5IO2A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c48s mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGSTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 50
structure length 158
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5io2A00
4F2IA 4MH3A 4PURA 2BJXA 1QK8A 1GUKA 2VM2A 3DVWA 5B8BA 4LMWA 3H8QA 1K3YA 5AISA 1XW9A 4PQIA 3W6GA 4EKZA 5HFGA 2CVKA 2N5AA 1O8XA 4N10A 4DEJA 4BWQA 4MJEA 3WGEA 2B7KA 4HDEA 2B5YA 3GA4A 1VF3A 2KOKA 1F9MA 1XWKA 2H70A 3WT1A 4NPBA 1DE1A 4XRAA 1I9DA 3TDGA 2IMIA 4IP6A 2RUFA 4JE1A 3E9JB 4FO5A 2LTKA 5J5NA 2P0GA 1PA3A 1TK0B 3CMIA 3O76A 3CSJA 4V1Ag 3BJ5A 1SL1B 3EYTA 1TP9A 2R2JA 4F82A 2H66A 2BTOT 2YZUA 4YH2A 1J9BA 3HA9A 1PD21 2F3MA 5D96A 4KH7A 5F0GA 4CW9A 2JZTA 4EDZA 2VCVA 4IBPA 3LORA 1PMTA 1RW1A 1PL2A 1FG4A 1PL1A 3I43A 5JWOB 4HQSA 4KDYA 2DIZA 4YQUA 3L0HA 2G0FA 2VUPA 3RPPA 2QGVA 2H74A 1MD4A 2V2GA 2QKEA 1SKSB 1XXUA 3BOAA 3I6AA 2PPTA 5H5SA 3EINA 1NM3A 1DBYA 5G5FA 4WR4A 1VF1A 4MF6A 8GSSA 4G9HA 4X0XA 1XW6A 3L9UA 3P90A 1G6YA 1GTAA 3GX0A 3ZFLA 1F3AA 1TI1A 3KZQA 5JWRB 2H1AA 4KB3A 4KA0A 3CTFA 1AQWA 1R4WA 1X9WB 1T3BA 1PX6A 3VI7A 1O73A 3WT2A 1GLQA 5F07A 1YZXA 3QR6A 4ML1A 3TB2A 2KP2A 1ML6A 1VF4A 4NXIA 17GSA 1JZOA 4V2LA 5CP1A 1FB6A 3G7JA 3FZ5A 3SWLA 5IQYA 1EOGA 2R6KA 3LXTA 1GSDA 1PX7A 3GIXA 1SU9A 4TOPA 4WR5A 2JSYA 4XTSA 4XHMA 2WCIA 4ILFA 3KM6A 4PGTA 1NW2A 2OE3A 4JRRA 5F8BA 3VWXA 2IFQA 3DXBA 3GN3A 1TOFA 2F8AA 1IYIA 3EC3A 4K9ZA 1DSBA 1HD2A 3HYPA 4E8EA 2GSSA 3TKSE 4LMVA 2PUKC 3CTGA 1W4VA 3R2QA 1SENA 1O7UA 3D6IA 1MD3A 1YKAA 22GSA 2XHFA 2WDUA 4OCEA 4PNGA 2R5GA 1EEJA 1YKCA 4TKYA 4RQXA 4FIWA 2GQMA 1B8XA 2CVBA 5G1LA 1JZDA 2L5OA 3GMFA 4PX1A 1KTEA 2DMLA 2IFQB 2OE1A 2RM5A 4GSSA 3LQ7A 4IJIA 3FHKA 2MMOA 4NHZA 5GSTA 2RUEA 2R3XA 3DVXA 4E8HA 4L5OA 1X5DA 1JZRA 3QOUA 3BCIA 5HR3A 5GAND 1GTUA 4J57E 2PMTA 3M1GA 5DALA 3DEXA 3LFLA 1M2AA 3FR9A 2GGTA 2JADA 2HT9A 3E0UA 1Q98A 5FWGA 4TR3A 3TRPA 2I81A 4G2EA 1A2MA 1TRWA 1R5PA 3F63A 5B8AA 