5IOWA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure ffcumene (hyperoxidized by cumene hydroperoxide)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
156
structure length
155
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 46
structure length 155
sequence length 156
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iowA00
1K0CA 2GSSA 2H1DA 2NVLA 1X5EA 1THOA 2H30A 2V6OA 5JCWA 3TJJA 2LEGA 1A8YA 1SD8A 1EGRA 4O32A 3DWVA 1LBKA 4AF2A 1YEXA 4MZBA 3IAM2 1A0RP 1GL8A 2BMXA 2CQ9A 2WCIA 3K8NA 2LV3A 1J9BA 2VCTA 3GSTA 2GS3A 2LSTA 2WB9A 3P90A 2YPMA 1OYJA 3IBHA 1EV9A 4F03A 5JCUA 4N11A 4GSTA 2H66A 2C0EA 3UBKA 2LNSA 4XRDA 1B8XA 3DEXA 2EIOA 5ECKB 4BWSA 3G7YA 3NOFA 2L59A 3KEBA 5G1LA 5J3RA 2IFQA 3CSJA 4LLRA 1NHOA 1FO5A 2C3QA 1YJ6A 3GNJA 2N5FA 2O8VB 2O89A 6GSWA 3L0HA 1T00A 2DJJA 3KM6A 2A2SA 1KEBA 1G0TA 1AC1A 1UC7A 2HXKA 3WD6A 2VLVA 4K9ZA 1T8EB 1FOVA 4XCSA 4EDYA 3LEFA 5A4WA 2GTUA 1O7UA 2WRTA 2JACA 2VAFA 2KP2A 2F8FA 1SKWB 4ILFA 2C3NA 2R2JA 1OVNA 2XC2A 3G9BA 2YCDA 3F4RA 3O6TA 4EF0A 3HY2A 3MSZA 5G5EA 3GH6A 2O87A 2L6CA 3ERGA 4GQCA 4LMVA 2L6DA 4OWYA 2KP1A 1G7EA 4ML6A 3TOUA 4L5OA 1XCCA 3MNGA 4YAPA 3RBTA 1OC8A 3MWHA 2NPBA 1A8LA 1XW6A 4K7NA 1R26A 4QL7A 2JL4A 4RI7A 2H70A 5CRDA 2IWTA 3FZ9A 1R7HA 3UMAA 4MZCA 4EKZA 4MH2A 5J9BA 2AB6A 1MDIA 2JU5A 3HDCA 1A2JA 4E8EA 3H1NA 1J08A 1G6YA 1Z5YE 4HJMA 3HXSA 2R4VA 2VIMA 3GX8A 4HI7A 3DVWA 3GRXA 1GH2A 5IMZA 1OKTA 3IK7A 1GUKA 5KN3A 2JSYA 5IM9A 16GSA 1SL2B 1ZZYA 4P3YB 4OCFA 4X43A 1AQWA 4WETA 4IKHA 1PA3A 5IMDA 4GWRA 4O7HA 4HZ2A 3APOA 2H74A 3FR6A 5EL8A 3LXZA 3L9UA 3ZVJA 3ZMLA 3OR5A 1BEDA 4ZL7A 3A2WA 1OC9A 2YV7A 5HQPA 1R5PA 3J7Yk 1PQNA 5ECLB 3RHCA 4IP1A 3KZQA 4TVEA 1KNGA 1G7OA 1M2AA 5J9CA 1K3YA 4ECIA 1S3AA 3VWVA 1Z7RA 3MDKA 1IYHA 2IN3A 5AN1A 3VI5A 5KN2A 3KTBA 2L5LA 2C4JA 3UBLA 4PNGA 3GKKA 4K2DA 1PD21 2RM6A 5D96A 3GH9A 1V58A 3UIWA 1GTIA 5GAND 1GSQA 1EOHA 4BA7A 4JZQA 3FZAA 4OFMA 3L9SA 1SL0B 4KSMA 4ZL8A 2LRNA 4DSQA 5EY6A 4ACSA 1K0NA 