5J9CA

Crystal structure of peroxiredoxin asp f3 c31s/c61s variant
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
GLKAGDSFPSDVVFSYIPWSEDKGEITASGIPINYNASKEWADKKVILFALPGAFTPVSSARHVPEYIEKLPEIRAKGVDVVAVLAYNDAYVMSAWGKANQVTGDDILFLSDPDARFSKSIGWADEEGRTKRYALVIDHGKITYAALEPAKNHLEFSSAETVLKHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of Peroxiredoxin Asp f3 Provides Mechanistic Insight into Oxidative Stress Resistance and Virulence of Aspergillus fumigatus.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Neosartorya fumigata (strain atcc mya-4609 / af293 / cbs 101355 / fgsc a1100)
molecule keywords peroxiredoxin Asp f3
total genus 48
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5j9cA00
4RQXA 4IS0A 1YKAA 4JBBA 3L78A 4L0WA 1WE0A 3M3MA 6GSTA 4POLA 4N11A 2FLSA 1GTIA 5JWRB 1ZZYA 4JR4A 2HZEA 2HLSA 4TRXA 2X8CA 4TN8A 3KD0A 4EDYA 3HZ4A 1BYEA 1U6TA 1V98A 4K7OA 1V40A 3FZAA 1OAZA 3GTUA 1JZRA 2C0GA 4DVCA 1ZMAA 4KNDA 4G10A 4IGJA 5ECQB 4MJCA 1MTCA 1GSFA 3HXSA 3C7MA 3IBHA 1GSDA 3DRNA 3TKPA 1EWXA 3KMOA 3TOTA 4AF2A 3GSSA 4WETA 3UVTA 2EIQA 5DQYA 5D93A 5B8AA 4DEJA 4AJ6A 3A3TA 2VD0A 4TR1B 5IIZA 3GKXA 1JZDA 1S3AA 5ECSA 1PKZA 3EMPA 4FIWA 2OBIA 2E7PA 1K0CA 3VI5A 4EE0A 5LCZA 2KUCA 3L9UA 2IJYA 3G9BA 4ECJA 5D8IA 4D73B 2VL9A 1O8WA 5JWOB 1R5PA 1K3YA 4WBJA 5IOXA 5CRDA 4MPFA 3RBTA 2ES7A 2AB6A 3TRPA 1N8JA 4F82A 3ZVJA 1TOFA 3LG6A 2BTOT 2EIOA 1U3AA 3GKMA 5AIXA 5IMZA 2GLRA 1J9BA 2L6DA 4PXOA 3H4KA 4KW6A 1FVJA 3GL3A 1ERVA 3D5JA 1A8LA 1JZWA 2FUG2 1T7PB 4ECCA 1UC7A 2F8AA 5G5EA 1SK1A 1HQOA 3LGCA 2NBSA 5ID2B 1TRUA 3C1SA 2WB9A 1V2AA 1F3AA 3IR4A 1O7UA 3LQ7A 2HT9A 1C72A 2X8GA 3DIEA 3FEUA 1VRSD 5CRHA 5G31A 2FD3A 2C0EA 4TR1A 3TB2A 