5JWOB

Crystal structure of foldswitch-stabilized kaib in complex with the n-terminal ci domain of kaic from thermosynechococcus elongatus
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
88
structure length
88
Chain Sequence
TAVLKLYVAGNTPNSVRALKTLNNILEKEFKGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLAKVLPPPVRRIIGDLSNREKVLIALRLLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of the day-night transition in a bacterial circadian clock.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Thermosynechococcus elongatus
molecule keywords Circadian clock protein kinase KaiC
total genus 28
structure length 88
sequence length 88
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jwoB00
1SJZA 2GDRA 3N9JA 3EC3A 3VURA 3RBTA 4F03A 1GLQA 5COHA 3G9BA 4I2TA 1NM3A 1UA5A 2B5XA 2LKUA 1TP9A 2JZSA 4YQVA 4DSSB 4I97A 2GZPA 3EWLA 1EZKA 4POBA 5IO0A 2FWGA 2I3YA 3KIJA 2WDUA 1BJXA 1FW1A 2FD3A 3KP9A 2JZRA 1GULA 4CDOA 3TKSE 4IVFA 4X43A 4V2NA 4ZILA 4MPGA 1EV9A 2IFQB 2YV9A 4NMUA 2H75A 2HFDA 4EKZA 5HFIA 2FLSA 2C80A 1AQXA 5DAKA 4MZCA 4LL4B 2NBSA 5G5EA 1WOUA 3DEXA 4PXOA 2VL2C 5CRWA 2LQOA 2VUPA 2FUG2 3HKRA 3M9KA 1EWXA 4L8EA 4XRAA 5DCGA 2LRNA 16GSA 3LORA 2B6MA 1EEJA 3H93A 3CYNA 4ECBA 3UIWA 22GSA 3DXBA 3KEBA 1R7HA 3GTUA 2QGVA 4XS6A 3VWXA 2CVDA 5A4UA 5B6NA 3EINA 5ELGA 2IWTA 4QL7A 1EP8A 2QKEA 2VCVA 2D2ZA 1SYRA 2C4JA 3FK8A 3QCPA 4IELA 2HE3A 4BWSA 5A4WA 5DJLA 3UBLA 1AQVA 2VL3A 4IP6A 4K2DA 2VCZA 4F0CA 4DSSA 3DGQA 3LQ7A 2B7KA 3QFAC 1ML6A 4EUYA 3LEFA 1DUGA 1XOBA 1OE8A 1J9BA 2C0DA 4FYUA 2YPMA 1IYIA 4WBRD 1J08A 1A23A 4ZIJA 3QOUA 2MYGA 2CA8A 1PKWA 3ZZXA 2XHFA 4RQXA 3GKXA 1A2MA 2ON7A 5EVOA 4IW9A 1GUHA 1EP7A 4MZWA 4EF0A 2IPAA 2DIZA 1ACVA 3IK9A 2R2JA 2YJ7A 1XFLA 4Q5QA 1TU7A 2WS2A 4G2EA 2CVKA 5IIZA 1OC9A 2FWHA 4MABA 4KDXA 2LEGA 1Z6NA 1F9MA 4KH7A 4ECJA 2WFCA 4V1Ap 1PRXA 1EGRA 2R3XA 3ED3A 2WULA 3I43A 1JHBA 2IMEA 2IMIA 2VLVA 2A2SA 2IL3A 1X0RA 4V2MA 1YEPA 2HLSA 1I5GA 3HYPA 4PUFC 1GH2A 3CXGA 1S3CA 4OO4A 1MEKA 1K0NA 1NSWA 5ID2B 2EC4A 1H75A 5C04A 1YF0A 4FIWA 