The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
66
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sequence length |
197
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structure length |
197
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Chain Sequence |
PRCWNCGGPWGPGREDRFFCPQCRALQAPDPTRDYFSLMDCNRSFRVDTAKLQHRYQQLQRLVHPDFFSQRSQTEKDFSEKHSTLVNDAYKTLLAPLSRGLYLLKLHGIEIPERTDYEMDRQFLIEIMEINEKLAEAESEAAMKEIESIVKAKQKEFTDNVSSAFEQDDFEEAKEILTKMRYFSNIEEKIKLKKIPL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of human J-type co-chaperone HscB reveals a tetracysteine metal-binding domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Co-chaperone protein HscB, mitochondrial precursor
|
| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
66
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| structure length |
197
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| sequence length |
197
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07743 | HSCB_C | HSCB C-terminal oligomerisation domain |
| A | PF18256 | HscB_4_cys | Co-chaperone HscB tetracysteine metal binding motif |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain | ||
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Monooxygenase | HscB, C-terminal domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L6L A; 1N1C A; 1NZ6 A; 2QWR B; 2DMX A; 2CTW A; 2M6Y A; 2CTR A; 2QWN B; 2LGW A; 4IT5 A; 1WJZ A; 3APQ A; 2CTQ A; 1HDJ A; 4J80 A; 2N04 A; 2OCH A; 2PF4 E; 2GUZ B; 3UO3 A; 2YUA A; 1GH6 A; 1BQZ A; 2EJ7 A; 2GUZ A; 2QSA A; 3UO2 A; 3UCS C; 1FAF A; 2Y4U A; 2DN9 A; 3APO A; 2LO1 A; 1N4C A; 2N05 A; 2QWP B; 3BVO A; 2CUG A; 4J7Z A; 1IUR A; 1BQ0 A; 4RWU A; 3AG7 A; 2CTP A; 2Y4T A; 2KQX A; 2RKH A; 2YS8 A; 2QWQ B; 1XBL A; 2QWO B; 1FPO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OMA B; 2OIE A; 4ZKI A; 1KQS U; 1S5H C; 1Q82 W; 1XMG E; 2NLJ C; 5D5Q A; 3ZRV A; 