4QPMA

Structure of bub1 kinase domain
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
345
structure length
329
Chain Sequence
PNPWDDKLIFKLLSGLSKPVSSYPNTFEWQCKLPAIKPKTEFQLGSKLVYVHHLLGEGAFAQVYEATQKQKFVLKVQKPANPWEFYIGTQLMERLKPSMQHMFMKFYSAHLFQNGSVLVGELYSYGTLLNAINLYKNTPEKVMPQGLVISFAMRMLYMIEQVHDCEIIHGDIKPDNFILGNGFLESAGLALIDLGQSIDMKLFPKGTIFTAKCETGFQCVEMLSNKPWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGECKPEGLFRRLPHLDMWNEFFHVMLNIPDCHHLPSLDLLRQKLKKVFQQHYTNKIRALRNRLIVLLLECKRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Substrate-Specific Activation of the Mitotic Kinase Bub1 through Intramolecular Autophosphorylation and Kinetochore Targeting.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
total genus 90
structure length 329
sequence length 345
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.286.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 4qpmA01
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4qpmA02
4I1ZA 3VNTA 1Q41A 4EKKA 4QMLA 2C47A 4ZXTA 2X6EA 2VWXA 5AAEA 4IAFA 5ANIA 5CAOA 3E8EA 1OM1A 3CPBA 4C34A 3AT2A 3R8PA 3EHAA 1SNXA 4L68A 4O0WA 3ZRKA 2XKFA 2IWIA 4M0ZA 4M67A 3UOHA 1H0VA 5C01A 3IQ7A 4ALWA 3CGOA 5HG9A 4WNOA 2OFUA 5CAQA 5LQFA 4RA5A 4NU1A 1ZY5A 4O0TA 3REPA 2X7GA 2OSCA 2G15A 5JN2A 2BRNA 2QQ7A 3PVGA 2IW9A 5JSMA 3T9IA 2OXDA 1Q24A 1IEPA 4QP9A 4C8BA 3W2SA 5CT7A 4BICA 2OXXA 1P5EA 3GBZA 1P4FA 2NRYA 3Q9ZA 4I5HA 4JS8A 4QP7A 4WSYA 4LGDA 4IANA 1QMZA 3EYHA 5ETFA 4EH9A 3PA5A 1PMVA 1W0XC 4BIEA 3T8OA 3OZ6A 3HV3A 4Y95A 4QYHA 4FG8A 5FM2A 3ZYAA 2W1IA 5LMBA 1XBCA 3RCDA 2IZTA 4FVPA 3OTUA 4O0XA 4UWCA 3PJCA 3ODYX 3R8MA 3BHVA 4D2SA 4BL1A 3HEGA 1KV2A 4MK0A 3CEKA 2AUHA 2UW7A 2IZUA 4HNFA 1OL1A 4ANSA 2QU6A 1WBWA 3HV4A 5HNGA 1NY3A 3CQWA 3S4QA 2OJFE 3D0EA 2PVRA 4J98A 3LCSA 2ITYA 4L3JA 4XLVA 3Q4TA 1R78A 4QP6A 4I24A 4RFYA 3GGFA 5F94A 4LL5A 4AT4A 4D1XA 4LRKA 2QD9A 4FYNA 4YHJA 1JSUA 4D2PA 1H0WA 4BTJA 4F65A 2V0DA 2W06A 3DQWA 4X2GA 4X3FB 3VRYA 4EWHA 3FZOA 4XG2A 2HY81 4KIKA 4IVDA 4LRJA 5CVFA 3WE8A 3A4OX 3OWLA 3V01A 1M14A 2VWUA 4RIXA 4DH8A 3RTPA 2W5AA 1CM8A 5I3OA 3Q4ZA 3PTGA 4EK8A 2JGZA 4KBAA 1QL6A 4XV2A 4MNEB 1S9JA 3GP0A 3MFSA 