4WKWA 3FY7A 3CYNA 5G2ZA 2LUSA 2GDRA 4RQXA 4GF0A 2KLXA 4K8MA 4Q5RA 4K7OA 4F0CA 1T4ZA 3RPNA 1MDJA 2RUFA 5CO3A 1NHYA 1JFUA 1ERVA 3FR9A 4MF7A 1TXXA 5GZZB 4IHUA 1LU4A 2AAWA 2B1LA 1C72A 5DDLA 3TJBA 1Z6NA 4MH3A 1OE8A 6GSXA 4HOJA 4TR4A 4EL1A 2FGXA 4GCIA 3CRUA 5G30A 5J4UA 4POMA 2YNXA 1YEPA 5CAXA 1T4YA 3Q74A 2X8HA 1HYUA 4L0UA 1UA5A 2MMAA 1EP8A 5DCHA 2GGTA 4F82A 3CRTA 2I9HA 1RK4A 3M1GA 1OC9B 1K3OA 1BJXA 3QAWA 2VCWA 1W4VA 4TN8A 1KTEA 4EC0A 3A2VA 3GHAA 3DKSA 4WXTA 1HD2A 3TKSC 4IN0A 3D0ZA 3UAPA 5F06A 2FWHA 1GSUA 4MMMA 4NV2A 5DALA 4CW9A 2E0QA 2FWFA 4POBA 2DIYA 1AW9A 3IXRA 4JRRA 3DMLA 3FRCA 2VL2A 1ZMAA 2OACA 2I3YA 1GULA 4IGJA 4OFTA 3KP9A 2PUKC 3VPTA 3I9V2 3GKNA 1K0AA 1AQVA 4ZBDA 2H6YA 4PQHA 4EDZA 2CZ2A 1PMTA 2GQMA 2YZUA 3M9JA 6GSYA 2FA4A 1V2AA 3RHBA 3VWWA 2HLSA 4LL1B 2HE3A 2LQOA 5G1KA 3D4TA 4MP4A 3IV4A 2LNTA 4V1Ag 3HCZA 2B3SA 3CMIA 2I4AA 1GUMA 3ED3A 3JCML 4CDOA 1E6BA 4XRAA 3M9KA 5IPHA 2E2MA 2MBTA 3ERWA 2K6VA 17GSA 3BCKA 3F63A 3HJPA 3KXOA 1GP1A 4MA9A 1V40A 3VWUA 2P0GA 19GSA 1YKCA 3APQA 2H0GA 3GMFA 2JZTA 2FHEA 2H1BA 1DE1A 3M0FA 1YF1A 2I81A 2VCXA 2M72A 2XPEA 3C1RA 2H73A 1XZOA 1GTBA 3TRXA 4RUVA 2PMTA 2L5OA 3TRQA 5CRWA 3TKSA 5ECIB 5FT3A 1TU8A 4KX4A 1FHEA 3QR6A 2V2GA 3US3A 1B48A 2REMA 4I6XA 1MDKA 5IO0A 3KJYA 4TXOB 2VLUA 1SYXA 2DC5A 2F8AA 3FK8A 3VFIA 1M9BA 4GRFA 3GYKA 2CZ3A 4E8HA 5F8BA 1AUCA 1U3AA 3I43A 3HHVA 3WT1A 4ZBBA 1X9WB 4NXIA 5KEJA 4O92A 5ENUA 5H5SA 4G10A 4PUAA 2YZHA 3FW2A 4FYCA 1MTCA 1SJZA 3UOMA 1SJ6A 3F4TA 3P8WA 4MF5A 2XHFA 1BX9A 2HI7A 3U5RE 3PH9A 5CYYA 1PN9A 1YF0A 4K1FA 2C80A 2EC4A 4GSSA 2B7JA 1JZOA 1TRWA 2DJ0A 2FY6A 2DLXA 2PGTA 1SK0A 3BBYA 3F3RA 4TRXA 5ABRA 5ECMB 5ECQB 4L0WA 2EIQA 4AJ8A 3LXTA 1VF1A 4ECBA 4KE3A 3I69A 3IR4A 4HJ2A 1BQ7A 3WT2A 3LYKA 2K8VA 1VGLA 1PL1A 1AAZA 5D9VA 3CTFA 2F9SA 3FZ4A 1F37A 3FKFA 3F6DA 3UJ1A 1F6MC 5IOWA 2X64A 3U6VA 1U87A 5ECHB 2B5EA 2DSAA 2YJHA 5D9XA 3ZFBA 3P7XA 4MPGA 2QC7A 4WBRD 1ST9A 1YZXA 3FEUA 3TGZA 3WYWA 4JU5A 1O85A 3P2AA 5JWQB 2HRNA 