5JWRB

Crystal structure of foldswitch-stabilized kaib in complex with the n-terminal ci domain of kaic and a dimer of kaia c-terminal domains from thermosynechococcus elongatus
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
89
structure length
89
Chain Sequence
KTAVLKLYVAGNTPNSVRALKTLNNILEKEFKGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLAKVLPPPVRRIIGDLSNREKVLIALRLLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of the day-night transition in a bacterial circadian clock.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Circadian clock protein kinase KaiC
molecule tags Transcription regulator
source organism Thermosynechococcus elongatus
total genus 25
structure length 89
sequence length 89
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jwrB00
3GYKA 3WGDA 5ABRA 4MH2A 4PQIA 5A5KA 1MDIA 1TDIA 4NXIA 4RI6A 1SK0A 5B7CA 3ZVJA 4PGTA 2EIOA 1ERUA 1K0OA 20GSA 2WJUA 4IQAA 1JZRA 1SL1B 5INYA 4NPBA 3H8QA 3ZMLA 3EU4A 3IRAA 4HEA2 1ST9A 2G2QA 2NVLA 4XRDA 3ZREA 5A4UA 1Y25A 3ZLPA 3DD3A 4IS0A 2RM6A 3PINA 2ZUPA 3E0UA 1GTBA 3BBYA 2YV7A 2H70A 4OD7A 4PQ1A 2GVPA 1MD3A 1X9SB 1T3BA 2WDUA 2LTKA 2PPTA 1N2AA 1GNEA 3DYRA 2VL2C 2K8VA 2VCZA 4HS1A 3SWLA 1XPVA 2F3MA 17GSA 2DBCA 1TRVA 1U3AA 2OBKA 3W6GA 3P2AA 4GF0A 2H1GA 5KN2A 5IO2A 1XOAA 3LSZA 1B9XC 5F8BA 3FW2A 3US3A 5GZZB 4BA7A 5CNWA 4GQCA 2IFQB 1A0RP 2CZ2A 3Q18A 2L6DA 2LRTA 3L4NA 4I5QA 3MAKA 3DIEA 3MDKA 2B7JA 2H6XA 1ML6A 4ECJA 4OO4A 1M2AA 1B4QA 1HNAA 2CX4A 3UARA 2J23A 2DJ2A 2B5YA 3GA4A 4X0XA 4V1Ag 3KCMA 3EINA 5IMCA 2DJJA 3LGCA 2PN8A 1O8XA 2GSSA 5DJMA 1O85A 4MJBA 3QPMA 4HQZA 2YP6A 4XTSA 4MCUA 1A2MA 3EE2A 3NOFA 3ERWA 3VWXA 2ON7A 5J9BA 4KGIA 1ZMAA 3IA1A 5D8IA 2YWOA 3KEBA 1TU8A 4MF6A 5ID2A 2DIZA 1Q4JA 2OADA 1BG5A 4EF0A 3D4TA 2RIIA 3U6VA 1O7UA 3TKSE 4Q5NA 1XVWA 1YY7A 4KDYA 4TR0A 4LMWA 2FCHA 4ZXGA 3M0FA 2VD0A 1Z5YE 4NV2A 4L5LA 4DSQA 5CRGA 3RHBA 1XWKA 3G7IA 4J2FA 2JZTA 5F07A 3TDGA 2VLUA 5JCWA 1X9MB 3DXBA 1WRYA 3QDNA 1SL0B 2C4JA 1RK4A 1GRXA 3L9UA 2CA8A 4IKHA 3IOSA 2JU5A 3W8SA 2IMKA 4IJIA 2OBIA 1XW6A 