1B48A

Crystal structure of mgsta4-4 in complex with gsh conjugate of 4-hydroxynonenal in one subunit and gsh in the other: evidence of signaling across dimer interface in mgsta4-4
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
221
structure length
221
Chain Sequence
AAKPKLYYFNGRGRMESIRWLLAAAGVEFEEEFLETREQYEKMQKDGHLLFGQVPLVEIDGMMLTQTRAILSYLAAKYNLYGKDLKERVRIDMYADGTQDLMMMIAVAPFKTPKEKEESYDLILSRAKTRYFPVFEKILKDHGEAFLVGNQLSWADIQLLEAILMVEELSAPVLSDFPLLQAFKTRISNIPTIKKFLQPGSQRKPPPDGPYVEVVRIVLKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a murine glutathione S-transferase in complex with a glutathione conjugate of 4-hydroxynon-2-enal in one subunit and glutathione in the other: evidence of signaling across the dimer interface.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (GLUTATHIONE S-TRANSFERASE)
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 74
structure length 221
sequence length 221
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1999-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1b48A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1b48A01
1U3IA 4IW9A 4AJ6A 1BAYA 2ES7A 3RPPA 4KDXA 3TRPA 4POLA 2X8HA 1YJ6A 5IMAA 5DDLA 3EURA 4WETA 4F2IA 4KW6A 4J2FA 2B3SA 3H8QA 5ECNB 4HQSA 2CX3A 3M3MA 4EE0A 1WIKA 2O89A 2B1LA 5LCZA 4TRXA 1K0OA 4FH8A 20GSA 1WMJA 2DJ0A 2VCWA 2H72A 2IL3A 6GSVA 5EY6A 2L57A 4EO3A 5JCUA 1K3LA 1TI3A 2MBTA 2DJ2A 2H1GA 2VD1A 2RIIA 1Z3EA 5GSSA 3F6DA 5D9VA 3J7Yb 2CZ2A 2FUG2 1R26A 4Z7XA 4BWQA 10GSA 1EV4A 4HZ2A 3D6IA 5HQPA 5DBQA 4G0IA 1GTIA 3CRUA 4MP4A 4ZILA 5B6MA 3HVXA 1AIUA 4NMUA 4MDCA 4GSTA 1U6TA 1SYXA 3DD3A 2H73A 4NHZA 1X9MB 2VOCA 1IYIA 4ECJA 2G0FA 2LRCA 4ID0A 1RK4A 4POMA 3GKXA 2L6CA 2XHFA 3PR8A 2V2GA 2VL9A 4LL4B 4KSMA 1F2EA 