2TRC | Genus

Total Genus 49

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	49
sequence length	217
structure length	217
Chain Sequence	EGQATHTGPKGVINDWRKFKLESEDGDSIPPSKKEILRQMSSPQSRDDKDSKERMSRKMSIQEYELIHQDKEDEGCLRKYRRQCMQDMHQKLSFGPRYGFVYELETGEQFLETIEKEQKVTTIVVNIYEDGVRGCDALNSSLECLAAEYPMVKFCKIRASNTGAGDRFSSDVLPTLLVYKGGELISNFISVAEQFAEDFFAADVESFLNEYGLLPER

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure at 2.4 angstroms resolution of the complex of transducin betagamma and its regulator, phosducin. pubmed doi rcsb
molecule keywords	TRANSDUCIN
molecule tags	Complex (transducer/transduction)
source organism	Rattus norvegicus
total genus	49
structure length	217
sequence length	217
ec nomenclature
pdb deposition date	1997-01-06

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.168.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Phosducin; domain 2	Phosducin, domain 2	2trcP02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2trcP01

2A2RA 1AW9A 4MPFA 2XPDA 4GXZA 4QQ7A 4XTSA 5DJMA 2G0FA 2IMEA 5A4VA 4EO3A 1N8JA 2LJKA 2KOKA 1YEXA 3IPZA 5CRDA 3DWVA 1O85A 4EF0A 4IJIA 5H5SA 2HT9A 1ML6A 4WR5A 2FWEA 1K0CA 2V2GA 3TJFA 3LSZA 2DBCA 2VD1A 3RPNA 1Z6NA 3UMAA 1XPVA 2M80A 3IV4A 1Y6EA 4KSOA 2JSYA 3IK7A 2RUFA 4JZQA 2MYGA 3HJOA 5LD0A 1V2AA 3DGQA 3I69A 3IXRA 1EV9A 1J9BA 3UL3A 4TKYA 4G9HA 2YCDA 1BX9A 1YDKA 1F3AA 4MH3A 2MBTA 1YKCA 2R5GA 1N2AA 5KN2A 4IQAA 1QFNA 1PL2A 3PH9A 2LKUA 2DSAA 3KD0A 1ILOA 3C7MA 2FLSA 1V40A 3FRCA 2I3YA 5ABRA 3G9BA 1LJRA 4WF5A 1SKSB 2X64A 1X5CA 2MMZA 2EIRA 1K0MA 5HFGA 4FIWA 2YV9A 3CTGA 2V6OA 2GZZA 1OKTA 2X99A 2X8GA 1NHYA 3DKSA 3ISOA 1JLVA 5KN0A 3J7Yk 1MDJA 2LEGA 4ZB8A 4TXVA 2DJ3A 1F9MA 4MK3A 4AJ6A 3S9FA 2BMXA 1Z7RA 1NW2A 3ERWA 3TDGA 