4KDYA 4GLTA 4G9HA 4N0VA 2BTOT 1EZKA 3ZYWA 2RUEA 1T7PB 3FYGA 1H4OA 5GAPD 1SK2A 2X99A 4LL4B 4ZIJA 2OBIA 3GIXA 3ZREA 4YQUA 2R37A 1F9MA 5AISA 1JZDA 4XS4B 2ZUPA 2YWIA 2JZSA 3TB2A 1YKAA 1WE0A 1Z6MA 3D21A 1MD3A 3ERFA 5IIZA 2O85A 4PX1A 2DIZA 2HSYA 2IMDA 4NMUA 5C04A 3A3TA 2ON5A 2H1GA 2GVPA 2GT5A 1VF3A 1ZYQB 3W8JA 1BG5A 1GNWA 4V1Ap 5IQYA 2FWGA 3TJFA 1O73A 4NPBA 3IK9A 4KB3A 1XVQA 1Z3EA 1UN2A 4GSNA 5HFKA 2CA8A 2VO4A 4G2EA 5AIVA 2OBKA 3UVTA 2H0HA 2OKAA 3GURA 4BPYA 3TCOA 3ZL5A 1DE2A 3ZIJA 3TKPA 2YJ7A 2H19A 1TK5B 1JLWA 4AJ6A 3D4MA 2CVKA 2IJYA 4HS1A 3MAKA 1XIYA 2AJQB 3RDWA 4TXVA 3DYRA 2ZNMA 1THXA 1H75A 1XXUA 3GV1A 4YQMA 4JE1A 4BVXA 4X0XA 2CVBA 4MPFA 3ZITA 1TW9A 3ZZXA 2IFQB 3O76A 5DVBA 2CT6A 2HT9A 4XIHA 1Z9HA 5HR3A 4N0ZA 2P5QA 3FZ5A 5B6MA 1PKZA 2WZ9A 1SL1B 4D73A 4HU9A 11GSA 1PKWA 1GSDA 1QUWA 2TRXA 5D9WA 1WIKA 3R2QA 2MYGA 3IAS2 2OJLA 2RM5A 4IBPA 3A2XA 2Z9SA 5A4VA 2P31A 5JWOB 2OE1A 3F3QA 4IELA 3QAVA 2OA7A 1JLVA 5B8AA 5GSSA 1DUGA 1EV4A 3KGKA 4IJ3A 1HQOA 3NZNA 5C00A 3KH9A 1WRYA 2H71A 4ZL9A 3H8QA 1UVZA 3C1SA 1LJRA 2FNOA 2PVQA 2DJKA 2FWEA 2HZEA 2H0IA 2HFDA 2PBJA 4ID0A 2X8CA 4IQAA 5J5NA 1U6TA 4GTUA 4AJ7A 2I1UA 4Q5QA 1Q98A 5E59A 5AIXA 1Z7PA 5ECOB 4NV5A 4WR4A 2WFCA 3W6GA 1NM3A 2YANA 3QDNA 1TI1A 2LJKA 4IJIA 4Q5FA 5IOXA 4IQ1A 5HR0A 4IVFA 4KCAA 3KD0A 4JBBA 4KGIA 3D22A 4HU7A 4J56E 4F0BA 4TOPA 2OE0A 1M0UA 5CREA 5A5KA 5D73A 1YDKA 2LTKA 2B1KA 4GXZA 4I2TA 2DJ3A 1FG4A 1I5GA 2DJ2A 1A23A 4MJCA 2MZCA 1SYRA 3BD2A 2LRTA 2VOCA 2LS5A 4L5LA 4N10A 1ABAA 3TKQA 2VL9A 2AYTA 3FR3A 1QMVA 2JZRA 2LQQA 1M2BA 1ILOA 3EMXA 4PURA 2VUPA 5H5RA 2G2QA 4MJEA 3HVSA 4D73B 4YH2A 1CQHA 5H5QA 5B8BA 3I6AA 5JWRB 1TI3A 1QXHA 4ZB9A 1T1VA 2HZFA 2L4QA 4H86A 4ECJA 1ZYEA 1TRSA 2C0DA 5E4WA 3Q19A 2IMFA 3C71A 4KH7A 1SD9A 4WBJA 4ZXGA 2ON7A 1K0MA 1SKRB 2PWJA 1TP9A 2J9HA 1A2MA 5DCGA 1ZOFA 3LWAA 4MLYA 3KH7A 1R4WA 1K3LA 3LORA 3WGDA 6GSUA 3GUSA 2H6ZA 3IDVA 5FHIA 2HZEB 1F3AA 4KCEA 1G6WA 3IE3A 8GSSA 4KA0A 3M3MA 3PR8A 3VURA 1ACVA 4YQVA 