F9UA 1U3IA 3HCZA 1TXXA 4ZB6A 5INYA 4ZILA 1AAZA 1VGLA 1YDKA 4V1Ag 3HA9A 1ZL9A 4TXOA 3ISOA 2YCDA 1TW9A 1NSWA 2V41A 2OKAA 3VWWA 1FOVA 2MBSA 1F3AA 4FYCA 2JADA 3TJBA 5JCWA 2VD0A 1PRXA 4OD7A 2KLXA 2F9SA 1NHOA 2EIQA 2FUG2 4TR1A 5IMZA 5CRGA 3EINA 5KEJA 2JACA 5KN0A 4O92A 3ZREA 1Z6NA 5DQSA 4ZL7A 4KCEA 5C00A 1XBSA 2H1BA 1BYEA 2H8LA 2DJ3A 1QFNA 3ZMLA 2C80A 1YKCA 4GSTA 1BQ7A 2LJRA 5CNWA 3TUEA 3C7MA 3MAKA 1M0UA 1WMJA 3FZ9A 3TOUA 1DBYA 4WKWA 3UVTA 2KUCA 1DUGA 4FH8A 4JE1A 4Z7XA 3BCIA 5J9BA 3BCKA 4D73B 5CREA 3W8SA 1X5EA 1PD21 1LU4A 4ZB9A 4H86A 1TK8B 4ZIJA 4HJMA 4QL9A 5IMVA 3LFLA 4PGTA 5DAKA 2HNLA 4P3YB 5EPFA 2O87A 1XWBA 4RQXA 5D9VA 1GNWA 3KP9A 2E2GA 2R6KA 4ZXGA 1GUMA 2WS2A 2YN1A 5J4UA 4IN0A 5AISA 2GZYA 3ZIJA 4OO5A 5B6NA 2MMZA 4JR6A 2ZCTA 1O8XA 3HVSA 1TTZA 4GF0A 3FW2A 1YQ1A 5HR0A 4K2DA 4WF5A 13GSA 1Z6MA 3M9JA 3UL3A 1ERTA 5DVBA 3QD9A 1ILOA 4I2UA 3GYKA 1EWXA 1G0TA 4IW9A 4BL7A 4L5LA 2RIIA 3LG6A 1FHEA 2HZFA 5JWRB 1Q98A 1GNEA 1FVJA 2YWNA 5JWQB 1AXDA 5IO2A 3OR5A 3RAZA 4KX4A 2K6VA 3FZ5A 2GZPA 2GSQA 1XIYA 2LTKA 5ELGA 3LWAA 3LXTA 2REMA 6GSYA 1WRYA 1G7OA 3HZ4A 2OJLA 1TDIA 1DSBA 4MJCA 1YEPA 1OC8A 2MZCA 4JEDA 5JCGA 3L0HA 1ON4A 3P90A 2C0GA 3A2VA 3WT2A 2OA7A 2VCXA 1URMA 2H0GA 4ZBDA 2QKEA 1K3YA 2TRCP 2GSRA 1PGTA 1MDIA 2F8FA 3GKMA 1V40A 1PL2A 1JFUA 3KEBA 5J9CA 2I81A 3EE2A 4GXZA 2HRNA 4KSMA 4GTUA 2QGVA 3NZNA 6GSVA 5D8IA 2CV4A 1XXUA 1M2BA 3IV4A 2LS5A 2FD3A 3O76A 2JL4A 2X64A 5IO0A 3FYGA 5LD0A 1U88A 4XS4B 4KA0A 4RQRA 5KN2A 4KH7A 4MA9A 1JZWA 2A2SA 3EURA 2CZ2A 4JU5A 2FA4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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