4QPMA

Structure of bub1 kinase domain
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
345
structure length
329
Chain Sequence
PNPWDDKLIFKLLSGLSKPVSSYPNTFEWQCKLPAIKPKTEFQLGSKLVYVHHLLGEGAFAQVYEATQKQKFVLKVQKPANPWEFYIGTQLMERLKPSMQHMFMKFYSAHLFQNGSVLVGELYSYGTLLNAINLYKNTPEKVMPQGLVISFAMRMLYMIEQVHDCEIIHGDIKPDNFILGNGFLESAGLALIDLGQSIDMKLFPKGTIFTAKCETGFQCVEMLSNKPWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGECKPEGLFRRLPHLDMWNEFFHVMLNIPDCHHLPSLDLLRQKLKKVFQQHYTNKIRALRNRLIVLLLECKRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Substrate-Specific Activation of the Mitotic Kinase Bub1 through Intramolecular Autophosphorylation and Kinetochore Targeting.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
total genus 90
structure length 329
sequence length 345
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.286.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 4qpmA01
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4qpmA02
2KULA 1DAWA 4S31A 3CY2A 5GNKA 2GS6A 2OSCA 2Y4IB 3TZMA 4FSNA 4D4RA 3MJ2A 4NT4A 5HTBA 5AV2A 4U41A 4YZBA 1XBCA 2X7OA 3QD3A 2GSFA 2PHKA 3F7ZA 3LQ5A 1OL7A 2QC6A 3NUXA 4U5JA 4GUEA 4EK8A 5KUPA 4XBRA 3ENHA 4FTOA 4FIJA 5FBNC 3CP9A 2W1IA 3F2NA 2QVSE 4LL0A 4ALVA 5JRQA 5CU6A 2QU5A 3KY2A 3GQIA 4KABA 5CALA 3L8SA 4IZYA 5AAEA 3NX8A 2W5HA 3N51A 5TKDA 4QMMA 4KIOA 3Q32A 4DH1A 1WBPA 1MQBA 4EI4A 3UQFA 2GNLA 3CQUA 4YZ9A 3I79A 4MXYA 5D7AA 4MQ1A 4CYJA 2OGVA 4I6FA 4GFGA 4DFNA 3W2QA 4D0XA 1KE6A 3HMNA 4TNDA 4HYHA 2XZSA 3SXSA 1GY3A 2XJ1A 1YWRA 3AD5A 3FZTA 4GG7A 4I6BA 4FVQA 4MVFA 4L53A 5DA3A 1VR2A 1OIRA 2FSLX 4AG8A 4CZYB 2JEDA 4A4OA 3R7EA 3RWQA 4K0YA 4IHPA 4CCUA 1E1XA 4S2ZA 3KULA 5L2IA 3U6HA 3V5PA 3E5AA 2Y4IC 3FLQA 3KVWA 1JOWB 1XBAA 3RMFA 5A6NA 4PP9A 1YDRE 4IAZA 2CGXA 3LIJA 5F95A 4X2NA 3RK9A 4QMNA 3DXNA 3G0FA 4AZFA 4O91A 5DT0A 4WUNA 4AUAA 2PMIA 3WF7A 2UW3A 3ORLA 3Q5ZA 3Q3BA 4FKQA 2VWXA 4PL3A 4DLIA 1XJDA 4W9WA 5EHLA 2UW9A 