5J9CA

Crystal structure of peroxiredoxin asp f3 c31s/c61s variant
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
GLKAGDSFPSDVVFSYIPWSEDKGEITASGIPINYNASKEWADKKVILFALPGAFTPVSSARHVPEYIEKLPEIRAKGVDVVAVLAYNDAYVMSAWGKANQVTGDDILFLSDPDARFSKSIGWADEEGRTKRYALVIDHGKITYAALEPAKNHLEFSSAETVLKHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords peroxiredoxin Asp f3
publication title The Crystal Structure of Peroxiredoxin Asp f3 Provides Mechanistic Insight into Oxidative Stress Resistance and Virulence of Aspergillus fumigatus.
pubmed doi rcsb
source organism Neosartorya fumigata (strain atcc mya-4609 / af293 / cbs 101355 / fgsc a1100)
total genus 48
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5j9cA00
4ZILA 3G7JA 2OA7A 3O3TA 4I8BA 3KP8A 5IM9A 1YKCA 2BJXA 4RQXA 5IOXA 1FO5A 2VL3A 4HOJA 5D9TA 4EVMA 5DQYA 3KM6A 4K7OA 1BAYA 4PNFA 2CV4A 1M2BA 4EF0A 4KCAA 4LLRA 3IK9A 1UN2A 2VM2A 4DSRA 4IS0A 4HU7A 1O85A 5J9CA 3EU4A 4EXJA 2GQMA 3C1SA 4IN0A 5J3RA 3ZTLA 1MTCA 2XHFA 3R2QA 1M2AA 1NW2A 5IMAA 5ABRA 4N30A 4PUFC 4D73A 4ZL8A 3PH9A 3ZZXA 4WF4A 1DBYA 4XS4A 3GKXA 8GSSA 1B4QA 2ALBA 2ON5A 3ERFA 2GT6A 1MD4A 2GSQA 6GSUA 1G7EA 4BWSA 1XCCA 4FYBA 1A0RP 4OCEA 4BWQA 5G30A 1XWBA 4LA1A 2V6OA 4XS6A 3GKKA 3BOAA 3EC3A 2YPMA 1GTIA 2L4QA 1B8XA 3CYNA 2CVDA 2DJJA 3CSIA 5B6MA 1MDIA 1EOGA 10GSA 5F8BA 3VK9A 3GSTA 4WXTA 5AISA 2H72A 5C04A 5L71A 4L8EA 3S9FA 3DMLA 3CXGA 3I9V2 3DVXA 1S3CA 5F07A 4HU9A 4ZL9A 2B1LA 3HVSA 2H73A 2YN1A 4L5OA 4IP1A 2HFDA 5G1KA 1O6JA 4XIHA 1ERTA 4OD7A 4K6XA 3A3TA 3HZ4A 5KEJA 3CSJA 1GSFA 4OWYA 2H01A 1HQOA 3TJBA 1SL0B 1EGOA 2LKUA 3VLNA 2IMDA 1MEKA 2EIQA 3C71A 4PGTA 3QR6A 2DIZA 4KX4A 4IJIA 5GAND 5E4WA 1FB6A 4TR3A 2A4VA 