5JCGA

Structure of human peroxiredoxin 3 as three stacked rings
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
TAPAVTQHAPYFKGTAVVNGEFKDLSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGSGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQYVETHGEVCPANWTPDSPTIKPSPAASKEYFQKVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial
publication title Structures of Human Peroxiredoxin 3 Suggest Self-Chaperoning Assembly that Maintains Catalytic State.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 59
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jcgA00
3RBTA 3J7Yk 2O85A 5E4WA 3D5JA 5D93A 3RDWA 2CT6A 1GSQA 3EMPA 4QL7A 1GP1A 4GSSA 4TW5A 4MF7A 4I5QA 4MDCA 3GTUB 2F9SA 2M80A 14GSA 1E6BA 1O85A 5DAKB 1X0RA 2JSZA 5H5RA 3VLNA 3KM6A 2LQQA 2KP1A 1XWKA 5EVOA 5G1LA 2AUVA 3L4NA 2GSSA 3UVTA 4IJ3A 5HR0A 1O7UA 5DALA 1Z7RA 4QQ7A 3CTGA 3VI5A 1Z6NA 3FZ9A 1GSEA 4WR5A 1X5DA 4I6XA 4OD7A 4HEA2 3MDKA 4OFNA 4ID0A 6GSSA 1ERVA 2VO4A 1GLPA 1TI1A 2R5GA 1RQMA 1YDKA 1HYUA 4FYCA 1TU7A 2TIRA 3CSJA 1XOBA 5HFIA 2NPBA 4POLA 1J0FA 4ILFA 5C04A 3LGCA 2BMXA 1F3AA 1VF1A 1TU8A 4NHZA 4WF5A 5A4UA 2MZCA 3TKPA 4PX1A 1XW6A 5B6MA 4K8MA 2C3QA 2GTUA 5F0GA 2WULA 1V9WA 4ZL7A 2DSAA 3WGEA 1XVQA 2K18A 2HLSA 4O92A 2HSYA 17GSA 3GHAA 2CVKA 1ZOFA 3F63A 3SWLA 4OFMA 4L5OA 4FH8A 3UJ1A 4MA9A 1PKZA 3F4RA 1ML6A 2OBKA 3H8QA 2MMNA 1GNWA 4HJMA 2B5YA 2F51A 4G2EA 2YWOA 4TXOB 4GF0A 1RW1A 1NHOA 3IAM2 4O7HA 1OC3A 1T7PB 2D2ZA 3H79A 1ILOA 4YQVA 1JZWA 1LBKA 1O73A 5AIXA 2ZNMA 3D22A 4J2FA 1MD3A 4HOJA 3IPZA 5ECSA 2VUPA 2L57A 2R6KA 4EXJA 4HZ4A 2L5OA 3P7XA 2LJAA 3KP9A 1WE0A 1QQ2A 2LJKA 3GYKA 1XWGA 4EE0A 2VCZA 2I4AA 3GFKA 4YH2A 1HNBA 1Q98A 1XVWA 2PWJA 4ZILA 3BOAA 4OFTA 4MH2A 2AB6A 2PN8A 5DDLA 2GSQA 1GTAA 3HJMA 1F3BA 3TKRA 3DMLA 5CAXA 2B5EA 5J9CA 1JLWA 1S3DA 3FR6A 2G2QA 5CNWA 3U5RE 4N30A 5GSSA 1GRXA 4IQ1A 2X64A 4WETA 5J3RA 1PSQA 5HQPA 4PURA 5DAKA 1X5CA 4NV2A 5B6NA 4ECCA 3LFLA 2IMDA 3HVSA 2BJXA 1ERWA 3SBCA 5CRHA 1SK0A 2OKAA 2CX4A 1ON4A 1A0RP 1XIYA 2MYGA 4QL9A 