5GHVA 2R3RA 1Q8TA 2PMNX 3GCPA 3K3IA 1Z5MA 2XNGA 4GRBA 3TT0A 3ZXZA 3FAAA 3PE1A 2A27A 3S3IA 5DT4A 1K9AA 2ZVAA 3M1SA 4NCTC 5A6OA 4RT7A 3GU4A 4GYGA 3BBTB 5AA8A 3MTLA 4FT0A 3Q9ZA 2QKWB 3KXZA 4C61A 2XJ0A 4BCQA 3SV0A 2WTIA 2QOQA 4ONAA 3RNIA 3FPMA 4R8QA 4OTIA 3T3UA 2WTKB 4XG4A 5CT7A 2ACXA 1WBTA 1LEWA 1R3CA 4BKYA 3BIZA 4R5SA 4GIHA 4ZZOA 1PXOA 3ZLSA 5DMZA 4BDDA 5IUHA 1I09A 1W83A 4DFXE 4GMYA 3EL8A 4KKGA 3L9PA 4UYNA 2WIPA 3LJ2A 4RMZA 3KRLA 4BI1A 3I7CA 2JIVA 1YXSA 3PXYA 3D83A 4F0GA 3F88A 5CNNA 4OBQA 4DHFA 2PSQA 4MD7E 3BYOA 4PUZA 1U4DA 4PMTA 4Y73A 5DH3A 3WYYA 4AZEA 5K4JA 3CE3A 5HICA 3G5DA 3RM7A 5ETFA 1OPLA 3OWJA 2ZB1A 3TZ8A 5HVKA 2W4OA 4ERWA 4BTKA 1K2PA 2WGJA 2OFUA 3AD4A 3MTFA 3JVRA 4ZEGA 2C6LA 2VTTA 3VHKA 4CKRA 5FM3A 2BAKA 3UDBA 2WOTA 2XCKA 3O8TA 4IAIA 3CPBA 3UOJA 3K54A 4GK3A 5BVDA 5CU0A 4GW8A 2BILB 2VGOA 4O0WA 1WBOA 2VTHA 4NIFB 3UP7A 4GVAA 5KBRA 3FLWA 4FTUA 3NYVA 5L2TA 3OC1A 4B8LA 5BUJA 4APCA 3VF8A 1OL2A 3KEXA 1VYZA 2Y8OA 4GFMA 4M0YA 4QTBA 4CCBA 5CF6A 4Y5HA 2VX3A 2IZRA 3WF5A 1PKGA 2G15A 4EHEA 2WTKC 2E9PA 3EQHA 4ACDA 2WOUA 3M2WA 1F3MC 5LJJA 4HCVA 5IH4A 3OEZA 5IA3A 3UC3A 2JIIA 3O50A 5E1SA 4CRSA 5H2UA 4RWJA 1OKVA 5L2WA 4FBXA 3WF6A 4XJ0A 3ROCA 4LGHA 4FIHA 2UZDA 4FVPA 5AIRA 4S33A 2QG5A 5J5SA 2ETKA 1UWHA 3QZFA 3VC4A 4BB4A 3TJDA 4D2SA 1NY3A 3R7IA 2VV9A 5H8GA 3SXFA 2W0JA 3K5UA 3RALA 4EZ3A 1M2QA 4BTJA 2H34A 3DOGA 3PA3A 2QR7A 3I60A 4UMTA 2BROA 4QYEA 4O27B 4UBAA 3U8WA 2IZSA 4IZ7A 5FXQA 2YIRA 3LFEA 5A54A 3QD2B 4I22A 3QRUA 2C47A 2QO9A 5CU4A 4V05A 4FVRA 4EOKA 3P5KA 3FUPA 3QF9A 3ZBXA 2CMWA 4FOCA 1J1BA 4H39A 5CASA 3VN9A 4JS8A 4DEHA 5HD4A 3IW5A 2HZNA 5AUZA 2FUMA 4ITJA 1SZMA 4USDA 1UVRA 3LFCA 3EFLA 2XNNA 3MFUA 4A9SA 3TUCA 4MAOA 4JDKA 4YHJA 4Q5HA 4QMWA 3WF9A 4QOXA 3ZONA 4CLJA 5ICPA 4IAAA 5CS6A 5FWKK 5JGBA 2PE2A 3UMWA 2VD5A 3UG2A 3E93A 5DR2A 3CQWA 4FNZA 4RC2A 1ZOGA 4AFJA 3C4ZA 4IJPA 5C8MA 1W82A 4EOLA 3RTPA 2JFMA 4WRGA 3ORTA 4PQNA 4USEA 4BCGA 2GMXA 2QOIA 3NNXA 