5DMZA

Structure of human bub1 kinase domain phosphorylated at ser969
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
349
structure length
339
Chain Sequence
NFIVGNPWDDKLIFKLLSGLSKPVSSYPNTFEWQCKLPAIKPKTEFQLGSKLVYVHHLLGEGAFAQVYEATQQKFVLKVQKPANPWEFYIGTQLMERLKPSMQHMFMKFYSAHLFQNGSVLVGELYSYGTLLNAINLYKNTPEKVMPQGLVISFAMRMLYMIEQVHDCEIIHGDIKPDNFILGNGFLEQDDEDDLSAGLALIDLGQSIDMKLFPKGTIFTAKCETGFQCVEMLSNKPWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGECKPEGLFRRLPHLDMWNEFFHVMLNIPDCHHLPSLDLLRQKLKKVFQQHYTNKIRALRNRLIVLLLECKRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Role of Intrinsic and Extrinsic Factors in the Regulation of the Mitotic Checkpoint Kinase Bub1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 339
sequence length 349
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.286.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 5dmzA01
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5dmzA02
3WF5A 3AGMA 4UMRA 4S31A 4OLIA 3AT4A 4F65A 1S9JA 3TWJA 3GI3A 2ACXA 4XG2A 2ZMDA 3CQUA 4O2PA 4AQCA 3KCKA 3QKLA 4WUAA 4Z7HA 1KV2A 3PJ3A 3UPZA 5AP2A 1Q62A 3PSCA 3QHRA 5BVWA 2EXCX 3JY9A 1OIUA 4DH5A 4RFZA 1IA8A 3BELA 4BHZA 3OZ6A 4QMPA 4IEBA 2ERZE 4W4VA 5CQWA 3MN3A 1PXKA 3PZEA 4QP1A 3UG2A 3AMYA 4IZ5A 2R3PA 3T9IA 1WCCA 4WRSA 1ZARA 4FV8A 3UZTA 3CY3A 3DJ7A 3HV6A 4YLJA 3WZJA 2FYSA 3LCTA 4USFA 1CM8A 2A1AB 5L2QA 3OF0A 4S2ZA 4BBMA 4EC9A 5DR2A 5GJGA 4FKIA 3LW0A 1JSVA 3KRRA 3WIGA 5AUUA 2UZBA 4PP9A 1SNXA 2LGCA 3FYJX 3Q32A 4I92A 4BBEA 2X7OA 4FZDB 4RJ3A 4UMUA 3WI6A 4IWQA 5BVFA 1CDKA 4FV4A 3MFUA 4AW5A 2I40A 4JBPA 1M52A 2XNBA 2OBJA 4YUQA 3AGLA 4DITA 4XV1A 5CZIA 3FLNC 4EQUA 5G1XA 3AD6A 4FBXA 4I5CA 5M44A 2ZJWA 3V5PA 2UVXA 5E7RA 4BWXA 3MGYA 3KF7A 3F7WA 3F5PA 4GT4A 3KK8A 4MQ1A 5HNBA 3U87A 4CZYB 2BDJA 3MTLA 4FKUA 2G01A 4YZ9A 3R8LA 3TI1A 3UQCA 2VWZA 1AD5A 4QP8A 3G5DA 4FL1A 3PSBA 3U6JA 4BCIA 3QCXA 4G6NA 3DTWA 2W9ZB 3I6UA 4FOCA 4IJ9A 4RX7A 3ZLYA 3DY7A 4J7BA 2BAJA 2DQ7X 1AGWA 4TNBA 3GCVA 4FTLA 4AT4A 4EKLA 1QPCA 4L6QA 4Z9LA 2X8DA 2R3JA 4G9CA 1IR3A 2BHEA 4C0TA 5HG5A 4CEGA 3MIYA 3PLSA 