1WJKA 1QK8A 1Z7PA 2IFQB 3VPTA 3ZFLA 4TR0A 4V1Ag 2B6MA 1U88A 3HCZA 3C73A 3FEUA 2HQTA 4I5QA 2H0GA 2HSMA 4HZ4A 3DVXA 3GYKA 3Q19A 5HR1A 4RQXA 2EIOA 3RPNA 4MF5A 3GKMA 1ILOA 1K3OA 4BVXA 2CVBA 4TR1A 1YKAA 5JCWA 1SK1A 3UAPA 1Y25A 3QFAC 2GTUA 3PH9A 2FWGA 4YAPA 1PA3A 2C0FA 3EMXA 3TKPA 1A24A 2C4JA 4ZBAA 4POBA 1SKWB 1M99A 5J9CA 1ST9A 2GZZA 3GHAA 1GUMA 4PXOA 4IP1A 3M0FA 1K0CA 3GSSA 1X5EA 3HVSA 5AIXA 3UEMA 4CHSA 2YOIA 2OADA 1PGTA 2GQLA 3IAM2 4MJCA 3H93A 2B5YA 1V57A 2JSYA 5GAND 3UL3A 5J5NA 4LL1B 5F8BA 3HJMA 3QOUA 1YDKA 2WULA 3VURA 4IELA 3L9VA 1O8XA 1SL0B 1NSWA 1ON4A 1QFNA 2VL2A 4MLYA 2LSTA 4EC0A 3FRCA 3IHQA 3GX8A 2JU5A 3Q74A 1FHEA 1NM3A 5GSTA 2IMDA 2X64A 3CBUA 1JZWA 1GNEA 4N10A 4IQ1A 4ZBBA 3EINA 2GQMA 3FKFA 3G7JA 2FA8A 4YAVA 3H4KA 2HE3A 1F9MA 1T8EB 14GSA 5A5KA 5CO3A 2OKAA 1AXDA 3IRAA 2H71A 4I8BA 5JWRB 2OBKA 5LD0A 1W4VA 1O8WA 4PQIA 1TK5B 2CVKA 1YKCA 1JZRA 4E8HA 3O6TA 1ZYEA 5ECMB 5DALA 4QL7A 3C8EA 1TP9A 1V9WA 2MMZA 2FCHA 3TRXA 2H66A 1XWKA 1T1VA 4WF5A 3IBHA 1M2AA 5IO0A 3WT2A 3AY8A 2WB9A 3GL5A 2VL2C 3NOFA 1J9BA 3ZYWA 1RQMA 1XWCA 3HJOA 2HZEB 2WCIA 3WGDA 3FK8A 2R37A 1V58A 3DMLA 1G7EA 3WT1A 3ZMLA 3GMFA 1HNCA 2ON5A 3VWUA 4JEDA 1FVKA 2C0EA 5D8IA 1PN9A 4PQ1A 2J23A 2F3MA 2CX4A 3QAWA 4NV2A 1A0RP 5KEJA 1WPIA 1XFLA 1PL1A 3DXBA 1OKTA 1SJIA 3CYNA 2NTOA 4CW9A 3VWXA 3ZREA 3V1WA 1ZOFA 2OBIA 3GIXA 1YEPA 2GS3A 1WOUA 4ULXA 2P5RA 2PU9C 3O3TA 2L5OA 4YQVA 3MWHA 2C0DA 4TKYA 2PMTA 5J41A 1GH2A 4OD7A 1OC8A 2VLUA 3CSJA 3LXZA 5A4VA 1A23A 3GNJA 2NDOA 2XBQA 2AUVA 1AAZA 4NAXA 2YV7A 2DC5A 3GRXA 4ML6A 3D5JA 1GSSA 2DLXA 1GULA 2VIMA 4IGJA 5J4UA 6GSTA 3KTLA 1YF0A 2VCTA 3QDNA 2MMNA 1U87A 2DIYA 4K2DA 2GGTA 1F3BA 3TJFA 3IA1A 2VCZA 4WXTA 1WWJA 4OCEA 4WF4A 2KP1A 4E8EA 2R6KA 3C7MA 1SKSB 5DCGA 3CTGA 3VI7A 4KE3A 5DVBA 2V6OA 