5IMAA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f2
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 48
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imaA00
3PGTA 1TDIA 1XFLA 5G2ZA 4MJAA 2FA4A 1GSQA 3NIVA 3ZL5A 4YAVA 3GN3A 4HEA2 2X99A 1V2AA 3IXRA 4IQAA 4JR4A 2B3SA 4WEYA 3FKFA 4TXOA 2VL9A 1M2BA 2VAFA 2LQQA 4H86A 2I1UA 1H4OA 1A2JA 1OE7A 4DSQA 4KUNA 1Z7PA 1V57A 2YWNA 5GZZB 1SU9A 1HD2A 3UIWA 2F9SA 5LCZA 2L59A 3TRXA 1Z7RA 5IMAA 5ECHB 3E9JB 2HT9A 2GSTA 1NHOA 1YJ6A 3TRQA 3VWUA 1SJ6A 1Z6MA 5KN2A 1VF1A 3F6FA 4L5LA 3ZLPA 3DGQA 2WGRA 2OKAA 5B6MA 4O92A 1OYJA 1O6JA 3DXBA 4J56E 1XBSA 2CVBA 3MNGA 1K0OA 1QQ2A 4KDYA 1MDIA 4JRRA 1OC3A 3N5OA 3FZ4A 4JEDA 2PVQA 2GSSA 3H1NA 4FYBA 3U6VA 3M8NA 5AIXA 1C72A 2FGXA 2VIMA 3CXGA 1FB6A 3TCOA 1XWCA 1SYRA 4IKHA 3FK8A 2I81A 1USBA 4I97A 3LYKA 4MF7A 1FB0A 3LJRA 1PGTA 1JLWA 3UBLA 2L4CA 2LJRA 2H0HA 1B9XC 4I8BA 5B8BA 5D9TA 1SKSB 2QGVA 1PD21 2GS3A 3VURA 2GZPA 2FWFA 4O7HA 4Q5QA 1URMA 3L0HA 2DMMA 2OBKA 2QSIA 1SYXA 1TRVA 3KH9A 2LKUA 3F3RA 3NZNA 1U88A 2DJ0A 5E4WA 1GL8A 3ZVJA 2V32A 1AIUA 1ON4A 2HFDA 2YJHA 4GQCA 1UA5A 3C1SA 4AGSA 1TK8B 1XOBA 2G2QA 3CTGA 1BYEA 2GLRA 1UN2A 2P5RA 4TVEA 1Z5YE 1M9AA 1X5DA 2N5FA 1K0AA 3CBUA 1AUCA 3O3TA 4WR5A 3VWWA 5IPGA 5IOXA 2H1AA 1OC8A 5KN1A 3GSTA 1GTAA 3D4TA 1M7TA 3D6IA 2H73A 3TB2A 4ZXGA 5C04A 4EVMA 20GSA 4PQHA 2VLVA 5ECOB 3QAWA 2O85A 2RLIA 2LJKA 3TKSA 5CNWA 4CDOA 4MPFA 5FHIA 5AGYA 4F0CA 1QXHA 2WZ9A 1ML6A 4HOJA 3TKSC 4FH8A 1BQ7A 4HI7A 2HSHA 4MP4A 2R4VA 4FYCA 4TR1B 4AJ7A 5CRDA 2VM1A 1W89A 2CQ9A 3E3EA 1TXXA 3KJYA 4HZ2A 1QFNA 3D4MA 3G7IA 2EIOA 3QPMA 3ZVJD 3HY2A 2LNTA 2VM2A 1YQ1A 4J57E 4NAXA 4ID0A 2X8CA 1SK2A 1SJZA 3QR6A 4G10A 2C1YA 4IN0A 4IGJA 2HRNA 3CRUA 4X0XA 3ZZXA 4F0BA 13GSA 4GWRA 6GSWA 1W4VA 2YNXA 1X0RA 1F9MA 1PL1A 1B8XA 2V41A 1T4ZA 2DBCA 3GV1A 4CHSA 1NHYA 4NWYA 4ULXA 4DVCA 3O76A 1N2AA 4KGIA 1CQGA 3GH6A 16GSA 3Q6OA 3GFKA 2H74A 5CO3A 1KEBA 4BPYA 1K0DA 3APSA 4HS1A 