6GSSA 4IP1A 1W89A 1AXDA 1XOBA 2OE0A 3PGTA 4ZB8A 1EGOA 3TKSC 7GSSA 11GSA 1A8YA 2MZCA 4BPYA 5F06A 3MNGA 4ECJA 3ZMLA 5ECSA 1RK4A 2P31A 2ON5A 1V58A 5L71A 4NAXA 4PUFC 3Q74A 3GKMA 3ZVJD 2ES7A 3HVXA 2PBJA 1Y6EA 5CAXA 4GQFA 2IMEA 1HNCA 5ECIB 4HU7A 1GSYA 2LV3A 1Z3EA 3TRQA 4J2FA 3WD6A 1EEMA 4MLYA 3WYWA 2FHEA 2XPDA 1SL2B 3UARA 3D0ZA 1PRXA 3DYRA 2DC5A 2JL4A 5LNKe 3F3QA 3QFAC 3KP8A 3HZ4A 1GLPA 3GTUB 4K8MA 4KX4A 2CX4A 2VLTA 4AJ6A 5CREA 3ERFA 2VAFA 1TXXA 1O81A 5KEJA 1SJ6A 1TRUA 2YNXA 5H5RA 2BMXA 3KGKA 1K0AA 2FWHA 4N30A 3VWVA 3UBLA 2AYTA 3LWAA 1O85A 2MMNA 2DJ3A 3D4TA 2WULA 3P2AA 4KSOA 3ZZXA 2LRTA 1GNWA 1ZYQB 1ZCPA 5EVOA 2HYXA 2IMFA 3F4RA 5A4VA 2H19A 3FZ4A 2M80A 2H72A 2DJ0A 5C00A 1OC9A 4HJMA 1GUHA 2LRNA 2HRNA 1M9AA 4JEDA 3LGCA 1WIKA 2H6ZA 1ILOA 3TOTA 4TRXA 3VWUA 3UOMA 2LQQA 1R5AA 3OR5A 4GWRA 1GTBA 4KW6A 2IL3A 3DKSA 2HSYA 1UA5A 3HKRA 3TKSA 2C8UA 2IPAA 16GSA 1E2YA 2C3TA 2V1MA 2HRFA 3VK9A 1A2JA 4TW5A 4KNDA 10GSA 4MPFA 1U87A 2B5XA 4IGJA 5A4WA 1A23A 2B1KA 3FZAA 1OC9B 18GSA 4CHSA 2KHPA 5ECKB 3G7YA 1U6TA 1B9XC 5IO2A 1BJXA 1OKDA 5IM9A 1Q4JA 2OACA 2FA8A 2AUVA 3GRXA 3DMLA 1K0OA 1OKTA 2DJ1A 3RDWA 2H01A 2AB6A 5DAKA 5KN0A 1EP8A 3C71A 3C8EA 5IMCA 2EIOA 3DD3A 2V6OA 5B6MA 1AW9A 4OD7A 1G6WA 4MZWA 1XFLA 2DLXA 3QD9A 3ZMKA 5GAPD 4DSSA 4J56E 3MAKA 1F37A 3HCZA 1XZOA 5IPHA 1C72A 3VI5A 6GSUA 3RHCA 1G7OA 1O8WA 2CAQA 2C3NA 1ERUA 5IMAA 2IWTA 4WF4A 4XCSA 4I2TA 4MK3A 1TKDB 3FZ9A 1OC8A 1KEBA 1MDKA 3GSSA 1WMJA 3NIVA 1PKWA 2DJ2A 3M8NA 1VGLA 3LJRA 2M46A 1UC7A 2OBIA 5ECLB 2L6DA 5J9BA 2HXKA 4YQVA 3A2WA 3VWWA 3ZIVA 2DMMA 4I2UA 2C4JA 2IIYA 1XWBA 4I97A 1F2EA 3EMXA 2TRXA 3CRTA 2VLUA 4QQ7A 3IAS2 5D93A 5JCWA 4EC0A 4IELA 5ECRB 5LCZA 2CV4A 4RI6A 3C7MA 4ULXA 5IMDA 3TUEA 2F9SA 4GCIA 3ERGA 4ECIA 1JFUA 1RQMA 2FWEA 3FR6A 1E6BA 1I5GA 2NPBA 3ZVJA 2C0GA 2DBCA 3D21A 2HZFA 1WWJA 2FD3A 4ZL9A 1YF1A 1YF0A 4GSTA 1GL8A 2PERA 3C1RA 3BCKA 1AQVA 2FCHA 5H5QA 2H6YA 1HNAA 3F8UA 9GSSA 1GULA 1K0CA 4HZ2A 4RQRA 5F05A 