5DMZA

Structure of human bub1 kinase domain phosphorylated at ser969
Total Genus 82
5010015020025030001020304050607080
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
349
structure length
339
Chain Sequence
NFIVGNPWDDKLIFKLLSGLSKPVSSYPNTFEWQCKLPAIKPKTEFQLGSKLVYVHHLLGEGAFAQVYEATQQKFVLKVQKPANPWEFYIGTQLMERLKPSMQHMFMKFYSAHLFQNGSVLVGELYSYGTLLNAINLYKNTPEKVMPQGLVISFAMRMLYMIEQVHDCEIIHGDIKPDNFILGNGFLEQDDEDDLSAGLALIDLGQSIDMKLFPKGTIFTAKCETGFQCVEMLSNKPWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGECKPEGLFRRLPHLDMWNEFFHVMLNIPDCHHLPSLDLLRQKLKKVFQQHYTNKIRALRNRLIVLLLECKRS

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Role of Intrinsic and Extrinsic Factors in the Regulation of the Mitotic Checkpoint Kinase Bub1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
total genus 82
structure length 339
sequence length 349
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.286.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 5dmzA01
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5dmzA02
4MQ1A 3C4XA 5BVDA 2ERZE 3EN7A 2V55A 4FC0A 3EQBA 5CSPA 3A99A 3QA0A 5A6NA 4EH3A 3TWJA 3GC7A 3WIKA 1H24A 1MRUA 4JI9A 3O51A 4GH2A 4DG3E 3IDPA 4FKQA 4X2KA 3UNZA 3VW8A 5FRIA 5A4TA 5HVKA 2WD1A 4EOIA 4DN5A 2XKEA 2J6MA 4RFZA 3VNTA 3QTXA 2ERKA 4Q9ZA 3CTQA 2OIDA 5AA9A 4C35A 2FGIA 1ZMVA 2YM4A 4IXPA 3RTPA 3IECA 5EI2A 4YC6A 5AP7A 4R1VA 3HZTA 1VR2A 4YURA 4IZ5A 2GHGA 2YA9A 3Q32A 1OIQA 4K8AA 3TJCA 4D9TA 5DIAA 2XNEA 4FG9A 5A14A 5KKRC 4LM5A 5HBEA 3OWPA 3L9NA 2WAJA 3UMXA 4BHZA 4C57A 2P2IA 4YJVA 4BL1A 2HY81 4NJDA 4A4LA 4RIYA 4K2RA 5BX0A 1BLXA 3UZTA 4FV1A 3QZIA 4RRVA 1UNLA 3DNDA 2UZBA 3T3VA 3GU5A 5HO7A 4BIDA 2JKQA 4FTQA 1B6CB 2R3MA 4I93A 2JIVA 2VTPA 2C69A 2WMQA 4KS8A 5EM7A 4UYAA 2RFDA 1WVWA 3QUPA 4F1MA 4OT6A 4IAFA 4CSVA 4OBPA 5DPVA 3PY3A 3PP1A 2BAJA 2CGWA 4ITHA 4UMQA 3D94A 4ASZA 4C7TA 3OEFX 2JC6A 5C03A 5DR6A 4BI2A 5AV4A 2UZOA 4EZ3A 3ENHA 3PPKA 3V6RA 3NW5A 2CLQA 