4J2BA

Rb69 dna polymerase l415g ternary complex
Total Genus 326
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
326
sequence length
901
structure length
901
Chain Sequence
MKEFYLTVEQIGDSIFERYIDSNGRERTREVEYKPSLFAHCPESQATKYFDIYGKPCTRKLFANMRDASQWIKRMEDIGLEALGMDDFKLAYLSDTYNYEIKYDHTKIRVANFDIEVTSPDGFPEPSQAKHPIDAITHYDSIDDRFYVFDLLNSPYGNVEEWSIEIAAKLQEQGGDEVPSEIIDKIIYMPFDNEKELLMEYLNFWQQKTPVILTGWNVESFAIPYVYNRIKNIFGESTAKRLSPHRKTRVKVIENMYGSREIITLFGISVLDYIDLYKKFSFTNQPSYSLDYISEFELNVGKLKYDGPISKLRESNHQRYISYNIIAVYRVLQIDAKRQFINLSLDMGYYAKIQIQSVFSPIKTWDAIIFNSLKEQNKVIPQGRSHPVQPYPGAFVKEPIPNRYKYVMSFDLTSGYPSIIRQVNISPETIAGTFKVAPLHDYINAVAERPSDVYSCSPNGMMYYKDRDGVVPTEITKVFNQRKEHKGYMLAAQRNGEIIKEALHNPNLSVDEPLDVDYRFDFSDEIKEKIKKLSAKSLNEMLFRAQRTEVAGMTAQINRKLLINSLYGALGNVWFRYYDLRNATAITTFGQMALQWIERKVNEYLNEVCGTEGEAFVLYGDTDSIYVSADKIIDKVGESKFRDTNHWVDFLDKFARERMEPAIDRGFREMCEYMNNKQHLMFMDREAIAGPPLGSKGIGGFWTGKKRYALNVWDMEGTRYAEPKLKIMGLETQKSSTPKAVQKALKECIRRMLQEGEESLQEYFKEFEKEFRQLNYISIASVSSANNIAKYDVGGFPGPKCPFHIRGILTYNRAIKGNIDAPQVVEGEKVYVLPLREGNPFGDKCIAWPSGTEITDLIKDDVLHWMDYTVLLEKTFIKPLEGFTSAAKLDYEKKASLFDMF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/dna
molecule keywords DNA polymerase
publication title Alteration in the cavity size adjacent to the active site of RB69 DNA polymerase changes its conformational dynamics.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage rb69
total genus 326
structure length 901
sequence length 901
ec nomenclature ec 2.7.7.7: DNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2013-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00136 DNA_pol_B DNA polymerase family B
A PF03104 DNA_pol_B_exo1 DNA polymerase family B, exonuclease domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1280.300 Mainly Alpha Up-down Bundle Monooxygenase Monooxygenase 4j2bA05
3.30.342.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich DNA Polymerase; Chain A, domain 1 DNA Polymerase, chain B, domain 1 4j2bA01
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4j2bA02
3.40.1820.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Ribonuclease H-like motif DnaQ-like 3'-5' exonuclease 4j2bA06
3.90.1600.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Palm domain of DNA polymerase Palm domain of DNA polymerase 4j2bA03
2VG6A 1GOCA 4ELUA 1JXEA 3ZSWA 4B3OA 1T03A 2IAJA 1RT4A 4AHVA 3QEVA 3ZT3A 2KZMA 4CF8A 1KFDA 4DMNA 4DFJA 4J2DA 1WSEA 1GOAA 3SYZA 3LWMA 3NF9A 1SL0A 4OKKA 3SNNA 3LP1A 4CGGA 3HXMA 1DTQA 3V9WA 4DSEA 3A2FA 3CYMA 3NCIA 3SPZA 2FBXA 3VQ8A 5E41A 3L2WA 3EYZA 3D45A 5SZTA 5J2QA 4HVJA 4DLEA 3V9ZA 3PX6A 3MXIA 2QK9A 2P5OA 5HRSA 1HYSA 4DU3A 4FK0A 3L8BA 4DF8A 1B9FA 3OYCA 3I0RA 1EP4A 4E7JA 3LPUA 3U3YA 1KTQA 5DMRA 2D0CA 4KKOA 4CEZA 5DK5A 4J2BA 4C8LA 4QOZB 3CFPA 4CJRA 5HROA 1R0AA 4E1NA 3AVFA 3V6DA 1UWBA 2ITGA 2QXFA 1WSGA 2D0AA 3SQ2A 2Z1HA 2HNYA 3KIOA 1D9DA 1XHXA 3F73A 3EZ5A 2FBTA 1RTJA 4FJMA 5K14A 2G8HA 3HPGA 5FRNA 3TAMA 3NF6A 3IAYA 2OPSA 4M3RA 1Z25A 1NJWA 4J2EA 4CK1A 2PYJA 4Z4CA 3MXJA 5J2PA 2JGUA 3DI6A 4BDYA 4E89A 3OYBA 1WAFA 4DQRA 4NCBA 1BIZA 1RT1A 1W9HA 1SUQA 3KLGA 1C1AA 3L3UA 4OLBA 1VSIA 3HVTA 1S6PA 1Q9XA 3WNEA 4CJVA 1LWCA 3OS1A 3OYDA 4CJ3A 1GOBA 5C24A 3VQCA 1YTAA 3WNHA 1XHZA 4N47A 3LP3A 1X1PA 1QSYA 4FZZA 2OZMA 2I5JA 5FRMA 4G1QA 1WAJA 4KHWA 3RRGA 5FROA 1QSSA 3HJFA 2F8SA 4FJ9A 2XY8A 1G15A 3ZSYA 4CIEA 3T19A 4O44A 4CERA 1FKOA 3SQ4A 4FM1A 4I2PA 2ZE2A 4FLZA 3NDKA 3ZSZA 3VA0A 1TK5A 3SUNA 1VRTA 3SPYA 5SWMA 1NKBA 2QKKA 1LW2A 4KAZA 2DFEA 4EZ9A 4AILC 4FM0A 4QAGA 4FJXA 1RT6A 4B8AB 2YNFA 1KVCA 3DOLA 4O55A 3VQQA 3K58A 5EU7A 4NYFA 1RBVA 4CK3A 3HYFA 4PQUA 3LPTA 2GV9A 2DTUA 2PZSA 3SZ2A 3FFIA 3B6PA 1L3VA 1TL3A 1BHLA 1QSLA 2YNHA 2ETJA 4FJ5A 4FJKA 2KW4A 1ZYQA 2HHSA 1TAUA 3RWUA 2VWJA 4CECA 4KO0A 4FLVA 3I8DA 4FLYA 4CGHA 3OS2A 4CHYA 1LW0A 4F3TA 2OPQA 4C8KA 