5AUWA 2UZEA 1PXKA 5CY3A 5M56A 2VX0A 2E9NA 5FEEA 3R01A 5EI6A 3VBWA 5ACBC 4KRDA 5IA5A 4GU9A 4BYIA 3COMA 5IH5A 4C02A 4AT3A 3IW4A 3GU6A 1LUFA 3OBJA 4EOSA 1JKSA 2ETRA 3QGYA 2O0UA 2OWBA 5EW9A 1Q97A 5E8TA 2XK4A 3F7WA 3OF0A 5J1VA 3UG2A 3FZRA 1RDQE 4GK2A 5FDXA 3BELA 3Q52A 4G9RA 4AAAA 2IVUA 2YAAA 5CEQA 4IAIA 3QCQA 4X21A 3AC2A 4I0TA 4DTKA 5A4CA 3ZH8A 5J1WA 4GFOA 4YLJA 5DG5A 3QTIA 4L43A 4K8AA 5I4NA 5IEXA 3AG9A 5FQDC 3NNVA 5KKRB 4O6EA 4D1SA 3FL5A 4CLIA 1OPKA 5D7AA 4EONA 3CQUA 2VTNA 3V5JA 4C3RA 4LFIA 2BDJA 4RX8A 2EWAA 2F7XE 2R3OA 3DAKA 4YLKA 2W1ZA 3PJ8A 3G2FA 4UMUA 4FK3A 1H1RA 2O8YA 3KK8A 4MXCA 1Q8UA 3O8TA 4EOOA 4CXAA 5E8YA 3TIZA 4USDA 1ZYDA 4DGNA 3ODZX 3LPBA 1AQ1A 4G16A 4WBBB 3UO6A 1M17A 5AA9A 4EOLA 4UWBA 4E6AA 4FZDB 4FV8A 4R3CA 1BI8A 4JAIA 4L8MA 2B53A 3FZ1A 3I5ZA 4XUFA 4FZ6A 4J8NA 1Q8TA 4F0GA 5KNJA 4UBAA 4FV9A 3QTRA 3OOGA 3C4XA 3MS9A 4AN9A 4D9UA 3PWYA 3POOA 4OTGA 4LOOA 2R0IA 5AEPA 4FZ7A 2W7XA 2RG5A 3FPQA 4C2VA 4DITA 1WCCA 5GZ8A 4JJRA 3BLHA 3PXYA 4FI1A 3RHKA 4HPUE 3F3ZA 3R2BA 4YPDA 2GU8A 3A7JA 3ZOSA 4KKEA 3WI6A 3NIEA 2W1GA 2JDVA 4NFMA 1JSVA 3O23A 4JDKA 4QP4A 3GENA 1Y57A 4CFXA 3THBA 3QD4A 1W83A 3HDNA 3MH3A 5DT4A 3W10A 1F5QA 1O6YA 5F20A 4BBMA 5HE1A 3BWJA 2XIKA 2QR7A 3UOLA 2RFDA 3COIA 3M2WA 3NW6A 3WZEA 4XG3A 2X0GA 5HGIA 5EM6A 4DH3A 4E93A 3H9OA 3PUPA 3M1SA 2P2HA 3VVHA 4DEGA 5DIAA 3MBLA 4UMPA 3ORMA 3FQEA 4JDHA 2AYPA 1BUHA 3OUNB 3G0FA 4BI2A 4HCVA 3TI1A 4FKWA 4ASEA 5DPVA 2EUFB 3UDBA 1YXUA 4FV6A 2R5TA 4GVAA 3DJ7A 1OUKA 2UW0A 3D15A 3KKVA 3R9DA 2R9SA 3GCPA 3O7LB 5M51A 4JXFA 3AQVA 4RX7A 4WG5A 1ZLTA 3OUKA 4YGAA 3VUTA 3OOMA 5EKOA 2Y4IC 5IA1A 1H8FA 4YZ9A 3KXNA 4NM0A 3OCTA 4CD0A 3KY2A 2YN8A 4MBLA 4FUYA 4U44A 5HO6A 2B9JA 3DB8A 1Q4LA 1YHSA 2UW9A 4D4YA 2OJIA 5IUHA 3Q3BA 4LMNA 2WPAA 5DE2A 4FKQA 2W4JA 1P14A 3IDBA 3MI9A 3R71A 5CEMA 5DHJA 5K0KA 5EYCA 3HV6A 3P7AA 5AADA 1OVEA 3DOGA 2BHEA 1DS5A 5C8MA 2BR1A 2GHMA 4MAOA 2F9GA 3R30A 1SYKA 2YCSA 2XS0A 4TYJA 1BX6A 3NNWA 3ZUTA 2Z2WA 4DEHA 3TZMA 3HDMA 2BALA 3Q6WA 3FKOA 2ZV2A 4U45A 5E91A 2PVNA 3FPMA 5E8XA 2YJSA 4TL0A 2Z7LA 3TV6A 5BQ0A 3CJGA 4A9TA 2JAMA 3QTQA 2XF0A 4D2WA 3TEIA 4FIEA 2R3FA 4YJQA 3JUHA 4F6UA 5EG3A 3UC4A 4NW6A 2J0JA 3I0OA 