5IOWA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure ffcumene (hyperoxidized by cumene hydroperoxide)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
156
structure length
155
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 46
structure length 155
sequence length 156
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iowA00
5ELGA 3FYGA 2VL9A 2DJ0A 1XWAA 2I4AA 3GUSA 3QFAC 1ERUA 2YWIA 3IAS2 1GNEA 1OKDA 3DIEA 4I2TA 1VF2A 2JSYA 2PBJA 4G2EA 1SL1B 4XCSA 3ZZXA 4MPGA 1EEJA 5KN1A 1GSUA 3U5RE 3L9UA 1X9SB 2LJAA 2YZHA 1FVKA 2K6VA 2LQQA 2AAWA 3GKKA 3DEXA 1AC1A 2YCDA 3LFLA 1B9YC 3RPNA 3H93A 4HS1A 3Q74A 1QUWA 4JR4A 4MJAA 3KCMA 5B6MA 1R5PA 1AXDA 3UBLA 3HZ4A 3EMXA 4IHUA 3ZTLA 4X43A 1FO5A 2GT5A 2DIYA 1DSBA 2IFQB 4ZIJA 4JR6A 5JCWA 2LKUA 3GSSA 3C71A 5GSSA 4FH8A 3FZ9A 4Z7XA 1Z6MA 4ZL9A 2FUG2 2KLXA 5J9CA 4FYBA 5IOWA 2VLVA 5HR3A 4TR0A 2H75A 3QOUA 3ZREA 4GCIA 1H75A 2A2SA 4O92A 1EGOA 3C1RA 3KH9A 1TRWA 2N5FA 3KXOA 1FOVA 3WD6A 2JSZA 1ZYQB 3LG6A 4ZBAA 3LGCA 3GN3A 3NIVA 4OWYA 1EWXA 2LRNA 3VWUA 1B4QA 4HOJA 1TKDB 2VCQA 4DSQA 3KH7A 5B8BA 3L4NA 1H4OA 4LMVA 1ZL9A 1Z7PA 4K2DA 3ZFBA 4KCAA 1V58A 1SD9A 5JWRB 1AAZA 4EF0A 5ECQB 3ZITA 2PUKC 3H1NA 2O89A 2PGTA 4RI7A 3UMAA 1ZMAA 2F51A 2JZTA 4ECJA 3L0HA 2OA7A 1ZCPA 4NHWA 5G1KA 1B9XC 5FHIA 2E2GA 5IMFA 5LCZA 4WF5A 3D4MA 4FYCA 1FG4A 1OKTA 2VD0A 2E0QA 3LORA 3ZIJA 5F0GA 5ECOB 3EE2A 1WMJA 5ECKB 2WFCA 3IDVA 2LJRA 3L78A 4CW9A 3BCIA 1YKCA 3F6DA 4ECCA 4TW5A 5ECMB 3TJKA 2H71A 4KW6A 1GLPA 4MCUA 5JWOB 4K0NA 1W89A 1A0RP 5JWQB 1R26A 2B3SA 3L9SA 1SENA 3K8NA 2DJ3A 1GSSA 1A8YA 3LYPA 1ZYEA 2H6ZA 2OE0A 5F06A 3UAPA 1PL2A 11GSA 2L6CA 4E8HA 3TDGA 1UA5A 4HU7A 4GQFA 2HSYA 2L5OA 5HR2A 2HXKA 1SYXA 1PX6A 1EV9A 2GLRA 1R4WA 2AYTA 4FIWA 1BQ7A 4TXOB 2P5QA 3WT1A 2I81A 1KNGA 3PINA 4EVMA 1PGTA 2O8VB 1OE8A 18GSA 3GHAA 5H5RA 2GZPA 2IMDA 4HZ2A 5LNKe 2D2ZA 4F9ZA 2CQ9A 3ZVJA 3PR8A 3UOMA 1XXUA 2C3NA 4MLYA 1XW5A 5J9BA 1PKWA 1M2AA 4N30A 5IMDA 2YNXA 4IELA 2QGVA 3FR9A 