5IMDA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f4
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 51
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imdA00
3RPPA 4PQHA 3GL5A 3H93A 3DXBA 2OBIA 3EC3A 5JWOB 18GSA 4AGSA 1GSDA 2WULA 1TK5B 3F3RA 2B1KA 1QXHA 3O76A 2M72A 2JACA 1QMVA 1XW9A 1YF1A 3DVWA 2GSRA 1GSEA 1CQGA 1O81A 4L5LA 1MDJA 2LKUA 3DYRA 1BYEA 1XW6A 4GTUA 1ERUA 4POKA 4XHMA 2H01A 5KN3A 4RUVA 3W8JA 3D4TA 3GTUA 2RIIA 2YWIA 1QGVA 4F03A 1GP1A 4YQVA 2H75A 2X8HA 3TKSA 1E2YA 1TOFA 1M2BA 1EGRA 2HZEA 3JCML 1GSQA 2CX4A 1OC9A 2XHFA 5J5NA 4MJCA 3EU3A 3A2WA 2FA8A 2H6YA 2RLIA 1AXDA 5DQSA 1K0DA 4IP6A 3IRAA 2FGXA 1U6TA 3QMXA 1MTCA 2VM2A 1B4PA 1NHYA 3CYNA 3EMPA 3HY2A 3F3QA 4ZL9A 4TXVA 1YDKA 4V1Ag 2LEGA 2CZ3A 2ON7A 2GSTA 4V2NA 2LRCA 4ZB9A 4ZBDA 5JCUA 3VPTA 10GSA 2V6KA 1ZYQB 3GMFA 1U88A 1SK1A 4LL4B 4TXOB 5IMAA 1XOAA 3GSSA 4XRAA 1V40A 1NSWA 1SL0B 2R4VA 4OFTA 1FB6A 3O3TA 2FWEA 4GLTA 2MYGA 3J7Yb 5DALB 4KNDA 3GNJA 2H71A 4EKZA 5HR1A 1XWAA 2YN1A 2BMXA 2YZHA 1SYRA 2CQ9A 4LLRA 5D9WA 2I1UA 1Z9HA 3W8SA 1WIKA 2LJRA 4K0NA 1YZXA 5FHIA 2LUSA 1IYHA 1DSBA 3VWWA 3ZFBA 3H4KA 4HDEA 2V2GA 2F8AA 2OE1A 2GZZA 2N5FA 3IR4A 3DIEA 2IN3A 4HS1A 3KJYA 4TR1A 5JCGA 1AQVA 3F63A 3HKRA 3HCZA 1AQWA 4Z7XA 1HD2A 5IMFA 5CRDA 4EC0A 3LSZA 2L4QA 3IV4A 2IWTA 1SKRB 5EVOA 2JZTA 1TU7A 1TK0B 3M9JA 2VCQA 5IMCA 1FHEA 3C71A 4EF0A 4AJ7A 1AAZA 3VWVA 1Z6MA 4WBJA 1PA3A 2OKAA 2TRXA 5JWRB 3C1SA 4JBBA 5IPHA 3ZVJA 1W89A 2B7JA 2GGTA 3GN3A 4ECJA 3ZFLA 1GSSA 1R5PA 9GSSA 4NXIA 4NAXA 1KEBA 3HZ8A 4IN0A 1A2JA 1Y25A 3KTBA 2HZFA 6GSYA 2JZRA 1XW5A 1O73A 2X64A 5GAPD 5ECHB 1Z6NA 1JZWA 4TR0A 5G1KA 1Z5YE 4KW6A 4WR4A 2C4JA 2O7KA 1TU8A 3ZIVA 3EE2A 2M46A 5ECKB 1QK8A 5ECRB 1FVKA 3EU4A 4IJIA 3TRQA 2LJKA 1UN2A 2YZUA 2YOIA 1VRSD 1T7PB 4ECCA 4GRFA 2QC7A 1X9MB 1RQMA 3H79A 1T00A 3NZNA 2F9SA 4H86A 2YPMA 2CVBA 5DVBA 2A2RA 4MP4A 4MJBA 1T4YA 3EINA 2E2GA 3WGDA 3DMLA 3IPZA 4N0ZA 4K6XA 1BQ7A 4NV5A 5HQPA 