4QPMA

Structure of bub1 kinase domain
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
345
structure length
329
Chain Sequence
PNPWDDKLIFKLLSGLSKPVSSYPNTFEWQCKLPAIKPKTEFQLGSKLVYVHHLLGEGAFAQVYEATQKQKFVLKVQKPANPWEFYIGTQLMERLKPSMQHMFMKFYSAHLFQNGSVLVGELYSYGTLLNAINLYKNTPEKVMPQGLVISFAMRMLYMIEQVHDCEIIHGDIKPDNFILGNGFLESAGLALIDLGQSIDMKLFPKGTIFTAKCETGFQCVEMLSNKPWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGECKPEGLFRRLPHLDMWNEFFHVMLNIPDCHHLPSLDLLRQKLKKVFQQHYTNKIRALRNRLIVLLLECKRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Substrate-Specific Activation of the Mitotic Kinase Bub1 through Intramolecular Autophosphorylation and Kinetochore Targeting.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
total genus 90
structure length 329
sequence length 345
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.286.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 4qpmA01
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4qpmA02
1XR1A 3F3WA 3BPRA 2ERKA 2C30A 4HNIA 1R1WA 3QQUA 4UXQA 4FG9A 4Z7GA 2NRYA 3CCNA 4GEOA 1KOAA 1YI3A 2VRXA 4HJOA 5HLPA 4BB4A 4Z16A 4RIYB 3VUTA 4M7IA 3D5WA 4PTEA 3TTIA 1SM2A 4G3EA 5LWMA 2PVLA 4APPA 4C4EA 3FLQA 3MY5A 4F7LA 4CFMA 3UC3A 1WBVA 4JG8A 4XLIA 4EQUA 2BPMA 5CX9A 5DRDA 4AP7A 4ANOA 4FX3A 1UA2A 4ZZMA 3S0OA 5IMEA 2YCRA 2R7BA 4AN3A 2CJMA 3DK6A 4K8AA 2UW7A 4XH6A 2B9HA 2GNJA 5BMSA 4BCNA 5TKDA 2ZV7A 5D9HA 5CYIA 2XK9A 2PTKA 5K4IA 4E6AA 3QALE 2Y4IC 4NM0A 5E90A 5EYMA 2JC6A 4KRCA 1FPUA 2PE2A 4XBRA 1GZNA 4A9YA 2OXDA 4GJ3A 4DH1A 4F9CA 4ACDA 3HDMA 4YC8A 3I7BA 1GAGA 4RFYA 1PXPA 3W2RA 3BYSA 4OTDA 4AXAA 2QODA 2JIVA 2XKEA 3Q5IA 4UEUA 2BDWA 2GHGA 4IC8A 4FV3A 1YOMA 3S3IA 4AGUA 4PPBA 3TUBA 1HOWA 5GNKA 4YJSA 3NPCA 5EKOA 2GCDA 3BLRA 3OT8A 1WZYA 2W1FA 4CKJA 1Q8WA 5IUHA 1YXSA 2NRUA 3C4CA 2HWPA 3EQHA 5B2KA 4MXYA 4L42A 4M0ZA 3HL7A 5ETAA 2UW8A 4DN5A 3D5XA 3KA0A 3ACKA 3GB2A 3QD3A 5EI6A 3R8ZA 4TNDA 3MPAA 4BZOA 1U54A 3P7AA 