2C1YA

Structure of pdi-related chaperone, wind mutant-y55k
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
TCTGCVDLDELSFEKTVERFPYSVVKFDIAYPKGEKHEAFTAFSKSAHKATKDLLIATVGVKDYGELENKALGDRYKVDDKNFPSIFLFKGNADEYVQLPSHVDVTLDNLKAFVSANTPLYIGRDGCIKEFNEVLKNYANIPDAEQLKLIEKLQAKQEQLTDPEQQQNARAYLIYMRKIHEVGYDFLEEETKRLLRLKAGKVTEAKKEELLRKLNILEVFRVHKVTKTAPE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Elucidation of the Pdi-Related Chaperone Wind with the Help of Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords WINDBEUTEL PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Drosophila melanogaster
total genus 71
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07749 ERp29 Endoplasmic reticulum protein ERp29, C-terminal domain
A PF07912 ERp29_N ERp29, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1150.12 Mainly Alpha Up-down Bundle Endoplasmic reticulum protein erp29 Endoplasmic reticulum resident protein 29, C-terminal domain 2c1yA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2c1yA01
4WXTA 1Y25A 5IMVA 1GUKA 1GTUA 4YQVA 3OR5A 5E59A 2H73A 2K8VA 2C3NA 1K0NA 4PQHA 1K3OA 1SKWB 1W4VA 5JCWA 2R4VA 2OACA 1T8EB 3HZ4A 1RW1A 2MBTA 1YQ1A 5ABRA 2A2SA 4OFTA 5HR3A 1ZYQB 3KP9A 1Q4JA 3A5WA 3RAZA 4MDCA 3DWVA 3C73A 3ZLPA 1XZOA 2LJAA 2TIRA 2OBIA 3IAM2 3CXGA 2YWMA 5DAKB 1SYXA 2FY6A 3UBLA 1UN2A 1EEMA 1SKRB 3GKMA 3GURA 3QAGA 5D9XA 1TRWA 2VLVA 3UARA 2WULA 1HYUA 3KCMA 3LWAA 5G31A 4MABA 3IBHA 1PL2A 3F3QA 3DVWA 4KSMA 4ML6A 3CBUA 3HY2A 5DCHA 4JE1A 3IV4A 3C1SA 2L6DA 5CO3A 1OE8A 1YEXA 1C72A 3TJBA 1O85A 5ELAA 2RUFA 3M8NA 1M9AA 1Z6NA 5AN1A 4AJ8A 1F2EA 3F4SA 3VWXA 1YF0A 4ZBDA 3TOUA 3M0FA 14GSA 2R5GA 4NPBA 5A4VA 4ECBA 3FY7A 1AQXA 3H8QA 1K0OA 1MD3A 2WGRA 1Y6EA 3GUSA 