1DUGA 1OE8A 3UIWA 1VF3A 4ZB9A 3CYNA 1HNBA 1XW9A 5D9VA 5E59A 4HDEA 4K0NA 2HRNA 3QFBC 3GNJA 3RHCA 2P5QA 4AJ7A 1G6WA 5DCHA 2RM5A 1GUKA 1ERTA 1VGLA 5EVOA 1M9AA 5ECOB 3O6TA 4G2EA 5DDLA 2EIOA 4JU5A 1CQHA 2CA8A 1R5PA 2H1AA 2DMMA 2C0FA 2L59A 1OAZA 3BD2A 1FHEA 2P31A 2GDRA 3KGKA 3UOMA 3UEMA 1GTIA 5IMVA 1QMVA 4WXTA 2H1GA 3L9SA 3ME8A 2DIYA 2H0HA 1JHBA 2VL9A 3QD9A 4V1Ap 4PX1A 5IMFA 4KX4A 3KTLA 4JRRA 1T00A 2FY6A 2MMAA 1J08A 2G2QA 3ZLPA 5B8BA 1YQ1A 2H72A 1X9SB 2F8AA 1MTCA 2DC5A 3SBCA 3TRQA 4XCSA 7GSSA 13GSA 5F06A 2JU5A 1Z6MA 1MD4A 2HFDA 1R4WA 4EDZA 4TR4A 4PQIA 1QXHA 2K6VA 1GSEA 2F51A 3HZ8A 4NWYA 3EMPA 1OC9A 5JWQB 1TU8A 5CAXA 1UVZA 3MDKA 1GP1A 3CBUA 1BEDA 1Z5YE 5HFIA 3GL3A 2ALBA 1AQWA 1QQ2A 1AAZA 3Q18A 1SYRA 1TRUA 2FHEA 5FT3A 4ILFA 5CP1A 3FYGA 1C72A 4N11A 2FWHA 2DMLA 3HD5A 3ZIJA 4I6XA 1FW1A 2IMFA 3RAZA 4EVMA 3F3QA 1WJKA 2CAIA 2HSHA 4JR4A 4DSSB 4AF2A 4RQRA 3GH6A 2O8VB 4NMUA 1U3IA 5JCWA 1T4YA 2H1DA 4OCFA 3ME7A 3UVTA 3ZIVA 3H79A 3MAKA 2MBSA 1XWAA 2NBSA 2H6YA 1Y25A 4IP6A 2HE3A 5ENUA 5IMZA 4F0CA 3M3MA 2H6XA 2PMTA 2WGRA 4HQSA 3M8NA 1PKZA 3GL5A 1NHOA 4MF5A 2E7PA 1B9XC 4KUNA 4DEJA 3LG6A 3VPQA 4MJBA 4DSSA 2OACA 1OC3A 2NDOA 4ISDA 3VURA 2HSYA 1SL1B 5KEJA 1X0RA 1SK0A 2V6KA 4KB3A 3KTBA 1PX7A 3HVVA 2PVQA 3KH9A 1X5DA 5G30A 2IIYA 3U6VA 3M0FA 16GSA 2WB9A 3FW2A 1HNAA 1YY7A 5G2ZA 1H75A 4G19A 5HR0A 2LTKA 1F3BA 4ZBDA 3GH9A 2A2SA 3UBKA 5IPHA 3EINA 3ZFLA 2MMNA 1K0AA 1ZYQB 1EP7A 1EEMA 5DQYA 3ZMKA 3ZRDA 1X9WB 4MF7A 4XS4B 3H8QA 1LBKA 2GZPA 5D9WA 1XBSA 2H30A 1TI3A 1T4ZA 4N30A 2C3TA 3GMFA 1RQMA 4F0BA 4XRAA 5ELAA 2JZTA 1SJIA 4KDUA 1PQNA 5ID2B 1FVJA 1YF0A 1WMJA 1GSUA 1SKRB 1DBYA 3FR6A 3C1SA 3D21A 1GSDA 4WF4A 1F6MC 2L5LA 2N5BA 2B1KA 2H19A 3EYTA 4WBRD 2VOCA 1U88A 4JE1A 1ON4A 4XS4A 6GSYA 4WEYA 3VI5A 4YQMA 