3EWLA 4HJMA 4KDYA 2GSTA 4V2MA 2L6CA 3EMXA 4XS6A 1AC1A 1Q4JA 3ERGA 1QXHA 2DMMA 1K0AA 3DEXA 3SBCA 3ME7A 5FWGA 3UBKA 4D73A 17GSA 1Z3EA 4Z7XA 3H79A 2JACA 4FYUA 1AIUA 4V2NA 4NHZA 4YQVA 1K0DA 1E6BA 3ZREA 2DJ2A 4PNGA 2CVDA 3BBYA 4IP1A 4EKZA 1G0TA 1GWCA 3N5OA 3KJYA 2H72A 1F3BA 2VCXA 1WRYA 2AYTA 1T4YA 3FZ9A 1ZYEA 2YCDA 1GNWA 2CX4A 3HCZA 4BA7A 3H93A 2RUEA 2F3MA 5ID2A 3DKSA 5IMCA 1XWKA 2GZYA 1XFLA 3N9JA 1KBNA 3G7JA 1PGTA 2ZCTA 1M9BA 3IK7A 5G2ZA 4TVEA 4HOJA 1Z6NA 4XCSA 3HJMA 3C73A 5HFGA 2REMA 4MP4A 4K0GA 3FW2A 3C71A 3PH9A 1FVKA 3QAWA 2CV4A 5ECKB 4Q5FA 1OE7A 2LRCA 3E9JB 2V1MA 3CSIA 5G5FA 2OJLA 3IPZA 5IMDA 3QOUA 1ABAA 1BJXA 1G7OA 1GUMA 2LSTA 3C1RA 4TXVA 2DJ1A 3TUEA 3MNGA 2VM2A 3LXTA 3DMLA 1GL8A 3ZLPA 2N5FA 1K0NA 2AUVA 3F8UA 1T8EB 4MJBA 2DJKA 3G7IA 3RDWA 1XWGA 1GUKA 2OA7A 2I1UA 4KUNA 4OCEA 14GSA 3SWLA 4ULXA 3ISOA 4GLTA 4NV5A 2OE3A 2WULA 2WZ9A 1PQNA 4TR4A 1DUGA 4WKWA 3U6VA 2M80A 1IYIA 4LLRA 5JCUA 2FWEA 4GRFA 4NWYA 2NPBA 2K8VA 3QCPA 2O87A 3PR8A 2IMKA 3F4RA 1EP8A 4O7HA 3ZIJA 6GSSA 3HJOA 4BPYA 1F37A 2R4VA 3WT1A 3JCML 3IAM2 4LA1A 2OE0A 2E2MA 3KEBA 3KH9A 5GSSA 2H30A 4K0NA 3TGZA 1ERUA 1OC3A 5CAXA 3ERFA 1USBA 3D22A 4HU9A 3P7XA 2Z9SA 1GSSA 2R2JA 3F6DA 3O3TA 2C8UA 2WS2A 4IW9A 1SJIA 4X0XA 4JR6A 1FAAA 12GSA 1U3IA 1A0RP 2YPMA 3VK9A 3ZRDA 2AV4A 2VIMA 4G2EA 3TRQA 3RHCA 2PVOC 3MDKA 1YF0A 1XPVA 5F06A 1TW9A 3TJGA 4MCUA 1XZOA 4BWSA 1XCCA 4HEA2 1M2BA 5CRWA 2F8FA 4LMVA 4NXIA 2C3QA 3VLNA 3UMAA 2MYGA 2HYXA 2H74A 5IOWA 3HD5A 4JZQA 3H1NA 5D73A 4CHSA 3I69A 2FWHA 2M46A 2C0FA 4KCEA 3EINA 5KN1A 4MF6A 4KDXA 1R26A 1Y6EA 5ECHB 1TK0B 4RUVA 2PMTA 5D96A 3QR6A 5DALB 3ZITA 5B6MA 3ED3A 3UOMA 1DBYA 2H0IA 4N30A 1O8XA 3MWHA 2HI7A 4NMUA 4ML6A 3D6IA 4O92A 1IYHA 