4QPMA

Structure of bub1 kinase domain
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
345
structure length
329
Chain Sequence
PNPWDDKLIFKLLSGLSKPVSSYPNTFEWQCKLPAIKPKTEFQLGSKLVYVHHLLGEGAFAQVYEATQKQKFVLKVQKPANPWEFYIGTQLMERLKPSMQHMFMKFYSAHLFQNGSVLVGELYSYGTLLNAINLYKNTPEKVMPQGLVISFAMRMLYMIEQVHDCEIIHGDIKPDNFILGNGFLESAGLALIDLGQSIDMKLFPKGTIFTAKCETGFQCVEMLSNKPWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGECKPEGLFRRLPHLDMWNEFFHVMLNIPDCHHLPSLDLLRQKLKKVFQQHYTNKIRALRNRLIVLLLECKRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Substrate-Specific Activation of the Mitotic Kinase Bub1 through Intramolecular Autophosphorylation and Kinetochore Targeting.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 329
sequence length 345
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.286.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 4qpmA01
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4qpmA02
4GG7A 3AGLA 4C4IA 3QCQA 1PXPA 5JRQA 3SLSA 3BGQA 4G34A 2UW3A 5CSXA 3ZEPA 4BCPA 3LXLA 4GW8A 5CSWA 2OIQA 3O8UA 4FBXA 4FSNA 3FZ1A 4GV1A 2VTLA 4V05A 4XX9A 1T46A 3PWDA 5BVWA 4EEVA 5AA9A 3L9LA 1URCA 4FUXA 2FO0A 2ITVA 2G9XA 4EQUA 2JDTA 3CD8A 3MIAA 3IO7A 4IW0A 4C62A 4RVTA 1SZMA 3EN9A 5M57A 2WOUA 5AR2A 4FYNA 2RG5A 3FL4A 5F4NA 1SNUA 3C7QA 3E62A 3FLSA 4I4EA 4KIPA 3DZOA 5C1QB 4LL0A 3OW4A 1S9JA 1P4OA 2XRWA 4QQCA 4FIHA 3RCDA 4MVFA 1Q24A 3A8XA 4TTHB 2PVFA 2KULA 2WMVA 1VEBA 1YQJA 3BX5A 4FSWA 4ENXA 4GK4A 4UALA 5KMMA 4XBUA 5TT7A 4F9YA 3LCOA 5J7BA 4Y8DA 3FLWA 5J8IA 2ZDTA 3ORTA 4M69B 4QTDA 3QCYA 4YJUA 3PPZA 4GVJA 1M7NA 4H3QA 3IECA 2FSOX 5IA1A 3HV6A 3R8MA 4AN3A 4M97A 2J0KA 3RPVA 3ZRKA 3UTOA 1UNHA 3W2CA 1H00A 3QD3A 4YMJA 2XF0A 4W4YA 5KBRA 3LXNA 3BI6A 4BI2A 5DHJA 3V6RA 1NVRA 3E64A 4TPTA 4A9TA 3MFTA 5HICA 1REJA 4DINA 3T3UA 4CT2A 3DKOA 4CVAA 4LUEA 4NUSA 3V51A 5KMNA 4R5SA 4JOAA 2XEYA 4Z9LA 4FTOA 1H1RA 2XIYA 3C50A 5A4EA 3MBLA 4D1ZA 2VTOA 4YJSA 3CE3A 3JY0A 4ACMA 5F1ZA 1G5SA 5FG8A 4AW0A 5IA0A 2F57A 1A06A 3TNIA 5L2SA 4DH7A 1Q8UA 2QI8A 5F95A 2BHHA 3DTCA 5CF5A 5DNRA 3GCPA 3KRRA 4KD1A 4UBAA 