5J9BA

Crystal structure of peroxiredoxin asp f3
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
163
Chain Sequence
GSGLKAGDSFPSDVVFSYIPWSEACGIPINYNASKEWADKKVILFALPGAFTPVCSARHVPEYIEKLPEIRAKGVDVVAVLAYNDAYVMSAWGKANQVTGDDILFLSDPDARFSKSIGWADEEGRTKRYALVIDHGKITYAALEPAKNHLEFSSAETVLKHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords peroxiredoxin Asp f3
publication title The Crystal Structure of Peroxiredoxin Asp f3 Provides Mechanistic Insight into Oxidative Stress Resistance and Virulence of Aspergillus fumigatus.
pubmed doi rcsb
source organism Neosartorya fumigata (strain atcc mya-4609 / af293 / cbs 101355 / fgsc a1100)
total genus 46
structure length 163
sequence length 169
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5j9bA00
5HR0A 2H8LA 2YWIA 1OKTA 5IO2A 2TRCP 4EDYA 3IOSA 3D4TA 3TJKA 2ALBA 4POBA 5DBQA 4J57E 1TK8B 1TDIA 3P2AA 1Z9HA 3N5OA 2XC2A 2FA4A 2G2QA 2JU5A 5HR2A 1PQNA 3M3MA 2CA8A 5F8BA 5D9TA 1T8EB 1A23A 5IOWA 1R7HA 2H74A 5IO0A 3I43A 3ZTLA 5J41A 2WFCA 2JZTA 5D9WA 1T4YA 3TOTA 1JLVA 4PQHA 4LL1B 4IQ1A 4DSRA 1O7UA 4Q5QA 3TDGA 1VRSD 2H1AA 3EWLA 1TI1A 4O32A 1PL1A 4XS6A 1GUMA 2JZSA 2DJ3A 4Q5NA 2L6DA 2DSAA 2IJYA 4MJCA 3HJMA 1FVJA 4XS1A 4TXOA 2YOIA 2A2RA 5GSSA 1K0CA 2P5RA 2WDUA 3ZITA 1SENA 1M9AA 4JEDA 2VL2C 4ZB8A 1EOGA 1Z6NA 3VWXA 2REMA 3D4MA 2FD3A 4K1FA 5JWOB 4G10A 3DRNA 5DQYA 3TKSE 2RLIA 3GN3A 4TR0A 3PH9A 3TRQA 1W89A 1PN9A 3FR9A 3MDKA 1C72A 3BJ5A 4IN0A 3KMNA 3VWUA 4E8EA 4E8HA 3BOAA 3KH9A 2PVQA 2V32A 3M9JA 2K18A 3IV4A 5IMCA 4J2FA 2HSHA 2HLSA 3KTBA 4XS4A 2MMNA 5GSTA 4EL1A 3A5WA 1GSSA 3NZNA 1EWXA 3DGQA 1Z7PA 3ISOA 1AC1A 4V2LA 5ECOB 2R6KA 2I81A 4AJ6A 1T00A 3DVXA 4MF5A 4POKA 3TB2A 2R2JA 3CRUA 4JRRA 