2ON5A 3ZYWA 2H0HA 1Q4JA 4MMMA 1THXA 2HI7A 4HU9A 4LL4B 3CXGA 1OAZA 1GL8A 4KNDA 3W8SA 4G9HA 1QK8A 2C80A 2IMKA 4EUYA 3ZVJD 4GWRA 2C1YA 1YF1A 2V1MA 1G6WA 4MF7A 3CBUA 4ZL7A 5HR0A 1ERTA 2PU9C 2H1DA 1N8JA 1K0CA 3N5OA 5H5SA 2X8CA 2IJYA 3QPMA 1JZRA 5HFIA 5CRGA 4MH2A 1WPIA 4GTUA 4IJ3A 3TRXA 5DJMA 4NV5A 3KIJA 2B6MA 2MMAA 3BOAA 1HNCA 1VF4A 4K8MA 1HNAA 1MD4A 5DDLA 2BJXA 1ML6A 1S3CA 2VCWA 2OADA 2OE3A 2HRNA 3TRQA 1E6BA 2DSAA 1FB0A 1U88A 3TJGA 3F4SA 1PKZA 4MZCA 2Z9SA 2DJKA 5ECRB 1TDIA 5EPFA 1GSFA 4EKZA 1K3LA 2M46A 2HSHA 5C04A 3IRAA 4HI7A 5IQYA 1JLWA 2L4CA 4MP4A 5DQYA 3GA4A 4PUFC 2RUEA 2XBIA 1AUCA 2RM6A 5IOXA 3U6VA 3DGQA 2DMLA 2C8UA 5IIZA 2HZEA 1G7EA 4FYUA 1T3BA 2PERA 5J5NA 1GUHA 2L4QA 4J56E 1WRYA 4KDXA 5D93A 2CX4A 5GAPD 3F3RA 1ZOFA 1GTIA 2C4JA 2CZ3A 2L57A 4YQUA 3KMOA 1JLVA 2R6KA 5F07A 7GSSA 5D96A 2O87A 1MTCA 3KTLA 4DSSA 5C00A 1GSEA 4ZB8A 2VUPA 1T8EB 4YQVA 3G7JA 3A2XA 5L71A 2LNSA 2KHPA 2FY6A 2CVKA 3GSTA 4OFNA 1NM3A 1NW2A 4IS0A 1XWGA 3GKMA 4PQHA 3KGKA 2MMZA 2LV3A 2GGTA 2RM5A 4MA9A 3DVXA 4K7NA 2CAQA 2C0EA 1F2EA 4ZBBA 3EWLA 4WBRD 2RLIA 4MH3A 4OMVA 2FLSA 2C0FA 3APQA 1F3AA 4N0ZA 1DBYA 1LJRA 1X5EA 3G9BA 4CHSA 3F9UA 3HZ8A 3HY2A 6GSVA 2DMMA 2YV9A 1K0NA 4HQZA 1TW9A 5IMVA 2OJLA 4IP1A 5DBQA 1T4ZA 1O85A 4LA1A 9GSSA 3VI7A 2R3XA 2V6OA 2PPTA 1U3AA 3ERFA 5KN0A 2VOCA 2MMOA 2L6DA 4BVYA 4J2FA 2GDRA 3HVVA 12GSA 4IW9A 5EL8A 2B7JA 5B7CA 3O76A 1T1VA 3P8WA 4X1UA 3CYNA 3EU3A 5CRDA 4ID0A 2YANA 3UL3A 4IP6A 2X64A 4MJEA 3DYRA 1XBSA 3UIWA 1TP9A 5F8BA 3TJJA 1YJ6A 2YPMA 4PNFA 3KTBA 1XZOA 4EL1A 2JADA 1QMVA 2IMEA 5G1LA 4TRXA 5GZZB 3F6FA 4LLRA 4F0CA 4ECIA 5DVBA 1MEKA 2B5EA 3HJPA 2GQMA 3O3TA 2H0GA 3HDCA 3CRUA 4EDZA 2B5YA 4JU5A 2H8LA 3F0IA 3I43A 3HD5A 5E59A 3FW2A 4XS6A 4JEDA 1K3YA 1M9AA 1XOAA 2B5XA 3G7IA 4K7IA 1J08A 1YZXA 4G19A 4PXOA 3IBHA 3FEUA 1TOFA 2GZZA 5DCGA 2GS3A 3FZ5A 4F2IA 4F03A 2GSRA 4ZILA 1SK1A 1YQ1A 3TKSA 3VFIA 16GSA 3IOSA 1GWCA 3BCKA 3D22A 4G10A 1GH2A 1Z6NA 2LS5A 5JCGA 3RHBA 1XVWA 4V2LA 2C3QA 