3HP5A 4G3GA 4ACDA 3BHVA 3Q52A 2OF2A 2GCDA 4XG7A 4O91A 3RJCA 5CAUA 2JBOA 3KU2A 2XK6A 3UP7A 3ZXTA 5CSXA 4G2FA 3S95A 3FQHA 4FTUA 4FV7A 4JQ8A 5A6NA 4HVHA 3TCPA 3KULA 5A9UA 2J9MA 3IGOA 5BX0A 2BZKB 3BRBA 4A9SA 2GNIA 3AXWA 3LCSA 2IZSA 5IUGA 1XBBA 1Y8GA 2JIVA 4TYGA 5J1WA 2OFVA 5HG7A 3OTUA 3VQUA 3PIYA 1P4OA 4EH8A 3D7ZA 3P1AA 3DK6A 3ZU7A 2WQEA 3GC9A 2R0IA 1Q8UA 4DFXE 3CIKA 2WTCA 2JFLA 2PE1A 4CZUA 1PXIA 3CXWA 3EYHA 2WTKB 4F6UA 4J8MA 2WTVA 4NCTC 4RIXA 2JDVA 3MA6A 4WHZA 3D4QA 2GS6A 4RLLA 4YJSA 5AR2A 5JSMA 3OBGA 3NW7A 3D5XA 1YXVA 3BU6A 3DB8A 3L9NA 5FTQA 3FZRA 4TTHB 4FG9A 4J97A 5KE0A 5CU0A 3MPMA 3L8SA 4ALWA 1JPAA 2Y9QA 3OTVA 4GCJA 3Q4TA 1F5QA 5EOBA 2Q0BA 1TVOA 3QWKA 3CS9A 2R7IA 1H08A 1UNHA 3G33A 5E8SA 2QOCA 3AT3A 3QKKA 5I3OA 3IOKA 2H8HA 3U6HA 5ANGA 4I21A 4EHZA 3WF6A 2W4KA 5ICPA 4F64A 3GVUA 3NR9A 3A4OX 3ANRA 4OBPA 4OT6A 3LJ0A 5JGDA 1CKPA 4JBQA 4GIHA 1JVPP 4IWPA 4MD8E 5EYDA 5AUZA 5CENA 4AOIA 5CNOA 3I6WA 2PZRA 1WVYA 2OW3A 2BR1A 3BE9A 3E93A 3SXSA 3W18A 4DFLA 5JFVA 2WMWA 4M68A 3F3ZA 4NK9A 4YZBA 3PP1A 5KCVA 2X0GA 4QMVA 3NCZA 3OHTA 2YIRA 4CRLA 3M11A 2C1AA 1H07A 4LRKA 2R7BA 3P9JA 4EI4A 4B6LA 1EH4A 1OL6A 2XK8A 5L8KA 4W8EA 3AC5A 4MBJA 3VBQA 2JD5A 4IX5A 4IMYA 2UZLA 5CWZA 2HWPA 4N6YA 5KMNA 3VVHA 3FWQA 4ZK5A 3LE6A 4DH3A 4AN3A 3PPZA 1Q3WA 2EB2A 1LEWA 4II5A 2OU7A 3Q9YA 4ZEGA 1ZYSA 4QP3A 4Z7GA 2GNLA 1GY3A 3UPXA 1OKVA 5IUHA 1UWJA 3KL8A 2YABA 4H1JA 1OIQA 4O6LA 3UMXA 1W84A 3R8UA 2WMQA 4FZ6A 4USDA 1DI9A 2XM8A 2ZM1A 4IZYA 4CRSA 4U3YA 4AZWA 1JNKA 3P0MA 5JEBA 1ZLTA 3E3BX 5BVDA 3PYYA 5FG8A 4FTIA 3CP9A 3IDBA 3B8QA 4JG7A 2PVLA 5HNIX 1KOAA 3MPAA 4FV5A 3TG1A 1Y57A 2HXLA 4CD0A 2HY81 4YPDA 4B0GA 4IB3A 3FMMA 1XH6A 4QMYA 1PJKA 1DM2A 4DLIA 5KMJA 4UZDA 3HA8A 2CGWA 4DFZE 4FI1A 3Q04A 4QYFA 3AG9A 4FK6A 4TYJA 5JZNA 1DS5A 2J5FA 4F9WA 3DKOA 3PPKA 4W4WA 3PVBA 3R30A 3EHAA 3ENMA 2XZSA 4IFGA 1Q61A 4RC4A 5L8JA 3BZ3A 2XBJA 4NTSA 4DEGA 2QHMA 3OCSA 4S32A 4U9AA 3ZBFA 1URCA 2WB8A 5CANA 5EI8A 5TOZA 4RT7A 2XNMA 4Y83A 2J0KA 3FC2A 1V0BA 5HVKA 5KBRA 3GGFA 5CTPA 3RHKA 2ZAZA 5I9UA 4X7QA 3QLFA 4PMMA 4EWHA 5A4CA 2A0CX 4YJNA 5DR6A 2R3OA 2RF9A 