5DMZA

Structure of human bub1 kinase domain phosphorylated at ser969
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
349
structure length
339
Chain Sequence
NFIVGNPWDDKLIFKLLSGLSKPVSSYPNTFEWQCKLPAIKPKTEFQLGSKLVYVHHLLGEGAFAQVYEATQQKFVLKVQKPANPWEFYIGTQLMERLKPSMQHMFMKFYSAHLFQNGSVLVGELYSYGTLLNAINLYKNTPEKVMPQGLVISFAMRMLYMIEQVHDCEIIHGDIKPDNFILGNGFLEQDDEDDLSAGLALIDLGQSIDMKLFPKGTIFTAKCETGFQCVEMLSNKPWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGECKPEGLFRRLPHLDMWNEFFHVMLNIPDCHHLPSLDLLRQKLKKVFQQHYTNKIRALRNRLIVLLLECKRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Role of Intrinsic and Extrinsic Factors in the Regulation of the Mitotic Checkpoint Kinase Bub1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
total genus 82
structure length 339
sequence length 349
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.286.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 5dmzA01
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5dmzA02
5FM2A 3Q9ZA 2R64A 2X7FA 3IO7A 3VBWA 2B7AA 2UW4A 5HG8A 4X3FB 2GNHA 2PVFA 5AP2A 4ACHA 2PVMA 3SVVA 3JYAA 4G6OA 3LHJA 3MB7A 2XZSA 2ITOA 4G9CA 4HVDA 2F7XE 2OZAB 1GAGA 2UVYA 2BR1A 4YR8A 5IPJA 3NIZA 3LE6A 4O21A 5DBXA 1KOAA 3BWJA 3EFJA 3FQEA 3KCKA 2ZV9A 3ORIA 4IB5A 4WKQA 3DOGA 4C3FA 3ZONA 4D1SA 3AQVA 3VS3A 3ZFXA 4FSNA 5CAQA 4C37A 4KSPA 4U3ZA 5KHWA 4RZVA 5AMNA 4ZY6A 2LAVA 2O8YA 2F57A 3Q60A 2XIKA 3HV3A 5EDRA 3PVUA 4FSQA 4GIHA 2YM8A 3HMIA 3P7BA 3LCDA 4CFFA 2XNEA 3A8WA 2OW3A 5A6NA 3ZRKA 1XH6A 3W2RA 3AMYA 2CGVA 5GJFA 5LMKA 3H0ZA 1XR1A 3M42A 5CVHA 4WRSA 3GU8A 1O6KA 1QPDA 5AV3A 5I4NA 3PYYA 3DS6A 4RZWA 4IJPA 3EZRA 3UVQA 3NCGA 4ZAUA 2JKKA 2OIQA 1FVRA 4I4FA 5AAFA 3CQEA 5CENA 5CF6A 3EQPA 3ZS5A 5EYKA 3TUDA 2F4JA 3D5VA 4FV2A 3V8SA 5HI2A 2QC6A 4JIKA 1VYWA 3BE9A 4YZNA 3NGAA 2PHKA 2P55A 3I6WA 1Q8WA 5AR4A 4CT2A 5HVJA 1OIQA 3ZLXA 5FLFA 4ASXA 4DG3E 5ETAA 3R1QA 1BKXA 3VC4A 5M4FA 3BCEA 3KRJA 3JY0A 2UW7A 3GENA 5HG5A 4ANNA 1Z9XA 3SQQA 1I44A 3E93A 1W7HA 3A2CA 3I0OA 3PLSA 4DFXE 4NU1A 4DGOA 3QTQA 4MXYA 5AUXA 1WBSA 3OW4A 3CEKA 4XCUA 4EHEA 3D5XA 4ITJA 3EFKA 5C8KA 