5JWOB

Crystal structure of foldswitch-stabilized kaib in complex with the n-terminal ci domain of kaic from thermosynechococcus elongatus
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
88
structure length
88
Chain Sequence
TAVLKLYVAGNTPNSVRALKTLNNILEKEFKGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLAKVLPPPVRRIIGDLSNREKVLIALRLLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Circadian clock protein kinase KaiC
publication title Structural basis of the day-night transition in a bacterial circadian clock.
pubmed doi rcsb
source organism Thermosynechococcus elongatus
total genus 28
structure length 88
sequence length 88
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jwoB00
2C0FA 5G30A 1X9SB 1I5GA 3P2AA 2X99A 5ECKB 4FIWA 3GRXA 2VCQA 5DALA 4FYUA 1B4PA 4X1UA 2VCVA 4MCUA 1YKCA 2GSSA 2BMXA 1XWGA 2H75A 2CVKA 1M2AA 5DCGA 2FGXA 2AJQB 5GAPD 2TIRA 5ECPB 4TXOB 4XIHA 1THXA 2EIOA 2IPAA 4K8MA 2M80A 1YZXA 4NPBA 3QCPA 3ERGA 5CRGA 1JFUA 4GCIA 1YY7A 1R4WA 3L9SA 1HNCA 3E0UA 1FO5A 2CT6A 1BX9A 2HI7A 11GSA 1VF1A 4NAXA 2DJ1A 4BVYA 4IS0A 3EINA 4ZB9A 4OFMA 2WULA 2C1YA 1V2AA 1RK4A 3EYTA 1GUMA 1QK8A 3PH9A 4G10A 4ZL7A 4XRDA 3DD3A 2B5XA 1XCCA 3MNGA 4DSQA 2LNSA 3CTFA 1GUKA 2LJKA 4BWQA 4HEA2 4O5RA 2LRNA 2VL3A 4K2DA 4AF2A 2YZUA 4BA7A 3GYKA 1PKZA 3HVSA 3L9VA 4OFNA 4TN8A 4XS1A 2H1DA 13GSA 4G19A 4OMVA 1XPVA 1GTUA 5D9VA 1K0MA 2E2MA 2B6MA 1TP9A 10GSA 1A0RP 1Q4JA 2QGVA 5A4UA 2QKEA 2JSYA 4XS4A 1EWXA 2I4AA 3J7Yb 1PKWA 1SKSB 3FZ4A 1OC8A 2NBSA 3CMIA 2E2GA 6GSTA 2C80A 3RPPA 1A8YA 3HXSA 3F4SA 16GSA 1PN9A 5IMFA 4KCEA 5F8BA 2HRNA 2CA8A 1K3YA 5DQYA 1ST9A 3A3TA 3IA1A 2DMMA 1WP0A 4QQ7A 2O85A 4WR5A 5GAND 1OKTA 1TJDA 3WGEA 3TRQA 1ZZYA 5KN1A 5LCZA 5HR3A 4ZB6A 2RUEA 3GL3A 1O6JA 3E9JB 5GZZB 4I8BA 2G0FA 1SD9A 1ERTA 2L59A 2DJ3A 4PUFC 3EMPA 17GSA 4MK3A 3LWAA 1SL1B 2H6ZA 3G7JA 1ZYQB 4KGIA 2VO4A 2FD3A 4HJMA 4KSOA 1DUGA 4MF5A 3HD5A 1GLPA 3CSJA 3FZ9A 1S3CA 1JHBA 3DWVA 1Z7PA 4GXZA 2CVBA 4E8EA 1QUWA 2HFDA 2H1BA 3CYNA 3HVVA 4D73B 1F6MC 1GNEA 1DSBA 3WGDA 2MZCA 