5IMDA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f4
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 51
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imdA00
3IA1A 3QR6A 4PURA 2MMZA 4N30A 4P3YB 4ZL7A 1GTBA 1T1VA 1F2EA 4N11A 1SJ6A 2FWHA 5G5FA 1HNBA 2HZEA 5IM9A 3ZITA 4KSMA 1TW9A 1Q98A 4NWYA 5ECRB 2ON7A 1ERWA 3EYTA 2B5YA 1BQ7A 5HFKA 1QK8A 1T4ZA 1VF4A 4NXIA 1GSYA 3GL3A 2RIIA 4NMUA 1DBYA 4TR4A 2NPBA 1GH2A 2C0GA 3KM6A 5ID2B 3IAM2 1EV9A 3J7Yb 3N5OA 1ZL9A 5CRHA 1XCCA 2R4VA 1TRSA 5IMVA 11GSA 5HQPA 3IC4A 1O85A 3IRAA 4KDUA 1GLPA 4TW5A 4MLYA 1YEXA 1H75A 4ZXGA 5LD0A 1OC9B 3VWVA 1TRUA 3IR4A 3IXRA 4IS0A 4AJ7A 1LU4A 3O3TA 1NM3A 2IWTA 3HVXA 3TUEA 2DMLA 5AIXA 5HFIA 2YCDA 1EOGA 2NVLA 1DSBA 3VPQA 2FGXA 5EL8A 3U6VA 1AQWA 5AGYA 5IQYA 3EE2A 2F9SA 4NHWA 1K0BA 1T4YA 5KN0A 1N8JA 3GV1A 4Z7XA 2DIYA 4L5OA 1GSDA 4XCSA 2L6DA 4XRDA 4Q5QA 3VK9A 5IMDA 1E2YA 3AY8A 1E6BA 2VUPA 3CRTA 2EIOA 2IMKA 6GSUA 5D73A 4JEDA 5F8BA 1X5EA 4IJ3A 4MMMA 2HE3A 3UMAA 3DVXA 1Z6NA 3VWUA 2HT9A 1PA3A 4RUVA 3SWLA 2N5AA 1W89A 1SJIA 4POBA 2PN8A 5A4WA 10GSA 2C0FA 3L9UA 3LJRA 2DJKA 3QAGA 2H0IA 3ZLPA 2FCHA 1W4VA 3ED3A 2WZ9A 3DRNA 3ZIVA 1XW9A 3GL5A 2YWMA 3J7Yk 2LUSA 3LORA 3TOUA 5CYYA 4EF0A 2JSYA 3H93A 5GAND 2HYXA 1PX6A 1U87A 2CAIA 3ERFA 4TXOA 5A4VA 1GULA 5HFGA 3M9JA 2CX3A 1A2MA 2DLXA 4F03A 1SK2A 1XWAA 4J57E 2VCWA 1FB6A 4WBRD 1XPVA 2RM5A 3C8EA 3KH7A 2K6VA 4K2DA 3KEBA 2LJKA 5KN1A 3LFLA 2PVOC 2FY6A 6GSTA 2VCTA 4HOJA 4AJ8A 4FYCA 5EY6A 3EU4A 4J2FA 1THOA 3IDVA 3LYPA 4K9ZA 2H8LA 4J56E 4HZ4A 3EC3A 2J9HA 2CA8A 3HVSA 2V6OA 4HQSA 4MF7A 6GSVA 2N5BA 4MZBA 3WGXA 1GL8A 3QDNA 1T7PB 2XC2A 5IOWA 1URMA 1XWBA 3DD3A 2LJRA 3DXBA 5CRDA 4K0GA 2B5XA 4YQMA 3ZVJA 2GSRA 1I5GA 4RQXA 4K7NA 3UVTA 3H4KA 3L4NA 1UN2A 4NV2A 1XZOA 4PNGA 2E7PA 1EV4A 3APQA 2OJLA 5ECSA 4Q5RA 2LS5A 5IMAA 2GT6A 4OFMA 3I69A 2IFQB 1U88A 3NZNA 2AHEA 5DCGA 1TU7A 4DSSB 4E8EA 5IOXA 1QUWA 2FLSA 2CV4A 2D2ZA 1XWKA 3RHBA 2L6CA 4TN8A 