3F5UA 2QR8A 4WD5A 3JY9A 5DEYA 5DG5A 5IUIA 3VUKA 2Z7SA 3P86A 4HVHA 1U54A 4I1ZA 3R1YA 4PX6A 1OB3A 1OKWA 2J5FA 4H36A 2LGCA 4WRGA 4YZMA 2VX1A 3QQJA 4DFNA 4MH7A 2F7ZE 4NFMA 4G3CA 4NT4A 1OL5A 4YHTA 2WEIA 4FF8A 4M69A 1RDQE 3EL7A 3THBA 4B6LA 4X3JA 1BL6A 4LRJA 5L3AA 3UBDA 3UG2A 5KKRC 2XCKA 4E7WA 3I7CA 4YTHA 2J5EA 4D2VA 1UKIA 4NTSA 3CR0A 3Q9YA 4ERWA 2E9VA 3FLQA 3P23A 3P0MA 3LQ5A 4U43A 3RGFA 4D28A 2VNWA 4A9UA 3OWJA 5AIKA 5I3RA 3LXPA 4RFZA 4BN1A 2C0OA 4FZ6A 1PXMA 4TN6A 5D41A 1JSTA 3SRVB 3F3TA 2UZEA 2YA9A 3CJFA 4FG8A 3LXLA 2CN5A 5BVWA 1OL1A 3NZ0A 3TZ9A 3CJGA 4B9DA 3OY3A 4YSMA 3VS0A 3CCNA 1U46A 3TKIA 2WZJA 4TWOA 4P5ZA 2YM3A 2C6IA 2PTKA 3W18A 2WQOA 1DAWA 4EUTA 3VF9A 5K5NA 4JX7A 4L3JA 2O65A 3QTZA 5HQ0A 3AC8A 4G3GA 4HCUA 5M4UA 2FSMX 3PY0A 4AXAA 2XK4A 2W1FA 2FUMA 4G5JA 2VWYA 2C68A 4R1YA 5CF5A 2XBJA 4EOSA 2RL5A 1SVHA 4JG6A 2ZV8A 2XRUA 4DH3A 3DQWA 3ZO1A 4I0TA 4YJOA 5HBEA 3QCXA 4YGAA 4A9TA 1NY3A 4ANOA 4F4PA 4GU9A 4TZRA 2ZMCA 2PZPA 2OJJA 3NCZA 2WKMA 2FGIA 1P5EA 3N9XA 5CLPA 3TL8A 4XV2A 3PA3A 5EI8A 3PJCA 4OTIA 5ETFA 2BPMA 3R9NA 4U0IA 5J79A 3TI1A 2VTJA 2YIWA 1ZWSA 2BFXA 5ITAA 4W4VA 1QPCA 4QD6A 4AE9A 3UIUA 5FXSA 3QXPA 1SNXA 1YHVA 3FKOA 2ONLA 2VO7A 3E3PA 3LLTA 5AA9A 2CDZA 1YDTE 3W16A 5KMJA 5I9ZA 1MUOA 1R0PA 3HDMA 4L44A 5HEZA 4I6HA 4D4RA 4JOAA 3VW8A 5JT2A 1H24A 2QLUA 5LXMA 4YZBA 4BDIA 2R9SA 5B2KA 4ANLA 3DZQA 4PMPA 3RAIA 2RGPA 3FQSA 4YZ9A 5EI2A 3Q4CA 5JH6A 5LWNA 4EOOA 3GC7A 3S4QA 4ZTHA 2E2BA 4QP8A 5M56A 4YBKA 4F6SA 4JT3A 2O0UA 4D9UA 2B9JA 4EOLA 2FA2A 4FNWA 2VTOA 5LVLA 4X7QA 3SOCA 3FZOA 2V55A 5AUYA 4BRXA 4JAIA 4XG6A 3FY2A 4OGRA 5KO1A 2YIQA 4YTFA 4U44A 1YOJA 5CU4A 2WMSA 5CYIA 4V04A 1YXSA 1FVVA 1X8BA 5HNGA 4AGDA 4YU2A 5IA1A 4O91A 4PMTA 1Q3DA 3E63A 2UW0A 3RNYA 2RF9A 4GFGA 4RFMA 4RIXB 3AC4A 4TKSA 3UQGA 4RVLA 3UO6A 4EZ3A 4PNKA 2PL0A 4C34A 4AW5A 5E7RA 3MY1A 5CSHA 3ZZWA 2DUVA 3CQUA 2PK9A 3R9HA 3SDJA 2ZAZA 1V0OA 4FV1A 5CF4A 4DGGA 2QODA 5TF9A 3PJ3A 4RIWB 3BLQA 3VUMA 2X2LA 3KRWA 4ZJIA 3RM6A 5FDPA 3NNUA 2VWZA 1Y8YA 4KIKA 4M66A 4FTOA 4MXCA 4R3CA 3TZ8A 3UDBA 2JAMA 3PSDA 4H3PA 3CPCA 2WGJA 2O3PA 5FTOA 5L8KA 4PMSA 3FMDA 