4EC0A 5DQYA 1HNAA 3TJFA 2YZUA 1NSWA 2P31A 1DSBA 2CA8A 2AAWA 2VO4A 1KTEA 2CAQA 2HLSA 4MZCA 3LFLA 4G9HA 3HZ8A 4N10A 5ID2B 4XS6A 1NW2A 2IMKA 1LU4A 4I6XA 1K3LA 2C4JA 5D9VA 2IL3A 4NHZA 4K0NA 1GULA 4XS1A 5D9WA 1A8YA 1QK8A 4HUAA 3L4NA 2AB6A 3F0IA 1XXUA 1SL1B 4OD7A 4EDYA 2F51A 5B8AA 3APQA 1XZOA 2H70A 3IK9A 3KP8A 3GX0A 1MEKA 3F4SA 2GZYA 4DSSB 1JZOA 2WULA 3WT2A 3LORA 3US3A 3QCPA 1EEJA 4OFNA 2IMDA 3LXZA 5EPFA 3EURA 1OKDA 5GAPD 1S3AA 1UC7A 2H19A 1QMVA 4PUFC 3ZREA 1B9YC 1RW1A 6GSYA 3H93A 2HI7A 5CRGA 3VK9A 4TR4A 2IPAA 4TKYA 3HYPA 3TJGA 2PVOC 2R6KA 3RPPA 1VF4A 2IFQB 4PNGA 2MMNA 2WB9A 11GSA 1S3DA 4RI6A 2M72A 3G7YA 1HQOA 4EUYA 4XIHA 1FO5A 2VL2C 4DSSA 3AY8A 2H1BA 3TJJA 5E59A 2R3XA 3H8QA 4ZL7A 3F4TA 3H4KA 1TP9A 3P90A 2QKEA 4GF0A 1FW1A 1Y25A 2O87A 3PH9A 3LXTA 1EGRA 4IP1A 3GKMA 5HQPA 4MLYA 5DAKA 3I43A 4KA0A 3L9UA 2VCTA 1V40A 1G6YA 4MDCA 2E0QA 2KHPA 3KP9A 2DMLA 4BVYA 1ZCPA 4RI7A 1J9BA 3MDKA 2PPTA 1XW6A 2B7KA 1ZGNA 1O8WA 4K7OA 3KM6A 5CP1A 1OC9A 4LL4B 5CRWA 5G1KA 5J3RA 4IJIA 2B1KA 1WJKA 1EGOA 3HCZA 1TRUA 4BL7A 4MF6A 5IMCA 4IW9A 4ZIJA 4TRXA 1TRWA 4FYUA 2VUPA 4WF5A 1YF0A 2JSYA 2CX3A 2DLXA 3GURA 1GSFA 1O8XA 1ZYQB 3F3QA 4MMMA 2RUFA 3VWVA 1N8JA 5ECKB 5ECLB 2CX4A 3GH9A 5JCUA 2N5BA 1E2YA 4MK3A 9GSSA 3EVIA 4TXOB 1SKWB 1E6BA 3OR5A 3BD2A 3UL3A 3DIEA 5F8BA 1SENA 1ST9A 2HZEA 5KN0A 1M99A 2H0IA 3O6TA 2FWEA 3LG6A 1SKRB 2L6DA 2C8UA 1PN9A 4HU9A 1XOAA 5IMZA 4OO4A 4PXOA 1EV9A 1R5AA 3W8SA 1TKDB 1M2DA 4K2DA 1XCCA 4YAPA 2IMIA 1F3AA 2CAIA 4AF2A 2K18A 3H79A 3MSZA 1PX6A 2IJYA 3FR9A 2HZFA 2PWJA 4ECCA 3KCMA 5ELGA 3F9UA 5HR1A 4AJ6A 5EVOA 2OJLA 2K8VA 4LA1A 3GIXA 5H5RA 1T8EB 3KGKA 5JCGA 3ZTLA 2C0GA 3GKNA 4POBA 4CW9A 2VCZA 5HFKA 4EDZA 3U5RE 5HFIA 5ECPB 1ERUA 2DSAA 1TK0B 5HR3A 4OMVA 3UARA 1GLQA 3EU3A 2R37A 3KZQA 5ELAA 2NPBA 4OCEA 5D9XA 2RM5A 1ILOA 4TXVA 3IAS2 1YEXA 1ZZYA 1TW9A 3RDWA 3R2QA 22GSA 1A0RP 4ISDA 3LQ7A 1AQXA 5FWGA 3GA4A 4F9ZA 2KP1A 3I6AA 1X5EA 3EMXA 3ED3A 4JBBA 