5KN0A

Native bovine skeletal calsequestrin, low-ca2+ form
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
346
structure length
346
Chain Sequence
GLDFPEYDGVDRVVNVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMDELILELAAQVLEDKGVGFGMVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSVYVFKGDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDDNKLIGYFKNKDSEHYKAYEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVSFVEAHKRSTLRKLKPESMYETWEDDLDGIHIVAFAEETDPDGYEFLETLKAVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFNIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Calsequestrin
publication title Characterization of Post-Translational Modifications to Calsequestrins of Cardiac and Skeletal Muscle.
pubmed doi rcsb
total genus 96
structure length 346
sequence length 346
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn0A03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn0A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn0A02
2VCQA 2DLXA 2PVQA 4TR3A 1R5PA 4EE0A 2V41A 1GWCA 5LD0A 3UJ1A 2DIYA 1OYJA 4FIWA 2H73A 4NHWA 1O81A 3DD3A 4KDUA 1PX6A 3QAVA 4LL4B 3VWXA 4F03A 2H72A 2L4QA 2C3NA 3MNGA 4PX1A 5ECLB 1R5AA 16GSA 1AAZA 2O7KA 3TKSC 3NIVA 4GSSA 4AGSA 5B8BA 2VM2A 4ZBBA 1K0MA 3E3EA 3WD6A 3H93A 4MJCA 1E6BA 2WGRA 2CZ3A 2BTOT 2TIRA 1ABAA 5FHIA 1OC9B 1X5EA 1WPIA 2XHFA 3LSZA 4GQCA 3KTBA 5ELAA 2DMMA 1EOHA 1QUWA 4IP1A 4MDCA 3HZ4A 1SK0A 1EV9A 1NHOA 5F05A 2B5EA 2LJAA 6GSUA 5KN1A 3IHQA 2WS2A 1GTUA 2LRNA 3IA1A 5G5FA 2RIIA 1SK2A 3KP8A 1F2EA 2AYTA 3IXRA 2R4VA 1BQ7A 1TRSA 5DAKB 2AHEA 4E8EA 3GKNA 2GS3A 3FW2A 4K0NA 4N0VA 2LV3A 3VWWA 1LJRA 1B8XA 2RUEA 6GSTA 1EOGA 1G6YA 4ECBA 3QOUA 4J57E 3EU3A 3DGQA 2M72A 1HD2A 2OE3A 1OAZA 1JHBA 2HRNA 2JSYA 5CYYA 1S3DA 1MTCA 5CAXA 1T4YA 2JZTA 2H71A 2GZYA 4JR4A 1PA3A 2VL2C 2FLSA 2F8FA 4AF2A 3G7JA 4LMVA 4PNFA 5IMDA 4MF7A 2I4AA 1JFUA 5DBQA 1K0BA 1T8EB 1HYUA 5DCHA 3GRXA 2VUPA 3ZVJA 1O6JA 3FZ4A 4KW6A 3HCZA 2L6CA 2FA4A 4I6XA 2HI7A 4MLYA 1XPVA 3TKPA 5HR3A 4P3YB 4LMWA 4EF0A 2YJ7A 4CHSA 1W4VA 2O8VB 3F4RA 3HJPA 3IR4A 3LWAA 2WZ9A 4V1Ag 4L0UA 