3QD9A 3E0UA 3DRNA 2TIRA 4K7IA 4OD7A 1KBNA 3ZTLA 3UARA 5GSTA 1XWGA 2MBSA 1X9MB 2QGVA 3KMNA 1WPIA 3KIJA 1QGVA 1V98A 1O8XA 4Q5NA 1GRXA 3DVXA 1XWKA 3TKSE 4G19A 4KSOA 3QFAC 4OO4A 4HQSA 4KAEA 4L8EA 2GT6A 1JZRA 1B9XC 2M80A 3ISOA 4MJBA 4IP6A 1OKDA 2PU9C 4TW5A 3ME8A 2TRCP 4LMWA 1PRXA 4PXOA 2XPDA 3W8SA 2JSZA 2P5RA 3E3EA 1CQGA 6GSTA 1ERUA 1SENA 3KP8A 2GSTA 2WGRA 1EEJA 2PPTA 2GZPA 2AUVA 6GSSA 2A2RA 2N5BA 1XWAA 2VLTA 2IMKA 2YWNA 3CXGA 3WGEA 3HJMA 4BVYA 3QAGA 5ECPB 3H4KA 3F0IA 5COHA 5DALB 4ZB8A 4Z7XA 3SWLA 1NW2A 1F3BA 1XPVA 3DIEA 1K0BA 2YWOA 2VM2A 1FB0A 3GA4A 1ZGNA 4WR5A 1GNEA 1WJKA 1N2AA 5DJLA 3QPMA 4OCEA 1O81A 3BJ5A 4MJAA 3HVVA 2C0FA 2O7KA 2H6XA 3LJRA 1A24A 1V9WA 4PQIA 3LYPA 1T3BA 1USBA 2H76A 1GSSA 5CNWA 4FIWA 4TKYA 3L4NA 1PGTA 1FB6A 22GSA 4FYBA 2VCQA 2FA8A 1E2YA 3S9FA 1HNCA 2ES7A 2IL3A 5DQYA 4XS6A 2QKEA 4RQRA 3ZVJD 5INYA 4DSRA 1YY7A 2N5AA 12GSA 1FVJA 3RAZA 5F0GA 3UEMA 1ZL9A 1JHBA 2A4VA 4HDEA 3CSHA 3GSSA 4V2MA 3ZLPA 2J23A 4EE0A 2LKUA 1AQXA 4DVCA 1IYIA 1BAYA 2H72A 5G5FA 1XW9A 3SBCA 3GKMA 3VWXA 2WULA 1GSFA 3LSZA 4XTSA 5DBQA 3QCPA 3EYTA 1GSEA 2YWMA 1GTUA 1TK0B 3TJKA 1K0DA 2HNLA 5KN0A 4F9ZA 1R5AA 3ME7A 4X1UA 5CRHA 4AGSA 1EP7A 2HSHA 4ZB6A 3TUEA 2H1AA 3TJGA 1OE7A 1GWCA 5IO2A 1PX6A 1N8JA 4XHMA 1K0OA 2OE3A 1ERWA 2IPAA 3HYPA 1X5CA 5ELAA 3VK9A 3EWLA 4NHZA 1DSBA 4QL9A 4J2FA 4XS1A 2V32A 1MEKA 5F07A 3D6IA 1X5DA 4GQFA 1A0FA 3LFLA 5ECNB 3L9VA 3D5JA 3EURA 1S3CA 3J7Yb 2DMLA 4ML1A 2C8UA 3CSIA 3VLNA 2IMIA 2YN1A 2MMNA 1AIUA 2V1MA 2X8GA 1EGOA 3BCIA 2HYXA 2K8SA 2EIRA 5D8IA 3EVIA 1M2DA 4DEJA 5HR1A 4QQ7A 6GSVA 4I5QA 4K0GA 3UL3A 3M8NA 2AV4A 2VL3A 3ZFLA 1QQ2A 1GUHA 3GL5A 3IHQA 3L78A 2CAIA 4OMVA 4IS0A 2H8LA 3EINA 3V1WA 1ML6A 2VD1A 3IA1A 4FYUA 1YQ1A 1SU9A 5HFIA 4ECCA 1XBSA 3A5WA 5F05A 2F51A 3G7IA 5D93A 2CX4A 3HD5A 1NSWA 4WF5A 4HUAA 3IC4A 4OO5A 4PUFC 3HJOA 4POLA 1GLPA 2GSRA 2XBIA 2M46A 3PINA 3QFBC 2GZYA 2C1YA 4O5RA 5JCGA 3HA9A 3AY8A 1TDIA 1MD4A 4TR1A 3KMOA 2IMEA 4TR3A 1XVWA 4ZBAA 3ZIVA 