2L6DA 3W6GA 2OE3A 4G19A 1Z6NA 1TU8A 2I1UA 3K8NA 4HU9A 5L71A 1XWGA 1DSBA 4TR3A 2HRKB 4KDYA 3IOSA 2IMKA 4TVEA 5G1KA 1FG4A 5A4UA 3RHCA 3BBYA 1T00A 2ON7A 1R5AA 1FVJA 2A2RA 3E0UA 4MZCA 3EMPA 4LMWA 1TU7A 2H6XA 2B1KA 4JU5A 4OO5A 2QSIA 3CTFA 4GF0A 3TJKA 3BOAA 3P8WA 1TRVA 4IJ3A 5J3RA 4AF2A 2LJKA 2L5LA 5ELAA 3OR5A 5H5RA 1PX7A 1W89A 5CRDA 4XS6A 1USBA 1CQGA 2V1MA 3CSHA 3I69A 2WS2A 2BJXA 4F03A 3QD9A 5ECIB 4PX1A 1ERWA 3DGQA 6GSYA 18GSA 2YCDA 1SENA 3M8NA 2H1AA 1E6BA 4TXOA 3TUEA 5ECQB 2R4VA 1XCCA 5DQSA 5DQYA 5ECPB 1F37A 3ZTLA 2REMA 5IOWA 3BCKA 2H01A 3GX0A 3ED3A 3G9BA 5CNWA 1ML6A 4K7OA 4WBJA 2CVDA 1XVQA 4RI6A 5BMUA 5ECLB 2H6ZA 3QAGA 4MH3A 3I43A 2NPBA 4ZIJA 3FY7A 1R5PA 4BVYB 3HDCA 2M72A 1HD2A 3H79A 3KZQA 1EOGA 2QKEA 3KIJA 1EP7A 3BD2A 5CYYA 2AJQB 5DAKA 4EVMA 6GSWA 3BJ5A 2XBIA 1BJXA 1A8LA 3IV4A 4MPFA 3EE2A 2X8GA 4ZL8A 1TOFA 3WYWA 5HR2A 4HUAA 1A2MA 3LJRA 3U6VA 5B7CA 1GSDA 1YF1A 1M9AA 2C3QA 4ILFA 2PUKC 2C8UA 3KMNA 3L78A 4NXIA 3KTBA 2B5EA 4K1FA 1JFUA 2K6VA 4DSQA 5B6NA 5CAXA 3KCMA 4D73B 3TDGA 17GSA 2LQQA 1Z5YE 3EVIA 2LEGA 2YWNA 1B9XC 6GSSA 1ACVA 3MDKA 2YANA 2LQOA 1F6MC 4KNDA 2XC2A 2N5FA 1MD3A 1GP1A 3ZLPA 2PVOC 2I9HA 3W8JA 1SD8A 2HXKA 1FAAA 1X5DA 4JZQA 2EC4A 3IE3A 2H70A 1VGLA 2FGXA 2H75A 4ZB8A 1GNWA 4DEJA 3GURA 5DJLA 4L0WA 3DWVA 4K7NA 4PGTA 3P2AA 2LJAA 1UN2A 6GSXA 3ZMKA 4K6XA 7GSSA 1OC9A 5IPHA 1TKDB 3GKNA 2HT9A 4EDZA 1KBNA 2DJ3A 1ZMAA 3QPMA 3GA4A 2R3XA 4GSNA 3IXRA 4ZL9A 3TKQA 3P90A 4L8EA 3SBCA 1TRUA 4AJ7A 4J57E 1PL2A 2VL3A 2VAFA 3L0HA 2HZFA 3KXOA 4F0BA 1PSQA 2A2SA 3MNGA 2L4CA 4RUVA 5AISA 1XWBA 3UMAA 4QL9A 5F0GA 3R3EA 5AIVA 4ML1A 3TB2A 2V6KA 4ZB9A 3UBKA 4EUYA 3LYPA 4EKZA 3GSTA 1K0BA 5G1LA 3NZNA 1Q4JA 3IAS2 4L5LA 3ZFBA 4EL1A 1XOAA 4Q5RA 5IMCA 3CRTA 4PNFA 2I81A 5A4WA 5FT3A 3D4TA 5ID2A 2LTKA 