3LCDA 5KBQA 3QU0A 3RAKA 1IRKA 3KA0A 3NIZA 3OXTA 5CEOA 1XR1A 2YITA 4ALUA 2GPHA 4FT7A 4C2WA 2OIDA 2OIBA 5J95A 4U97A 2QVSE 3ODYX 2BZHB 2GNFA 4X21A 5M4CA 4FODA 5AP6A 4FTOA 4M69B 4S34A 5JZJA 2JFMA 3FZSA 2B4SB 5HCXA 2XF0A 4AE6A 3EKKA 3DFAA 4HNIA 5CYIA 2DUVA 3F5UA 3HV3A 3R2BA 4EH4A 4ONAA 1V0OA 4V05A 1CSNA 2VTTA 4IWDA 4PMPA 4EK3A 1OUKA 1YOJA 2VU3A 2C3IB 4H36A 5I4NA 4FTCA 3QL8A 2OJGA 4IB1A 3T8OA 2R3HA 4BCMA 3RK7A 4XG8A 3FXZA 4GU9A 3H10A 3ZCLA 4EOSA 4D2VA 4ZLZA 3G2FA 5KMOA 5KNJA 3ZOSA 4O1PA 2JBPA 3B2WA 4KS7A 4DGLC 2B53A 2UZNA 4WBBB 4W9WA 2WQNA 3WF8A 3S00A 2WU7A 4D9UA 2W1DA 4ZTSA 3PG3A 4C59A 4TW9A 5F95A 2YLFA 2BZIB 3PVUA 4FT9A 3ORNA 3TKIA 2AC3A 3UZPA 5TT7A 3TZ8A 4IANA 4NH1A 2ITZA 4RJ4A 5LWNA 3EFLA 5DT0A 2EU9A 3E8EA 3OP5A 3QRUA 3R9DA 3V5WA 2HZ4A 5LXMA 4UY9A 4CKIA 3QCSA 1H0VA 4QTDA 4RIWA 5CEQA 3Q3BA 3OS3A 5HCYA 3TNQB 1UU9A 1M17A 3QGWA 4TXCA 4DG0E 3A4PA 5AA9A 3ITZA 4BCJA 3P08A 4R3CA 5FBOA 3RWQA 3B8RA 4G9RA 4XRLA 4CQGA 2VWWA 4XG9A 4UMPA 4D2SA 2QOBA 5LVMA 2W99B 4RX9A 4P5QA 3SD0A 3QTRA 2HAKA 3LFQA 5T3QA 4LGDA 5C01A 1XBAA 2VWYA 3D7TA 2B1PA 3A7FA 3TZ7A 2BTSA 3G9NA 4RIYA 3D5UA 1WVXA 3JVRA 4M15A 3P7AA 5T68A 1ZY4A 5CNNA 2ITVA 2VX0A 3Q5IA 4C4HA 3MWUA 4C35A 3VF8A 3KC3A 1NVRA 4BCKA 1H8FA 3E87A 3VUIA 3CPBA 3V51A 5KMMA 3FQSA 3IQ7A 1UKHA 4HYSA 2JDTA 4L01A 1MQ4A 1R39A 1JKTA 1GZNA 4QQJA 4CV8A 3LVPA 4G3FA 2PSQA 3HUBA 5CZHA 4ZTRA 4EC8A 1GIHA 5CU3A 5D12A 4QYYA 1OL2A 4KKEA 5LVLA 4DH8A 4DG3E 1SVHA 1KV1A 2WMXA 4CYIA 5M4UA 4PL3A 2QONA 3LHJA 5LVOA 5ITAA 4QT1A 5DBXA 1ZZ2A 1MRYA 1U5RA 1QPJA 4KBCA 4R1VA 4EYMA 2VX1A 4M66A 4YPSA 1ZOEA 2YM4A 3K54A 5KZIA 5BMSA 3QQLA 1Q8YA 4WG5A 5D1JA 5FXSA 3ZLXA 4ZZOA 2QOHA 3NSZA 5EM5A 5EOLA 4PY1A 4X0MA 2XKDA 5F1ZA 4XCUA 3OEZA 4QMUA 1OZ1A 4GW8A 3BWFA 4BKZA 2XBAA 3ZO3A 4EK8A 4MD9E 2WOUA 4IM2A 3COKA 2G1TA 3S0OA 4KIKA 4PP7A 5HOAA 3EIDA 4XH6A 3BKBA 3OD6X 1VJYA 4L42A 3QQFA 4FTQA 1IG1A 5HG9A 3HL7A 5H8EA 4L46A 4IB0A 5DWRA 3UP2A 2WTIA 4RWJA 3UIMA 4D1SA 2XA4A 2HELA 4EOKA 2C0IA 3A7IA 2OH0E 2G9XA 3NYNA 3CTQA 4W9XA 5H8GA 3DDQA 2YM7A 2ZVAA 4RA4A 3TJCA 1Y8YA 3FSFA 4FTRA 3BBTB 4GSBA 2BILB 4Z3VA 