5IMVA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f6
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 49
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imvA00
4NMUA 3ZVJA 1E2YA 1UN2A 2WGRA 3RHBA 1EV9A 4XHMA 1T4YA 1R5PA 2V6KA 4K7NA 3L9UA 4N0VA 3M9KA 2PVOC 4JR6A 4FO5A 4PQHA 4KX4A 4TRXA 2VCTA 4HU7A 2CA8A 4YQVA 1PD21 5CRWA 1K0AA 2FA4A 2I9HA 3HJOA 4DVCA 3ZLPA 3HVXA 2AAWA 4IS0A 5IO2A 2YN1A 1B9XC 2V32A 4MA9A 4JZQA 2ON7A 4PX1A 5D93A 3TKSC 1OKDA 2H76A 2M80A 2V2GA 4POMA 4TR1B 3QPMA 6GSTA 3APSA 5HFKA 4MF6A 5IOXA 2OE3A 2QGVA 1AQVA 3A2XA 4EVMA 5DCHA 1NM3A 2H72A 3CXGA 3TJGA 2H6YA 5E4WA 17GSA 3E9JB 4WR4A 1TRUA 4ZBAA 14GSA 1KBNA 1X5EA 1N8JA 3P8WA 1T4ZA 1B8XA 2PU9C 1A8LA 2H71A 1V98A 22GSA 1OAZA 4GRFA 5JWQB 4L5OA 5IM9A 3EE2A 2J9HA 1R5AA 3A2VA 3L9VA 4HZ4A 1Z5YE 2FD3A 2JADA 1G0TA 4TXVA 5CNWA 5DAKA 1SK0A 3UARA 4G9HA 1Z6NA 4X1UA 1M2BA 3GX8A 3EU4A 1A2LA 4ZL9A 3KXOA 1YF0A 4ZBDA 1EZKA 5J9CA 5GAND 4X0XA 4EL1A 2F9SA 2G0FA 4K9ZA 4MZWA 3IA1A 2GLRA 2HLSA 1JLVA 5CREA 3ZIVA 1G7OA 1SYXA 3CSJA 1HQOA 4HS1A 3DEXA 3J7Yk 4FH8A 1TRVA 2LJRA 3KEBA 3FYGA 1ZYQB 3CRTA 3ME8A 4RUVA 4N30A 3A2WA 1FHEA 2C0FA 2K9FA 3D22A 3GKKA 1VF2A 4YAVA 16GSA 2JU5A 1Z9HA 3W6GA 3Q74A 3G7YA 1PKZA 1TJDA 1GWCA 1FAAA 2VCXA 1WIKA 3AY8A 1E6BA 3LFLA 2DSAA 1ZL9A 2REMA 1ABAA 3DD3A 2JACA 1DUGA 1A2MA 3O6TA 5AN1A 3F6FA 2LV3A 4N11A 4V2LA 1XBSA 1F9MA 3GN3A 5ECSA 5A4VA 3IPZA 1THOA 1SU9A 1TDIA 5FWGA 3LG6A 3O3TA 2H0IA 1U6TA 2H74A 3UBLA 5GSTA 5ECRB 10GSA 4ECIA 3ZTLA 1W89A 4CW9A 1Z3EA 4N0ZA 4ZBBA 1GUMA 3O76A 2B5EA 2V1MA 2FWEA 4HZ2A 1EWXA 4EUYA 5EPFA 2NPBA 3UMAA 2K8SA 4TR0A 1KNGA 3EINA 2YCDA 1W4VA 2VCVA 3GUSA 1GTBA 4ECJA 5F0GA 1SKWB 2IMFA 1EGOA 1MDKA 2H73A 4GXZA 2CZ3A 1F2EA 1U87A 2YWIA 4FIWA 2C1YA 1GSFA 2XPDA 4WEYA 1ZOFA 2KP1A 3MDKA 3P2AA 5HR1A 3RDWA 2OADA 1LU4A 3TUEA 1OYJA 2VOCA 4EO3A 5ECHB 2WS2A 2WFCA 1EOGA 2HSYA 2H1DA 1GSDA 1PL2A 1JLWA 1WWJA 5DALB 2GTUA 3HVVA 5ECOB 3ZMLA 1M9AA 2PVQA 