4HU7A 3SBCA 5J41A 1DE1A 5JCWA 1ERTA 2V6OA 3TKSE 1O73A 2B6MA 2MBSA 2CV4A 2EIRA 3C71A 4KE3A 3ZYWA 1F37A 3TKQA 6GSVA 2DIZA 1MD4A 3KMNA 1U6TA 2IIYA 4NHWA 2KLXA 5IM9A 2GVPA 1PL2A 2DJJA 5HR2A 2X8HA 4IQ1A 1SD8A 3IHQA 3GL3A 4J2FA 3W6GA 2GSRA 4GLTA 4BWSA 4HZ4A 5D96A 1VGLA 4YQUA 2MMOA 4TR0A 3CTFA 2IMEA 1V98A 2VL3A 3KH7A 4XRDA 5DVBA 3Q18A 1MD3A 2FA8A 3RHBA 2JZSA 3ME7A 2WJUA 2FWHA 5B7CA 2H0GA 3BBYA 3DYRA 4N0VA 2WFCA 5ECMB 3GUSA 4LMWA 4POKA 3A5WA 2OACA 2J9HA 1EV4A 2EC4A 3Q74A 1R7HA 1THOA 2DJKA 17GSA 2NDOA 1OE8A 1WMJA 3FR6A 1DUGA 3GHAA 1JZDA 1GUHA 4L8EA 1CQHA 2YP6A 3HVVA 3TGZA 4I5QA 5C00A 2F8AA 5F07A 4HJ2A 3HA9A 1YZXA 2JADA 2HSYA 2PBJA 4EO3A 5DBQA 4MABA 2N5AA 4MPGA 1XIYA 1PKWA 3HD5A 2PGTA 3EE2A 3IC4A 5ECNB 2LJAA 3TKRA 1Z9HA 3FW2A 4WKWA 1WWJA 1VRSD 2WRTA 1SJIA 3GKXA 1K0BA 4MJBA 2MMZA 2IN3A 3ZITA 4PNFA 2RM6A 5LD0A 3UBKA 4E8HA 3QDNA 3ZRDA 4V2MA 1S3CA 2YV9A 3WGEA 2KP2A 1A0FA 3HKRA 2YN1A 2WS2A 3KEBA 3IBHA 1ACVA 2I4AA 1X9SB 4NXIA 4TN8A 4V1Ap 1EOGA 4BVXA 3GSSA 3EU4A 4NMUA 3IAM2 1UVZA 4NPBA 3RAZA 2HRFA 3IE3A 1ZOFA 2O89A 2Z9SA 4LL1B 1HYUA 2P5QA 4ZB6A 1GUKA 1G7EA 2BJXA 2DJ3A 3QAGA 1GTIA 4FO5A 1EZKA 3M9JA 2GQMA 3APOA 3HZ4A 4JR6A 5DCHA 4KAEA 4PURA 1GUMA 5D73A 2H6YA 2AV4A 4PGTA 4XS4A 1TI3A 2R2JA 1U87A 2M46A 1FAAA 1T3BA 3QFBC 4F82A 5A4VA 14GSA 2E2MA 3EC3A 1B4PA 3M1GA 1PSQA 2TIRA 1F3BA 2RUEA 5GAND 2L4QA 1SD9A 1I5GA 1YY7A 3VFIA 1SL2B 3ZIVA 4MCUA 4JZQA 1LBKA 3GRXA 5ENUA 4NV5A 1PMTA 3HJPA 3ZFBA 2VOCA 4MA9A 1FHEA 1KNGA 2AJQB 5KEJA 2F8FA 5H5QA 2DJ1A 4GTUA 4L0UA 4GCIA 3FY7A 3F6DA 2CVDA 3HHVA 5B6NA 2LRNA 5DAKB 4K6XA 1J08A 2YOIA 4KCEA 2OE1A 2TRXA 3GYKA 3ISOA 3L9VA 2AHEA 2B1LA 5ABRA 4ILFA 2JL4A 3ZFLA 2VCXA 3EWLA 4L5OA 2YV7A 2E7PA 1OC9B 2ON7A 1Y6EA 1DE2A 3GX8A 4JU5A 4ZBBA 1PKZA 4FIWA 3L9SA 5JWOB 4N30A 3FZ9A 3ME8A 1EEMA 2XPDA 2LRTA 4O5RA 3HJMA 3HJOA 4QL9A 1G7OA 4ECJA 5DJLA 2XC2A 3KTLA 4XHMA 2X8GA 5ECSA 1GSYA 2XHFA 1T1VA 5INYA 5GSTA 4OWYA 1HNBA 4P3YB 5DCGA 