4WIHA 4JXFA 4S2ZA 4IAKA 4XEYA 2YDJA 3GB2A 3D5VA 5HZNA 3GU7A 3PA5A 3DDPA 1ZYJA 3ACKA 3KRJA 2V0DA 2VGPA 2ITOA 3HA6A 5JZNA 5J7HA 4TN6A 4UB7A 5TOZA 4BCGA 3LAUA 4ALWA 3COIA 3GT8A 4IAZA 5L8JA 3HUBA 2EUFB 2YIQA 3F3WA 3OVVA 4YP8A 2PVRA 1OKZA 2C3JA 2DS1A 2O8YA 3GUBA 3UVRA 4YLKA 4CKRA 4ERWA 3C4ZA 3BYMA 4OW8A 4YUQA 4IEBA 4UY9A 3R7VA 3G6GA 3BLQA 3OXZA 4BCFA 4XG4A 4MX9A 3SD0A 4U81A 3R7GA 3DFAA 3MJ2A 3RK7A 3RPOA 3W18A 3VBXA 3F3TA 5LMKC 5AP1A 2IW6A 5KMNA 3F88A 1H27A 1PKGA 4L52A 4I23A 1O6LA 4G3GA 4QMXA 3IW8A 4MF0A 4EK5A 3IOPA 5CI6A 3UODA 3D14A 2OF4A 4I92A 3T9TA 4O1OA 4LRMA 3NNUA 1IRKA 2JD5A 1GIJA 1M52A 4IFCA 4JDJA 4N6YA 3D2KA 3G5DA 5CAUA 1FOTA 2H6DA 2VZ6A 4M13A 2Y9QA 2VTOA 1K3AA 4W9XA 5IKWA 4F65A 3DAKA 2PSQA 4AU8A 1YHVA 2B53A 5E92A 5LVLA 5IEYA 1URCA 5M53A 5CSXA 2A1AB 4C34A 2W4OA 4EORA 4HVGA 3LJ0A 3QQHA 4ACDA 5EH0A 1JAMA 2X6DA 2O63A 3JXWA 3QUEA 1ATPE 4RIXB 2BZKB 4EQCA 4CZYB 3QRJA 4I24A 4GT5A 4RVMA 4YTHA 2YM3A 5FM2A 4L45A 1XBCA 3WF9A 3RBWA 5J7BA 4QMVA 3GU4A 1OUYA 4FIGA 4N6ZA 4R7HA 4M15A 3ZZEA 4OTFA 3TZ8A 4PL4A 4GCJA 3ORLA 3WIGA 2J2IB 2C6IA 4CCBA 4M3QA 2BRMA 2ONLA 3MPTA 1JWHA 3ZBFA 4FSYA 4NH1A 4X3JA 3UOKA 4QYYA 5IDPA 3ZEPA 4D0WA 5HX6A 3R30A 4WG4A 4BICA 3CTHA 3AT3A 4XRJA 4NEUA 2R2PA 5EW8A 2QOKA 4S31A 3A4OX 4BDIA 2UW6A 3V3VA 3QXPA 3AT4A 4DEEA 2OJ9A 4XHKB 3KB7A 3MN3A 4O38A 4E6AA 5I3RA 3BI6A 4CYJA 3PZEA 3I4BA 2QD9A 2LAVA 3FUPA 2BRBA 4FL2A 3E3BX 3ZUUA 4DTKA 3TNHA 2ZMCA 3ERKA 1YXTA 4V0GA 3HDMA 2I0YA 4YSMA 2XK6A 3JY9A 2X81A 3LCTA 1ZWSA 4I20A 3KCKA 5HBJA 3FDNA 5CSVA 5HBHA 3CD8A 2BAKA 4TYJA 4HJOA 3I6WA 3F61A 3MTLA 3QQUA 4PDOA 5HNGA 3VS1A 3TNPC 4B6LA 4F99A 4DC2A 2UW3A 4M67A 4XP2A 3TG1A 2XIRA 3U9NA 1OIUA 4Y85A 3WE4A 3ZXTA 3OG7A 4Z16A 4P2KA 5DR9A 3Q53A 4AZFA 1U5RA 3V5PA 2GS7A 2PVFA 3R00A 4UWYA 4NJ3A 3L8VA 2QOIA 3ZUVA 3TXOA 3E8CA 2VWIA 1UKHA 4FUYA 4M97A 2FSOX 2CCIA 3IW5A 3QZGA 3WZUA 1J91A 3TT0A 2WKMA 2PE2A 2Z7RA 3A7GA 4EKLA 3U6HA 3ZUTA 1FQ1B 3R7EA 2F2UA 1LEZA 4X2FA 3PJ8A 4P7EA 