1C1BA 3DRSA 1NK8A 3KLHA 4CJWA 1SL1A 4DU4A 3K5OA 1YT3A 4B08A 3L2UA 4B9SA 1NK0A 4HCCA 1S1VA 4CFCA 2PYLA 3AVLA 3RTVA 2KFNA 4KRFA 3VQ5A 4DS4A 3V81A 3TI0A 3AVBA 2AJQA 3AO1A 3E01A 3DLGA 4DQQA 3VN5A 3SV3A 2FBVA 1IKVA 1JLQA 3TAGA 1WN7A 2YNIA 4CEAA 3ULDA 3QIOA 3F9KA 4GMJB 4WE1A 4OKEA 1LWEA 3P5JA 1O1WA 1KVBA 1RTDA 4ZTJA 1X9SA 4FJ8A 1C1CA 1BL3A 3KLIA 4K8ZA 4C8OA 4Z4EA 3O3FA 2KFZA 1NK7A 3OYMA 1ZBHA 2ZQBA 4HHTA 3O4QA 3PUFA 3QERA 2P51A 3KJVA 4CGJA 2WOMA 1EX4A 2O4IA 4CCHA 4KI6A 5HBMA 1NJXA 1KSPA 3AO4A 3QEIA 4FJIA 1FKPA 4IG0A 4JRQA 2XY7A 3ZSQA 4OPJA 4HTUA 2A1SA 5HLFA 1X9MA 4KB1A 3VQPA 3SUPA 4LH4A 3K5LA 4I2QA 4Z4GA 2HHTA 4FW1A 4CJSA 4OGCA 1A5WA 3L3VA 4N56A 4DSLA 4Z4IA 3NF7A 1ITGA 2A1RA 5CY4A 4CJTA 3LZJA 4FJHA 1S1TA 1WSIA 4CFBA 4Y1CA 3V9UA 3RMBA 2B4JA 3C95A 2W42A 2BANA 3NHGA 3VQ7A 2ATQA 1BI4A 1TKXA 5KRTA 2EX3A 4PY5A 4IFVA 3OYGA 3LALA 1IH7A 1IKWA 1RT7A 3LP2A 2XY5A 3CG7A 2Y1JA 1XI1A 1NK9A 2G8KA 4LSLA 4BDZA 1IG9A 4C8NA 4OKJA 1JKHA 4CJUA 4W5NA 4DSKA 1CXUA 3HSTB 3M8SA 1A5VA 1QQCA 2IC3A 1HMVA 5HRRA 4DFMA 3OJUA 2XY6A 4CJFA 3OYFA 5I3UA 4ELVA 4ZTFA 1T8EA 1TK8A 1SL2A 4CE9A 2HW3A 3DRPA 4AHSA 1NKCA 3CFOA 3O3HA 4CF0A 3DLBA 4F4KA 2O4GA 4DS5A 4FK2A 3BDPA 2HVHA 4RW4A 4B9UA 4NCGA 3RMCA 4N76A 3RMDA 2DY4A 3SQ0A 3NH1A 1NOYA 1IKYA 4FJLA 3K5MA 3TARA 1RDAA 3PV8A 3OS0A 4KV8A 3D0PA 1YVUA 3HVRA 2VG7A 1D5AA 2P5GA 1U4BA 1BI4B 4DSJA 1JL1A 4KHQA 3AO3A 1BQMA 3TAPA 3K2PA 4M3UA 4Y1DA 4IKFA 1JLAA 4I9QA 3MEEA 2PY5A 2X78A 2RF2A 3DMJA 4CF1A 4CJ4A 1ASVA 4IG3A 2IOCA 4CGDA 2HNZA 4B9NA 2HHXA 2D0BA 3JSMA 1WSJA 4M3XA 4CGIA 1L3TA 1B9DA 1C0TA 1VSJA 3DLKA 4B9LA 3VQDA 2OPPA 3AVKA 4W5QA 1WLJA 1D8YA 2Q3SA 4W5TA 1RBRA 4JS4A 3KK1A 3CM5A 3HO1A 4FCYA 2G8FA 5T7BA 4XIUA 4CF2A 3DLEA 1JLCA 1UAXA 3C94A 3ZSVA 1SV5A 3AO5A 4I7FA 3QESA 1A5XA 1LAVA 1SKRA 2OYQA 2HNDA 3NBPA 1HNIA 2YHAA 2G8IA 4CJKA 2ZD1A 3HL8A 3O3GA 3KLEA 4PA1A 3SV4A 1KRPA 4DQIA 1JL2A 4M3YA 3AVNA 3QEXA 2HHWA 3G0ZA 3P83D 1Y97A 5KI6A 