5JWRB 4K7IA 2KUCA 4KDUA 1EV9A 1F9MA 2LEGA 3TJGA 5DVBA 1E2YA 3M1GA 2CT6A 6GSYA 1BX9A 4X43A 1WE0A 4PURA 3QDNA 3J7Yb 3ZZXA 4WF4A 4JR4A 4DEJA 5G1KA 5EY6A 4XCSA 1GSYA 2CVKA 1MDKA 1HNCA 4L0UA 5GAPD 1GLPA 5A5KA 1RK4A 3ZFLA 3VI5A 1PL1A 5FWGA 1XVWA 2K18A 3UJ1A 1WOUA 2FCHA 1K0AA 1XCCA 4L5OA 1GRXA 2FGXA 1GULA 3GH9A 2JSZA 3VPTA 5L71A 2M72A 1TK5B 1SJ6A 4PUFC 1TRUA 1O6JA 3LORA 2V2GA 2VO4A 1K3YA 1JZOA 1T4ZA 2VL2A 2YANA 3UMAA 2BMXA 2B1LA 4BL7A 2L59A 2B7JA 1S3CA 2LJKA 6GSVA 2REMA 1BJXA 3TDGA 3TRQA 1KBNA 4EF0A 4K6XA 1Z6MA 1EZKA 5LD0A 1TTZA 3M3MA 7GSSA 5J5NA 4ZBAA 3HHVA 1XW9A 2DJ1A 3QOUA 5ID2A 1R7HA 3GKKA 3L0HA 3TJKA 5KN3A 1V9WA 4BPYA 2H0HA 4K8MA 4PNFA 4EXJA 1FG4A 2I81A 4NWYA 1YZXA 2VLUA 4GRFA 5IIZA 4TW5A 5ENUA 4E8HA 3UBKA 2E2GA 1TI1A 3L4NA 3D21A 2X64A 5JCGA 2VCQA 1O8WA 5H5RA 1R4WA 1F6MC 2GT5A 2YWOA 1QK8A 1U6TA 3VI7A 2H1DA 5G30A 4ZIJA 1O7UA 1TU7A 3RBTA 4HI7A 1O81A 3D4MA 4MPGA 5AGYA 1A8LA 4TR1A 2VL9A 1XWAA 2C3QA 2R2JA 2RUEA 4KAEA 2LNSA 5F07A 3TOTA 4GSSA 2DMLA 5G5EA 2H70A 4JBBA 4WBJA 4GSTA 2GS3A 1B8XA 4HQSA 4IP1A 3N9JA 2HZEA 1K0DA 2L5OA 1EP8A 2VLTA 4IJ3A 3LSZA 2H6XA 4E8EA 1PMTA 2YNXA 1PX7A 3UIWA 5IQYA 2LRTA 1FVJA 1AXDA 2F8AA 4K0NA 4KDXA 3RPNA 2IMIA 3ERWA 2O8VB 5DDLA 5GZZB 1BEDA 2YCDA 2PN8A 1V58A 5IO2A 5GSTA 2GQLA 4KNDA 1EGRA 3CSHA 3NOFA 3R2QA 2H6YA 1X5DA 3I43A 2DIYA 4F03A 3G7JA 3DYRA 2F51A 3QFBC 2HXKA 4MCUA 2XC2A 3HXSA 1YDKA 3GH6A 2FLSA 2AB6A 1DBYA 4P3YB 1GL8A 1SL0B 1XWCA 3IE3A 1QGVA 1R5PA 4ZXGA 1ML6A 4K2DA 2J23A 2QGVA 1UA5A 4MJCA 2M80A 2YPMA 3QD9A 2FHEA 2ZNMA 5GSSA 3US3A 2YZHA 1ACVA 3QAWA 4KX4A 3L9VA 4BA7A 1DE2A 2L4CA 3C7MA 3PINA 4IJIA 3U6VA 4FYUA 4GXZA 5HQPA 1WP0A 1R5AA 2XPEA 2VM2A 4ILFA 4NAXA 4K7NA 2GDRA 2GSQA 5DQSA 3M9KA 4FIWA 2DJ0A 1TJDA 2B5XA 4I97A 2H76A 1M99A 3F0IA 5IMAA 