4G19A 3AY8A 5HR2A 4WF5A 2RUFA 1WJKA 2VCVA 4GWRA 3KXOA 2A2RA 3KTLA 1THOA 3L9SA 3HJPA 5KN2A 4G9HA 2O89A 4OO4A 4I97A 1OC8A 2RM6A 3HVXA 2JL4A 1EV4A 4EL1A 3WGDA 2CZ3A 2RLIA 2MMZA 1U88A 1GH2A 1MD3A 1ZOFA 1GUHA 1WPIA 1Z5YE 3DYRA 4TOPA 2IMEA 1FW1A 2PBJA 3VPTA 5F05A 4K7NA 1TU8A 2YWOA 5ELGA 1O81A 4NAXA 3GNJA 2KHPA 4GXZA 3CRTA 2H19A 4JU5A 3UBLA 3TDGA 5DALA 2WGRA 1S3DA 3EYTA 4HZ4A 2JZSA 4LL4B 5J9BA 1B9XC 4N10A 1JFUA 3D4TA 2H75A 3J7Yb 4MH2A 2B1KA 2CAIA 4BWQA 1QMVA 4MJEA 2TRXA 2J9HA 2GGTA 2YZUA 2N5BA 4MDCA 1XW5A 3MSZA 2A4VA 4WF4A 2IPAA 3ZYWA 1WIKA 1A23A 5L71A 2RM5A 4DSSB 1FO5A 1WP0A 3HHVA 1GSUA 2HRNA 3RHBA 4PQIA 4AJ8A 2VLVA 3KCMA 1R5AA 2GSSA 4V1Ap 3ZFLA 3CYNA 3IC4A 1G6YA 1EOGA 4HUAA 5IO2A 3QFAC 3FZ5A 4IJ3A 1GP1A 3ZZXA 1ST9A 4HI7A 3FR6A 5LD0A 2H6ZA 1RQMA 4PUFC 2H1AA 1PL1A 4YQMA 2R6KA 2IMFA 1NM3A 2CAQA 3J7Yk 2F9SA 4ISDA 2YNXA 3HA9A 9GSSA 1EOHA 1H4OA 3CBUA 3DXBA 3Q19A 1V58A 5GAPD 4MA9A 2G0FA 4O32A 2PWJA 2HSYA 3I6AA 2KP2A 1GLQA 1M2AA 3IHQA 4F2IA 1X5DA 3NZNA 3TKSC 1TRSA 2VL2C 2XBQA 3VWUA 4DSSA 4IHUA 1UVZA 2H70A 4AJ7A 4GQCA 4YQUA 5J5NA 1I5GA 2H6XA 4MZWA 3WD6A 5HR3A 1T3BA 2RIIA 3V1WA 1AXDA 3DVWA 3GSTA 3D4MA 3QPMA 3QAVA 2YJHA 2YWMA 2H66A 4XRDA 1PRXA 2GZPA 5ECNB 1UA5A 1ZGNA 2J23A 1PN9A 5ECRB 3TOUA 5F0GA 2VM1A 3ZMLA 3LXZA 2V32A 1R7HA 2YN1A 2P0GA 3LYKA 5EL8A 4PQHA 2LNTA 4GQFA 2V6KA 3M9JA 3IXRA 1K3LA 3FHKA 3W6GA 3A2VA 3EVIA 2ON7A 3E0UA 2JZRA 1PX7A 5ECIB 2YZHA 4WXTA 1U87A 4BL7A 1SKWB 3GUSA 3M8NA 10GSA 2BMXA 2L5OA 4HDEA 4TR3A 1OKTA 4JRRA 4KE3A 1B4PA 4Q5QA 5F8BA 5LNKe 4MMMA 4MJAA 3C8EA 4E8EA 5AISA 1B48A 5IPHA 2IMDA 3IDVA 6GSXA 2VOCA 5DDLA 2IWTA 1KNGA 4KSOA 1EV9A 5J41A 1CQGA 2K9FA 5COHA 4OO5A 1TK8B 1MDIA 4EO3A 2LQOA 2B7JA 3QFBC 