2C8UA 6GSVA 1FAAA 1T1VA 1K3LA 1A2MA 3HZ4A 2WCIA 4IGJA 2CZ3A 2K18A 2HNLA 5J9BA 4HJMA 5FHIA 5HQPA 1JZOA 3FEUA 3AY8A 5ID2A 1SJZA 2H75A 2TIRA 2LRTA 1GTAA 5IIZA 1JLWA 5HFKA 1BYEA 4ZB6A 5B6NA 4N0VA 3VWWA 2OE1A 1TI1A 2CZ2A 1F37A 1FG4A 2XHFA 4OWYA 1PN9A 1S3AA 2PN8A 2GSSA 3KMOA 1I9DA 4O5RA 4HI7A 3GA4A 2VD0A 4HU7A 3RPPA 3G7JA 2LQOA 2LRCA 4OMVA 1PD21 1DE2A 3CSJA 3MSZA 3DXBA 2B7KA 2CVBA 1F2EA 2DLXA 1GTBA 1M7TA 3D22A 2R37A 4PUAA 2H71A 1WOUA 2LS5A 4OO4A 5LNKe 5DAKB 5EY6A 5HR3A 2NVLA 1A8YA 2K9FA 4TOPA 5F07A 3HJPA 4X1UA 2VCWA 5JWOB 1X9MB 5ECNB 3HA9A 5AGYA 4LLRA 2EC4A 3GSTA 4CW9A 2IN3A 1H4OA 3EWLA 4TR1B 2GGTA 3C71A 1XOBA 4OO5A 5AN1A 3I43A 2OA7A 2FGXA 2H0IA 2GLRA 2LNTA 3D6IA 5DAKA 1SYXA 2J9HA 3KCMA 2BJXA 3RHBA 3KZQA 1JZDA 3CRTA 4EL1A 4ECIA 2FNOA 2FWFA 3PR8A 4ML1A 1TRSA 1M2AA 3GUSA 4EC0A 3IOSA 2N5AA 1B4QA 3DIEA 3L9VA 2VL2A 3UBLA 1QK8A 2LSTA 1KNGA 4PQHA 2WJUA 3IAS2 5B8AA 4TR1A 5ECHB 2OBKA 1AUCA 1XZOA 3TCOA 4NAXA 1FOVA 1TRVA 3QPMA 4IW9A 4NXIA 4OFMA 3QAGA 3E9JB 3APQA 1SJ6A 1V9WA 5ECQB 4L0WA 5IOWA 4KW6A 4BA7A 3PINA 5F0GA 5C00A 3WT2A 1R5AA 5EPFA 3O3TA 5J3RA 3L4NA 4LL4B 2PERA 1A8LA 2WRTA 5IMCA 1E6BA 2HI7A 1VF2A 3D4MA 1GL8A 1ACVA 2AV4A 3CSIA 4KDXA 1TK5B 2L57A 1IYIA 3TOUA 2WS2A 3ERGA 4KNDA 1K0NA 4FO5A 4LA1A 5D73A 1TU7A 1ZGNA 2KP1A 3FZ5A 5GSSA 3DD3A 3KP9A 4MP4A 2QKEA 2VLUA 1U87A 1MEKA 2H73A 2O85A 2VIMA 1URMA 3QDNA 5IMAA 4ZBAA 2K8SA 1X5EA 1NM3A 2RIIA 2XC2A 1XW6A 5A4WA 1XVWA 4X43A 5DQSA 1EWXA 4JR6A 18GSA 4YAVA 2QSIA 4ACSA 2IMDA 2XBIA 1TK0B 4P3YB 4HZ4A 3GKNA 1G7OA 2RLIA 1W4VA 2CVDA 2GZYA 3VPTA 5D9TA 2JADA 4J57E 3WT1A 1MD3A 4MMMA 4MZBA 2HLSA 3TGZA 3F8UA 4XIHA 3LEFA 3A3TA 2C3QA 5CRHA 3E0UA 1E2YA 2AAWA 3EU3A 4MJCA 2IWTA 4FH8A 4V2MA 2C3NA 4MH2A 3WGEA 1UA5A 4POBA 1M0UA 8GSSA 5D8IA 5B6MA 