4BVXA 1TK8B 1VGLA 3DD3A 3CSIA 3MWHA 5CP1A 1BAYA 2DJKA 2E7PA 3UL3A 2VCTA 2GQKA 2R3XA 3LYPA 1GH2A 3O6TA 1PQNA 2IMKA 3BD2A 5G5FA 1DUGA 3F4TA 4X1UA 2MBSA 2GZPA 1XWKA 2AV4A 5HR2A 3VWUA 2MYGA 3DMLA 1GSFA 2KP2A 5D9WA 2L4QA 2I4AA 1NHOA 4L0WA 1G6YA 4O7HA 3P2AA 4OCEA 3GMFA 3EWLA 1AUCA 4BWSA 2IIYA 9GSSA 1OC8A 5DALB 6GSWA 2IWTA 5C04A 1NM3A 1Z3EA 4EUYA 3HKRA 1G7EA 2LJRA 2V6KA 1XFLA 2HLSA 2I3YA 1SKSB 2IFQB 2OBKA 4PXOA 3VURA 1MEKA 1AC1A 2AAWA 2VOCA 5JCUA 3QR6A 3QPMA 2C3TA 2AYTA 1PRXA 3CRTA 3H1NA 3KMOA 1PGTA 3JCML 3KTBA 1G7OA 1S3AA 2HSYA 1KEBA 3EE2A 3IPZA 2EIRA 4LMWA 5AISA 2B5EA 4G19A 1ZGNA 5H5QA 4IHUA 3A2VA 5EL8A 2CX4A 1KTEA 3GKXA 1FHEA 3GKNA 3ZREA 4O92A 2PPTA 3GL3A 1XBSA 3HDCA 4J2FA 3EINA 2J9HA 2IJYA 3CTFA 1O8XA 2A2RA 5B7CA 1U3AA 2WJUA 1GWCA 1U87A 4GSNA 4I8BA 2O87A 1YEPA 2HSHA 3GA4A 4POMA 1ERUA 4XS4B 4TRXA 2IMFA 1Z7PA 4Q5RA 2VM1A 1SK2A 1LJRA 1XW5A 3HZ8A 5ECSA 5HR0A 1O73A 3K8NA 4KA0A 2PVQA 3BCKA 3G7IA 4HUAA 3GX8A 2E2MA 1TXXA 3PR8A 1WPIA 3FZAA 3ZVJA 1WRYA 2NTOA 2H1BA 1GNWA 4EVMA 2H0IA 4K0GA 1Q98A 4J57E 4OD7A 1BYEA 5B8BA 17GSA 1VF3A 3GSTA 4PGTA 1ST9A 1YJ6A 3KH9A 3GN3A 2WFCA 2JZTA 2V1MA 3J7Yk 4IELA 3W8SA 2LKUA 5KN0A 4EE0A 3HD5A 3ZRDA 2C0EA 5HFKA 3LXZA 3GRXA 3S9FA 3E3EA 6GSUA 2H30A 4LL4B 3QCPA 4MH2A 2GGTA 1SJZA 1V57A 3ZFBA 3QAVA 1EGOA 3KGKA 3PGTA 1IYHA 2N5BA 1THOA 4N0VA 2QSIA 4WBRD 4ZILA 4RI7A 4MPFA 1K0CA 1EEJA 1YKCA 3LXTA 3UVTA 1FW1A 3E9JB 3UOMA 3TJFA 3MDKA 1GSEA 1OC9A 5IPHA 4O5RA 3A3TA 4KSOA 2L5LA 2OE0A 1ZYEA 5J4UA 3C71A 2JL4A 3VLNA 2EC4A 4XRDA 3DXBA 4TR3A 1JHBA 5IO0A 5HR1A 2VCZA 2NBSA 2X8GA 3Q74A 1F3BA 3LEFA 3TGZA 2VD1A 3BJ5A 4F82A 5J9BA 3WGXA 5CREA 4TXOA 1NHYA 2E0QA 3CYNA 4XRAA 4V1Ap 3ED3A 2CAQA 5FHIA 3IAS2 2YZUA 1XPVA 4HS1A 2OJLA 3IDVA 4EDYA 3L9UA 3Q19A 3FEUA 5ECLB 