3RPNA 2GT5A 3KH9A 2JL4A 3W6GA 4ZBAA 2P5RA 1V58A 1B9XC 3TOUA 4JRRA 4FYUA 3EU3A 1Z7RA 1H75A 1OC9A 2YWIA 4HQSA 4GWRA 4OFNA 3WGXA 5IO2A 2AAWA 2XPDA 2V32A 2N5AA 1WP0A 4V2MA 3UBLA 2G0FA 2DSAA 1JZDA 1ON4A 4TN8A 5JWQB 4F03A 3US3A 3MDKA 4AJ6A 1OVNA 3BBYA 4TXVA 3TKQA 3DEXA 1CQGA 1TW9A 4OMVA 2MBSA 1BJXA 1FHEA 2LJKA 1H4OA 2GQKA 2GS3A 4OCFA 4RUVA 1TRVA 1XWCA 9GSSA 2HZEB 2V1MA 1PRXA 3HJPA 2L6CA 4OFTA 2LNSA 3LYKA 1K0MA 1WWJA 1R7HA 1PSQA 3HZ8A 4V2LA 1EP8A 3CRUA 4Q5NA 3F3RA 4K9ZA 1IYIA 3CTGA 4PQ1A 1FAAA 11GSA 1SD8A 4V2NA 4IELA 1ZL9A 2GTUA 2FLSA 4HQZA 5ELGA 3IDVA 2Z9SA 3HA9A 5B6NA 3FZ9A 2WFCA 2HRNA 1XWKA 1A0FA 2C4JA 4ZBBA 2IJYA 2J23A 2P5QA 2DMLA 2F3MA 4EL1A 3APSA 4FO5A 2F51A 4PURA 1SYXA 3TJJA 1TU8A 1PL1A 2GZZA 2R37A 4EDZA 1GH2A 2YZUA 5JWRB 4ECJA 5G31A 1GSYA 5DAKA 2FWFA 2GSSA 3QMXA 5F06A 4WBRD 2K6VA 4OFMA 1J0FA 3JCML 3KMOA 4BPYA 3SBCA 2YWMA 2MYGA 4OO5A 3LFLA 1WOUA 1XW6A 3BD2A 2CVBA 2C8UA 1X9MB 4ZL7A 19GSA 2K8SA 1X5EA 3PR8A 2E7PA 4MZWA 2VM1A 2X64A 3UL3A 2LQQA 4DSSA 2HNLA 2H1DA 3TRXA 1GULA 4ZB6A 1PN9A 3ZVJA 4ISDA 3HY2A 6GSWA 5H5QA 3H93A 4ZXGA 4IQ1A 1FW1A 3FR9A 2H19A 4NHWA 3C1RA 3DGQA 14GSA 4JR6A 1TI3A 2RM5A 4TR1A 3M3MA 1M2DA 3L0HA 1GNEA 5ECIB 2YNXA 1S3AA 3E3EA 3H8QA 1EEMA 4KSOA 4NWYA 2C0EA 2C1YA 3GMFA 1XVWA 5J4UA 1O73A 1V40A 1QXHA 3GTUB 4KAEA 5KN3A 3MWHA 4G9HA 5CO3A 1SKWB 4J2FA 3F9UA 1X5DA 2DC5A 5CRWA 4GSTA 3QD9A 2K18A 2C3QA 3VWWA 4DVCA 2CAIA 2P31A 2IFQB 2PGTA 3DXBA 3L9SA 12GSA 1U3AA 3DYRA 4MF7A 2IN3A 3EINA 3GHAA 2PWJA 1TRWA 2MMOA 3GURA 1VF4A 4NXIA 7GSSA 3ZIJA 2AUVA 5D73A 4JEDA 4YQVA 1R4WA 1XW5A 2GLRA 2YJ7A 2GSTA 2LRCA 5HFGA 3P2AA 2MMNA 2WDUA 1GLQA 3WT1A 1KNGA 2C0DA 4GSNA 2IL3A 5DVBA 2E2MA 3F3QA 5ECOB 5D96A 3HJMA 3L9VA 3PGTA 