4I5QA 1XWBA 4IJ3A 2PBJA 4KAEA 1XIYA 4HUAA 3ZZXA 2VL3A 1FB6A 1THXA 4TRXA 1SKWB 5GAND 2VCXA 4OFNA 2GTUA 3GX8A 4KA0A 5L71A 1SL0B 5AISA 5JCUA 11GSA 1BG5A 2B5EA 2RM6A 1T7PB 3TKPA 4GLTA 1OYJA 3DVWA 2VM2A 3HDCA 1Z9HA 2HZFA 2HXKA 1YZXA 3WGDA 3GV1A 1EOGA 3VWXA 4TVEA 3IDVA 2LJRA 4QL7A 4MPGA 3LFLA 5D96A 6GSSA 2E2GA 3GFKA 2C0EA 2WFCA 3M9KA 4FYCA 4IQ1A 2CAQA 4Z7XA 1XW5A 2O7KA 3GX0A 3P2AA 4MF6A 3H4KA 1M2BA 2CT6A 2YZHA 4LMVA 3J7Yb 3QAVA 2Z9SA 2JZRA 1U6TA 3M9JA 5ECMB 2N5FA 1GLQA 3Q74A 3NOFA 3GKKA 2H76A 3ZREA 4HEA2 3EE2A 3KM6A 2L6DA 3KEBA 2CV4A 4NHZA 2IPAA 2VCTA 6GSWA 4YAPA 3GKMA 2PPTA 3GTUB 2F8FA 1SL2B 1M9BA 3A2XA 4I2UA 2AYTA 2ON5A 4Q5FA 1GSSA 2C0DA 1B4PA 3F4RA 1XFLA 4QL9A 3IRAA 3DRNA 4K2DA 3GN3A 4I2TA 3D5JA 2O89A 4ECJA 1R7HA 4PQ1A 3ZL5A 5G5FA 1ABAA 1KBNA 2GT6A 3GTUA 3UAPA 3P7XA 3KMNA 5ELGA 3WGXA 4D73B 3F3RA 1O81A 4Q5QA 5LCZA 4KCEA 4TR0A 2LQQA 4MZWA 2PGTA 3P90A 2YWOA 1BAYA 3TJJA 3UARA 12GSA 1AQVA 2REMA 2R4VA 2B5XA 4IVFA 2I81A 2C0GA 4IBPA 2P0GA 3DMLA 1GRXA 1YF1A 2IFQB 5F8BA 4GSSA 1AXDA 2C1YA 1K3YA 2H0GA 4WR4A 3TOTA 1T8EB 1XCCA 4D73A 4GSTA 22GSA 4K7OA 2YWNA 1I5GA 2ES7A 3QMXA 5CNWA 4L5OA 4HOJA 4JBBA 5ECLB 3ZVJA 3KIJA 3LYKA 3UJ1A 3ZYWA 1YEPA 1BJXA 1GUHA 2O87A 5GAPD 2YPMA 4YQUA 4BWSA 3D0ZA 3IHQA 2LRNA 1AIUA 4KGIA 4XRDA 3C1RA 3CSHA 4MLYA 1TW9A 2VCZA 3P8WA 1GWCA 2I1UA 2CX4A 1A23A 2GQMA 4LMWA 5DCGA 4XS6A 2PUKC 4KCAA 4MA9A 3MNGA 4CHSA 4NHWA 3FK8A 5GSTA 1TRWA 4ZL7A 4GRFA 19GSA 1VF4A 3GYKA 4HZ2A 5ECRB 4Q5NA 4OCEA 2HRFA 3FKFA 2GVPA 2JSZA 1AC1A 5AIVA 4N0ZA 5CREA 2DJKA 2GT5A 4PGTA 2LV3A 5IO0A 3HXSA 4F2IA 4K6XA 1WPIA 2K8VA 1JZRA 2XPEA 3PGTA 4IS0A 3IBHA 3KJYA 1EP8A 2B7JA 1XVQA 5J9CA 2DJJA 1CQGA 1THOA 1GSFA 2QC7A 3VWVA 1HYUA 5ECIB 2R3XA 4GTUA 5J5NA 4IP1A 2FCHA 2C80A 1W89A 3TKSA 4GCIA 2YP6A 