3VURA 1T4YA 5JWRB 4HQSA 2ON5A 2ZCTA 1SD9A 3GKMA 2F51A 1GSQA 2YCDA 1WE0A 1O73A 3TJKA 4LMVA 4PNGA 5DJLA 5IMZA 3IV4A 3GTUA 3VFIA 4YQVA 4ILFA 4OO5A 5HFGA 2DJ1A 5AGYA 4BL7A 5D73A 1H75A 4HDEA 3IC4A 2BTOT 2FWGA 1KTEA 4DEJA 5IOWA 1MD4A 2HRNA 4KB3A 1T8EB 5ELAA 3E9JB 4EUYA 1DSBA 1ERTA 5ELGA 3QOUA 1NHOA 2EIQA 3HD5A 1EP7A 3FR6A 4PQHA 3GUSA 4MF7A 4LA1A 3NIVA 5B8AA 1GUHA 3F9UA 5AIXA 2KOKA 1OKDA 2R4VA 3G9BA 4ID0A 5DVBA 4WF5A 1UVZA 1K3OA 3KMOA 4L5OA 1XBSA 1YJ6A 3MSZA 4HU9A 5A4VA 2O85A 3ZTLA 4D73A 1ZGNA 2IWTA 4FYBA 2HZEB 1LU4A 1USBA 1WOUA 4MJEA 3UIWA 3EMPA 3SBCA 4XS4A 4HZ2A 1XCCA 4DVCA 5EPFA 5HFIA 1TW9A 5IMVA 2H66A 4GWRA 4MMMA 1EGOA 1LBKA 1OC9A 2YWMA 4KW6A 1OYJA 1JFUA 2IJYA 3RAZA 3VWUA 4HOJA 5JWOB 3ME8A 5CAXA 1R26A 3HVSA 4K7IA 2M80A 3FZ4A 1QFNA 3A2XA 1OVNA 2XC2A 3A3TA 4EL1A 1Z3EA 1ZL9A 1QK8A 3GKNA 4KAEA 1XWGA 4GRFA 4GXZA 4F82A 2TIRA 3VK9A 1GSUA 4ECCA 3UVHA 5GSSA 3KMNA 1XVQA 2PU9C 2JZRA 1JZWA 1T00A 3E3EA 1XFLA 1PKWA 4MPGA 2XPEA 3TJGA 3GNJA 4PUAA 3IPZA 4TN8A 4MA9A 4JU5A 2C3NA 4KCEA 3KP8A 1A23A 4V1Ap 3D22A 5D9VA 1V9WA 2V1MA 3O76A 2PWJA 2LRCA 1GSFA 1FB6A 4RQXA 3LEFA 3AY8A 3GN3A 3HYPA 4IJ3A 2EIRA 2E7PA 4NMUA 4MZCA 5D93A 4G10A 1ABAA 1ON4A 1XWAA 3DWVA 2I1UA 3G7JA 2CX3A 1C72A 3U5RE 3IBHA 1W89A 2VM1A 2J9HA 2VCTA 2X8CA 2PERA 4LL4B 5ENUA 3TB2A 2LQOA 4FH8A 3TRQA 2C0DA 3P8WA 3RBTA 11GSA 5IMFA 1PA3A 3FR3A 2CQ9A 4JR4A 2C0EA 1G6YA 2HT9A 4I6XA 4N11A 2HZFA 3CTFA 4ZIJA 1FHEA 3TOTA 2FWHA 4MJAA 4F03A 3DMLA 4YQMA 1BYEA 4NV5A 4TW5A 1ERWA 1FAAA 2H0GA 3TKSA 1S3AA 5G31A 1OAZA 2AYTA 4KUNA 4XHMA 1TU7A 2IL3A 1F3AA 2B6MA 1PMTA 3L9SA 2F8FA 3GL5A 3IHQA 2L57A 4TXOA 1YF0A 1GSSA 3P7XA 4POBA 2GZYA 2O89A 4JE1A 1EP8A 2LJKA 3TGZA 3LJRA 1AQXA 1THXA 1ILOA 4O7HA 5DDLA 2C3TA 4L0WA 4BWQA 1EEJA 2B1KA 3HA9A 2EC4A 2WZ9A 2A2RA 1S3CA 1URMA 1YKAA 5L71A 1VF2A 3HDCA 2H0IA 3ZFBA 3C73A 1A8YA 1X5EA 2R3XA 4TXVA 2B5XA 3IK9A 3CYNA 3LXZA 2GGTA 1EEMA 3QAWA 1V58A 2YWIA 1FB0A 1BQ7A 5C04A 4TKYA 2WRTA 3L0HA 3FK8A 5EY6A 4CHSA 4KDXA 4XS1A 4XRAA 3GKKA 1SKWB 1F2EA 5KN0A 4MZBA 2KLXA 4IELA 5AISA 5F0GA 1BJXA 3CBUA 3LG6A 