2H73A 2LUSA 5CNWA 3LXZA 2VCXA 4NHZA 4MK3A 2IN3A 3D5JA 1K0DA 4MCUA 4KCEA 2C1YA 4MP4A 5D93A 2M80A 2VLUA 3DKSA 2E2MA 3LQ7A 3HVXA 2WS2A 1ACVA 4AJ7A 3TRXA 2H0IA 3J7Yk 2C3NA 2DIZA 12GSA 4GSNA 1ST9A 4F2IA 1G6YA 4TXVA 3UAPA 1XFLA 3KEBA 1O6JA 3GH6A 2VIMA 1O73A 1A0RP 5LD0A 2YWMA 1QUWA 2E0QA 1K3YA 3BBYA 5EPFA 3TGZA 2O89A 5ECKB 1GSYA 4OCEA 5AGYA 3IAS2 2DJKA 3QAWA 2EIOA 3F8UA 1TK5B 3GH9A 2JADA 2VLVA 3H93A 5IMFA 3FYGA 5INYA 1PMTA 2B7KA 2CZ2A 4KX4A 4ZB6A 3GTUB 3C71A 1O8WA 1PGTA 3RHCA 3VFIA 4K6XA 3W8SA 4OFTA 3TJFA 1R26A 4OWYA 1F6MC 1T3BA 5ECLB 4IELA 3ZRDA 3E0UA 3DWVA 2O8VB 2LV3A 2H6ZA 2NBSA 1XIYA 1SK0A 2FUG2 3HJPA 2MBSA 1X9MB 4K7IA 1N2AA 2VL9A 5J3RA 8GSSA 3FKFA 3JCML 5AIVA 1SL0B 3RPNA 4K2DA 18GSA 5IQYA 1SYXA 4AGSA 3A2VA 4N0VA 3KJYA 3EVIA 4V1Ag 4GTUA 1ZYEA 4O7HA 2BJXA 1YEXA 1T4ZA 2GSTA 1H4OA 5HFGA 1DUGA 5IMAA 5LNKe 1GWCA 3ERWA 1QK8A 3P90A 4MJBA 1RW1A 3R2QA 4DEJA 1N8JA 1A2LA 1XOAA 1AXDA 3D22A 5GZZB 4G2EA 4GCIA 2DLXA 3AY8A 3Q19A 2VM2A 4NV5A 3KP9A 3LGCA 4PQIA 2OA7A 1YKAA 4HUAA 4V1Ap 3IE3A 5G5EA 4IP1A 1EGRA 1BYEA 1V40A 2GT6A 2IFQA 1AUCA 4WXTA 5D8IA 1X9WB 5ECMB 2C0DA 2VL2A 3P8WA 1T1VA 2LRCA 4ECCA 3IAM2 4F0CA 1YY7A 4NHWA 1JZOA 4NV2A 3L78A 4MZBA 1SU9A 5CRGA 5D9VA 1UA5A 5B6MA 2K8SA 2X8GA 5DJMA 2VD1A 4ML1A 2H1BA 5DVBA 5F07A 1OC9B 1LJRA 4ZILA 1WOUA 2PBJA 2LNSA 1YKCA 4DSQA 4EE0A 1Y6EA 2GDRA 1OVNA 5IMZA 1GL8A 1F3BA 1M0UA 2KP2A 4ECBA 4IJIA 2HYXA 2LEGA 2R3XA 4K7OA 3IA1A 1GSUA 3CMIA 1ZCPA 2JSZA 3QFBC 4IKHA 2WCIA 1QMVA 1JFUA 2OJLA 5D9XA 4LA1A 3ZIVA 4HZ4A 1GSQA 3WT2A 1WIKA 1XZOA 2LJKA 2ZCTA 1R5PA 2F8AA 4AF2A 1TI3A 2VCTA 2LJAA 4DSSA 2XPEA 2IMEA 4HJ2A 2L5LA 3F9UA 4KW6A 2GQLA 5ECSA 2L5OA 4PQ1A 3FW2A 3CSIA 5ECPB 5ELAA 4RUVA 2N5BA 5HR1A 3MSZA 1Q98A 