2CZ2A 4KSOA 2DIYA 2GSRA 4E8HA 1T7PB 2CVKA 5B6NA 4KW6A 3KTBA 1DE1A 3PINA 5JWOB 1XIYA 5B7CA 4OCFA 3GYKA 1TRSA 3HHVA 4OO4A 1SYRA 4KNDA 2LNTA 2QSIA 4FYUA 2MMNA 5CO3A 2H19A 4TR1A 2X8CA 1XWKA 4KSMA 2H01A 2B1LA 4DSQA 1X0RA 2B5XA 1WMJA 2VCZA 4G10A 5DAKB 2VM2A 5DVBA 4WR5A 2HYXA 3GA4A 4Q5NA 2IMDA 4HJ2A 3BCIA 2C80A 2YV9A 5KN0A 2YNXA 3E3EA 1OVNA 2PGTA 1TK5B 3WT2A 5IPHA 1SJIA 1SK1A 1JZWA 3UEMA 3WGXA 1PL1A 3GRXA 4E8EA 2P5QA 1ZMAA 2VCWA 2I81A 3IAS2 3DXBA 3TDGA 3TOUA 4ZL8A 1DSBA 4O5RA 3FHKA 5GAPD 4KDXA 1M7TA 1I9DA 2GQLA 4TKYA 3TOTA 2B6MA 1HNAA 3QFBC 2HZEB 5D9TA 3D21A 2TIRA 2GGTA 3TJKA 4K6XA 1BG5A 2DLXA 3S9FA 2O89A 1XWBA 5DJLA 2H1GA 4TR3A 1C72A 2B5YA 3U5RE 4POBA 2E7PA 1EEJA 4MJAA 1Y25A 1TI1A 3GH6A 2XBIA 2B3SA 1M2AA 3TKSE 4GSNA 3W8SA 1T8EB 2MMAA 3MAKA 5F06A 2VL2A 3H4KA 5ECQB 4OCEA 4NHWA 4YQMA 2MBSA 4KDYA 4NPBA 1SL1B 1GSUA 3GFKA 2VM1A 4L8EA 1TI3A 1X9WB 4K8MA 5LD0A 2LS5A 2H6XA 2WB9A 2FWGA 3KM6A 2FY6A 1TKDB 1EGRA 5A4UA 2VLUA 2N5AA 4WBRD 1O81A 1UA5A 1M9BA 3JCML 1XFLA 4F82A 2L6DA 2AYTA 1PKWA 4OO5A 2R3XA 4XTSA 1K3YA 4IGJA 3GX0A 5C00A 2HE3A 5ECIB 1U3AA 1ERWA 1PRXA 5IO0A 3TCOA 2N5BA 1ERUA 2KLXA 2V41A 2I3YA 2FWHA 4YQUA 4V1Ag 3VPTA 1X9SB 1PGTA 4QQ7A 4XS4B 1XPVA 4HU9A 3UVTA 5G5EA 2WZ9A 4DEJA 2EC4A 4NV2A 4MF7A 4XIHA 1EP8A 4ZB8A 1XXUA 3KIJA 2DIZA 2L57A 1GL8A 1S3CA 3G9BA 1Z7PA 4GQCA 1V2AA 1FW1A 2MZCA 1GLQA 5FT3A 1AQWA 1A23A 5DQYA 3GTUB 3WGDA 2J23A 1GNWA 2AUVA 4CHSA 1O6JA 3TJBA 2HRFA 3IC4A 5ECKB 3KD0A 5D9VA 4WXTA 2L59A 3LEFA 4PUFC 2ALBA 4F03A 1ST9A 1BX9A 3HDCA 1Z7RA 3SWLA 3OR5A 4EF0A 5EVOA 3ZL5A 1B4QA 3F0IA 5G30A 3G7JA 1M99A 1Y6EA 4POLA 3EMXA 3QD9A 1V40A 3DIEA 2JSYA 3WYWA 4OFNA 1KEBA 4HI7A 2I1UA 3HY2A 2GZYA 3LSZA 5CP1A 1PSQA 2M46A 5DBQA 1FOVA 3C8EA 5DALA 5ECMB 2WJUA 2F3MA 1AIUA 3EMPA 3G7IA 1GSEA 5G31A 1XWGA 3N9JA 3ZFBA 1A0FA 3HA9A 5F07A 2DMLA 4HQSA 1ILOA 1NSWA 1OC9B 3LXTA 1AUCA 1X5CA 5H5QA 4ML1A 3QFAC 1K0BA 4NAXA 4MJBA 3BJ5A 3P90A 2PBJA 4OD7A 3GV1A 