2RPIA 1BISA 3TAFA 3AVHA 4OJRA 3OYHA 3HT3A 4E7LA 1NK6A 1RTIA 1BCOA 3VQ4A 1I39A 4B8CA 1U49A 3THVA 4N41A 2DFFA 2Z1GA 4M3ZA 1VSLA 1KLMA 3VQ9A 4BWMA 1L3UA 3PO5A 3SI6A 1JLEA 4DTJA 1BIUA 2XHBA 4FVMA 4Q0BA 1JXBA 2IGIA 2WONA 3NAEA 2X6NA 1U48A 3IS9A 1RDDA 4E1MA 4KHUA 3VQBA 3HP6A 1RT3A 1WSFA 3ZCMA 2HB5A 1XWLA 3V9SA 4ELTA 3ZT4A 1W0HA 4CJPA 3CM6A 4I9LA 4E19A 5HRPA 1JLBA 3EY1A 3LAKA 3V1OA 1TKZA 3TWHA 4FLUA 5C25A 4OLAA 3BGRA 4KPYA 3CQ8A 4W5OA 4RG8A 3DM2A 3LDSA 4FJJA 3OY9A 4LD0A 4H8KA 4O4GA 3SUOA 2HVIA 1VSHA 3QNOA 3MEGA 4FXDA 3KK3A 3L2RA 3AVMA 4CJEA 3K5NA 1MU2A 4OGEA 1X9WA 4FM2A 4EP5A 3LANA 4RW9A 3ZT0A 1RBUA 1IKXA 2GUIA 2IDOA 3NGZA 1ZBIA 1KVAA 3OVNA 3NGIA 4Z4FA 2QKBA 2VWKA 3HM9A 3S3NA 4O0IA 3DLRA 2NUBA 4KREA 4AHUA 1QE1A 3L2QA 2BGGA 1CZBA 4C8MA 5J2NA 1VRUA 1RBTA 2RKIA 1T05A 4F2RA 1RBSA 3QO9A 4FZYA 4JRPA 3LWLA 3KKSA 4YFUA 1VSFA 2X74A 2VG5A 3TR8A 4L8RB 1ASWA 4CJQA 1C0UA 2YKNA 1ZBLA 4J2AA 4Z4HA 4CEQA 3OYIA 4CEFA 4O0JA 3NH0A 1S6QA 1KFSA 2Z1IA 4KHNA 3OYEA 4EZ6A 2BDPA 1BQNA 1DTTA 3ZSOA 3V4IA 2HHVA 1TVRA 2D5RA 3RR8A 2HMIA 1CZ9A 4CIFA 1EKEA 3MEDA 1BCMA 3AVGA 1S9GA 3AVJA 4OVLA 4DFPA 3SUQA 3TANA 3CFRA 3V1RA 4CESA 1TAQA 4FYDA 5CZ1A 4N5SA 4QCLA 2B5JA 4DTUA 3MAQA 4LSNA 4E7HA 4CEOA 4FJ7A 1QTMA 4CFAA 3JYTA 4KTWA 4RW6A 4DF4A 1J54A 3IG1A 3TAEA 1IO2A 1RILA 3ZT1A 1U45A 4FLXA 3ZSXA 1FXXA 1RNHA 4FLWA 3QIPA 3AVCA 5HP1A 2RN2A 5FDLA 1REVA 3S9HA 3QNNA 4AH9A 3SCXA 4KHSA 4M3WA 4DQSA 3M8PA 1TKDA 3AA3A 2DFHA 4ICLA 4BWJA 3LP0A 4DTXA 4EP4A 1FK9A 4DTPA 1S1UA 3AVIA 2OPRA 3B6OA 2R7YA 1TGOA 3S3MA 3AO2A 3P1GA 4CFDA 2G8VA 3KD5E 3QETA 2Y1IA 2G8UA 1NK4A 1EXQA 5CYQA 4DFKA 3C6UA 1HRHA 4LH5A 4JLHA 3V9XA 2YHBA 2YV0X 5D3GA 3NH2A 1HQEA 1RCHA 1J9AA 1N6QA 1ZBFA 3VA3A 3SQ1A 4HUFA 4KHYA 3QEPA 1Q8IA 1LAWA 4FJNA 2GBZA 5C42A 1ZBUA 1J5OA 4LY7A 1EETA 2XRIA 1CLQA 3AVAA 3MECA 1HQUA 4CJLA 2E6LA 3AA2A 4CEDA 3ASMA 3M8RA 4AHCA 4CGFA 5KTQA 1SKWA 4DTRA 4F2SA 3U6FA 1S9EA 3AV9A 3PX0A 4DTOA 3C6TA 