1TJDA 2PGTA 1MDKA 5LNKe 4KDYA 2PPTA 2AB6A 5F8BA 1B4QA 2H1BA 2XBQA 1Y6EA 4HUAA 4EE0A 1K3LA 6GSUA 1GRXA 5DQSA 1UVZA 2O87A 3P8WA 1TKDB 1ERWA 5HFKA 4BA7A 1NHYA 4AF2A 5DBQA 4RQRA 5CP1A 3L9UA 1U88A 3HJPA 2WJUA 3IK7A 3IHQA 4XCSA 2DJ1A 2B5EA 1SK1A 4X1UA 4EC0A 5DVBA 4GF0A 5GAND 4PNFA 3M0FA 2H6XA 4FYBA 2H72A 1OKTA 2JZTA 3HVXA 3D4MA 10GSA 4K1FA 1TTZA 3KH7A 4KW6A 5IOXA 4BVYA 1ST9A 5KN3A 3TJJA 1A2JA 3Q6OA 4V1Ag 4MJAA 1B9XC 3ZL5A 3ZTLA 4POLA 4ML1A 1Y25A 2HRFA 5G1KA 1YJ6A 2WB9A 1T7PB 3L9VA 2GZYA 4LLRA 4ULXA 5GSSA 3TKSC 5KN1A 4GCIA 4LA1A 3DRNA 5ID2A 4K7IA 3ZYWA 5INYA 3KMNA 1AIUA 2GQMA 3ERWA 2GSQA 2GSTA 2C0EA 1U3IA 1ZOFA 2YOIA 3D5JA 3UVTA 4J2FA 1B48A 3GH6A 6GSWA 2OACA 3FY7A 1S3AA 5H5SA 1AAZA 4I5QA 4IP1A 5JWQB 1T3BA 3MWHA 3HA9A 1GSQA 1ZZYA 3IAM2 5H5RA 3IBHA 3H79A 2LS5A 3FR9A 4PGTA 3WD6A 3FEUA 2CQ9A 5HR2A 1TW9A 2OE1A 4KA0A 1NHOA 1TOFA 4KSOA 3TJKA 4DSRA 3EURA 4L0UA 4TR1B 3HHVA 3EMXA 4KSMA 1KTEA 2H0HA 3VPTA 1EV4A 5J9CA 2H1GA 2PUKC 3RPPA 3KTLA 2RM5A 2FWEA 3GURA 4GRFA 2X8CA 3GX0A 1YZXA 2GSSA 1PX7A 1VGLA 2PBJA 3DYRA 3KJYA 1B9YC 5GAPD 2XPDA 1G7OA 2WZ9A 1EEMA 4WBJA 2R5GA 5JWRB 2YCDA 1UN2A 2C0GA 2F51A 6GSXA 3G7IA 2V1MA 4XTSA 1F3BA 5CNWA 1XBSA 5ECKB 1E2YA 2CX3A 1WE0A 3EU3A 1GWCA 5B7CA 1WP0A 4JE1A 4Q5NA 1G7EA 4AJ7A 3E3EA 2H1DA 1Z7PA 5LD0A 1XW9A 2G0FA 5DCHA 1XCCA 3GNJA 1ZL9A 3UJ1A 3CBUA 4OFTA 4MK3A 1F2EA 1F37A 1XWGA 1I9DA 2REMA 3TKSA 3F3QA 1AW9A 1HNAA 3WGDA 5J4UA 2VCTA 3F4RA 3CRTA 2XBIA 5G5FA 1USBA 2H8LA 1A0FA 2R4VA 3ZIJA 1V98A 1THXA 2MMAA 1BYEA 2H0GA 4NHWA 5DAKB 3CTFA 3LYPA 4NV5A 1XWCA 2H66A 1SK2A 2FNOA 1X5DA 5CYYA 2YZUA 3E9JB 1TI1A 3D0ZA 4PNGA 4TW5A 3QAGA 6GSYA 2K8SA 1O8XA 1XIYA 2DJJA 1SL1B 4EO3A 3L0HA 2HRNA 1R26A 3MAKA 5ECOB 1EOHA 5J5NA 4HQSA 4ID0A 2C0FA 4MJEA 1M2DA 2E2GA 4NAXA 1QK8A 2VD0A 4TXOB 2V32A 8GSSA 3K8NA 3GSSA 3TGZA 1X9MB 2BJXA 1T4ZA 2YN1A 3SWLA 3FR6A 3KXOA 4WR4A 2VL9A 5F0GA 1G0TA 3CSHA 5D73A 4XS4B 2DSAA 1K0BA 3MNGA 1O6JA 1A2LA 3KTBA 2LQQA 3HD5A 5L71A 1XPVA 1ABAA 1HD2A 4H86A 2Z9SA 2I1UA 1K0CA 1SD8A 1FVKA 6GSSA 2HT9A 3ZITA 2MZCA 1W4VA 5AIXA 