3O6TA 1YEXA 3HJOA 4WBJA 4RUVA 1NSWA 3RHCA 2LRCA 1SJZA 3KEBA 3A2VA 4CDOA 1K0AA 4ZL8A 3ISOA 4K0GA 3GMFA 5IPGA 3C73A 3HVSA 3M8NA 5B6NA 4ZXGA 4GSNA 5ENUA 2QSIA 3FRCA 1M2DA 3IHQA 1TI1A 4BPYA 4POKA 4PX1A 3ME7A 3ERGA 4KSOA 1WP0A 2AHEA 3PGTA 1CQGA 2YWNA 4JZQA 3C1SA 3CSHA 4V1Ag 2NBSA 4IKHA 4NXIA 4KDUA 1TI3A 5A4VA 3A3TA 2AJQB 4KCEA 3APOA 2VAFA 4AGSA 3KM6A 1ILOA 4LMWA 3DWVA 4KH7A 4ULXA 4TXVA 1OC3A 2F9SA 4V1Ap 1I5GA 3D4TA 1KEBA 3GH6A 4IVFA 4P3YB 5CNWA 3EINA 4XHMA 3WGEA 2CX3A 4H86A 3TOTA 2HZEB 2VCTA 3F3QA 2NVLA 1GULA 2H1BA 2R37A 3D0ZA 2WZ9A 6GSWA 5ABRA 3HKRA 1XW6A 5INYA 2R4VA 1G6YA 4PQ1A 5FT3A 2MYGA 3ZL5A 4AJ7A 1BG5A 3DKSA 3VWVA 1K0OA 4ISDA 6GSTA 2J23A 4Q5NA 2YZUA 1A24A 2HYXA 4DSSB 3Q19A 2CZ2A 2FCHA 5DCHA 2I9HA 3GKXA 3FR6A 2TRXA 4GLTA 3HYPA 5D73A 3TRPA 3RAZA 3FHKA 4GSSA 2HE3A 2LSTA 2BMXA 2B1KA 3GL3A 5ECLB 1V57A 3IXRA 5G30A 3LXTA 3ERWA 3QAGA 5DJLA 1SYRA 1X0RA 3ZMKA 1ZZYA 1U87A 3HA9A 2YWMA 2DJ2A 1UC7A 4EDYA 4MF5A 3MSZA 4N11A 1WJKA 2YN1A 4KGIA 5IPHA 1SK2A 1BX9A 2GTUA 5ECIB 3WGXA 3HJMA 4ZB6A 3Q6OA 2GQLA 3ZIVA 5H5QA 5CRWA 1EP7A 3GYKA 3GTUA 2VL2A 2DJ1A 4IBPA 1Q98A 4K9ZA 2H1GA 5GSTA 3GL5A 4WKWA 2JACA 4TR3A 2XPEA 4WEYA 1NHYA 4WR4A 4OD7A 4YQMA 1XCCA 4HQSA 3F4RA 3BBYA 4E8EA 1A0FA 5KN2A 3BD2A 2OKAA 4ZB9A 2DLXA 4AF2A 3GFKA 3J7Yk 2LEGA 1A8LA 1M0UA 4FO5A 2LNTA 4BWQA 2KP1A 1FHEA 2JU5A 3SBCA 2PVQA 3D21A 1FAAA 2H70A 2JZSA 5D9XA 1HNBA 3DXBA 4TR4A 1OE7A 2I3YA 3FZAA 4ACSA 4GF0A 2WRTA 2WCIA 1GSDA 4I8BA 1J9BA 1PA3A 3P7XA 1TK0B 3ZLPA 3VWWA 1GUMA 1YDKA 1O81A 5D9TA 5AN1A 2VCXA 2VL3A 6GSUA 3M1GA 1K0MA 5ECSA 2AUVA 2ON7A 4ILFA 1LU4A 2CAIA 2FWFA 5HFKA 1OC8A 4JE1A 2P31A 3LYKA 2A4VA 4HJ2A 2H74A 1KBNA 5KEJA 1UVZA 1BJXA 2C0GA 5IM9A 3LQ7A 2WS2A 1XWKA 1IYHA 2HLSA 2H72A 4HDEA 1DE2A 2KUCA 3TKSC 2WGRA 4OO5A 1URMA 3EMPA 2NDOA 1E2YA 2ZNMA 1B48A 3ED3A 1ON4A 2IIYA 1O73A 3GURA 1A23A 2X8GA 5IO2A 4BVXA 3EYTA 5B8AA 1I9DA 5DAKA 3GRXA 2VIMA 4QL9A 5IMCA 4NHZA 3IC4A 4GXZA 4EO3A 1OVNA 1BYEA 2HRFA 4IGJA 4JBBA 4PURA 