1TDIA 2DC5A 3KGKA 3QR6A 4DSQA 2RUEA 1TK0B 4WF4A 2LS5A 2GQKA 1WPIA 5LD0A 1GTUA 4MABA 2GT5A 3ZYWA 2LTKA 2CVBA 2LEGA 1BG5A 3VURA 3FR3A 3HVVA 1SYRA 2AHEA 3G7IA 4ECIA 4X0XA 1K0DA 3A2WA 2YP6A 3D0ZA 3V1WA 3IXRA 2FGXA 3WGXA 1TRVA 1WP0A 1A8YA 3GURA 4JBBA 4V2NA 4BVXA 4K6XA 4BVYA 3O6TA 2YWNA 1ZYQB 2DJ3A 1QXHA 2Z9SA 4KW6A 2IJYA 1TP9A 4ZBAA 4ZB8A 1J08A 3UOMA 2TRXA 1DBYA 1TI3A 1FVJA 1NHYA 2H19A 2LJRA 2MBSA 5B8AA 3WYWA 3WT2A 2LRNA 1X9SB 1J9BA 1OE7A 2CVDA 1F9MA 1R7HA 4HI7A 1THOA 3C8EA 4NHWA 1OC8A 2CZ3A 2JU5A 3E9JB 3LORA 3N9JA 2PVOC 1YF0A 2A2RA 3CBUA 3H4KA 2VD0A 2C3NA 2HZFA 4MF5A 1M2AA 1W4VA 2R2JA 2V6KA 3IV4A 4E8EA 4N11A 1H4OA 4TXOA 1BQ7A 4MP4A 3GKNA 5CO3A 3ERFA 5GAPD 2GT6A 5HR2A 2O7KA 4H86A 2EC4A 2RUFA 5KN2A 3W8JA 1ZMAA 3FZ4A 3KMNA 4ML6A 3WT1A 3Q19A 2N5FA 3PR8A 4ZBDA 3Q74A 2HZEA 2H0GA 3QMXA 3HXSA 4PQHA 1FB6A 3KD0A 1WIKA 3Q6OA 1EV9A 2OA7A 3CMIA 1Y25A 1EP7A 2ZUPA 5G5EA 1T4YA 2VCQA 1EP8A 1AQXA 2P31A 5FHIA 4AJ6A 4K7NA 3W8SA 1ZCPA 1SJIA 2LUSA 1TRUA 2VLTA 5G1KA 2MMZA 1XZOA 2OE3A 3D6IA 3F3RA 4ECBA 1V58A 5B8BA 1PX7A 4FIWA 2PBJA 3TUEA 3Q18A 1GLQA 3KTBA 4PNGA 5IOXA 20GSA 4TKYA 3IBHA 3LSZA 4BPYA 4LA1A 3L9SA 1VF3A 1CQHA 3DD3A 1G0TA 1ZZYA 2WJUA 4G19A 2QC7A 1LJRA 2JZRA 3TKSA 2WGRA 1VF4A 3IC4A 1PL1A 1T1VA 3BBYA 4NXIA 5AN1A 4ZBBA 3RPNA 3APOA 1B48A 3GRXA 1TJDA 4MF6A 2BTOT 3C71A 2C0GA 2VD1A 4KX4A 1XWAA 4F03A 1F37A 5ECLB 3TJKA 1S3AA 1M9AA 1O8WA 2OJLA 2YWMA 4N10A 3HY2A 4KAEA 2TRCP 3KH9A 1A24A 1T3BA 4IP6A 4OO4A 3ZLPA 4I2UA 1BAYA 5IIZA 3TJBA 4D73A 2A2SA 1XW9A 4POKA 3S9FA 3DVXA 5A4WA 3EU3A 4IS0A 3EE2A 3LXZA 2P5RA 4TR1B 4IKHA 1BJXA 1NM3A 1C72A 4DEJA 4OCFA 1OC9B 3I6AA 5ECNB 4PXOA 1V40A 3F4SA 4AF2A 5B7CA 5A4VA 1YZXA 3FR9A 5D9XA 3QFAC 1DE1A 4EO3A 2HXKA 2GQMA 1U87A 5ECQB 3DKSA 3FYGA 2C80A 2VCWA 2H75A 1EEJA 1ZL9A 4EL1A 3HZ4A 3ME8A 1G6YA 4MK3A 2VCTA 5CP1A 4BA7A 3GSTA 3W6GA 1SU9A 3HYPA 3C7MA 5GSTA 3VWXA 1EOHA 2OACA 2NDOA 2QSIA 3TDGA 1S3CA 1M2DA 4ULXA 2FCHA 4DSSB 1JZRA 5ID2B 4PQ1A 4AJ8A 2NVLA 4K7OA 1UVZA 4XS4B 3UMAA 5JWRB 2B3SA 5IPGA 3G7YA 