5IPHA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c84s mutant
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFSAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 51
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iphA00
3A5WA 3ZYWA 5D9XA 2YCDA 1USBA 4V1Ag 4F0BA 5HR2A 3IV4A 3ZVJA 2H66A 1O85A 4ID0A 1V98A 2I4AA 4L5LA 1R4WA 5IO0A 3QPMA 3DWVA 5CYYA 3GX8A 2PVOC 2JU5A 1Y25A 1X5EA 3G7YA 4YQMA 1FB6A 3GN3A 4XHMA 4MA9A 4ILFA 1ERTA 3BOAA 4Q5NA 2I9HA 4ECCA 1Q4JA 4GQFA 2LJRA 3O6TA 3PH9A 4V2MA 3GTUB 2R5GA 5ELAA 4EO3A 4EC0A 1YDKA 2RM5A 3GUSA 3LXZA 1TI3A 4AJ6A 2GSQA 4WF5A 1VF2A 1EOGA 4ULXA 2FHEA 1UVZA 3QMXA 2YOIA 5GAPD 4PNFA 2LJAA 1JHBA 2B5XA 1PMTA 1NW2A 3VI7A 1TKDB 1SK1A 3F6DA 3TB2A 1OC9A 4IKHA 2HNLA 3W8SA 1GSEA 2A2SA 4ML1A 5IO2A 2VLVA 4EE0A 3TKRA 2O8VB 2OE0A 3TKSC 5EY6A 3IK7A 3DRNA 1QQ2A 2H72A 1TK5B 1X9SB 1ZMAA 4PQHA 2PU9C 9GSSA 4PUFC 3PGTA 4JR6A 5D73A 1K0DA 2WB9A 3IR4A 3G9BA 2VOCA 1R5PA 1U6TA 2P0GA 6GSUA 2PN8A 3GX0A 1ZCPA 1TTZA 3V1WA 4AJ7A 1O73A 4TKYA 3ZIVA 4HZ2A 1RQMA 1T1VA 1UN2A 1B48A 1V58A 1VF3A 3HJMA 4F2IA 3UOMA 1H4OA 2MBSA 4MZBA 1O6JA 3TKQA 3LQ7A 5A4WA 2AYTA 3APSA 2PPTA 1DE1A 4TOPA 3C71A 2DJJA 4AGSA 3BCKA 3N5OA 5DAKB 3FR6A 2R37A 2VM1A 3TJFA 2A2RA 1OE8A 2H1BA 3RAZA 4KGIA 4OCEA 3GKKA 3L9VA 4V2NA 4O5RA 4JZQA 3GMFA 3MSZA 4XRAA 3GURA 1LBKA 1B8XA 2HRFA 2OBKA 4TN8A 4HZ4A 2TIRA 3QAVA 3FR3A 1ZOFA 5F8BA 2IFQA 5DQSA 4I97A 2VD1A 1DE2A 1VF1A 3LXTA 2M80A 3CSHA 1DBYA 1A2MA 1BYEA 3QOUA 1F3BA 3TDGA 4H86A 3WT1A 1WIKA 4HS1A 1PN9A 2OBIA 2KP1A 2I3YA 3APQA 3UL3A 4JRRA 3HVSA 2H19A 3F0IA 4MPGA 3D5JA 5IMFA 4DSSA 4K2DA 1QK8A 2EIRA 1EV9A 1XFLA 2IMDA 2KLXA 1X9MB 3KH9A 1V57A 1F9MA 3L9UA 3IRAA 2KHPA 2B6MA 5D9TA 3D22A 3ZFLA 2ON5A 5D96A 5IMVA 2YP6A 2X8GA 1TU7A 3A2WA 4TRXA 1YQ1A 4K1FA 2LS5A 1GSDA 2XC2A 2PWJA 5GSSA 2BTOT 4MK3A 3F3QA 4FH8A 2VL2C 3ZMKA 2K9FA 3ZFBA 3VLNA 1AQVA 1GLQA 2V2GA 4I5QA 1X9WB 2VCTA 3KZQA 3VPTA 5COHA 3Q19A 4LLRA 1FVJA 3WYWA 3GSTA 