4EE0A 2XBQA 2M72A 3MAKA 1K0CA 2MMZA 3TKSE 2X99A 3WT2A 3IOSA 5E59A 2ES7A 2O7KA 3EMPA 2B6MA 2F9SA 2EIRA 4O92A 4POMA 2H1BA 4X0XA 1Z5YE 3HD5A 2QKEA 5GAPD 2NTOA 1G0TA 5ECNB 1TU7A 1ZYQB 2A2RA 1JLVA 1ZGNA 2EC4A 4MJBA 1QUWA 3VFIA 3ME8A 1N8JA 1U6TA 1AQXA 4RQRA 1JZOA 3IHQA 4J57E 3TJFA 5B8AA 3FHKA 1SJZA 4F9ZA 3LYPA 2BTOT 4EO3A 1OC8A 4YQMA 5ID2A 4MJAA 2K8VA 3M1GA 4XS1A 2DBCA 2YCDA 5A4VA 3HVVA 2DMMA 4ECIA 1B4PA 5A4WA 2B1KA 3GX8A 2H6ZA 3LQ7A 4K7NA 1GTBA 3ISOA 1R5PA 2H75A 4Z7XA 4IVFA 4ZBDA 2KLXA 2L57A 6GSVA 1XPVA 2LQOA 1EWXA 5ECMB 4K2DA 2YOIA 5IO0A 5DALB 3WD6A 4NMUA 5G1LA 4LMVA 5DCGA 1J08A 3ZYWA 4DSQA 1GTAA 1GSDA 3WGEA 3KP9A 1T00A 1PKWA 3F4RA 2HE3A 3HJOA 3LORA 3ED3A 1SYRA 4AJ7A 2VL2C 2FD3A 2KP2A 1GTUA 1ZMAA 1M7TA 2LRTA 4K7IA 4ML1A 2R5GA 4I97A 2H1AA 3J7Yk 5CRGA 4KA0A 4IW9A 1E6BA 2FNOA 4YQUA 2IMIA 3FZAA 1X9SB 3EWLA 1PA3A 3FYGA 2LEGA 1UVZA 1GSUA 2OJLA 4TR4A 3KTLA 5EY6A 2FWHA 4G2EA 5DJLA 3EURA 1T3BA 3F0IA 4GSSA 1XIYA 5CP1A 2R2JA 1EV9A 2JZRA 1T7PB 1ERUA 4MF6A 2O89A 3IR4A 4KCEA 5LCZA 2H66A 17GSA 3ZFLA 2L4CA 1XXUA 4XHMA 4MZBA 5A5KA 1A24A 3QAWA 1YZXA 4L0WA 2DJ3A 2H71A 2YWOA 1WJKA 1HD2A 2GSRA 3GKNA 1Q98A 4GLTA 1O7UA 4HZ2A 5JCGA 5AGYA 3J7Yb 3ZMKA 1FOVA 4AGSA 1YEXA 1NHOA 4LL1B 3PINA 4KE3A 1A23A 3L9UA 1SJIA 1JZWA 1ABAA 3IV4A 2YANA 2E2GA 3GFKA 3L78A 3ZRDA 4OO4A 4TXOA 4AJ8A 3TCOA 4IHUA 4GQCA 3KH7A 3QAGA 3F4TA 2VCWA 4CW9A 3KZQA 2AB6A 3H4KA 3HCZA 5HFKA 4PX1A 2JADA 3UEMA 5FT3A 4I2UA 2GZPA 3D22A 2REMA 3ZFBA 4KGIA 1W89A 4I5QA 2JZTA 3CRTA 1WIKA 5IMDA 4CDOA 4MCUA 3GH9A 2OKAA 3EMXA 5HR1A 3UOMA 1PKZA 2VO4A 4GRFA 2ON7A 4FYCA 1GUHA 4MH2A 3IAM2 2VCXA 3TB2A 3I6AA 4PQHA 2TRXA 5JWOB 1M9BA 4WF5A 1YEPA 2OE0A 3ZLPA 2L59A 2PMTA 2R4VA 4KH7A 2H0IA 3L4NA 