1Z5YE 2VCTA 2YN1A 3US3A 2H8LA 4ZB8A 6GSUA 3DMLA 4N0VA 1JLWA 3D22A 5JWRB 2AYTA 1A8LA 1SJ6A 1K0NA 3GIXA 1ZL9A 3M0FA 2B5YA 1F3BA 1SK1A 5IPHA 1NSWA 3KZQA 2V32A 18GSA 4RI6A 5HR2A 1EGOA 1U88A 1WRYA 3A5WA 2CX4A 4G2EA 3RPNA 4JRRA 2R3XA 3W8SA 1PGTA 3D4TA 4WF5A 4MPFA 3FR9A 4IKHA 1BYEA 1VF4A 1YDKA 2FA8A 4ML6A 2I3YA 4EF0A 4PURA 2HZFA 4N30A 4N10A 1M9AA 4MJAA 4HU9A 4TOPA 1EOHA 2K8VA 1THOA 3RHCA 1V57A 2H30A 3QOUA 1A2LA 2JZRA 4CDOA 3KP8A 3QMXA 5IPGA 1XVWA 2ZNMA 5H5SA 1XW6A 4WBRD 1BG5A 1PSQA 4JU5A 2DMLA 3LG6A 5D96A 5INYA 2MBSA 4MLYA 2FWGA 3F4RA 2DJ0A 4KCAA 1CQHA 4GRFA 2YOIA 4MABA 5AGYA 2XC2A 1OKDA 2CZ3A 2H19A 3TRXA 1E2YA 3DGQA 1ACVA 1PQNA 1WIKA 6GSSA 3KMNA 2IMEA 2LRCA 5A4VA 4WETA 3TKSE 3HA9A 2JL4A 4JEDA 4F9ZA 1E6BA 2JSZA 1Z6MA 1SJIA 1FW1A 1O8WA 1Z6NA 3H1NA 3VLNA 4Q5QA 1KTEA 2QSIA 4MZBA 5JCGA 4PUAA 6GSYA 4LL1B 3F6FA 2H76A 2B1LA 2GGTA 4GSNA 2H0HA 3F63A 1FOVA 2XBIA 4WEYA 2IMDA 2B3SA 2VCZA 1IYIA 3GTUA 2E0QA 3EC3A 5C00A 2DIYA 1PA3A 5D73A 3P7XA 2H74A 3ZFLA 4EC0A 2VUPA 1X5EA 3GN3A 4XS6A 3GX8A 5FHIA 1AQWA 3KH9A 2B5EA 2H1AA 2IMFA 2JACA 3TGZA 3FW2A 1GSEA 2J23A 4GF0A 2I81A 2GQLA 3ZYWA 3BBYA 1GSQA 1R26A 2RM5A 5JWQB 1FHEA 4POLA 5DAKA 5IO2A 4GLTA 3H8QA 2E7PA 4RUVA 4WKWA 1ERVA 2WJUA 3IXRA 4YQMA 2R4VA 4JR4A 4POBA 2V6KA 3D21A 3GKXA 1XW5A 2DC5A 5CP1A 1ZCPA 2PN8A 1UC7A 2YWIA 3VFIA 1YEXA 3KEBA 3C1RA 1G0TA 3O3TA 3GH6A 1HNBA 1ON4A 1GTAA 1HQOA 4AJ6A 5HFGA 4L0UA 1EOGA 4IHUA 2PVOC 3ZVJA 5F05A 1PL2A 3FZAA 1FB6A 3G9BA 3GV1A 3ERWA 2HE3A 3DRNA 2LSTA 5ELGA 1GULA 4V1Ap 2N5FA 1MTCA 3LJRA 1AAZA 3CBUA 4GSTA 1EP7A 4ZILA 2VL9A 2YPMA 4XCSA 5LNKe 2HLSA 2VLUA 2VLTA 4IN0A 1TRUA 2X64A 1GLQA 3QAWA 2YP6A 2P31A 2OE0A 4L5LA 3F4TA 1QQ2A 1PRXA 2VM1A 4PQ1A 1EV9A 4MDCA 3HJPA 3M3MA 3UBKA 4K7OA 1QFNA 1MDKA 3H79A 1NW2A 3DVWA 1XWKA 2PPTA 2FWFA 3GHAA 4K7IA 4IBPA 2YCDA 1EGRA 3HJMA 2VAFA 3LORA 1TRSA 1W89A 1GUHA 1T4YA 5J5NA 2ZCTA 2FWEA 3JCML 1YF1A 2CAIA 4Q5FA 1AXDA 1FAAA 3M1GA 4IVFA 2OBKA 2VL2C 3IDVA 2MMAA 4MH3A 4F03A 1A23A 2C8UA 2X8HA 1X0RA 1XVQA 2YV7A 3VPQA 3ZL5A 4LL4B 2OADA 4IW9A 3RDWA 1TOFA 