2B9Z A; 5EC1 C; 4LH7 A; 1KU9 A; 3E4Y A; 4B3T B; 2A0L A; 4PI0 A; 1FZ7 E; 3W7W A; 1Q9Y A; 4X1I B; 3P3P A; 2F1M A; 2HP8 A; 2ODM A; 4UCS A; 3L0M A; 1H8H G; 4F6E A; 5C8Y B; 1XNQ B; 3AG2 B; 4UXN A; 4G28 B; 3ZN0 A; 5B1B B; 1QQC A; 4D6T H; 1YVW A; 3QF7 A; 2GBO A; 3CC2 V; 4DV0 O; 4DW1 A; 3ABK B; 2EIK B; 1KUQ A; 2KB1 A; 4XDL A; 2VWJ A; 5KHG A; 3U10 A; 3KKY A; 2XAH A; 3L72 H; 2DEB A; 4RAI A; 3JAL B; 2MMB A; 3JSN A; 2K5S A; 1NQT A; 1X4T A; 4BAY A; 3AK3 A; 1VP7 A; 2VIX A; 4FJL A; 1F7Y A; 1SQF A; 3X2Q B; 2HLD G; 4MVS A; 2IJK A; 1SQB H; 4QND A; 2E74 B; 2DTU A; 5LGU A; 1JFF A; 1I94 B; 3MAQ A; 5B1O A; 1IDS A; 3E2E A; 3E8B A; 4TV8 B; 1K34 A; 2LGQ A; 1IZ3 A; 1HW7 A; 1QBZ A; 3CCJ V; 3E8H A; 5FNV A; 2DOS A; 3SJJ A; 1Q8I A; 4UCR A; 3OGI B; 4J11 A; 3SQ4 A; 3SJA C; 3ZMV A; 3ASO C; 3CC4 V; 3WB1 A; 1HDJ A; 1IBK O; 1BS3 A; 3CFO A; 4I4T A; 2IJH A; 3ML0 A; 2JH8 A; 1VQ4 V; 4GX0 A; 2DYS C; 1W59 A; 2FW3 A; 2UUB O; 2YEV B; 4JTA B; 4WBN B; 4MVR A; 2M7W A; 1DK1 A; 2DWD C; 4WFF A; 4RNG A; 4A5U B; 2WPD G; 4K3A A; 5LHI A; 4D7S A; 4FFB B; 3K06 A; 3JD0 A; 4UB6 Z; 3STZ C; 3QVN A; 2GUZ A; 4DU1 A; 3ZN1 A; 4WF9 V; 2LO1 A; 3ZX6 A; 4E3S A; 2K9P A; 3OM3 B; 1M9N A; 2HFE C; 3FB7 C; 4JAV A; 1I7F A; 3FKS G; 3D8C A; 1FZ5 E; 2E75 B; 2XAS A; 4AKI A; 2RDC A; 3ASO B; 3K0G A; 1NEX B; 2QKS A; 2E5L O; 4X8A A; 2ZNI A; 4I55 A; 4LF9 O; 4WFB V; 4DTO A; 1Y74 B; 3CFP A; 1R3L C; 2P1P B; 1H2M A; 5IYZ A; 1JQ0 A; 1P22 A; 2P1N B; 4DO2 A; 5LGT A; 5KHJ A; 2E3C A; 2F43 G; 2DYS B; 5B66 Z; 1N36 O; 2H8P C; 3HPL C; 3SPG A; 3LDD A; 5L3E A; 2YIB D; 1J5E O; 2ZM6 B; 1FZ9 E; 4ADN A; 3TK1 A; 4UVC A; 3WSO A; 3HKD A; 5IYD O; 5FPR A; 5CBH A; 1I94 O; 1VQ5 V; 2ZD9 A; 3NDK A; 3SCX A; 1AVM A; 1OZ0 A; 1OCC C; 3CXH F; 1KEC A; 1S5L Z; 1ZAU A; 3CP1 A; 2Y69 C; 3P3N A; 4XDK A; 4E2L A; 1UJW B; 2ZIO A; 5LYJ B; 1FKA O; 4EB6 B; 3G71 V; 4O2B B; 1R1B A; 4FJJ A; 5JQG B; 2A9H A; 4JI0 B; 4DTN A; 1R6N A; 4JI1 O; 2CAZ C; 3OT7 A; 5KX5 B; 4DU4 A; 4BIZ A; 4LFC B; 3JCU Z; 3B09 A; 1JR9 A; 4FK0 A; 5HFM A; 3RYF B; 2Q5Z A; 4AQY O; 2PY5 A; 4O4J B; 1GMG A; 3ZBH A; 2B5U A; 4X65 O; 1Q6U A; 2R70 A; 3DXR B; 2QR4 A; 2UUA B; 3MHS C; 4M3R A; 2JDI G; 5IZ7 A; 2F66 C; 3ZJZ A; 3ZRX A; 2JS5 A; 3CX5 F; 3QNO A; 2P90 A; 2VJ4 A; 1P49 A; 4JI4 B; 1N33 B; 5KUK A; 5KA5 A; 2L6L A; 4OPA A; 1OCC B; 1H8E G; 2Q6A A; 1XVC E; 5KAI Z; 2WA3 A; 3H1H H; 2ILM A; 2O57 A; 2BCC H; 4EFB A; 2Y69 B; 2Y48 A; 3STL C; 4DR6 B; 4YJ3 B; 1FAF A; 2KSD A; 1YI2 V; 5EBM C; 1FFT B; 1K9M W; 1RPR A; 3RN4 A; 1IUR A; 2JGU A; 3CEI A; 3JSL A; 1XOU A; 1IH7 A; 4TUY A; 1L8D A; 3NXS A; 4PEL A; 3SYO A; 4DR3 O; 4BR6 A; 2YXY A; 4YIO A; 5H5N A; 1AIL A; 3I55 V; 1SER A; 1G1X B; 1TAE A; 2H94 A; 1JJO A; 1WN7 A; 3J80 N; 4M45 A; 3UM7 A; 2WSS G; 3K0D A; 4PA4 A; 1JMK C; 1T5E A; 2YIA A; 2OZM A; 4TSF G; 4RL5 A; 1VF6 C; 3IGA C; 2DYR B; 2DWE C; 4X66 B; 3CMA V; 2HR3 A; 2ZM6 O; 2ZCE A; 1SZX A; 2LW7 A; 2HG5 C; 1XMQ O; 1EM1 A; 1MAB G; 2L35 A; 3JAM N; 1L0N H; 4YIP A; 4X1Y A; 3L9D A; 3P30 A; 4WFA V; 4IIJ A; 3L1N A; 2Q9L A; 4JI2 B; 1FZI E; 4B3S B; 5EYP A; 2OVQ B; 2EJ7 A; 1SA0 A; 2Q7G A; 3RMB A; 1XVE E; 1MMM A; 4GZR B; 3AK2 A; 3JD3 A; 1P7G A; 1PV0 A; 1YXB A; 4DRX B; 1NH2 D; 2JGD B; 2R72 A; 1D5A A; 3DC5 A; 5LGN A; 1P4R A; 2WAM A; 4PA3 A; 4DTS A; 4LFA O; 4LF8 B; 4YXW G; 3OAA G; 4CZZ A; 3BFR A; 3K5L A; 1IVS A; 4JAA A; 2VQE B; 1SS3 A; 4PDR A; 1OV9 A; 3JCZ A; 1CLQ A; 3NR7 A; 3F5W C; 4K0K B; 2XUM A; 3K79 A; 1FXV A; 3QEI A; 3JAT B; 1E79 G; 4NVP A; 3ETD A; 3CS5 A; 2NR5 A; 4IGG A; 4O2A A; 1W0J G; 3ZMT A; 2EZO A; 4JYY A; 4AIL C; 3RT3 C; 3BY6 A; 2CGO A; 4KHQ A; 4FLU A; 3MKS B; 3RWR D; 4FVM A; 4IHJ A; 4B7K A; 3RVY A; 1K33 A; 1P7B A; 4IT5 A; 2QTS A; 3APQ A; 3UO3 A; 1GN2 A; 5BMV B; 2YUA A; 3A0R A; 3BA9 A; 3T4Z A; 2JEX A; 1QR8 A; 2P1M B; 4JF3 A; 1Z2G A; 1R6T A; 3K58 A; 3E83 A; 3RFR A; 3LNN A; 4F4L A; 4LF7 B; 2JHC A; 4UV8 A; 5TIS Z; 1EBO A; 4DTR A; 1KP3 A; 1FZH E; 1O9H A; 4X64 O; 3GB7 C; 1HP8 