3TGZA 4D73B 3A2VA 2LNTA 3GL3A 3VI5A 1PMTA 2HZFA 1YKAA 4GCIA 3ZMLA 2WB9A 4L0UA 4G19A 1BQ7A 2X8HA 4HEA2 3IE3A 2NBSA 3Q6OA 2PVOC 16GSA 1YQ1A 3RPPA 3Q74A 1JFUA 2R3XA 5IMCA 6GSYA 1ILOA 1TJDA 2B7JA 2L6DA 2CX3A 1ZZYA 1XOBA 2PU9C 3TRQA 2JZSA 1IYHA 1OYJA 2V6KA 1RW1A 1SKSB 1ZCPA 5JCWA 4HDEA 4O5RA 4CHSA 2VCVA 4ID0A 3P90A 4TRXA 1MDKA 2H0HA 3CBUA 2KP1A 4MABA 3ME7A 2F8AA 1THXA 3Q18A 5ECHB 3IBHA 1ZOFA 1Z9HA 1OE8A 4Q5FA 4QL7A 3UARA 1NHYA 2VLUA 3RBTA 1TK8B 2NVLA 1OKDA 1TKDB 2JSZA 5FWGA 1VF1A 2H30A 3QPMA 5HR0A 1U88A 1N2AA 2E0QA 5IMVA 2FUG2 2L5OA 2JSYA 1V57A 1ZYEA 1ERVA 3N9JA 4KNDA 1GP1A 4GTUA 1TDIA 1QGVA 2TRCP 4IJ3A 1W4VA 2HYXA 4K0NA 4K1FA 3D21A 3ERGA 4ZB8A 1U3IA 2QSIA 3VPQA 1YY7A 1ML6A 2H6XA 1SK1A 4POLA 3RAZA 1SL1B 2CQ9A 2IWTA 5HR3A 1AQWA 2JU5A 2CX4A 3UAPA 1GUKA 4NV2A 2GZYA 3F4SA 2I9HA 2KHPA 5IPGA 3W8SA 4N0VA 4LL4B 4JBBA 3GL5A 2AYTA 2O87A 3TKPA 5J5NA 1GSSA 2B5XA 2OADA 2HT9A 1R26A 5IQYA 2H8LA 3LG6A 2WJUA 3CMIA 2H76A 4LMWA 2V2GA 4MPGA 4MDCA 4POKA 1MD3A 4DEJA 3TJGA 4MZCA 3RHCA 1I9DA 4AF2A 5HQPA 3ZIVA 4N0ZA 1URMA 1XVQA 5ECKB 1TK0B 3NOFA 5D93A 4F0CA 1SU9A 2DIYA 2VL2A 2P0GA 1K0OA 1A8LA 2CAQA 1O8XA 4E8EA 1VF2A 3QOUA 2I4AA 5ELAA 5DQSA 3GYKA 2I1UA 4I2TA 5KN2A 1A2MA 3ERWA 1Q4JA 1BYEA 4KDUA 3LJRA 1QFNA 3QCPA 1WE0A 2DJ2A 3FY7A 3HKRA 3I69A 3RDWA 4V1Ag 4XCSA 3FEUA 5D9XA 4MF5A 3H79A 5CRDA 1T4YA 1V98A 4E8HA 1HNCA 2NDOA 1YJ6A 1XWAA 4WR4A 3SWLA 4PNGA 2PUKC 2B7KA 4NHZA 1F6MC 4EC0A 4XRAA 1YF0A 4P3YB 1ST9A 2VAFA 2D2ZA 5INYA 4Q5QA 5ECLB 5KN0A 1AUCA 5HFIA 3WYWA 1X5CA 3RHBA 3ZVJD 3BCIA 3IPZA 2BMXA 1AXDA 3GUSA 1M9AA 2F8FA 2LRNA 1SK0A 2KUCA 6GSSA 1J9BA 4BA7A 2AHEA 2VCZA 2HXKA 4TKYA 3BCKA 2H0GA 5F0GA 1LJRA 1OE7A 3GV1A 3E9JB 2HRFA 3EE2A 5FHIA 5IPHA 