4MDCA 3GH6A 5HR3A 4HU7A 2LEGA 4OD7A 3FZ5A 4GCIA 5CRDA 2L4QA 5J3RA 1A0RP 3G7JA 2C8UA 2DC5A 3M9KA 1T00A 2VLUA 3P7XA 4TW5A 4QL7A 2WZ9A 4EDYA 1THOA 2HXKA 2QKEA 3KTLA 5KN0A 1SL1B 3GL5A 3VWUA 1XWCA 5AIXA 1DSBA 3GKXA 5EL8A 1UC7A 1NHYA 4K0NA 1SENA 5CP1A 1TU8A 5H5RA 3R2QA 1OAZA 5DDLA 2H70A 4D73A 4HOJA 3CBUA 4IP6A 3TCOA 3AY8A 1HD2A 1W4VA 4HJ2A 3UBLA 2CT6A 1JLWA 5DVBA 4FO5A 6GSWA 5IPHA 3S9FA 5B8BA 1PKZA 1VF4A 5JWQB 3F6FA 1G7EA 2DJ3A 2X8CA 1OYJA 2AV4A 5ELGA 4IBPA 2LRNA 2IFQB 4N30A 2L57A 3M9JA 2JL4A 1SKWB 2P31A 3FR9A 2RIIA 3M1GA 4GSSA 4YH2A 1T8EB 3FRCA 4IS0A 4FYUA 5ECPB 3LSZA 2H1AA 1F2EA 1GLPA 3HY2A 5F0GA 1WE0A 2GT6A 2JADA 1AXDA 2DIYA 3IE3A 3TRPA 3M0FA 2C0DA 4BPYA 1DUGA 4MLYA 4LMWA 4XS4B 4G10A 1JZRA 1EOHA 5G5EA 2VL3A 3GTUA 2GSSA 4EXJA 4MH2A 2NDOA 1PL1A 1NHOA 2WDUA 4GTUA 2CVKA 3HD5A 1O8WA 5B6MA 1JFUA 4IQ1A 5CNWA 3I6AA 5JWRB 3RHCA 3UVHA 1M9AA 1OC3A 3U6VA 3TRQA 1SYXA 2YJ7A 2FY6A 3UVTA 3TRXA 1BX9A 1ABAA 1WRYA 2WGRA 2LQQA 2CVBA 1J0FA 2YPMA 4IVFA 4O32A 3UIWA 3BBYA 3GNJA 3C7MA 1GTBA 1R26A 2ON7A 2FD3A 2H0IA 2WULA 3ED3A 4MF7A 3LJRA 5GZZB 1V40A 1S3AA 1R7HA 5ECNB 2VO4A 3IBHA 1ERWA 2HYXA 1YKAA 3APOA 3LYKA 1K3YA 4TR3A 5DJLA 3UMAA 1TXXA 3ZVJD 3E9JB 1XZOA 1SD8A 4HQZA 1GUKA 1F6MC 2IN3A 3IAS2 3F63A 5JWOB 2VL9A 3W6GA 2GQKA 3D21A 3KMOA 2HT9A 4GQCA 1GTAA 2GVPA 3IA1A 1TK8B 2B7JA 2H6XA 4ZILA 4OFMA 2MMZA 2V32A 1SU9A 3GHAA 4WXTA 1EEJA 2E7PA 4NV2A 4K7OA 4RI6A 2DSAA 5DAKA 3ZIJA 4MF5A 2LRTA 1FB0A 2H6YA 1T4YA 1M9BA 2B1KA 2VIMA 3L0HA 4YAPA 4I6XA 5HR0A 2FA8A 3FYGA 4BL7A 2R6KA 4ZL9A 4EVMA 3H93A 4BA7A 3P90A 3F8UA 1XWKA 4LL1B 3EU3A 5HR1A 5ID2B 1HNAA 6GSXA 4MJBA 1TRSA 1M0UA 2G0FA 1S3DA 1QXHA 2IIYA 1BJXA 2FGXA 1YZXA 5DALB 2XHFA 3QAWA 4DSQA 3Q18A 2AJQB 2JSZA 14GSA 1Z7RA 1EGOA 1Z5YE 5G30A 1K3LA 4KH7A 3GFKA 5A5KA 1XW9A 1MEKA 3MDKA 4KDUA 2YANA 2DJ2A 2YZHA 3HXSA 2K8VA 5GSTA 4JBBA 1SJZA 3DD3A 1J9BA 3G7IA 4G19A 2HLSA 3CMIA 4OCFA 3DVWA 2GZZA 1EWXA 2LRCA 2K18A 1GSUA 1JZOA 2HZFA 4P3YB 