3FZ5A 2LUSA 2FNOA 5IMFA 3VWXA 1AW9A 2LEGA 5G31A 1FOVA 5COHA 1AQWA 1XWAA 4TW5A 1YDKA 4LMVA 5IIZA 3E0UA 3QOUA 4Q5RA 4WBJA 1M2AA 1GTBA 3LWAA 3A2WA 1I9DA 1XVQA 2HZEB 1SK0A 4EF0A 5ECRB 5DALA 2VCQA 4G19A 2VLTA 4KDXA 1ZMAA 2CZ2A 3D22A 5DQSA 4RQXA 4GSSA 3NOFA 3VPTA 3CSJA 2B5XA 3EYTA 3I69A 2LV3A 3TKPA 3KTBA 3QD9A 2XBQA 7GSSA 3IDVA 2H76A 3BJ5A 2HYXA 2HXKA 3DMLA 1FVKA 4IBPA 3UMAA 4OFMA 2OADA 4K9ZA 1A23A 1M9BA 5G1LA 2GDRA 4KX4A 3DEXA 2K9FA 2F3MA 3KXOA 4POMA 1XWGA 2LS5A 1RK4A 4V1Ag 3GTUB 1GNEA 1TJDA 1O85A 1XWBA 1FVJA 1K0MA 4QL7A 2BMXA 1JFUA 1TU7A 8GSSA 3LGCA 4O32A 4WR4A 4HQZA 2B7JA 5KN3A 2QC7A 5H5SA 4OFTA 3ZMKA 2C3TA 2H66A 3ZMLA 1YF1A 4MH3A 3IOSA 1TRSA 3CMIA 3KIJA 4KNDA 5JWQB 2GT6A 1WP0A 2VD0A 1EP7A 1BEDA 4K7NA 10GSA 2PU9C 5AISA 2H30A 1SK1A 1XW9A 1AC1A 4GQFA 2FY6A 5CYYA 3C1RA 4ZL9A 3EMPA 1MDJA 4IP6A 5D93A 4NV2A 2JZRA 2OBIA 6GSTA 3VI7A 2PERA 3QAVA 2NTOA 2DJ2A 3GTUA 4EL1A 2PUKC 1IYIA 2JZTA 3F4RA 1R4WA 3N9JA 1TOFA 1GRXA 4XTSA 2G0FA 4D73B 2C0FA 4JE1A 1MDKA 2FLSA 2VLUA 1OVNA 3LSZA 4ECBA 2DIYA 2J23A 3RPNA 3DD3A 4GRFA 3RHCA 1JHBA 4WBRD 1XWKA 5IMVA 3KD0A 4HJMA 1K3YA 1WE0A 1ERVA 5EY6A 3TUEA 4I2UA 4K7IA 5J4UA 3P8WA 2HNLA 2FHEA 1TK5B 1GH2A 2GT5A 4OO5A 4ZBAA 2C0EA 2ZUPA 2I9HA 3MAKA 2YJ7A 2IWTA 2K8SA 4DSRA 1M0UA 2C80A 4D73A 2ES7A 1GP1A 1F2EA 1GSEA 1IYHA 3BCKA 1T00A 2TRCP 3HDCA 4KSOA 2XPEA 4POLA 3TJKA 2OE3A 3IPZA 2IMFA 3VLNA 5A5KA 3BCIA 3C8EA 1XVWA 1X9WB 3Q19A 3UVTA 1TU8A 5IMDA 2JACA 4YH2A 5G5EA 1PQNA 4PUAA 2C0DA 3A2XA 4ZB8A 4WETA 3M3MA 4I2TA 3FZAA 3A3TA 3MWHA 12GSA 4GXZA 3D21A 4IHUA 3M9KA 3TRPA 4WF4A 3LEFA 2VCWA 2ZNMA 4ZB9A 1HNCA 3ERFA 1ZL9A 5LNKe 1V58A 1YKAA 4KDUA 3DKSA 3M0FA 2H75A 2OE0A 3DVWA 4Z7XA 1JZWA 2WDUA 4EKZA 3HVSA 3RBTA 2BTOT 1YKCA 2LTKA 2PN8A 2K6VA 4MH2A 1XPVA 1WIKA 4IS0A 3FEUA 2RIIA 5J5NA 1GSDA 3LYPA 1VF2A 1OAZA 3D5JA 4EXJA 3PINA 5IPHA 1FG4A 1KBNA 4N0ZA 4G2EA 1SL0B 4F03A 1R5PA 1G6WA 3UVHA 4XRAA 1Z6NA 2M80A 5EL8A 3GKKA 5ECIB 3TDGA 