1F3BA

Crystal structure of mgsta1-1 in complex with glutathione conjugate of benzo[a]pyrene epoxide
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
222
structure length
221
Chain Sequence
AGKPVLHYFNARGRMECIRWLLAAAGVEFEEKFIQSPEDLEKLKKDGNLMFDQVPMVEIDGMKLAQTRAILNYIATKYDLYGKDMKERALIDMYSEGILDLTEMIGQLVLPPDQREAKTALAKDRTKNRYLPAFEKVLKSHGQDYLVGNRLTRVDIHLLEVLLYVEEFDASLLTPFPLLKAFKSRISSLPNVKKFLQPGSQRKPPMDAKQIQEARKAFKIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Residue R216 and catalytic efficiency of a murine class alpha glutathione S-transferase toward benzo[a]pyrene 7(R),8(S)-diol 9(S), 10(R)-epoxide.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTATHIONE S-TRANSFERASE YA CHAIN
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 81
structure length 221
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2000-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1f3bA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1f3bA01
4IP1A 3FYGA 5D9VA 4X0XA 3KIJA 1XPVA 4DSSA 3GL3A 4L0WA 3P90A 4MPFA 3BCKA 3P2AA 2H30A 4K0NA 1GUHA 3TKRA 4WEYA 3H8QA 1AUCA 2VUPA 3TJBA 2LRCA 1HNBA 1UN2A 4TOPA 4V2MA 2CX4A 3KH9A 4AJ6A 2FHEA 1W4VA 4IELA 2H70A 2VL2C 1O81A 2DJ3A 1QUWA 3HJOA 3GIXA 3CSIA 3A5WA 4I2UA 4XTSA 2VCWA 2HI7A 1YF1A 4ECIA 3FY7A 1ERWA 1EEJA 2ZNMA 3NZNA 4NHZA 5DVBA 5GZZB 3ME7A 5E4WA 5FWGA 3L9SA 5C00A 2RLIA 2AAWA 2LEGA 2D2ZA 4I6XA 2YZHA 1A23A 3JCML 4L0UA 2JSZA 3VI5A 3ZMKA 4KDXA 5B7CA 2NTOA 3KH7A 1NM3A 3TKQA 4ZBAA 4GCIA 1E2YA 2BMXA 2H01A 3CTGA 2H73A 4MMMA 1PQNA 2PN8A 5CRDA 2JZRA 2IIYA 3BOAA 1HNCA 1VF4A 2PMTA 3UOMA 3GRXA 1K0BA 3D4TA 1GNWA 1XCCA 2I9HA 4IP6A 3GTUA 2LRNA 3TUEA 2I3YA 2B5XA 1K0OA 1AAZA 2KUCA 3W8SA 5EL8A 4MH2A 1N2AA 3TDGA 3H79A 3LQ7A 1PD21 