5J9BA

Crystal structure of peroxiredoxin asp f3
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
163
Chain Sequence
GSGLKAGDSFPSDVVFSYIPWSEACGIPINYNASKEWADKKVILFALPGAFTPVCSARHVPEYIEKLPEIRAKGVDVVAVLAYNDAYVMSAWGKANQVTGDDILFLSDPDARFSKSIGWADEEGRTKRYALVIDHGKITYAALEPAKNHLEFSSAETVLKHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of Peroxiredoxin Asp f3 Provides Mechanistic Insight into Oxidative Stress Resistance and Virulence of Aspergillus fumigatus.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Neosartorya fumigata (strain atcc mya-4609 / af293 / cbs 101355 / fgsc a1100)
molecule keywords peroxiredoxin Asp f3
total genus 46
structure length 163
sequence length 169
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5j9bA00
2PGTA 4GWRA 2HXKA 5COHA 1GNWA 1FHEA 3M9KA 18GSA 2YJHA 4KW6A 2MMAA 1C72A 4ZL9A 2HZFA 2ON5A 4V1Ap 6GSXA 2OJLA 1QGVA 3TGZA 2LSTA 1CQHA 1VF4A 1SKWB 4ZB8A 3LXTA 5J5NA 1Y25A 1IYIA 4BA7A 4GTUA 1XWKA 2PPTA 3KCMA 1ZMAA 4HJMA 5IMFA 1FB0A 5LD0A 1ACVA 4PGTA 1SK2A 1LJRA 3DRNA 3I69A 4WBRD 5C04A 4XHMA 3ME8A 1KTEA 1GSSA 3KGKA 2H6XA 6GSUA 5AISA 4I5QA 1GLPA 1B9YC 2ZCTA 2OA7A 4WR5A 3ZRDA 2YZUA 2IPAA 4EXJA 1XZOA 1Z5YE 1F3AA 3LQ7A 2B7JA 4XS6A 3UEMA 1S3CA 5D9TA 1X5EA 2GGTA 2O85A 3QAWA 3TJGA 3M8NA 4N0ZA 3ZTLA 4J57E 3RHCA 1K0BA 2H6YA 3ISOA 2R2JA 3LSZA 3ZITA 4QL9A 1WRYA 2XBIA 5IO0A 22GSA 1EP7A 2EIRA 1B4PA 1TK0B 3QD9A 3VLNA 1YDKA 4KUNA 2O87A 2I3YA 2HI7A 3QCPA 3UMAA 5A4WA 1BQ7A 3A2VA 1XWAA 4OFMA 1OVNA 2CA8A 3GH9A 2TRCP 1FVJA 1XPVA 4YAVA 2FCHA 3CRUA 4O7HA 1A2MA 2PVOC 1URMA 2DC5A 3MNGA 4K1FA 3F3QA 3HXSA 3HHVA 1JLWA 4JEDA 5A4VA 2H75A 1GSDA 3TKSE 5ECSA 4K9ZA 1X9MB 3BOAA 2DIYA 1USBA 2FLSA 2IWTA 1T8EB 1J0FA 