A; 2IU3 A; 5D5P A; 3ZHQ A; 2ZT9 B; 4CBC A; 4B3M O; 3UIQ A; 4TOI A; 1HNX B; 2QXF A; 4J10 A; 1M4U A; 4C7U A; 2RMK B; 2HVJ C; 1BHB A; 3J81 N; 5EBL C; 4PA9 A; 3LNM B; 2E31 A; 1EN6 A; 3SPC A; 3V7D B; 3K3W A; 4LF5 B; 2ITC C; 1OCZ B; 4PDM A; 5CA3 A; 3RGB A; 5J2T A; 3NCI A; 3C3T A; 2Y4U A; 2QEX V; 1P84 F; 3LUT B; 4M3X A; 4JI2 O; 4JRQ A; 3N2K A; 4NXM B; 1TUB A; 2UXD B; 1Q7Y W; 4FPP A; 4CS3 A; 4JI3 B; 2P22 C; 4UCV A; 5EIB C; 3TAF A; 1M1K W; 4W4L A; 4DXW A; 1IBL O; 1WA8 A; 3D36 A; 4P2Z A; 5IRE A; 4QE9 A; 1YJ9 V; 1XMF E; 3W7T A; 5IYB O; 3T1Y B; 3VQV A; 3A0H Z; 4NXN B; 4FK5 C; 2AW9 A; 3F5T A; 5GTH Z; 5L3D A; 4FM2 A; 5IJ9 A; 4HNA A; 1XL4 A; 2ATK C; 4X62 O; 3CCE V; 2D3O W; 4FK4 A; 4JTC B; 3R65 A; 1H2G A; 4K0K O; 2CTW A; 4CS4 A; 3FAV B; 2UUC B; 1MSD A; 3FYI B; 4JI7 B; 4X9Q A; 3CRM A; 4GX5 A; 3E8F A; 4KXR A; 2ITD C; 3RMD A; 1BQZ A; 3SVI A; 4DUY B; 4PI2 A; 2D2C B; 2Q67 A; 4D7T A; 4HYO A; 4DR5 B; 3B8N A; 4FM0 A; 2ZIM A; 2JJ2 G; 4JPR A; 4DR1 B; 1U97 A; 4ICG C; 3IC9 A; 2LFS A; 1MHY G; 3FB5 C; 4KFM A; 4FLX A; 1NH2 B; 1IBM B; 4DTJ A; 1Y4M A; 2QWR B; 4U3J B; 3JD2 A; 3JAR A; 5IWA B; 1S5J A; 3N27 A; 5JJE B; 4LF7 O; 4FJH A; 3CRR A; 4KHY A; 4DV7 B; 2P5O A; 2YDE A; 5L3C A; 1VQL V; 3APO A; 4E4E A; 4ZHQ A; 4GUN A; 2CUG A; 1ROP A; 3LSS A; 2KG7 B; 1M57 C; 3C6O B; 4PV1 B; 1SKV A; 3HKB B; 4MS2 A; 2PFT A; 1URF A; 4TT3 G; 1FXK B; 5CBG A; 1JJ2 U; 2Q73 A; 2OYQ A; 4JYA B; 3SUO A; 2FKX A; 1VF5 B; 5LMN O; 1QCE A; 4MT8 A; 5K1X A; 1CP9 A; 4WFE A; 4LF6 O; 2B7M A; 1YF2 A; 2RJZ A; 5KHI A; 3B4S A; 4FJK A; 1G4Y B; 3UCS C; 1YCI A; 3SYA A; 3NAE A; 3TAE A; 3JAS B; 1NTK H; 4Q6G A; 2UXD O; 4H0L B; 1D2D A; 4JI8 B; 2PI5 A; 2BOB C; 2W6I G; 2Q7H A; 4X1K A; 4KHP B; 3C94 A; 1WJZ A; 3JAW A; 4J80 A; 1B6Q A; 4X89 A; 4JI3 O; 3WU2 Z; 5H2F Z; 2YXH A; 4DTX A; 4IL6 Z; 2QWP B; 3C6P B; 2OZS A; 1GM7 A; 1KBH A; 3T2M A; 2QM7 A; 2AZ0 A; 4J7K A; 1GRJ A; 1S76 D; 1M57 B; 4K8X A; 1WPB A; 1WAZ A; 1Y76 B; 4NXN O; 5DN6 G; 