4X1UA 2V6KA 4MJCA 4GLTA 2X8GA 2YNXA 3NZNA 3M9KA 5ECPB 2H76A 1X5CA 3TRXA 2JSYA 4LL1B 4POKA 2WS2A 4F2IA 3A5WA 2ZNMA 1J08A 3WYWA 3DVWA 4JRRA 4TVEA 1IYHA 2VM2A 4O92A 1MEKA 4I2TA 5E59A 2YZUA 5LCZA 1QGVA 4K7OA 4MP4A 3IR4A 3ZRDA 3IE3A 3LWAA 4BVYA 1ERVA 4KSOA 4FIWA 5FWGA 3ZMKA 3BCIA 1R5PA 2MBTA 5ECMB 2H1DA 1H4OA 3APOA 4HJMA 5J5NA 3KH9A 2C8UA 3EURA 2OE1A 2DJ3A 4ML1A 3FRCA 4QQ7A 3VI5A 3KGKA 3LYKA 1YF1A 3UOMA 5F05A 2QSIA 4IGJA 3TKQA 14GSA 3IK7A 2K9FA 5CYYA 4NHWA 3FEUA 4MF5A 1NSWA 1PD21 3Q74A 5B6MA 4ZB9A 1DE1A 1TK5B 3TJBA 5ECKB 3TOUA 6GSTA 2HNLA 3PH9A 4I97A 3HHVA 5H5QA 1A0FA 2B5EA 1TK8B 2ALBA 1XW9A 3CRUA 4TR3A 5HFKA 2LS5A 1BEDA 3Q6OA 1AXDA 3UL3A 2O8VB 5ID2B 2VCQA 1Q98A 4JBBA 5DCHA 4V2LA 13GSA 2H74A 2HE3A 3HVXA 1M2DA 2QGVA 1EV9A 4PXOA 4HJ2A 2HSYA 1ZCPA 1LJRA 4IP6A 2HXKA 4DSSA 4I8BA 2YOIA 2BJXA 4RQRA 2GT6A 1PX7A 3UJ1A 5J9CA 1X9WB 3CSIA 3EMXA 2NDOA 3CRTA 1TK0B 2CAIA 5HR2A 4CW9A 2JACA 3TKRA 1G7OA 1TXXA 2F8AA 4RI7A 3RPNA 2LNTA 1NM3A 2E2MA 2OA7A 5ECLB 1SD8A 5IMDA 2D2ZA 2LUSA 3W8JA 4MDCA 4ZBAA 9GSSA 4MH3A 1DBYA 1T1VA 1NW2A 4X43A 2GT5A 3HXSA 1KNGA 1OE8A 2RM5A 1TOFA 2L59A 1BAYA 4IN0A 2N5AA 2H01A 1MDJA 2I9HA 3HJOA 1F6MC 4GQFA 1A2LA 4KCAA 2FY6A 5A4WA 4EXJA 1YDKA 1FG4A 3ZZXA 2GTUA 2L4QA 1WIKA 2R6KA 1PRXA 1JZDA 2H75A 5EL8A 6GSUA 4ZL8A 3BOAA 3GH6A 3F4SA 4ISDA 2ES7A 4AJ8A 3GSTA 3GFKA 5ECQB 1IYIA 10GSA 2NBSA 4V2MA 1M99A 3GTUB 1A24A 1K0CA 1SKRB 5COHA 2P5QA 4ZB6A 4N0ZA 3FHKA 1GSEA 2R5GA 4G19A 5JCUA 1PQNA 4H86A 1TKDB 3J7Yb 3GSSA 2GS3A 1XXUA 1VF4A 4J56E 3FY7A 2X8HA 5GAND 1NHYA 4TRXA 2GSTA 1GUKA 5D9WA 1PL1A 3QCPA 1AIUA 5DAKA 4KDUA 1K0MA 3HZ4A 3KD0A 4K7NA 1CQGA 4IHUA 4ECBA 4ZL7A 1K0NA 5ECSA 2YJ7A 2AUVA 5ECRB 1CQHA 4E8EA 3ZIVA 1XW5A 2DIYA 2JADA 3KM6A 5J4UA 3PGTA 2VO4A 5ECNB 3L78A 2K8SA 2V6OA 2XPDA 4D73B 1YEPA 4JEDA 1SJ6A 2A2SA 2VAFA 2NTOA 3D21A 4OCEA 4XS4B 1JZOA 3QMXA 4XIHA 5E4WA 2TRCP 1G7EA 4WKWA 4NHZA 3A2WA 2FA8A 2V2GA 3I6AA 5IMAA 4TR1A 3KTBA 3HZ8A 1UC7A 4BVXA 5ECHB 5HR3A 1E2YA 4K9ZA 1OC9B 2M46A 2LRNA 2VL2A 1M2BA 2R2JA 1T7PB 1U3IA 4EDYA 1W4VA 1GTIA 2PUKC 4K1FA 2VL9A 2LJRA 