1NVRA 4QMPA 2UZNA 4MXAA 2ITOA 3QWJA 4FG9A 4IXPA 3ZZEA 3PUPA 1YW2A 5EM8A 3H0YA 2XNMA 1REKA 4IE9A 4F6UA 1Y6BA 1RQQA 3S1HA 3DTCA 1Y8GA 3IW6A 3AG9A 1V1KA 2OI4X 3ZXTA 3IG7A 3AD6A 2XKFA 5EM6A 3DJ5A 4XV2A 3VUDA 3P08A 4C38A 3L8VA 3ORZA 3Q96A 4D5KA 5J7HA 4X6RA 2VO7A 2QD9A 5I9UA 4HPTE 3MV5A 3WZUA 3OBGA 3W16A 1X8BA 3AOXA 4BFMA 3PPZA 4GL9A 2C6OA 3IGGA 5M53A 5DN3A 4YNOA 4X21A 2C5NA 4FTTA 4ITHA 4O2ZA 4NKAA 5E1EA 3RPRA 2EB3A 2XM8A 4ZLZA 1V0OA 4IM0A 2OW3A 4UX9A 4XV3A 5DGZA 2QR8A 4LGDA 4TTHB 1YVJA 4RVTA 4MTAA 2EXCX 2OXDA 3LCDA 3FMEA 3Q4TA 4MHAA 4XCUA 5J8IA 1JVPP 4AP7A 4AU8A 4C36A 4C57A 3QHWA 3CLYA 1TKIA 2DQ7X 1SYKA 2BAJA 2VO6A 4O0XA 1WBVA 3V3VA 3PIYA 3QXOA 2Q0NA 4LYNA 4CEGA 4ZAUA 5BPYA 3BPRA 3DB8A 4DG2E 4NCTA 4FKPA 3QQJA 4BN1A 4Z9LA 4B6LA 1IEPA 4QTEA 4XRLA 2XS0A 5DLSA 1T45A 4QTDA 4QP2A 2YAKA 4NM0A 5CI6A 4NFNA 5CAVA 4ANQA 4BDJA 4U0IA 3D2IA 3KXXA 3TTJA 3EQRA 2BFXA 4JQ8A 1ZZLA 2QLQA 4LUDA 4RX5A 3R9DA 1ZXEA 5ANKA 5M4FA 3QTSA 2CGVA 3LHJA 2C5XA 4PWNA 2ZM1A 4M69B 4EQMA 5I9ZA 5FGKA 4M0ZA 5C27A 1MRUA 4RA4A 3A7GA 4TWOA 3VRZA 4ERKA 5CXHA 4OAVB 2H8HA 2R3QA 3PE2A 2HY81 4LI5A 2R3JA 2EB2A 2IW9A 4AGDA 4HYSA 4O0SA 2X4ZA 1GJOA 1OIUA 5I3RA 3G9LX 3PJ2A 4L3PA 5AR5A 2BFYA 4PNIA 5ACKA 2QO2A 4FT3A 3QCXA 2J7TA 2B54A 2YWPA 3FYKX 3QQHA 3R1QA 4P5ZA 2WXVA 4IVBA 5CSWA 4BCPA 4NSTA 2WELA 4EK5A 4OAUC 5FP6A 4CQGA 5JK3A 4FNXA 3DBCA 4S32A 1PXJA 4YTIA 3ZOSA 4QQTA 4FZAB 1CKJA 3NSZA 2E2BA 4FZ6A 3CY3A 3ZM4A 5EDRA 1H28A 4YSMA 2ITQA 2PK9A 3IDPA 5J1VA 3QTUA 1VEBA 4C59A 4PTCA 3ZEWA 1PKDA 4YSJA 3UPZA 4ZZMA 1XHAA 1OPKA 3KN6A 1DAYA 5LQFA 1U59A 3HVCA 3OP5A 4XX9A 4F7JA 2HCKA 5J95A 3F3UA 3ODYX 4PDOA 4JT3A 1P14A 2GQGA 4FSWA 1OPJA 1AD5A 4G3GA 3C0HA 3O71A 2JDSA 2VZ6A 2JBPA 5G6VA 4FICA 4DGNA 5C9CA 4AOTA 3PIZA 4AGCA 4C2WA 4Z55A 4QNYA 4BZOA 4RVLA 3I6UA 3POOA 1ATPE 1PYEA 2PY3A 1SM2A 2C5VA 3V5JA 5D7VA 4YZCA 3GFEA 2R3OA 5L3AA 4TZRA 5CSXA 3ZC5A 2CGUA 5JFSA 1UNHA 3FMHA 2V55A 2X2KA 3Q53A 4FSQA 1JAMA 4CYIA 