4FIJA 4E5BA 5L2WA 1BLXA 4K9YA 4QTDA 4JBOA 1UU8A 1YDSE 3UQGA 4LRMA 4AW1A 3Q4CA 4ERWA 2V7OA 3E62A 3P0MA 2ZAZA 4FZ7A 2XIZA 1MRVA 4I5PA 4G31A 1SVEA 4P90A 3OVVA 3LCOA 4N6YA 1H08A 2R3PA 2X8IA 2XK3A 3FMJA 3NW6A 3VS2A 4JOAA 5J87A 3V5WA 3RPOA 4X2JA 2BHHA 5HTCA 3RBWA 4XOYA 5DT3A 5HU9A 5CSHA 2FUMA 3CD3A 3FXWA 2PZPA 3LFAA 3FXXA 1PXKA 1W0XC 3WF6A 4I6FA 1FVVA 3ORNA 4C36A 3D2IA 4FKLA 5DA3A 4RC3A 4U9AA 4EKLA 3OXIA 3PXZA 4Y85A 3C4EA 3NAXA 5AV3A 3W2QA 2RF9A 3NUYA 5CSWA 5KUPA 3UO5A 3V6SA 4USFA 3CBLA 4C59A 2W4OA 2UZVA 4KBCA 1M2PA 3KF7A 2WIHA 4V01A 4B8LA 5JN2A 1NY3A 2BUJA 4YZ9A 4BGGA 4QTAA 5IEYA 3Q96A 3BGZA 3F5UA 3W32A 4DEHA 3PSCA 4U40A 3R04A 1BI7A 4XJ0A 4B8MA 1IA8A 3H10A 2YABA 3MI9A 4IJ9A 1PJKA 4P5QA 2YHVA 4WIHA 1GNGA 2W17A 4RWLA 3TL8A 4KS7A 5BYYA 1OKYA 1Q3DA 5EW9A 4EH8A 3B8QA 4JDKA 4YMJA 1R0PA 1QCFA 1PMVA 4WA9A 4CRLA 4TT7A 3POOA 4GUBA 4MXCA 4CKRA 3DA6A 5LOHA 3OW3A 2P3GX 4K1BA 4R6VA 4EZ7A 2UW9A 4L44A 5F4NA 2XRUA 3PWDA 3FMHA 5LVPA 4ZTNA 1UKHA 4FT3A 3RAHA 3JYAA 3RAIA 1K9AA 4RX5A 5IH4A 4J95A 2VD5A 1S9IA 4ASZA 3BYMA 5CXHA 5HI2A 4BCKA 4FIEA 2QKRA 2VU3A 1KE9A 1H0VA 5BVFA 4C3FA 5FBNC 4XG6A 4II5A 3KRLA 3BQCA 4FKGA 1X8BA 3AOXA 2I6LA 2RFSA 3MTFA 4GH2A 4A07A 2XYNA 1P4FA 4EH4A 4CLIA 3L9MA 4N6ZA 5AV1A 4D4YA 3O2MA 4QQ5A 5IISA 4BN1A 4H3PA 4TWPA 2X7GA 5DLSA 4D1ZA 3KF4A 4U8ZA 2R0UA 2XKDA 4J53A 4AZTA 2XK4A 4XNEA 4C33A 4R3PA 2OGVA 1J1CA 2ESMA 3I6WA 2UZDA 3WIGA 4DEEA 2DS1A 4GYGA 4AQCA 5JT2A 3PXFA 4FF8A 4OTFA 1R39A 5I9VA 1LR4A 3TZMA 5LARA 4GFMA 5CASA 2UVZA 4YO6A 4DGOA 3IW7A 3GC7A 4GG7A 2C3LA 3QTUA 2QU5A 3R7EA 2F57A 3BGPA 5J1VA 1VYWA 3Q9ZA 2UZOA 2WELA 4Z3VA 5KKRC 4AX8A 2Z2WA 4NT4A 4FIFA 4TWCA 4BICA 1CDKA 2Q0NA 4KD1A 4M68A 4XV3A 5E8UA 3ZUVA 1CKIA 2C4GA 1T46A 5AUXA 1ERKA 4AT5A 4PL5A 2JDVA 3VS4A 3R28A 4KSPA 2WQNA 4CCUA 1RW8A 1PMNA 3PYYA 2C6LA 2XIYA 4R1YA 1W98A 2B4SB 4AGDA 3EQDA 4GYIA 4F9WA 1YHWA 2WHBA 5KO1A 4F63A 3ITZA 4ZSLA 2BDJA 5AIRA 4DG0E 4TL0A 1U4DA 5A6NA 3BCEA 5HO6A 