4CHPA 4OPKA 1S1XA 1BGXT 1HYVA 1YTUA 4KI4A 5CYMA 3ZSRA 1KCFA 3LZIA 4E3SA 1U47A 4CIGA 3QLHA 5JS2A 3LAMA 1UOCA 4B9MA 4BE2A 4FLTA 3VQEA 1QS4A 3OJSA 2FBYA 2IS3A 4IFYA 1B92A 3I0SA 3PO4A 4PUOA 4HCBA 4CHNA 2E4LA 4DSFA 1HPZA 3O4NA 1VSKA 4NCAA 5J2MA 2XO7A 3QINA 3TAQA 4AHTA 2KTQA 1CXQA 4H4OA 4FK4A 4KFBA 1U04A 3MXMA 1NKEA 5I42A 3OYAA 3KLFA 1VSEA 4W5RA 2BE2A 4DTSA 2OZSA 1ASUA 1TK0A 1NJYA 3WNGA 3V1QA 1NK5A 4BDPA 3VQAA 3TABA 3IRXA 3OYJA 4UQGA 4CF9A 3OYLA 1TL1A 3DRRA 4BACA 4GW6A 1N5YA 4Z0UA 2HHQA 4B9TA 3SJJA 4RW7A 3T3FA 4H4MA 5HRNA 1Q9YA 4Q5VA 5KGWA 4E0DA 4CHZA 4MFBA 2G8WA 3DOKA 2EHGA 3DYAA 1D9FA 2YKMA 1NOZA 3L2VA 2FC0A 5JS1A 3PX4A 4IBNA 3ZT2A 3RMAA 3OYNA 4M45A 2LSNA 3RR7A 2F8TA 4E7IA 4HUGA 2JLEA 3KD1E 4B9VA 2HHUA 4RW8A 4CJ5A 1I3AA 2E6MA 2KQ2A 3WNFA 4CHOA 2F96A 5CZ2A 5J1EA 2OA8A 4JS5A 3NF8A 3HPHA 1LV5A 1VSDA 3NFAA 3KTQA 1VSMA 3PY8A 4FZXC 1HYZA 1QHTA 3AA4A 1TKTA 3KKRA 4CEBA 1LWFA 1TV6A 4ID5A 1S1WA 2B6AA 4O5BA 4BE1A 3VQ6A 3RRHA 4DG1A 1UA0A 1SKSA 4CHQA 4YNQA 1RT2A 1WSHA 1KLNA 4GVMA 4FW2A 4M42A 4DWIA 2X6SA 4E7KA 3NGYA 4CEEA 3NE6A 4M3TA 1RDBA 3DLHA 4M41A 3H08A 4HUEA 4CK2A 4F3OA 4PWDA 4NYNA 3T1AA 4DTNA 3UIQA 1JLFA 3ISNC 4ZHRA 4TSXA 4BE0A 2YNGA 1WNSA 1Z26A 1RTHA 3ALYA 5KRSA 2Z1JA 3ITHA 1NJZA 1K6YA 1JLGA 4DTMA 3G10A 3HPOA 3M8QA 3K57A 4DQPA 2P1JA 4KTQA 4FJGA 1S5JA 1HNVA 4KTZA 1VK0A 4F8RA 3AA5X 3U3GA 1HJRA 3K59A 1L3SA 3HP9A 1C6VA 4DLGA 3S3OA 4DU1A 3QEWA 4DSIA 2KZZA 1XC9A 4ID1A 1F21A 3KK2A 1C0MA 4AHRA 4KB0A 3OYKA 1UA1A 1L5UA 5KGXA 1RT5A 1T7PA 1DLOA 1RDCA 4IDKA 4MQ3A 4R5PA 3HK2A 1J53A 4K8XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3QERA 2P51A 1NGAA 3L1NA 1EX4A 4X65K 5E26A 4KI6A 5HBMA 1KSPA 4JRQA 4IG0A 5AQYA 5HLFA 4KB1A 3VGLA 4LH4A 5IT9O 4EHTA 4WQ5C 5KQ8A 4IWVA 3L3VA 4N56A 1ZC6A 1NMNA 4KBOA 2A1RA 3LZJA 4FJHA 1WSIA 4CFBA 3DLLL 1E3MA 1VQ5N 1BI4A 1TKXA 3EN9A 3LALA 1IH7A 3LP2A 2Y1JA 1XI1A 2G8KA 4WFBL 1JKHA 2UUBK 4BR4A 3R8EA 1CXUA 1QQCA 