2A2SA 1XW5A 2K6VA 3UBKA 1XOAA 3IHQA 5CYYA 1R4WA 1H4OA 4IP6A 4MJCA 3M3MA 3QAWA 3D5JA 2CV4A 3KMOA 2VLTA 4WKWA 2YWMA 1XCCA 3F6DA 1UC7A 4IJ3A 6GSWA 3HCZA 1O7UA 4Q5QA 1QFNA 5KN2A 1NHOA 4BA7A 4PXOA 2E2MA 5H5RA 1JZOA 3SBCA 3EU3A 4NWYA 3TKPA 5IQYA 4I97A 2H1AA 3KP8A 3F4RA 3NOFA 3KCMA 6GSUA 1GH2A 1QQ2A 4XS6A 2OACA 2QC7A 4K2DA 1K0CA 2HZEA 3LJRA 5D8IA 3BCKA 1F3AA 4NV5A 5ID2A 5A4WA 2FGXA 4HDEA 6GSSA 4GQFA 1I5GA 1S3AA 1DBYA 1FVKA 3H93A 2H70A 3ME7A 2PERA 4ULXA 1NW2A 5IMCA 1AW9A 2X8HA 3ED3A 3Q19A 2JZTA 1WOUA 1T1VA 1T3BA 1G6YA 2O85A 1RK4A 2YZHA 3IXRA 1XW9A 1YEXA 4RQXA 5IMZA 3VI7A 3HJPA 4K1FA 2DBCA 18GSA 3GH9A 5B8BA 2GS3A 1JZDA 3DMLA 4BVXA 4ACSA 2FUG2 12GSA 2EIRA 3FY7A 1XVWA 1SENA 3N5OA 2OE0A 4HEA2 4WF4A 2HZFA 4LL1B 3ZMKA 1VGLA 5HFGA 4JU5A 5DCGA 3VI5A 3UAPA 5F05A 2YP6A 4HJMA 4YH2A 4ZILA 1Q98A 3IR4A 5ECNB 3C1RA 3H8QA 3DKSA 4L0UA 4ECCA 5LCZA 3EYTA 2WRTA 1IYIA 2IWTA 1GP1A 3IK7A 3VURA 2GT6A 4J2FA 2LUSA 3WD6A 1XW6A 4J57E 1B4PA 3FZ9A 5JCGA 4XS4A 1TW9A 2DJ2A 5AGYA 5IIZA 3FR6A 3VWWA 2KOKA 1VF4A 2IL3A 4ECBA 4ZB9A 1JFUA 1EV4A 4NHZA 4JRRA 1ZGNA 2EIOA 4OWYA 3EWLA 3GL5A 1VF3A 3M9JA 4D73B 5LNKe 1GSSA 3H1NA 4GWRA 1PX7A 4MH2A 3TJFA 5KN3A 2CVBA 1WE0A 3ZVJD 4F0BA 1AXDA 3GTUA 3CRUA 1FG4A 2AB6A 4PNGA 4PQ1A 2PMTA 3MWHA 3TKQA 3GL3A 1HYUA 2GSTA 2Z9SA 4KB3A 5H5SA 3ZIJA 2RLIA 2CT6A 2ZUPA 5IMAA 5E59A 4LA1A 1O73A 2HI7A 5AIVA 2IMKA 3NZNA 2C3TA 4O92A 1TK0B 3HYPA 2LEGA 1K3LA 1TRWA 3M0FA 3FZ5A 4Q5FA 3FR9A 2C3QA 4ID0A 2LJAA 4I6XA 5G5FA 1A8YA 2IPAA 4V1Ap 3VWXA 5DJMA 3F8UA 1M2DA 2RM6A 2YWOA 2OBIA 4MP4A 9GSSA 2H0GA 5G1LA 2BTOT 4JBBA 4TVEA 4F0CA 3HVSA 1MEKA 2JL4A 2YANA 2M72A 4H86A 5HR0A 4ML6A 4POKA 3RAZA 2LJKA 1YKCA 2XC2A 1QGVA 1OC9A 1J08A 4I5QA 4L0WA 3M8NA 2C0EA 2GSSA 1U3IA 1ZYEA 2K8VA 2LNSA 3EC3A 1YJ6A 6GSXA 2B7KA 1YZXA 4Z7XA 1MDJA 2C8UA 1YEPA 2JZRA 6GSYA 3C71A 1URMA 2XPEA 11GSA 2DJ1A 1WJKA 4IN0A 2B1KA 3Q18A 1WPIA 3V1WA 3FR3A 1XZOA 3APOA 2I4AA 4JR4A 4GTUA 3KJYA 5JWRB 