5JWQB

Crystal structure of kaic s431e in complex with foldswitch-stabilized kaib from thermosynechococcus elongatus
Total Genus 15
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
15
sequence length
88
structure length
88
Chain Sequence
TAVLKLYVAGNTPNSVRALKTLNNILEKEFKGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLAKVLPPPVRRIIGDLSNREKVLAGLDLLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of the day-night transition in a bacterial circadian clock.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Circadian clock protein kinase KaiC
molecule tags Transcription regulator
source organism Thermosynechococcus elongatus (strain bp-1)
total genus 15
structure length 88
sequence length 88
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jwqB00
1OVNA 1YF1A 3KM6A 1OC3A 4NMUA 4KNDA 1OE8A 3IC4A 4MJCA 3SBCA 4JRRA 4EDZA 1G7OA 2X8GA 2O87A 19GSA 3HY2A 18GSA 1AXDA 5DCHA 6GSWA 2FHEA 3ZFLA 3FYGA 4DSSA 2WCIA 4QL7A 4JR4A 3RDWA 1QK8A 3TOUA 3ZIJA 4E8HA 4BPYA 5HR3A 2M80A 4ID0A 2QKEA 2BJXA 2H73A 2D2ZA 1A2MA 1SD9A 2OE0A 2PU9C 1GLQA 2IMDA 4NWYA 2V1MA 5COHA 4HQZA 4ZXGA 2B1KA 4AF2A 1GTUA 2PVOC 4QQ7A 3BCKA 3KMNA 5G30A 4KE3A 1J08A 3LXZA 1GWCA 3C1RA 5A5KA 3GX8A 4IN0A 3S9FA 3QAVA 5KN2A 3TJJA 2HZEA 4MMMA 3VWUA 1IYHA 2H74A 2FY6A 4GCIA 2PUKC 1Z7PA 2I1UA 2YNXA 1K3OA 2FD3A 3H4KA 4G19A 3EE2A 3QOUA 2RM6A 4K0NA 2N5AA 4NXIA 1TU8A 4V2LA 3VI7A 4TOPA 1ABAA 5B8BA 1GLPA 2ZCTA 1K0DA 2YZHA 3FR6A 1B8XA 3IHQA 4HI7A 1NM3A 1SK1A 1WE0A 3UVTA 4XS4A 5H5QA 3ZMKA 1R5AA 3EMPA 5ECLB 1SENA 4RI7A 4AGSA 2XBIA 2I9HA 3GKNA 5AGYA 3UMAA 3Q74A 2ZNMA 4O92A 5HR1A 1THXA 4TXVA 1A24A 4POLA 2LNSA 3QCPA 4IBPA 2VLTA 5FHIA 4GTUA 3MAKA 4ZBDA 1YQ1A 5IMDA 2AUVA 4V2MA 1WMJA 4ECJA 1K0CA 2IJYA 1PSQA 1DUGA 1KEBA 4K6XA 5C04A 2H30A 5F06A 3FY7A 3F3QA 3G7JA 2VAFA 2VM2A 4F82A 3LQ7A 3VK9A 5KN3A 2L4QA 3E9JB 1BYEA 2PERA 2DJ0A 4ZL9A 1DE1A 1MD3A 3P7XA 2B5EA 3IAS2 4WXTA 1F2EA 5ECHB 5FWGA 4EUYA 3E0UA 4ML1A 1HQOA 2B7JA 5ABRA 2R6KA 4HQSA 3GL5A 2GQLA 2C3NA 3A2XA 2X8HA 3TKRA 2C0FA 3QAWA 5J41A 2GSRA 2VL2A 1VF2A 