1M9BA 5B6MA 2V41A 1B9XC 2RUFA 1A0RP 1OC3A 1O6JA 4ID0A 4BWSA 2PN8A 4D73B 3KMNA 1OKDA 4L0WA 3RBTA 4TKYA 4KA0A 3QDNA 4LMWA 17GSA 1SK2A 1PRXA 2G2QA 1J08A 13GSA 1B4QA 4ZB8A 5DQYA 1AQXA 3R2QA 5F8BA 1GUKA 1XWKA 4NV2A 3TUEA 4TOPA 4HUAA 2DIZA 4YQUA 3EVIA 3G7JA 4HU7A 1M2DA 3UVTA 3FYGA 1EZKA 4I97A 2LS5A 4O32A 2VD0A 3HDCA 1Q4JA 4TXOA 5FT3A 3GV1A 4L0UA 3UL3A 4K7NA 3H8QA 3IOSA 2K9FA 1GTBA 3GKXA 1LU4A 3NIVA 2PERA 3FHKA 3CMIA 4GSNA 4F2IA 2FLSA 4PNFA 3TOTA 3M8NA 4N11A 4MDCA 2VLTA 1ZMAA 4GQCA 4IHUA 1JZOA 4MZBA 2B3SA 4TRXA 2PPTA 1MDKA 2B7KA 5ECIB 3EYTA 2C3TA 1SYXA 2FD3A 2WJUA 4MH2A 3C73A 3WT2A 2YNXA 3DD3A 2GT6A 3NOFA 4EDYA 1TRUA 2OADA 4YQMA 5D8IA 1QFNA 4KAEA 3FZ9A 5GAND 2EIQA 2VD1A 2VL2C 3L78A 4OO5A 2XPDA 4MLYA 4FIWA 4MF5A 3U6VA 4DSSB 5GSTA 2O85A 2VUPA 4RI7A 4EDZA 5LD0A 1GLPA 3PINA 4QL7A 3P2AA 4KGIA 4TR4A 4ZB6A 4MA9A 2H30A 1A24A 5EL8A 2LTKA 1E6BA 3M1GA 4MJAA 2VM1A 1O7UA 3AY8A 2H72A 2KLXA 1FAAA 2N5BA 3IAS2 1X9WB 2H73A 2PVQA 2HSHA 4GSSA 1SKSB 4HZ2A 4FO5A 5ENUA 3I43A 5CRWA 3L4NA 1WJKA 4K7IA 7GSSA 1XWGA 3GX0A 4WF5A 1TKDB 5HR3A 3HYPA 2AUVA 2JU5A 1HQOA 5EY6A 4ZBBA 1G6YA 5A4WA 2H1GA 1S3AA 4OWYA 1KBNA 1SU9A 2N5AA 1SD8A 2ALBA 1GWCA 4IKHA 3LXTA 4IS0A 3J7Yk 1C72A 2VAFA 2KUCA 2FNOA 1A8YA 1N2AA 1GUMA 1ABAA 1H75A 1AW9A 3VI5A 1TXXA 2O89A 1XIYA 2IFQB 4YH2A 4FYUA 1AIUA 3D21A 4J56E 3WGEA 1SJZA 6GSVA 2L4CA 1B8XA 2F8FA 4CDOA 3TKSE 4Q5RA 1LBKA 2ZUPA 3VFIA 1K3OA 1M2AA 1GSUA 1ACVA 1JFUA 2RUEA 1MD3A 2F51A 3F4SA 2LNSA 6GSTA 3HA9A 3TGZA 3LXZA 2OACA 1SL2B 2V6OA 1HNCA 2L6DA 2F3MA 3DKSA 2H74A 4AJ6A 1ZZYA 3M3MA 4L8EA 2H1BA 2MMZA 4D73A 3IE3A 3TOUA 4WF4A 2WRTA 2K8VA 5HFIA 2XBQA 4FYCA 5IOXA 3D0ZA 1YJ6A 3LWAA 4F82A 5CNWA 4BA7A 2I4AA 1XWCA 4J57E 2DJ1A 2YV9A 1U3AA 3QAVA 1M0UA 3QAGA 2DMLA 4N0VA 3BBYA 2B5XA 1DE1A 1ZOFA 4KX4A 5B8BA 2EIOA 4LL1B 4ZIJA 1GLQA 3D22A 2CVDA 2LQOA 3LYPA 1FO5A 2C0EA 2DJ0A 1EOHA 3WD6A 4G2EA 4WXTA 1THOA 2H19A 2MMOA 1K0MA 1TI1A 3CXGA 5FWGA 3F9UA 3IK7A 