2C4JA 4X43A 3BCIA 5IOWA 3D21A 2PERA 5LNKe 2H19A 1PMTA 4IQ1A 1YJ6A 1TK8B 5H5QA 2TRCP 4O92A 1XVWA 2B7KA 2OA7A 2VCVA 1M0UA 1QK8A 2R2JA 3Q6OA 4I97A 3ISOA 2LUSA 5D8IA 3HJMA 2CZ2A 4O5RA 2ALBA 1EGOA 1CQHA 2VL2A 2NVLA 2O87A 2HNLA 2AUVA 2M46A 3HJOA 1KNGA 1O8WA 4JEDA 2DSAA 3WGDA 5KN3A 2IWTA 2MMZA 3I6AA 1AQWA 1FVJA 4MPFA 2RUFA 1PSQA 5ECKB 1X0RA 5G1KA 2R5GA 3VPTA 3J7Yk 2CAIA 1YF1A 3UVTA 6GSVA 2GT5A 3G7IA 1M9AA 2VLTA 2R37A 1HNBA 13GSA 4X0XA 1YZXA 2FNOA 4E8HA 4QQ7A 1Z5YE 3EWLA 3C71A 4OO5A 2HT9A 4YAPA 3SBCA 2B1LA 2DJ3A 4GWRA 2H1DA 1GNWA 4HZ4A 2PWJA 1Z9HA 4I5QA 4K8MA 2YJHA 2CA8A 2EC4A 1GSEA 3TJBA 4EKZA 2MMAA 3GUSA 1GTAA 3UAPA 4ISDA 3WT1A 4PQIA 4XS6A 4TVEA 4YQUA 4XTSA 4HS1A 2LKUA 1KEBA 3F6DA 1GSDA 1B9XC 4I8BA 2DJ1A 2WCIA 3J7Yb 2K9FA 3WGXA 1GP1A 1V98A 2L4CA 3DXBA 3M8NA 1EP7A 3VFIA 1GH2A 5D9WA 1SU9A 2K6VA 1XWBA 4NXIA 1B48A 2RM6A 2IN3A 4K6XA 5CNWA 5GZZB 4TXVA 4MZCA 2B1KA 1O7UA 2P5RA 2VCXA 5CO3A 1TDIA 1G0TA 1XCCA 1FG4A 1Z3EA 3D22A 4WEYA 2EIRA 4HDEA 3LORA 4NHZA 1JZDA 1SJZA 1XWGA 2V6OA 1U6TA 3L0HA 1DE1A 4KDYA 4EO3A 1V58A 2HRFA 4HQZA 2FCHA 3JCML 4XS1A 1THOA 2H01A 2MMNA 1J08A 2CAQA 1X9MB 2B3SA 5HQPA 2JSZA 2DMLA 5C04A 4GXZA 3RPPA 4NMUA 2H0HA 3US3A 1TU8A 1BAYA 2PU9C 1XW5A 4KE3A 1GTIA 3GSTA 3ZREA 5CRDA 4XRAA 5B6NA 2YV7A 5D93A 1GSYA 4DSRA 1TK5B 4WBRD 1SYRA 4LA1A 4FYBA 3M0FA 1R7HA 3EMXA 1MDJA 1E2YA 2V32A 1GUHA 1MDIA 4NAXA 4TW5A 1TI1A 1B4PA 1M2BA 2B7JA 4NV2A 3GH6A 1GTBA 3DVWA 4FH8A 1T3BA 3A5WA 1RK4A 2ES7A 2G0FA 1FVKA 5D9XA 5F06A 2K8VA 2PGTA 1DSBA 3LQ7A 3ZRDA 2R6KA 1K0CA 4POMA 4F9ZA 1HQOA 1U88A 2X8HA 1OE7A 2IMEA 4KX4A 3TKRA 1GUMA 1G6WA 2YPMA 2E2GA 1O8XA 4JRRA 2J9HA 3F3RA 3F63A 1J9BA 5HR0A 2C8UA 3I9V2 2GDRA 3IDVA 3GL5A 2CQ9A 3VI5A 1GULA 2VAFA 3BBYA 2WFCA 3CSIA 1LU4A 2HXKA 4H86A 1S3AA 5DCGA 3TRPA 5DAKA 1U3IA 5DDLA 3CRUA 4ECJA 1GNEA 2GZZA 2NDOA 1UC7A 1YDKA 1FB6A 5A5KA 6GSSA 2IPAA 2YN1A 4MH2A 3IPZA 7GSSA 2CVBA 3EMPA 2F3MA 3DKSA 4WBJA 4IGJA 1XWCA 2H8LA 2E7PA 4IVFA 2GLRA 4XS4A 2DJJA 1DE2A 4BA7A 1X9WB 1FAAA 1AUCA 3UL3A 4IBPA 5HR2A 2B5YA 3D4MA 1YEPA 4OFTA 5FT3A 5HR1A 1ZMAA 1WIKA 5EL8A 1CQGA 3LEFA 1EWXA 2X8GA 3FZ9A 