2PWJA 2GQKA 1Z6MA 4GLTA 4BWSA 4ILFA 3L78A 1X9MB 5KEJA 5ID2B 3Q6OA 4JEDA 4K7OA 1GTAA 1S3DA 2B7JA 4FYBA 5J5NA 4Q5RA 2LTKA 1ZCPA 1FB6A 2A2RA 3IE3A 4HQZA 2HSHA 2ZNMA 1EP7A 3FZAA 2IFQA 3IK9A 4V2MA 2HRNA 3GURA 2FLSA 5C04A 3DVWA 4TXOA 2A4VA 4HUAA 4F9ZA 1MDIA 5HQPA 5CRDA 5J41A 3ZZXA 4AJ6A 3GKMA 2GQMA 4MH3A 2R4VA 2P5RA 2OE1A 4MZCA 4O32A 1ON4A 3R2QA 3LYKA 1LJRA 2IMIA 2MYGA 3MSZA 3VLNA 4PUAA 4MPFA 2F8FA 4PGTA 1GSYA 2RM5A 1H75A 1F3BA 1V57A 3A3TA 2LQOA 2GT5A 2X8GA 3LXZA 4P3YB 1EOHA 2L5OA 4KGIA 1CQGA 4HOJA 3US3A 1HD2A 3D0ZA 2DJ3A 1GLPA 3LWAA 5IMVA 3GMFA 4NXIA 2HT9A 4EXJA 2O7KA 2MMZA 1J9BA 4XRAA 3WGEA 3ZREA 4ZXGA 4QL7A 3I69A 1XOBA 1YQ1A 2H30A 3UVHA 2VO4A 4L5LA 2RUEA 1AC1A 1Q4JA 1QK8A 3TJJA 4AGSA 1BJXA 5EY6A 2YV7A 2CVDA 2F51A 3LORA 3FKFA 2VIMA 5ECLB 3QDNA 3RBTA 4OMVA 5L71A 4YAPA 1O8WA 4D73A 3IAM2 1GNEA 4QL9A 2VL3A 3KGKA 2FHEA 3F63A 3QAGA 2H0HA 2VD1A 1BQ7A 3M1GA 2K18A 5JCWA 3HXSA 1QUWA 2V6OA 13GSA 2DMMA 2L4CA 3DWVA 1YY7A 2LKUA 3FZ4A 1BEDA 4EDZA 4TOPA 2YZUA 3IOSA 2DJKA 1OKTA 1V9WA 3QOUA 3GIXA 3QR6A 3GSSA 4PNFA 1K0MA 2XHFA 2WULA 3NIVA 3PH9A 1G7EA 1MD4A 4IQ1A 2RUFA 4MPGA 1GTUA 4EE0A 2HXKA 2VUPA 2YPMA 3ZYWA 4MABA 2MBTA 2R6KA 5A5KA 4XS1A 4X43A 4OFTA 2IN3A 3U6VA 2CAQA 4WBJA 3C1SA 1R26A 4MCUA 3UIWA 2C3NA 3DYRA 2BJXA 2ON5A 3A5WA 3ZITA 5B6MA 3KH9A 4IP1A 5COHA 3C73A 2VAFA 4XCSA 1SD9A 2VLVA 2L4QA 2TRCP 2FCHA 5B8AA 1RW1A 1B9YC 1OC8A 1PA3A 4EDYA 1R7HA 1G6WA 1TXXA 3D4TA 5CRHA 1DE2A 1AQXA 2H75A 3D6IA 2LQQA 3DGQA 2OKAA 2H66A 3UJ1A 3TRPA 1XWCA 3BBYA 3J7Yb 3TKSA 1K0NA 4IBPA 2RIIA 1USBA 3CMIA 3I9V2 1FVJA 1SL2B 4DSSA 1SK2A 5ELAA 2IFQB 4IKHA 3HZ8A 4GCIA 2KUCA 4TXOB 5D96A 4ZL7A 4TR4A 4OFMA 1U88A 1J0FA 2QKEA 5EL8A 2GZZA 2E2GA 2D2ZA 2R2JA 4LL4B 1MTCA 2O8VB 4GF0A 2MMOA 2GZPA 2NTOA 2P31A 2YJHA 3CBUA 5IMFA 3HZ4A 4G19A 5F8BA 4AJ7A 3LGCA 4XRDA 5ECPB 3FEUA 2C4JA 3FK8A 1WP0A 4ISDA 4FYCA 1XWAA 1B48A 4GSSA 19GSA 1YDKA 3KZQA 2EIQA 4GSTA 3UOMA 4IW9A 4EC0A 3RPNA 3ERFA 