1XKKA 4PL3A 4WRSA 4FMQA 2QD9A 3TV6A 2OJGA 4O0TA 2CCHA 4KKGA 1VR2A 4WNOA 4TYHA 3HA8A 3KRJA 2QURA 4FTMA 2E9OA 3OP5A 5GJDA 4RVMA 4AA5A 3VRYA 2C1AA 4YNEA 5FQDC 3ZOSA 2B9FA 4C61A 1XH4A 3D4QA 1H24A 4WNPA 4YTFA 3P7CA 4ZAUA 3BYMA 4YO6A 4L6QA 2XK4A 3KK8A 2IWIA 3RGFA 3NUYA 3G51A 1FGKA 3V5TA 1MRYA 4YURA 2YZAA 5C8KA 3L9NA 5FGKA 4BGHA 4U7ZA 3GU7A 5JGAA 1W83A 4KINA 2BUJA 3EZRA 2OG8A 4FKWA 2UW6A 4DGLC 3PWYA 3RAKA 1WVWA 4G9RA 3DCVA 3ZDUA 5EW9A 1OL6A 4DN5A 4PMMA 3LFQA 3S1HA 3QTSA 4G6OA 3HLLA 4ZLYA 2H8HA 3FSFA 4WO5A 3REPA 4YZ9A 4BRXA 4HOKA 3KK9A 4V0GA 2GFCA 3LCDA 4ENYA 3VBWA 3QGWA 4M68A 4FL1A 3ALOA 2VTRA 4W8EA 3EQFA 4OTDA 4Y46A 2YM6A 4GT4A 5DFPA 3ZYAA 5JFXA 3R1QA 3QBNA 4UXQA 3FLZA 2CJMA 2QLQA 4U45A 4YPSA 3UZPA 3Q53A 4RFZA 4K18A 3NZ0A 3UE4A 4YHTA 2YISA 4WT6A 5JMSA 4C4EA 3Q3BA 2VTIA 5CANA 4K8AA 3SRVB 1GNGA 4O0UA 5TOZA 3AGMA 3A7HA 4OTGA 4UMUA 3VAPA 3AOXA 3E8NA 3Q52A 4S2ZA 2ESMA 5HCYA 4LM5A 2HK5A 3RHXA 2C68A 3IOPA 4KA3A 2W4KA 3IGGA 3ULIA 4HNFA 5CF8A 2X2KA 2XUUA 3COHA 2VWZA 3TEIA 4NW6A 4K0YA 4E5AX 4G3DA 3VS0A 5HG5A 4JNWA 2HZIA 4BBEA 4QNAA 3GFWA 4LUDA 4AWIA 5AM7A 4PNKA 4F0GA 1JVPP 4DHFA 1STCE 3PTGA 2VO6A 3GI3A 4IXPA 1YDRE 4X7QA 5HI2A 1YHSA 5FWKK 3LFSA 2OZOA 2PY3A 4KKHA 2QCSA 3FKOA 3SDJA 3QTUA 4H1MA 4K77A 3OWPA 3UJGA 3TUCA 1UVRA 4S34A 3MA3A 1X8BA 3O7LB 4GT3A 2RL5A 3KRWA 2SRCA 3F3VA 3NNWA 4J97A 4GCJA 4EORA 2JAMA 2X4ZA 3BZ3A 3DGKA 4JJRA 4FKVA 2R3NA 4EOKA 4A9SA 4X2KA 2R3OA 3QF9A 2WIHA 2QONA 4IDVA 2YWPA 5HQ0A 3CLYA 4PMTA 3EIDA 3M11A 4WA9A 3VJOA 3DY7A 3CTHA 2RGPA 4MD8E 5DOSA 4AE9A 2OJIA 3DK6A 4NWMA 4QMXA 3BE2A 4TWOA 5HE3A 1GAGA 3KXGA 4D0WA 4FF8A 3OCBA 2XNPA 3W2SA 3MTLA 4CKIA 3LE6A 3O71A 1YXSA 3OS3A 3D15A 5HE0A 4HCVA 3R8UA 4ACCA 5CY3A 2J90A 3QAME 5BVEA 3HUCA 4F6WA 4L45A 2G15A 4ASZA 4IJPA 5HIEA 5EKOA 1WVXA 2X9FA 5FTQA 2GS7A 3PYYA 1FMOE 3H3CA 3QLGA 5DE2A 3ACJA 4IQ6A 2J7TA 1GIJA 3AMYA 1PHKA 2XNEA 4C4FA 4G6NA 3OXTA 5ANDA 5AAFA 2B7AA 4NJ3A 3VBQA 3R0TA 4FC0A 4ZIMA 4DEEA 3LVPA 1WVYA 4GJ2A 4BZDA 3K3JA 3G2FA 3DQWA 3NYXA 3DBCA 5AUTA 2XIZA 3I0QA 2VO7A 2XYUA 4RLLA 4EQMA 4YNOA 2B55A 3VF8A 2P55A 5HLWA 4AU8A 1Y57A 