2KOKA 2HI7A 2OE1A 2GGTA 1SL2B 3G7YA 4KSMA 2HLSA 3P7XA 1SD9A 3VURA 3KEBA 3APQA 4K0GA 4JE1A 4FH8A 1KTEA 4PXOA 1T1VA 1AIUA 3OR5A 3LXTA 5IIZA 1GLPA 4JU5A 5J9BA 3U6VA 2DLXA 4F2IA 3O76A 1O81A 4WETA 1JZRA 3K8NA 5DAKB 4F0BA 4KDXA 1DE2A 3TJKA 3D0ZA 5D9WA 3IRAA 1OAZA 1X0RA 2PPTA 3HYPA 5ECQB 3TKSC 1GWCA 2XPEA 2RM6A 3F6DA 2B5EA 2MBTA 4RI6A 4N11A 4ML6A 2QGVA 1OC3A 3UVTA 1G7OA 3M0FA 4O32A 1FB0A 1EGRA 4MP4A 3FW2A 3AY8A 4DSSB 2TIRA 4IBPA 5CNWA 1GSQA 3HDCA 3LWAA 2YJHA 1SENA 3KIJA 3QAVA 3VWXA 5G5EA 6GSXA 1F3AA 1DUGA 2DJ1A 2OACA 4I6XA 2WCIA 3F63A 4KW6A 4WEYA 2WGRA 2O8VB 2IMFA 2HZEA 2IMKA 4TR1B 2C3NA 1GSEA 1XW9A 2EIOA 4PQIA 2OBIA 2B3SA 1UC7A 2FCHA 5IOWA 2AV4A 1V9WA 2R6KA 3DD3A 1JHBA 5EVOA 1EP7A 1A8YA 1XWGA 4ACSA 2H1GA 2YZHA 4Q5RA 5D8IA 2VCQA 3GA4A 3QFBC 3HHVA 2ZNMA 4WR5A 3GN3A 6GSTA 3FKFA 3KTBA 4FIWA 2H6YA 5ECSA 1EV4A 1AC1A 2VLTA 2IMEA 2VD0A 4XRDA 5ENUA 1RK4A 4JZQA 2LUSA 4IGJA 1KBNA 1NM3A 4XTSA 5GSTA 3KMNA 1TXXA 2RUEA 2OBKA 4O7HA 2VOCA 2X8CA 1E2YA 3EVIA 3GIXA 1B48A 2YWNA 4ECBA 2VLVA 3G7IA 1BG5A 2LJRA 1FG4A 4NV5A 1TP9A 3DWVA 3VWVA 1S3DA 2XBIA 4KB3A 2NPBA 1T4ZA 1K3YA 3V1WA 1PL2A 3TDGA 1WPIA 3M8NA 5LNKe 5GZZB 3TRPA 3LSZA 2B5YA 1SJ6A 2M46A 3ZREA 1PD21 4L5LA 1M99A 4NPBA 3EYTA 4TOPA 4ILFA 3A2XA 2VUPA 2C0GA 4YAPA 4H86A 4V1Ap 1LBKA 3M9KA 1VGLA 4X1UA 2GDRA 5DJMA 1HNBA 3MSZA 5H5SA 2YV9A 5EL8A 3M9JA 2FWGA 2IIYA 2H70A 3HVXA 2WS2A 1SKRB 5H5RA 4MH3A 4QL9A 1AAZA 2AJQB 1QK8A 1FVJA 1XBSA 2IPAA 4HJ2A 3CSHA 2XC2A 1NSWA 5ID2B 3KCMA 1FVKA 4TW5A 4YAVA 3QDNA 2FA8A 1GUMA 1TOFA 5D9VA 1TRUA 3GKMA 4RI7A 4ULXA 3LEFA 1LU4A 4EKZA 1R5AA 2LSTA 1K0BA 2JACA 4X43A 3N5OA 1WRYA 3GTUA 1MDJA 3GH6A 2YP6A 4XS4B 4HI7A 2FA4A 2M80A 1X9WB 2C0FA 2CZ3A 1O8WA 2I81A 2C3TA 