1A0RP

Heterotrimeric complex of phosducin/transducin beta-gamma
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
218
structure length
188
Chain Sequence
FEGQASHTGPKGVINDWRKFKLESEFSRKMSVQEYELIHKDKEDENCLRKYRRQCMQDMHQKLSFGPRYGFVYELESGEQFLETIEKEQKITTIVVHIYEDGIKGCDALNSSLICLAAEYPMVKFCKIKASNTGAGDRFSSDVLPTLLVYKGGELLSNFISVTEQLAEEFFTGDVESFLNEYGLLPEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Phosducin induces a structural change in transducin beta gamma.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRANSDUCIN (BETA SUBUNIT)
molecule tags Complex (transducer/transduction)
total genus 56
structure length 188
sequence length 218
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
P PF02114 Phosducin Phosducin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.168.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Phosducin; domain 2 Phosducin, domain 2 1a0rP02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a0rP01
2RUFA 4TR1A 3FZ4A 4PGTA 4D73B 4GCIA 1V58A 1PL1A 4LA1A 3F6FA 3MSZA 1ZOFA 2VCTA 3QR6A 2O8VB 2R6KA 2V6KA 2TRCP 4K9ZA 1FVJA 1TRVA 3D5JA 3KMNA 1TXXA 4F9ZA 3ZREA 2OE1A 5B6NA 2AB6A 3G9BA 2H1DA 4DSRA 3DWVA 3IK7A 3TDGA 1BYEA 2XHFA 5COHA 1BG5A 3F4RA 4AJ6A 2QKEA 2DBCA 3CSJA 3FHKA 4KSMA 3LYPA 3DXBA 2ALBA 4JR6A 2FCHA 1EGOA 2GQLA 1FB6A 4AGSA 1G6WA 4KE3A 1SJZA 4IN0A 4G9HA 4MZWA 2WDUA 2VCWA 3BD2A 3LORA 2OE0A 5JCGA 4TR0A 4I5QA 4POMA 5ECSA 1WE0A 4OCFA 2BTOT 2C1YA 1AQWA 1Z7RA 1MDIA 4TOPA 5DCHA 3APOA 1A23A 1U6TA 3F63A 2L5OA 2IPAA 3ZYWA 5B8AA 3WD6A 4LLRA 2OE3A 4PX1A 3HVSA 2ON5A 3VPTA 2GDRA 2WGRA 2H6YA 5AN1A 5DVBA 4JBBA 4O32A 4POLA 2HT9A 4PNGA 3BBYA 5F8BA 2RIIA 4YQVA 1A2LA 3DVXA 3H8QA 4MJEA 2CQ9A 2DJ1A 2L57A 1YJ6A 4TXVA 4RI7A 4EUYA 2A2RA 