5E8SA 5AV2A 5L2TA 5L2SA 3NAXA 4MWHA 2KULA 5M4CA 3QTIA 1TKIA 1MQ4A 4KINA 5A4TA 3GFWA 2DQ7X 3E8CA 4PV0A 3JS2A 2B4SB 4XJ0A 4RWKA 4FKRA 5DT3A 3FPQA 2KTYA 1H1PA 3ORPA 4UEUA 4DEDA 4UY9A 3RKBA 2PZ5A 5FGKA 4FA2A 1RE8A 4E5BA 1M17A 2NRYA 5DVRA 4Q9ZA 3ZLYA 4FL1A 1BMKA 1JSUA 3QUDA 4WNMA 4DITA 2YM5A 2J51A 3R73A 4FZDB 4HOKA 3FY0A 4OTWA 1UNHA 4L3PA 3BV3A 4PUZA 4XV9A 1BLXA 1R78A 2ZM1A 5H2UA 2OH4A 5HNBA 3DLZA 3R7VA 3A4OX 4FZFB 1GZ8A 4R3PA 4FSYA 4DEBA 3BIZA 3KXNA 4MVFA 4CKIA 1AGWA 4Y83A 4G34A 3TIYA 4C36A 4DEGA 3UNKA 5D12A 5H3QA 4G3EA 4ZLZA 5HICA 4MD7E 2PZIA 4TWPA 3BBWA 4QYEA 1JKKA 1GIJA 4YNEA 2ZB1A 5EYMA 5CEOA 2R0IA 2REIA 2WTCA 1PXPA 4IB3A 4IZYA 4H39A 3RK9A 4IFCA 5AJQA 1JKSA 4YLKA 1WBPA 4RBLA 3FQHA 4RVMA 1Q3WA 5CY3A 3U4WA 1G5SA 3ZRMA 4Y95A 2C5VA 3W33A 3ZM4A 1RJBA 3K2LA 3UNJA 3IGOA 4FKIA 3U9NA 4AT3A 3EN9A 3KXGA 3FMKA 5AV0A 3TNWA 3ULZA 5IA2A 3OY1A 1HOWA 3TZMA 4TXCA 2NO3A 4G16A 4R3RA 5A54A 2VTRA 3COHA 4JQ8A 4TYHB 3K3IA 4ZTLA 2HELA 1DS5A 3NYXA 4EWHA 4CMOA 5K4IA 3BU3A 1TQPA 4O0SA 4CZUA 3UP2A 5CALA 3LFSA 4EH6A 2WQBA 3TNQB 3GQIA 3HVCA 4LRMA 5KBQA 1IA8A 5JGBA 3MA6A 3OF0A 5E8UA 3P4KA 4QQ5A 4YHJA 3R9OA 1R39A 2UW3A 1S9JA 2R7BA 4IM3A 1J91A 4PP9A 2FYSA 2JC6A 2XK3A 4XV1A 4C38A 5BQ0A 5HLWA 5D1JA 5CSWA 1UU9A 1M7NA 2IVSA 2ZB0A 3HMNA 3OOMA 4D5KA 2R7IA 4A06A 3S2PA 3QYZA 3WF7A 4GV1A 2C6EA 1CSNA 1Q62A 3RHXA 2ACXA 3U8WA 3ZFMA 4OR5A 4BIEA 2QKRA 1EH4A 4U97A 4DGNA 2OJ9A 3IK3A 4QMLA 3VRZA 2QO2A 2QU5A 3CP9A 4ID7A 3VNTA 4I41A 5AP6A 4Z7HA 5DMZA 3SXRA 3OXTA 4H3BA 2ITVA 4GCJA 3LFQA 2UZVA 2QOCA 3CQWA 5ETIA 4OTHA 4ZTRA 4ZK5A 2UZBA 4ITHA 1UWJA 2PUUA 4DTKA 3LW0A 4YSJA 1F0QA 3UIBA 2BZHB 2VD5A 3F9NA 3LJ2A 4RRVA 3U51A 4XYFA 2WMVA 4BCNA 4FG7A 4K18A 4RLLA 3G90X 3MGYA 3T3VA 4LL5A 4Q9SA 4HYHA 3D7TA 3R1SA 5JGAA 4NUSA 3G0FA 2WQEA 2PE0A 3TKHA 3P7AA 1E1XA 3V6SA 1AQ1A 4FTKA 1JOWB 4BI2A 2C0IA 2FB8A 4FIEA 4TT7A 2XNNA 4UMUA 4M0ZA 2RFSA 2NRUA 4G3DA 3HMOA 4MNFA 5E8XA 4YJVA 1ZYDA 5CEPA 3I4BA 2YAAA 3IGGA 5HBHA 5K0XA 4ZSLA 3Q5IA 4JRVA 4MX9A 3E8NA 3MY0A 5CEMA 4PDSA 2BFYA 5C9CA 1PKDA 3VS7A 1ZY5A 3OHTA 3CKWA 3FI3A 3O8UA 4CVAA 5JQ8A 4QMVA 4EH3A 2UZWE 