4KABA 5GZAA 4PL3A 5CENA 5ICPA 3R2YA 4E20A 1ZRZA 2C30A 4RIXB 3F5UA 4FR4A 1BL6A 3EFJA 3CIKA 2G2IA 3AT4A 3KL8A 3KXMA 2ZDUA 4FKPA 4IFGA 3QKKA 4QMOA 4O0RA 5FRIA 4GV1A 3UYSA 4H1JA 4JLCA 3F3TA 1YXSA 3BCEA 4IWDA 4RJ8A 3BBTB 5LVPA 5L2TA 4FL1A 3ZRMA 3LXPA 1A9UA 2B52A 2HW6A 3KMMA 5HX8A 3ORPA 4DLJA 1J1BA 3D83A 5A4EA 1P4OA 3RGFA 3P4KA 3PE1A 4IVCA 3V8SA 1OKYA 2DQ7X 2O64A 4Q5HA 4CTBA 3BE9A 2R0UA 3PY1A 4ACHA 4DG3E 3IK3A 4EH4A 5E7RA 5E8UA 3QXOA 1M2RA 1K3AA 3GXLA 4WG4A 4CV9A 2QHMA 2GNIA 2XKCA 1GIHA 2XRWA 5D10A 4ZTLA 4CZTA 2R3LA 3HECA 3UIUA 5CU4A 3FMHA 4YZCA 4FSNA 2PZPA 1NVQA 4K2RA 4CT2A 5A6NA 3TWJA 3CKXA 1B38A 4J52A 4QRCA 3BZ3A 4C62A 3R9OA 4ZZNA 3DTCA 4ACGA 3DDQA 2Y6MA 4I4FA 2GS7A 5IPJA 4IX4A 1PXOA 3ZS5A 2WQOA 2H6DA 2YM8A 3E88A 3U8WA 2ITUA 1PY5A 3VUDA 3UZPA 4UXLA 5J7HA 3H0ZA 4MWHA 3U6HA 4FL3A 4TWNA 4YZDA 5JGDA 3ZCLA 5KZIA 2WMTA 5IG1A 4MF1A 1LR4A 2R3KA 2ITQA 2ERZE 4IADA 4M15A 4XRJA 4HPTE 3ZSIA 1HCLA 3CPCA 1YWVA 5IA0A 3ZHPC 3VF8A 2UVYA 3V04A 2PVKA 2VTSA 2W05A 4YZBA 3S00A 1UKHA 3TZ7A 1MRVA 4FNXA 3NUYA 1OL6A 2BUJA 4FV5A 5KUPA 2B1PA 3ORTA 5J87A 3QUPA 3FI4A 1KOBA 3NYOA 3OCBA 4MBJA 5ANGA 4CRLA 4DGOA 4BI1A 3FXWA 1H08A 3A8XA 4CV8A 5KHWA 4Z7GA 3FZPA 2FSTX 3EFLA 4FV1A 1FMKA 5BYZA 4XG6A 3NRMA 3GI3A 3I7BA 3MJ1A 3RALA 5AUZA 2R3IA 5CSXA 3A60A 3NUXA 4EK4A 2B9FA 2IVVA 5IEVA 3KRXA 2XJ0A 1YDRE 5CF6A 3C7QA 2FSMX 3UIBA 4CYIA 5LARA 4DAWA 3E8NA 4Z7HA 4RFMA 5DN3A 5CU2A 4CFVA 2YFXA 4Z3VA 2WMVA 1QPJA 2BRMA 2C3KA 1YVJA 2OIDA 4AACA 3OWJA 3BBWA 4ANNA 3QX4A 3HA6A 3HVCA 4OAUC 3EZVA 4FKLA 5E1EA 3MWUA 3Q96A 5L2QA 1GZOA 4QQJA 2GFSA 3CXWA 5KMKA 2HOGA 4JG7A 2XK9A 5FXQA 4QMQA 2E9VA 2FYSA 4PTCA 3PSBA 3W2RA 2F57A 1Q62A 4XBRA 4DGGA 3R7IA 3VIDA 3KB7A 5FLFA 2VUWA 5FTQA 4JR7A 4MQ2A 4GUEA 2R7IA 4ZS0A 2WQEA 5HCXA 3SVVA 2WMSA 4ERWA 3JPVA 2YM3A 1FMOE 1TQMA 2XEYA 3CY2A 3HGKA 4MYGA 4BBFA 3QC4A 4FTTA 4Y73A 1VJYA 2WQMA 3VJNA 3QTUA 3QRIA 2NPQA 4NJDA 4X3FC 2JIUA 1PF8A 4QMZA 4A9RA 3Q9XA 3DPKA 4A7CA 4AW0A 5BUEA 1FGIA 4IXPA 4MF0A 3G9NA 2YABA 3CY3A 4M14A 4U41A 3LOKA 3QUDA 4S31A 4C4EA 2F7ZE 4QMTA 2W1EA 4TTHB 2QKRA 1V0OA 3WE4A 2PY3A 4PP7A 4P7EA 3PA3A 3GB2A 3QHWA 4B99A 3VQUA 3AC3A 4GK4A 2X9FA 2BZIB 4YJSA 5BMMA 2WOUA 