2C0FA

Structure of wind y53f mutant
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
CTGCVDLDELSFEKTVERFPYSVVKFDIAFPYGEKHEAFTAFSKSAHKATKDLLIATVGVKDYGELENKALGDRYKVDDKNFPSIFLFKGNADEYVQLPSHVDVTLDNLKAFVSANTPLYIGRDGCIKEFNEVLKNYANIPDAEQLKLIEKLQAKQEQLTDPEQQQNARAYLIYMRKIHEVGYDFLEEETKRLLRLKAGKVTEAKKEELLRKLNILEVFRVHKVTKTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Elucidation of the Pdi-Related Chaperone Wind with the Help of Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords WINDBEUTEL PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Drosophila melanogaster
total genus 70
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07749 ERp29 Endoplasmic reticulum protein ERp29, C-terminal domain
A PF07912 ERp29_N ERp29, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1150.12 Mainly Alpha Up-down Bundle Endoplasmic reticulum protein erp29 Endoplasmic reticulum resident protein 29, C-terminal domain 2c0fA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2c0fA01
4TXVA 4YQVA 3PGTA 4MJEA 1O85A 3D6IA 2E2MA 3KMNA 3TKSE 1WOUA 3VK9A 3F8UA 5D9XA 2BJXA 3UARA 4WETA 4DSSB 1ZZYA 1X5DA 5LD0A 3C73A 2LRCA 3L4NA 4F82A 3ERWA 3D22A 4GXZA 1JFUA 5J5NA 2JZTA 1MDJA 1LU4A 5J41A 1UN2A 4BPYA 5AN1A 1SD8A 4BA7A 1MEKA 1JLWA 1YF0A 1FVKA 1XVWA 1AQVA 4F03A 1OE7A 5B6MA 1TRUA 5C04A 2KP2A 3FZ4A 2DMLA 3TB2A 3PH9A 1EWXA 3DXBA 1GUHA 2KUCA 4N11A 1GP1A 1QUWA 1V57A 4GQCA 2H30A 1DBYA 5IOXA 2EC4A 4BL7A 3P8WA 4GWRA 5GSSA 4AF2A 3CYNA 2HI7A 5HR3A 5IMAA 1PA3A 4JEDA 4ZIJA 1X9SB 2MMOA 2C0FA 3IBHA 2K8VA 4D73B 3FR9A 3GFKA 4FH8A 2KOKA 3KP9A 5IO0A 2K18A 2VL2C 5G1KA 5E59A 1WWJA 4POMA 4X0XA 2IFQA 4K0NA 3M1GA 3ZL5A 2CX4A 5ABRA 4MA9A 4PURA 4DSRA 4MCUA 1K0CA 4IJIA 4LMVA 1YZXA 1KEBA 1TU7A 