2GZYA 3C73A 4EL1A 4TR0A 4PUFC 2L4QA 2YN1A 2OKAA 3EWLA 1T4ZA 2MZCA 2VM1A 2R5GA 1A8LA 1I9DA 3GV1A 2NVLA 3HJPA 3SBCA 1NW2A 4G2EA 4L0WA 1YQ1A 2GSRA 2NDOA 2C0FA 1HNBA 2HRFA 2CZ2A 2FUG2 4EE0A 3UBLA 1DE2A 4EVMA 4Q5FA 4E8HA 5D96A 2WRTA 4YQMA 3DVWA 3KXOA 2HSYA 1FO5A 4I6XA 5ECHB 1F6MC 1SD9A 2GZPA 4N30A 2VL9A 2NPBA 1GLQA 3N9JA 1YEPA 4PQHA 2B5YA 4PURA 2CT6A 1XIYA 3GMFA 2V2GA 2XPDA 5CRHA 4X43A 3ZFBA 5DDLA 1SD8A 1YKAA 5INYA 1XCCA 2WS2A 2KP2A 3EYTA 4XS4A 2LKUA 5ECNB 4YH2A 12GSA 2XHFA 4TXOA 2OACA 1O8WA 4MMMA 4MABA 4TXVA 1ON4A 1GUKA 3VK9A 5E59A 2LJRA 4V2LA 4ZBAA 4GSSA 4ZBDA 1TK5B 5DJLA 2OBIA 2K8SA 4MJAA 2QKEA 2AYTA 4V2MA 2CZ3A 4QL7A 4ID0A 1X9SB 1SKSB 3D21A 4MA9A 3D5JA 1I5GA 2YJ7A 3H8QA 4RI6A 2YV9A 2OE0A 3QAVA 4HU7A 4GF0A 3FKFA 5JWOB 2M72A 1AIUA 1PX6A 1Q98A 2YWMA 1ML6A 2F8AA 1BAYA 3GKNA 1T7PB 1BX9A 4ACSA 2VD0A 1ERTA 5DALA 1VF2A 2RUFA 2E0QA 3FYGA 4LMVA 1ZOFA 2HSHA 1DE1A 1EOHA 2M80A 3M1GA 1YY7A 3DGQA 5EL8A 5HQPA 5B6MA 3HCZA 4JZQA 3L4NA 4G9HA 4WETA 1MTCA 4FO5A 2C0EA 1VF1A 5ECPB 3DXBA 1PSQA 6GSSA 2FA8A 1A23A 5KN1A 3GN3A 4HUAA 1ZCPA 2HZEA 4D73B 1RK4A 3CBUA 3GX8A 1R26A 4KSOA 1WWJA 2LTKA 3LEFA 3GIXA 1GSQA 4GRFA 2H8LA 5ECOB 3GSTA 1QXHA 4N0VA 1O6JA 1R7HA 1NHYA 3WT1A 1GWCA 3P8WA 4H86A 1EV9A 2V41A 4ZL8A 3KJYA 1MDIA 2L4CA 2H71A 1G7EA 2DJ1A 2IFQA 2MBTA 2H6ZA 3GHAA 1O73A 20GSA 1JZOA 3TRQA 3ZIVA 4ISDA 5IOWA 2BJXA 1TI3A 1V58A 2GLRA 5G31A 2N5FA 3F6DA 4ZL7A 4HDEA 1SENA 1EZKA 2V6OA 1XVWA 3HVSA 5D93A 2C1YA 2AV4A 2VM2A 3G7JA 3GKMA 1A2JA 1OKDA 1SK0A 2B5XA 1XW5A 2PERA 2OE1A 1HNCA 5ID2B 2H76A 1M99A 3DYRA 2LEGA 4WBJA 3LFLA 5JCUA 2IMIA 4TR4A 3GTUA 3VWWA 3H93A 2VAFA 4Z7XA 3D22A 5ELAA 3TOUA 3Q19A 1R4WA 1SYXA 4L8EA 5H5QA 5A5KA 2AJQB 2H19A 4FYUA 1GTBA 2YP6A 