1HMVA 2D1KA 4NXNK 2XY6A 2HW3A 4ZTFA 1SL2A 3DRPA 3ID8A 3L6QA 3O3HA 4CF0A 3KZBA 2O4GA 4DS5A 3AGRA 4EAHD 1XMOK 4FK2A 3T1YK 3BDPA 2HVHA 3CC7N 3CQXA 4FJLA 4GAMC 1X3NA 1EQYA 2CGJA 2P9SA 1D5AA 2H3GX 5AQLA 1JL1A 1BQMA 3RSEA 1JLAA 4I9QA 4WYBA 3SAFA 4CF1A 1LDKE 3L0MA 3THWB 2D0BA 3JSMA 4OPAA 2IVNA 2QWNA 1C0TA 3DLKA 2O8EA 2Q3SA 2J4RA 1RBRA 3CM5A 5M1QA 3THXB 5LL6Z 2GELA 4CD3A 1JLCA 1UAXA 4B1XB 3ZSVA 1SV5A 3VF4A 3OGMB 3VEYA 3TSPA 3QESA 2NRTA 2OYQA 3NBPA 5IZ7A 2OTLN 2G8IA 3AVNA 1VQ4N 5KI6A 1Y97A 3THYB 5M1PA 1RTIA 1BCOA 3OW2M 3THVA 4X5MA 2DFFA 4K0KK 5AQRA 3EEQA 1EWRA 5BPNA 1L3UA 3PO5A 4WQ4A 3HGKE 3DWLA 2IGIA 4FWQA 3IS9A 5AQOA 4BGBA 2WBNA 4BRAA 2HB5A 3V9SA 4MLEA 3CM6A 1FZ5E 4FWLA 3H1VX 4E19A 3VEWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VG6 A;  5BRH A;  2WUS A;  5AQK A;  2IVO A;  1KFD A;  3VEV A;  4J2D A;  1WSE A;  3AAR A;  3O1B A;  3V9W A;  1DTQ A;  2P9U A;  3A2F A;  3SPZ A;  3L2W A;  3EYZ A;  2O8D B;  1GLJ O;  2E2N A;  3PX6 A;  3ZLJ A;  5HRS A;  2NRW A;  4DF8 A;  3AAQ A;  1KQS M;  4E7J A;  1G99 A;  5AJ3 K;  4H0V B;  2D0C A;  5DK5 A;  4C8L A;  4QOZ B;  3FZH A;  5HRO A;  3A8Y A;  4LF7 K;  1EWQ A;  1WSG A;  2P1M B;  2Z1H A;  3O9Q A;  1XHX A;  3F73 A;  2D0O A;  4FJM A;  1K73 O;  1VQ8 N;  5FRN A;  3IAY A;  1NJW A;  4JK9 A;  5AZJ B;  4CK1 A;  2PYJ A;  4Z4C A;  4BDY A;  4LF6 K;  3OYB A;  3EKS A;  1WAF A;  1RGI A;  4NCB A;  1BIZ A;  1RT1 A;  3L0Q A;  2E5L K;  1C1A A;  1R59 O;  1VQ7 N;  3L3U A;  4OLB A;  4HWI A;  1VSI A;  3HVT A;  1S6P A;  3WNE A;  3VEX A;  4A2B A;  2BH1 A;  4PKI A;  3R6M A;  2V7Z A;  5E84 A;  3VQC A;  1YTA A;  2HBJ A;  3WNH A;  3LP3 A;  2ZWH A;  2XY8 A;  4A5B A;  3T19 A;  4FM1 A;  1NGJ A;  5JLH A;  4CZF A;  5AQF A;  4FM0 A;  2BUP A;  2YI1 A;  2HHH K;  2FSN A;  4O55 A;  3K58 A;  5EU7 A;  4NYF A;  1RBV A;  4XH1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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