1GH2A 4F82A 2LNTA 2VL3A 2N5AA 5ENUA 3FY7A 2RM6A 1MTCA 5FT3A 2H01A 2YZHA 1R5PA 4TN8A 5GZZB 2K9FA 3BD2A 5AGYA 2B1LA 4XRAA 2YJHA 3M9JA 4N0VA 2H74A 5KN1A 1RK4A 1M0UA 2H72A 2IMIA 3BCKA 5IMFA 1V57A 3G9BA 1AQVA 4KCEA 2VL9A 2XC2A 3ED3A 2I9HA 4KDXA 2VCXA 1UN2A 3K8NA 2YJ7A 1MEKA 2B5XA 2PPTA 2F8AA 4CHSA 1A0FA 3CRUA 1SENA 2L6DA 3U6VA 2I3YA 2C3TA 3F9UA 1JZOA 3HHVA 3KZQA 5EPFA 1JZDA 22GSA 2HRNA 2V6OA 1OVNA 3HDCA 4Q5FA 3TOTA 2O87A 1XCCA 4YQUA 2OADA 3LJRA 2B6MA 2AYTA 2I81A 2VOCA 3HZ8A 3QD9A 2MBTA 3OR5A 5HR1A 1TXXA 1A2LA 1K0OA 4F9ZA 3ZRDA 2PVQA 4XS6A 3KXOA 5J4UA 3DRNA 1SJ6A 3ZMLA 3VPQA 5GAND 2VL2C 2YPMA 2YV9A 3I69A 3VI7A 5G30A 2AAWA 3CYNA 4OO5A 2E2GA 4YAPA 1OAZA 3L9UA 4FYUA 1GSSA 3M9KA 2HE3A 3GX8A 3US3A 2A4VA 4WEYA 4HS1A 2IFQB 1GTBA 3LWAA 3NIVA 4MH3A 4TR1A 1PGTA 1DUGA 4MJEA 2O89A 3GIXA 4OMVA 5D96A 1MDIA 1OC9A 4NV5A 1SKSB 2CA8A 2L5LA 1XWBA 1TRSA 4GQFA 3UL3A 1TK5B 1YKAA 3LXTA 1PX6A 4EC0A 2IWTA 5C00A 4KCAA 2DJ0A 2H76A 2H6XA 2MMAA 5ABRA 5CRDA 3TJFA 6GSTA 1SK2A 4GRFA 2GLRA 3TCOA 2B1KA 4ACSA 4BWSA 4WBRD 4KSOA 3F0IA 3GH6A 3GTUA 2GDRA 3IA1A 2QKEA 5IM9A 5D9VA 1UA5A 3F6FA 2H30A 3EVIA 3GL3A 2GZPA 3GV1A 5D8IA 2WFCA 2JSYA 4MPFA 4DSSA 5IQYA 4L0WA 1EV4A 5JCGA 3ZFLA 4RI7A 5DQYA 2M46A 5JWOB 3A5WA 1O6JA 6GSVA 3R2QA 5ECOB 5DCGA 5DBQA 4WR4A 9GSSA 2PUKC 3HCZA 3EU4A 1SD8A 4IVFA 4XTSA 1KEBA 1GL8A 1IYIA 1GSFA 1Z7PA 2MMOA 5F07A 2FWFA 2GSTA 3GKXA 2X8HA 3H1NA 3GMFA 3MAKA 3CRTA 3DYRA 3CSHA 1XFLA 12GSA 4IW9A 4IP1A 2VLUA 3M0FA 1QK8A 3QOUA 4GWRA 3CTFA 3EURA 5CRWA 4ECJA 5KN0A 3M8NA 2JACA 2XHFA 1FG4A 2GZZA 1VF2A 3HD5A 1I9DA 3E3EA 5D73A 2LNSA 2YN1A 4ZB9A 2C1YA 4N0ZA 1YEXA 2JADA 1Y6EA 1LU4A 2FA8A 3GX0A 2DLXA 3TKSC 4YQMA 4GTUA 4NAXA 4KH7A 2WRTA 2H1BA 1ACVA 1KNGA 5EL8A 1SD9A 2KOKA 2XBQA 2PGTA 2DJ2A 3LYPA 6GSXA 4TR4A 2EIQA 2H1DA 3FZAA 1K0CA 3ZIVA 2L4QA 3GL5A 5J41A 4HJ2A 1SKRB 3FW2A 3UEMA 6GSUA 2KHPA 1UC7A 3D21A 1WOUA 4XHMA 4O5RA 1TTZA 3DEXA 4LL1B 3HJOA 2KP2A 2HFDA 1FB0A 4XIHA 1PN9A 2YANA 2VM1A 1NW2A 4Q5QA 5JCWA 2E0QA 2IFQA 2FWEA 2H70A 4IJIA 2YCDA 2JZSA 