3GTUA 1V98A 2FA4A 1AW9A 3KD0A 1MDKA 4MJEA 5IM9A 3APQA 1GLPA 1PMTA 1PX6A 2HRNA 4XCSA 4Q5FA 3QMXA 3VFIA 1S3DA 4TR4A 1O7UA 4MABA 1TJDA 2LV3A 5E59A 1ZL9A 1A2JA 1TI1A 1BYEA 1AQXA 3ZRDA 1KEBA 1GLQA 4X1UA 2LS5A 1WP0A 3LYKA 3M9JA 2C3NA 5E4WA 19GSA 3KP9A 4XS4A 3C71A 2JZTA 2FLSA 4IN0A 5D9TA 4PNGA 2CV4A 4V1Ap 4HU7A 3U5RE 1Y6EA 2DMLA 1EWXA 3LQ7A 1M2DA 3A3TA 1FW1A 3ZVJA 4QQ7A 2CAQA 5G30A 4NPBA 5HR0A 3TRQA 3MSZA 2X99A 3D0ZA 2R2JA 4G2EA 1PRXA 3D4MA 4WEYA 2YJHA 1EEMA 3FYGA 3FZ9A 3ISOA 3M1GA 1I5GA 2FD3A 4KSOA 1Q98A 2HSMB 3HZ8A 4KCAA 5F05A 2RLIA 2JZSA 4NHWA 4V2LA 1TRWA 3APSA 3KH9A 3HA9A 4JR6A 4MPGA 4BVXB 4TR1B 5G5FA 1T4YA 1B48A 5EL8A 5JCGA 2PERA 1EV9A 3UARA 2IWTA 4TOPA 4MJBA 4MMMA 4KCEA 2YWMA 4XS1A 1FB0A 3EU3A 2AHEA 3VWVA 3RHBA 1SJ6A 3F4SA 1I9DA 3L4NA 5IPGA 3UVTA 4XRAA 5CRHA 4MCUA 3KEBA 3LWAA 3WGEA 1UA5A 5B8AA 4MK3A 2RUFA 2AYTA 4DSSA 1FB6A 4XTSA 1HNAA 5IMFA 2GZYA 1SKRB 1GWCA 2GSRA 1DE1A 2GZPA 2AV4A 4FYCA 1G6WA 2FY6A 1MD4A 2IIYA 3SWLA 1TXXA 3GN3A 3MAKA 1QXHA 4V2NA 1FOVA 2CZ3A 2M80A 3S9FA 4F9ZA 12GSA 4HI7A 2GDRA 2ALBA 5ECHB 1GTBA 1V40A 4BL7A 3TJJA 1MDJA 3DRNA 2YJ7A 1YQ1A 3O76A 1O73A 2ZCTA 1PKZA 2QC7A 1XPVA 4L0UA 1B4QA 2X8CA 5HR3A 3KGKA 1CQHA 3CXGA 1S3CA 1SD9A 3UJ1A 5AGYA 2LRNA 4XIHA 5HFKA 3ERFA 4HEA2 1A0FA 11GSA 2HLSA 3ERGA 3D21A 5D73A 1M9BA 1ZCPA 4EF0A 1TW9A 3HKRA 4O32A 5KN3A 2LKUA 1ZZYA 3HYPA 2O85A 4KGIA 2OACA 1TK0B 4GSSA 1LJRA 2H6YA 3EC3A 4LA1A 1GL8A 1O81A 2YWIA 2VUPA 4GLTA 2FWHA 2NVLA 3L9SA 2MZCA 3GH9A 2H76A 4HQZA 3US3A 5DALB 1K0AA 3A2WA 3TCOA 2B7JA 1GRXA 4IBPA 2RUEA 1MEKA 6GSUA 3KM6A 4N11A 2H1DA 1HQOA 5IMDA 1KTEA 2DMMA 3C1RA 2N5AA 4K0NA 1GUKA 2L4QA 3PPUA 1PQNA 1EGRA 3TJGA 2IMEA 3GUSA 1S3AA 2WDUA 1TK8B 2VCXA 1O85A 1QUWA 1JZDA 1QGVA 2GSSA 3LSZA 1AUCA 4BPYA 2OJLA 5IO2A 2IFQA 3F0IA 5ENUA 