3CSJA 2M72A 5EPFA 1VGLA 5KN0A 2GQMA 3BJ5A 3TJBA 4I97A 1XOBA 2DIZA 4TXOB 1M2BA 2H71A 3KTLA 5HR0A 2CQ9A 5CNWA 4RQRA 3ZTLA 1TW9A 2L4CA 4ZB9A 4K0GA 3CRUA 4J2FA 4WR5A 5G1LA 4ZBAA 5DAKA 4PQHA 1SK2A 5B6MA 5LCZA 1S3CA 5ECKB 1TU7A 3DVXA 3FZ5A 4GSSA 2KHPA 1YZXA 3G7YA 5CRGA 1BJXA 3EC3A 5INYA 4MZBA 3M9KA 3G7IA 3CTGA 3TRXA 5DJMA 1RK4A 1PQNA 2MMOA 3F4RA 3EU4A 2C1YA 2F3MA 1A2LA 2LRNA 2LV3A 5HR2A 3FEUA 3KEBA 3Q6OA 4KB3A 5ECSA 2VD0A 3L0HA 5CAXA 1PKZA 5J3RA 1ZZYA 3KXOA 3D5JA 3DXBA 4IP6A 5JCGA 1YJ6A 2LQOA 2IWTA 4LL1B 3GNJA 1QMVA 1FB6A 3GH6A 4H86A 5EVOA 3FR9A 4IJ3A 2H1GA 1I9DA 5E4WA 3P8WA 5A4VA 2VCZA 2VL3A 2HYXA 4K7OA 2CVKA 4WKWA 1XWKA 2N5BA 4WETA 3FK8A 4BVYA 2H6YA 2CX3A 1XBSA 2YPMA 3Q18A 1A8YA 3P2AA 2ALBA 4PNFA 2IIYA 2IFQB 4BWSA 5HFIA 2REMA 4IKHA 5ECOB 2RUEA 3ERFA 3GKXA 2DJ3A 4NV2A 1O7UA 5AN1A 4DSRA 2H66A 2DJKA 4WF5A 2H75A 3RHBA 4ML6A 4WBRD 4X1UA 2CV4A 3LJRA 5J9CA 2EIQA 4KA0A 1ZMAA 4DSSB 6GSUA 3UOMA 5DCGA 1KNGA 4ZB8A 1WPIA 2DMLA 1EV4A 5KN1A 1SYXA 1QQ2A 3CTFA 4L0UA 4TR4A 2VM1A 3D22A 4GQFA 3F8UA 3LEFA 4XHMA 4N11A 1JZWA 2HRNA 4PX1A 5HFGA 1KBNA 5IPHA 2DSAA 1HD2A 1NW2A 1C72A 3FZAA 2GT5A 2K6VA 1JFUA 2YV9A 4PQIA 5H5RA 3APOA 1SL2B 4KSMA 1M9BA 2B5XA 4GSNA 4AJ7A 4MA9A 4FO5A 1URMA 1O73A 4F0CA 5IMAA 3IV4A 3GMFA 4NHWA 2C4JA 2B7KA 5IMCA 2J9HA 2HZEB 3TRPA 4N0VA 1Z9HA 2XHFA 1GULA 3EURA 3H8QA 1T7PB 1LJRA 3L9SA 5CO3A 4F9ZA 2LJAA 5D9WA 4IW9A 2LS5A 4HJMA 2OJLA 2HNLA 3DGQA 1SKRB 2H70A 5JCUA 5C00A 1T00A 3W8JA 1FW1A 2FGXA 1TI1A 16GSA 2YZUA 2WDUA 5GZZB 1WRYA 4EO3A 2R37A 4I6XA 2O8VB 2ON7A 1UN2A 4FIWA 2HI7A 4BL7A 4OFNA 2ZUPA 4OMVA 3NIVA 6GSXA 2I81A 17GSA 1AW9A 3VLNA 2XPDA 1I5GA 3KTBA 2L5OA 2JSYA 3VWWA 5DQSA 2GZPA 1JZOA 1OC9A 2A4VA 4KDUA 5D73A 3HJPA 5GSTA 1A0RP 2LQQA 2DMMA 3I43A 3CSIA 5CRDA 4I5QA 1SJIA 5H5SA 5ECNB 4JU5A 4TW5A 3ZVJA 2P5RA 3V1WA 1X9MB 4OD7A 2GSTA 3OR5A 1SU9A 1XWGA 2YWIA 4N10A 5D9VA 1H4OA 1GNWA 1QXHA 2YV7A 5L71A 1EV9A 3EINA 3M0FA 3D21A 3TKPA 1N2AA 3IOSA 1PL1A 4I8BA 3APQA 3U6VA 2KP1A 1ERWA 3F63A 3GKKA 2C3QA 4XIHA 5ECRB 3ME7A 4L5LA 4MZCA 2JADA 2MMZA 3DIEA 4ZL8A 2O89A 