5LOHA 4EUUA 4ZOGA 1ZLTA 4WNMA 2B9JA 5IG1A 2J2IB 4IAKA 3ZLWA 1HOWA 4FTMA 3U9CA 4RFZA 4GJ3A 4RJ8A 5J9LA 4CD0A 2G2FA 3CGFA 4I4FA 4TYIA 5A4QA 3FHIA 4IB5A 2OFVA 5M44A 3ZH8A 5IA1A 4MXCA 4C4EA 4P5QA 4HVIA 1MRYA 2C4GA 3ZO1A 3DJ7A 3E7OA 4E3CA 5FD2A 4IC8A 2C0OA 3MA3A 4WD5A 4JBQA 1QL6A 4BCOA 4A4LA 4DFYA 2C6EA 4O0TA 5DR6A 4M8TA 2I1MA 2VWZA 3QU0A 3UO6A 3IQ7A 4QP1A 4YJRA 3UQCA 5JZJA 3O51A 3KCFA 2XEYA 3WZJA 3ROYA 4FKVA 3R8VA 2HY0A 1ZY5A 3NIZA 4D9UA 4BDAA 4HCTA 4OTFA 2VWUA 2PZIA 3D0EA 3KL8A 4WNKA 2FSTX 4CQEA 3A7FA 5J1WA 3NUSA 3Q6UA 4KKHA 2C3LA 4QQCA 3TNPC 5HU3A 4KIQA 3VW8A 3HRCA 5CTPA 3WARA 4PDSA 2YM4A 5F94A 3LVPA 4IACA 1OVEA 1Q99A 4RIOA 5F20A 4ZZNA 5DPVA 5IUGA 4U8ZA 3RBWA 1M7QA 5BVOA 4QYYA 3W1FA 4D4SA 4G1WA 3IPHA 3TWJA 2O65A 3IW7A 3LFQA 1XH6A 3OXIA 4EHGA 4D58A 2C1AA 4UZDA 4L9IA 3ZS5A 1KE8A 4BGQA 2OH4A 1YDSE 5FM2A 3DNEA 4UN0C 3A4OX 3CXWA 2O5KA 1R0EA 3BGPA 5M55A 4I92A 4PPAA 2QCSA 2XNOA 2OF2A 2HELA 4GK2A 4IX6A 4D1XA 4DH7A 4EOMA 4AW2A 4K9YA 4WG4A 4CLIA 3U87A 4Z7GA 2ERZE 1ZYDA 1Z57A 2ONLC 3NS9A 5DEYA 3QWKA 1QPCA 4ZY5A 1YXXA 3NEWA 5DR9A 5KHWA 3T8OA 3MDYA 4DH8A 2UZWE 4CTBA 1B6CB 3BQCA 1UU3A 3FL5A 3RM6A 5ANDA 3VWAA 3QGWA 4L68A 4R3PA 1ZMUA 3G90X 3QKMA 3OMVA 4FIGA 5H3QA 4FTIA 4Y8DA 3BCEA 4G3FA 3DQXA 2ITZA 5HG8A 3PTGA 3ZCLA 4C3FA 4FL1A 1YWNA 2NO3A 2G01A 3FLZA 2ZOQA 4G2FA 4XRJA 4EOSA 3EL7A 5HG9A 4V0GB 4IANA 3ZO3A 5CEIA 4CSVA 1BMKA 3ERKA 3GVUA 4QMZA 2OWBA 4ENYA 1S9JA 2CPKE 2R4BA 1ZYCA 4KRCA 4XEYA 2F57A 2RF9A 3DT1A 5EM7A 3WYXA 5JGAA 3DKFA 2CLXA 2PZ5A 4R1YA 4UWBA 4YJUA 1Z9XA 3R9OA 3AC2A 1Q3DA 5IA4A 2YCQA 4A06A 2HW7A 2PVKA 2FSOX 3EN4A 3EOCA 2YIWA 4FKJA 3FE3A 2BZKB 4WG3A 4O6EA 4KBCA 4C4IA 3OZ6A 5CEKA 3NYOA 4GT3A 5DHJA 4MKCA 4UMUA 4BTFA 4D55A 3PXZA 4WRSA 4WUAA 1H1QA 3H9FA 4OTRA 4AACA 5CF8A 3DV3A 2C3JA 3MYGA 2YDIA 2WQEA 3ORPA 2FB8A 2WMTA 2QODA 3OROA 4IEBA 5FQDC 3IDCA 5IDPA 3HMPA 4GK4A 5EDQA 5AAFA 4JLCA 3QTZA 2XK6A 2VGPA 3KQ7A 3QRKA 2YAAA 4G31A 5EI8A 2ITYA 4ANOA 