3IE3A 2PU9C 4BL7A 5LD0A 5GSSA 1VF2A 3HYPA 5ID2B 1QXHA 2H1GA 5DBQA 2MMNA 1SENA 3KM6A 3KD0A 3BCIA 2LNTA 2RIIA 5HR1A 4F2IA 1TTZA 1FB0A 2H70A 4DSSB 2IFQB 3U5RE 3UARA 1W4VA 4NHZA 2J9HA 5G1KA 3TKSC 2LJAA 5A5KA 2GZZA 2O87A 4NWYA 3OR5A 5EL8A 5F0GA 1Z3EA 5B8AA 5AIVA 2FNOA 3WGXA 3TOUA 4H86A 3H93A 1XWAA 2MMOA 3D6IA 3MDKA 4KNDA 4QL7A 2HSHA 4I2UA 1WPIA 2ES7A 3TKPA 4EDYA 1T3BA 3EWLA 3L0HA 3VK9A 2L57A 19GSA 3QAVA 4FH8A 4MZCA 3EVIA 2HZEB 5AN1A 3IRAA 4WBJA 2O8VB 1K3LA 3IAS2 3M9KA 4X43A 3FKFA 1EZKA 1GP1A 3IOSA 4MMMA 2DSAA 2PWJA 4GWRA 1AIUA 4TXVA 1SL2B 1WE0A 3DYRA 2YANA 3TJJA 4GQFA 4ML1A 2PERA 4HI7A 2YWNA 4ECBA 5B7CA 3H4KA 1G6YA 1JZWA 2XPDA 4GTUA 5CNWA 1OC9A 2PBJA 5IMAA 4WXTA 5HFIA 5EY6A 3FY7A 4IP6A 5G1LA 3FRCA 1TW9A 5D93A 2CZ2A 3UBLA 3DEXA 2WRTA 3RHBA 1VRSD 2NTOA 2V2GA 3MAKA 2H6XA 5B8BA 4HQSA 3QFAC 3LEFA 5D9WA 4XTSA 2DBCA 22GSA 2YV9A 3GKKA 4I97A 2LQOA 1XFLA 4Q5RA 2WZ9A 5DVBA 2KP1A 2ON7A 4MP4A 2XPEA 5DQSA 4KUNA 2G2QA 2A4VA 4TVEA 1CQGA 2WDUA 2IWTA 4KB3A 2VD0A 3O6TA 3I6AA 4TR1B 2FLSA 3CSIA 5H5RA 4OCFA 2I1UA 4RI7A 1WWJA 3VI5A 1USBA 1PX7A 2LS5A 4K0GA 2C0EA 4KX4A 1O81A 3VWUA 4ZL8A 1IYHA 2FHEA 2AB6A 1PD21 3GMFA 2WFCA 1MD3A 5EPFA 1BEDA 2GT6A 3PR8A 1V58A 3ZRDA 5ECRB 1J9BA 4XRAA 4FYCA 1FG4A 4FYBA 1T1VA 4KW6A 4N11A 1M9BA 2I9HA 1EV4A 3TOTA 1M2DA 3WYWA 3UMAA 1MDIA 2B1KA 1PL1A 1Z9HA 4I2TA 3M9JA 2BJXA 3L78A 4EO3A 3FYGA 2L4CA 3G7IA 3UL3A 1YKAA 1Z7RA 1SKWB 4TXOA 3ZITA 1ML6A 1EEMA 2F3MA 5G31A 4JE1A 2WS2A 4OO4A 2YWMA 1O8XA 3CXGA 3FK8A 1G7OA 4ZL9A 4KE3A 2LQQA 1UN2A 1K0CA 2GLRA 4X0XA 3VPTA 1O7UA 3GUSA 4ACSA 1DE1A 3GL5A 3NIVA 2X8CA 4DSRA 3GA4A 1O85A 2XHFA 5JCWA 5CRHA 4LA1A 5E4WA 2L5LA 1TU8A 1XOAA 4JR6A 2LEGA 5FT3A 5D8IA 4KDUA 5DALB 5ABRA 5G5FA 4I6XA 3HKRA 6GSXA 3TB2A 3GNJA 2FY6A 3M8NA 4YAVA 1NM3A 2ALBA 3FR6A 2M72A 4J56E 2PVQA 3TKQA 3IR4A 2OBIA 1YJ6A 2HXKA 1K3OA 4PGTA 3KCMA 1XOBA 4PQHA 2NVLA 4IQAA 7GSSA 1VGLA 3MWHA 8GSSA 1T7PB 5ECIB 1A0FA 3LSZA 1T00A 2RUFA 1V9WA 2TRXA 2HSYA 3I43A 3ZTLA 5D9TA 2KP2A 1N8JA 3F8UA 3HJOA 4ECCA 4F0BA 2JU5A 1UVZA 2R6KA 1XBSA 1K0BA 2LRTA 