2JZTA 1XW6A 1V98A 1EP8A 1A2JA 1BYEA 2YJ7A 4USSA 3QD9A 5JWRB 1GLQA 5ID2A 5ECHB 4LMVA 5B8BA 2VIMA 1GUMA 4HQZA 5LNKe 4XRDA 1OC9A 1TRSA 2QSIA 2LJKA 3CMIA 1TU7A 3UIWA 1KEBA 4BVXA 3GA4A 4J56E 1GTIA 2FD3A 3QFAC 4BVYB 2O85A 3F0IA 2DJ1A 3O76A 4GWRA 2FWFA 3LWAA 4KSMA 4DSQA 3H4KA 2IMKA 2B1LA 1ZOFA 3DD3A 2F8AA 2H0GA 4EF0A 1QMVA 4AGSA 1SK0A 5CAXA 1TU8A 2V32A 1LBKA 3DXBA 3C1SA 12GSA 5F07A 3U6VA 1PKWA 4XS6A 3E0UA 3VURA 3HZ8A 3IA1A 4GRFA 4TXOB 4OFMA 2OE1A 3LXTA 2K6VA 2PBJA 3SBCA 2DMLA 2RUEA 5COHA 2HFDA 3VPTA 4XS4A 2YN1A 1PN9A 2VD1A 3ZFLA 2K9FA 1SJIA 2CVDA 2B7JA 5G30A 4MP4A 3LSZA 5F05A 2FWEA 4K6XA 1OC3A 2PUKC 1K0CA 2PVQA 1YEXA 4ZB9A 3HYPA 4BPYA 1G6YA 3KTLA 2M72A 2TIRA 4G19A 3M9JA 2YJHA 3GUSA 1S3AA 1TW9A 4RQXA 3CSHA 1T1VA 3ZIJA 1XWBA 5AIVA 4KX4A 3ERFA 3GH9A 4QL9A 3CTFA 4TRXA 3IV4A 4OO4A 2C3TA 2PVOC 3DKSA 4BA7A 4HUAA 4X43A 2WGRA 2KOKA 4QQ7A 2WS2A 4N11A 3FHKA 4PURA 3PGTA 4WXTA 5DQYA 4NWYA 3GKMA 3N5OA 1GTAA 4K0GA 3TB2A 3FR3A 2DMMA 1G6WA 4O7HA 1U88A 5H5QA 1PGTA 4MK3A 4POBA 1BAYA 3SWLA 2HXKA 3HJMA 2B6MA 5A5KA 1JLWA 1RW1A 3O3TA 2IFQB 3CRTA 2ZCTA 3VPQA 2YWOA 1XIYA 3ME8A 5CNWA 4NXIA 4L5LA 1WRYA 1YKAA 5LD0A 4DSSB 2CV4A 3I6AA 1MEKA 2NPBA 1TXXA 4MF6A 4EXJA 3UARA 1JZDA 5CP1A 2PGTA 2HYXA 1T4ZA 3RPPA 2R5GA 3CYNA 1K3YA 3ZL5A 2H71A 1A0FA 3ZIVA 2K18A 2BTOT 3GN3A 2OE3A 4EDZA 4WR4A 1F3AA 1B4QA 3ZREA 3L9UA 3F6DA 4Q5RA 4EC0A 5A4UA 1A8LA 2HLSA 5F8BA 1F6MC 4BWSA 5D9WA 5IO0A 2AJQB 1EV4A 6GSTA 2KLXA 2HNLA 1UC7A 1FG4A 2GTUA 3TOTA 1T3BA 3IDVA 2C0FA 3FZ9A 2GT6A 2CT6A 4HJMA 1T7PB 5ECKB 2L57A 5GAND 3GSTA 3HDCA 3H93A 3VFIA 3G7IA 4MJAA 4ISDA 3ZTLA 1VF2A 4ULXA 3TKPA 3GTUB 1R7HA 4N10A 5EY6A 1ILOA 1NW2A 2FA8A 1M2AA 1R5AA 3HD5A 1XZOA 1Q4JA 1WE0A 1SL1B 1YEPA 2WULA 1M2BA 5CREA 2M46A 3GKXA 1QGVA 