3DWVA 1NW2A 3P2AA 2FWFA 2VAFA 4J56E 4F9ZA 4I5QA 18GSA 4IQ1A 4F0BA 1K0MA 5IM9A 1SD9A 2JADA 3TRXA 1A2MA 1G6WA 5KN3A 3LJRA 4K8MA 2LNSA 2I9HA 4POKA 3D21A 4NHWA 1ILOA 1TKDB 2C80A 4K6XA 2GTUA 4TKYA 3M0FA 5C00A 1XWAA 1EP7A 4KSMA 4OFMA 4EC0A 2A2SA 2D2ZA 3IV4A 3KM6A 5CO3A 2BJXA 4I6XA 1HYUA 2X8HA 4IBPA 1GSQA 2LKUA 2OACA 2MMOA 3TJKA 3UL3A 3WGXA 3ZFBA 2I4AA 1Z6MA 1S3CA 1TRWA 4MABA 4CDOA 2FCHA 2GQMA 1A0FA 1JZOA 2H1DA 1K0OA 2TRCP 4P3YB 2KP1A 2H6YA 19GSA 5EY6A 1Z7RA 2H1GA 4I8BA 1TU7A 2XPDA 4IP6A 1VF2A 4ZBDA 4H86A 4ZB8A 5FT3A 5HFKA 4MPGA 5DJMA 2PUKC 3GFKA 4TXOB 3LEFA 2K18A 3GH6A 5J9CA 2L4CA 2KOKA 4ID0A 3O6TA 5HFIA 4MF7A 5FHIA 1B8XA 3R2QA 2GSQA 2GSRA 3UIWA 3F3RA 3CMIA 3K8NA 3W8SA 3F6FA 1YQ1A 3P8WA 2MZCA 3KP8A 1SK2A 1EGRA 2P5RA 1HD2A 4XIHA 1X9WB 4KH7A 4RI7A 4X1UA 5CYYA 4EVMA 1XW6A 3TJFA 1PSQA 1XOAA 2FA4A 2JSZA 3Q6OA 3P90A 2VCTA 1UN2A 5CP1A 1T00A 2YV9A 2YV7A 3HKRA 1X0RA 2HFDA 2PN8A 3TKQA 1SJ6A 4ECIA 3GHAA 2GT5A 1OC9B 2O85A 3FR9A 4TW5A 4AGSA 4EXJA 1O85A 3IAS2 1FB0A 4TXOA 2XBIA 1TK5B 2LEGA 3GKKA 2WCIA 5H5SA 3TKSE 2FHEA 4PURA 4LL1B 3F4TA 3VFIA 1W89A 2E2GA 4KB3A 1J08A 5HR1A 1NSWA 1V9WA 2VUPA 3S9FA 2VCZA 1M99A 1QFNA 2VL3A 1XW9A 2JSYA 1SL0B 3WYWA 4I2TA 2FY6A 1BQ7A 4DSRA 4V2LA 2I81A 2PPTA 5D9TA 3MAKA 5C04A 4OCFA 4IELA 4Q5RA 5G1KA 3BJ5A 5INYA 2V6OA 5DCHA 4QL7A 3RPPA 5ABRA 1HNAA 1BEDA 4ZBBA 1XVWA 3HY2A 1VF4A 2L59A 1QK8A 1WWJA 2QSIA 1OC9A 3L4NA 1XOBA 2C3TA 1DE1A 3US3A 2LTKA 4RI6A 4GCIA 4J2FA 4QQ7A 4HJ2A 1XWBA 3VURA 1EEJA 1QUWA 4GTUA 5H5RA 4JE1A 2R37A 4K7IA 4KA0A 4HU7A 4XS4B 2XPEA 3QD9A 2DBCA 4OWYA 3UAPA 3U5RE 5A4UA 3UEMA 2K6VA 5GSTA 2GDRA 5D9VA 2ZUPA 1BX9A 1J0FA 1THXA 2JU5A 4XS1A 4XTSA 4JEDA 5DVBA 5B8BA 5G30A 2LJKA 1V57A 6GSYA 3G7YA 