4HQSA 1B4PA 3IK9A 4EF0A 4NWYA 3L0HA 1THXA 5IMCA 1KBNA 3GSSA 1GWCA 2M72A 4ZXGA 4KA0A 3HJPA 3VWUA 5A5KA 1WMJA 2RM5A 3GH9A 3IR4A 2ON7A 2YZUA 1QMVA 1M7TA 5IO2A 2YWIA 3PH9A 2H0IA 2VIMA 2WS2A 4IQAA 1MDKA 1XWCA 5HFKA 2H0HA 5H5SA 2ALBA 2V1MA 1B9YC 2LRTA 1SK1A 1AQWA 2GZYA 1OKDA 2HT9A 1WWJA 2E2MA 2L4CA 5DALB 4RI6A 2GVPA 1HD2A 4I2TA 3IHQA 1MD4A 2CAIA 3HKRA 1GULA 4ZL9A 1ABAA 1FAAA 1FOVA 1EWXA 2H73A 2OE0A 1YQ1A 3QFBC 2IPAA 3QCPA 4K2DA 1Z5YE 4WKWA 5HR3A 4L5LA 2LSTA 1YJ6A 1PMTA 3DGQA 1K3LA 1M2BA 5F05A 3ZTLA 2WDUA 4RUVA 1ERTA 5G2ZA 3FRCA 1QGVA 18GSA 4I8BA 3KIJA 3FK8A 1R4WA 3EC3A 3A2VA 3ZFBA 1GUKA 1K0MA 1XPVA 2HRFA 1AW9A 4Z7XA 2GGTA 2H71A 2VCVA 3UVHA 4X1UA 4MZBA 4Q5NA 3UAPA 4HU7A 4JR4A 3EMXA 2HSHA 3RAZA 1GUHA 4ML1A 2FHEA 1TOFA 2XPDA 1TRWA 3TRXA 1U6TA 3BJ5A 4KUNA 2N5BA 4NMUA 2YOIA 2LKUA 4LMVA 2FNOA 3TJGA 1I5GA 3MWHA 4OCEA 2FD3A 3IAS2 13GSA 1N2AA 2GSRA 3MSZA 2E7PA 4RQXA 4E8HA 3A2XA 5HFGA 4K9ZA 2YNXA 1CQGA 1KTEA 2YV7A 3DXBA 3ZVJD 3CXGA 3EYTA 3GKMA 1OKTA 1A2JA 3ZZXA 2B7JA 5CYYA 3C1SA 1HNCA 1A2MA 3IOSA 4JRRA 3LYKA 4KB3A 2H1GA 2KLXA 4LL4B 5H5QA 1YKCA 1AUCA 2X99A 1U3AA 2CAQA 2IIYA 4PUAA 4OWYA 1Z3EA 3QPMA 3KEBA 2G0FA 3IE3A 4K7IA 1FHEA 2JL4A 3AY8A 1K0AA 2PU9C 2H1AA 1PKWA 4GSNA 2K8SA 4IHUA 2F8FA 3LG6A 1DE2A 3VWWA 2K6VA 3EINA 2C0FA 3DIEA 4F0CA 1BYEA 3GA4A 2JZTA 5ECIB 1EEMA 1FVKA 4MZWA 6GSWA 1AC1A 16GSA 1EOGA 3L9VA 3UARA 5IOWA 1B9XC 11GSA 4GQCA 4XS1A 3HA9A 3F6DA 5AISA 3GUSA 3M3MA 2F3MA 5ELGA 2FLSA 3KH7A 3F8UA 4TRXA 2H6ZA 3M1GA 2P0GA 4TXVA 1ST9A 4MLYA 2DMLA 1VGLA 3FZ5A 3J7Yb 3TKQA 4RQRA 1QUWA 4NPBA 3MNGA 4I97A 1SL0B 4JR6A 1OE8A 10GSA 2V32A 5ELAA 3UBKA 2XPEA 5DQSA 1BX9A 2ZCTA 4MMMA 4WBJA 1XOAA 2EIRA 4EDZA 2DJ1A 3I9V2 5JCUA 4GCIA 4EDYA 3D4TA 1A8LA 3UBLA 1T4ZA 1EGRA 4KSMA 2H8LA 5L71A 1GSYA 1URMA 3LEFA 1V98A 4BWQA 3F4TA 4IN0A 3LQ7A 5DVBA 5IMAA 3QAGA 5IO0A 1FO5A 2PERA 2J23A 1IYHA 1O81A 1PA3A 2P5QA 3RHBA 1SJZA 3L78A 2NBSA 3RHCA 4DSRA 3VFIA 2CX3A 4K0NA 3ZVJA 4G10A 4V1Ap 4IBPA 3DVWA 4J57E 3PGTA 1R26A 5IMVA 2FA4A 3ISOA 1B8XA 4YAVA 1Z9HA 