3K2LA 2OIBA 4QMOA 4AE6A 4ZZNA 3FZSA 3W2PA 3RINA 2IZUA 3P7BA 5BVOA 4YLJA 2F9GA 4CQGA 1OB3A 3IW6A 3UODA 4H36A 4FKQA 2RSVA 5F1ZA 5BVWA 5TT7A 3RP9A 3AC1A 4ZY4A 4TTHB 5L8KA 3LPBA 3BHHA 4IAZA 4AZEA 1KOBA 1OI9A 2P4IA 4AOIA 3ORKA 4BZNA 4D28A 1Q97A 2ZV2A 3UP2A 4K77A 4R5SA 3HUBA 4BCHA 4DCEA 3GXLA 2YM4A 1ZZLA 2BIKB 5ANIA 4D4RA 3OHTA 2YAAA 1ZMUA 4KRDA 3R7VA 3UG2A 4X6QC 1VR2A 5AUTA 3PRIA 4AN2A 4IE9A 3R30A 2R64A 3VBVA 3FLYA 4E4NA 4I5CA 2WTJA 2C3JA 1SNUA 3COKA 4E8AA 4ALVA 2W99B 3PPKA 2PY3A 3A4PA 1YI6A 3AT3A 5JGBA 5DN3A 1F3MC 4ASXA 4BCIA 4F1OA 3QD4A 4PRJA 3F2AA 5AV0A 4YTIA 3BYOA 3I5ZA 4DH5A 4ZY5A 1YXXA 1OKVA 5EYDA 3UOJA 4DHFA 3S4QA 2ZM4A 3ULZA 4D0WA 3BHVA 3D2KA 3L1SA 4FR4A 2FSLX 2HW7A 4TN6A 2PMIA 5JRQA 4KINA 3FPQA 4EK3A 2ZOQA 4I41A 5L2IA 1ZY4A 4QQTA 4MWHA 5HG9A 3RM7A 2YM5A 4NEUA 3EN7A 5LCKA 5T6KA 2HOGA 5TO8A 3G90X 5ANDA 3DGKA 4IBMA 1Q5KA 4JQEA 2YDJA 2A19B 3KC3A 4FT9A 5LMKA 3RK7A 5L8JA 4AZVA 3RCJA 5KZ0A 3G51A 3QRIA 4TWNA 5K3YA 5HD4A 4V05A 3SX9A 1F5QA 3MH0A 5E1EA 2QOLA 1KE6A 4YJPA 1Q3WA 2VO7A 2QVSE 1OUYA 5EDPA 2VTPA 2QCSA 3KXXA 4ZTLA 3V04A 4O91A 2VTHA 3QHRA 4XG4A 4L67A 4KBKA 3OWLA 2IZRA 4CTCA 5H2UA 3GNIB 4YSMA 1URCA 4L53A 2X9FA 2XF0A 3QUEA 1LEZA 1JSVA 3Q52A 4O0SA 2OZAA 3LM0A 3MFTA 2G2FA 3FLZA 4YTHA 3HMIA 2R3GA 4BDKA 3KY2A 4O0XA 3E8CA 2AYPA 3C0HA 3SHEA 4TKSA 1WVWA 2ONLC 2UW4A 4NU1A 4BBEA 4X2GA 2C68A 3BV2A 4QYFA 3ZLSA 4BDDA 1WAKA 3OY1A 4OTQA 1YRPA 2ITPA 2BHEA 3FKLA 4ANBA 3OTUA 3U51A 1YHVA 1W83A 5CEOA 3L8XA 3I1AA 4FOCA 5CSXA 5FXQA 4FKRA 3A4OX 2B52A 4GFGA 3LFDA 3ZSIA 2RG5A 5M53A 3IS5A 4I20A 4CZUA 5HEZA 1VEBA 4WNKA 3Q9WA 5G6VA 4FTUA 5K0KA 1YKRA 3ZOSA 4L45A 3LFFA 3SXRA 3QL8A 1YWRA 3A2CA 2QOBA 4S32A 4UYNA 2W7XA 2B54A 3WE4A 4YSJA 4WRGA 5AP4A 2WMAA 2AC5A 4ASDA 5I9YA 1E9HA 4WNOA 3QUPA 3ZFYA 4BL1A 3W1FA 3L8VA 2JKOA 2A4LA 5EFQA 3NNWA 3TIYA 4D1SA 3QXPA 1FMKA 3R9DA 5IEXA 4RPVA 3FMKA 3LOKA 3LCDA 1UU9A 4E6DA 3GBZA 4I94A 4BCPA 4EOOA 5B7VA 1QPJA 4RJ4A 5A46A 4FTLA 