1OYJA 2V41A 5CNWA 3GV1A 2H76A 2LRTA 1X5CA 2C4JA 2X99A 3CTFA 2B3SA 1EGOA 1X5EA 2EC4A 3CSJA 3W8JA 2LJRA 1A24A 7GSSA 5A4VA 3GTUB 1N2AA 2HSHA 2B7KA 3TJBA 3UARA 1DSBA 3VWVA 1Z9HA 1ZL9A 3F63A 1OKDA 2MMAA 2H1BA 1X9MB 1YY7A 5ECLB 1O6JA 3BCIA 2ON5A 3ERWA 1M2DA 4XS4A 3KH7A 4HQZA 2C0DA 1YKCA 1KEBA 3F4SA 1K0BA 4XRAA 2DC5A 2C3NA 1XXUA 2OE1A 3O76A 1XBSA 5IMFA 4IJIA 4MF5A 3ZIVA 1AQVA 2MBSA 1AAZA 4WEYA 2VCQA 5H5QA 3UJ1A 1GRXA 1EZKA 2JZTA 2CQ9A 1RW1A 4ZB6A 3GX0A 3DD3A 2LRNA 3VWWA 1TJDA 1MDKA 2FWGA 1JHBA 2WRTA 1ACVA 5ECPB 1AUCA 3APOA 2L57A 4FYCA 5EPFA 1GTAA 3GKNA 4HZ2A 4NPBA 4IKHA 4F03A 3Q74A 1G7EA 3IE3A 3M1GA 2C1YA 3LSZA 1YDKA 1QQ2A 1R4WA 11GSA 1H75A 2CX3A 4OFNA 5KN0A 4PGTA 1NHYA 4EF0A 1AW9A 3F0IA 4YH2A 5ECMB 5D9WA 1YJ6A 2WDUA 3A2WA 3LFLA 1NHOA 1SD8A 1SENA 6GSUA 3FRCA 4ZBAA 4X43A 1E2YA 1M9AA 4L8EA 4K2DA 13GSA 2QKEA 1TI1A 4DSQA 4EUYA 20GSA 1AQXA 4KGIA 1YEXA 4ZILA 3I9V2 4PNFA 3HDCA 3KTBA 4MK3A 2DIYA 2YWIA 4MZBA 2NVLA 4K1FA 2K8SA 3EE2A 4GSTA 5EVOA 3QAGA 4OD7A 3A2XA 2XC2A 2HZFA 2GQKA 3F3QA 3TJJA 4IVFA 3BCKA 2DSAA 2IFQB 3OR5A 1MDJA 1TTZA 5DAKB 3A5WA 1PA3A 3DGQA 3D0ZA 2DJ0A 2ZNMA 4NV2A 1ZCPA 1SL1B 3CRUA 4K9ZA 1YZXA 22GSA 3GA4A 2KLXA 2N5AA 3NIVA 1GLPA 2IN3A 4ZL9A 5DCGA 1PX6A 2PERA 1F6MC 2FNOA 2WFCA 2DJJA 5ENUA 2IIYA 2LV3A 1URMA 4ILFA 1M7TA 1LJRA 1PKWA 1PD21 3H8QA 3L0HA 2MMNA 1Q98A 2B5YA 3TKRA 6GSVA 4ECBA 2L4QA 3KP9A 2LJAA 2B5XA 2DLXA 2P31A 1KTEA 2AAWA 4CW9A 3GL5A 2IFQA 2VD1A 3Q18A 5J4UA 5HR0A 5CRGA 1ML6A 4HS1A 1HNBA 2GQLA 3FKFA 2CT6A 3FYGA 3ZTLA 5DAKA 6GSWA 3EC3A 4ZXGA 3HVVA 1GSEA 3FY7A 4ZIJA 2GZZA 3IOSA 2OKAA 4L5OA 4KCAA 3GRXA 1VGLA 3GX8A 4IN0A 2MBTA 2M72A 2P5QA 1HNCA 2IL3A 3FR3A 5E59A 1TI3A 5JCGA 2B1LA 2YWNA 2HXKA 1A8YA 3RAZA 