2O8VB 1H4OA 3MAKA 2YJ7A 2P0GA 5C04A 2L57A 2AHEA 3ZMKA 2LV3A 2XPEA 3IC4A 1ZYEA 3F8UA 4E8EA 2JSZA 3DWVA 3UEMA 1XFLA 2H66A 5ECOB 1A2LA 5H5QA 1K0NA 3FK8A 1T3BA 4EL1A 1WE0A 2RM5A 2AAWA 2H8LA 4IJ3A 4OFMA 1Z7RA 4HQSA 4CHSA 2CZ2A 4KCAA 2VOCA 22GSA 3UIWA 5DJLA 3GHAA 4GQFA 1NW2A 2VLVA 1V57A 2BJXA 1K0OA 5KN2A 2JL4A 4WEYA 2YWMA 3VWUA 4PGTA 1X5DA 3APSA 3LJRA 4IBPA 2AJQB 2K6VA 3MNGA 3L9SA 4FH8A 5E59A 6GSWA 5F06A 4DEJA 4XS6A 2B5YA 1XZOA 2AYTA 3F4RA 5ECSA 2GZPA 3TCOA 6GSXA 1SKWB 1R5AA 1EWXA 5J9CA 4MK3A 3A3TA 4LMVA 3CBUA 3UBLA 4GXZA 2JADA 4K2DA 1Z3EA 1TP9A 1XVQA 3VI7A 1BG5A 3ZIJA 2PBJA 4ML1A 1YKCA 3TRXA 2KP2A 2H70A 3F6DA 3GH9A 4PNGA 1CQHA 4DSQA 1SL1B 5AGYA 4XS1A 1ILOA 1BJXA 1WRYA 4XS4B 1YY7A 2C1YA 5G5FA 2PVOC 2H76A 4I2TA 5HFKA 4MZCA 2B5EA 4JEDA 5B8AA 5D93A 4BVYA 2H0GA 1JLWA 5KEJA 4OO4A 1R4WA 4F0CA 1A0FA 1GUHA 2LRNA 4E8HA 5IMZA 1EEJA 3WYWA 2NPBA 1TRVA 5ECQB 2CA8A 2WCIA 1HNAA 1N8JA 4YAPA 3G9BA 1GL8A 2FHEA 5CYYA 3GSTA 1F2EA 4I8BA 2DIYA 2IMDA 4KE3A 1ZGNA 4GCIA 3D6IA 2DLXA 4ZILA 1OKTA 3FKFA 6GSUA 2HNLA 5HR2A 4L5OA 1ERVA 1G6WA 3GRXA 1F6MC 4POMA 2KP1A 1FG4A 4PQ1A 4PQIA 5DCGA 2MZCA 2O87A 6GSSA 3GA4A 4OCEA 4PXOA 5CRHA 4JRRA 1F3BA 1OE7A 2ON5A 4NMUA 1M99A 4X1UA 3CRTA 5CRGA 5IOWA 4KUNA 4I6XA 2EIRA 1A2MA 2XBIA 4NHZA 4RQRA 5EPFA 1VF4A 4JR4A 1RW1A 4JR6A 1XVWA 2LJAA 3A2VA 4ZL8A 2IPAA 4I5QA 3W6GA 4MJEA 2GS3A 5ECNB 3TKQA 4DVCA 3F6FA 5CAXA 3CTFA 2RM6A 2HXKA 1R7HA 3FRCA 2J9HA 2WFCA 2PUKC 4XIHA 2CAQA 3DGQA 2WS2A 2YWOA 1BEDA 1G7EA 3LORA 2REMA 1NM3A 5DCHA 3KP8A 3FR3A 4PUAA 2V1MA 3KD0A 4MPFA 2E2MA 4X0XA 3FZAA 5IMVA 2GDRA 5G2ZA 3TJKA 3CSIA 3Q74A 2DJ3A 4K7OA 3C1RA 1J0FA 1TJDA 2FY6A 3CSHA 5DAKB 3C8EA 1PGTA 4YAVA 4V2LA 3ZTLA 4MCUA 2GSSA 1J9BA 5G1LA 5DALA 4HQZA 2VL2A 4QL9A 2GQLA 4JE1A 3QD9A 2DJKA 2MMAA 2DSAA 3RHCA 3ZLPA 5ELAA 2HI7A 5IPGA 16GSA 5J41A 1YQ1A 2JSYA 2LSTA 2VIMA 2WZ9A 3SBCA 12GSA 2HSYA 4KCEA 4ULXA 3HVXA 2BTOT 2PMTA 5ECLB 2H6ZA 1K3LA 3TJFA 2E7PA 3F4TA 