4F2IA 5ECIB 1XOBA 1B9XC 2DJJA 3QFAC 1X9WB 5HFGA 2GLRA 2F9SA 3KMNA 4NHZA 4L8EA 6GSTA 4G9HA 2HRFA 1B4QA 3TKRA 4MJBA 1MDJA 2YWNA 4JR6A 2VD0A 1SU9A 1IYIA 2RIIA 2CAIA 3IXRA 4DSQA 1LBKA 3W6GA 2CX3A 3I6AA 1PA3A 3IK7A 1B48A 4KCAA 4HOJA 1MDIA 4IW9A 3WYWA 5J9CA 2X8CA 5COHA 1T7PB 1FAAA 3Q18A 1J0FA 3FZ4A 1GNEA 2MMOA 4GQFA 4NXIA 4XIHA 2BJXA 4TXVA 1VF4A 3F9UA 4IKHA 2DJ3A 1EOGA 4OFNA 5IMZA 1PN9A 5ECNB 4H86A 4CW9A 5JWOB 3CMIA 4I5QA 1A2LA 4IQAA 4IVFA 3SWLA 2PGTA 3EURA 3W8JA 1X9MB 1M2BA 5ECQB 5IMDA 2FA4A 3I69A 3KP8A 4F9ZA 3KJYA 2FWHA 2DBCA 5E4WA 1F3AA 1GLQA 5ID2B 2C1YA 3DIEA 2HT9A 2MMZA 2WS2A 5B6MA 1HD2A 18GSA 1XXUA 2CZ2A 1GTAA 2NDOA 3KH7A 2CA8A 2H19A 1J08A 3LJRA 3KEBA 4GWRA 2FWGA 3KXOA 4I2TA 4TR1B 1A24A 1M2DA 1M9BA 5B6NA 1XIYA 4EL1A 4PQ1A 4JU5A 3HCZA 1XWGA 2CVBA 4HEA2 4ZB6A 1A0FA 3IA1A 4HU9A 2HZEB 6GSXA 5ECHB 2H1GA 3IC4A 4BVYA 3GHAA 2PWJA 3TKSA 2JU5A 3LFLA 3H93A 2ZUPA 5DJLA 4CDOA 4XS6A 5J41A 2G2QA 2VL2C 1EV4A 3EU4A 1VF1A 4K7OA 1A8YA 1EOHA 3GTUA 4GTUA 4RUVA 2PVOC 3TCOA 4DSSA 4KUNA 20GSA 1OVNA 4HZ2A 4D73A 4GCIA 5FT3A 4OMVA 2VCXA 2TRCP 4EDZA 4K9ZA 3FKFA 5EVOA 3TKPA 2ZCTA 1T3BA 2LTKA 2YOIA 4ML1A 5IM9A 3MNGA 3WGEA 1G0TA 2Z9SA 2QKEA 1I9DA 4OWYA 3GL5A 4NV5A 4ZB9A 1X5EA 3IK9A 4YQUA 5CRHA 4PNGA 3C1RA 2RM6A 1K0BA 5INYA 2V32A 3RHCA 1FB0A 3NIVA 5IOXA 4WF5A 5F05A 2H0GA 1TDIA 2GZZA 2TRXA 3I9V2 2X99A 3VWVA 3FRCA 1AQWA 4JRRA 5DALA 1FB6A 3ZITA 1XVQA 3FW2A 1QUWA 4I2UA 1PKWA 4CHSA 2K8SA 3GX0A 1H4OA 1SENA 3DVXA 3MSZA 3NZNA 1T00A 4LA1A 3TJJA 3DKSA 2DLXA 4MF5A 5ECKB 3N5OA 2KHPA 2IFQA 4RQRA 4EO3A 1SL2B 1ERTA 5AIXA 1GSUA 1PX6A 4KDYA 3CTGA 4GQCA 3ME8A 2LS5A 5G2ZA 4NHWA 2MZCA 3BCIA 4MJAA 4ZB8A 3AY8A 2O85A 1UC7A 2O89A 3P8WA 2GT6A 1TOFA 4MLYA 4IP6A 5B8AA 4AJ6A 4HDEA 3BOAA 2DJ2A 4AF2A 1TK0B 2HZFA 