1JHBA 4MLYA 2D2ZA 1KBNA 2LQQA 5DAKA 5ECIB 3GYKA 3KD0A 1MD4A 3ME7A 2XBQA 1A8YA 9GSSA 2HI7A 2DJ0A 1A24A 3ZVJA 4BWSA 2HSYA 1V57A 1F3AA 5J9CA 3VURA 2KLXA 3QCPA 2GQKA 3C1SA 3C73A 4QQ7A 2H66A 5CRHA 1OE7A 3S9FA 1GSFA 1XPVA 3LSZA 4IJ3A 1TRSA 4EXJA 3RAZA 4IQAA 2P0GA 5ID2B 4MH3A 3GURA 2JACA 3Q6OA 1KTEA 4GRFA 4GSTA 1JZDA 2OKAA 1BQ7A 5KEJA 5D73A 2VCVA 1XW9A 2F9SA 4IVFA 2NTOA 6GSTA 1JZWA 1EEMA 1THXA 2PWJA 2F51A 3UOMA 1PD21 1XW5A 3C8EA 4KSOA 1A0FA 4I2TA 2O87A 4MA9A 1DE2A 1FOVA 4J56E 2FWFA 3ERFA 2H75A 4KDYA 4DVCA 4N10A 3VI7A 1M2DA 1S3AA 3FZ5A 5B6NA 4FIWA 4QL7A 2YWOA 3ZL5A 2VLTA 2N5AA 2VL3A 4YQMA 3APSA 2GZZA 1F2EA 2H1GA 2B7JA 4FO5A 4IS0A 17GSA 4KUNA 2HNLA 3EMXA 4N30A 5F05A 1F37A 1M7TA 5ECNB 2FWHA 1SJIA 2VO4A 2LKUA 2FCHA 6GSXA 4ZBBA 2GSSA 2HZEB 2LRTA 4ID0A 2CVBA 2MMAA 3TCOA 3FZAA 3EINA 3UVTA 1X5EA 1GP1A 1U6TA 2RM6A 5IPGA 5GAPD 3CRTA 4K9ZA 3GV1A 4Q5RA 4D73A 1WJKA 2IMKA 4RQXA 3GNJA 5FHIA 1SD8A 2H0GA 1ERVA 1PA3A 4L0WA 4IHUA 1XWKA 1OC8A 1OC3A 2Z9SA 3LEFA 4GQCA 3GKKA 5J4UA 5JWRB 2ZUPA 2VM1A 4HQZA 2C0EA 4O92A 1HQOA 3UBLA 4RI7A 2VCWA 3A2XA 3EMPA 4OCFA 4MPGA 4PUFC 3KM6A 3LFLA 2HXKA 3FEUA 3LWAA 4NPBA 4K0GA 4YH2A 5A4VA 2QGVA 4OMVA 1LBKA 2IIYA 1BAYA 2OE0A 3UARA 3ED3A 4HS1A 2CX4A 2B3SA 5G2ZA 3APOA 4KDXA 1K3LA 1XVQA 4CW9A 4POLA 2H1DA 5DCHA 3TKRA 1HNCA 1ZL9A 3ZMLA 1R5AA 1XWCA 5J5NA 4WR4A 2M46A 3HZ4A 5C04A 3EC3A 6GSYA 3Q18A 1SYRA 2X99A 3HXSA 3LXTA 1UVZA 2ON5A 1JLWA 2HRNA 2KP1A 3FR6A 4I6XA 1A2JA 4HEA2 3F6DA 2LJRA 3HCZA 1HD2A 3L9UA 2X8CA 4O5RA 4GXZA 2YANA 1EZKA 2EIRA 4GLTA 2QKEA 5H5SA 3BCIA 3I69A 5ID2A 1ERTA 4XRDA 1MDKA 1XVWA 2MZCA 3G9BA 2BTOT 3GX8A 4MH2A 2YWNA 5KN1A 1TRVA 4I8BA 1BX9A 1EP8A 4MZCA 3K8NA 3M1GA 5G1LA 2B5YA 13GSA 3H1NA 3HDCA 3H4KA 