4JR6A 3APSA 4NAXA 5INYA 3RPNA 5JCGA 1U6TA 2HXKA 1SL1B 5GSTA 3I6AA 1RW1A 3TJBA 4V2NA 5IO2A 3GH9A 3D4MA 3ZFBA 1A23A 5J4UA 1WJKA 1B4PA 1FAAA 4WXTA 2C0EA 5D93A 1X0RA 3DKSA 3GFKA 4V1Ap 1GTIA 5E59A 1ML6A 1NW2A 4EXJA 2HRFA 1O7UA 5CRWA 3PR8A 5A5KA 2YV9A 5G31A 1K0MA 4Q5NA 2QGVA 1ZCPA 3FYGA 4CHSA 4YH2A 3GSSA 3DGQA 1F3AA 1X5DA 1V98A 5G1LA 3KP8A 4EDZA 1Z7RA 1GLQA 1PKWA 9GSSA 1A2LA 5FWGA 2JZRA 2X8HA 5ECPB 2C1YA 3G7IA 4EVMA 3R2QA 2PVQA 3D5JA 1BG5A 4MP4A 5G1KA 2O89A 1SU9A 1BEDA 3I9V2 1WP0A 2YNXA 2HSHA 4H86A 4V1Ag 3F3RA 2JL4A 1EOHA 1NSWA 1K3LA 2H19A 1X5CA 2N5FA 3VLNA 4F0CA 3M1GA 4DSRA 2H70A 2ZNMA 1ZMAA 2AYTA 3ZTLA 4ZBDA 4XS4B 3L9VA 2PERA 1YY7A 4WETA 4HJ2A 5DAKA 4GWRA 1YDKA 4IELA 3KIJA 5KN3A 4POLA 1XOAA 1SKWB 2E2MA 3UARA 3TGZA 3FZ4A 1AIUA 2DJJA 1MTCA 1UC7A 2B3SA 2KUCA 4WR4A 5HR0A 4HQZA 3CMIA 4MPGA 3H1NA 1GUHA 3EINA 4MJBA 1LJRA 3QOUA 2GQKA 2NBSA 2VL2C 4FO5A 1J0FA 4BL7A 1M2DA 4POMA 2AJQB 2HI7A 1Z7PA 3A5WA 3ZZXA 4BPYA 1HYUA 4HUAA 4BVXA 2C3NA 5IPHA 1J08A 1ON4A 2YPMA 5G2ZA 1PN9A 2V32A 4AJ6A 1Y25A 3DEXA 4KW6A 4I2TA 2E2GA 4LMWA 1QXHA 3F63A 2HZEB 2JZSA 2AV4A 3FZ5A 3LXTA 1XW5A 3EMPA 4MF5A 2MBTA 4GSSA 2V6KA 2WCIA 3GH6A 1HNCA 4KDYA 3RBTA 2M72A 5A4UA 3DIEA 1XXUA 2H72A 4WBJA 2VM2A 4MJCA 5AISA 4MZWA 2ES7A 3UL3A 5DQSA 5G30A 1GTAA 1A2JA 3LYKA 4TRXA 3EVIA 3FK8A 2KOKA 3ZMKA 4ZIJA 2LNSA 2YWIA 1K3OA 4MH3A 1YJ6A 4ISDA 1PSQA 2RUEA 4MJEA 2H1BA 1EGOA 3UOMA 2EC4A 2P0GA 3TRQA 2GZZA 4YAPA 4PNFA 3GA4A 1G0TA 2IL3A 1OC3A 3FRCA 4IW9A 1GSUA 1O8XA 2LQOA 4FH8A 3GX0A 3BCIA 1R26A 4HS1A 2FNOA 3C1SA 1ST9A 2YOIA 2ZUPA 5H5SA 2L59A 5DJMA 1OC8A 2RUFA 4F0BA 3K8NA 3UVHA 1MD3A 1JFUA 2PWJA 5D96A 1M0UA 1M99A 2C3TA 1K3YA 5JWQB 1G7EA 4KUNA 1S3CA 3GMFA 1PL1A 3LGCA 2CX4A 3F4SA 2JU5A 2XBIA 3GURA 2I81A 2PMTA 2I9HA 4TXVA 1VF3A 3M8NA 3CSHA 4OFTA 3CSJA 2DJ0A 4MZCA 2VO4A 1F9MA 2VCVA 2H66A 4IJIA 1PD21 3KD0A 4OFNA 1SD9A 4XHMA 2JZTA 4ID0A 1FHEA 2G2QA 1QMVA 1KTEA 4O7HA 2O87A 2IPAA 4OD7A 2VL9A 