1A2LA 3QMXA 4TR0A 2LRCA 1I9DA 1RQMA 5CP1A 4V2LA 1B9YC 5G31A 2PERA 2R5GA 4I8BA 2KUCA 4V2NA 1U3IA 1GTAA 20GSA 4JEDA 2AHEA 2B5XA 1XWCA 3UVHA 3TRPA 3APSA 3ZRDA 4HEA2 3VI7A 4DSSA 4NHWA 2GSQA 3C8EA 5ECSA 4FO5A 4K6XA 2K18A 2L57A 2B5YA 3F4SA 3GN3A 4MF6A 3FHKA 5FWGA 4BWQA 4ISDA 2FD3A 2K9FA 5DJMA 1DBYA 2V6KA 3O3TA 2NDOA 3GFKA 1Q4JA 1SK1A 3Q6OA 1PL2A 2CAQA 3N9JA 1EEMA 1M7TA 1FVKA 4N30A 1Y6EA 3GTUA 2D2ZA 3HZ8A 2VCVA 4KUNA 4KNDA 2H01A 2RIIA 5IMCA 4JR4A 2LJAA 2F3MA 3LG6A 3TDGA 3E9JB 1AXDA 4NAXA 1RW1A 3EU3A 5IMAA 2WS2A 1S3DA 1VF2A 1X9SB 3WGXA 4PQ1A 2VL2C 2H75A 1EWXA 2MMOA 5LNKe 1XWBA 4IW9A 1M99A 1URMA 4JR6A 5D9TA 5B6NA 2CVDA 4MCUA 1X0RA 1VRSD 4PGTA 3EE2A 1SKSB 2VCZA 2QSIA 4I97A 3EU4A 5ID2A 4KW6A 5DQSA 1FAAA 2NTOA 2BJXA 3N5OA 1F2EA 2KHPA 4KDXA 3F6FA 1U88A 4K0NA 4OFNA 4F2IA 3EMPA 3GL3A 1O8WA 1TRUA 1Y25A 3DD3A 3C7MA 1XFLA 5DAKA 3G7JA 4KDUA 4PNFA 1WOUA 4TR1B 1SJIA 1ZCPA 2GQLA 1EOGA 3PGTA 3BOAA 1ON4A 3RPPA 5HR2A 5ELGA 3IOSA 2XBQA 3QOUA 4FH8A 4POKA 3LQ7A 1TKDB 5HFGA 2PVOC 5J41A 1JZWA 1XW5A 2LJRA 10GSA 1BYEA 2NBSA 2YOIA 4DSSB 4HQZA 1QFNA 2E2GA 1V57A 4BL7A 4J57E 1OC3A 4ZILA 18GSA 4MK3A 2C0GA 5IMFA 4EO3A 4MZWA 4TXOA 5ECRB 3GTUB 3HVXA 1TJDA 3VPQA 3C73A 3TOTA 2IIYA 3TKRA 2B6MA 3HZ4A 2V41A 2CX3A 14GSA 4I2UA 1TK8B 3KCMA 2G0FA 4YAVA 3IRAA 3IPZA 3H93A 1WP0A 3EC3A 3GKXA 4EXJA 3CTGA 1FW1A 3ZMKA 1PSQA 2E7PA 1J0FA 2DJ1A 4HZ4A 2CV4A 2R6KA 2DBCA 2ZCTA 1QK8A 4RI6A 2HRFA 5ID2B 3KTLA 4ULXA 1OAZA 1ERTA 3GX0A 1B4PA 4NWYA 3HKRA 5LCZA 4EVMA 1TU7A 2ALBA 2JADA 5KN1A 2GQKA 1B4QA 4MDCA 2FLSA 4LA1A 2DMMA 2GZZA 2RLIA 5DAKB 5LD0A 2C3TA 1M9AA 4CHSA 5AGYA 2WDUA 3DXBA 2YP6A 4EUYA 5B7CA 1HNAA 5EVOA 1TRVA 2PN8A 13GSA 4MABA 7GSSA 1GLQA 3DGQA 1TTZA 1O6JA 1XOAA 1W89A 1WWJA 1XOBA 3H79A 2B7KA 2VM1A 3F8UA 2R3XA 1HNBA 9GSSA 2WJUA 2YV9A 3NIVA 5IPGA 5IMVA 3LGCA 2L4CA 2MMZA 2OADA 4XS4A 2FCHA 5CRGA 4WF4A 5L71A 2KOKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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