1Q98A 1X5EA 1WOUA 1FB0A 3E3EA 2VCWA 4MJEA 2E0QA 3TKSA 3O6TA 3TKSE 2TRCP 1GSFA 4EKZA 1YKAA 4GLTA 4KSOA 2FWGA 4MP4A 4XRDA 1PD21 2RLIA 3ZZXA 1B9YC 1SD8A 5F07A 3DWVA 3GTUA 1A0FA 1K0AA 4MH3A 2XC2A 3QFBC 1HYUA 1PRXA 4KAEA 3TUEA 1OYJA 2PN8A 1ERTA 2L6CA 3MNGA 4HUAA 3IK7A 2QGVA 3HZ4A 3VFIA 2LTKA 1J9BA 4P3YB 5ECMB 2H19A 1CQGA 1XCCA 1SL1B 4OCEA 3C73A 3HZ8A 2B1LA 4XRAA 4YQUA 2GSQA 1YEXA 3IBHA 4OFMA 1F3BA 1ML6A 1RW1A 4EE0A 2GLRA 5GAPD 1K0MA 2DLXA 1ZCPA 4ZIJA 4EXJA 1TRVA 3ZLPA 3G9BA 4E8EA 4NV5A 2HSYA 1AUCA 3ERWA 3KZQA 3N5OA 4DVCA 4IJIA 1XWBA 3J7Yb 4TR0A 1O6JA 2X99A 4OWYA 1B9XC 1SJ6A 3TDGA 3W8SA 3ZMLA 2K18A 1TOFA 4GWRA 3CRTA 2JZSA 5CRWA 4DSQA 1X9SB 1UC7A 2V6OA 3LGCA 2O7KA 2E2MA 3UAPA 3ZVJD 4JE1A 1TK8B 1PX6A 4IVFA 4OCFA 1WP0A 2FNOA 2TRXA 2PBJA 1EWXA 4V1Ag 1K0OA 2HFDA 2HLSA 3CMIA 5AISA 3APSA 5ENUA 3M8NA 3F4TA 1DE2A 2AV4A 3SWLA 1EZKA 2VL2C 4X43A 4GRFA 4POMA 3ZITA 2ES7A 1GP1A 3LSZA 1GUKA 3FZ4A 2CAIA 5IMVA 2OKAA 1EP7A 4RUVA 4BVXA 3DVWA 5EY6A 4J57E 2FWEA 3LG6A 2DBCA 3C71A 3KD0A 2KUCA 5FT3A 1E6BA 3KJYA 4XS1A 2EC4A 5IM9A 4TR3A 4WEYA 3LORA 3PH9A 4TRXA 3HYPA 3KMOA 2L59A 2OE3A 5JWQB 3CXGA 1K3YA 1N8JA 4MF7A 5J5NA 2V6KA 2OACA 2V41A 1A23A 1T1VA 1JZRA 1M99A 1R5PA 4BWQA 3D0ZA 3F9UA 3TRQA 2IPAA 7GSSA 1Z7RA 1X9WB 2C8UA 1GSQA 4IS0A 4EL1A 4N30A 3UBLA 2JZTA 3RPPA 2VLUA 5D96A 5G2ZA 2G2QA 3A2WA 3ZYWA 4KCAA 2WB9A 3HA9A 4YAVA 1Z6NA 1WJKA 2AB6A 3UIWA 3KGKA 1M9AA 3NOFA 2BMXA 1MDJA 1AIUA 6GSSA 1TK5B 3RAZA 2H1AA 2I4AA 3EMXA 2FLSA 2OADA 4POKA 4BA7A 3IK9A 3LXTA 2WFCA 4IQAA 4XS6A 1ZL9A 2GSSA 4OO5A 5ELAA 2K8SA 3HXSA 1B4QA 1VF4A 5IMFA 4TR1B 2O85A 2IMIA 4YQVA 4K7NA 5JWRB 1U6TA 4YAPA 5A4UA 5IO2A 1M7TA 4ISDA 4O32A 5CYYA 2WJUA 4L0WA 3GKMA 2VCTA 20GSA 2LEGA 4G2EA 1UVZA 5CREA 1U3IA 4TVEA 2DIYA 3D4MA 4J56E 2GZYA 2NVLA 3TCOA 1R26A 4V2NA 1PL2A 3UL3A 1OC9B 5DVBA 1TP9A 1WIKA 3FKFA 2VIMA 3EWLA 3TGZA 2BTOT 2H0HA 4OO4A 3HVSA 3DMLA 1FVKA 5GSSA 3MDKA 2FA8A 1SK0A 2YN1A 1NSWA 2TIRA 5IO0A 2H8LA 2IMEA 1FAAA 4F0BA 5LNKe 4RI6A 4ACSA 1TDIA 1Y6EA 1H75A 3WGXA 2NPBA 3C7MA 4KCEA 1GSUA 3LYKA 3L78A 3UARA 