4CW9A 2DC5A 2GQKA 3KP9A 1HNCA 1YKCA 3DIEA 3G7YA 5ID2A 1K3LA 4WKWA 3WYWA 5F8BA 2I9HA 3N9JA 2N5AA 4AJ8A 2A2SA 5A4WA 1XOAA 4ID0A 2NTOA 5KEJA 1BEDA 4HI7A 5JWRB 3KGKA 3IK9A 1TK0B 2VLVA 4RQRA 2JACA 2LEGA 5LCZA 2QC7A 4K7IA 1QQ2A 2H74A 2LQOA 2L5LA 2XC2A 2IL3A 3A2WA 2KOKA 1BYEA 3GKKA 3GMFA 4JE1A 3TB2A 3LFLA 2OE1A 5IM9A 3EC3A 3KMNA 3TDGA 3UBLA 4BPYA 1SL1B 1EV4A 3KJYA 3ZFLA 2JU5A 1A0RP 1WRYA 1Y6EA 3GNJA 2FWEA 1N2AA 3ZLPA 1OKTA 1O85A 3IE3A 3U6VA 2QSIA 4IHUA 2XBIA 5F0GA 5ELGA 3VURA 4EC0A 1RQMA 2GT6A 1A24A 1T4ZA 3L78A 4LLRA 2JZSA 4Q5RA 3O76A 1U87A 2HLSA 3RHBA 5C00A 2D2ZA 1OC3A 3TKSA 3TRXA 4HUAA 4X1UA 1NM3A 2JADA 2B5XA 4GRFA 3UARA 1JLWA 4NPBA 1SYXA 1Z6NA 6GSXA 3VI7A 2LNTA 3HZ8A 3Q19A 3FR3A 1TOFA 3H4KA 4XS4B 3GV1A 3IAM2 3A2XA 1F6MC 3LG6A 3UBKA 3A3TA 3FKFA 4ZB9A 3V1WA 1S3CA 1ZZYA 3LXZA 1ZCPA 2QKEA 2VLUA 4HU9A 1XZOA 4MH3A 4KDXA 3LJRA 4IKHA 5G2ZA 5HFKA 1OE8A 3Q74A 1AIUA 1BJXA 1M7TA 4GLTA 5ID2B 3P8WA 4Q5QA 4XCSA 1DBYA 1K0NA 1YY7A 1TRVA 2I1UA 2TRXA 5D9VA 4ZXGA 4IW9A 1PN9A 3IOSA 2AV4A 3VWUA 4FYUA 5DQYA 2GSSA 2FWHA 3EINA 1IYIA 4N30A 5A4UA 4KAEA 5B7CA 4OO4A 2LTKA 4KNDA 3ZIVA 2VD1A 4TR0A 3ERFA 3DMLA 3I43A 3WT2A 4ZB6A 2DJ0A 3SWLA 3LGCA 3ZL5A 3HD5A 3PH9A 4GSTA 2CV4A 4JR6A 3BD2A 3EYTA 3UIWA 2M80A 2NPBA 2MZCA 1VF2A 2P5QA 3EVIA 1SENA 2WB9A 3ME8A 3TKQA 1SJ6A 3F4SA 3KXOA 2AB6A 3HVSA 4GTUA 1EEMA 2ON7A 3TJGA 3KTLA 5JWQB 1GLPA 5G31A 4G9HA 4L8EA 1F9MA 5IMAA 3RAZA 3FK8A 2O85A 3ZZXA 4DSQA 8GSSA 4BVXA 1PRXA 1ERTA 1URMA 2YV9A 3FYGA 5HFIA 4OFNA 3CXGA 5J3RA 1G7EA 3LYKA 1XOBA 5AISA 5DJMA 1GL8A 4BL7A 2PUKC 3QCPA 2JZRA 2H30A 1IYHA 2LJKA 5ABRA 3GX8A 2L6DA 4KH7A 1H4OA 4MJEA 4KSOA 1XW6A 3FRCA 1GSQA 4Q5NA 4Z7XA 3FY7A 1F37A 2VIMA 2I81A 5AIVA 3M1GA 18GSA 4PNGA 4CDOA 4JU5A 2R3XA 3KZQA 5JCUA 2ZUPA 1PKWA 1YKAA 3NZNA 1THXA 1V40A 3IK7A 2GQLA 2AAWA 3TKSE 2MYGA 3CSJA 2ZCTA 1AQXA 4TOPA 4KSMA 4F82A 3DVXA 4DEJA 5G30A 4L0WA 3HVXA 5E59A 1K0DA 5IQYA 3A2VA 5INYA 4TXOA 2HZEB 2V2GA 3APOA 1Q98A 3PR8A 4ZL9A 3HHVA 3L9UA 2FUG2 2OACA 1SKSB 3D6IA 4YQMA 1O73A 4KA0A 2GSRA 3QR6A 2MMOA 3C8EA 2K8SA 2WDUA 1OC8A 3IAS2 1NW2A 2JL4A 2P31A 4V2NA 1ILOA 2MBTA 