1IYIA 5G5FA 3H4KA 4Q5FA 3BCKA 3ZVJD 5B8BA 2M46A 5ECMB 3WGXA 2FD3A 1AXDA 2RUEA 1K0NA 3GRXA 6GSWA 2FCHA 1FB0A 2I81A 3GX8A 5CRGA 2IMKA 4OCFA 2B1LA 1O8XA 2CAQA 3R2QA 2AJQB 1F9MA 3GV1A 2M80A 2HT9A 3DKSA 2LEGA 3P2AA 2DSAA 2LJKA 1AAZA 4HZ2A 2FA8A 4NXIA 2E0QA 4I97A 3GKXA 3BOAA 1QK8A 1YEPA 2QGVA 4MF7A 3F4SA 2A2SA 3O6TA 1M2DA 5CP1A 4TXOB 2N5FA 4L0WA 4QL7A 5J9BA 1ZOFA 3F6FA 4FYCA 4PNFA 1ACVA 4FO5A 1GSSA 4FYBA 4HU9A 2VAFA 4POBA 1PGTA 3W8SA 2YJ7A 3IE3A 3L9SA 2B6MA 4ZB8A 3KMOA 4ECBA 4QQ7A 1GSFA 5G5EA 2E7PA 1DSBA 4HJMA 3QD9A 4EDZA 2IL3A 3RPNA 5IIZA 3GTUA 4YAPA 1XVQA 5CAXA 3IOSA 2HXKA 1V40A 2GGTA 4MJAA 1X5EA 4GSNA 3UL3A 3WGEA 1TI3A 4KSMA 3C1RA 2WJUA 1JZWA 4MZCA 4G9HA 4X43A 2YP6A 1NHYA 1R5PA 2FWHA 3FRCA 5H5SA 2FUG2 1HYUA 2WZ9A 3GH6A 3QFAC 2H0HA 1ILOA 3IHQA 1ZGNA 4JU5A 4NHWA 4MH2A 2FLSA 4GSSA 4POLA 3EYTA 1YEXA 4PXOA 4KDXA 2R3XA 3FR6A 3K8NA 1HD2A 4K6XA 4KW6A 1IYHA 3VI5A 2C80A 3GNJA 5AIVA 2L6DA 2MMNA 2I9HA 3HA9A 3KP8A 3Q6OA 5IQYA 4DSQA 2H6ZA 1I5GA 1O6JA 2R2JA 4OFMA 1FHEA 5B6NA 1K0OA 4IP6A 3UAPA 4JZQA 3TJBA 2OACA 1TK0B 4NV2A 3TJJA 2CQ9A 3O3TA 1JZOA 3VURA 2YZHA 4EXJA 1U87A 5G31A 1UC7A 1SL1B 1G7OA 2GS3A 2XHFA 1XFLA 4HUAA 2YOIA 1DE1A 4F2IA 2OA7A 3KH7A 4KE3A 2YJHA 3VWVA 4GRFA 3UJ1A 1GLQA 1F6MC 3TCOA 1MTCA 1H75A 2PVQA 3HVXA 2PBJA 3MDKA 3US3A 3GUSA 4EE0A 2N5BA 1HNBA 3HD5A 4OFNA 4V2LA 3LYKA 2IMEA 3N9JA 2HRFA 4J2FA 4HQSA 4GLTA 5F06A 2C0GA 1KTEA 2DJ3A 3GKKA 3SBCA 2XBQA 1G6WA 5A5KA 4OO5A 2E2GA 5F05A 1U6TA 3EMPA 4L5OA 1OKDA 2YZUA 3FZAA 2H76A 1QMVA 2L4CA 5D96A 4IGJA 2H66A 1B4QA 4V2NA 2C1YA 2O7KA 4HZ4A 3WT2A 2IJYA 2VLTA 1NM3A 2H0IA 4MJCA 1CQGA 2YCDA 2JSZA 1SL0B 3LWAA 2FY6A 1EP8A 5JCGA 4TR0A 4N30A 2R4VA 3TRXA 2M72A 1TW9A 4LA1A 4IW9A 2VL9A 3MNGA 4Q5QA 4ULXA 1GTBA 3S9FA 3HXSA 2WS2A 3WT1A 