1OE8A 1FB0A 4LLRA 2OBIA 4WEYA 2DJ1A 1FVKA 2CAQA 1ZMAA 2CVDA 3HY2A 2GLRA 2IPAA 5CO3A 3O76A 1WWJA 3D21A 4RQRA 5HFKA 4YQUA 4PXOA 3O3TA 4TR1B 2KUCA 1URMA 4ACSA 4TN8A 1OYJA 2XHFA 2CV4A 1SL2B 2LTKA 4F0BA 4QL9A 3QPMA 1SKSB 5CP1A 1AQVA 1WMJA 4XHMA 4RI6A 2CT6A 3U6VA 3GX0A 2H6XA 3DEXA 3IRAA 1V2AA 2H19A 3M8NA 2QSIA 2OACA 1T7PB 1FAAA 2F3MA 2MMOA 3IHQA 2KHPA 5IMDA 1TRUA 4ZXGA 4TW5A 4ECIA 1TK0B 1U88A 5IOXA 2HE3A 3DVWA 3G7IA 4HU9A 1M2AA 2OBKA 1YQ1A 2PMTA 4WBRD 1DE1A 1VF1A 2VOCA 3ZREA 3IR4A 3C7MA 3VPQA 4ZIJA 1USBA 1Z5YE 2L59A 2H6YA 5J9BA 2HZFA 1MEKA 2PUKC 3F6FA 4HDEA 1I9DA 3TRPA 1Q4JA 2FWEA 1GSEA 2E2GA 1CQGA 1GTUA 2CVKA 1THOA 3TKQA 1GRXA 5DALB 3FHKA 4YQVA 5KN2A 3HHVA 6GSWA 3IC4A 2DMMA 2WB9A 4I2UA 2FA8A 5CRDA 4P3YB 3KXOA 1EV4A 4L5OA 3E3EA 4MPFA 5FWGA 1PL2A 3GKXA 1TXXA 4KSMA 3IDVA 1PRXA 1PKWA 1FO5A 4XIHA 2O85A 4HJMA 1AQWA 4ZBDA 4ISDA 4GSSA 1SK1A 2H72A 2ES7A 3GL3A 1NHOA 2OE3A 2R5GA 1KNGA 5IM9A 4OD7A 1B48A 4WKWA 4LMVA 4TVEA 1NW2A 4L0UA 1ZOFA 3M9KA 1OAZA 1H75A 1XWGA 1XBSA 3QR6A 4ZL7A 3CSHA 2XPDA 3GRXA 4EKZA 3FY7A 1Z3EA 1G6WA 5CRWA 5C00A 2YZHA 4MJAA 2VUPA 1VF3A 3GHAA 3A2WA 2IL3A 1SL1B 5IIZA 3WGDA 2DJJA 1OKDA 4CHSA 11GSA 2GZYA 3HA9A 4EDZA 3CTFA 3DMLA 2YV7A 4FH8A 4EO3A 5DDLA 4TRXA 4IGJA 2GVPA 2YPMA 3L9VA 3TJJA 3ZIJA 2QC7A 3F4SA 1DBYA 2FGXA 5ECHB 1AQXA 1NSWA 4JU5A 2YJ7A 3PR8A 1RK4A 2H0HA 1SJ6A 4TXOB 4NAXA 4F82A 4PX1A 2PVOC 2L4CA 3IBHA 2GZPA 1ON4A 2C3QA 1S3DA 4MF6A 2GSRA 3US3A 4ILFA 2LNTA 5CAXA 3ZYWA 5HFIA 4PGTA 2B5XA 4KE3A 4TOPA 1I5GA 3LORA 3H8QA 4OFMA 2J23A 1NHYA 2C80A 2E7PA 3MWHA 3SWLA 2M72A 3UJ1A 1V58A 1G7OA 1CQHA 3UL3A 5L71A 1FG4A 3RPPA 4OO4A 3KCMA 2XBIA 5ENUA 1GTBA 3GTUA 6GSSA 4XS4B 1U87A 2L4QA 3J7Yb 2RUFA 5EY6A 4I97A 1SKRB 1MDIA 