3GHAA 3GKNA 2WCIA 3E0UA 3GNJA 2NBSA 3FW2A 4MK3A 3HD5A 1VRSD 4I2TA 1FO5A 2FNOA 1K3OA 5FHIA 4IJIA 5D9WA 2PN8A 2OBKA 3VPQA 2DJ0A 3CYNA 4KDUA 4RI7A 2GVPA 3VK9A 2IMEA 3W8JA 1WRYA 1A2JA 5G1KA 1N2AA 4AJ8A 4J56E 3KH7A 4O7HA 5GZZB 3QMXA 3GSTA 2P0GA 1QMVA 5J4UA 5ENUA 3I6AA 4BL7A 3F3QA 1TK8B 1GULA 2AHEA 3CTFA 4I8BA 5DDLA 1SKRB 1QXHA 4WF5A 4KE3A 1EEMA 2R5GA 4MDCA 3VWVA 3KMNA 4KA0A 1FB0A 3HKRA 5HFIA 1T00A 2N5FA 1K0OA 4IQAA 5HR2A 3VFIA 3IV4A 5D73A 4LMWA 4RQRA 1GSQA 1ZZYA 2ES7A 1RQMA 3PR8A 2VCQA 3BD2A 3KTLA 3EVIA 2OJLA 1GUKA 1ERTA 3CSIA 3GKXA 3C7MA 2FA8A 4V2NA 2BMXA 3WT1A 4TW5A 1TTZA 5CAXA 5J3RA 3RHCA 3L4NA 3D4MA 1F6MC 2CX3A 4IHUA 4K7IA 1HNCA 3TRXA 3ISOA 3ERGA 4F2IA 4JE1A 4IELA 3QCPA 1X5DA 1JZRA 1OE7A 1PX6A 1SL0B 2FWFA 2H6ZA 4KCEA 4MZBA 1YF1A 2VL2C 1XVQA 4I2UA 4MJEA 5IPGA 1PMTA 1O85A 1O8XA 5GSSA 2AV4A 5KN1A 5JCUA 5J9BA 2LRCA 3FRCA 1KTEA 4KAEA 2E0QA 1JHBA 1OE8A 4AF2A 4BVYA 1PN9A 1NHYA 1CQHA 1BYEA 2VD0A 1LBKA 3VWUA 3L0HA 3F3RA 1TOFA 5G2ZA 4EKZA 4PURA 1ERVA 2H8LA 1TP9A 2PUKC 1SJZA 4BWQA 4DSSB 5CRGA 4K0NA 4ZIJA 2JSZA 4RI6A 1IYHA 1A24A 1VF1A 2NDOA 3CTGA 2F8AA 1AAZA 2NVLA 3DVXA 7GSSA 3EURA 2L6CA 2JZSA 5D9XA 3TKRA 1ACVA 3I43A 2C0DA 1GUHA 3LYPA 1PQNA 2R37A 3MNGA 8GSSA 2IJYA 2G2QA 1M0UA 2TRXA 2XBQA 2L5LA 3CSHA 5HR3A 4LMVA 5ELGA 2YWNA 2DJJA 4BPYA 1SD8A 2CQ9A 5AISA 2ZCTA 1MD3A 3TB2A 1K0DA 2C0GA 4K0GA 3RPPA 4WETA 2CX4A 2GDRA 3BOAA 1GRXA 3ZRDA 2LRNA 2LSTA 1OC3A 5DQSA 2DC5A 4ZB6A 5INYA 2H1BA 4DSRA 4CDOA 5IMDA 5IOWA 3F9UA 2VL9A 3ERWA 4KUNA 2PPTA 3QAVA 2O87A 2HFDA 1SJ6A 1YKAA 5ABRA 2KHPA 6GSVA 3F4SA 3LQ7A 2LRTA 4IVFA 1TU7A 4PQIA 2YOIA 3P7XA 3TRQA 3IDVA 1A0RP 3TGZA 1BAYA 4MLYA 4G2EA 2GSQA 3F4TA 5AIXA 2X64A 2HNLA 3HJMA 4KCAA 2X99A 3DRNA 2YJ7A 3L9SA 3KP9A 4N10A 1SKSB 4MF5A 1UVZA 1GTIA 2CAIA 2KP2A 2AJQB 3K8NA 4KH7A 2OA7A 3IRAA 4MMMA 3UL3A 3APQA 3PGTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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