3LXZA 18GSA 2X8GA 4MDCA 5IPGA 2VL3A 1YKCA 3EINA 2LJRA 1FVJA 1WMJA 1GTUA 3KJYA 4FYUA 4Z7XA 4TR1B 4XIHA 3E9JB 3TUEA 1OVNA 3P7XA 3E3EA 4KUNA 4N0VA 1R5AA 4O5RA 5GSTA 4F0BA 5KN2A 2B7JA 1ZCPA 1GSUA 5ECKB 1SYXA 4ZL9A 4OMVA 2H01A 5G2ZA 3Q18A 4IJ3A 2CX3A 2CVKA 2YNXA 2V6KA 3TOTA 3ZMLA 3D5JA 1PL2A 1ERWA 1GTIA 3GSTA 2ALBA 2P5RA 2HRNA 2H19A 3FEUA 3M8NA 5J4UA 4BVYA 2DJ1A 3EC3A 3PINA 2FNOA 5ID2B 3CRTA 1S3DA 1GUMA 2RLIA 4MH3A 3MAKA 2F51A 1GL8A 3U5RE 2GZPA 3ZVJA 3VWUA 3D21A 3W8JA 2H6XA 3ZTLA 4KH7A 3HVVA 1ERTA 2BMXA 5B7CA 2EIRA 3VPQA 4MPGA 3F3RA 3LQ7A 1EGOA 4WXTA 4LL1B 3ZLPA 3RHCA 3GSSA 1U88A 4WF5A 4CDOA 2VCWA 17GSA 5CRWA 1UA5A 4WR5A 5AGYA 3IK9A 5CRHA 1XCCA 1X5CA 1GNEA 3TRQA 3TJGA 5EY6A 13GSA 1Y25A 1GSQA 3JCML 12GSA 2JADA 2PU9C 4MPFA 1KBNA 2RM6A 3BBYA 2HNLA 3IXRA 1SKRB 3IK7A 1T8EB 5EVOA 4GQFA 5E4WA 5JWOB 1B48A 1VRSD 1FG4A 2OE3A 4L0UA 2YPMA 5CRDA 1T3BA 4G19A 3WGDA 1DUGA 3HYPA 2G2QA 1EV9A 2C3TA 4EUYA 3RBTA 3V1WA 3QAGA 1QFNA 3RPPA 2NBSA 3IR4A 2H1GA 1SJ6A 4RI7A 5L71A 1K0DA 2IMIA 5LCZA 2LQQA 3A2XA 1WP0A 4WKWA 1Y6EA 1T4YA 3KCMA 2C3QA 1H4OA 3P90A 2XPDA 2VOCA 4HQZA 2LNTA 1YKAA 5ECOB 4I6XA 4WR4A 2V32A 3A3TA 2X8HA 1XXUA 3VPTA 1XOBA 3UMAA 4JE1A 6GSUA 1F3AA 2GTUA 3A2VA 1W89A 3UEMA 3U6VA 1R7HA 2MBTA 5COHA 5HFIA 5IMCA 2IMDA 2YN1A 1V98A 6GSYA 1GSYA 2L6CA 1BX9A 2VLVA 2D2ZA 1OC3A 2C3NA 1ON4A 3QR6A 4DEJA 1TI1A 5DDLA 3SWLA 4P3YB 2V1MA 5F07A 3ZMKA 1A24A 1T00A 4EKZA 3CSJA 2WRTA 2YANA 2L5OA 1AQWA 5HQPA 4GSTA 3F3QA 5DCHA 3GH9A 3EMXA 3PR8A 1OYJA 1YY7A 1EP7A 4YQMA 3H79A 3GL3A 2H1AA 2OJLA 2CZ2A 1XBSA 5F8BA 3RHBA 1OKTA 2WFCA 3FKFA 4TR1A 3HJOA 4ZBDA 5CYYA 4CHSA 2K9FA 3F63A 3W6GA 1Z9HA 1XPVA 1SJZA 5H5QA 4MMMA 4N10A 1OC8A 4J56E 4ECCA 3KTLA 2MYGA 5ECRB 1R26A 3BD2A 4XS1A 3QCPA 4IELA 5HFKA 1XWGA 