1ERUA 1JZWA 5F05A 1TK5B 3CBUA 3H79A 1GNEA 1SKSB 2JADA 3HHVA 4K7IA 4TXOB 4WF5A 5IMCA 5DVBA 4Q5FA 3P90A 4IQAA 2YZHA 1SK0A 1OE8A 3IHQA 2HFDA 5J9CA 5FT3A 2DIZA 4PX1A 2OBKA 2ON5A 3ERGA 3HDCA 3IV4A 4BVYA 5DDLA 2HZFA 4XIHA 5DQYA 1S3DA 2A4VA 4QL9A 3BCKA 3LG6A 2LRCA 4KX4A 5CP1A 1X9MB 4O92A 3UIWA 5LCZA 4L5LA 2CZ2A 1TI3A 1BYEA 1HQOA 18GSA 3HJPA 1EGRA 4YQUA 1OVNA 2OADA 2HSYA 3G9BA 4CW9A 3UBLA 3FZAA 1R4WA 1RK4A 3BD2A 3LWAA 1V57A 5ID2A 1M9BA 2B7JA 2YP6A 3ZVJD 5IMFA 3ZREA 1ERVA 2CT6A 1FVKA 1U3AA 4IP1A 1SENA 1AQVA 3UBKA 4OO5A 1XFLA 5IMZA 3I43A 2C4JA 1C72A 4HJMA 1K0DA 3CSIA 3KZQA 4KGIA 5CO3A 1XWGA 2FWEA 5GAPD 3TRPA 1OE7A 2DJ1A 4BA7A 1EP7A 2MMAA 5B8AA 3RAZA 1G7OA 1GTUA 5EPFA 3EU3A 5CAXA 3DYRA 1RQMA 4IBPA 1KBNA 2DJ3A 4LLRA 4G19A 1GWCA 2G0FA 2YWNA 3F8UA 3GHAA 2GVPA 3EWLA 1DE2A 2KLXA 3U5RE 1AUCA 1AAZA 4I2UA 2R6KA 5JWRB 2GSSA 2VLUA 4K8MA 3D0ZA 2MMOA 1F37A 1T3BA 2WRTA 3GX8A 4G2EA 1QFNA 4L0UA 3LXZA 3TKSE 4ZILA 1WRYA 2H6YA 4MABA 1K0OA 1YKAA 4XS1A 4F2IA 3NIVA 3JCML 2H0HA 5B6MA 2WS2A 2QKEA 3PH9A 4ZBBA 2BTOT 2R3XA 3G7YA 4EKZA 1YF0A 2XBQA 4G9HA 4MCUA 2IMEA 3D6IA 3VI7A 3GTUA 4GSTA 1SYRA 1R7HA 4WEYA 4MDCA 1AXDA 1ACVA 1T00A 2VIMA 2IMDA 1MDIA 8GSSA 3TKPA 3KTBA 2GDRA 4GRFA 2WULA 5EVOA 1OAZA 3MAKA 1FW1A 2NDOA 1YKCA 2C3QA 4EL1A 5D9VA 3VPTA 4N0ZA 3GN3A 2DSAA 1V2AA 3LSZA 1THXA 3W8JA 1M7TA 4ZBAA 4KE3A 3D4TA 5ECHB 2GZYA 3TJKA 3C73A 4MF6A 2B1KA 5G5EA 2V1MA 2XHFA 3C7MA 4HI7A 5ECNB 1VGLA 4TOPA 2YJHA 3FR9A 3UEMA 4FIWA 4L8EA 3PGTA 1PX7A 3WYWA 2H6ZA 2GSQA 4BWQA 2OA7A 3HXSA 5HR1A 2F8AA 7GSSA 3TDGA 2GS3A 1TXXA 2VCZA 3E3EA 4F9ZA 1A8LA 2FWFA 2VCQA 4TR1A 2LTKA 1FO5A 2IN3A 1TDIA 1GRXA 4KAEA 4ACSA 1B9XC 3KTLA 1WPIA 1AQXA 2F8FA 4IGJA 3CTGA 4CDOA 1BAYA 2EIRA 4PQIA 1IYIA 2LNTA 2IMFA 2O7KA 3HJMA 3E0UA 1M2BA 5ECQB 1WOUA 3IBHA 4GXZA 4X0XA 1VF1A 3HCZA 3KXOA 5D9TA 1IYHA 3F3QA 3TJFA 1B48A 3HZ8A 1XOBA 3C71A 1EEJA 2VLTA 3HZ4A 3V1WA 5IPGA 5DJLA 2WB9A 5D9WA 2IJYA 2PUKC 4OWYA 2FD3A 