4J57E 3OR5A 1YF1A 2BMXA 3HCZA 1LBKA 3RAZA 2DIYA 3A2XA 1HQOA 4I8BA 1RW1A 2C3QA 1ZYQB 1TK0B 5J41A 2KOKA 4OO5A 1ILOA 3RPNA 1BG5A 2L6CA 3WT2A 3PGTA 2CAQA 5JWOB 2OBKA 2VM2A 3ZFBA 1OC9B 3HY2A 1TRUA 4AJ8A 1GSDA 18GSA 4TXOA 2I9HA 2OJLA 2F8FA 3APOA 3P7XA 3UARA 1O81A 4PX1A 2YWMA 4NXIA 3QD9A 2CZ2A 3GHAA 2LTKA 5EY6A 4OFNA 5G30A 4WKWA 2PERA 4XS4A 2ES7A 2GS3A 4ILFA 4GWRA 5DQYA 4RI7A 4F2IA 2H71A 2CVBA 2JADA 3FZ9A 3TKPA 1V40A 2YP6A 4ZBBA 4FH8A 2LNTA 3WGEA 4WETA 2C1YA 3ERFA 3HZ8A 3EVIA 3BOAA 3BCIA 3IC4A 1GNWA 5CREA 2LJKA 4ZB6A 2TRXA 4NWYA 2H6YA 1JFUA 2YWIA 3QAWA 1GLPA 1VF3A 3I6AA 1SJ6A 2N5BA 2KP2A 2YV7A 4YQUA 4HZ4A 1R4WA 1TK5B 4XIHA 2VO4A 4EXJA 3HVVA 4HU7A 1W89A 2XPEA 3LYKA 3GRXA 5IMDA 2CZ3A 6GSVA 2LJAA 1VF1A 2FHEA 5ECMB 1M99A 1JZRA 4V2LA 3H8QA 3NIVA 4KE3A 2X8GA 4OFMA 1VRSD 19GSA 4JRRA 2A2RA 1MD3A 2TRCP 4JU5A 1XWBA 1SK0A 2L5OA 3J7Yb 1LU4A 3ERGA 4HJ2A 5EPFA 1PD21 3VFIA 5F07A 1YKCA 3FZ5A 2J23A 2E7PA 2L57A 2VL2A 3KH9A 5IPHA 3F8UA 4Z7XA 3A2WA 3BD2A 4EVMA 3L78A 4IHUA 2VCWA 2YZHA 4GXZA 1SL2B 3IA1A 4IJIA 4ZBDA 4MJCA 2PU9C 4GQFA 2V41A 3HDCA 5AGYA 1ERUA 1WRYA 2HNLA 3ZMKA 1M2BA 1M2AA 3GSTA 3UBKA 4POKA 5D96A 4HU9A 2MBSA 1GL8A 4L5OA 5KN2A 4BVXA 2JU5A 4IQAA 2OE0A 2V2GA 1YQ1A 3KD0A 3MSZA 2ZUPA 3ZREA 1PN9A 4KNDA 4HOJA 2X99A 3HZ4A 4BWQA 1K0AA 1YDKA 5B8AA 3GA4A 3GKNA 2HZFA 4L0WA 1Z5YE 2IMKA 4MH3A 1WWJA 2YWNA 3CMIA 1FHEA 5DJMA 1BX9A 3TRPA 1MD4A 3F0IA 2FA4A 3F4SA 2VLTA 2N5AA 4FYCA 7GSSA 3DD3A 4DVCA 3GN3A 2YANA 1M9AA 3VWUA 2FCHA 4K7OA 3G7JA 1FB6A 2DJ2A 2B7JA 3IPZA 1E6BA 3KP8A 2O7KA 1MDJA 4Q5RA 2L4QA 4XS1A 3R2QA 1DBYA 5CRHA 4BPYA 1XW5A 4GTUA 4YH2A 3D22A 3PR8A 1DSBA 2DJKA 1XVQA 4DSQA 2DC5A 1R5PA 1DE2A 4NPBA 5H5QA 2KP1A 2L5LA 1G6YA 2MMZA 5ECHB 5DALB 2IN3A 4MCUA 4MPFA 1FB0A 1AXDA 1QXHA 3FKFA 3KZQA 1GSEA 2I81A 3WYWA 4YAPA 1OC8A 5AN1A 5IOWA 3ME7A 1N2AA 5J3RA 3VPQA 2CT6A 2RLIA 2FWFA 2GZZA 2WGRA 4N0ZA 3TCOA 4CHSA 2RUFA 1ERTA 1ZCPA 4IKHA 3TOUA 4N0VA 1EGOA 3EE2A 3M3MA 1SKSB 4G9HA 3GKKA 3KMOA 3TJGA 2NTOA 3FHKA 3GFKA 2F3MA 3Q19A 1WPIA 3GX8A 4D73B 1XWAA 1M7TA 4JZQA 4K6XA 