1GSQA 2IMIA 2EIRA 3TJBA 4JRRA 20GSA 4OCEA 1R7HA 2FWGA 4RQXA 4DSRA 4BA7A 4MABA 1TRSA 3VPTA 3H8QA 2E7PA 4WR5A 2O85A 4POLA 3GNJA 5ELAA 1GP1A 2FNOA 1WOUA 1ERWA 3F63A 1O8WA 3HVXA 4F82A 5CYYA 4QL7A 1OC9A 4TVEA 5DQSA 3A2WA 3E0UA 4PGTA 5G31A 2H01A 3FR3A 4YH2A 3QAVA 1F37A 5D9WA 4IQAA 3F8UA 4NPBA 1GTUA 1QXHA 1GSYA 2OE1A 1M2BA 4XIHA 4TR1A 3CSIA 4ZBDA 4Q5RA 2CT6A 2H1AA 5DALA 5CREA 1CQHA 3F4TA 5A5KA 3CTFA 1ST9A 3IPZA 1OYJA 3GKNA 3HHVA 4MK3A 4XS1A 5A4UA 1SL0B 4XTSA 1RW1A 4HUAA 3JCML 1EP8A 2C3TA 4OFMA 4MJCA 1QGVA 4Q5FA 1C72A 2H19A 3I9V2 4QQ7A 2ALBA 1RQMA 1FW1A 2L5LA 5FWGA 4D73A 1B8XA 1VF3A 1XVQA 1X9WB 3LJRA 5GAND 2YJ7A 3APSA 3EVIA 2VCVA 4YAVA 2B7KA 2VCZA 1N2AA 1BEDA 3KP8A 3LSZA 4KAEA 1O8XA 4I6XA 5ECPB 3LXZA 4MF6A 1FVJA 1B4PA 19GSA 2G0FA 2LQOA 2CA8A 4J57E 3E9JB 4TN8A 1TRUA 8GSSA 4IJIA 3KZQA 3QAWA 4XS4A 1PL1A 1ERVA 2B1LA 3IA1A 2VL2C 1WE0A 4L0UA 3TKRA 1UN2A 3GTUB 3HCZA 4GSTA 3IAM2 3FY7A 4K7OA 1F9MA 3WT2A 1PD21 4MPFA 3TKPA 2QC7A 3GH9A 2VO4A 2M72A 5G5EA 1A2LA 1T00A 5KN3A 1K0BA 3DMLA 2VM1A 3DD3A 4EC0A 1GUKA 4MZBA 5G5FA 4N0VA 2MMNA 2PN8A 2YP6A 3DVWA 4KSMA 2DJJA 2C0DA 1AQWA 2I1UA 4AJ8A 2F3MA 1YEPA 4O7HA 4L8EA 2REMA 2X8HA 2ZCTA 1MD3A 1DUGA 2DIZA 2IL3A 4N10A 1JZWA 4YAPA 1F6MC 2F8FA 1THOA 1YF0A 3IE3A 3VPQA 5ECNB 4OCFA 1XIYA 2TRCP 3UJ1A 2LRTA 2KP2A 5IO0A 3VI5A 3FZ4A 2CV4A 2GSTA 3SWLA 3UBKA 1JHBA 2HNLA 3CRTA 2H73A 3MAKA 3WYWA 4AJ6A 4PNGA 17GSA 2EIQA 3IK9A 1QFNA 2DC5A 2XBQA 2RIIA 4O32A 2LJKA 3Q18A 3P90A 1EOGA 4KE3A 2GSSA 1XWCA 2IWTA 3EU4A 1K0DA 2PMTA 1V2AA 1V9WA 2XHFA 2H0IA 4NAXA 3RBTA 2VLUA 5AGYA 5DAKB 4HZ4A 1S3DA 4I97A 5IMZA 4XRDA 2HT9A 2H76A 1EZKA 3A5WA 3VURA 4EXJA 5F05A 3W8JA 1F3BA 2G2QA 2H66A 1M7TA 2JZRA 1GLQA 1GTBA 1SK0A 3VK9A 2CVDA 4DEJA 2CVBA 2IPAA 2WB9A 1M99A 4LL1B 4BWSA 4MZWA 3EURA 1HYUA 1XWBA 1AW9A 4KA0A 22GSA 3I69A 2M80A 1EEMA 3KD0A 5EVOA 4L5LA 1X5DA 1X5CA 2RUFA 4OO4A 1Y6EA 1WWJA 3IV4A 4MDCA 1BAYA 1G0TA 3R2QA 3GX8A 1OC9B 1K3OA 2GT6A 3QFBC 2FWHA 4POMA 1TU8A 1JZOA 1W4VA 