4KCAA 3EURA 5H5RA 4ACSA 1TU7A 3GL3A 4EVMA 2X64A 3CRTA 4RQXA 2GGTA 2PMTA 3ZFBA 2F9SA 2VO4A 3M9KA 2LNSA 3F8UA 3GHAA 3RHCA 1XIYA 2FGXA 4IJIA 5G5EA 1ERVA 4QL7A 1V9WA 2N5BA 2GZPA 4RUVA 4WETA 4MP4A 1GRXA 2H66A 2F51A 1PQNA 3GH9A 2FY6A 5J4UA 2FWGA 1NHYA 4ML1A 3FZAA 5B6MA 2VL3A 4MCUA 5IMZA 1XXUA 3KCMA 3F0IA 4XRDA 3TRQA 2H0IA 2V1MA 4MK3A 3U5RE 4PGTA 3AY8A 2GSQA 2H1AA 3H1NA 4HEA2 1XWAA 2H76A 4FYCA 3GURA 4IP6A 1GSSA 1JLVA 1V57A 4MPGA 4POKA 2YWOA 1RW1A 4KUNA 4ZL7A 3UOMA 2IMIA 5IMVA 4ZL8A 3HA9A 2HSHA 2AJQB 2DJ2A 5FWGA 1WE0A 5J41A 1ACVA 1A2LA 3MWHA 5ECQB 5IMCA 5ECIB 3ZMLA 1B4QA 2X99A 1Y25A 4KGIA 1ZL9A 4EDZA 5EPFA 5L71A 1WOUA 4PQHA 2EIOA 3F6FA 3APSA 3HVVA 2VD0A 1T00A 4PUAA 1HNAA 5IO2A 3P2AA 3TOTA 4TXOB 4MZBA 1WWJA 3PINA 1H75A 3O6TA 3K8NA 1G7OA 2IFQA 4YH2A 5IO0A 2DIZA 4ILFA 5ECPB 1SK1A 5CRHA 1QGVA 4IS0A 3RDWA 2OADA 4YQVA 4AJ6A 5GAPD 2FWFA 4HQSA 1TP9A 5AIXA 4K1FA 5ENUA 2YWNA 5IIZA 2LS5A 4D73A 4O7HA 1JZWA 3I69A 3HDCA 1WP0A 5DVBA 3ZITA 3GX0A 3FHKA 2FA8A 5EY6A 5JWOB 4J2FA 3VWVA 3TUEA 3QD9A 3RPNA 3EE2A 2LRCA 2VCWA 3GYKA 1KTEA 1LBKA 5CP1A 3DRNA 2QGVA 1K3OA 1DUGA 3F4TA 4V2LA 3GSSA 3L4NA 4IN0A 5GAND 2YZHA 2OBKA 4PURA 4TRXA 2O89A 2H70A 1TXXA 4GSNA 2KP1A 3NOFA 4G10A 1Z7PA 2XPDA 2IMFA 2L57A 3BOAA 4JBBA 2C0EA 4K0GA 1I9DA 1GSFA 2H1BA 1VF1A 4PXOA 4N10A 4MJAA 3QAWA 2YP6A 3ZYWA 2H1GA 3APQA 2ZNMA 2P0GA 3QDNA 5J9BA 1FW1A 5AN1A 4NWYA 3GN3A 4HZ2A 1BG5A 2OE0A 3FZ5A 3E0UA 1XFLA 2F8AA 2YCDA 3O3TA 1EGRA 5CREA 3UVHA 4O32A 1PD21 1FHEA 4MMMA 3KH7A 2C80A 5J9CA 1XVQA 4MF5A 4I2TA 4ZILA 4TR1A 5IPHA 3CTGA 2IMDA 4J56E 1USBA 2H0GA 2IMKA 2GQMA 2KUCA 2IIYA 2YNXA 2OKAA 4BVYA 4EUYA 2K18A 1X5DA 4IJ3A 6GSWA 3RBTA 1ZGNA 3W8JA 3H8QA 1QMVA 4G19A 1FO5A 1XWKA 2J23A 5KN0A 4OMVA 2H6YA 1QXHA 4GQFA 3PGTA 2PPTA 1ML6A 5IPGA 2IFQB 1TRWA 1F3AA 1YEXA 2YWIA 5ECRB 5GSSA 1M9BA 3LYPA 2HFDA 3MDKA 3ZVJD 4ZB8A 1M2AA 5ECNB 1EZKA 5D73A 2CVDA 4AJ7A 1Q4JA 2BMXA 4D73B 1ZYEA 2CX4A 17GSA 1AW9A 2C3QA 4ZBAA 3E9JB 5H5SA 2CT6A 3DWVA 2HZEA 3TGZA 4TN8A 3UMAA 1AC1A 4ECCA 1T7PB 3ZMKA 4ULXA 3GKMA 3KD0A 1WJKA 3FR6A 4BWSA 1XBSA 5DALA 1B9YC 4HJMA 4F2IA 5ECHB 2CX3A 3GA4A 