3DYRA 3GHAA 1S3CA 2ON5A 3IRAA 4ECIA 3UBLA 1Q98A 1ERUA 2I3YA 16GSA 3VFIA 2AV4A 3LGCA 3GIXA 3NIVA 2VCXA 5EL8A 4EL1A 5EPFA 4TW5A 2GSQA 2MZCA 3KEBA 2LS5A 3VWWA 1U3AA 3CBUA 2WGRA 5DALB 2B5EA 1TRWA 1SKWB 4OCEA 1TK8B 2GZYA 2B1KA 2JZSA 3ZREA 4I2UA 1NHOA 3APQA 5ID2A 3EU4A 1I9DA 1ML6A 1ABAA 1PX6A 2X64A 2O8VB 3ME7A 1PL1A 3F0IA 1J0FA 1XWAA 5INYA 4AJ6A 1TRSA 4Q5NA 4AJ8A 4OFTA 5IMVA 2DJ2A 2O85A 3DRNA 4DSSA 1A2MA 1MD4A 2HYXA 4ML6A 5F0GA 1T1VA 4HJ2A 3GL5A 3DMLA 2HE3A 3O76A 4BWQA 2O87A 3DVWA 4ZBBA 1PQNA 2CVDA 4XS6A 5ELGA 2MMZA 1UVZA 4IS0A 5ECLB 1ZL9A 4BWSA 10GSA 1SK1A 1OAZA 4JRRA 2C0EA 4MZBA 2XPEA 2ZNMA 2GLRA 1R4WA 3J7Yb 2DJ0A 2FHEA 3KM6A 5CNWA 4ZILA 1K3YA 4E8HA 1NW2A 4ECJA 1GULA 3DEXA 3L9UA 3HCZA 3GURA 4LL4B 5A4VA 3TKSA 4K9ZA 3FYGA 2DBCA 2OKAA 4H86A 3QOUA 1Z6NA 2X8CA 4YH2A 2H0GA 5ECHB 2JZRA 2VCZA 1A8YA 3FR3A 4HOJA 2CZ3A 4EDYA 2CT6A 4D73A 4ILFA 4TVEA 3F4TA 3UVHA 5KN0A 4PUAA 1JHBA 3DGQA 3EVIA 2L5LA 3TRPA 1SK0A 11GSA 1WE0A 3F4RA 5D93A 4KB3A 1DE2A 5IMFA 4YAVA 5CO3A 1F37A 4IKHA 4IQ1A 3F6DA 3IAM2 1M9AA 1M7TA 3APSA 5D9VA 4OD7A 2CVBA 1OC9B 4IQAA 3LORA 4XRDA 1W4VA 2OBIA 2PN8A 3G7YA 3ED3A 4TR4A 3ERGA 1TOFA 2F9SA 4KA0A 1PD21 3UIWA 1XOAA 2OE0A 2AAWA 6GSXA 4TKYA 3RDWA 3HJPA 2FWGA 4PQHA 4O32A 3ZRDA 3IA1A 1HNCA 1THXA 3L78A 1XW6A 3OR5A 3HKRA 2GSSA 1EOHA 3MSZA 1M9BA 2EIOA 2AB6A 2QKEA 4F0CA 3GYKA 2IFQB 5ECIB 1VF4A 2C4JA 1M2BA 2VO4A 1F3BA 2NDOA 2EIQA 2X99A 2C8UA 5IPHA 3I43A 4LLRA 3DWVA 2AYTA 2NVLA 3NZNA 3ZFBA 2IMFA 2OE1A 1GH2A 3TKQA 4TXOA 2CV4A 5IOWA 4IN0A 1TRVA 2JSYA 2B5YA 1S3AA 2ON7A 4NV5A 1PSQA 2R6KA 3FHKA 2IPAA 14GSA 5DALA 5HR1A 5J3RA 4WBRD 4XCSA 4HEA2 1M2AA 3FW2A 2NPBA 2I4AA 4WBJA 3D4TA 4RI6A 3CRUA 3KGKA 3QFBC 1PRXA 1FOVA 2DJJA 1TU8A 5ECQB 1BQ7A 3VI7A 1M0UA 1A0RP 1C72A 5C00A 