1TTZA 3TOTA 2YWNA 1XVQA 2EIRA 4G10A 3VI5A 3VPTA 2VD1A 3UBKA 2C3TA 3R2QA 1AAZA 1JLVA 4GSTA 1TK0B 1TI3A 2WULA 1OAZA 3CBUA 2YP6A 3F6FA 3IXRA 2B6MA 3KCMA 5D9TA 4I2TA 2E2GA 4MDCA 3A3TA 1SKSB 4NAXA 5HQPA 1TJDA 1WWJA 5F05A 2MBSA 1G6WA 1GTAA 3KP9A 5HFKA 2MMNA 1AQXA 2X8CA 2H1DA 2H76A 4HZ4A 2PGTA 2YWMA 3IA1A 2OBIA 4KH7A 3GTUB 4K9ZA 2H01A 1JZDA 1V58A 1YKCA 2X64A 3EYTA 3HHVA 1R7HA 3KH7A 1GSDA 1TRWA 6GSVA 1XOAA 4WF4A 3C8EA 3ERGA 2AAWA 2IN3A 4N0ZA 1HNBA 1USBA 2C0DA 5LD0A 3M3MA 1F37A 5DDLA 1OC8A 2P31A 1O85A 2CVDA 3I6AA 2YJ7A 3K8NA 4HOJA 4CDOA 4LMVA 3TJKA 4EF0A 4HU9A 3QAGA 2YANA 4WR4A 5G31A 4FYBA 4GF0A 4EDYA 11GSA 4HJ2A 2F8AA 4IGJA 4AJ6A 1XXUA 5ID2A 2GVPA 2IL3A 4ZBBA 1R4WA 5D93A 2AYTA 1K3LA 4K2DA 2GTUA 3BBYA 4KUNA 4MF6A 4F03A 2G0FA 2HE3A 4KDXA 2Z9SA 2LNTA 3H1NA 1BQ7A 6GSTA 5D9XA 2H0IA 1TXXA 4XS4B 4D73A 1U87A 4G9HA 1V40A 5DBQA 2CAQA 1J0FA 1XZOA 1B48A 5ECPB 3GUSA 1XPVA 1V57A 5IMZA 2VOCA 1DSBA 5B8AA 4Z7XA 4MK3A 3ZL5A 1U88A 2XBQA 2VCXA 2L5LA 5D8IA 3TKQA 3GL3A 3HCZA 4MZWA 1GH2A 3DRNA 3TKSC 1THOA 1W89A 5IQYA 2YJHA 2IMKA 3TB2A 3HVVA 2HSHA 2FWFA 3GV1A 5KEJA 4TN8A 2CVBA 4K1FA 4TKYA 2DJ1A 1M0UA 1LU4A 3ISOA 2JU5A 2WZ9A 2L57A 3FHKA 1T8EB 2C0GA 1B4PA 2GZZA 2H1BA 5ECIB 3WT2A 2AHEA 1XW5A 3GSTA 2IFQA 3PINA 5EL8A 4Q5FA 1GSEA 2RM5A 3ZIVA 1OE7A 3GURA 4GQCA 3H79A 3VWVA 5CP1A 2MYGA 2A2RA 2QSIA 1GRXA 5A4WA 3H93A 4MJBA 4I2UA 2DJJA 4IHUA 2B3SA 4LMWA 4Q5NA 4K7IA 3KIJA 5IOXA 1LBKA 2R5GA 2KOKA 9GSSA 8GSSA 2RIIA 4MABA 5DAKB 5IIZA 4L8EA 1SYRA 2OBKA 3A5WA 4HEA2 5JCWA 3QFAC 1VF1A 2LJKA 2WS2A 3KH9A 3EVIA 4LLRA 1FG4A 2V32A 3DEXA 4WBJA 3VPQA 1E2YA 2GS3A 1ILOA 4HZ2A 2VLVA 3CSHA 3WGDA 1UA5A 4EVMA 3Q19A 3DYRA 2FUG2 2FA4A 4KX4A 4FH8A 4ZB6A 4NHZA 1TRSA 1A8LA 1G0TA 3D6IA 3A2VA 2FCHA 2YOIA 4JZQA 4PUAA 2HT9A 3F4SA 2KLXA 1V98A 5DALA 1Z5YE 3HJOA 3GSSA 5G5EA 4DEJA 1PMTA 5IOWA 4O7HA 1DBYA 2VUPA 3FRCA 4MJAA 2C0EA 4IELA 1PN9A 3F3RA 5ELGA 10GSA 3RPNA 3DD3A 3QR6A 3GX0A 2JSZA 2IMFA 5F8BA 4ZILA 3RBTA 4MLYA 1XWAA 2R3XA 2AJQB 4FYCA 1GNEA 3WYWA 4YQMA 1OKTA 1Y25A 3J7Yk 4ECBA 1YY7A 4XTSA 1MTCA 3HD5A 4PQ1A 