4U40A 4WA9A 1Q61A 2QC6A 4ZAUA 3EL7A 2XS0A 1MQBA 3HV5A 5AR8A 1WBPA 3WOWA 4U6RA 4HVIA 3F66A 3NW6A 3LCDA 1ZOEA 4HGEA 4ASDA 2BDFA 2WIHA 5I9YA 3M1SA 1F5QA 3FLWA 3OWLA 1M7QA 3ZCLA 5EM5A 4C2VA 4FTAA 4AW1A 5HGIA 5JFSA 1JKLA 3R02A 4QMNA 5C1QB 4XP3A 4QPMA 1WZYA 4I4FA 2R3IA 3GCQA 5CXHA 5H9BA 2VTSA 4XLIA 5CAPA 5LVOA 2Z2WA 5EOBA 2XNNA 4NZWB 5EM8A 1QMZA 5DA3A 4UWBA 3EL8A 2BFYA 5ICPA 1KE9A 2VX0A 3I81A 4CQEA 3DJ7A 4I6HA 3FHRA 4AN3A 3PXZA 4JRNA 3C4WA 4PMSA 5IISA 2A19B 2W1CA 4U0IA 4RLKA 4XBRA 2YEXA 3MA3A 4E4NA 4A9UA 2OJGA 3C4EA 4L9IA 1Y6AA 5BVWA 1YI3A 1YDTE 2E9PA 3H9RA 3HRFA 4NIFB 5HG9A 4EI4A 4FV7A 3PSBA 1UNHA 4FSRA 2W1DA 1OECA 2B9HA 4EOKA 4KIKB 1KSWA 2PL0A 3UG2A 4QQJA 4IHPA 4UWCA 3I5ZA 3O7LB 4U97A 3SXRA 4RWLA 4XV9A 5LJJA 4PQNA 4U80A 4DFNA 4BWPA 1B38A 4AZVA 3DJ6A 3OWKA 1NVQA 4JRVA 3R9HA 4HYIA 3VS3A 5CXZA 4II5A 3UIUA 4YR8A 2GSFA 5AUUA 3F3UA 3OCTA 4O0RA 5KMLA 3QQFA 4PDSA 1YW2A 4W4VA 3O8TA 3V5QA 2OJJA 4F9CA 1W82A 3WZEA 4EBVA 1SVGA 3HV7A 4O96A 4BDKA 3RZFA 4PPBA 5CSHA 3DU8A 3MIYA 4FKWA 3SLSA 4LI5A 5C8KA 2ZAZA 1KE5A 3K5VA 3QX2A 4Y95A 4MNEA 5B2LA 2F7EE 4L43A 1ZOHA 2YFXA 2PVMA 4UXQA 1UU9A 2GTMA 3FLNC 5KMKA 2EWAA 3CBLA 5H2UA 4C36A 1KE7A 1Z5MA 2J4ZA 3OS3A 1WBOA 3V8TA 5M4FA 3FMMA 2FH9A 2UZLA 1RW8A 4QP4A 3FYJX 4HNIA 2ONLC 3GFEA 5JKGA 4CFMA 2YABA 1ZMWA 2BILB 4J97A 4R5YA 1QL6A 3OT3A 4FTRA 4TYHA 3R8UA 3VQUA 3NR9A 2VAGA 3FMLA 2Z7LA 4LGGA 1HOWA 3LQ5A 1CDKA 3AC8A 3AXWA 3V5WA 3H3CA 2QI8A 3EYHA 1QPDA 5CQUA 5I4NA 2XRWA 3PG1A 4B4LA 4BRXA 3OOGA 4H3QA 5E90A 5AA8A 3AT2A 4FG8A 4X2NA 3CY2A 2QU5A 3FI3A 3T9IA 4IVBA 2OXDA 2RGPA 2WU6A 4NW6A 4FUXA 1H08A 4CFWA 4WNOA 1BKXA 3HYHA 4MBIA 5EKOA 3RPYA 4O22A 2IZSA 3Q6UA 4WG3A 2ACXA 4CNHA 2VNWA 4F1OA 2E9VA 3GOPA 3PXKA 3QTUA 4I22A 5JEBA 2YJSA 4IZYA 5HE3A 3IK3A 3WF6A 4FL3A 3EQCA 4E4MA 4EH6A 4NFNA 3V6SA 3I0OA 3PVGA 5AP4A 5AR4A 3CPCA 3QX4A 5IPJA 2XK4A 3NDMA 4FGBA 2R4BA 5IA3A 1O6YA 1J1CA 4XG9A 5J1VA 3CP9A 2IW8A 3NIZA 4E4XA 4QTBA 3RAKA 3KXNA 4D2PA 4QMTA 