3QAVA 4IBPA 1LJRA 3A2WA 1WIKA 1USBA 4X1UA 2HSYA 1N2AA 1E2YA 1VGLA 2GT5A 4EF0A 1WRYA 5GAND 4F9ZA 3HJMA 4G2EA 3TDGA 2IIYA 1JZRA 4KSOA 3TJKA 4I2TA 5G1LA 2J9HA 4V2MA 1JZDA 1XWBA 3MWHA 1SU9A 2PUKC 4ZXGA 3Q19A 4EVMA 3C71A 2DLXA 4EO3A 5AISA 1RK4A 3CTFA 3C7MA 2P0GA 3QMXA 3I69A 3UOMA 2GQMA 1TXXA 1G0TA 1GRXA 1EOGA 2WDUA 4MLYA 2ES7A 4TN8A 3GTUB 1PKZA 5HFGA 4ZL7A 1J9BA 2R5GA 4IP1A 4AGSA 5KEJA 3RAZA 1B4PA 1MDIA 2H71A 4OWYA 1FO5A 1TP9A 3Q74A 3QAWA 4KDYA 2MBSA 5ECSA 3EURA 1AW9A 2H1DA 3L0HA 3LFLA 2BTOT 1BJXA 3ERFA 3GKMA 2V6OA 1PX7A 4FIWA 1FB6A 1F2EA 1A2JA 2LRTA 2FWEA 4MK3A 1PMTA 4POKA 5FHIA 7GSSA 1GUKA 5ELAA 3KXOA 2DC5A 4LMWA 1ZMAA 5CREA 3D4MA 1EV4A 2TIRA 3QDNA 2F3MA 1TDIA 1GTAA 1TJDA 3GA4A 3HDCA 3TKRA 1E6BA 4TR3A 1VF2A 2G0FA 2NTOA 1GLPA 3LJRA 2I1UA 3KD0A 1T7PB 1BEDA 3EE2A 4NMUA 2Z9SA 1GNWA 3H1NA 3VLNA 4PGTA 1OC9A 2H1BA 9GSSA 2B5XA 2MMAA 2WB9A 5DCGA 4ZBAA 2VUPA 3M9KA 3FK8A 3G7JA 4L8EA 4I5QA 1YDKA 3N5OA 3TKSC 1X0RA 4TRXA 1EEJA 1THOA 2PVOC 4K2DA 5FWGA 2LV3A 5AIXA 3KTBA 3VWXA 1BYEA 2WCIA 4KGIA 3IPZA 1QQ2A 4NHZA 2LRNA 1V2AA 2QSIA 2JU5A 4KAEA 2RIIA 1SL2B 2PMTA 1Z3EA 4KDUA 1YJ6A 3LYPA 3ZZXA 1K0MA 4ZB9A 2KLXA 1N8JA 1B8XA 1Z7PA 2CA8A 2K8SA 1TK5B 2ZCTA 2V41A 3I9V2 1Z7RA 4MF6A 5GZZB 2K6VA 2LQOA 5IMZA 2YWNA 4JR4A 4ISDA 5FT3A 4PNGA 6GSTA 1HNAA 1U3IA 3UVTA 2L59A 2HLSA 3KIJA 1O73A 1A0FA 2H72A 4J57E 1URMA 2VCVA 1A23A 3KZQA 4CW9A 4DVCA 2GVPA 2H70A 5D73A 3G9BA 3ZIVA 1O81A 3AY8A 2LTKA 2VM1A 2HZFA 2VD1A 4ML1A 2VCQA 5G30A 8GSSA 2REMA 1XW9A 4HS1A 3HZ4A 2GQKA 20GSA 4K7OA 1SKSB 2F8AA 5DQSA 1CQHA 4O92A 4K8MA 5D8IA 2OADA 2LJAA 2GSRA 4MABA 2CAIA 2H6YA 4NAXA 3BCIA 1Z5YE 3KH9A 3EU3A 4ZL8A 4GCIA 4IHUA 1VF1A 2XC2A 4KNDA 3DVXA 3DD3A 2TRXA 3IAS2 3IV4A 2F8FA 1TKDB 1O8WA 4WF4A 3GKNA 22GSA 5DJLA 3CSHA 