4V1Ap 2F51A 2A4VA 4MPGA 1HQOA 1A2LA 3ME8A 2JZRA 3F3RA 13GSA 3Q18A 3KTBA 2J9HA 2TIRA 1DUGA 3CBUA 3VURA 3GNJA 2IN3A 5D9TA 2N5BA 2EIRA 1AC1A 3KJYA 3FR3A 2YZHA 5GSSA 3IK9A 4FH8A 1X5CA 2HE3A 1VF2A 2QC7A 5J9CA 3I9V2 2LJKA 1XCCA 4JZQA 2HSHA 4ZILA 2YJHA 3GL3A 3UJ1A 4OWYA 3IXRA 2VLVA 4N0VA 5KN1A 2A2SA 2E7PA 1O6JA 2X64A 3GYKA 3FRCA 1MEKA 4GSNA 5DVBA 2JACA 4XS1A 1T4ZA 1WRYA 1OE7A 3KH7A 1ERTA 1Z6NA 3QFBC 5IOWA 4NHWA 1XWAA 3WGXA 1FVJA 1GNEA 1ST9A 3TKRA 2KLXA 1TJDA 4MZCA 3UL3A 2L59A 4Q5FA 1TU8A 2GS3A 1PKZA 4HU9A 3QPMA 3ZLPA 4TVEA 1GRXA 3IRAA 2B5EA 2R4VA 3EURA 4ZBAA 4NMUA 3L78A 1ZMAA 4MP4A 4I8BA 1R26A 1BG5A 2E2GA 3HY2A 4YAVA 4K1FA 4MH2A 2DJJA 4OO4A 1Z7RA 4FYBA 2YCDA 1R7HA 1SJIA 3TJGA 3HVVA 1JZWA 2VOCA 2H0HA 2HLSA 5JWQB 1GWCA 1SKRB 4LA1A 1GSFA 2X8HA 4ISDA 1OVNA 1SJZA 1K3OA 2VL9A 3GH6A 3APOA 2LQOA 2NBSA 12GSA 1EV9A 1URMA 1XOAA 4RI7A 3ZFBA 3EWLA 4TR4A 2GQLA 3IR4A 4NWYA 2PU9C 4OFTA 2YV9A 1YQ1A 1K3LA 2GSRA 1TTZA 2YOIA 5DQYA 5HR1A 2X8GA 2LKUA 2B6MA 1F3BA 1WJKA 2KP1A 3GV1A 3L4NA 2IMDA 3J7Yk 4MCUA 2DSAA 4AF2A 1MDIA 1THXA 1OYJA 3KP9A 2HI7A 1K0NA 2NTOA 3QDNA 2GLRA 5A5KA 1FVKA 1TU7A 4GQCA 2LJRA 4Q5NA 3UVTA 4L0UA 2VD0A 3SBCA 3W8JA 4ID0A 5JCUA 5CO3A 5ECNB 5IIZA 1AAZA 5G5EA 2PVQA 2CX3A 5COHA 2YWNA 4L5LA 4MF5A 4PXOA 3GL5A 2XPEA 1BQ7A 3GKKA 5DALB 3HHVA 1HNBA 5HR0A 5IMZA 4DSRA 3H93A 3M0FA 1IYHA 1VRSD 1OC3A 3QCPA 3M9JA 2L4CA 2TRCP 5D8IA 1NHOA 2K8SA 2E0QA 6GSVA 2GT5A 3UEMA 4O92A 2H0GA 1Z9HA 1GSEA 1JLVA 4TR1A 1DE2A 5AIVA 2VCXA 3UAPA 2X8CA 1MDJA 4IS0A 1EP7A 4FYCA 4HJ2A 4K2DA 5DQSA 1T00A 2I1UA 3D22A 2H76A 4ZB6A 2OJLA 1TW9A 4KDUA 4OFNA 2WRTA 1XW5A 1QMVA 4HS1A 14GSA 3TKQA 1CQGA 1XWGA 2LNTA 3FY7A 3ZIJA 2CT6A 1M2BA 3ERWA 3IAM2 3KXOA 2WB9A 3F4SA 4IJ3A 2RLIA 4MMMA 2FY6A 1EOHA 2E2MA 3LEFA 1EZKA 4PUAA 5G30A 1UVZA 2LEGA 2O87A 3HVSA 3PINA 3FYGA 4K7OA 3DGQA 4TR1B 2FWGA 1ZGNA 4DVCA 3NOFA 1LBKA 3EU4A 4WF5A 5J3RA 2YPMA 2OBKA 1AUCA 4ECBA 1V2AA 4IVFA 4KCAA 1QFNA 1TI3A 5IMVA 1USBA 3BD2A 