1O81A 4BVXA 3CBUA 3PGTA 4MMMA 2C0FA 3FR3A 2YCDA 2GSQA 2WRTA 2R4VA 1BEDA 4KH7A 3HD5A 2MYGA 5JCUA 2RIIA 3QAGA 1SD9A 3GL5A 4BA7A 4F03A 1TOFA 5F06A 2LRNA 2P5QA 1X9SB 4KAEA 5IMVA 3F3RA 3UVHA 3F0IA 1VGLA 6GSVA 4KA0A 5G5FA 3ERGA 3UEMA 1A8LA 3MAKA 1ERWA 1SKWB 4PNFA 2O7KA 2TRXA 4HQSA 1TRWA 1QFNA 4YAVA 3GKNA 3PINA 3EURA 2H01A 1TKDB 1TJDA 2PERA 4FYBA 2LS5A 2MBTA 3G7YA 5CYYA 2GTUA 2WGRA 3ZMKA 1PX7A 3P7XA 1TTZA 1TW9A 1K3OA 4H86A 1WE0A 3U5RE 3GIXA 3HJOA 2V6KA 4K0NA 1B4PA 2K8VA 1IYHA 4PURA 4TKYA 2H70A 3TUEA 1ABAA 1GULA 2YNXA 1B9YC 2IMIA 1O85A 1YDKA 2RUEA 2HFDA 4X1UA 2G0FA 3ZLPA 3IXRA 4MF7A 1Y25A 3IK9A 2I3YA 1A2MA 1OC9A 4JR6A 1UC7A 3LYKA 1QQ2A 2DC5A 4Q5FA 1TU7A 2VCZA 5G1KA 3CTGA 3CSJA 1YF1A 2B6MA 3GFKA 3ME8A 2I9HA 1EOHA 4BWQA 3MNGA 2YZUA 3UMAA 3NIVA 3A3TA 3D0ZA 1EV9A 4EF0A 2GGTA 2CAIA 1SJZA 3CXGA 1XWBA 4MABA 1K0AA 2K9FA 2WZ9A 3TKSC 2B5EA 2DMLA 1GUKA 3LYPA 2EIQA 1S3CA 3BD2A 4GWRA 3E9JB 2PPTA 3ZFBA 4IP6A 4V2MA 2IWTA 1WPIA 4G9HA 2V2GA 1EGOA 3GUSA 3VI5A 1ZYQB 4F9ZA 3HVVA 3HVSA 2FLSA 4JE1A 5H5RA 4KGIA 1R4WA 5LCZA 3FZ4A 3LJRA 2IFQB 2J9HA 1J08A 2JSYA 22GSA 3G7JA 3QDNA 1PKZA 3DXBA 1AW9A 16GSA 4HOJA 4G19A 1GLPA 1FB6A 1HYUA 4EC0A 2R37A 1AIUA 2V6OA 1IYIA 1XCCA 1UN2A 5B8AA 1FHEA 3V1WA 3WGXA 2PU9C 2A4VA 2WJUA 1YJ6A 1PX6A 3DD3A 14GSA 5KN0A 3KZQA 3EYTA 2H76A 3ZFLA 4GF0A 1X0RA 4KDUA 1JZRA 1SK2A 5HR3A 3WGEA 3EE2A 1HNBA 1M9BA 2HT9A 2JZRA 1Z6MA 4NWYA 1GH2A 3KTLA 4KNDA 4JR4A 3HYPA 4TR4A 3UBKA 2V1MA 3I6AA 4ZBAA 1GTIA 3IK7A 4YAPA 1ERUA 2H71A 4HU7A 1M2BA 2MMZA 3DIEA 4DSSB 4IBPA 4X43A 1QGVA 5JWQB 2VCQA 1TP9A 1VF4A 1XW6A 4Z7XA 5DJLA 4HI7A 4LL4B 4LMWA 2AUVA 2YN1A 1ZZYA 5ECRB 1ILOA 4ECJA 5JCGA 3H79A 2YJHA 1MDJA 2C3TA 4WETA 3QMXA 3VWVA 2DJ2A 1EP7A 