4ECIA 2A4VA 5D73A 4MJEA 2C8UA 1N8JA 4KB3A 3EC3A 5LNKe 4KH7A 2LSTA 4MZWA 4XS4A 3TKSE 2ES7A 12GSA 16GSA 2WDUA 3EMXA 4TR0A 3O76A 3UEMA 2V6OA 3D6IA 4MF7A 4PX1A 6GSSA 3FR6A 2XBQA 1PSQA 2B1KA 5IMFA 1GUMA 4EKZA 1XOAA 4AJ7A 2D2ZA 4POLA 5LCZA 4POBA 4OCFA 1THXA 1OKDA 3VPQA 3ZVJD 5ECMB 1R26A 2HFDA 2NVLA 4KE3A 1X0RA 1T1VA 1S3DA 2K6VA 4DSRA 1BG5A 5F0GA 1PD21 4V2LA 3WT2A 3LQ7A 2YP6A 3F63A 5DAKA 5DCGA 22GSA 4V1Ag 2R37A 2H8LA 3C8EA 4TOPA 3HVXA 4WR4A 1F37A 1SD8A 1ZCPA 3GFKA 1SK0A 4ZL8A 3ZMLA 3FZ5A 5D8IA 4GLTA 2WZ9A 1USBA 3VK9A 2GQMA 5DJMA 5JWQB 2JACA 1URMA 1TU8A 2V41A 3LG6A 2GZYA 3FR9A 2P0GA 1HNAA 2B6MA 3HJOA 4ULXA 3L9SA 1TP9A 4ZBBA 1X9SB 4O32A 3FYGA 3APSA 4AGSA 4KW6A 4WETA 4G2EA 4IBPA 1ABAA 3RDWA 2KLXA 1GP1A 4ID0A 10GSA 4QQ7A 2DIZA 2H71A 4OO4A 3U5RE 4FYCA 4OFMA 3SBCA 2B5YA 3Q6OA 1JZRA 2RLIA 4NMUA 1ERVA 3EYTA 4V2NA 2H01A 1WJKA 2HNLA 2YWIA 2H74A 2H75A 1ZOFA 4XHMA 2YV7A 2C80A 3L78A 4X0XA 1LU4A 4Q5NA 3TRXA 4IGJA 1JLWA 2GSTA 4YQMA 2JZRA 1XWBA 2GTUA 4G10A 3BBYA 1V98A 1VF2A 5F8BA 4MH3A 5D93A 3CRUA 1EWXA 3ZL5A 1QFNA 1SD9A 1HQOA 1OC9B 3D4TA 5AIVA 4ZL7A 8GSSA 2EIOA 2FWFA 1AAZA 2YN1A 2EIQA 1QMVA 1M0UA 1TRVA 1TRSA 4HJ2A 2B3SA 1A23A 4GF0A 3KD0A 13GSA 5H5SA 2YV9A 1OYJA 4FYBA 4HZ4A 2CVDA 2IMEA 5CNWA 4TXOB 5CYYA 1B9YC 3FK8A 2PUKC 5ECRB 1CQGA 3KIJA 1OE7A 3TUEA 2LQQA 1GSQA 5A4WA 2H6ZA 2PERA 4I6XA 1N2AA 2CQ9A 3M9JA 1TKDB 3H79A 3V1WA 1V40A 5CRWA 2VL3A 3ME7A 1A2MA 2VIMA 5DQYA 1WMJA 2LRCA 1SYRA 4OO5A 2ON7A 2FWEA 1I5GA 3HYPA 4POKA 1JFUA 1ZZYA 2DC5A 5IMCA 3D5JA 2M46A 5IOWA 2O7KA 4MA9A 1ILOA 1EP7A 2WRTA 2PBJA 1BQ7A 1SJIA 4MP4A 1Z7RA 4WKWA 4N11A 2GSSA 2VCWA 19GSA 1ZL9A 4HU7A 3UVHA 3KZQA 4YAVA 1GTBA 3P7XA 1WIKA 3H4KA 3IR4A 4HJMA 3ZIJA 1VRSD 2H1AA 3F6FA 2LV3A 2FUG2 4PUAA 2FA8A 2XPDA 2KP1A 2C0DA 