2H75A 4ML6A 2LQQA 3IC4A 3EU3A 3GKNA 4XRAA 5HFKA 4HUAA 3KD0A 5A4WA 2B5YA 1AQVA 3MNGA 1H4OA 4NWYA 2D2ZA 4LMWA 1CQHA 4D73A 4Q5NA 1Z7PA 2JL4A 6GSTA 3ZIVA 2MBTA 2CV4A 3APSA 2HSHA 5HQPA 2GZYA 2LUSA 1AC1A 2CZ2A 1TI1A 5D9TA 2NTOA 4L5OA 2ZNMA 3HZ4A 5CP1A 2LNTA 4GSSA 4WBJA 1FW1A 11GSA 1URMA 4HI7A 4KUNA 1IYHA 4BA7A 4MLYA 1XW9A 1XZOA 2HRFA 2JACA 19GSA 4X43A 2GT6A 3IDVA 5ECRB 1SKWB 1EV4A 3Q6OA 1J0FA 3ZFBA 2H0HA 3RHBA 3F3RA 5JWRB 4OO5A 2H6ZA 1V9WA 4WEYA 3TB2A 4EE0A 3D4TA 1Y6EA 2OKAA 1M99A 2E2GA 3TJFA 3GA4A 4MZCA 3VLNA 3HJMA 3WGDA 4BWSA 1V98A 5C00A 1X9WB 1U3IA 5EVOA 1B8XA 1PKZA 2L5LA 2KP2A 3PINA 4ECBA 1OC9B 3UIWA 3RAZA 2H6XA 3EINA 6GSUA 1T4ZA 1GSDA 4MCUA 4I8BA 2MMNA 4LL1B 3VURA 5B8BA 3A2VA 3EURA 3IR4A 2B7KA 3VPQA 3FR9A 4ZB6A 4IELA 3TOUA 1OC8A 1X5DA 2H73A 5HR0A 3KH9A 3Q18A 5IO0A 1SJIA 4ILFA 3N9JA 4N11A 2AJQB 3HVVA 1JZWA 3CXGA 1GSUA 3KJYA 2MYGA 1T1VA 5ID2B 3HYPA 1Z6NA 1RK4A 2L4CA 2VM2A 3UMAA 2PN8A 3IA1A 4L8EA 1G7OA 4I97A 1VF1A 2CAQA 4OO4A 3DYRA 1THOA 3GRXA 2GGTA 1FHEA 2O85A 3DVWA 3FYGA 5HFIA 1XFLA 4WETA 3QFAC 5DCGA 4P3YB 5G2ZA 2TRXA 1TJDA 5DDLA 1K0BA 4EKZA 1YKCA 1GWCA 1SK2A 2H66A 2K8SA 1PX6A 1R26A 3C71A 3TKSA 13GSA 1GNWA 2B1KA 1VRSD 3ZL5A 5IQYA 2FWEA 2E7PA 5EL8A 1X9SB 1TDIA 1EWXA 2B3SA 1NSWA 1EP7A 1USBA 3DD3A 1B9XC 1KEBA 3IHQA 2DJ2A 2GQMA 4KB3A 1R7HA 2CA8A 3QAVA 1K0OA 2R2JA 4L0WA 4BVXA 5EPFA 4DSSB 4O7HA 1N2AA 1TK5B 3MDKA 3L78A 4EXJA 4V1Ap 4EF0A 3GFKA 4F0BA 1GH2A 1SYXA 5F0GA 3P90A 4MDCA 1VF3A 3TCOA 1MDKA 1HQOA 1T3BA 4FIWA 3WGXA 5G5FA 4GLTA 1ZMAA 4ID0A 1WRYA 5KN1A 5CRWA 1BQ7A 4FYCA 5JWQB 3TJGA 3F9UA 4MP4A 3D0ZA 1EEMA 1T7PB 2XC2A 3FZ9A 9GSSA 5ID2A 2KLXA 4AJ7A 3QFBC 1YF0A 1ABAA 4POBA 1Z5YE 2CX3A 1T00A 2NPBA 1ZYEA 3QAWA 5IMCA 3L9UA 2VL2A 1TRWA 1F3AA 2C3TA 3HA9A 