4L5LA 3FZ4A 5EPFA 1A0RP 5G1LA 3IAM2 5ABRA 3IK9A 4ECJA 1GSFA 1B48A 3QR6A 1DBYA 5A4UA 1OKTA 3ZFLA 3CSHA 2WDUA 1THXA 3O76A 2FA4A 4KGIA 1TU7A 3EU3A 3HZ4A 1V98A 4PQ1A 1EV4A 2F51A 1PL2A 2C8UA 3U5RE 5KN2A 4XS4B 3FZAA 3DD3A 1PGTA 3PH9A 1O81A 3M0FA 4TXOB 5FWGA 1YKCA 1AAZA 2CVKA 4ZXGA 2A2SA 3MAKA 2GZZA 5L71A 2H1AA 3IAS2 4MLYA 1HYUA 2O8VB 5HFIA 1M9BA 5CP1A 2DIZA 2FWHA 3BBYA 3ME7A 1F3BA 3LWAA 5GAND 4OFTA 2O7KA 3IHQA 4O32A 3UBKA 3TJJA 4TR3A 3VPTA 3OR5A 4ECBA 2C4JA 2VD1A 4NV2A 3TKRA 2WB9A 3M3MA 1W4VA 4YAPA 3ZREA 2YNXA 2VO4A 1MEKA 1Z3EA 4JU5A 1PD21 3GNJA 2I9HA 2QSIA 1MD3A 1ZZYA 5G2ZA 4LMWA 2KP1A 2YANA 3P90A 4XIHA 5KN3A 2WZ9A 3GX0A 2FWFA 2GSSA 2O89A 4GXZA 5KN0A 2DBCA 2IN3A 5DALB 4IP6A 2G0FA 1PL1A 1SJIA 4K7NA 5LCZA 4RUVA 3ZMLA 4EDYA 5CNWA 1S3AA 3H4KA 4KAEA 2H73A 1K0OA 1GSEA 3FK8A 1K0MA 3APSA 1ERUA 2L6DA 3TKSC 2KHPA 1X5DA 2HZEB 2B1KA 5JCWA 5DQSA 1LBKA 1ERWA 4DEJA 1F2EA 3C7MA 4MPFA 1GP1A 4WEYA 3DWVA 3RHBA 4OMVA 3H1NA 5D8IA 3CMIA 4Q5QA 2IFQB 4TN8A 2YCDA 2OADA 1M2DA 2YZHA 1PA3A 1K0AA 1DSBA 1TRWA 4EKZA 1U6TA 2GVPA 4AF2A 4RQXA 5ECKB 2IIYA 2VCXA 4KDUA 1SL1B 3GSSA 4IQAA 2TIRA 3ERGA 4TKYA 4FYCA 8GSSA 1OE7A 1WP0A 2B1LA 3QAGA 1ZYEA 3V1WA 3P2AA 4D73A 2X8GA 2V6KA 5B6NA 3ZVJA 1G7OA 4ILFA 3ERWA 1XXUA 1GNEA 2GDRA 3QDNA 2NBSA 2N5BA 4KH7A 4NAXA 3APOA 1T1VA 4NV5A 1PX7A 5HR2A 3WGDA 3F6FA 3GTUB 2A2RA 2H72A 2IMEA 3JCML 2H0GA 1FG4A 3FR6A 1TKDB 3J7Yk 1BJXA 2VCVA 4AJ7A 3ZYWA 4TRXA 2MMOA 1O8XA 3PR8A 3BD2A 2K8VA 5IMDA 5ECMB 4EDZA 5ECRB 4BWQA 3VWUA 1TRSA 5KEJA 2X8HA 2DLXA 1TI1A 2A4VA 4MZBA 2P31A 4JRRA 1Z7RA 2L59A 2VL3A 2VIMA 5EY6A 1G0TA 3A2XA 1JZRA 2FNOA 4KB3A 3MSZA 3N5OA 3L0HA 3ERFA 5ID2A 1Z9HA 2HFDA 4PUAA 4RQRA 4IBPA 2GTUA 1B8XA 2E2GA 5AIXA 1VF3A 