5HR2A 1PMTA 3HY2A 4H86A 1USBA 1UN2A 2H6ZA 1FO5A 3FZ9A 4FYBA 1V57A 1SK1A 3BCKA 1GH2A 3HVXA 3EMXA 1ERUA 2IMKA 1EGOA 3JCML 3N5OA 3F9UA 4AJ8A 1HNCA 1QUWA 3HKRA 2OE0A 2E0QA 4MCUA 1SU9A 2FUG2 5G5EA 2VAFA 4CDOA 3FHKA 5FWGA 2ZUPA 3V1WA 1T3BA 2B5YA 4TN8A 3CXGA 1HD2A 2VM1A 1GUMA 3C8EA 4TXOB 5ECSA 1ZZYA 1SENA 2OKAA 1ERVA 3G7YA 1PKWA 2B1LA 4N10A 2ZNMA 4V1Ag 3SWLA 5INYA 2YNXA 2HZEB 3VK9A 4RI7A 2FA4A 3TKSE 4ID0A 3GURA 1BQ7A 3L9UA 2F9SA 3APOA 4K8MA 2J23A 3ZVJD 3VWUA 3TJBA 4Q5RA 4PNGA 5H5RA 5GZZB 2ON7A 3GSSA 1RW1A 3Q6OA 1PL1A 5DVBA 3HVSA 4NPBA 1GNWA 1J0FA 1QGVA 2H8LA 4TXOA 1MDIA 3TJKA 4POKA 3W8SA 3HHVA 6GSXA 1SK2A 1M2DA 4GF0A 5JWRB 1JFUA 3TJGA 2DIZA 2HZEA 2PVOC 3IAM2 2AHEA 4X0XA 3BJ5A 3TKRA 2VL2C 4E8EA 2YOIA 1EOHA 1EZKA 1TK8B 2AB6A 2JZSA 3C73A 1A0RP 2GQLA 4I97A 2KUCA 3W8JA 5CRGA 3UVHA 4ZL8A 1ST9A 3ZFBA 4J56E 3A5WA 1OC8A 3IC4A 4XHMA 4EXJA 1EEJA 5J4UA 3A2WA 4IKHA 1O73A 4ECCA 4K9ZA 3ZTLA 1A24A 2YJ7A 1ZOFA 2YJHA 2AUVA 5COHA 5IMDA 5IM9A 3RDWA 1XWKA 4I8BA 5IO2A 1K3OA 3WD6A 2M46A 2GSTA 1K0DA 4YQVA 3A2VA 4BPYA 1RK4A 4V2NA 2FWGA 2L5OA 1PX6A 3OR5A 1EV4A 5IQYA 4KE3A 3BBYA 2KP2A 1MDKA 4MZCA 4POMA 4DVCA 1OVNA 3VI7A 17GSA 3TRPA 4OD7A 4PNFA 1B48A 2P5RA 1XXUA 3EVIA 3VFIA 3VLNA 2X8CA 2CQ9A 2V32A 2NTOA 5DALB 4F9ZA 4IHUA 2GSRA 2X8HA 4NV2A 3D4TA 3ZITA 1GLPA 5G1KA 1O8XA 2L4CA 3QFAC 1GNEA 3QAWA 6GSTA 5IPGA 2YN1A 1KEBA 3MWHA 2XBQA 3IA1A 2H70A 1O7UA 1ZMAA 2H01A 4ZL9A 3F0IA 4PUFC 3LQ7A 4WETA 4BWQA 3CRUA 5DALA 3QR6A 1OC9B 3IE3A 1OE7A 5CO3A 3W6GA 3QOUA 5KN1A 2A4VA 3FR9A 4FYUA 2LNSA 1S3DA 1TP9A 2PWJA 3EU4A 4JEDA 3QCPA 2YWMA 1K0BA 1NSWA 5F05A 4RQXA 3APSA 4GQFA 1VRSD 1G6YA 3L78A 1FB0A 3CMIA 3LGCA 4L8EA 2B6MA 5CYYA 2MZCA 3KXOA 5J41A 3L0HA 3H1NA 3F4SA 1O8WA 5D9XA 2DJ1A 4V2LA 3K8NA 4ULXA 5AIXA 4ZBBA 