4WEYA 1NHYA 4ECCA 2RIIA 3HXSA 2XBQA 1XVQA 3ZITA 3AY8A 1FB0A 3GUSA 4MJBA 1M9BA 2MMZA 1MTCA 2VIMA 1GH2A 2ZCTA 2M72A 3HD5A 2FGXA 2GSTA 2V32A 3VLNA 3F0IA 3K8NA 3LG6A 4IKHA 4TN8A 3APSA 2H1DA 1WP0A 2WJUA 3M3MA 3RAZA 3WGDA 2FNOA 5ELGA 4MA9A 3CSHA 3KCMA 5LD0A 1SKWB 5B7CA 1EV4A 1TK5B 4MABA 2B3SA 2CAIA 4O5RA 4ZB9A 2VM1A 2C80A 3ZL5A 5CNWA 4POKA 2MMAA 2HNLA 4L8EA 5DCHA 3A2XA 5KN2A 2VCTA 3IA1A 5D9VA 3ZYWA 2FA4A 1V40A 5D73A 3IOSA 4LL1B 1ABAA 1ZYEA 5HQPA 3MWHA 3F4TA 4X43A 1AQXA 4IQAA 3TJBA 3C1SA 1BEDA 1EWXA 1H4OA 2O85A 1T7PB 3P8WA 4POBA 3FKFA 4FYUA 1PN9A 4ZXGA 4EXJA 2ON7A 4NV5A 3UIWA 4WKWA 4TXOA 5D9WA 2WFCA 1KBNA 4O7HA 2H30A 1B4QA 2C0DA 1SD9A 2RM6A 4MJAA 3GHAA 4OFMA 1Y25A 5DCGA 4G19A 2MBSA 3D5JA 2X99A 5DAKB 4K7NA 5ECQB 1JLWA 2WZ9A 1LJRA 1X0RA 3QAWA 3ED3A 3UVHA 2C1YA 3VFIA 3BBYA 3N5OA 4QL7A 4JU5A 3GKXA 4POLA 3CSIA 2H73A 2DIYA 2JZSA 3PR8A 2B7JA 4DSSB 3HJOA 1BX9A 4ZL8A 3GSTA 5ID2A 2GQKA 5ECOB 4IW9A 3HJMA 3J7Yb 2O89A 2K18A 4TXOB 2L5LA 3ME7A 5DJMA 1T8EB 4RUVA 1QQ2A 4D73A 5IMFA 4HEA2 1S3AA 3IV4A 3UBKA 2PWJA 6GSYA 2P5QA 2CA8A 1ZOFA 1FW1A 3EE2A 2VO4A 3H1NA 5ELAA 4N11A 5IPGA 2I4AA 1T1VA 4GRFA 4F03A 4YQMA 2HZEA 4GLTA 5AIXA 4HZ4A 2H71A 1X9SB 3DRNA 1FHEA 5FT3A 2C0EA 3F9UA 2EC4A 4F0BA 4JR4A 4WXTA 2IMKA 2J23A 2AV4A 3CRUA 3TJJA 3TJFA 1HYUA 1B48A 4IN0A 1ZL9A 2GSQA 5CRGA 5ID2B 1XVWA 1Z7PA 5HR2A 2FLSA 3JCML 4D73B 19GSA 4K0GA 4ACSA 2L57A 4ML6A 3A3TA 4XS4A 3TOUA 1A0RP 2H1BA 1LU4A 4V2NA 1SK0A 4K0NA 2XC2A 4BWSA 4F9ZA 3KD0A 4JR6A 2HZEB 1SD8A 2K9FA 1YY7A 5CYYA 1X5EA 2XBIA 2GDRA 4ZBBA 4GTUA 2OKAA 6GSTA 3KTLA 5C04A 4BA7A 2B1LA 4EL1A 2I3YA 5KN3A 1K0BA 3U5RE 3DIEA 3VPTA 1TRSA 5G2ZA 5ECHB 1SK1A 2MBTA 1S3CA 4HUAA 3FK8A 1FO5A 4PNFA 3KMNA 2ZUPA 4WETA 2NDOA 1THOA 5AGYA 4EO3A 1GTIA 2K6VA 3F6FA 3U6VA 3GX8A 1SYRA 4XS4B 4EF0A 4XIHA 4EUYA 4KE3A 1M7TA 5IOXA 1CQHA 3GFKA 3D4MA 3ZTLA 6GSXA 1OE8A 1ERVA 4ZL7A 4BL7A 4MF7A 3KH9A 2CZ3A 4YAPA 2H0IA 2VCQA 1A8LA 1YDKA 4ZIJA 4OO5A 3LYPA 3EU3A 