5DBQA 4K7NA 1EOGA 2EC4A 2DJ0A 2FLSA 3C1SA 2L59A 4ZIJA 2G2QA 3ZLPA 4KGIA 1JLVA 3HXSA 2X8HA 3LWAA 5JCUA 2B1LA 3HKRA 2V2GA 2X99A 4AJ8A 1PX7A 1TU7A 4RQXA 3EU4A 4NHWA 4MMMA 1GL8A 3IBHA 1SK0A 3DIEA 4TR3A 5D93A 1R5PA 2K18A 4PUFC 4TN8A 4FYBA 2LJAA 3PH9A 4TKYA 3KMOA 2JZTA 1PD21 2YV9A 4K2DA 2CVBA 1O8XA 1OE7A 1I9DA 1T4YA 5ECPB 5F07A 1TK0B 3I9V2 1QGVA 4MJBA 4MF6A 1V57A 1FG4A 2IFQB 5ECKB 4RQRA 1WIKA 4PURA 3U6VA 1LBKA 3H4KA 3LXZA 2VAFA 3ZITA 1V40A 1GTAA 3KIJA 3UOMA 2QSIA 2GT5A 1K0NA 3ERGA 2DMMA 1GSYA 2CX4A 2WJUA 2PMTA 2IMEA 2I1UA 1PRXA 2FA4A 5IMDA 3ZTLA 4WR4A 1YQ1A 5GZZB 1HNAA 4HS1A 4KH7A 2VCVA 1PL2A 3UL3A 2R3XA 4KX4A 5ELGA 3GH9A 2LRTA 3KGKA 2MMZA 5J5NA 5CO3A 1EOHA 1F6MC 1GTBA 3A2WA 2MMAA 1X5EA 1XW6A 3CRUA 4MABA 2GZPA 4MJCA 3SBCA 5DJLA 2H1BA 3QCPA 1GSFA 1SJ6A 4N30A 1RQMA 4HJ2A 3GKKA 2LTKA 3EVIA 3UVTA 4JEDA 2F8AA 3CSIA 3KXOA 1B4QA 2YWMA 1JZRA 3GTUA 3P2AA 4F03A 2DIZA 1ERTA 2DJ3A 1YF1A 4HEA2 5B7CA 22GSA 3BCKA 1SKSB 3QMXA 5E59A 2IIYA 2F9SA 3F4TA 2N5AA 1TTZA 4KDXA 1NM3A 1XVWA 5IMZA 3TRPA 4K0NA 4OCEA 4KAEA 1XWKA 1BEDA 1PGTA 4I2UA 2WB9A 2RUEA 5E4WA 3IOSA 2HYXA 2YJHA 1F9MA 3U5RE 2V32A 2LV3A 4F82A 2OADA 1MD4A 4GQFA 1J9BA 4QL7A 2GSSA 2I4AA 2VLVA 3HVXA 3M0FA 2H19A 2IMDA 1Z6MA 3F0IA 3GN3A 3S9FA 5ECOB 3DEXA 5D96A 2M46A 1AUCA 5ECMB 1SD9A 1DBYA 4F2IA 3UBLA 2DLXA 3ERFA 3GMFA 5G31A 5KN0A 3ZRDA 1HNCA 4ISDA 3F6DA 5ECIB 1O8WA 3IV4A 3ZVJD 5ABRA 2JU5A 1K3LA 4NXIA 4WR5A 1M2AA 5GAPD 1S3CA 2WZ9A 5GSTA 4DVCA 2LRCA 6GSYA 2HSYA 3LQ7A 1SYRA 3RPPA 2XBQA 3ZMKA 5DQSA 3NIVA 2YJ7A 2HFDA 4ZBAA 4EDZA 2G0FA 5IIZA 1XWCA 5ELAA 2E0QA 10GSA 5KN3A 1GUMA 2C3QA 4HJMA 3ISOA 2X64A 20GSA 1A0RP 3GH6A 3KCMA 2R5GA 2YANA 3RBTA 3F3QA 1X5CA 1JZOA 2PBJA 2GQKA 5CRGA 3RDWA 4PXOA 1XOBA 1RW1A 1YKAA 2L6DA 3I43A 