2B1LA 5C00A 2LRNA 2ALBA 1OYJA 3MWHA 3KGKA 3NOFA 4ECCA 4ZL8A 5ELGA 4FYUA 1XWCA 3IOSA 4FYBA 2TRXA 4MPFA 3IPZA 2TRCP 1SL0B 3FY7A 4KA0A 13GSA 2H75A 1PMTA 1A0FA 1YEPA 3ME8A 3F4RA 3A2WA 3HY2A 1A8YA 4TR0A 1V9WA 2X8CA 2C0DA 1VRSD 2YZUA 3MNGA 14GSA 3BJ5A 1WWJA 2VOCA 2K8VA 2OBIA 1CQHA 1JZRA 1OKTA 5DCHA 1TTZA 3F9UA 3TKSA 3TJGA 2FA4A 3IK9A 5GSSA 5JWOB 2LV3A 4KDXA 1KEBA 3EURA 3WGEA 1V40A 1O81A 3GYKA 5ECKB 4GLTA 1EZKA 1YF1A 4TVEA 2H73A 2GQLA 2WFCA 3LEFA 3TRXA 5DALA 4XS4A 3HD5A 5CREA 5F07A 2P31A 3BBYA 5ECMB 1WIKA 4HDEA 4IHUA 1MEKA 3GUSA 4PQ1A 1GSQA 2GLRA 5C04A 4BWSA 3IAS2 3HJOA 2AAWA 5E4WA 4JU5A 4MJAA 1XIYA 1F6MC 1JLVA 2RLIA 2H01A 4YAVA 2LKUA 5ENUA 2FWGA 2LQQA 4IKHA 4V2LA 3IK7A 17GSA 2L5LA 4EC0A 5HR2A 3MDKA 2K8SA 2F3MA 4KB3A 1S3AA 2Z9SA 4LL1B 3VFIA 4ZB9A 3DVWA 2VL3A 3IE3A 4O32A 4OCFA 1XVQA 5FHIA 1YQ1A 2FUG2 2H71A 2L4CA 4AGSA 3FW2A 5HR3A 3HYPA 1TKDB 1K0AA 4LL4B 2H74A 4JRRA 4XTSA 4ECBA 1O6JA 2L4QA 1AW9A 3P8WA 3GSTA 3TB2A 3W6GA 3C1RA 2CZ3A 1Y6EA 3QAVA 2OE0A 3KMOA 2HNLA 3ERWA 4GTUA 2FHEA 1SD8A 2JACA 4MA9A 1SJZA 3D21A 4MK3A 2CVKA 2LEGA 4F82A 2GGTA 1QGVA 2R5GA 4ZL9A 4OO4A 4PXOA 1PRXA 3QD9A 4K1FA 2MYGA 3KH9A 4ML1A 3VURA 5B8BA 3CTFA 2HLSA 4D73A 4DEJA 1ZGNA 2IMIA 1JZDA 2VLVA 2YV7A 1UVZA 4X1UA 4GSNA 2I3YA 2DBCA 3ZFLA 3RHCA 3WGDA 4KNDA 4JE1A 3HVVA 3QCPA 3A2VA 1TOFA 1LBKA 3ZIJA 2YWOA 2ZCTA 3KCMA 1BJXA 3Q74A 3F6FA 3VI5A 1Z6MA 1SL2B 2KHPA 4PGTA 1HD2A 2QC7A 1UA5A 4GQFA 4K0NA 1WE0A 6GSXA 2GSTA 1FOVA 5KEJA 1GSEA 2RM6A 2V41A 2HRNA 1B9YC 2LJAA 2GTUA 1O8WA 5CRGA 2REMA 1J9BA 16GSA 1MD4A 1K0CA 5D8IA 2C8UA 2E0QA 3M9KA 1O73A 5ECOB 3BOAA 4KH7A 2PGTA 4HEA2 1R5PA 2M80A 3WT2A 1USBA 2BMXA 5F06A 1FVJA 2IIYA 6GSWA 2A2RA 2MZCA 2L57A 1GUKA 1OC9A 4HU7A 4ECIA 4DSQA 1PL2A 2VCXA 3GTUB 1A24A 2DC5A 22GSA 3TCOA 4JBBA 1TRVA 2C80A 1G6WA 1H4OA 4QQ7A 2LRTA 3F6DA 4KCEA 5KN2A 2H1DA 4GCIA 3TJJA 2YJ7A 1AC1A 3QMXA 5J9BA 3DMLA 3S9FA 3GNJA 4ILFA 4PUAA 1JZOA 2KP2A 1B8XA 1FG4A 3ZYWA 