2CX3A 2Z9SA 1PSQA 4OO5A 3GSSA 1ST9A 1ACVA 5DCHA 2K8SA 5JCWA 2V6KA 2FUG2 2PUKC 5DJMA 1T7PB 2MMNA 4XRDA 1MDKA 4TXOB 2FNOA 2L5LA 1QMVA 1AIUA 2DBCA 2MYGA 5J5NA 3MAKA 1B9XC 3C73A 2ZCTA 5D9WA 2BJXA 4IHUA 5D9VA 4JEDA 3EE2A 3CYNA 2OJLA 1O8XA 5J41A 1XWBA 3IHQA 4J57E 3Q74A 2XPEA 4O92A 4XIHA 2CV4A 1GP1A 2H8LA 3RPPA 3N9JA 1BG5A 2HI7A 2VLTA 3DGQA 4YAVA 2DMMA 3ME7A 4PNGA 4TXVA 5HFGA 4K9ZA 1LJRA 1QUWA 1Y6EA 2YWNA 5F07A 4POBA 11GSA 1GH2A 5FT3A 4MF6A 3VI5A 1T4ZA 3HCZA 1AC1A 4YQUA 3CRTA 3ZTLA 4KSOA 4HEA2 1X5CA 3CXGA 1XVQA 1PQNA 4X1UA 2YZUA 3NOFA 6GSSA 5INYA 2VAFA 4ML6A 4OFTA 5AN1A 2H30A 4PX1A 4IJIA 3TOUA 2OA7A 5KN2A 3DIEA 5G2ZA 2IMKA 4OFNA 3TJJA 4EL1A 3RPNA 3FK8A 4HJMA 4KE3A 3LEFA 4XS1A 3E3EA 2CAIA 3M3MA 3TKPA 1EZKA 4Q5FA 1XOBA 4J56E 3D4MA 1MD4A 2YNXA 1KEBA 1PL2A 2IJYA 1GSQA 1G7OA 2VCXA 2PGTA 1AW9A 1BEDA 1M2AA 2FWFA 3BD2A 3UJ1A 2LJKA 4XS4A 2DJKA 3F4RA 2H75A 3KGKA 3HZ8A 3KIJA 4EF0A 5G31A 2DMLA 3HVVA 3I69A 3GRXA 3UARA 3HDCA 2GZPA 2CAQA 1A2LA 2C3TA 3ERWA 3EINA 2OADA 2OE1A 1G6WA 1ZYEA 2F9SA 4OWYA 2R3XA 3F3RA 1GNEA 1OE7A 2LV3A 1YKCA 2GQLA 2VUPA 1XVWA 5IMCA 2GDRA 2N5BA 4PURA 4ECJA 4QQ7A 3KP8A 3HYPA 1SKRB 4RUVA 1IYHA 2ZNMA 5ECKB 1KBNA 3F4SA 5AIVA 3VURA 1WOUA 2WCIA 4FYCA 1M99A 3ZL5A 4ZL8A 4MJAA 2H1DA 3DMLA 2PVQA 1MDIA 2B7KA 2QSIA 2KOKA 1PKWA 1JZDA 4KAEA 18GSA 4GXZA 3QCPA 5D93A 1XIYA 19GSA 3NZNA 2NBSA 2QGVA 6GSVA 3A2XA 1M7TA 1HNCA 1A0FA 3SBCA 3TJBA 4Q5QA 5DBQA 4MP4A 2HFDA 4TR0A 4ZBBA 2N5FA 4ZBDA 3ZMLA 2YJHA 4J2FA 4ZL7A 1TDIA 5ENUA 1SYRA 3CTGA 2H73A 3H4KA 1MD3A 3QAGA 1U88A 1F37A 4ZBAA 1Z3EA 4Q5RA 2P5RA 4LMVA 5ID2A 1NSWA 4DSRA 1TW9A 4YQVA 4FIWA 6GSTA 2DIZA 1U3AA 2C3QA 1ZL9A 2V1MA 5DALA 2LTKA 4V1Ap 1R5AA 2CZ2A 1WP0A 4NHZA 4K6XA 5A4UA 2B5EA 2M46A 4TR1B 2GS3A 1EEMA 1SJ6A 1SK2A 1YJ6A 5AGYA 5ECSA 4NAXA 1ZYQB 3D6IA 3CRUA 2H71A 5IOXA 1GRXA 2EC4A 5JCUA 5B7CA 1HQOA 4IJ3A 5LCZA 2O87A 4F9ZA 3J7Yb 1TRVA 5IOWA 1U87A 3DKSA 1ZZYA 1K0AA 3I43A 2WRTA 4KDXA 2DLXA 2EIOA 4O7HA 2F8AA 