3KIJA 3TKRA 3KH7A 12GSA 2GTUA 1RW1A 2JZSA 1GSYA 2K8SA 3UEMA 3TDGA 2LKUA 1GSFA 1G7EA 14GSA 3QDNA 2PGTA 1ZGNA 1KNGA 3KGKA 1YF0A 4P3YB 2GSRA 3IK9A 2H01A 4I5QA 2GZYA 2CX3A 3PINA 4TKYA 4KSMA 2L6DA 3EMXA 3VI7A 1B9YC 3N9JA 3PGTA 4HZ2A 5DCHA 4GSSA 2FCHA 1WJKA 3S9FA 3LYKA 2GSQA 3UVTA 3VURA 4EVMA 4XS4B 2VCWA 3F0IA 4K1FA 4V2NA 3D0ZA 1XZOA 3UOMA 2B7JA 2CAQA 2AV4A 3F9UA 4L8EA 3R2QA 2VM2A 1ERUA 5ECSA 4D73A 3C1SA 4HOJA 3UVHA 4EXJA 3TJGA 5IM9A 2HT9A 4TR4A 1A2JA 5DJMA 3WD6A 4L5OA 2C3NA 1HYUA 3TRPA 1RQMA 2RLIA 2DJJA 2MBTA 2V1MA 3ZVJD 1AW9A 2D2ZA 1OAZA 2FUG2 1VF3A 4TR0A 3APOA 3P90A 4POMA 1J08A 1Y25A 1T4ZA 3D4MA 4G9HA 4EKZA 1ERWA 4ULXA 2RM6A 3KJYA 2TRCP 3NZNA 5JCUA 3KTLA 2IL3A 1GNWA 1OE8A 3HCZA 4MJEA 1EEJA 5IOXA 20GSA 1JZRA 3KTBA 4HJ2A 1HD2A 2H0GA 2GS3A 3TUEA 2L6CA 1M0UA 2HNLA 1PX6A 2K18A 1SU9A 5CYYA 2R5GA 2AUVA 4NHWA 5JWOB 5KN2A 5J9BA 2NDOA 4KDYA 5B6MA 3C73A 3L4NA 3HZ4A 5L71A 1GTBA 3P8WA 4AGSA 2CQ9A 2JZTA 4O7HA 3FZ5A 2VOCA 5B6NA 4O32A 4IP1A 5ECQB 1ZYEA 1G6WA 3BD2A 2C0DA 1LJRA 2H71A 4CHSA 1SL0B 3W6GA 3IK7A 2N5BA 2LUSA 2DJ2A 1KEBA 3BOAA 1TXXA 4PX1A 2R2JA 4YQVA 9GSSA 1XW9A 4EDZA 1YQ1A 4YH2A 1H75A 4O92A 5D9XA 4EE0A 3HDCA 3ME8A 4BVXA 2H0IA 4LMVA 2XBQA 5H5QA 5A4WA 2L4QA 1FVKA 3TCOA 4MJBA 2HYXA 4PNFA 4GQCA 3CRTA 4F82A 3GKNA 3C8EA 1HNAA 1OYJA 2NPBA 2VCXA 3WT1A 3TJBA 5ECMB 4K6XA 4V1Ag 3QR6A 3DXBA 2YZHA 1F9MA 4J2FA 2H72A 3WT2A 3FR3A 4Q5NA 2O89A 4LLRA 3UIWA 3CSHA 2V41A 4HQZA 4MF7A 2LV3A 4IQ1A 5DJLA 3SWLA 2GQMA 1DE2A 1A2MA 4IGJA 2WB9A 4NV2A 5EVOA 3KMOA 3GFKA 3C7MA 4BWSA 1Y6EA 1T8EB 2EIRA 2MMZA 4WR4A 4ZBAA 1AQVA 4PNGA 4NXIA 2EC4A 1U87A 3Q6OA 1TU7A 2K6VA 3UAPA 4OFTA 4E8HA 5CAXA 3NOFA 2OE1A 1FVJA 3SBCA 1ABAA 1SJZA 3K8NA 1MDJA 3A2XA 1R7HA 1ILOA 2Z9SA 3HZ8A 3IBHA 1TRVA 1SYXA 3UJ1A 1GSDA 2H73A 1U3AA 4EUYA 1GL8A 2ON5A 4ECJA 3GTUB 3DIEA 3GH9A 3EE2A 3DKSA 4ILFA 2V6OA 3IHQA 1X9WB 2F8AA 3VWXA 4QL9A 3LFLA 3MSZA 5COHA 4AJ7A 1TK8B 4FO5A 5G5EA 1OC3A 2H66A 3ZZXA 5J41A 5ECHB 5J3RA 1AUCA 3F3RA 2KUCA 4IJ3A 5IMZA 2HRFA 5DAKB 3LXZA 3J7Yk 2VIMA 3E3EA 2CV4A 5CO3A 1M7TA 4KDXA 