1TRWA 1N8JA 2NPBA 3VWVA 3TOTA 3LG6A 3L4NA 4RUVA 2JSZA 1K0MA 2M46A 1FOVA 1ERVA 1WMJA 2GT6A 5JCWA 4TR4A 3QMXA 3KM6A 4X0XA 5A5KA 3TJFA 3D6IA 3C1SA 3VLNA 1V9WA 4GSTA 2ON5A 3EMPA 4MZBA 3LWAA 1TK8B 4OCFA 1FVJA 1K0DA 1X5EA 2AV4A 2O8VB 3F3RA 3C8EA 5DALA 4MDCA 13GSA 5D93A 3KGKA 3C1RA 5CAXA 1F6MC 1TRVA 2K18A 1SKWB 1OE7A 1R5AA 2VCQA 2B1LA 2CX4A 2LNSA 1HYUA 3CSIA 3GKMA 2DMMA 2C3TA 3LSZA 4ZBAA 4EDYA 1CQHA 3GV1A 4E8EA 4G10A 12GSA 5IM9A 3EYTA 14GSA 4EL1A 2EIOA 3DWVA 5D9WA 2LUSA 5HFGA 2FGXA 2F9SA 1TDIA 4D73A 2M80A 1U6TA 3GL5A 3TRXA 2NDOA 2O85A 3S9FA 4HS1A 1O73A 2HSYA 1A8LA 2GT5A 4O92A 1JZWA 4HZ2A 4ECIA 4TKYA 4WEYA 1JLWA 2P31A 1KEBA 5KEJA 5G2ZA 2DMLA 2IMDA 4KCAA 1QMVA 1TI3A 4GSNA 2AJQB 1SKRB 2X8HA 1AQWA 1BAYA 1URMA 1TU8A 1TXXA 1QUWA 3F9UA 1IYHA 1OVNA 2KHPA 4TVEA 3D4TA 5D8IA 4HEA2 3U6VA 1SU9A 4N30A 3D21A 1PL1A 5ECLB 1S3DA 2MMOA 1GTBA 3DVWA 2I4AA 3Q74A 3WGXA 2ZCTA 3P90A 3C73A 1T00A 1J0FA 1BEDA 2H70A 1A24A 3VI5A 4IBPA 3W8JA 4ZL9A 4P3YB 2P5QA 3O76A 3W8SA 1O8WA 2PVOC 2H73A 5IPGA 5IQYA 3C7MA 4DEJA 2QSIA 3U5RE 3IV4A 1SYXA 2OBIA 4ZXGA 4J56E 1AC1A 1T4YA 4K8MA 1OKDA 2GLRA 1B8XA 5B8BA 3M9JA 3F6DA 2IJYA 3TKRA 1X5CA 1JZDA 3ZFLA 2LV3A 3A3TA 2L59A 4ECCA 1OYJA 3UL3A 4TOPA 3IAS2 4GSSA 4CW9A 2OE3A 3DVXA 2EIRA 2CV4A 6GSTA 4KCEA 3DKSA 1SJIA 3CTGA 4OD7A 1Z6MA 4K7NA 4ACSA 1XWKA 1FG4A 4GLTA 3ISOA 1M0UA 2K9FA 2P0GA 1PA3A 5IMFA 3JCML 2L6DA 4EDZA 3IXRA 3DIEA 2DBCA 3MDKA 3ZLPA 1GSYA 3EU4A 5HR1A 5HR3A 4N10A 3A2VA 4MA9A 1QFNA 5EL8A 3UMAA 2GQKA 3TDGA 2C8UA 3VWWA 3IR4A 1OC3A 3APSA 4NV2A 3AY8A 3M1GA 1XW6A 2HXKA 1RK4A 2IFQA 4F82A 5ELAA 1Q98A 5CO3A 4IS0A 2FA8A 3GL3A 2PWJA 1NW2A 5JCUA 2C3NA 2V6KA 2JL4A 4O5RA 3QDNA 4IN0A 3DMLA 1PX6A 2AAWA 3CSJA 3W6GA 2VIMA 5F05A 1WJKA 5G31A 3N5OA 3TJBA 2M72A 5IO2A 5ECNB 4ZB9A 3O3TA 1QGVA 1T1VA 1RQMA 1WIKA 3VK9A 4XRDA 4IQ1A 5D9XA 4E8HA 4OMVA 2LRTA 3TUEA 3LFLA 5J9BA 1CQGA 4LL1B 2B3SA 3NOFA 3UOMA 2RUEA 1FAAA 2GGTA 3TKQA 2H19A 1B4PA 3RDWA 3M8NA 2NVLA 2H6ZA 5B6MA 3L9SA 5GZZB 2YJHA 4PUAA 5CRGA 5ECIB 1PQNA 4YAVA 1PSQA 1FO5A 2HSHA 2ZNMA 4HJMA 