5LD0A 1SYRA 2VCXA 4FYCA 2QKEA 4YH2A 3PR8A 1FVJA 3QFBC 5KN1A 3CXGA 2K18A 2H72A 3D6IA 2OACA 2MZCA 1VF1A 2NPBA 4FO5A 2JSZA 2DMLA 1M9BA 1WWJA 2C0GA 3M8NA 4HUAA 3QR6A 2N5FA 2YWNA 3GIXA 2MMZA 2FUG2 3FYGA 3K8NA 4Z7XA 2MMAA 1QMVA 2RLIA 1VF3A 4K0GA 5C00A 4YAVA 4BWSA 1X5DA 2H73A 2L5LA 4PX1A 5DALA 3Q19A 3IAS2 4ZB8A 3F63A 5H5SA 3KTLA 3F3QA 1TJDA 4FYUA 4ZBDA 1YQ1A 3LXTA 2JL4A 1SJIA 3C1RA 3ZIJA 2P31A 3GH9A 4J57E 2GSRA 1I5GA 3GHAA 3C8EA 3RPPA 2H1AA 4WEYA 3ZITA 1J0FA 2O87A 1TI3A 2VOCA 3DRNA 1K3YA 1M0UA 3G7YA 6GSVA 1ZYQB 1RW1A 4GSTA 2GZPA 1WMJA 2VD1A 2IPAA 3F0IA 4N0VA 4KH7A 5CRWA 4OFMA 1B9YC 1SK2A 2PMTA 3UBLA 4KNDA 4GTUA 3UMAA 1OE7A 5DBQA 4N10A 2X64A 2OE3A 3DGQA 3VWWA 2DLXA 1QUWA 1SKSB 6GSXA 2WGRA 1Z6MA 1EZKA 1TRWA 4JZQA 1FVKA 1TRSA 2V41A 1HD2A 3S9FA 1PSQA 5J41A 2VCWA 2WULA 4MZWA 5JCGA 3DEXA 4HZ4A 5CP1A 3CSJA 3ZVJD 1DE2A 2C80A 2LQQA 3EVIA 4EE0A 2GQKA 5AIVA 5IQYA 5G1LA 5HR1A 4TXOB 5G2ZA 2H19A 3D4MA 2B7KA 1GTAA 2VLTA 3GMFA 5ECIB 2DC5A 6GSWA 4O5RA 2H0HA 2OJLA 3BD2A 2M72A 1V40A 3DKSA 4WETA 4WBRD 4QL9A 5J3RA 4YAPA 1SJZA 4ZILA 1GL8A 2WCIA 1O6JA 4QL7A 1N8JA 2HRFA 1GLQA 2FA4A 4K6XA 4NWYA 5IIZA 1GH2A 5G5FA 5LNKe 1MDKA 2IN3A 4KX4A 4NAXA 1ACVA 1B4PA 2KP2A 2JZSA 1AUCA 2I3YA 4WR4A 1EGRA 1K3LA 1ZOFA 4HI7A 1SU9A 5H5RA 1XWBA 3QAGA 1K0DA 1SL2B 2DMMA 3GRXA 1XIYA 4GSNA 2PGTA 2GDRA 3TKPA 2IFQA 4OFNA 2F9SA 5G30A 5IO0A 2H71A 4PUFC 1TP9A 4EO3A 4AJ7A 4F9ZA 1O8WA 2XBIA 4POMA 1XOBA 3VWVA 1OC3A 4ML6A 3GL3A 2HSHA 2LV3A 5B8BA 3C1SA 1OC8A 1RQMA 2BMXA 4OFTA 4AGSA 1XWCA 1ZZYA 1TTZA 3LORA 3MNGA 4POLA 1TRUA 2CVKA 1QXHA 4K2DA 4WF4A 4L8EA 4EC0A 1G0TA 3D5JA 2FHEA 1PX6A 5FHIA 1HQOA 1F37A 3F3RA 3BJ5A 2MMOA 3HJMA 1YKCA 1I9DA 5D9TA 1WPIA 2AB6A 6GSSA 1VRSD 2FLSA 2CV4A 1AW9A 2PVOC 5EVOA 5CREA 3HJPA 4OCFA 3ZL5A 2KP1A 6GSYA 4GSSA 3ISOA 5DQYA 4WBJA 3F8UA 3P90A 1PN9A 2O7KA 1AQWA 5JWQB 3UEMA 3H93A 2HFDA 2MYGA 12GSA 1R5AA 3GKXA 2G0FA 3UBKA 4IBPA 2HLSA 5KEJA 1GULA 2YPMA 3KZQA 3UVTA 3F6FA 5D96A 3QAVA 3L9VA 5G1KA 3ZFLA 2RUFA 2X99A 2GQMA 4PNFA 2N5BA 4IW9A 2LSTA 1V57A 2DSAA 4GCIA 3TKSC 5CO3A 2L5OA 4EVMA 