2LV3A 2HZEB 4POMA 1PL2A 4F2IA 1AAZA 4ISDA 1F6MC 4FYBA 4F0BA 1W89A 3ZIJA 2FWHA 5KN3A 1MDJA 5KEJA 1M99A 3C1RA 3IDVA 5IMZA 4X43A 4O32A 2IL3A 3QDNA 2REMA 5IPHA 2HNLA 4KE3A 1GSUA 3KP8A 1T8EB 2C8UA 3APQA 5CREA 4MJAA 3G7JA 2KUCA 5DJMA 1T00A 2X8CA 3O76A 4TVEA 5ID2A 2VLVA 4XS4A 4J56E 3VK9A 1GTIA 4V1Ag 2NTOA 4POBA 2XBIA 3O3TA 4PQIA 5LNKe 3KCMA 1HQOA 2V2GA 3TRPA 5IMDA 2J9HA 19GSA 4JE1A 3WD6A 1SKWB 2WCIA 1JHBA 1K0BA 5JWQB 3VWVA 3APSA 5ECKB 2DIZA 1Z6MA 4HUAA 1X9MB 1X9WB 7GSSA 4KGIA 3ERWA 4ZL8A 1U88A 4MJCA 4GXZA 3P2AA 4XRDA 2VL2A 1U3IA 1XBSA 1A23A 4KDUA 1H75A 4V2LA 2FUG2 3GN3A 4G9HA 1F2EA 4JEDA 4CW9A 2L59A 5CRGA 4EKZA 5AIVA 4L0UA 1K0NA 1E2YA 4K1FA 4AGSA 1YF1A 2V41A 4D73B 4Q5RA 3FHKA 2LRCA 2IN3A 4GLTA 3DWVA 8GSSA 2C0DA 4MPGA 3TOUA 1R5AA 5ECPB 1SYXA 3D4MA 4V2MA 1YY7A 2EIOA 1OYJA 3JCML 1FW1A 3E0UA 2K8VA 2CV4A 1Q4JA 4PGTA 4EVMA 2C4JA 1XW5A 3KTLA 1DSBA 3FKFA 4XCSA 1GUMA 4ZB6A 5G31A 5COHA 4DVCA 2O8VB 3P90A 3A3TA 2CQ9A 4MJBA 4TR3A 2VM2A 3BCIA 2IMKA 3WGDA 1G6WA 1K3OA 1O8XA 3GKKA 6GSYA 3CSIA 4KDYA 2PMTA 4HQZA 3QAVA 1AXDA 1EGOA 1EZKA 3IK7A 1V2AA 2B7KA 1TK8B 2DIYA 3TB2A 4HDEA 5J9BA 3ZREA 1WRYA 4P3YB 4HU9A 3I43A 4HZ2A 4TOPA 5EY6A 1JFUA 2OBIA 2CZ2A 3ZITA 2WZ9A 1XXUA 2ON5A 2DJJA 2H66A 2X8GA 5G5FA 3TGZA 4IGJA 5F8BA 5J5NA 1QFNA 1M9BA 5D9WA 2I1UA 4MCUA 5ECRB 4EUYA 3NOFA 1JLVA 2C0EA 4LMWA 3TKSE 1PQNA 1TKDB 1GSDA 3KMOA 3IRAA 4K0GA 4WXTA 2R37A 3C73A 2VAFA 4CDOA 2GQLA 3RPPA 1USBA 2R3XA 3UIWA 5ECMB 2ES7A 4L8EA 4MZCA 2RLIA 1BEDA 1ERUA 3PINA 3HVXA 4IELA 2WB9A 3N5OA 4JZQA 3TRQA 3ME7A 1WJKA 3ZL5A 1X5EA 2OE1A 5INYA 2AJQB 5D9TA 2LQOA 3KJYA 4KNDA 2FWGA 4JU5A 1N8JA 1PRXA 1YEPA 1SL2B 2HYXA 2GS3A 5F06A 1VRSD 1G7OA 5LCZA 1ZYEA 4PNFA 3ZMKA 4BL7A 2HI7A 1SL1B 4TR0A 1B4QA 3VPTA 2QGVA 1K3YA 2DBCA 2IMFA 2DMMA 4FO5A 1AIUA 2AV4A 3ERGA 2L6CA 5FWGA 1HNAA 3NZNA 2R4VA 4GSTA 3TJJA 4ZIJA 2RIIA 3GNJA 4AJ7A 4PUFC 4LLRA 1TW9A 1PD21 2H6YA 2IMEA 2DJKA 5ECHB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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