1THXA 2Z9SA 1DE2A 4GTUA 1IYHA 4FQUA 3QCPA 1GSFA 1XW5A 4YH2A 3VWWA 3ERWA 1XOBA 4OFTA 2YZHA 2ZNMA 1X9WB 2IJYA 4JRRA 4V2MA 4ZB6A 2FWEA 1A2LA 8GSSA 4JR4A 1B8XA 2HSNB 1FO5A 3KH7A 3HHVA 1VF2A 1WRYA 2FHEA 4ISDA 1Z6MA 2LNSA 4ECBA 4KX4A 3TKSA 2E7PA 3LEFA 2GSQA 4F0CA 1YEXA 4EXJA 3KJYA 2VCVA 3ZVJD 5JWOB 1NW2A 3W8SA 4HOJA 2E2GA 5ECSA 3HJPA 2OE1A 1J0FA 2C80A 2VM1A 1DUGA 2G2QA 4MF6A 5HFIA 1SU9A 1GSYA 3FR6A 5ECRB 1JZOA 2VLVA 2JZRA 5F06A 2VO4A 2K18A 3G7YA 4DSRA 2AB6A 1WE0A 5ABRA 1EEJA 13GSA 1EGOA 3FZAA 5B8BA 2JADA 1X9SB 5C04A 1C72A 3GV1A 5H5SA 3IC8A 5LNKe 4J56E 1SK0A 4O5RA 4EDYA 5COHA 3EYTA 2GVPA 3APOA 5DJMA 1XW6A 3F4RA 2WGRA 1AQWA 2TRXA 1E2YA 1XXUA 2A4VA 4N0VA 2YN1A 5IQYA 4ZXGA 1PKWA 1VRSD 2PWJA 2LNTA 3IDVA 4PURA 4MH2A 3ZIJA 3VK9A 4WR4A 1O6JA 1UC7A 1AC1A 2FWFA 1A8YA 1NHOA 1SYRA 3KMOA 4G0LA 1YZXA 2BTOT 4G9HA 3TKSC 1NHYA 4JE1A 4I2UA 3ZITA 4NWYA 4O92A 4RQRA 4TN8A 3PGTA 3ZIVA 1G6YA 3TKRA 4N30A 2WFCA 4K0GA 2DJ1A 1U3AA 3RBTA 2HNLA 2I3YA 2H74A 1M0UA 2UZ8A 3F4TA 4G0KA 4GRFA 4MA9A 4JBBA 3CMIA 4TXOB 3FHKA 1GSUA 3TKSE 4XHMA 4MZBA 5AN1A 2MYGA 4LMVA 2O7KA 3JCML 3FR3A 4OFNA 2TIRA 1MDIA 2NBSA 2HZEA 1R4WA 5GZZB 1XZOA 2RM6A 1PD21 4WKWA 2H0HA 3DKSA 4HS1A 1J08A 2PBJA 3DVWA 4I97A 3IC4A 1JLVA 1G7OA 1LBKA 5CREA 1K0MA 4IVFA 4ZL7A 4PUFC 3DEXA 4WBRD 3ZL5A 4AGSA 1Z9HA 4OCFA 5FHIA 2GLRA 2HRFA 1ERTA 5DAKB 1EZKA 4GQCA 5IMZA 1B9YC 4P3YB 3N9JA 2P31A 1BEDA 2PN8A 5D9XA 2C0GA 3WGXA 2DJKA 3TOUA 1XVWA 1K3YA 5J9BA 5INYA 1OAZA 2P5QA 1BG5A 2IMIA 2QGVA 2R5GA 5F07A 3RAZA 3ZZXA 1GTAA 3QAVA 2MMOA 5FWGA 2PPTA 5D9WA 1BQ7A 2JACA 4FIWA 4ECCA 3QR6A 1EP8A 3R2QA 4KUNA 2TRCP 1H75A 3I6AA 4KH7A 3N5OA 3TGZA 3LFLA 2I4AA 5EVOA 1MTCA 1OYJA 4Q5QA 3LXTA 3IK9A 2E2MA 1ERVA 1AQVA 1ZGNA 5KN0A 1H4OA 4F82A 3UIWA 1X0RA 3Q18A 2XPDA 1ERUA 1M2BA 