1X9SB 12GSA 3SBCA 1VF2A 5H5RA 5L71A 3QAWA 2CQ9A 1ZYQB 4K6XA 1K0NA 2B7KA 4O5RA 2OE3A 4L0WA 3Q18A 5CNWA 4IN0A 3TKQA 1TK0B 4QL7A 1FB0A 3QPMA 4I6XA 3EMXA 5F0GA 4V2MA 1TU8A 1V58A 4IQ1A 1TRWA 1PKZA 5J3RA 1XW6A 5JCUA 3GKNA 3ME7A 5AIVA 3D22A 1N2AA 4TR1B 3H8QA 1YZXA 4XRAA 4OCEA 2FA8A 4I8BA 4I97A 4PUFC 2V2GA 3TOTA 3ZMLA 1NHYA 4GF0A 4WF4A 1M2AA 4TR3A 3M0FA 1HNAA 1XVWA 1DUGA 3APOA 4WKWA 1SYXA 4EE0A 1ZZYA 2DMMA 5DAKB 3PINA 2F51A 5ECIB 4POKA 3CYNA 4LA1A 3FKFA 1X9WB 3N9JA 1PQNA 3Q6OA 1Z3EA 2XPEA 4X43A 2EIQA 4MH2A 3GKMA 2YANA 1ILOA 3Q19A 2VD0A 2NTOA 2OKAA 2A2SA 2K18A 4RI6A 2YN1A 3KMNA 4ULXA 5J41A 4NHZA 5JCWA 4EO3A 2I1UA 2O8VB 2BJXA 4EUYA 4ZB8A 4IVFA 1JHBA 4NPBA 2H76A 1ZYEA 4EDYA 4E8HA 4XS6A 3UAPA 3OR5A 2AUVA 20GSA 3GKXA 1Z9HA 1JLWA 3DWVA 4N0VA 6GSYA 2OE1A 3M3MA 1DE1A 4G10A 2H0GA 5COHA 2QSIA 3UJ1A 2PPTA 5H5QA 2B6MA 5DBQA 2WDUA 4RI7A 2VAFA 5D9XA 3QFAC 4PQHA 1QQ2A 2H30A 1CQGA 2K9FA 1TJDA 3F0IA 4DVCA 1ZOFA 2VM1A 3TKSC 19GSA 2X8GA 2IFQA 3A2XA 1XBSA 4GQCA 2R2JA 3F4TA 3FZ9A 4DSSA 3GKKA 2AB6A 1A0RP 1GNWA 3RPPA 1EP8A 1GUMA 1Z5YE 1Q4JA 1I9DA 3TKRA 1U3IA 4I5QA 3US3A 2MMNA 2PU9C 2X99A 1SKRB 5DALB 4KCAA 3G7JA 2OACA 3WT1A 2J23A 3W8SA 4K7OA 1ABAA 4LMVA 2M46A 3O6TA 4ECJA 1TP9A 1PGTA 3QFBC 3CRUA 3FR3A 5GZZB 4NV5A 5IIZA 2B5EA 3P2AA 3ZRDA 5ABRA 4RQRA 3FEUA 2O85A 2H1AA 3HKRA 3VWXA 1MDKA 2CVBA 3VWWA 5ELAA 3P7XA 4IP6A 3L78A 1R5AA 2R37A 2CAQA 2I4AA 4KSOA 1GP1A 4JZQA 1EEMA 4OMVA 2H6XA 1F3BA 1TK8B 2L5OA 5AN1A 1WMJA 3KP9A 4YQVA 3WD6A 5J5NA 2H1GA 1G6YA 3HA9A 5B7CA 3RDWA 4HU9A 2JSZA 5IO0A 2WJUA 1T8EB 3A3TA 4HZ2A 1TI1A 2CVDA 2PBJA 2DJ2A 2GZPA 2TIRA 5B6NA 3L9SA 2P5RA 1SK1A 3GRXA 3FR6A 1GSSA 3CXGA 2P5QA 2WGRA 3KJYA 6GSSA 1NHOA 3O76A 2LSTA 1BX9A 1ERTA 3GIXA 3FHKA 3ISOA 1GSFA 4AF2A 3LQ7A 5ECLB 1EWXA 1B4QA 1KNGA 2XPDA 3E9JB 2MBSA 4TKYA 2X64A 4N10A 4ZB6A 4D73B 5LNKe 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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