4QMYA 4DINA 2YLFA 4CLIA 4BCNA 4DH7A 4XS2A 2PVKA 3H0ZA 2C6KA 4OUCA 4ZSEA 1KE8A 3ODYX 1RE8A 3KK8A 4ID7A 5AP5A 3DK7A 4G16A 1YOLA 5L8KA 4L67A 2QNJA 3V8SA 3D0EA 2X4FA 3HV4A 4FG7A 4AQCA 3KRWA 2R3KA 4RVLA 3ZM4A 4U5JA 3UPXA 2GS6A 4RBLA 5KE0A 3JVSA 2W1IA 2ITNA 3RAHA 4UMUA 4ZTMA 4EK4A 5AV3A 3R7OA 3BIZA 4ZP5A 3GU6A 5BUIA 2YCFA 3F5GA 4FVQA 2OG8A 3D9VA 2UW5A 3HL7A 3D4QA 5AUVA 3BZ3A 3UVQA 3BX5A 3FZ1A 2P2HA 3QTWA 5H8EA 2QHNA 2QLQA 5BMSA 3ODZX 1Y8GA 2Z60A 3HUCA 3Q9XA 4MQ2A 2OW3A 3LFEA 3DKGA 5L6OA 4AFJA 2ZB0A 3FMNA 3LLTA 5GJDA 3VS4A 2ZOQA 1Y57A 3P23A 3RZBA 2C6DA 5L8LA 1OL5A 5F1ZA 5EM6A 3ZSHA 4OLIA 3GNIB 3FI4A 2A4LA 3IQ7A 3NUYA 1Q8YA 2IZTA 2OBJA 4FEQA 4FKRA 5DR2A 2CSNA 4IW0A 3GVUA 2X2LA 3ZH8A 4J8MA 2J0MB 3EQRA 3TKIA 3VC4A 4QYFA 3S0OA 3LFQA 2R5TA 4XBUA 1FGIA 3D2IA 5F94A 4ITIA 1NVRA 4A06A 4MD8E 4CCUA 4YJTA 3EFLA 3WILA 3EYGA 3PG3A 4AW5A 4FT5A 5C27A 3V5LA 4O27B 2AC3A 4QTAA 3ZMMA 4BFMA 3O2MA 3V51A 3MDYA 2VTLA 4PX6A 5ANKA 4ZY6A 1DI8A 4PUZA 3B2WA 1GZNA 4PPCA 4AG8A 2Q0BA 4QRCA 4W4WA 1BI7A 3BV3A 4YBKA 2B7AA 2R3JA 3Q9ZA 1H1PA 1FMKA 3TZMA 3FJQE 1JSTA 1MRYA 4FT3A 2G9XA 3CTJA 4GK3A 2GDOA 3DQXA 2WQMA 1Q4LA 3M11A 4IQ6A 2C6MA 4FNWA 4B8MA 1T46A 2HOGA 4IJPA 4FVPA 1HCLA 3P78A 5CWZA 3S4QA 4D28A 5KX8A 3SRVB 4I41A 4W8DA 4BYIA 3O23A 2WB8A 2ZYBA 3EOCA 4MXAA 3VF8A 5CAQA 3FLSA 1KWPA 4F63A 3D7TB 3LQ8A 2WNTA 4S32A 4AUAA 5FDPA 2J90A 3BQCA 4EL9A 3PJCA 5GZ9A 4FMQA 4USEA 5M4UA 5KZ0A 3RPVA 3VAPA 5FP5A 4AA0A 5KMOA 3A2CA 2XEYA 2OFVA 4L7FA 4MWHA 4QP8A 3QKKA 5M51A 2HZ0A 2B9FA 4CMUA 3RJCA 1P4OA 4E7WA 1PY5A 3MFTA 3BELA 4FTJA 4PL3A 5AM6A 1QPCA 2I1MA 4I5HA 1H0VA 4PTCA 1GIIA 1XH6A 2J5FA 3DCVA 4ZJJA 2I0VA 4FSWA 4FKSA 4CFFA 4X3FB 1YWNA 2J50A 2WQEA 2VD5A 3MS9A 3Q4TA 3DOGA 2C1BA 4AFEA 2Y6OA 3OBJA 4U43A 5K3YA 5EHYA 4ANLA 2B9IA 5IUHA 4J95A 1U54A 3KF4A 4BBMA 2JFMA 4A9RA 5H8GA 5J5TA 5F9EA 4IE9A 2OIBA 3NZ0A 3FZSA 4IX5A 1Q41A 3QZFA 4IWQA 5CQWA 4D2WA 3OD6X 2UVXA 2Y6MA 3E88A 5DH3A 4ACMA 2E9UA 3MW1A 2UZWE 4WHZA 