3HZTA 3UJGA 3GU8A 3CGFA 2YLFA 3BELA 2WFYA 3MH2A 2J0IA 3DNEA 2W1GA 3LXLA 1U59A 3OWKA 4O1OA 3WARA 3CKXA 3OWPA 5JK3A 4HGSA 3FDNA 3ODZX 4R1VA 3SXFA 4FV7A 2C5YA 4KIKA 3U9NA 4C57A 4FTNA 4DGLC 4TY1A 2PE0A 3ZO3A 3PLSA 4O1PA 1TQPA 2ZB1A 2WZJA 2RFNA 2ZDUA 4FUXA 4E1ZA 5IEVA 4I93A 2O0UA 4BDEA 4RA4A 2ACXA 3UYSA 3VUDA 2X2LA 4OBOA 1W7HA 1Z5MA 5IA1A 5DNRA 3R7UA 3UIMA 2W1CA 5EI2A 4HYIA 3KFAA 3ZHPC 4EUUA 4W4YA 3CKWA 2PMOX 2YM3A 3DJ7A 4OGRA 1U5RA 2VX0A 1DS5A 1WBNA 3OZ6A 4A7CA 3R8LA 1HCKA 2A2AA 5DGZA 3MVJA 4YUQA 1KE7A 3ETAA 3PIXA 2VWIA 4AE9A 5HLWA 4DEGA 4FV2A 1PXMA 3DKFA 4NTSA 4HNFA 4F0GA 2PK9A 4JX3A 5KHWA 1OKZA 3RPSA 2YACA 4QQCA 3SRVB 2OO8X 3BWJA 3GQLA 5HX8A 1WVYA 3HEGA 4LRJA 2V22A 2C1BA 3RHKA 3E63A 5FDPA 3EYGA 5ANKA 3V8TA 3ZC5A 4PDOA 4MF1A 3E7OA 3R21A 4RT7A 2G15A 4UB7A 2GDOA 4BTJA 4QMMA 3U9CA 4AN9A 3R22A 2YIRA 3IPHA 3QTQA 4PMSA 5HD7A 5L6OA 3MV5A 4G2FA 3P08A 5AR4A 3K3JA 4OTWA 1GOLA 1H25A 4L01A 3F3TA 5E92A 3UNZA 4APCA 3MVLA 4PPCA 3TEIA 4ZTQA 1PXIA 4ZJJA 5EKNA 5FXRA 3FZPA 2R3HA 4FA2A 3QZFA 4FI1A 2YJSA 1OVEA 3ANRA 2RFDA 3F61A 5GZ8A 4C7TA 3FHRA 4EL9A 3LW0A 3R8MA 4L3PA 3VO3A 4ZAUA 3QA8A 2JBOA 4LV5A 2R3KA 4IC7A 4Q5HA 3W55A 5C26A 2XK7A 3C0GA 3DJ6A 3U4WA 2AUHA 4C3PA 4CKIA 2R3JA 5BQ0A 4AA0A 5CEPA 1YDRE 5IH5A 4LM5A 2VX3A 4MEDA 2CGXA 2XEYA 5BVDA 2YLEA 2XYUA 4IX4A 5DHJA 3TUDA 4TZRA 4NUSA 5JKGA 4U42A 3AC3A 3MS9A 4X3FC 4E5WA 4KIKB 3MFUA 4IWDA 4S30A 4YPSA 3POZA 5L4QA 4Q5EA 4CRSA 4HW7A 4E6CA 4IW0A 1E1VA 1R0EA 3EN6A 1Z57A 2W1DA 3C5UA 4NFMA 3QC4A 3E88A 1JSUA 3CD8A 3EH9A 4EQMA 3KVXA 3LJ1A 4L52A 4UXLA 2OFUA 3NNXA 5JRSA 1WBTA 4B99A 2JKQA 4HZSA 5HE0A 2ITWA 3EQGA 3JUHA 2B9JA 2GS6A 3ZTXA 4WNPA 2EB2A 4XYFA 5D7AA 2UUEA 2ETRA 3RZFA 3NNUA 5FEEA 3O8TA 1UWJA 1GIIA 3C4ZA 4YJQA 4ZTHA 3WYXA 3CTQA 5IPJA 4C34A 4RVKA 5CSVA 2LAVA 3KXZA 3V8WA 5ACBC 2UZLA 4NJDA 4IADA 4AFEA 2O3PA 2OJJA 3DPKA 3TN8A 2ZM1A 4YP8A 1LUFA 3HA6A 4FVQA 3TV4A 4HZRA 5FTOA 2WPAA 2FGIA 2H34A 4C2WA 3RTPA 2IVSA 2I0YA 