1SD9A 1PGTA 2JSYA 5HR0A 4HDEA 2AYTA 2DLXA 2FY6A 3FYGA 4IJ3A 4QQ7A 2PVQA 4XHMA 2H1AA 2YWOA 5LCZA 2H0IA 2H74A 1X9SB 1KNGA 4PQHA 3ZIVA 4MMMA 5FT3A 2B5YA 5CRDA 2CAIA 4TRXA 3GYKA 9GSSA 5D9VA 3IDVA 3RHCA 4TR0A 3O6TA 3V1WA 2VCXA 3RHBA 1C72A 4AJ6A 3A5WA 4KGIA 2H76A 2HZEB 4HQZA 2P5RA 3FR3A 3I9V2 2PN8A 5IMVA 4POMA 4Q5FA 5IMCA 4F9ZA 5IMZA 4QL9A 5ECPB 4WF5A 5F06A 4KX4A 4MJBA 2R6KA 2LSTA 1T8EB 3HJMA 4N11A 4WF4A 1Z3EA 1K0OA 2GVPA 1GSSA 2XC2A 1GUKA 2J9HA 3SBCA 5G1LA 4K0GA 3ZVJD 2DJ0A 4I6XA 2VD1A 2AHEA 5ABRA 3LXTA 3F6FA 2YNXA 1G6WA 3VI7A 1HNCA 4WR5A 1GUMA 4FO5A 4F0BA 3FZAA 1K3YA 5KN0A 1SENA 5E59A 3WT1A 1Z9HA 4PQIA 4ZL7A 4JR4A 2VAFA 5HQPA 2N5FA 4ZB8A 1V57A 1THOA 1OAZA 1Q4JA 4LMVA 2KUCA 1HNBA 4WXTA 3HJOA 1KBNA 4GQCA 1ON4A 4ZL8A 2OA7A 2GSRA 2G2QA 2O89A 1XZOA 1JZOA 2H01A 1U3AA 1ZGNA 3P2AA 3HVSA 2JACA 3UVHA 2OKAA 3NZNA 2HZEA 4PQ1A 2OADA 1PL2A 4OWYA 2E2MA 2PMTA 4JEDA 1GNEA 3J7Yk 1AUCA 2QC7A 2TIRA 4JBBA 5ECQB 3QAVA 2LJRA 1GP1A 2GTUA 5ECSA 3ZRDA 2BTOT 5FWGA 5AISA 3GUSA 1U87A 17GSA 4OCEA 2VM1A 1BQ7A 3ZVJA 4G19A 1YY7A 2A4VA 1YEXA 2HYXA 3TB2A 1V2AA 4TXVA 2B1KA 3BCKA 1PKZA 1O85A 5GSTA 4PURA 1GSFA 4KAEA 2RIIA 3GMFA 1A0RP 3BBYA 3IE3A 2F8AA 2K8VA 2HI7A 3QFBC 3F63A 3H1NA 2ALBA 3FZ4A 3QR6A 1GTIA 2GQLA 3LJRA 4MH2A 1Z7RA 4YQMA 3LGCA 1M9BA 4HI7A 1LJRA 3APQA 1XOAA 3UAPA 1K3OA 2EIQA 2KLXA 2AUVA 1GTUA 2DJ3A 4L5LA 3GH9A 3ME8A 1GTAA 4ML6A 3US3A 4MP4A 4KDUA 3GIXA 1X9WB 3QPMA 20GSA 4MF5A 3IOSA 3F4TA 1DE1A 2E0QA 3I69A 1MTCA 11GSA 4K0NA 4LMWA 2RM6A 3PH9A 3UEMA 2L4CA 3TRQA 1ZMAA 1QQ2A 5FHIA 3FW2A 3HXSA 3ZMLA 3IRAA 4RI6A 4TR1A 1TRSA 2IMFA 5JCGA 2H30A 1F3AA 1A8YA 1PMTA 2MBTA 3C71A 4TR3A 1EOGA 3KCMA 1JLVA 4BL7A 1VF2A 1ZYEA 5AIVA 3G7YA 4IGJA 4I2UA 4ISDA 3H4KA 5DDLA 5IMAA 2X64A 3FRCA 1V58A 2K6VA 3LXZA 3BJ5A 1VF4A 2VOCA 4MLYA 1YKAA 2LRCA 3E0UA 4TN8A 1GSUA 1MDIA 3PINA 2V6OA 4KB3A 1XVWA 1H4OA 5D9TA 1XXUA 1SL0B 4JR6A 2WRTA 2MMNA 4AGSA 4NHZA 3Q18A 5ECRB 2VLUA 5A4VA 1O7UA 4K9ZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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