1PL2A 2YOIA 2V2GA 4L5LA 2CZ2A 2HRFA 5IMVA 5AGYA 5JWQB 3GURA 5J3RA 2E0QA 3VPQA 5D9XA 3CXGA 2DJ3A 5B7CA 4WBRD 2O7KA 3FK8A 2IMIA 2FA8A 2VLTA 2H8LA 3EURA 3IRAA 2NDOA 4PX1A 4ACSA 1LU4A 2H71A 2GVPA 3QDNA 1B9YC 4RQRA 2QC7A 3F9UA 3CSHA 3E3EA 1MD4A 1XIYA 2YANA 3LWAA 4YAPA 1FHEA 4GSSA 4ML1A 4FYBA 1WOUA 1TXXA 4GSNA 2ALBA 5AIVA 4QL9A 4TR0A 4LMWA 1FB6A 4N0ZA 5JCWA 5KEJA 5B6NA 3GIXA 1W4VA 3HZ8A 1LBKA 8GSSA 3WT2A 4GF0A 1SJZA 3HVSA 2AJQB 3L9VA 4Q5NA 1DE2A 1ZYQB 5IQYA 2VLUA 2TIRA 3FZ4A 4MZCA 5DJLA 2PGTA 2GS3A 5CREA 2H0HA 3GMFA 1GTBA 3RPNA 3TCOA 3CTGA 1F2EA 5AN1A 1Z7PA 1M0UA 1GSYA 2EIRA 3KMNA 2LQQA 4MH3A 1X9SB 2OBKA 3WGEA 3HYPA 1XWCA 16GSA 4J57E 3KZQA 2CA8A 2WJUA 1T4ZA 4WR5A 1VF3A 2PU9C 1TDIA 4F0CA 3VWXA 2G2QA 3ZVJD 1I9DA 2QGVA 1SKSB 3EU3A 3PGTA 4OFTA 2H0GA 1YF1A 3QMXA 3NOFA 4KX4A 2F51A 4FH8A 1JLVA 1AQWA 4BVXA 1ERWA 5GAND 5IO0A 4PUAA 1FG4A 2VO4A 4POMA 2R3XA 5A5KA 1OVNA 3UVHA 1ERTA 1F9MA 1GTUA 1SKRB 3IK9A 4V1Ag 5GZZB 1T1VA 2LS5A 2VCWA 1BAYA 4KDUA 1JLWA 5DBQA 4ZL7A 1SL2B 2PVQA 2AHEA 4KAEA 1K3OA 3PINA 2GT6A 2XHFA 1SYRA 3APSA 3I43A 3M9KA 4O5RA 4BVYA 4HQSA 1YEPA 2DIZA 3LORA 5ECOB 4I2UA 5IPGA 1SYXA 5E4WA 2OADA 2HNLA 5F07A 5HQPA 3EU4A 5G1LA 3VI7A 5IMAA 5A4WA 1WMJA 2H73A 3APQA 2B6MA 4E8HA 2I3YA 1SU9A 3KIJA 4N0VA 4PQ1A 2NTOA 2CVKA 3GYKA 1A2LA 2L5LA 5ELAA 1OE8A 3BOAA 2HZEB 3IA1A 4WR4A 3BD2A 4IQAA 5DQSA 3ME8A 1TP9A 2X64A 4YAVA 3GH9A 4FO5A 1RK4A 1O73A 3ZL5A 4POBA 2YJ7A 2R5GA 1QGVA 4ZB9A 4XHMA 3KGKA 1XVQA 2HE3A 4MLYA 3TKSA 1VF1A 2VL2A 1MEKA 4ZL8A 1A2JA 4L0UA 1PMTA 2CVBA 1BG5A 1FOVA 2FGXA 2O8VB 4EDZA 2DMLA 1Y25A 2B5EA 3DVXA 1B4QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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