4PX1A 3FW2A 1YKAA 3QFBC 1EOGA 1YF0A 3GKMA 3RAZA 3KCMA 4GF0A 2CVKA 5LCZA 2ZCTA 3O6TA 1O8WA 2VCXA 3BJ5A 3F0IA 4AJ8A 1VGLA 4BWQA 4GSTA 3A5WA 4OFNA 1V58A 1OE8A 1TDIA 1EV9A 3IXRA 3HZ4A 1T1VA 1PKWA 1XPVA 3DVXA 4BPYA 3VPQA 4WBRD 2J23A 4IW9A 4F9ZA 4XS4A 3D4MA 4G9HA 1JHBA 4POLA 5D9TA 2LQQA 3ERGA 3MWHA 3OR5A 4WR5A 2M80A 1GTAA 1UVZA 3HD5A 5GSSA 1DBYA 3L0HA 2HRNA 2XC2A 4N10A 1EP7A 3KM6A 5ELGA 2Z9SA 2IJYA 1AC1A 1MDIA 1W4VA 5DDLA 1A23A 5GZZB 4OCFA 3APQA 4HU9A 1USBA 2QKEA 1X5EA 8GSSA 1ERWA 2H1DA 4IGJA 14GSA 3FZ4A 2QGVA 2VCTA 5IIZA 2NVLA 3G7IA 3PR8A 2VL3A 2EC4A 2VCVA 1MD4A 2HRFA 3MSZA 2HE3A 3GH6A 5J9BA 1SD9A 2FWHA 3E0UA 3UMAA 1G0TA 2AV4A 1F37A 4K0GA 3US3A 5KN1A 1I5GA 5IM9A 3WT1A 5F07A 5JWQB 2P5RA 1GSYA 5F05A 2DBCA 1Y6EA 3HVSA 1EEMA 3FZ5A 3UJ1A 5D73A 3ZL5A 1PD21 1XOBA 1XCCA 4ZXGA 2GTUA 3UARA 1GULA 2C0DA 3HJPA 3GUSA 3N5OA 3GURA 3TRPA 3L9UA 4IVFA 1T8EB 1A8LA 3DRNA 3N9JA 4O92A 1VF2A 3QCPA 5C00A 4TVEA 3CSJA 4TW5A 2QSIA 5AIVA 2B1LA 1FW1A 1PL1A 2GQMA 1B48A 3BD2A 4GWRA 5IQYA 2C80A 4Q5FA 4G19A 4XRDA 1VF3A 2DMMA 1X5CA 3GKNA 3FEUA 1ST9A 1HYUA 2KOKA 1TTZA 3IAM2 3KP9A 1JZRA 3HJMA 3I9V2 3Q18A 1AUCA 2VCZA 2CT6A 1M9AA 1TW9A 5F0GA 4ILFA 5DAKA 3Q19A 2FWGA 5ECMB 3FY7A 2C3QA 1F9MA 2FCHA 5HR0A 3E9JB 4KDXA 2R2JA 3U5RE 5H5RA 3TKRA 1BAYA 2P31A 5L71A 2IMFA 3LQ7A 2ZNMA 3DEXA 3EWLA 5HFGA 1XWBA 5COHA 3E3EA 1THXA 2H0HA 1X9SB 3KIJA 2CAIA 3GKKA 5J4UA 4PURA 3TKSC 3D5JA 1URMA 1IYIA 1PKZA 3UAPA 1FB0A 2IMEA 4QQ7A 3VK9A 1S3DA 1TI3A 2R37A 1QQ2A 2CV4A 4KSOA 2VCWA 2IIYA 1O8XA 4DSSA 4IP1A 2DJJA 1G7OA 1TRWA 2H6XA 4KSMA 5CP1A 1PX6A 4HJ2A 2E0QA 5KN0A 4LA1A 5DJMA 2D2ZA 1EP8A 2L59A 2R3XA 2PU9C 1PN9A 5B6NA 1M7TA 1ON4A 2JZSA 3MDKA 3HVVA 3HXSA 1YEPA 2MBSA 3ME7A 3KH7A 4NHWA 3BOAA 1F3AA 5G5EA 2FA4A 3EURA 2PWJA 4K8MA 5AN1A 4RQXA 2GVPA 3P7XA 5D96A 3KMOA 2PGTA 2HLSA 3WGXA 4IQAA 1ZCPA 2OE0A 5AIXA 3I69A 1K0AA 4ZBAA 4KH7A 2YV7A 1OYJA 1RK4A 2K18A 4HOJA 4PUFC 2WGRA 1DE2A 4O7HA 2X8GA 5A5KA 