4FL3A 1FQ1B 1Q8TA 4R7IA 4ALWA 1PKGA 2HENA 2BROA 4D4YA 3EQBA 1Z57A 4PRJA 3KB7A 4GT4A 5I9UA 2XM8A 4KABA 1Q61A 2WTIA 3H3CA 5HHWA 5F94A 4C61A 3KA0A 5TO8A 4BKZA 4H1MA 5EK7A 3RAWA 3ZH8A 5GZAA 4M3QA 3PP1A 4RA5A 3R7OA 5CAPA 3FXZA 4FGBA 4YBJA 4NEUA 4O2ZA 5HIDA 2GTNA 3UO4A 4DLIA 2ESMA 4MXAA 5E8YA 2JAVA 5DR6A 4CLIA 5L6OA 3EH9A 1RW8A 4AZWA 4QMWA 2OICA 2Z7QA 3QQLA 1UNLA 4RWJA 4HYSA 3ET7A 5ACBC 5JK3A 2CCHA 3N51A 4F9WA 5DFPA 1Q97A 5AWMA 1GZOA 2HY0A 4OTPA 1YWRA 2QOHA 4LM5A 4O6EA 4PP7A 4TYJA 4RWLA 3TZ7A 2W4KA 3E92A 4UBAA 4BWKA 1SM2A 4TNBA 4ZJJA 2JFLA 3V51A 2C5XA 4L6QA 4BBEA 1VR2A 3F6XA 3OW3A 3OCSA 2ERKA 1DI9A 3I0QA 4MAOA 3W2SA 2VGOA 3F7ZA 4MQ1A 2OXYA 4E20A 3NUPA 3R7EA 5LCJA 4QNYA 3OEFX 3DV3A 3IDPA 2R3OA 4EK8A 3RZFA 4CSVA 2VO0A 4FX3A 3BE2A 4RVTA 1JWHA 5ACKA 3VBTA 3SW4A 4F0GA 3PVWA 1PW2A 4DFYA 5HNIX 4ZJVA 2AUHA 5HESA 5DLSA 5C03A 3V5JA 3PTGA 4L68A 3FSKA 2JFMA 5DR9A 3UOLA 3W32A 3KXHA 4IAAA 4IZ7A 3TV7A 4QP6A 3W8LA 1FVTA 3BQRA 3PXFA 2X6EA 5ANOA 5HU9A 4L8MA 1PF8A 2B52A 3LFFA 4AT5A 3CPBA 1QCFA 4KKEA 1OIYA 3ORXA 2X7OA 4KNBA 4R5SA 4FR4A 3A7IA 4FTIA 3SXFA 3WZUA 1PXOA 5BVFA 4RJ5A 3QTRA 5HIEA 3P08A 4G9RA 4NCTA 4JQEA 3UQCA 5HIBA 3CS9A 1Q4LA 5FG8A 4BTKA 3MFRA 3H30A 4DEHA 5G6VA 1APME 2QKWB 2PMLX 2YCSA 4HNFA 2VNYA 3DA6A 3QQUA 4EK3A 2VUWA 3E87A 2W1CA 3I81A 4UWCA 3LVPA 4QYYA 4F63A 4FUXA 2RG5A 4EBWA 3IDCA 3ANQA 4FKUA 5BVNA 5LCKA 4NWMA 1QPJA 2GSFA 2AYPA 3OBJA 4TYGA 3D7ZA 4A4LA 2B54A 5CVGA 4ZXTA 3ZU7A 1NA7A 2HCKA 4F0IA 3GC0A 4X2GA 3HV5A 5J9LA 3TG1A 2G01A 3D5UA 4C4EA 3AT3A 3TV6A 4CNHA 3L8PA 4LYNA 4P90A 3G33A 3SOAA 5AR3A 5IG1A 2BRGA 4IVBA 3DDPA 4WOVA 3MIAA 4FV3A 4MD8E 2W0JA 1H25A 4BDDA 5L6PA 4C4JA 2YM7A 2HW7A 2IZRA 1ZMUA 3R7GA 4QTAA 5IU2A 5I9WA 4DEAA 4AOJA 5KE0A 3V5QA 4L52A 2V5QA 2EXMA 4CFXA 4L00A 3MFUA 3Q32A 1KOBA 1ZZLA 2YABA 4GW8A 1GOLA 3U4UA 3LM5A 3QHWA 3ZC6A 5IA3A 4FNYA 4Q2AA 3MY5A 4D58A 2H9VA 4KIOA 3ULIA 2QO7A 3QFVA 4IM2A 4IDTA 3AOXA 3D4QA 2BIKB 4RLKA 5GJGA 5BUJA 3VAPA 4FZ7A 2X4ZA 4XH6A 2HYYA 1U4DA 4IADA 4O0WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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