4FYUA 5DAKB 20GSA 3GSSA 1B4QA 1VF2A 3LG6A 1K0OA 1W4VA 3RHBA 5D96A 2F8FA 1B8XA 4POMA 3FK8A 2HRFA 2BMXA 4L5LA 3F4RA 1V9WA 2L57A 3WYWA 2HZEA 1O8XA 1XXUA 5KN3A 4ZL8A 2C4JA 2OADA 3F3QA 2FNOA 4XCSA 3EU4A 3VWWA 1X5DA 1TU8A 3I9V2 4JBBA 2RM5A 1MTCA 4K8MA 1YEPA 5E59A 4OO5A 1GSDA 2JL4A 4MJEA 4GQFA 3W6GA 2VAFA 2OE1A 4BPYA 2VD0A 3C1RA 5G31A 4NMUA 3KH7A 4MDCA 1K0BA 3HZ8A 4K7NA 5CREA 3IPZA 5FT3A 1X5CA 3L4NA 2V41A 5AISA 5IPHA 2YV9A 1GLQA 3TKSA 1K0NA 3GKMA 3N9JA 3WD6A 2YP6A 2X8HA 4OFNA 3RDWA 2DIYA 1HNAA 3ZZXA 1K0MA 4JZQA 4BVYA 1WRYA 2NDOA 4FYCA 2PGTA 3KMOA 4NXIA 5B8BA 5G30A 3HKRA 2A2SA 4WF5A 5ABRA 3L9SA 4XRAA 2N5FA 4MZWA 1ML6A 2B1LA 3QAVA 2LSTA 3EU3A 1EEJA 4L8EA 2CZ3A 3O6TA 1G0TA 4N0ZA 5HQPA 4D73B 2AYTA 1DSBA 4CDOA 2PN8A 3KGKA 3GA4A 5AIXA 1YF0A 2GQMA 3TOUA 3TJBA 5JCWA 1GUHA 3FRCA 3RBTA 4WF4A 3L0HA 2KOKA 3FZ9A 2DBCA 4X0XA 4I5QA 5ELGA 1YZXA 1F9MA 4V2NA 1GNWA 5A4WA 1WP0A 5DCGA 2C0GA 4KCAA 5EVOA 3W8JA 1BG5A 2I4AA 3F63A 3VK9A 3UIWA 1BJXA 5AN1A 4PUAA 2AHEA 19GSA 1PSQA 1E6BA 1FW1A 1V98A 5A4UA 4ZL9A 4BL7A 1MD3A 5E4WA 3M0FA 1U3AA 2CQ9A 3GSTA 2WULA 4TR1A 4XTSA 4EVMA 1GNEA 3NOFA 5GAND 3QOUA 2L6CA 3ZVJD 5H5QA 4TR3A 2I1UA 1J0FA 5ECQB 3WT1A 2TIRA 1B9XC 4AJ8A 2C8UA 1GTAA 3TKPA 4KB3A 5DQSA 3DYRA 1XWAA 5F0GA 3CYNA 4IW9A 2IMFA 2GT5A 3KIJA 5COHA 3APQA 3GMFA 2X64A 10GSA 2NPBA 4EUYA 2H30A 6GSUA 2K6VA 3TJGA 1J9BA 3VLNA 2P31A 3VPTA 2NVLA 5A5KA 1M99A 3SBCA 2IMDA 2ON7A 3Q74A 1E2YA 2AV4A 1NM3A 1ZGNA 1Z7RA 7GSSA 2AB6A 2FWGA 1KEBA 2AJQB 2FY6A 2AAWA 4ULXA 3BCKA 1G7EA 2GS3A 4ZB9A 3F4TA 2CX3A 5EL8A 2EC4A 4N11A 2ZNMA 4WR5A 1RQMA 4ML6A 3QFAC 3QD9A 5DALA 2LQOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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