3IC4A 4HOJA 5ID2B 2CQ9A 4JRRA 1FB6A 3GURA 5ECOB 5CRGA 2VD0A 3F6FA 4JR4A 2GDRA 1EOGA 3UBKA 4JE1A 4ZILA 3IR4A 4EL1A 4RUVA 1K3OA 2F9SA 4GTUA 1AQWA 4YQMA 17GSA 1XBSA 2NDOA 4TXVA 4O5RA 4CW9A 1HNAA 4IVFA 2OJLA 2VOCA 1A0RP 2YNXA 3A2XA 1DE2A 3HJPA 4TR1A 2R6KA 4MLYA 5IPGA 1JLVA 4IBPA 1GSEA 2HSMA 4HU9A 2MZCA 2DBCA 2LJRA 1TOFA 2IWTA 3KMNA 2H0HA 4FIWA 3KM6A 4G9HA 22GSA 3M8NA 4NHWA 3KXOA 3QAGA 3FR9A 1YZXA 2WZ9A 4JBBA 1MD4A 3FR6A 3O6TA 5ENUA 3QPMA 4Q5NA 2O87A 1DSBA 2VLUA 2DC5A 1R26A 5IMVA 1TRWA 4KA0A 5EVOA 4KDUA 3ZVJA 2CVKA 1FHEA 4IQ1A 1QXHA 1WOUA 2XPEA 1PX6A 5D73A 2C4JA 1XWCA 5ECRB 1N8JA 4XS4B 4EUYA 3DYRA 3MAKA 1Q98A 5J4UA 2GQMA 3IAS2 1USBA 3LJRA 4KGIA 2I1UA 1ERUA 2REMA 1XXUA 1J0FA 1O8WA 2H1GA 5ECIB 2HRKA 2WB9A 3WGDA 3M9KA 4YH2A 1AQVA 1THOA 1JZOA 1GTUA 2M80A 4OFTA 4JEDA 16GSA 1FVJA 3HVVA 1GP1A 5F0GA 2H6XA 1GWCA 5C04A 2OBKA 1GUKA 6GSSA 2XC2A 3LGCA 5IPHA 2LS5A 1W89A 2H1DA 1EOHA 5JWOB 1X5EA 5DBQA 4EO3A 1GULA 4H86A 2TRXA 2VO4A 2HRFA 2C3QA 1PL2A 4J2FA 2YZUA 4POLA 3TJKA 1M0UA 5D9XA 4MPGA 4L5OA 5F06A 2L4CA 3ZMLA 3IK7A 3FEUA 5KN2A 5D9TA 3UAPA 2YP6A 1K0MA 2HZEB 2CX3A 4Q5QA 4AJ8A 2ON7A 5HR2A 4ILFA 3WT1A 5CYYA 3LFLA 3OR5A 3M3MA 3UVTA 3TKSC 3C1RA 1A2MA 2HT9A 3EVIA 3FZ4A 4OWYA 2X8HA 5DQSA 1ERVA 3GHAA 2F3MA 4LL4B 1ERTA 2VL2A 4IW9A 1DUGA 3AY8A 2OACA 3IC8A 4JZQA 2YCDA 4IJIA 1MDKA 4NV5A 5IMZA 2X8GA 18GSA 1OAZA 5ELGA 2LNSA 2IMDA 3IOSA 4TW5A 5KN0A 3DIEA 5FT3A 3ZYWA 4GF0A 5IMFA 4HZ2A 3L0HA 1B8XA 4K1FA 2X64A 4FQUA 3GKNA 3KZQA 3TJJA 1GSYA 1BEDA 4ZL8A 2FWHA 1OE7A 1OVNA 2B5YA 1URMA 1K0DA 1ZCPA 1M9AA 1SD8A 2DJKA 5KEJA 13GSA 2H8LA 4KW6A 3M0FA 4V1Ap 3HVXA 5B6MA 1EZKA 1TI1A 1JZRA 4NV2A 4XHMA 4D73B 4EKZA 4MJCA 1ZMAA 2HRNA 2IMEA 5J9BA 5AISA 4MF5A 3L9VA 4PQIA 2XBIA 2HE3A 2C0DA 3GL5A 