2XOK G; 2DMX A; 2M6Y A; 2GTS A; 1AI7 A; 1VQ8 V; 2YIB A; 4PJ0 Z; 4W4K A; 3OTO B; 2ZXW C; 3SUQ A; 2UUC O; 4YHH O; 4NTY A; 4DR7 O; 1YHQ V; 1LDK E; 2B1E A; 2IBZ H; 4R7C A; 1IX9 A; 2XT9 A; 1NR7 A; 1AI5 A; 1NVP B; 4DUY O; 5BZB A; 4M3T A; 1GAX A; 4J9Z B; 1S3J A; 1E1Q G; 1H2K A; 4DR5 O; 5LXT A; 2QTO A; 3MHH C; 2QWN B; 5IJ0 A; 3HGK E; 1PL4 A; 5DEC A; 3K9S A; 3RYC B; 3SDL A; 4FM1 A; 2Q0A A; 5IWA O; 1L1F A; 1GTO A; 4JZG A; 5GON B; 3OGC C; 5JH7 B; 4LBE C; 1LR1 A; 2HJD A; 3QES A; 2AXT Z; 3OEE G; 2FYU H; 4O4I B; 2WWW A; 2P67 A; 4QPJ A; 1FJG B; 2LGW A; 4N21 A; 2PYL A; 2PF4 E; 2IW5 A; 1K5S A; 2ZXW B; 2UXB O; 5JCO A; 4CC5 A; 2N05 A; 4ABM A; 4DTM A; 1RSO A; 4F6R A; 4JYA O; 2HKO A; 2NNU A; 1R3J C; 3FX7 A; 2BOC C; 4I9L A; 1EZJ A; 3IAY A; 1FXX A; 3Q4H B; 3VBB A; 1XL3 C; 5AG2 A; 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4LNU A; 5LOV A; 2WLI A; 2RCU A; 4P9P A; 2QM4 A; 1GN6 A; 3HKE A; 3L8B A; 3D3I A; 1N0J A; 1FZ8 E; 1K7D A; 5J2T B; 4YJ2 B; 5H6Q A; 3HKC A; 3N1B A; 2P06 A; 2JJ1 G; 5F2V O; 5LP6 A; 3S3W A; 2CDY A; 1OCR C; 4FLV A; 4JYC A; 1LUV A; 4RWU A; 3QO5 A; 4TQD A; 2EIM B; 2V7Q G; 3FD9 A; 1AB3 A; 4GKK B; 1WB8 A; 1JVM A; 1HWY A; 4FIP C; 1ZX3 A; 1GN3 A; 1K97 A; 4FJI A; 1R3K C; 4RUE A; 4HZ3 A; 2B1G A; 1QHT A; 5BR8 B; 1BT8 A; 4KHN A; 1WA8 B; 2BSK B; 4I6J B; 4ZOL B; 3L73 H; 3RYI A; 4BW5 A; 3S3X A; 5CA1 B; 2HHH B; 5J2U A; 2ZDI A; 4MTG A; 3ZHR A; 3CRQ A; 4HNA B; 3S9H A; 3SQ1 A; 3CJH B; 1MZE A; 3WG7 B; 3OGM B; 3N2G A; 4FJX A; 5EC2 C; 1FFX B; 3QG5 A; 1YTF B; 3QEV A; 1ARO P; 1E1R G; 4NKG B; 1H2S B; 1XNR B; 5LA6 B; 4UVB A; 4FJ7 A; 2OCC C; 4HBN A; 3SUN A; 1R73 A; 2QA4 V; 3ZHU A; 2QGN A; 4X1I A; 3AG4 C; 4QNH B; 4JAU A; 3WB0 A; 5C8Y A; 3I56 V; 3W7U A; 4FLT A; 1FZ6 E; 2OIG A; 5B1A C; 4OX9 B; 3KD1 E; 3A2F A; 4UV9 A; 2IU0 A; 1N32 B; 4O4L B; 4X20 A; 4I7Z B; 2A79 B; 2JIZ G; 4MTO A; 3QEW A; 4FJM A; 3ZHS A; 1CXZ B; 3BVO A; 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