3OR5A 2LTKA 3QMXA 1USBA 2DBCA 5ID2A 2VM2A 4MJBA 2K8SA 1SU9A 2NPBA 1GNWA 2ES7A 1TXXA 4IN0A 3TB2A 4TR1B 3ME8A 5DALB 3CSJA 2H6XA 2PVOC 4KB3A 4DVCA 2AB6A 4ML1A 6GSYA 2VD1A 2XPDA 2V41A 2WULA 4KDYA 2EC4A 1LBKA 5HQPA 2N5BA 4V2MA 3LEFA 3TKQA 4D73B 1T4YA 5AIXA 1HQOA 1PQNA 2IN3A 3BJ5A 1Z5YE 4PUAA 1HD2A 4Q5QA 1AQVA 3TJFA 1MDJA 2VLTA 3RPPA 3FKFA 2GQKA 3GX0A 3UVTA 3NOFA 2V2GA 4KUNA 1U6TA 1SKSB 6GSXA 1TRVA 2E2MA 1TJDA 1XFLA 1GRXA 2QKEA 5HFGA 4I5QA 1ZGNA 1PX7A 4XS4B 1KTEA 3NZNA 5D9VA 1SL2B 1A2JA 3MNGA 3WGDA 1SD8A 2PWJA 5CAXA 3M0FA 3QDNA 5G2ZA 1ACVA 2A2RA 4XRAA 4NMUA 3TGZA 1AIUA 3QCPA 14GSA 4KX4A 2FA8A 3IK7A 1PMTA 2EIOA 1V40A 1EV4A 2GZYA 1NHOA 2P5RA 3CTGA 2MBTA 2N5AA 2IFQA 5J4UA 3D5JA 3KMNA 1QQ2A 1Y25A 4X0XA 1WIKA 3ZMLA 2NTOA 3MWHA 6GSSA 3C8EA 3G7YA 1T7PB 4HJMA 2GVPA 3VWXA 5J41A 3J7Yb 5ECHB 2HFDA 4K1FA 1SJIA 1S3AA 2YV7A 2WDUA 3MDKA 2MZCA 2GSQA 4NV2A 1VRSD 3PH9A 4WF4A 1V98A 4L5OA 2K18A 2K9FA 1XW9A 3GV1A 2FA4A 3HXSA 5D8IA 3P2AA 3RDWA 5EY6A 4EE0A 5E4WA 1Z7RA 2YJHA 3KP9A 2L59A 4V2NA 3FK8A 5J3RA 2OBIA 1PSQA 1MDKA 1FB6A 4GRFA 3M9KA 1DE1A 1XOBA 1Z9HA 1M9BA 3US3A 2R2JA 2X99A 2OACA 1G7OA 3QD9A 2J9HA 3E3EA 3M3MA 4WXTA 1TU7A 1U3IA 3N9JA 5CO3A 4TKYA 4OFTA 2IMFA 2TIRA 2JL4A 3QR6A 3H4KA 3UVHA 10GSA 5CRHA 3UARA 4RQRA 3V1WA 4ECBA 1O7UA 4K6XA 2R5GA 5A4WA 1Z3EA 2O7KA 1YKAA 1SJ6A 2WJUA 2LUSA 1MDIA 3TCOA 2V32A 5LD0A 4NWYA 3TUEA 1O6JA 3KJYA 3L9VA 3W6GA 4GQCA 4PQIA 3IR4A 2F8AA 1A2MA 4O5RA 1AQXA 4BL7A 1EGRA 1GTAA 4ML6A 4L0WA 4RI6A 2HZFA 1SKRB 3D6IA 3H79A 5CP1A 1TK5B 2V6KA 4TXOA 3EC3A 2FGXA 3S9FA 3TOUA 1EOHA 1PRXA 4TOPA 1SKWB 1R5AA 4WETA 2AV4A 2P0GA 3GIXA 5COHA 1TTZA 2YOIA 1ABAA 5AISA 5ID2B 4HEA2 2OBKA 1XPVA 1TK8B 2YWOA 1VF1A 2KOKA 1IYIA 5IMAA 3I6AA 2FWEA 2FD3A 3ZRDA 3UEMA 1JZDA 3LWAA 3VLNA 1RK4A 2H30A 4POBA 4IQ1A 1PN9A 5HR1A 3C7MA 3DRNA 2FHEA 5AIVA 3CMIA 1VGLA 2H6YA 2XC2A 3AY8A 1X9MB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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