3VWVA 1V40A 1JLVA 3QFBC 4BPYA 1B8XA 1XIYA 4OCEA 2OE3A 5IOWA 2YJ7A 2F51A 3ME7A 5DDLA 1UA5A 3EU4A 1BAYA 3RBTA 2VD1A 2A2SA 6GSVA 4V2MA 2P5RA 3CRUA 2P0GA 2R37A 3ZIVA 1X5DA 1GSSA 2DIZA 3F6DA 4HZ4A 4ZBBA 2VLVA 1TDIA 2M46A 4ECIA 3RAZA 2B7KA 4XHMA 4PQIA 1AC1A 1SK0A 3ZLPA 2KOKA 1TI1A 1X9MB 3C71A 3LXTA 5E59A 3TJKA 4MJCA 4RQXA 2REMA 3CTGA 4TR3A 3DVXA 5ECOB 2QC7A 1MD4A 3Q19A 3F3QA 3QPMA 3GSSA 1EP8A 1GRXA 5C04A 4MA9A 1J0FA 1R5PA 1PMTA 2P5QA 4V2LA 1GTIA 2C3TA 3HY2A 5ID2A 1I9DA 1S3AA 4L0WA 3GSTA 1F2EA 4MZWA 5CREA 3TJFA 1S3DA 2C3QA 3ED3A 5G2ZA 4DSSA 2AAWA 2IFQA 3L9UA 1MEKA 5CRDA 4DEJA 1GH2A 5ECNB 2IN3A 4CW9A 1OVNA 2GVPA 1V98A 1K0OA 1B48A 1TRWA 3ZFBA 5F06A 3I69A 1SKRB 1TI3A 2K9FA 2WGRA 2DJKA 3ZMLA 4IJIA 3BJ5A 3IAM2 3KP9A 4HUAA 3GURA 4HU7A 4ISDA 1XXUA 3V1WA 2C0GA 2FWHA 3D5JA 5KN3A 4TW5A 1U3IA 5HQPA 3QD9A 2CVDA 2YWOA 2H6YA 2EIQA 4ZBDA 2HZEA 1JZDA 3N5OA 4KA0A 2IJYA 1OE7A 2KLXA 3APQA 1F37A 1XWCA 3ISOA 1ZMAA 4OD7A 5GSTA 2GDRA 3I9V2 1Q98A 1K0DA 3EURA 2KHPA 1ZOFA 2FA4A 2OJLA 3LGCA 4ID0A 2DLXA 1K0AA 1SK2A 3LYPA 2LTKA 3GKMA 1GSUA 1WOUA 3IV4A 1QMVA 2X8GA 1XWBA 2IIYA 5AIXA 2OKAA 3U6VA 5HR0A 3IPZA 5ECLB 5KN0A 5J4UA 3A2WA 1KBNA 4OO5A 1SYRA 2VL2A 2YNXA 2WCIA 1WMJA 2L5OA 4POKA 1A24A 3ERFA 4PXOA 2JADA 2N5AA 1BJXA 1R5AA 4WF4A 5IMDA 2F9SA 5AISA 3Q18A 1U6TA 2GT5A 4JZQA 1AQXA 3HHVA 1LBKA 5FWGA 2PMTA 3A2VA 2YJHA 4F0CA 3Q74A 3FHKA 3KXOA 4K0NA 3HVXA 4KAEA 4EL1A 2O7KA 2ZUPA 1TK0B 4ZIJA 4TR1A 5IMVA 1JZOA 1OC9B 4DVCA 3TKSA 4YQUA 5F07A 4KH7A 2IMIA 5J9CA 1B9XC 5IQYA 5IMCA 1F3AA 5CRWA 2A2RA 5KEJA 1X5CA 4Z7XA 1M99A 1LU4A 4NMUA 1NHOA 3G7YA 4HS1A 3ZREA 2PUKC 3GX0A 4J57E 2OACA 2AHEA 5HFKA 1TKDB 1URMA 4K7NA 6GSWA 1O73A 3FEUA 3ZMKA 4JBBA 2BTOT 1DBYA 2F8FA 3APSA 3O76A 4OWYA 5ELAA 2C4JA 3BCKA 4NV5A 1H4OA 2GZPA 3LQ7A 4RQRA 1SD8A 4MH2A 1C72A 4ZXGA 4MF6A 3VWWA 5ENUA 2GSTA 4N0ZA 1QGVA 1M2BA 3W8JA 3AY8A 4YAPA 4LMWA 3EU3A 4K9ZA 1TK5B 1N2AA 2GQKA 4IELA 3IC4A 5IO0A 4TRXA 3QAGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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