3L9SA 1XBSA 4FYBA 4GF0A 3DEXA 2FWGA 4KCEA 2YWMA 3LGCA 1O81A 2O85A 1YEXA 2IMIA 2YWIA 1XOAA 5IMAA 4IP1A 5D8IA 3KJYA 2L4CA 4MZWA 4V2LA 2AHEA 2GSRA 3FZ4A 4CW9A 3HVXA 1XXUA 2L6CA 3CSJA 4TXOA 1VRSD 1Q98A 2VCQA 13GSA 4MMMA 3PINA 1FW1A 3H79A 3ZITA 2VCZA 2REMA 1M2DA 1TRWA 5H5QA 1CQGA 5F06A 2HZEB 1A8LA 1SL2B 5E59A 5FHIA 3KTBA 2B5YA 3CTFA 3DYRA 4XS6A 4F82A 2VD0A 4G9HA 1NM3A 4GSNA 4JU5A 3IOSA 1K3OA 3IXRA 4DVCA 3QDNA 1XPVA 5J9BA 4POKA 1W89A 2LKUA 5ECQB 3ZRDA 4NMUA 2VL2A 2IMEA 1TP9A 2WS2A 2XBIA 1GULA 4L8EA 1TI1A 4WF4A 2LSTA 1OVNA 2L6DA 3GIXA 3HJOA 1GUHA 2GGTA 2R4VA 3GL3A 2HRNA 2L5OA 3DVXA 2OKAA 3JCML 1AAZA 2F51A 4GWRA 5J9CA 1C72A 3TJKA 3IDVA 2TRXA 2C0GA 5HFKA 3US3A 1GL8A 2CQ9A 4L0UA 4NWYA 1QFNA 4CHSA 1G6YA 2VCWA 4IELA 4IW9A 1AQXA 1XWGA 2D2ZA 4POLA 5CRHA 2LQOA 2I81A 1GSFA 2H01A 4HU9A 1K0CA 4GLTA 4IN0A 2YV9A 5KEJA 5G1LA 2IL3A 3IC4A 4I2UA 1XW5A 1N8JA 2VM2A 3LG6A 4KW6A 4KUNA 4WETA 2WJUA 2CVDA 2ZUPA 4PQ1A 2GTUA 2FCHA 4PGTA 3BCIA 4OMVA 2VCVA 1PGTA 2E0QA 2IWTA 5HFIA 4N0VA 3TGZA 1EP8A 5KN1A 2MMOA 3KH7A 5J4UA 4F0CA 7GSSA 2C1YA 5IQYA 1XW6A 1MDJA 2LNTA 3FW2A 2RM6A 4K7NA 4XCSA 1Z9HA 1YEPA 1F3AA 2BMXA 2C3NA 5JCGA 2M72A 5CAXA 8GSSA 2DJ0A 3UEMA 2HSHA 3C1SA 1ON4A 4HI7A 3GH9A 1YF0A 2XBQA 4GSTA 5IPGA 2R2JA 4XTSA 3PR8A 4CDOA 3EURA 1YF1A 1PD21 4GRFA 1I9DA 4BVXA 2P5QA 5LD0A 1EV4A 4PXOA 2GZYA 1VGLA 5AISA 2H0HA 2NPBA 4MH3A 3VWXA 2QC7A 2K6VA 4MABA 1UA5A 5A4VA 1E6BA 1WMJA 3O76A 4LL4B 3UAPA 2X64A 1FVKA 3GV1A 4KDYA 5C04A 2MMAA 3L4NA 1A2JA 3LYPA 4ACSA 1OC8A 3I9V2 4JR4A 1PRXA 2H76A 2ES7A 2LNSA 5ECLB 1HYUA 2H0GA 3TJGA 1K0MA 20GSA 4TR4A 1GWCA 1PX7A 4HUAA 3ERFA 3EC3A 1GSSA 1EGRA 4ZB8A 4MZCA 1ERUA 17GSA 2JZRA 5IIZA 3QFBC 1GSYA 1RK4A 1T3BA 4NHWA 2PMTA 4NPBA 4TR1A 4HDEA 3QFAC 1TRUA 1V2AA 3HA9A 4K0GA 4PQIA 2F8FA 3HKRA 4L5OA 4ZB6A 1A23A 2NTOA 4E8EA 5FWGA 3VWVA 4N10A 4NV5A 4RQRA 3RBTA 5H5SA 2B1LA 3EU4A 2E2MA 3HZ4A 4HQSA 5IMDA 5ECOB 4WR4A 3L78A 4POMA 2E2GA 2WFCA 1AUCA 3ISOA 1URMA 