3EU3A 1MDJA 1XW9A 4WBJA 2MBSA 2R4VA 5IMCA 1SD9A 3V1WA 2GGTA 4G2EA 4CHSA 3EINA 1SENA 2YV7A 1SL0B 2MMZA 4F03A 1O7UA 5ELAA 2V2GA 4HU7A 3IAM2 3L78A 1FAAA 1WPIA 4MA9A 1WJKA 2HRAA 3GH6A 5HR3A 1QQ2A 5ECLB 10GSA 4BL7A 5IM9A 4IKHA 4TR1B 3UMAA 2YWNA 3D6IA 1VRSD 3GNJA 1GH2A 4HS1A 1XFLA 3LG6A 5BMUA 3EYTA 1S3DA 1THXA 2CZ3A 1SYXA 4OMVA 5DAKA 4GQCA 1XOBA 5ECMB 3HHVA 2OKAA 5GSSA 3UBLA 2J23A 3PINA 2F8FA 2IMIA 3FZ5A 2O8VB 3MDKA 3G9BA 3F3RA 1F9MA 4E8EA 5CRHA 3HXSA 1JHBA 4L8EA 4TR0A 4F2IA 1C72A 1Z3EA 5IIZA 3PPUA 9GSSA 3HY2A 4K7IA 3TOUA 4ZBBA 4POKA 4YAVA 4ZXGA 3F63A 4YQVA 2EIOA 3ZRDA 2UZ8A 2HRKB 1CQHA 2H19A 2HSNB 3LORA 4ZL9A 1Z7RA 1FB0A 3UVHA 2AYTA 1BG5A 4N0ZA 3MWHA 2GSSA 4F9ZA 4EVMA 1TKDB 4ECBA 2WJUA 2G2QA 1O73A 1SU9A 1M9BA 3EMPA 1XWKA 3C7MA 2H6YA 1TK0B 4G0LA 2A2SA 4GSSA 14GSA 2EIQA 4RI6A 4HQSA 2G0FA 3F3QA 1VF1A 1T8EB 3TRPA 2ES7A 2OA7A 2DIZA 2LRTA 2H75A 1XVWA 3MSZA 2H6ZA 3QAVA 2B3SA 4XRAA 4DSRA 5DDLA 4LL1B 4NPBA 3F4TA 3WD6A 1XWAA 2H1AA 2VCTA 1X9SB 1EP7A 5GSTA 4XS1A 5HQPA 4LLRA 3ERWA 4K8MA 2JACA 3RPNA 2NVLA 2C3NA 1WP0A 6GSWA 1AIUA 5DJLA 1GSSA 1V9WA 2MBTA 5INYA 4RI7A 2AHEA 2X99A 3F4RA 4PUFC 2IPAA 4PXOA 4OO5A 2VM2A 4IHUA 3TKSE 3DVWA 2LTKA 2FA4A 5H5RA 3H1NA 2GSQA 1WIKA 1X0RA 2ZUPA 4ML1A 4BVYA 3US3A 4I97A 3QDNA 1OC9B 3TCOA 2WDUA 5HFKA 4F0CA 4RQRA 3CBUA 2XPDA 3TRQA 1FW1A 3QR6A 1NSWA 1O8XA 5B6NA 4EE0A 4KUNA 3QOUA 4GSTA 2V1MA 4BVXB 1PRXA 1QK8A 2A4VA 4ECJA 3P8WA 3WT2A 4GSNA 4TN8A 4ZIJA 1B4PA 3TJFA 2DJ0A 1EGOA 1B9XC 2PPTA 4TXOA 2E0QA 4JR6A 2IN3A 1UA5A 3IPZA 3D21A 2LNTA 3ZITA 1K3LA 1MD3A 2DLXA 2P31A 4TR3A 3KP9A 1M99A 1EV9A 3ZZXA 3K8NA 1JZWA 5IO2A 2H74A 2XHFA 3D5JA 2MMNA 2C80A 5KN3A 4OCEA 1XW5A 2VCZA 1G0TA 2HZFA 4G0KA 3G7JA 1AQXA 2JL4A 3KTBA 2H72A 2ON5A 2XBQA 2DSAA 4MDCA 1OKDA 