2P0GA 4MJAA 4OO4A 1B4PA 4MZWA 1KNGA 3F6FA 4PUAA 4X0XA 2CQ9A 1N8JA 5CRWA 2C1YA 4FO5A 3FZ4A 3LGCA 3HXSA 4BWSA 4KB3A 2IN3A 4Q5NA 2VLTA 2K8SA 2AAWA 3GFKA 2VM2A 1ZYQB 4IS0A 3VLNA 5EPFA 1OC9B 4K8MA 2HRKA 2E0QA 4H86A 3I9V2 2HI7A 1GSQA 3HY2A 3DYRA 1XW9A 2OA7A 4GXZA 4IP6A 5DCHA 2FNOA 3E9JB 4LLRA 3C1SA 4KA0A 2GQKA 1HNBA 2L59A 2F8AA 1SJZA 2YZUA 3KP8A 4O7HA 2DSAA 1SK2A 3HZ4A 5ECOB 5KN2A 2GSTA 1GSEA 2GT5A 1JLWA 5IMVA 5D96A 4KAEA 3F3QA 2YNXA 4FYBA 4MF7A 3RDWA 3FW2A 3TJBA 3M9KA 3UBLA 2M46A 3EWLA 2VCQA 3WD6A 2H19A 5G5EA 5IOXA 3IPZA 4HJMA 3F3RA 2PVQA 2HSHA 5CRGA 4NV5A 4TW5A 1THOA 5ID2B 3Q6OA 4IHUA 3GTUB 1SL2B 2IPAA 4L5OA 3A2VA 5JWQB 1TTZA 3P7XA 2K9FA 2O8VB 3PINA 4ACSA 1VF4A 2F9SA 5H5QA 3F63A 5IIZA 5D93A 1N2AA 1Z7RA 1V2AA 2CA8A 1F3AA 4I2TA 4HDEA 1G0TA 3FR9A 4FYUA 3EU4A 4ECIA 2HYXA 3TOTA 2O87A 4OFMA 2PGTA 2F51A 1XIYA 2LUSA 2IMFA 4BVYA 3GH6A 2H1BA 1XBSA 3LG6A 2MMAA 3GKKA 1VF1A 4GQFA 3F8UA 1M7TA 9GSSA 4YQMA 3GL3A 4WR5A 3LORA 3VPQA 2H0IA 2ZUPA 2LJRA 2CAIA 4XS4B 5ELGA 1R7HA 4TXVA 4XRDA 5GAPD 4GCIA 4X43A 4DVCA 3L9UA 5HFGA 1OVNA 2V32A 5CP1A 1OE8A 4BA7A 1GUHA 4AJ8A 3A2XA 2JSZA 4IKHA 4KF9A 4PTSA 2KHPA 3D22A 3G7IA 4RI7A 3HVVA 4OWYA 2F8FA 2DBCA 1LU4A 1TRSA 4GWRA 1K0DA 2J9HA 3BCIA 4I6XA 4ZBDA 4D73A 2V41A 2YWOA 1OKDA 1GTUA 2D2ZA 2EIQA 1VF3A 2WRTA 2LRTA 2RM5A 2DIZA 3ME8A 1K0NA 2H30A 2BMXA 4CDOA 3CSIA 1T3BA 3UOMA 2WJUA 3F9UA 1T4ZA 3IR4A 3A5WA 1OC3A 4HJ2A 1BX9A 2OE0A 1UVZA 2YPMA 2VD0A 4K9ZA 2B7KA 2MBSA 2K8VA 4IJIA 1URMA 3NIVA 3UVHA 5ECKB 1X5CA 5G2ZA 2GT6A 4K7IA 2N5BA 4N0ZA 2WZ9A 1TDIA 2KLXA 1T7PB 3J7Yk 4OMVA 16GSA 4G10A 1QQ2A 4DSSB 1YY7A 2XPEA 2YV9A 2H8LA 2YP6A 3ME7A 2HRAA 3QFBC 2HSYA 2EIRA 1HYUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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