3BCKA 2A2RA 2FD3A 1M2DA 4WR4A 5D9TA 3KH9A 2B6MA 1WMJA 3D5JA 1T1VA 4K7NA 1N8JA 3ME7A 3VK9A 3QPMA 1K0OA 5F07A 3TJFA 3HYPA 4XHMA 1W89A 3P90A 1PKZA 4NV5A 3GTUA 2DJKA 4EL1A 1EEJA 3OR5A 3L9SA 1TKDB 2PN8A 1FOVA 5COHA 1FB0A 19GSA 1QFNA 5A4VA 4I2UA 4TR1B 2G2QA 1OKDA 1X9SB 3R2QA 3KEBA 3WGEA 10GSA 5E4WA 3M3MA 3FR9A 1K0AA 2GTUA 2LRTA 4K2DA 4TR4A 1TI3A 1XW9A 5DJLA 1C72A 1VRSD 5AGYA 2PBJA 5B8AA 20GSA 3HY2A 2BJXA 4ZBDA 2OBIA 4MA9A 4PQ1A 4WF5A 4ZIJA 4PUFC 2GSTA 4OFMA 4N0ZA 3CBUA 3IC4A 4MABA 2E2MA 2IJYA 3TJKA 2RM5A 2PVOC 1SKWB 4F0CA 11GSA 3TJJA 4V2MA 1ST9A 3C73A 4IELA 4MZWA 3KM6A 1MEKA 3IBHA 1PL1A 1TRUA 2FHEA 3QFBC 5IOXA 4GCIA 4IQAA 2XPEA 5J5NA 2VCZA 1ZOFA 4L5LA 4F0BA 4BWQA 3TCOA 3BJ5A 1U3AA 2H6XA 5CRWA 4N11A 1Z6MA 4WR5A 3GIXA 4G2EA 1VGLA 3D4TA 2GVPA 2HSYA 3ZTLA 2A4VA 1ON4A 2EIQA 1AXDA 2HYXA 4XIHA 4EXJA 2C3TA 3CYNA 5DALB 1PX7A 3GKXA 2C0DA 2NBSA 4HJ2A 5EVOA 3M9JA 1R26A 3G9BA 2CVKA 4DVCA 3H79A 9GSSA 2C0FA 1A2JA 3W6GA 3VPQA 3QAGA 4DSSA 5GSTA 4Q5FA 1I5GA 2REMA 4OWYA 3MSZA 3FEUA 1J0FA 1BX9A 3C1SA 1F3BA 1JZOA 3F3QA 1SKRB 3S9FA 1UN2A 1A8LA 3HXSA 5JCGA 2LSTA 4ML6A 5ECOB 1TW9A 3ED3A 1R4WA 2YOIA 1A2MA 3GTUB 5DQSA 2Z9SA 4WXTA 2C1YA 1KBNA 3HKRA 1TTZA 4KCEA 3L9VA 2VM1A 4V1Ap 5IMFA 1UVZA 1SL0B 1MD4A 2OJLA 4L5OA 4MF6A 3QMXA 2DBCA 1AQVA 1SL2B 1YF0A 3DYRA 3LXTA 2WRTA 2ON5A 3DEXA 3GFKA 4GF0A 3UEMA 1NSWA 3CTFA 2WJUA 2I3YA 2E0QA 1TJDA 3IRAA 3EU4A 2WULA 3C7MA 4QL9A 5HFGA 4ECIA 5JCWA 1GSUA 4RI7A 5KN2A 4TKYA 2LJRA 1A8YA 2VL9A 1OC9A 2YWMA 4OCEA 4EDYA 1SJIA 2KLXA 2V6KA 5G1LA 3ZIJA 1PL2A 2HE3A 4K7OA 4MJBA 1PGTA 3N5OA 1YQ1A 4KB3A 12GSA 1X5CA 3ERWA 4K9ZA 3CMIA 2L5OA 14GSA 1ERUA 2VCTA 1SD9A 4LL1B 3ERGA 3P7XA 1K3YA 3IV4A 2C0GA 22GSA 2YZUA 3C1RA 2RLIA 2L59A 1OVNA 4YAVA 2MBSA 2X8CA 5ECSA 1GUKA 5D96A 4JZQA 2N5FA 1JZRA 4OD7A 3F9UA 1VF3A 3D0ZA 2H75A 3W8SA 4OCFA 1VF4A 2YANA 1Z7RA 2XBQA 1A23A 1M99A 3Q18A 4WF4A 1ZYQB 1UA5A 1A0FA 1SD8A 2KP2A 3KMOA 1EP8A 3TOUA 2KHPA 1GLQA 4POBA 1MDKA 1MD3A 3MAKA 4DSSB 2VOCA 4POLA 2H6ZA 3CSHA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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