2PHKA 2JEDA 1OGUA 2UZTA 4IEBA 4EWHA 5E1SA 1B6CB 4PDPA 2BROA 2Y8OA 4HCTA 2YFXA 4IAAA 4M66A 3ZO2A 3NR9A 1LEWA 5LJJA 1JBPE 4I0RA 1XQZA 3D7TB 5JQ8A 4YNEA 5ANJA 3D4QA 2YDIA 3O50A 4EEVA 2ZJWA 4BI1A 2R3QA 4BGHA 4ARKA 3I5NA 3EN5A 1B39A 3F69A 4GV1A 2OG8A 3EJ1A 2XEZA 4D5KA 4FTOA 4IDTA 5AX9A 4C38A 4FV6A 3VUHA 5AADA 2WTVA 2XNMA 1BL7A 3FLWA 3PXRA 4OUCA 5D10A 3SQQA 4PDSA 3KN5A 4X3JA 4XCUA 5CU6A 5AUYA 4BBFA 4K11A 1RE8A 2F7EE 2W0JA 4D2WA 1M2QA 4DFLA 2JDRA 5FM3A 2XRWA 3FZRA 4DH8A 4E26A 4D1XA 5AA9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3VN9 A;  2YEX A;  2X2M A;  3L9P A;  4FTC A;  3KMW A;  3E92 A;  3UQF A;  3TCP A;  1ZYL A;  2GNF A;  3FQE A;  4IIR A;  4JL9 A;  1QMZ A;  1H8F A;  3OY3 A;  4CTB A;  5AAG A;  2XIR A;  3IDB A;  2OF2 A;  3F2N A;  2P55 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 1XR1 A;  3F3W A;  3BPR A;  2ERK A;  2C30 A;  4HNI A;  1R1W A;  3QQU A;  4UXQ A;  4FG9 A;  4Z7G A;  2NRY A;  3CCN A;  4GEO A;  1KOA A;  1YI3 A;  2VRX A;  4HJO A;  5HLP A;  4BB4 A;  4Z16 A;  4RIY B;  3VUT A;  4M7I A;  3D5W A;  4PTE A;  3TTI A;  1SM2 A;  4G3E A;  5LWM A;  2PVL A;  4APP A;  4C4E A;  3FLQ A;  3MY5 A;  4F7L A;  4CFM A;  3UC3 A;  1WBV A;  4JG8 A;  4XLI A;  4EQU A;  2BPM A;  5CX9 A;  5DRD A;  4AP7 A;  4ANO A;  4FX3 A;  1UA2 A;  4ZZM A;  3S0O A;  5IME A;  2YCR A;  2R7B A;  4AN3 A;  2CJM A;  3DK6 A;  4K8A A;  2UW7 A;  4XH6 A;  2B9H A;  2GNJ A;  5BMS A;  4BCN A;  5TKD A;  2ZV7 A;  5D9H A;  5CYI A;  2XK9 A;  2PTK A;  5K4I A;  4E6A A;  3QAL E;  2Y4I C;  4NM0 A;  5E90 A;  5EYM A;  2JC6 A;  4KRC A;  1FPU A;  2PE2 A;  4XBR A;  1GZN A;  4A9Y A;  2OXD A;  4GJ3 A;  4DH1 A;  4F9C A;  4ACD A;  3HDM A;  4YC8 A;  3I7B A;  1GAG A;  4RFY A;  1PXP A;  3W2R A;  3BYS A;  4OTD A;  4AXA A;  2QOD A;  2JIV A;  2XKE A;  3Q5I A;  4UEU A;  2BDW A;  2GHG A;  4IC8 A;  4FV3 A;  1YOM A;  3S3I A;  4AGU A;  4PPB A; 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