1YQ1A 4MJBA 1TP9A 5GAPD 1GNEA 4IGJA 1JFUA 2QGVA 3FRCA 3ZLPA 5DAKB 4O32A 4HEA2 1HYUA 4I8BA 1XWGA 3HCZA 2L59A 4DVCA 1K0AA 3DEXA 3IK9A 2H76A 4K9ZA 3WGXA 4KF9A 4GQFA 4NAXA 4K7OA 3KEBA 3QAWA 4KCAA 3NOFA 4IQAA 1KBNA 3BBYA 2MMAA 3UL3A 5ECQB 1T00A 4Z7XA 2JU5A 4KH7A 1DE1A 2N5BA 2VCQA 4KCEA 5DALA 1ACVA 20GSA 3S9FA 2FGXA 3M1GA 3ERGA 4TVEA 1V58A 2OBIA 3W8JA 1SL2B 2AUVA 4KDYA 1RQMA 1S3CA 4ID0A 4IS0A 1B9YC 4WBRD 1B48A 3IE3A 4N30A 3UEMA 2C0EA 4HDEA 1ZL9A 3KP8A 1U6TA 4MH3A 3C8EA 3ED3A 3PH9A 2QC7A 4PNFA 3Q74A 5JCWA 2IL3A 5J5NA 4K2DA 5DCGA 4MABA 2R2JA 1ZGNA 2PU9C 3EWLA 3GSSA 2C1YA 4J57E 3VWUA 4FYUA 3D0ZA 2FY6A 4HI7A 5HR1A 5HFGA 2V6KA 2NBSA 4PQHA 2CA8A 2GVPA 1SKRB 5LCZA 3I43A 4IJ3A 1X9WB 3LYPA 3F8UA 1VF3A 3IRAA 3I9V2 2IJYA 1Z5YE 1HD2A 1H75A 1XVQA 1SKSB 1LJRA 2YV9A 1G7EA 4KE3A 2O7KA 1UVZA 3F4SA 4ZBDA 3W6GA 3VWVA 1GSDA 4G0IA 3GX0A 3ISOA 1TRUA 4QL7A 4MCUA 2FWGA 2OE0A 1HQOA 3TKSA 4I5QA 4HZ4A 1GLPA 2CAIA 3GV1A 4WKWA 4CDOA 3N9JA 1BX9A 1IYIA 1J08A 2GZZA 1YKCA 2N5AA 6GSXA 3DVXA 4KAEA 2F51A 4YAPA 4ZB8A 1G7OA 2C0GA 3GFKA 5JCGA 4GXZA 4IN0A 4OCFA 1TJDA 3BCIA 2E2MA 3IXRA 2I81A 4FO5A 2R37A 1NHYA 1ST9A 5J9CA 4P3YB 3RHCA 1Z9HA 3HVSA 2HSYA 2ALBA 5ABRA 4PTSA 3QFBC 3HKRA 2VLTA 4WF4A 3KJYA 5G2ZA 5DCHA 1Z6MA 2E2GA 4FYCA 3APSA 5IQYA 5J41A 1GSFA 5CO3A 2VM1A 1GSUA 3P7XA 5FHIA 3EC3A 1FVKA 1SJ6A 4NMUA 3L4NA 2IMFA 4EDYA 4F0BA 2B7KA 4LMWA 4WETA 2KP1A 2HSMB 2VL9A 2Z9SA 1K0NA 4V1Ag 1A24A 3WYWA 2BJXA 2VLVA 3PR8A 5A4VA 2N5FA 3GYKA 5G31A 1U3AA 2PERA 4ZB6A 7GSSA 2GSRA 5AN1A 3EU4A 3C73A 3A2WA 1T4YA 4KSOA 5E59A 3VWWA 3R2QA 3VWXA 2GQLA 2MYGA 3HA9A 5G1LA 3IBHA 11GSA 6GSUA 3D4MA 4KB3A 2YPMA 2FCHA 4BWQA 1QFNA 2HSHA 3FZAA 2H1BA 1WWJA 2YANA 6GSYA 2HQTA 2DJJA 2K8SA 4AJ7A 3BJ5A 1BJXA 4OFNA 3TJGA 5IOXA 