3FYKX 4GUBA 3AOXA 2JDSA 2O3PA 2PVFA 5CSVA 2WFYA 4YP8A 3A62A 4JI9A 3UMWA 4PTEA 4KA3A 4RJ5A 3LQ8A 4EUTA 2CGUA 4GIIA 4E4MA 4ENYA 3HMPA 1WBWA 4TY1A 3NZ0A 2KTYA 2YIYA 4I0SA 4QMTA 4U41A 3I0QA 4XG6A 3EOCA 3LIJA 4FUYA 5LMBA 4DTKA 4FYOA 1KWPA 3LFAA 3UC3A 3ALOA 4R3PA 4EH7A 1UA2A 5K0XA 1BUHA 1PW2A 3GU6A 4ZTNA 4E6QA 5AADA 4MXOA 4QQCA 4CZTA 3HRBA 4I6FA 4U42A 3E3PA 4H3QA 1ZYCA 4EKKA 2YACA 2QOFA 5TR6A 5DNRA 4QTBA 1HCLA 4B8LA 2V0DA 4TWOA 4DGNA 5IEXA 2FUMA 2UZUE 3DK7A 1YI3A 2DWBA 4FSZA 4YHFA 1LR4A 3ZO1A 2YERA 2QO9A 3QALE 4FSYA 4YBJA 3V01A 3U4WA 2P33A 3O51A 5CAOA 3LLTA 4HOKA 4QMLA 3P5KA 5E1SA 5CF4A 4PWNA 4CFVA 5J5TA 3MW1A 1P5EA 4NJDA 2ESMA 5E8YA 1PXPA 4P7EA 3TNWA 2YLEA 3WIKA 5AIKA 2X2LA 1UNGA 2PE2A 3EQRA 3O7LD 4AZSA 4RA5A 5A14A 2R0UA 4IWOA 5J7BA 1W83A 3PP0A 3NGAA 3OXIA 3C0GA 1B38A 3DAJA 4FKOA 2CPKE 4DEDA 5D10A 3R1NA 1PHKA 3ZO2A 5CAVA 4FT3A 1W7HA 2X6EA 3D83A 4QMQA 3W2CA 1OL1A 4NWMA 1VR2A 5CU4A 3BEAA 2A27A 4KB8A 4E5AX 3H0ZA 1RJBA 2R3KA 1CMKE 2JLDA 2FO0A 3QC4A 4GRBA 4AF3A 3R7OA 4ZY5A 3E8NA 4F08A 4MNEA 3BLQA 4CNHA 5L6PA 1H1SA 3D2KA 3VAPA 2YDKA 3LPBA 3ERKA 4QP9A 5CI7A 3CE3A 3U9NA 5HKMA 5FBNC 4N6ZA 4KAOA 5EYMA 5BNJA 2X7FA 3D14A 3BHTA 3DPKA 5D9HA 4ASEA 4X2JA 5DFPA 4RBLA 4DGOA 2QR8A 3DNDA 5E8TA 5B2KA 4AT3A 2YCSA 4CMTA 4WD5A 5ANDA 4ACMA 1SVEA 4NFNA 2Z7QA 3COHA 4YTHA 3ORIA 5EYCA 5HIBA 1TQMA 3HECA 3QXOA 3F61A 3MDYA 5AIRA 3PA3A 2XUUA 3CTJA 4D2RA 4IVAA 1SMHA 2RGPA 2VGOA 4AAAA 5M55A 4G16A 3W55A 5CXHA 5EKOA 2F7ZE 2GNHA 3LCKA 4OBQA 2PVYA 2VTJA 3VUDA 1OL5A 1I44A 3AQVA 5EI6A 4ZJIA 4JOAA 2ITXA 3ZHPC 3BLHA 4E5BA 4FKJA 4MAOA 3DV3A 2O2UA 4G3EA 2FSOX 3F5XA 1YWRA 3LFSA 2VNYA 5IZFA 4FKTA 3IG7A 4ZS0A 3R00A 4H3BA 5C8MA 3C0IA 4MYGA 4RX8A 4GL9A 4NSTA 4IJPA 4O0XA 3WARA 2XKCA 4G3DA 4ZY4A 1U54A 3EMGA 4AW2A 2B7AA 2OJ9A 3Q9ZA 3LFCA 4RPVA 4BDAA 4R7HA 3VF9A 4QRCA 1BYGA 3V6RA 5K4JA 4TYHA 3ZFYA 3UIBA 3VW6A 1QCFA 4FT0A 5HLNA 2XNEA 3WILA 5ACKA 3TTIA 2XS0A 5CS6A 2NPQA 4QNYA 5CVHA 3VNTA 4DAWA 2C6IA 5BUEA 2ZDUA 2SRCA 4AGUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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