3HY2A 4V1Ag 5FWGA 4ZL7A 2E2MA 1ML6A 3C7MA 2DJKA 4L5LA 1GUHA 3V1WA 4LMVA 5JCWA 4KCAA 2MMOA 2YCDA 2QC7A 5ECHB 1VGLA 4MPGA 2MZCA 4KA0A 4TR4A 4XS1A 1T8EB 4Q5FA 1XWGA 2CAIA 4O92A 3GKXA 4QL9A 1Y25A 4XRDA 3UAPA 4JU5A 1MEKA 2P0GA 3UEMA 1SENA 3H93A 4MH3A 2AUVA 2CT6A 3HJPA 3O6TA 4E8EA 2K8VA 1GP1A 2CVKA 3CTGA 5HR2A 1BX9A 4KCEA 3BCIA 4I6XA 5C04A 3RHCA 2I9HA 1THXA 1HD2A 3GV1A 2N5FA 1V2AA 1K3YA 3L0HA 5A4UA 1XXUA 1R5AA 1TP9A 3GX0A 3GNJA 4GWRA 3M3MA 4GF0A 2VL3A 3KTLA 5HR3A 4L0UA 4HZ4A 2H30A 1LJRA 2XPDA 4TRXA 4ZB9A 4IJ3A 4K8MA 2OACA 1H75A 3F4SA 2FHEA 2J23A 2VCXA 1A0FA 1GULA 1PKWA 5DJMA 1NHYA 1W4VA 4I2TA 4IW9A 2KHPA 3LFLA 3GKMA 2FA8A 3TKPA 1O85A 2H0GA 1A2MA 2OBIA 2P5QA 5DAKB 1GSEA 1AQXA 4HU7A 4J2FA 5CAXA 2AAWA 1G6YA 1TK8B 1JHBA 2VD0A 3L9SA 4PNFA 4IS0A 4WBRD 4YAVA 1N8JA 1Q4JA 4TW5A 1Z3EA 2GLRA 1QFNA 4TXOB 5CRHA 5LNKe 1F2EA 2X8CA 4V2NA 4GXZA 2H0IA 4V2MA 5ECLB 4LL4B 1U3AA 2I81A 1TOFA 2P5RA 1VF2A 1M2DA 1QK8A 3QOUA 6GSWA 5D8IA 1Q98A 2VO4A 1A2JA 2KUCA 4ACSA 2DMLA 3P7XA 2JZSA 2JADA 8GSSA 12GSA 1PN9A 1S3AA 1X0RA 4K7OA 4MH2A 2C0EA 3RPNA 1HYUA 1M7TA 3VWUA 4CDOA 4GSTA 2L6CA 1OC9A 1JLWA 3HZ8A 4BL7A 3NOFA 2EIOA 1XWAA 2FNOA 4V2LA 2WULA 3CBUA 2O87A 2B6MA 3CMIA 4WF4A 4EC0A 4TR1B 1PQNA 2YOIA 2MBSA 2YP6A 4NMUA 5FHIA 5AISA 17GSA 2R4VA 3EYTA 3GURA 4RI6A 3ZZXA 3US3A 3L4NA 5EY6A 1NW2A 4X0XA 1DSBA 3W6GA 1FVKA 5CNWA 3GL3A 5IM9A 3PGTA 1Z9HA 3SWLA 4RUVA 1IYIA 3TRXA 2ES7A 1XPVA 5G5EA 4ZL9A 4Q5RA 2VL9A 5D9WA 6GSXA 1SK1A 2HE3A 2AYTA 2FUG2 1SD8A 1EGRA 1YDKA 3GL5A 3MAKA 2H1GA 1S3DA 3O3TA 3GX8A 2FY6A 2V6OA 2DJJA 3UJ1A 2LS5A 1SKRB 3VFIA 1ZGNA 1ERVA 1GTUA 2HNLA 4EO3A 5LCZA 1EV9A 4IQ1A 3UBKA 2YWOA 1UVZA 4MA9A 2WRTA 3IRAA 4MJAA 2VCQA 1A24A 2OA7A 4JZQA 1SL1B 5GSSA 3ZFLA 1YEPA 1WJKA 3J7Yb 3W8JA 