2PMTA 5D8IA 4F2IA 4V2LA 1TI1A 1JLVA 2MZCA 3ZIJA 5HR0A 4YQVA 4HDEA 1THXA 2JSZA 4KB3A 2CT6A 1YEPA 4XS4B 3CRTA 4GSNA 2D2ZA 2KUCA 2LSTA 3GNJA 5DJMA 4ML1A 3IRAA 1U3AA 4ZBDA 3IV4A 5F06A 1ABAA 3F8UA 3L78A 4TR3A 1DBYA 1T4YA 2YANA 2FCHA 4TR1A 3KMOA 2CVKA 5IQYA 3GL5A 4Q5FA 1WRYA 2L5LA 3V1WA 1LJRA 1Q98A 2NVLA 2REMA 2XBIA 3FRCA 3UAPA 2HE3A 1K3OA 3P7XA 5DDLA 2A4VA 4K1FA 1Q4JA 4N11A 4GSTA 3D0ZA 2VCVA 1B48A 1GSUA 2LRCA 3F63A 1TTZA 2LQOA 4IELA 5G5FA 2C3QA 1F6MC 3S9FA 1U3IA 1AAZA 1XW5A 2O8VB 3J7Yb 3JCML 4YQMA 5GSSA 4MJEA 3DRNA 2AUVA 5G30A 1QUWA 2ALBA 3WGDA 1A8LA 1G0TA 2V2GA 1VF3A 3HVXA 4IJ3A 2GQKA 1GNWA 4PQIA 2L5OA 3UOMA 1PA3A 4AJ8A 2CZ3A 4PQ1A 2GTUA 1PRXA 2GSQA 5CRHA 1EOHA 6GSUA 2WCIA 3FHKA 2YWMA 6GSSA 4KH7A 1WPIA 3DVXA 2FD3A 4RQRA 2H1GA 19GSA 3HXSA 2KOKA 4KW6A 4Q5NA 3WYWA 3BOAA 3TOTA 4XCSA 2H71A 4E8EA 4HQSA 1EWXA 3DWVA 3I9V2 4X43A 2H6XA 5L71A 6GSXA 5ID2A 5AIVA 2MYGA 2OA7A 1X5CA 2A2RA 3GMFA 5IO2A 2MBTA 2L6CA 3J7Yk 2MMAA 4IVFA 3ERWA 1NM3A 3G7JA 1ERWA 1MTCA 1GTUA 2GGTA 5AN1A 2ON5A 2VL2A 2O7KA 4X1UA 1BG5A 3WT1A 4EE0A 2GZZA 1X9MB 2H6ZA 2YZHA 4V2NA 4WXTA 1EP8A 4ACSA 2EIQA 3SWLA 3K8NA 5DALB 1JZRA 4TOPA 4QQ7A 2FWGA 3QMXA 1A24A 1AQVA 4L0WA 1A2MA 1OKTA 1GSSA 2X64A 2DC5A 5A4UA 3VI5A 5J9CA 5CAXA 3WGXA 1RQMA 1T7PB 2VD1A 2FUG2 5JWRB 1ZYEA 4BWQA 1AXDA 4KSMA 5F0GA 2H1DA 2H01A 3PR8A 3ERGA 5CREA 1R26A 1A2LA 4DEJA 5FT3A 2IFQA 3UEMA 2NBSA 3CSIA 4KCAA 4MZWA 2H72A 4RUVA 1WOUA 4ML6A 2AYTA 2H8LA 3VPQA 4MZBA 3IK7A 1Z3EA 4ZILA 3C73A 4ECIA 3G9BA 5A4WA 1GWCA 3IA1A 2V6KA 2C3NA 5ECQB 2P0GA 1K0CA 4OCFA 2YPMA 2B5YA 1V9WA 4LLRA 5J9BA 2ZCTA 3CSHA 3W8JA 4MF5A 3TJBA 2LNSA 2YCDA 18GSA 3C7MA 3WD6A 1J0FA 3FR3A 3QFAC 2JU5A 3FYGA 1GLPA 5IOWA 3CYNA 2B5EA 5IO0A 4K8MA 2GQLA 1QGVA 3TOUA 1B4QA 5HFGA 1BJXA 3P2AA 4MJCA 1BX9A 1PX7A 2YWIA 5F05A 1O7UA 2YWOA 3UJ1A 3EINA 1H75A 2L57A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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