1DUGA 1ZL9A 1U3IA 3IA1A 2IL3A 2H1AA 3Q6OA 2IFQA 5E4WA 2IMIA 1ML6A 2LRTA 1XBSA 4WETA 3LYKA 4AF2A 1WP0A 3QOUA 4I2UA 1GNEA 2C8UA 3GIXA 3ME8A 3ZITA 1O85A 3H1NA 2NDOA 1XXUA 2VO4A 4OD7A 2X99A 2HYXA 3KZQA 3KH9A 4P3YB 5DBQA 4ML6A 3APOA 2K8SA 5ID2B 3GL3A 1YEXA 1TRSA 2V32A 4EVMA 3PGTA 3K8NA 3M9KA 4F0BA 1MEKA 3KEBA 3QR6A 1GH2A 4IQ1A 2X8CA 2OJLA 3KGKA 5A4VA 1JZDA 2FWFA 1SK0A 2NTOA 1PSQA 4TN8A 3RPNA 3LFLA 4WKWA 1OAZA 2OBKA 1PX7A 3S9FA 4RI6A 5J3RA 3UVHA 3V1WA 4J2FA 4HEA2 1EGOA 1B9YC 1SENA 2H0IA 3UOMA 1FOVA 1V98A 1QUWA 3VURA 1GTUA 1NHOA 1R26A 1JLVA 3RHBA 4ECIA 5CO3A 3QAWA 2TRCP 3TJJA 1X0RA 5D9VA 4N30A 3SWLA 4Q5NA 1I9DA 4DSRA 1TK8B 1GTIA 4MF6A 2MMNA 2R5GA 3IBHA 3ISOA 20GSA 2C0GA 2G0FA 4V2MA 4NWYA 2IMKA 3ZVJD 4K9ZA 2FUG2 3CRUA 4MH3A 1GSFA 3KTLA 3QFAC 3ZMLA 3C7MA 1PL2A 2AB6A 4MZWA 4CW9A 3GTUB 5D9XA 2ES7A 2YJHA 2YWNA 3ERWA 5G30A 3BCKA 2GQKA 4ISDA 1T4ZA 5LNKe 3IK9A 4MMMA 2HZEB 3M0FA 1OC8A 1OC9B 1WPIA 2C0FA 3RDWA 3HHVA 1FVJA 1V9WA 2GT5A 2OA7A 3ZREA 2L5OA 1UA5A 2VLUA 3PH9A 3P8WA 3CTGA 2A2SA 2B6MA 1WOUA 4HI7A 4BL7A 3L9VA 5AISA 4MABA 3LGCA 4KB3A 1UC7A 2WDUA 3ZZXA 4POBA 4NPBA 2A4VA 4HZ4A 1K0BA 4XCSA 2GZYA 2DC5A 5ECPB 1K0CA 5IMDA 4TR3A 2CX3A 3TB2A 4ACSA 2NBSA 4MPGA 2R6KA 4KDUA 2VL9A 2I9HA 5B7CA 3IHQA 4V1Ap 5ABRA 3G7YA 2MBTA 2TIRA 4XTSA 2HFDA 3I6AA 11GSA 1KNGA 1BX9A 2GSQA 5IO0A 2I81A 5CREA 1V2AA 2YP6A 3ZRDA 1ERTA 1HNBA 3TJBA 2L6CA 2HT9A 4BVXA 1K3YA 4EUYA 1SJ6A 5G31A 3HJOA 3QPMA 1LJRA 3VLNA 4IELA 1WWJA 4G10A 4MF7A 3FR9A 1U87A 5INYA 3TJGA 3ERFA 1Q98A 1GRXA 5H5SA 3KXOA 4TR1B 1Z7PA 4HJMA 3P90A 2DJ2A 5ID2A 3ZYWA 2KHPA 1GNWA 4O5RA 5JCWA 2I3YA 3VWXA 3GYKA 5IO2A 19GSA 3ED3A 1S3CA 3TKPA 4ECBA 4EO3A 1WMJA 4KDYA 4ZL7A 2P5QA 3BCIA 1EV4A 3GFKA 4FYBA 3A2XA 4JZQA 1PMTA 4OMVA 4EE0A 1VF1A 4Q5QA 1KTEA 2YCDA 3UBKA 1PQNA 3IDVA 4K1FA 2C3NA 3EMXA 3LEFA 2WB9A 2YANA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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