2X99A 3IK7A 3IRAA 4ZILA 3PGTA 3CTGA 3KTLA 4MH3A 5GAPD 3C1RA 2H1GA 4MZCA 3KP9A 1JZWA 3CXGA 3DVXA 3CRTA 3LGCA 2LRCA 1G6WA 4OD7A 3UOMA 3D4MA 3Q18A 4AJ6A 3L9UA 4ZB6A 2I1UA 2VCZA 2CV4A 2L5LA 4MZWA 2B6MA 3GKKA 1EGOA 1QFNA 2WCIA 1F9MA 2JACA 5J9CA 3IXRA 3A2WA 1HNAA 1GRXA 3BCIA 3WGXA 2AAWA 1SJZA 1TDIA 3Q6OA 4POKA 3IDVA 1PKWA 2RIIA 6GSVA 1SYRA 2GQLA 3TKQA 1XW9A 1J9BA 2VCQA 4HQSA 1H75A 4CDOA 3IC4A 5JWRB 1UN2A 2C3NA 4HQZA 5C00A 4EUYA 4XTSA 1A2LA 4IQ1A 3C71A 3P7XA 2ES7A 2C3QA 2V32A 3DEXA 3UJ1A 1OC8A 1FB6A 2D2ZA 4LL4B 5IMAA 1GTAA 1A0FA 3FR9A 2EIQA 2GSQA 5GSTA 4PNFA 1T00A 3NIVA 4L5OA 7GSSA 5DAKB 4EF0A 4XS1A 4IN0A 1XVQA 2P5RA 3A5WA 1ILOA 4WF4A 4AJ8A 3EU4A 2X64A 3EMPA 1TRVA 3MWHA 5B7CA 3UARA 3R2QA 2EC4A 3H79A 5ENUA 2DMMA 2JL4A 4TOPA 1E2YA 1M0UA 3CTFA 1XBSA 2LRNA 1N8JA 1PKZA 2BTOT 3WYWA 2I81A 4HU9A 1V40A 4F2IA 1B9XC 2Z9SA 2XBQA 4V1Ag 3F4RA 4AGSA 2FD3A 2VLVA 3E3EA 1X0RA 3I6AA 5CRWA 1TK8B 1GH2A 4POMA 3GL5A 3HD5A 4GQFA 3UVTA 3BJ5A 3NOFA 3QPMA 1ZL9A 2ON7A 4GSNA 3TRPA 4HJ2A 1J08A 1ST9A 3GRXA 3KEBA 4J56E 1AQWA 5F05A 2PU9C 1Q4JA 4MK3A 3TB2A 2YWIA 3HVVA 4OFNA 3HJMA 1O7UA 2DJ2A 4CHSA 14GSA 2L6CA 3IPZA 1GSUA 3LJRA 3TDGA 3DKSA 3VI7A 2PN8A 3KM6A 3GL3A 2OBKA 1XW6A 2AHEA 2F9SA 4ZB9A 4KCEA 5J41A 3O6TA 2WFCA 1HQOA 1KNGA 1W89A 2YWOA 4MF6A 2DJ3A 2VLTA 5B8BA 1PQNA 2FHEA 4G10A 5IPHA 1NSWA 4K0GA 4MPGA 1M7TA 4V2NA 11GSA 1YF0A 4K8MA 1Y6EA 1U87A 2DJJA 3W8SA 4XRAA 5J9BA 3GUSA 1AC1A 3RBTA 1IYHA 2K6VA 2WJUA 3KH7A 3EE2A 3VI5A 2DJKA 4PXOA 4GSTA 2YV7A 1K3OA 3ZMKA 3C1SA 2J23A 1BG5A 3WGEA 4L0UA 3TKSA 1GSYA 5F06A 1OE8A 2J9HA 4IJIA 3RDWA 5DQYA 4K7IA 3QMXA 2N5AA 1KEBA 1SL0B 3U6VA 2LRTA 4OWYA 2R3XA 2MYGA 3ZL5A 4F0CA 2V1MA 4IJ3A 2JADA 1GTIA 3LYPA 2VOCA 1FOVA 2HLSA 