4JRRA 4TXOA 1J08A 3GYKA 4IJIA 2GSQA 4BVYA 4O5RA 3WT1A 4ZL8A 3P8WA 4ZXGA 3PR8A 5F05A 4WXTA 5H5QA 2ZUPA 4OWYA 4GTUA 5H5SA 1TRSA 3C8EA 4ZILA 6GSSA 2DC5A 3KM6A 2M80A 3FR3A 3M9JA 3UARA 4ZB8A 3APQA 3KP8A 4XCSA 3LSZA 2OJLA 3A3TA 2YWNA 5ECNB 4EVMA 1ST9A 4J56E 5IMAA 2GZZA 4TVEA 3IE3A 2F3MA 4CW9A 3F8UA 4DSSA 2IMIA 3C73A 5H5RA 4POKA 3FEUA 2WFCA 3VI5A 1AW9A 1OKTA 1DUGA 3M1GA 4NHZA 2F8FA 2O89A 4XS4B 1ERWA 4EDYA 3VWXA 3GHAA 4N0VA 4HZ2A 2FWHA 2B5XA 3EMPA 2RM6A 1B48A 2VLUA 1MD3A 1TI3A 3KZQA 2YZUA 2HXKA 1F37A 2VIMA 2B5EA 1GLPA 1LU4A 4BPYA 3C1RA 2YV7A 2HZEB 1QMVA 2H01A 5CRDA 3D4MA 2LJRA 3Q74A 5IMVA 3TGZA 4XHMA 2JSZA 1C72A 3A5WA 2ZCTA 4G19A 4MPFA 3DRNA 4IVFA 2VM1A 2GSRA 2XPEA 1WOUA 4IGJA 3IAM2 3G7YA 3EWLA 3QPMA 4AF2A 2VLTA 1X9MB 4FH8A 2LKUA 3D21A 1B4PA 5FT3A 1ON4A 1XVQA 5KEJA 2NVLA 2O7KA 3ME7A 3GUSA 4OFMA 2PVOC 1KNGA 3OR5A 5INYA 4EL1A 3ED3A 1QUWA 2FGXA 3HHVA 4DSQA 2YWIA 5IPHA 3ZMLA 1U88A 2VCZA 1OKDA 2I3YA 2JSYA 2IFQA 5IO2A 1GUKA 3QAGA 1WP0A 1O7UA 2VUPA 1O73A 3LYKA 1E6BA 3CRTA 3UVHA 4IP6A 3TKQA 4NAXA 5LD0A 3E3EA 2FWGA 3TJJA 1MTCA 4OFNA 4ECJA 3TKRA 1TU8A 3O76A 2C0DA 2C4JA 3CTFA 4KDYA 1M9AA 4HDEA 5CYYA 2DIYA 1EP8A 1HNBA 2F51A 1FAAA 4ZBBA 4XS4A 4HU9A 2VD1A 2VOCA 4Q5QA 3FK8A 3FW2A 1SU9A 2EIQA 3ME8A 3BOAA 3NZNA 3WGEA 4ML1A 1G0TA 4NPBA 4JE1A 4K6XA 1TW9A 2RLIA 2C80A 2WCIA 3HDCA 1QQ2A 2H76A 5J3RA 2HZEA 3TUEA 4ECCA 4ZBDA 1OVNA 3DMLA 4HQSA 3D22A 3M8NA 2GVPA 5HFGA 1ZZYA 1XOAA 2FWFA 4FYUA 3D6IA 1YY7A 3BJ5A 3W8SA 1KBNA 1JFUA 2H8LA 1O81A 5G1LA 5J4UA 3FZAA 2C0GA 4YQMA 5ENUA 1GRXA 2PPTA 2ON7A 2C0FA 1XCCA 1EEJA 5G30A 5IPGA 3VWVA 2V41A 1XIYA 2RM5A 4YAPA 1E2YA 4XTSA 1GLQA 1FOVA 3QD9A 5HR1A 4Z7XA 1K0DA 2A2SA 3QDNA 4IP1A 2Z9SA 1DE2A 3HCZA 1EZKA 3G7JA 1WPIA 3IAS2 1OYJA 5KN2A 3HD5A 