4DSSB 1WJKA 3KH7A 4IVFA 2LJAA 1PL2A 2H6YA 2YJHA 1JLWA 4KSMA 2OE0A 5GAPD 3M3MA 4IQ1A 5KN3A 2H1BA 2TRXA 1BX9A 1K0AA 3HY2A 3J7Yk 1SENA 1O81A 1GNWA 5FT3A 3EYTA 3QFAC 3H1NA 5CRDA 4KA0A 3TJJA 5IOXA 1Z6NA 2CAQA 1U87A 4MK3A 2HI7A 1GSYA 1F3BA 5DQSA 1V2AA 3TRPA 3C7MA 3GX0A 3N9JA 2AV4A 2L4CA 4HU7A 3O3TA 3VI7A 3F4TA 3R2QA 1GP1A 4MPFA 3OR5A 1M9AA 1Z9HA 1AAZA 2AJQB 3GX8A 4TR4A 3WT1A 4TOPA 1B8XA 4K8MA 3N5OA 3WGEA 2IMEA 3KP9A 3TUEA 2Z9SA 2KUCA 3ME7A 3JCML 5IM9A 1HNCA 3FR9A 4N30A 3ZYWA 2GLRA 3D0ZA 2C0FA 2I4AA 3TJFA 2DJKA 3FZAA 3H79A 5IPGA 2REMA 4DSRA 4E8HA 1EOHA 4ZBBA 2AAWA 2IMDA 2LKUA 2P0GA 3EU3A 5HR0A 2HZEA 3VPTA 1U88A 5CRHA 2PBJA 5F06A 3UAPA 2YN1A 2VUPA 3IXRA 3CTGA 1AQVA 2VLVA 3VLNA 5DAKB 3LYPA 1QQ2A 1X0RA 1EWXA 2RUEA 2IMFA 1FO5A 3H4KA 2WFCA 1Y6EA 1J9BA 2P5RA 5IPHA 1SK1A 2WB9A 2A4VA 1KBNA 5G5EA 3M1GA 2FGXA 2YANA 3O6TA 3ERFA 2FD3A 3EWLA 3ED3A 2L6CA 4JR6A 2LNSA 3APQA 3LFLA 1R7HA 3I9V2 2IIYA 3FZ5A 2CZ3A 2H6ZA 3IDVA 5DCGA 16GSA 4V2NA 4P3YB 2MMNA 4KE3A 2B1LA 2IMIA 2YV9A 3RDWA 2VIMA 22GSA 2E2GA 1KEBA 4TR1B 4ACSA 4L0UA 2DJ0A 1Z7PA 3LQ7A 4AF2A 3WGXA 1PKZA 1OKTA 1SYXA 3CMIA 1GLPA 4CDOA 5ECOB 1E6BA 3GV1A 4OMVA 3BCKA 4ECIA 3VPQA 4F0CA 2FWFA 3KIJA 3GURA 3V1WA 1Z7RA 3QD9A 2E0QA 2YZHA 2XBQA 3TCOA 1V98A 1A8LA 4EKZA 2FNOA 3FZ9A 1G6WA 4IP1A 2CVDA 4ULXA 3DVXA 5HQPA 2R37A 4ZL9A 1A2JA 1GWCA 1GTUA 2PVQA 3A2VA 3I69A 2H8LA 2VCVA 2HYXA 1THOA 2C3QA 2GSQA 3MWHA 2K6VA 1JLVA 1T4ZA 1PGTA 5DALB 2C1YA 4G2EA 4MABA 4YQUA 1R4WA 19GSA 3IAM2 2CT6A 1F9MA 2KHPA 4I2UA 3C71A 4EDZA 4XCSA 2QC7A 3WD6A 3WT2A 2V32A 3HCZA 2FWEA 3FKFA 1DUGA 1EV4A 1EOGA 4F0BA 1K0BA 2CVBA 3APSA 3EC3A 1UN2A 5AN1A 1S3DA 1B48A 4PURA 4Q5QA 1U6TA 1GSDA 2GQLA 4WXTA 3HKRA 4LLRA 2GZZA 1VGLA 3ERGA 3F4RA 4AJ6A 2OKAA 1M7TA 4G9HA 18GSA 1WP0A 1HNBA 2VL3A 3F6DA 5GSTA 4WR5A 3M9JA 1FW1A 3I43A 1AC1A 8GSSA 4BPYA 7GSSA 2XHFA 4OWYA 4K0NA 2AHEA 3CSHA 3KJYA 1YZXA 1ZYEA 2B3SA 4Q5FA 1TI1A 3HVVA 1UA5A 5D9XA 1YEXA 4XS6A 4MLYA 1XZOA 2LEGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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