3H93A 2H1BA 4WKWA 4O92A 1HQOA 2QGVA 3F6FA 1AQXA 6GSUA 4GWRA 3EC3A 2KHPA 2V1MA 2LJAA 2WULA 2VLTA 4K1FA 2C4JA 3BOAA 5C04A 4EUYA 3F63A 1Z7PA 3BCIA 5KN3A 2V41A 3LXTA 3HYPA 4OFTA 3FY7A 1B8XA 1OKDA 1PRXA 4LL1B 3TB2A 1GSQA 1U3AA 2AJQB 2DJ0A 3N9JA 3G7IA 2VO4A 1K0OA 5E4WA 4RUVA 3E3EA 4RI6A 3LWAA 1IYHA 1S3CA 3HJMA 2H66A 5B7CA 2WZ9A 1KTEA 2R2JA 1V98A 2OE3A 1TTZA 4K7NA 4K0GA 5ECPB 1V58A 2M72A 2LUSA 2WDUA 1SD9A 1PGTA 3Q19A 4HJ2A 2IJYA 3ED3A 4BVXA 5G1LA 3U5RE 1GSYA 3ERFA 3F6DA 4KSMA 4K7IA 4YH2A 1WWJA 1GTUA 4EKZA 2YWIA 4KDYA 2GS3A 4G10A 5JCGA 2E2MA 2CVKA 4HU9A 2VUPA 4ML6A 5HR1A 3DYRA 2GQKA 4IELA 4XS1A 4PURA 3TRXA 4GQCA 4L5LA 1PSQA 5H5QA 3NZNA 4GSNA 3FR3A 3R2QA 2H74A 2L6CA 3RBTA 1ZL9A 1TJDA 1XWGA 2MMOA 4EDYA 4PXOA 3F4TA 3FZ4A 1LU4A 5ECKB 1WP0A 2IFQA 5CRWA 1TKDB 2B3SA 2EIQA 4NV5A 2FD3A 3O76A 1DSBA 3IR4A 4TW5A 4BL7A 1ZYEA 4J2FA 5A5KA 2L4QA 2RUEA 5A4UA 4MJAA 2TRXA 3GHAA 1FVKA 2PU9C 2D2ZA 3M1GA 4ZILA 2I9HA 1DE1A 5DJLA 3DVXA 1YJ6A 4MJEA 4BVYA 3GIXA 2HYXA 2VCQA 2TRCP 1Z3EA 2F3MA 4AGSA 2OADA 4HQZA 5D93A 3IK9A 1WE0A 1YKAA 1M99A 1GULA 4MABA 4MDCA 9GSSA 3TUEA 4O7HA 2IMIA 2OJLA 3KH7A 4ZIJA 3CTFA 3LXZA 2I4AA 4ZXGA 4O32A 1ERWA 2CX3A 2YANA 1A2LA 3KP8A 4ECBA 1WRYA 1TOFA 3EURA 2YV7A 5G31A 2JACA 2BTOT 3NIVA 1B9YC 3I6AA 1TDIA 5DBQA 1XWCA 2DJ2A 4WBJA 1G7EA 4DSQA 4EE0A 5IOXA 2R6KA 3HCZA 1Q4JA 5EL8A 1O6JA 1Q98A 1XOAA 1A0FA 1SD8A 1ZCPA 3DEXA 1JZWA 3FZAA 3GKXA 2NPBA 4KH7A 10GSA 4POLA 1EGRA 1A2JA 1PA3A 3WYWA 3LYPA 1R26A 3LJRA 1UC7A 2GSQA 4E8HA 1TXXA 2YZUA 20GSA 2JL4A 2ZCTA 2IL3A 3TKSC 4F03A 4L0UA 3I9V2 2FA8A 2OBIA 4DSRA 3LORA 4F82A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2TRCP

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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