5KNJA 3AQVA 3IDBA 1OL1A 4L42A 4NFMA 3ULIA 3VF9A 4Q2AA 3PWYA 3ORNA 3VW6A 4DFXE 3SA0A 3HVCA 4FV8A 3O96A 4F9BA 3FMKA 3Q52A 4FV0A 3RWQA 4YBJA 4L7SA 2DWBA 3NRMA 4DHFA 1RQQA 4DITA 4L46A 2PVHA 4BI1A 2CKEA 5GNKA 3SQQA 5BUJA 2OFUA 2RF9A 3G90X 2VNYA 3GU8A 1UVRA 4FKIA 4YNOA 3TJDA 3KULA 3MB7A 5LCKA 1OM1A 4EHZA 5IU2A 3BE2A 2O2UA 4LOOA 1XO2B 3OBGA 3OROA 3ZC5A 3QRTA 3QRUA 4F0IA 2JKMA 3B8RA 5HVJA 3RMFA 2ITWA 3I5NA 2JIUA 5EHOA 3DK6A 4ANNA 3MFUA 5JGBA 2BZHB 3DB8A 4KS7A 3TZ7A 4DCEA 3E8NA 5E8YA 5IA5A 5HE1A 3I0QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4D1Z A;  2W99 B;  5JQ5 A;  4FRF A;  5LAR A;  5A4Q A;  2VRX A;  5DRB A;  4GVA A;  5JZJ A;  2X7O A;  4N70 A;  4DBN A;  4XV3 A;  2QOQ A;  3MI9 A;  4BDE A;  1DS5 A;  2HWO A;  3QTI A;  3FQH A;  2VWZ A;  2BZJ A;  3HKO A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 4MQ1 A;  3C4X A;  5BVD A;  2ERZ E;  3EN7 A;  2V55 A;  4FC0 A;  3EQB A;  5CSP A;  3A99 A;  3QA0 A;  5A6N A;  4EH3 A;  3TWJ A;  3GC7 A;  3WIK A;  1H24 A;  1MRU A;  4JI9 A;  3O51 A;  4GH2 A;  4DG3 E;  3IDP A;  4FKQ A;  4X2K A;  3UNZ A;  3VW8 A;  5FRI A;  5A4T A;  5HVK A;  2WD1 A;  4EOI A;  4DN5 A;  2XKE A;  2J6M A;  4RFZ A;  3VNT A;  3QTX A;  2ERK A;  4Q9Z A;  3CTQ A;  2OID A;  5AA9 A;  4C35 A;  2FGI A;  1ZMV A;  2YM4 A;  4IXP A;  3RTP A;  3IEC A;  5EI2 A;  4YC6 A;  5AP7 A;  4R1V A;  3HZT A;  1VR2 A;  4YUR A;  4IZ5 A;  2GHG A;  2YA9 A;  3Q32 A;  1OIQ A;  4K8A A;  3TJC A;  4D9T A;  5DIA A;  2XNE A;  4FG9 A;  5A14 A;  5KKR C;  4LM5 A;  5HBE A;  3OWP A;  3L9N A;  2WAJ A;  3UMX A;  4BHZ A;  4C57 A;  2P2I A;  4YJV A;  4BL1 A;  2HY8 1;  4NJD A;  4A4L A;  4RIY A;  4K2R A;  5BX0 A;  1BLX A;  3UZT A;  4FV1 A;  3QZI A;  4RRV A;  1UNL A;  3DND A;  2UZB A;  3T3V A;  3GU5 A;  5HO7 A;  4BID A;  2JKQ A;  4FTQ A;  1B6C B;  2R3M A;  4I93 A;  2JIV A;  2VTP A;  2C69 A;  2WMQ A;  4DRB J;  4KS8 A;  5EM7 A;  3B0B C; 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