5HTIA 1FGKA 4MHAA 3NLBA 2JD5A 3R22A 4IC7A 3BU6A 3QYWA 1Q8WA 1UU7A 4G31A 3I5NA 5CNNA 3E92A 3NUPA 1L3RE 4U7ZA 3ZC6A 3QKMA 4YJVA 2I0VA 2J7TA 4K18A 4EH8A 1ZY4A 5L6OA 5FWKK 2VX1A 3V6SA 1CTPE 5G6VA 4FTLA 4ANOA 4I94A 2BRHA 4FTRA 4UMTA 4RIYA 5FP6A 2WU6A 4QOXA 2I6LA 2XEZA 5I0BA 5D41A 3H30A 4JG6A 3QD2B 4K11A 4R1YA 4WT6A 3FBVA 2J0KA 4JQ8A 3SXFA 3E87A 1M2QA 3LMGA 5J5TA 2HWOA 4W4XA 4KIPA 4DEAA 4EL9A 1SNUA 2E2BA 4CRSA 5KKRC 3LQ5A 4EQMA 2GHGA 3OTVA 3WF5A 4L7SA 2H34A 2C6MA 2VO0A 2VO3A 3VS0A 3UO5A 4KNBA 2XA4A 3UMXA 3HMOA 3W2PA 4I92A 3MA3A 3V5WA 1XR1A 4GG5A 3DKCA 3OEZA 1YXXA 4IAKA 2XIZA 4AZVA 1Y6BA 2JKMA 4EEVA 4JQ7A 1T46A 3QLGA 3DNDA 4NM3A 3RNYA 3U51A 3WBLA 5KHXA 4QQ5A 4RVKA 4IVAA 3GNIB 5E8ZA 5B7VA 3MFRA 4FKVA 2WKMA 2X81A 3BKBA 2A4LA 1G3NA 2QO9A 2YIYA 3EQRA 4KWPA 4BCJA 2C6LA 4ZY5A 4BHZA 5HTCA 1PXMA 3L9NA 2PSQA 3NSZA 4XS2A 2IZSA 4GRBA 3KU2A 4GVJA 2QG5A 3LFSA 3KULB 3LFDA 4G6NA 4BCNA 3C0GA 4AFJA 4I5CA 5LMKC 1SVHA 3AC1A 3ET7A 4AZFA 2GTNA 3A99A 3NYVA 4WKQA 3FLSA 2Y4IB 3G6HA 3SXSA 4I23A 4O2ZA 4ANQA 2BDFA 2UZOA 4IFCA 2WU7A 4W8EA 2C0OA 3S1HA 3NNUA 4IZYA 4LG4A 3MVLA 3DKFA 3RAHA 4L3PA 3GCVA 3FYJX 4CFMA 4U6RA 4QMNA 2ITXA 3LIJA 5HVJA 3EFKA 4A9SA 4BYJA 4WUNA 4X3FA 5DWRA 4TN6A 3VBXA 3TKHA 4WUAA 3HMIA 4E6DA 3DKGA 3PVUA 4BDIA 2UW4A 1OMWA 5E1SA 2ZV7A 4CFFA 5CI7A 3FZTA 3KQ7A 1JBPE 4AP7A 3OY1A 2ZAZA 2DS1A 3IKAA 4PTEA 5LCJA 1ERKA 3QQLA 4ALVA 2B55A 2QOQA 5HVKA 3F7ZA 5EDQA 3HV5A 1XH7A 2HYYA 1ZYSA 1O6LA 5HI2A 4KD1A 3BYSA 4BBEA 1Q8ZA 1XH6A 5HBEA 3ZLWA 5CASA 2GPHA 1SMHA 1BLXA 3TG1A 3RI1A 4GUBA 4BCQA 3E8CA 1J1CA 2QONA 2ZYBA 2JBPA 2HW7A 5DEWA 4IWOA 5DBXA 4FODA 3R8UA 1RE8A 2G2FA 2I1MA 4YO6A 2XZSA 4P5QA 1E1XA 3SKCA 3ZEWA 5DGZA 3TV4A 4J95A 2G2HA 3ZRLA 5JT2A 2UZBA 2VTQA 5FBNC 4YTIA 4ACCA 5KE0A 1F0QA 2OF2A 3LXLA 4L46A 1H1QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1I44 A;  1YXV A;  4FF8 A;  3P79 A;  2BRB A;  1XO2 B;  4MXO A;  3RBW A;  2CSN A;  4YJU A;  2WTC A;  2XBJ A;  4CCB A;  3R8V A;  4ARK A;  3HMM A;  2QOC A;  4F7J A;  5LJJ A;  2VTT A;  4NCT A;  4ZP5 A;  2H8H A;  3A4P A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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