4RWKA 2GS2A 4FL2A 2YIRA 4IANA 2O63A 5CI7A 4HVHA 5C9CA 5J79A 3T9TA 3NW5A 2VNWA 3QRJA 5AP1A 2HY81 4V01A 2UW7A 4CT1A 2UZTA 3TWJA 4MKCA 4KIKA 3SOCA 2ONLA 2JKKA 1F0QA 4O2PA 5LVLA 4IC8A 4BHNA 4ITHA 3VS3A 3HV7A 1JLUE 3F5UA 2C1BA 4OGRA 4MD9E 3LFFA 2ZVAA 3MVMA 1Q5KA 3CPBA 1RDQE 2GS6A 2W9ZB 5IA5A 1XH7A 2YFXA 3UOKA 3V5WA 3O8PA 2GHMA 4XHKB 2XM9A 5C26A 4PQNA 4MXAA 3FHIA 1YXXA 4FI1A 2W17A 2XJ1A 2C30A 2HZ4A 3GNIB 1Q61A 2OF2A 1UU3A 4FSRA 4GT5A 4JVGA 3R7UA 4D4YA 3VUMA 3ZCLA 3HZTA 2Q0NA 4AQCA 2GU8A 4HYIA 2WU7A 2YM8A 2EXEA 4ALVA 2XZSA 3DK3A 3UODA 5CAPA 5EDRA 4IWQA 3PZHA 4JS8A 5TO8A 3R73A 4RZWA 3WF7A 1SYKA 4TYIA 3AMAA 4WUNA 3BRBA 3FPMA 4RG0A 5IDPA 5IMEA 4FYOA 5GHVA 4HPTE 4W9WA 4FV3A 4BCIA 5IG1A 1PF8A 4QO9A 4LRMA 3MH2A 3U4WA 3ULZA 4BCOA 2C0TA 4UMQA 2H9VA 2OIDA 4DGNA 5L8LA 3WOWA 1WBTA 3F5GA 3OTUA 4EK4A 1KE5A 4EOSA 3TJDA 5A46A 1QPCA 2QO7A 2PWLA 4CFUA 2BFXA 2F2CB 3MY1A 4CYJA 3E7OA 3S95A 3QWKA 3VS7A 5FDPA 3TKHA 5CAUA 2WEIA 2WTIA 5CALA 3RZBA 1Q62A 3OFMA 3H9RA 4BB4A 5JT2A 2B4SB 2OSCA 3D2KA 2YIXA 5AP3A 2PVJA 2PE2A 4UYNA 2PHKA 3D7TA 3G9LX 3Q4TA 5IMXA 2QODA 4DFYA 3NCZA 3PIZA 3IOKA 2GTMA 1XQZA 4AZFA 2WQBA 3VWAA 4GS6A 4EHVA 5IPJA 1OPKA 4WUAA 4GJ3A 4RJ5A 3SD0A 2XCHA 3PJ2A 1CKPA 1UNGA 2XBAA 4X2JA 4LMUA 5AUZA 4IWOA 3D83A 5D11A 4M13A 5HO8A 3ZSHA 4CEGA 3SW7A 3OW3A 4C37A 4U79A 3K3IA 2Z7QA 4RX8A 5CU6A 4DYMA 5M4UA 5TE0A 1RQQA 2W1CA 3BLHA 4FT0A 4I5MA 4UMTA 2ACXA 3FZTA 3R30A 3F66A 2EU9A 5EI6A 3TT0A 2Y8OA 4OTFA 3BHUA 4OT6A 3BU6A 5FP6A 3RAWA 3HL7A 2O65A 1DI9A 4WSQA 2YJSA 3ORXA 2HW7A 4JX3A 5A4CA 3DKGA 5H3QA 3JS2A 5B2MA 3LJ0A 4BDJA 3DNEA 2W0JA 2H6DA 4J8MA 4JI9A 3DQXA 4Y95A 3Q9YA 3VJNA 4FTKA 3DBDA 3FL5A 3JXWA 2ZYBA 4LOQA 3VBYA 1HOWA 4ANSA 3FAAA 4U0IA 3RI1A 3RK9A 3SOAA 4HVDA 2XK3A 5EI8A 4PDOA 3Q6UA 1OKVA 2C0IA 2XA4A 4FR4A 2Y6MA 4I1ZA 2J51A 3BHVA 3QRTA 5J9YA 4NW5A 1OMWA 3TCPA 4B6LA 4QMWA 2VTNA 3PP0A 4YBJA 4EYMA 3WIGA 3GT8A 3DBQA 2OFUA 4OAUC 2ZJWA 3DPKA 3PZEA 4BVUA 5L6WL 3EQBA 2UZLA 3FMDA 4P5QA 2HYYA 2R0IA 3H0ZA 3C9WA 5EM7A 4KSPA 4BIBA 3RZFA 3ALNA 4XV1A 4FA2A 4IX5A 4W9XA 2WQOA 3VQUA 2EB3A 2PZ5A 3QQUA 4PDSA 4O0XA 