3FZ4A 4MMMA 2IFQA 2PBJA 2MMAA 3I43A 2LJAA 3QFAC 2VL9A 4IP6A 5JCUA 5G5FA 4K8MA 3G9BA 3TKRA 1G6WA 3FR3A 2GQLA 5AIXA 4GXZA 5CRHA 5DDLA 2DJ0A 2FWEA 5EPFA 22GSA 3NIVA 5B7CA 5IMFA 5CYYA 1Z3EA 3IA1A 5AIVA 2VCTA 1UA5A 3VPTA 3TOTA 1VF3A 5DBQA 2FHEA 2L5LA 1YF1A 4HS1A 1WMJA 4KDYA 3U5RE 3MNGA 5CAXA 2ZUPA 2O85A 4F82A 2LV3A 3FRCA 2FY6A 1Y25A 3Q19A 1Z6MA 1GRXA 4HUAA 3D6IA 1A2LA 1HYUA 3P8WA 1I5GA 3E0UA 3DKSA 4MA9A 4QQ7A 3TKSA 3C73A 5G2ZA 5COHA 4GF0A 3UIWA 4IKHA 2RLIA 1AW9A 3IK7A 3KJYA 4KUNA 1BX9A 1PX7A 5GSSA 3FR6A 3GX0A 1C72A 5HR2A 4PUAA 3GSSA 2QC7A 3HXSA 3UMAA 3VI7A 1DE1A 3GNJA 1QQ2A 3VWUA 1K0NA 2VIMA 4POBA 1XFLA 2OE3A 1F2EA 4G10A 1F37A 1KEBA 3TUEA 3FK8A 4TR0A 1B9YC 5J41A 2PVQA 2K9FA 3A5WA 4EUYA 4HJMA 1DSBA 4N10A 2HSYA 1EOHA 4TXOB 4TVEA 2N5FA 1K3LA 1GL8A 2LS5A 1F9MA 1OKTA 4BVYA 4ECCA 1Y6EA 1QMVA 1M0UA 1HNAA 1OC9B 1TRSA 3C7MA 3GRXA 3NZNA 5DCHA 3D4MA 1YDKA 1T8EB 3FZ5A 4MJEA 2WULA 4GQFA 1A2JA 4WBJA 1TI1A 4ZB9A 1GNWA 2V41A 3KXOA 5DALA 2N5BA 1PX6A 2RUFA 1TTZA 2I3YA 4J56E 3IAS2 2FGXA 5ECPB 18GSA 1ACVA 3F8UA 3ZL5A 5B8BA 3KD0A 1TK5B 1XZOA 5F05A 1EEJA 4HZ4A 4ZIJA 3APOA 1VRSD 1G6YA 4WKWA 4MJCA 3DVWA 3IC4A 1PQNA 1F3BA 2RIIA 1BEDA 5KN1A 2DJKA 1V2AA 2WRTA 2G2QA 20GSA 3KGKA 1CQHA 4MK3A 1RQMA 4NAXA 2C80A 3W8JA 3DRNA 3BJ5A 3LGCA 3CTFA 1PGTA 2GVPA 2YV7A 3F6FA 4BVXA 2PERA 1ERWA 3O6TA 2CZ2A 2HSHA 3A2WA 3UBKA 2CVKA 5C00A 1Z7PA 3IXRA 13GSA 2ZCTA 2X8GA 2CT6A 1K3OA 4YH2A 5CREA 5AN1A 2A2SA 5IMZA 3ZITA 4EDYA 3D4TA 3LXZA 1U87A 1THOA 3UVHA 1Z6NA 2MZCA 5LD0A 1USBA 1SK2A 2WZ9A 2LTKA 1AQVA 3WGDA 3H1NA 3C8EA 4MPFA 4BL7A 3UJ1A 2PN8A 4JR4A 2J9HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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