3W6GA 3VFIA 1T3BA 3HVXA 1GTUA 1OYJA 3KD0A 2LQOA 3CSIA 2CAIA 1WMJA 3CSJA 5IM9A 1X9WB 2JZTA 4MJBA 2DMLA 4WXTA 5CYYA 5G1KA 3US3A 5AN1A 1ZYQB 3AY8A 1EEJA 3TOTA 1XWCA 1YEXA 5GZZB 2L5OA 2HRNA 1ERVA 3HZ8A 2TRXA 2CQ9A 3ZLPA 3TJFA 3IA1A 3G7YA 1M9AA 4QQ7A 2FWGA 4TR1A 1KBNA 5G5EA 3KTBA 1TOFA 4TW5A 4WF5A 3J7Yb 3K8NA 1TP9A 4DSSB 2G2QA 4GCIA 4DSQA 1DUGA 4GQCA 4POLA 1XWGA 4MCUA 4MDCA 2LS5A 4JR4A 5ECLB 1YF1A 2OE3A 5AGYA 2XC2A 1WPIA 5H5SA 2K18A 4F82A 2M46A 2CAQA 3F9UA 3TJBA 5F0GA 4YQUA 1WIKA 1XOAA 5DAKA 5CAXA 4MP4A 2IMDA 4RI7A 5HR3A 3F0IA 5D9VA 4IP1A 4N11A 4HEA2 4WKWA 3F3RA 2IJYA 6GSTA 2KOKA 3GA4A 1AQXA 1BYEA 2FGXA 4JBBA 4MH2A 4ECCA 1AW9A 4GLTA 2K9FA 1TXXA 4IVFA 4K0NA 5FHIA 2DSAA 3RPPA 6GSWA 4MF5A 3L9VA 2VLUA 16GSA 2VUPA 4HZ2A 1WE0A 5CREA 4KCAA 5DVBA 4N10A 5LNKe 1ZGNA 1A8YA 1SJ6A 1GL8A 1V9WA 3M9JA 4OCFA 2KUCA 2MBSA 5D73A 2REMA 3QFBC 1SL2B 2E2MA 2VL2C 4ML6A 1UA5A 2JSYA 5IMZA 3ZVJD 3FHKA 2QGVA 3ED3A 1V57A 4Q5RA 5G30A 4IS0A 1YJ6A 3E0UA 3EVIA 2HNLA 4BVYA 3F63A 5J3RA 4OCEA 1JZDA 4YQVA 6GSYA 4MJEA 2JSZA 3VWVA 4OO5A 1WOUA 4BPYA 3TCOA 5GSSA 3LXZA 2FY6A 5HR1A 4X0XA 3VURA 2PUKC 2PBJA 2H70A 1E6BA 2HYXA 4IHUA 5B8AA 1K3LA 1TJDA 2RUEA 5HFGA 3IBHA 3EURA 2CVBA 2RLIA 4HOJA 1EWXA 1H4OA 2C3TA 4OO4A 1THOA 5ECIB 2F8FA 2JZRA 4I2TA 1RQMA 1FAAA 1JFUA 1QQ2A 4IGJA 3FRCA 1XOBA 2YOIA 3HDCA 4KSMA 1TW9A 3CYNA 3HY2A 1SU9A 4XRDA 3IE3A 3VPQA 2H0HA 5IOXA 1FW1A 3TRXA 1GUHA 2YWNA 1UVZA 5HR0A 5IQYA 2LJKA 4J2FA 19GSA 2AUVA 1PRXA 5ECQB 1EGRA 1X5CA 3TKPA 3GURA 1Z7PA 4HS1A 3UVHA 1O85A 4EO3A 3L9SA 4LA1A 3FY7A 2WULA 1QMVA 1AXDA 5D9XA 4KNDA 2P5QA 2DJ0A 1MD4A 1S3DA 3KH9A 4ZIJA 4TR1B 1RW1A 1A24A 1GUMA 2ZUPA 1TRUA 4PQIA 2LQQA 2IL3A 1R5PA 2EIOA 5E4WA 4CW9A 2GS3A 4G19A 1F37A 