4ZK5A 2JKQA 2VV9A 4FV2A 1TQPA 3SHEA 3DB6A 2A27A 2BZJA 1VYWA 1CKIA 2R3HA 3FMLA 3O7LD 3FUPA 3QLFA 3VUKA 3DBEA 4C38A 4NKAA 1FGIA 4U43A 4F0IA 1CM8A 1J91A 4FKJA 4FTTA 4Q5EA 5AUYA 4OTRA 4TYEA 5J9LA 1PYEA 5GJGA 3KXXA 3DJ5A 5CU3A 3DTWA 3MWUA 5JGBA 5AP4A 3WZKA 5BVNA 3PJ1A 2W1EA 2B9HA 4FKUA 5AP5A 3P4KA 4EL9A 5EH0A 4I22A 4N6ZA 4QYGA 4UWYA 2BALA 3ZLYA 2R9SA 3CPCA 2J0JA 1YXVA 5H8GA 1TVOA 3KRLA 4YHFA 3RM7A 4B8LA 4S32A 2UZNA 1TQMA 3KMMA 4L8MA 4FIFA 5JFVA 2XNBA 4JAJA 4O91A 3TV4A 1RW8A 4BCJA 1OZ1A 2BROA 5K9IA 5J87A 2CKEA 3O96A 2QG5A 2EWAA 3E8DA 5DWRA 4J53A 2ZM3A 3LW0A 3OWLA 2R0UA 3SQQA 2X7OA 4RIXB 5DI1A 1SMHA 2GNFA 5LVOA 2VWYA 2X6EA 2I0VA 4JIKA 3R2YA 5HHWA 5FEEA 4FZAB 3KXHA 3AT4A 5G6VA 3FI4A 4O21A 2G01A 3C1XA 4M15A 3I7CA 5BUEA 3SKCA 4QMTA 3U51A 4U80A 5J7HA 3CJGA 4Z55A 3T9IA 1V0PA 3Q6WA 2V5QA 1OI9A 2ZMCA 3AC4A 1PKDA 3KVWA 2OJJA 5EHLA 4JL9A 3TACA 4JRNA 3E92A 1FOTA 2O0UA 3QQLA 4EJNA 5HBJA 2GHLA 3KA0A 3A7JA 2X7GA 4J8NA 4E6AA 3LFAA 4RIOA 4CFNA 1DAWA 3MPMA 1CTPE 3A7GA 3UG2A 4YSJA 5JQ8A 2BZHB 4X6QC 2XBJA 4NM5A 2Z7RA 2WU6A 4BTKA 3Q32A 3KC3A 2XNGA 4D2WA 1M14A 3TXOA 4E8AA 3QZFA 5JZJA 2HY0A 2R7IA 4JBVA 4DEDA 2NPQA 3MFSA 3U6IA 3UIMA 2ETRA 3QRUA 2QOFA 3NRMA 5EYDA 4BFMA 3ZDIA 4JIAA 4RVKA 3O51A 3BQRA 1V0OA 1KE6A 1EH4A 3MH0A 4PTEA 5JRSA 2V7AA 1P4FA 4JBQA 4O27B 5CT0A 5CEPA 5M4CA 5H8BA 4HJOA 2BDFA 3MDYA 4IFCA 4H1JA 4UB7A 4AZWA 4X3FC 4AT4A 5EKNA 3SA0A 4NFNA 3DU8A 3QX4A 4RIWB 3RWPA 4NTSA 4DG3E 4QTEA 4Q9SA 2HW6A 4OBOA 3E87A 3OD6X 5CASA 4HGEA 4YTHA 2UW8A 4L68A 4BDBA 3FMHA 4FNYA 3CBLA 4YO4A 4CMUA 3R63A 3BBTB 5ICPA 2XKCA 4R6VA 3ROCA 3BWFA 4DG0E 1FPUA 2BRGA 2BR1A 4NEUA 2WMBA 1GOLA 4QP1A 3TNPC 3SRVA 2GFSA 2O3PA 3OF0A 1R1WA 3GQLA 3PY3A 3BV3A 4FZ6A 2NRYA 4QTCA 1R78A 5AV1A 2B52A 5AUUA 4UV0A 4U5JA 5AP6A 4PF4A 5AR8A 1Q99A 3IDCA 4R3RA 3LFEA 5DLSA 1H07A 2HXLA 3OWJA 4AACA 1KE8A 3KKVA 3NAYA 4AFJA 5A6NA 4F99A 3GOKA 2WGJA 4TRLA 4EOIA 2GNJA 3QUEA 3GOPA 3LCTA 2E2BA 3GVUA 3H10A 4FV8A 4NZWB 3H4JA 4AW1A 3MY0A 5T3QA 4ANNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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