1EEMA 4PX1A 1HQOA 3HHVA 2OBKA 2AUVA 4NPBA 5D9WA 2A2RA 3G7IA 2PERA 1K3LA 2DJKA 2GSTA 2M66A 1AC1A 2VM2A 2HSHA 1FAAA 4XTSA 3M9JA 2H74A 3UBKA 2L4QA 2GT6A 2PPTA 1ZYEA 2VCTA 4L5LA 4Q5RA 4AJ7A 2YWIA 2HZEB 2YV7A 1YQ1A 3L9VA 4PQIA 3HZ8A 1WPIA 3C1SA 4XS4B 4HU7A 6GSVA 3E0UA 3TGZA 1SENA 1XIYA 2TRCP 4V1Ap 3F9UA 1G6YA 1VF3A 1EZKA 2FWFA 5DAKB 3APOA 3H93A 4PQ1A 1V58A 5DVBA 1PKWA 4JR6A 4XRAA 2GDRA 2YWOA 1ZYQB 2R37A 3EWLA 1B9XC 4MP4A 1BAYA 1OE8A 1RW1A 1AIUA 2RM5A 4GF0A 3ME8A 3GN3A 3GX0A 1ERVA 2DMMA 3J7Yk 4RQXA 4NWYA 1XW5A 2YV9A 3D0ZA 1BG5A 2B7KA 3IDVA 2LKUA 4KCEA 4EC0A 3TKPA 2DIZA 3IC4A 3FY7A 2QC7A 2IN3A 3M3MA 1FW1A 5ECPB 2VL2A 5ECNB 1X9WB 2LSTA 3ZFLA 1AUCA 1GSDA 2KP1A 2GZZA 2V2GA 1SJIA 5ENUA 2PWJA 4WEYA 4BVXA 4N0ZA 3CTGA 4I8BA 4RQRA 4K0GA 5IMDA 3WD6A 2C0DA 3C8EA 5DBQA 1O7UA 2FGXA 2A4VA 2DIYA 2B3SA 4ACSA 4E8EA 1X9MB 1XWCA 4YQUA 1MDKA 4XHMA 2P5QA 1A2LA 5DQYA 3DIEA 4RUVA 5KN3A 2YWMA 4K7IA 1RQMA 3NOFA 4ZB6A 5B8AA 5HR0A 2KHPA 1YF1A 2H73A 1SD9A 5KN1A 5HR2A 4KCAA 2H75A 1K3OA 4QL9A 2ZUPA 3CSIA 4K7NA 1LBKA 5GAPD 4O7HA 2J23A 2O89A 3I6AA 4K1FA 1Q4JA 1ST9A 4GTUA 5H5RA 4KX4A 5DJMA 3FZ5A 5A4WA 4MF5A 3TOUA 1XZOA 3LG6A 6GSSA 2GQLA 2N5AA 2XBIA 5JCWA 3TJFA 4PUFC 2LNSA 4HI7A 1PN9A 1GWCA 4JBBA 1KNGA 1QGVA 1TTZA 4OO4A 2PGTA 1J08A 1A8LA 2VD0A 1GSEA 3GMFA 1M99A 4G10A 3ZYWA 2H8LA 1QXHA 1G7DA 3HY2A 5LNKe 2VIMA 2AHEA 1XWKA 3BJ5A 2IWTA 1EGRA 1SK2A 3HVSA 3M0FA 5JWRB 3A5WA 5J9CA 3ZIJA 3LSZA 5A4UA 1Z6MA 3ISOA 5IM9A 1K0AA 3ZITA 4IVFA 1G7EA 1MD3A 1AQXA 2P31A 5JCUA 2VLUA 3FZ9A 2HFDA 2RUFA 3LXTA 2LUSA 2JL4A 1K0BA 4ID0A 4HDEA 3CMIA 1JLVA 4MJBA 2WULA 2HZEA 1T4ZA 2FA4A 5JWQB 4TOPA 3CXGA 2JACA 3WYWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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