1O6JA 4IHUA 2HLSA 2N5BA 1W89A 4MZBA 4CHSA 3KP9A 4PQHA 4J57E 2LEGA 3GSSA 3M9KA 3MWHA 5D9VA 4MF7A 3FRCA 3R2QA 3I69A 1BAYA 2C8UA 2X8GA 4YQUA 4GRFA 5D9XA 1M2BA 2BMXA 2TIRA 2XBIA 2KP1A 5B6MA 4NV2A 1GSSA 7GSSA 3TJKA 2REMA 2PU9C 5AIXA 2CZ3A 1ERUA 4GQCA 3ZIJA 2PGTA 14GSA 4K7IA 1A8LA 1XW5A 2EIRA 2LSTA 3LJRA 2YZHA 2AV4A 4F0CA 3WYWA 1R4WA 2GS3A 3LEFA 1GNEA 3EE2A 3H1NA 2IJYA 1VF4A 4FO5A 4IQAA 5DALB 2LRNA 3KH7A 4QQ7A 5AIVA 1UN2A 3FR6A 2GTUA 3DKSA 3G7IA 3GSTA 1OC3A 3EC3A 2IMKA 2L4QA 2IMFA 3TOTA 2P31A 2PERA 4PQ1A 4X1UA 2OBKA 2B7JA 2LNSA 2R37A 3LGCA 1TKDB 3TRQA 3LG6A 1QXHA 3CSHA 1GSQA 2K9FA 1WMJA 3EMXA 1XWBA 1SL0B 2YNXA 3TKSE 1FO5A 4OMVA 2AHEA 2PUKC 4G2EA 4G10A 3IPZA 3DGQA 3E0UA 1ZL9A 4N10A 4WKWA 2HZFA 3KTBA 5J41A 2C3NA 4JR4A 4PUAA 3I6AA 3HJOA 4KDUA 3IXRA 3AY8A 1I5GA 2JZRA 1AXDA 3FZ5A 3VK9A 2GSTA 1WWJA 1MDJA 1K3OA 4OFTA 4IBPA 2QGVA 4XS6A 4DEJA 2KOKA 1AIUA 4OD7A 2HRNA 3E9JB 2WS2A 3N5OA 1PMTA 1DE1A 1PSQA 3TKSC 1JZDA 4K1FA 4PQIA 1ZYQB 1ZCPA 1KTEA 2M72A 4HQZA 3TJBA 16GSA 3WT2A 1M9BA 3ERWA 3FKFA 4K0GA 3VI7A 2NDOA 2IWTA 1K0MA 5J9BA 4KNDA 3JCML 2YN1A 1A8YA 1G7EA 18GSA 3GTUB 5A4VA 3KEBA 1YZXA 5AGYA 4NV5A 5DAKA 1SL2B 3CYNA 5J9CA 1CQGA 5JWOB 4KW6A 5IOWA 3J7Yk 1UC7A 1U87A 4XIHA 1NHOA 4H86A 4ECIA 1M0UA 3L9VA 5DALA 5G1KA 3Q19A 2LQOA 2H1AA 3H79A 2PVQA 2NBSA 3ZVJA 5L71A 2IN3A 5D73A 1BJXA 2CVDA 1YEXA 4YH2A 1K0CA 3LXTA 1AAZA 2DSAA 3A2XA 4BWQA 2HI7A 2H74A 1XBSA 1PA3A 2H71A 6GSVA 2A4VA 4E8HA 2FD3A 4N0ZA 2BJXA 5GAND 1F3BA 4ULXA 1TRUA 1ILOA 3GIXA 2PWJA 1UA5A 3IK9A 1OE8A 2V1MA 5DQYA 1FB0A 3VWWA 5IOXA 3K8NA 3FY7A 1GTIA 2J9HA 4WF5A 2K6VA 2YPMA 5IMFA 2H72A 5CREA 2IL3A 4GSNA 4MK3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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