4F1MA 1XO2B 2W05A 3C50A 2R3KA 3LCOA 4J96A 4O1OA 1IR3A 2J5EA 2QOOA 4WO5A 4Y85A 3Q9WA 5E8UA 2H6DA 4FTKA 1KE5A 5CVGA 1FVRA 4DGOA 3C4EA 5HU9A 4M66A 4PL4A 3PXQA 1E1VA 5IU2A 1OL6A 2WQNA 1YI6A 2XYNA 3SRVA 4A9RA 4TXCA 1OUKA 3V5LA 4AZVA 4N4SA 4CNHA 2WZJA 3MB6A 4EOOA 3F5UA 3UOKA 4YLLA 4IB3A 1XH4A 3NIEA 3UP2A 3VS5A 3UZTA 2R3FA 3NNUA 4DGGA 4FNYA 2I40A 4E5WA 3WE8A 3SHEA 3FZRA 2QONA 3R7YA 4LOPA 4R5YA 4EEVA 4EHZA 3BV3A 1TQIA 4HW7A 4FSMA 4BDBA 4M13A 3COHA 5F1ZA 3R7OA 1J1CA 4K77A 3EJ1A 3KK9A 1S9IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4FII A;  3K3J A;  4Z3V A;  5KMI A;  2B9I A;  3F2A A;  3ZHP C;  1A9C A;  3G2F A;  2JD5 A;  1H1S A;  3LFF A;  1N3S A;  1H08 A;  2UZT A;  4K6Z A;  4YJQ A;  5AP4 A;  3P86 A;  2XUU A;  4G9C A;  3PP0 A;  3PSC A;  4X2J A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 2KUL A;  1DAW A;  4S31 A;  3CY2 A;  5GNK A;  2GS6 A;  2OSC A;  2Y4I B;  3TZM A;  4FSN A;  4D4R A;  3MJ2 A;  4NT4 A;  5HTB A;  5AV2 A;  4U41 A;  4YZB A;  1XBC A;  2X7O A;  3QD3 A;  2GSF A;  2PHK A;  3F7Z A;  3LQ5 A;  1OL7 A;  2QC6 A;  3NUX A;  4U5J A;  4GUE A;  4EK8 A;  5KUP A;  4XBR A;  3ENH A;  4FTO A;  4FIJ A;  5FBN C;  3CP9 A;  2W1I A;  3F2N A;  2QVS E;  4LL0 A;  4ALV A;  5JRQ A;  5CU6 A;  2QU5 A;  3KY2 A;  3GQI A;  4KAB A;  5CAL A;  3L8S A;  4IZY A;  5AAE A;  3NX8 A;  2W5H A;  3N51 A;  5TKD A;  4QMM A;  4KIO A;  3Q32 A;  4DH1 A;  2P11 A;  1WBP A;  1MQB A;  4EI4 A;  3UQF A;  2GNL A;  3CQU A;  4YZ9 A;  3I79 A;  4MXY A;  5D7A A;  4MQ1 A;  4CYJ A;  2OGV A;  4I6F A;  4GFG A;  4DFN A;  3W2Q A;  4D0X A;  1KE6 A;  3HMN A;  4TND A;  4HYH A;  2XZS A;  3SXS A;  1GY3 A;  2XJ1 A;  1YWR A;  3AD5 A;  3FZT A;  4GG7 A;  4I6B A;  4FVQ A;  4MVF A;  4L53 A;  5DA3 A;  1VR2 A;  1OIR A;  2FSL X;  4AG8 A;  4CZY B;  2JED A;  4A4O A;  3R7E A;  3RWQ A;  4K0Y A;  4IHP A;  4CCU A;  1E1X A;  4S2Z A;  1EFU B;  3KUL A; 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