3VPQA 5A4UA 2KUCA 3M9KA 4F0CA 3Q19A 5G1KA 2GT6A 3O6TA 5J41A 3RHBA 4ZBDA 1B9YC 2YN1A 3LXZA 5J4UA 4KCEA 3IPZA 2L4QA 3PH9A 4PQ1A 3P7XA 4DSQA 2R37A 1PQNA 4BVYA 5HFIA 1QUWA 2G2QA 1XBSA 2QSIA 2YJ7A 4KDXA 4L0WA 4G10A 1WPIA 4PQHA 4LL4B 3HDCA 2DJKA 4N0ZA 4AJ7A 3W8SA 4OCFA 5JCGA 2I9HA 3DWVA 4Q5RA 1Z6MA 4Z7XA 2ALBA 2LUSA 1K0DA 1GSSA 3IK7A 5FHIA 2LNSA 2PGTA 3LSZA 3UMAA 2V41A 2JSZA 1T4YA 1M99A 4WBRD 4HI7A 1EGRA 2GZYA 3US3A 3ZRDA 1M0UA 3LYKA 3QAVA 3A2VA 2CZ2A 2YP6A 4EVMA 2CVDA 2O7KA 2VL2C 1TRVA 3L9VA 4KUNA 1YEPA 4IQ1A 5EL8A 4OMVA 1GP1A 4I5QA 1WOUA 3H4KA 5ABRA 1QXHA 4QL9A 4MJCA 3TKPA 3GTUA 1SL0B 1B4PA 4JBBA 5E4WA 1JHBA 4H86A 1YJ6A 4KAEA 2P5RA 1A24A 3S9FA 2D2ZA 2VCWA 4XRDA 4TR0A 3MSZA 5EY6A 2CQ9A 4EE0A 5CRDA 2YANA 5ENUA 3IHQA 2ZNMA 1ERWA 2NVLA 2H75A 4HOJA 2YWIA 3TGZA 2GVPA 3IDVA 1OAZA 1WE0A 2GTUA 2YV7A 1GSQA 4XS6A 1U3IA 2FWFA 1U88A 1H75A 1F6MC 3QMXA 5DDLA 3RBTA 2A2RA 4POMA 5AN1A 1GUMA 3N9JA 1ON4A 4IHUA 2REMA 1XWCA 3TCOA 2IJYA 4AGSA 3F6DA 4K7IA 2C3QA 2H8LA 3KMOA 3RPNA 2MYGA 2LRCA 1ZZYA 3QAGA 1V98A 3TJKA 4K6XA 2PVOC 2AAWA 3KEBA 2L6CA 4NV2A 4HQZA 6GSWA 2OADA 3G7IA 4GXZA 3CYNA 3HZ8A 1M2DA 1Z5YE 3IC4A 3L9SA 3TRXA 2LJAA 3C73A 5E59A 1G7EA 4V2MA 3ISOA 3GH9A 1GSUA 5ECPB 4WBJA 5CRHA 1A0FA 2FUG2 1FAAA 2N5FA 2H6XA 1V57A 2VL2A 2YWMA 1XIYA 4KGIA 2H1GA 3GURA 1J08A 1G0TA 1J0FA 1U3AA 5IO0A 1NSWA 2C0FA 2HFDA 3NZNA 1KNGA 3A5WA 3FEUA 5DBQA 4X1UA 1QGVA 20GSA 2AJQB 2VD1A 3O3TA 5DJLA 3GKNA 4O32A 1TK8B 4Q5QA 5D9XA 3Q6OA 1FOVA 3FW2A 3G9BA 3IE3A 4MZBA 5HFKA 2VCZA 2GZPA 2OA7A 5EPFA 5GZZB 1TDIA 3KIJA 3ZREA 5INYA 4GF0A 3MDKA 5ECMB 3I69A 3H79A 2WS2A 4I6XA 1S3DA 5B6NA 1BYEA 2LS5A 2O8VB 3IBHA 1N8JA 3E3EA 4AJ8A 4BVXA 1PGTA 2YWOA 1K0MA 4MDCA 2Z9SA 2K8VA 1UN2A 2V6KA 1BAYA 2VL3A 3HJPA 2EIQA 3APQA 1SYXA 2PN8A 4CDOA 2LSTA 1SK2A 1AIUA 4EDYA 2F8FA 4KSMA 4TXVA 1ACVA 5G31A 2JU5A 3V1WA 1PSQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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