1ACVA 2NDOA 3UVHA 3GN3A 4LA1A 1G7EA 3GYKA 1PKWA 1QUWA 4KW6A 2ON5A 3AY8A 4L5OA 1OKDA 1JLWA 3N9JA 3UJ1A 1Q4JA 1ZYEA 4MF5A 4ECCA 1S3DA 1HNCA 3QDNA 2PMTA 1M2AA 4KGIA 3IAM2 3QPMA 1EEJA 2R2JA 4HU7A 3M1GA 1GUHA 1VRSD 2LRCA 4NPBA 3GH9A 2E7PA 2H0GA 1A2JA 3IR4A 1FHEA 5GAND 4FYUA 1YDKA 2V2GA 3W6GA 1TKDB 3I69A 3P90A 4PGTA 1F6MC 3RHCA 1Z3EA 1PA3A 3GFKA 2LJRA 1GTIA 2NBSA 3QMXA 4Q5RA 2N5FA 1FOVA 2OE1A 2LRTA 4HS1A 3L9VA 6GSYA 2QC7A 1XVWA 1MD4A 1T4ZA 3I9V2 2C80A 2I3YA 1ERVA 2H6ZA 1AQVA 2MMAA 4OFTA 1BX9A 1VF3A 1X5CA 2FWHA 5ID2B 5JWOB 1V9WA 3DKSA 1O81A 3PGTA 5AIXA 1SJZA 1KTEA 22GSA 2JACA 1W4VA 1XFLA 2GGTA 2XPEA 5DQYA 2OA7A 4JBBA 4RQXA 3MSZA 4D73B 2B5YA 2GQKA 4MPFA 1XW9A 4HDEA 4F2IA 3GA4A 3LYPA 3JCML 3HDCA 2HXKA 1SL0B 2CZ2A 3F0IA 1Z6MA 4EC0A 2F51A 2LKUA 2PVQA 3LFLA 3NZNA 3MWHA 4K8MA 3QD9A 1ST9A 2K8VA 4ULXA 2VCQA 2YCDA 4MCUA 4V1Ap 3US3A 1AC1A 2F9SA 3WGEA 3BOAA 5CRHA 2L6DA 2DJ2A 1ZOFA 3BD2A 4CHSA 3ZREA 1U3AA 2R4VA 2HZFA 4Q5QA 2GDRA 3IDVA 4IP1A 3UEMA 1HNAA 3FR3A 1O8WA 1X5DA 1GTBA 2CZ3A 3KP8A 4YH2A 3L4NA 1MDKA 2VO4A 5ECQB 4JEDA 1YF0A 4ILFA 2CT6A 3IRAA 2CA8A 3ME8A 1F3AA 2KP2A 1SKWB 1ON4A 2VL9A 1O8XA 1IYIA 3IPZA 2CX4A 3O76A 3M9JA 4ECIA 4PNGA 3WD6A 1QGVA 4MPGA 5AIVA 5IPGA 2J23A 2WRTA 2JZRA 3C1SA 1BEDA 2LUSA 4IQ1A 1CQHA 3ZFBA 1BAYA 1PGTA 1ZYQB 1S3AA 1BG5A 1AQWA 2P0GA 12GSA 3EU3A 4LL4B 2F8FA 1EOHA 1FVJA 1EEMA 1RQMA 3HVXA 1G6YA 1MEKA 3HKRA 4GXZA 1EGOA 4TXOA 5G1KA 1XIYA 3LWAA 2DC5A 1NHOA 1NHYA 2MZCA 1GSYA 2YWOA 4X0XA 2M46A 1GSSA 1T3BA 3ZRDA 3BCIA 5J9BA 1XW6A 4O5RA 1YEPA 1QFNA 1PX7A 3CYNA 1XWCA 2HRFA 2PPTA 2EIOA 3ED3A 2JL4A 1ZGNA 3PR8A 1MDIA 1GUMA 5B6NA 3HJMA 4KDYA 1K0BA 3O3TA 4MH2A 1M2DA 5E59A 5DJLA 4AJ8A 2VCVA 3L9UA 1EOGA 2GT6A 4XCSA 3TJGA 5DALB 3VURA 3IE3A 4ZL7A 4TR1A 2K9FA 4CW9A 1K0NA 5J4UA 1X0RA 4POBA 3TJFA 2WGRA 2RUFA 5G5FA 4PUFC 3U5RE 3FW2A 5F0GA 2H6XA 1JHBA 2LSTA 13GSA 3GHAA 2P5QA 4PXOA 5B7CA 3D4TA 1ERUA 1V2AA 2A2SA 3VWXA 1EGRA 3GIXA 1T4YA 3F6DA 3WT1A 14GSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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