5JCUA 5J3RA 2O89A 4XIHA 2RIIA 3KMOA 3IHQA 4ACSA 1PX7A 1IYHA 2GZYA 4ML6A 4HJ2A 1I5GA 1YF0A 2KHPA 1U3IA 3FK8A 2P5RA 5KN1A 4PGTA 1Z6NA 4MJEA 2GSTA 3UJ1A 2GS3A 3QCPA 4MZCA 3GX8A 3NIVA 1Z7PA 4FYBA 4O92A 1BQ7A 1FO5A 3DRNA 2GQKA 3BD2A 1ZYQB 5G5EA 3Q18A 2YOIA 2LJAA 3F9UA 2L5OA 1CQGA 5ECSA 2WRTA 2TRCP 4AF2A 1GTBA 1SJZA 1MDIA 1WMJA 1ML6A 3MNGA 1SYRA 2L4QA 5DALB 1TK5B 4OD7A 3APQA 1TDIA 4PUAA 1V40A 8GSSA 2HZEA 4ECCA 3KCMA 1F2EA 1R5PA 4DEJA 5B8AA 4FH8A 4TR4A 2LUSA 1V57A 5JWQB 2H66A 1PMTA 1KTEA 3J7Yb 2YWMA 2LKUA 2EC4A 4X1UA 2L5LA 1OYJA 5AGYA 4N0VA 4LA1A 1A8YA 1AW9A 1MTCA 2V41A 1DBYA 1A2LA 1EWXA 2JSYA 2FNOA 3A2VA 2J9HA 4V2LA 1PSQA 2OADA 5ECNB 5H5SA 1KNGA 1SK1A 1OC8A 2GT5A 3CSJA 1F3BA 3APOA 3WGEA 5IOWA 3DWVA 2C8UA 1ZYEA 2QKEA 2JADA 2FLSA 2V6OA 1Y6EA 2P0GA 5D96A 1I9DA 2A2RA 4PX1A 5G1KA 3ZFBA 2CAQA 4MF7A 2L6DA 4WF5A 1NHOA 1F37A 2AB6A 3FKFA 3TRXA 4JU5A 4MZWA 4K7NA 5D8IA 1R4WA 1U87A 3Q19A 4PNGA 2L6CA 3QMXA 1YY7A 5EPFA 2GZPA 2GLRA 5A4WA 3I69A 2LQOA 4KNDA 5DJMA 3Q6OA 1X5CA 1OE8A 5CRWA 2DJ2A 2R3XA 1TI3A 1TTZA 3EURA 4PQ1A 2RM6A 1Y25A 4TKYA 3RDWA 4YQUA 3R3EA 1SK2A 4D73A 2PWJA 3VK9A 3VLNA 1LU4A 1EGRA 3ZVJD 2I4AA 2MMOA 3C71A 5HR0A 1J9BA 2P5QA 1PL1A 3DGQA 3EE2A 2VAFA 1TRVA 1ZZYA 1H4OA 4XCSA 1PA3A 1GRXA 3E9JB 2LQQA 1TK8B 3HZ4A 1OKTA 5ECPB 2E7PA 5D93A 3LYKA 1X5DA 5IMAA 2RM5A 2YWIA 4G10A 2WCIA 2LV3A 3DMLA 2EIRA 2VCVA 2JZSA 3RBTA 1RK4A 2FUG2 3KD0A 1V2AA 4MZBA 1AC1A 1GSQA 4F82A 1X9MB 1E6BA 4POMA 4Q5FA 2VCXA 2B5EA 3LEFA 4GLTA 3RAZA 2X8CA 1M7TA 1O6JA 19GSA 6GSVA 1M2DA 3GMFA 1AXDA 3LXZA 3RHBA 3EMXA 3E3EA 3TGZA 2VL3A 3D22A 1VGLA 4BL7B 3A3TA 5IMDA 1EEMA 3VI7A 5HFIA 2H0IA 2RUFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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