2B5EA 2ALBA 1XWBA 4WR4A 4LLRA 2H0IA 2RM6A 3IR4A 1YZXA 4POBA 3DMLA 4NWYA 1LU4A 1K0CA 3FW2A 2ZNMA 1PN9A 5JCGA 9GSSA 3UIWA 2H01A 5F07A 2H66A 2GQKA 2B7KA 1NM3A 1MDJA 3FEUA 1OC9A 1G6YA 3HKRA 4KDXA 2LNTA 2FWEA 2H74A 4F0BA 2JU5A 4O92A 3KP8A 1M2BA 4NPBA 4K6XA 1WJKA 3PINA 1VRSD 4DSSA 1OAZA 4KDYA 1K0NA 2PVQA 5AIVA 5FT3A 1UC7A 3EC3A 3HJOA 5H5RA 1U3AA 2P0GA 3GYKA 5CO3A 2YPMA 2VCWA 3APQA 3I43A 1V2AA 2XPEA 3FZ5A 17GSA 4I2UA 3SWLA 5DJMA 3RAZA 3WT2A 3IOSA 1TU8A 1SK1A 1Z6NA 5IO2A 2LJAA 5G5FA 4LL1B 3NZNA 4I8BA 4E8EA 4I97A 3UL3A 3KIJA 2WGRA 5EVOA 1PMTA 4JE1A 3I9V2 1B4QA 4X1UA 2PWJA 4Q5NA 4TVEA 1HD2A 4XCSA 1N2AA 1QK8A 4DSRA 1EP8A 4IKHA 1CQGA 4BWSA 2C80A 3C8EA 4HZ4A 4P3YB 2QC7A 4IELA 3IV4A 2CVDA 3D0ZA 4KA0A 2LUSA 2B3SA 4KE3A 5IPGA 5J4UA 1ABAA 1U88A 2GSTA 3VWXA 5DCHA 3GH6A 3UAPA 2MMNA 3E9JB 3S9FA 3WD6A 3HYPA 5IIZA 2MMZA 2BMXA 1JLVA 4NXIA 3ZIJA 5DBQA 2E7PA 2LV3A 4EC0A 1AUCA 4IW9A 2H1DA 2AB6A 2R37A 4BVXA 3FZ9A 3ZZXA 1XFLA 4ECIA 5JWQB 2GQMA 2GT5A 2CX4A 3F4SA 1BEDA 3D6IA 5F8BA 3G7IA 3W8JA 4O5RA 3EINA 1JHBA 3F8UA 5CRGA 1NHOA 2LNSA 1QUWA 1MDKA 3LYKA 5HFKA 3TUEA 3KMNA 4MJCA 3F4TA 5IMCA 3QOUA 5D9WA 4HI7A 2C0GA 4K2DA 2H30A 3KZQA 1GULA 2CX3A 2JZSA 2VCTA 1VGLA 2IMFA 2IMKA 3G9BA 5DCGA 1AQVA 1EEMA 4DVCA 4PX1A 2F3MA 3L78A 3EMXA 3LG6A 2R6KA 4JR6A 1FVKA 5CRDA 1M2AA 4K7OA 3GFKA 3DIEA 2C0DA 3BCKA 4KX4A 5IMVA 2HE3A 1T4YA 4NHWA 2GT6A 1K3YA 2R4VA 2HT9A 4MF7A 1TTZA 2NTOA 3RPNA 3Q74A 3QFAC 4PNGA 3MDKA 1SKRB 4NMUA 1R5AA 4ULXA 1EOGA 4F03A 4BL7A 2KLXA 3A3TA 4FH8A 2VL2A 3KMOA 3D4TA 2RM5A 1U3IA 2PMTA 4ML1A 2L57A 5ELGA 1K0DA 1OC3A 1OC9B 1Z6MA 2X8CA 4FIWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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