3A3TA 4ZB9A 3KD0A 3A2VA 4I8BA 4DEJA 2C0EA 1X0RA 2YWOA 4X0XA 3DXBA 3ME8A 10GSA 2AAWA 2FWEA 2C0FA 3WGXA 1B4PA 2RUEA 1K0NA 5CRWA 1OC9B 2FA4A 2OE3A 2LUSA 2XPDA 3E0UA 16GSA 2JZTA 4I2TA 2CX4A 3FKFA 3TUEA 3FY7A 1GNWA 3CSIA 3ZLPA 3FZAA 2CA8A 1FO5A 1U3IA 3M8NA 3GYKA 2HZEA 1A8YA 1OKDA 5ECRB 2H6ZA 3RDWA 1FHEA 2GT5A 1K0BA 1BAYA 1GTIA 4MCUA 5ABRA 2V6OA 1M2BA 3J7Yk 5IMZA 3FZ9A 1WWJA 3RHBA 2TRCP 1YY7A 2X99A 3IK9A 3Q6OA 1TJDA 3TKSA 3P2AA 3KMNA 1H75A 2GLRA 2FWHA 3EYTA 1PA3A 3MWHA 1GTUA 1JZWA 2JSYA 2JACA 1J08A 5B8AA 2JZSA 3O3TA 3WT2A 4JE1A 1E2YA 4ISDA 5IM9A 3GA4A 4EDZA 3WD6A 2O89A 5GAND 5L71A 1SD9A 4G2EA 4TVEA 1LU4A 1G0TA 3IPZA 5HQPA 1TOFA 3H1NA 5G1KA 2RLIA 1B9YC 2H1GA 4KNDA 4WR5A 4BVYA 1SKSB 4WBRD 5ECHB 2MBTA 4KA0A 1WJKA 5EPFA 4L0WA 4N11A 4ZXGA 1FAAA 3HHVA 2AUVA 3UBKA 4RQXA 4WEYA 1N2AA 1AQWA 4AF2A 3OR5A 1Z7PA 3EVIA 4F03A 1O7UA 5EVOA 4K8MA 2B3SA 5G5FA 4N0ZA 2HSYA 3GKNA 2X8HA 3C1RA 3LORA 3LFLA 1XWAA 5B6NA 3BJ5A 4DSSB 4RI7A 5CRGA 3F4TA 4EUYA 4BWQA 4NXIA 3KXOA 4WBJA 2C4JA 2GQMA 4EKZA 4IGJA 2DJ1A 2PBJA 3VPQA 2PERA 4KB3A 1KNGA 4X43A 1HNBA 1CQHA 5F05A 3ZREA 2J9HA 1SJIA 2IPAA 2O7KA 1JLVA 3KM6A 1Z6MA 5E4WA 2N5AA 1Z6NA 2EIQA 5CREA 5LNKe 2YV7A 2IMFA 3K8NA 3P8WA 2A4VA 3EMPA 1FG4A 3ZZXA 3HJPA 2MZCA 3VWWA 1B4QA 3F9UA 4OO4A 3EWLA 1PX6A 5ECMB 2OACA 1OKTA 2L59A 3FHKA 1ZGNA 1QGVA 1ILOA 1THXA 3IAM2 4KCAA 4MJEA 3ERGA 2RUFA 3SWLA 4WKWA 2FLSA 4MJCA 2G2QA 2H74A 3WGDA 1TK0B 3TOTA 5ECIB 4BWSA 1MTCA 5DQYA 2C80A 1I5GA 5C00A 3VFIA 1S3CA 1V9WA 3MNGA 5DCGA 3EMXA 3NIVA 3D0ZA 4MPFA 4PUAA 4Z7XA 2I1UA 1KTEA 3W8JA 4D73B 1WPIA 3FEUA 3KP9A 4AJ8A 3TKSE 3KEBA 3H8QA 2NVLA 3QD9A 1SL0B 12GSA 2ALBA 4ECIA 4QL9A 4K7IA 4LA1A 1GUMA 6GSYA 3VK9A 4KX4A 1ERVA 3D4TA 1RW1A 2HE3A 3U5RE 2KUCA 5KN3A 2KP2A 3QR6A 2GSTA 1K0OA 3LWAA 4ZIJA 1XCCA 5CO3A 1SK0A 2F3MA 2YN1A 3WGEA 1BQ7A 4ECBA 4IQAA 1IYIA 3KCMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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