3LGCA 1AIUA 1FVKA 1W89A 3IHQA 2VAFA 4N30A 3HA9A 2LRNA 2IL3A 4MZCA 3GYKA 3IOSA 3F4RA 3HJPA 3ZMKA 4L5LA 5CRDA 4Q5FA 3GNJA 1JZWA 3TB2A 3G9BA 4LMVA 2XBIA 3ZTLA 2P5QA 3GIXA 4NV2A 4EC0A 1OAZA 3VFIA 4DVCA 3WT1A 3MAKA 5ELGA 2I9HA 1WWJA 2OE1A 3HVVA 4YAPA 3FZ9A 4N0ZA 3LYKA 4ECCA 1U3IA 1QXHA 2I1UA 2HI7A 1T4YA 1DE1A 4RI6A 3E0UA 3QMXA 2AUVA 4KGIA 3ZIVA 1DSBA 2HRNA 4Z7XA 2M66A 4XS1A 3P90A 2H72A 3ERFA 2N5FA 3TRPA 5ECPB 1YY7A 3F8UA 1U88A 5ECOB 2RM5A 2LNTA 2L6CA 3A2XA 1E6BA 1XW6A 3EU3A 3D22A 1K3LA 2CZ3A 3APOA 1GUHA 2K9FA 3EVIA 5KN2A 2L57A 3RPPA 1J9BA 5CRGA 4F0CA 11GSA 2VCVA 3UAPA 3WGDA 4ISDA 3FR3A 3DRNA 4TN8A 4TKYA 1CQHA 5EPFA 2IMDA 2WCIA 1B4PA 1Z9HA 2P5RA 3GTUB 1RQMA 4FH8A 4DSSB 4TR4A 3O3TA 4TVEA 4QL7A 4JEDA 4D73B 2FD3A 2R6KA 4LL1B 2AJQB 2IPAA 2JSYA 3RHBA 3ISOA 1X5CA 4ECJA 1QQ2A 3DGQA 1K0MA 2PMTA 4MZBA 2F8FA 3F3RA 4YH2A 5D9VA 3ZYWA 4LLRA 1FO5A 1OC3A 4QL9A 2MMNA 4HQZA 4MK3A 2H66A 4ZL9A 4N10A 2LUSA 1TI3A 3D0ZA 2C4JA 3IRAA 2HYXA 3ERGA 1A0RP 5J3RA 4JZQA 5F06A 1M2AA 5A4UA 1Z5YE 1TW9A 2VUPA 1HNBA 1YF1A 2LQOA 1SL1B 5GAND 2N5AA 2ON5A 2ALBA 1G6WA 4V2MA 3GV1A 1AQVA 4FO5A 3CSJA 5KN1A 2G0FA 2OADA 3TKQA 2P31A 2NPBA 4IN0A 1JLVA 1AW9A 2C0FA 4PQIA 2F3MA 2OE3A 3TKSC 2GSRA 2YJ7A 1GSSA 1FOVA 4KCEA 1ZMAA 1PKZA 2YJHA 4WEYA 2KOKA 1UVZA 2B7KA 5DBQA 3EMPA 3PH9A 2OKAA 1KNGA 1SK1A 4ACSA 1NSWA 2DMMA 2GVPA 2PU9C 3VWWA 4J56E 1GTIA 4MF6A 1YKAA 2BTOT 5D96A 4IS0A 1V2AA 1JZDA 2JZSA 2AHEA 2CV4A 1A2JA 2IN3A 3DEXA 4XTSA 5D9TA 3HJMA 3F6DA 1NW2A 3HVSA 5KEJA 3A2WA 2MMAA 5HFIA 1ERWA 1OKTA 1G7DA 2QC7A 2JADA 2WB9A 4WR5A 4F0BA 4Q5QA 2FNOA 1MD4A 4RQXA 5IPGA 3G7YA 1MTCA 3FHKA 5G1LA 1M7TA 4K1FA 5C00A 4MMMA 2OA7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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