1GSYA

Glutathione s-transferase yfyf, class pi, complexed with glutathione
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
PPYTIVYFPVRGRCEAMRMLLADQGQSWKEEVVTIDTWMQGLLKPTCLYGQLPKFEDGDLTLYQSNAILRHLGRSLGLYGKNQREAAQMDMVNDGVEDLRGKYVTLIYTNYENGKNDYVKALPGHLKPFETLLSQNQGGKAFIVGDQISFADYNLLDLLLIHQVLAPGCLDNFPLLSAYVARLSARPKIKAFLSSPEHVNRPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The three-dimensional structure of a class-Pi glutathione S-transferase complexed with glutathione: the active-site hydration provides insights into the reaction mechanism.
pubmed rcsb
molecule keywords GLUTATHIONE S-TRANSFERASE CLASS PI
molecule tags Transferase
total genus 73
structure length 209
sequence length 209
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1996-10-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1gsyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1gsyA01
4WBJA 1K0BA 2HRNA 2HFDA 4EUYA 1KEBA 4KSOA 2KUCA 2NDOA 4NV5A 2KP2A 2H71A 2ON5A 2LSTA 1LBKA 1J0FA 4IKHA 3APQA 4HU7A 3DMLA 1M2AA 3HJPA 3SBCA 4OFMA 1K3OA 4N0ZA 18GSA 1AUCA 3KH9A 5DDLA 7GSSA 2LKUA 1JFUA 5ECRB 3ERGA 4FYBA 1ZMAA 4I2UA 2DJ0A 3TRQA 2HRKB 4IQAA 3F3RA 1IYIA 4J57E 3APSA 4YQMA 1V40A 4HEA2 2HI7A 4ECCA 1OE8A 3EU3A 4TR0A 2RUFA 1M9BA 5DALB 5COHA 4HUAA 4KE3A 4GCIA 5CAXA 3HZ8A 4EO3A 3HHVA 3DXBA 1PX6A 3HJMA 1Z7RA 3IOSA 2A2SA 1ERUA 2MZCA 3M8NA 2CQ9A 4MH2A 1NW2A 1O8WA 2YCDA 3FZ4A 5AISA 2VCQA 4WR4A 2IPAA 4Q5NA 1MD3A 5A4UA 3ISOA 3M0FA 4L0UA 3QAWA 2CAQA 2HSMB 3WYWA 3HDCA 3GKKA 1UN2A 3QCPA 4DSSA 3ZL5A 1GSQA 3PR8A 2OADA 2JSZA 5GSSA 5A4WA 2NPBA 4EDZA 2H1GA 3IAM2 4K2DA 3R3EA 3GSTA 4AJ8A 4ZBAA 3EC3A 4JR4A 1GTIA 1BQ7A 3NIVA 3M3MA 9GSSA 2FWEA 3NOFA 2GSSA 2LRTA 2EIOA 5BMUA 4PUFC 3J7Yb 2KP1A 1AQWA 2FCHA 1XWKA 2ZUPA 2JZTA 1O8XA 1XCCA 2XBIA 1SK1A 1GULA 3UJ1A 3GX8A 1X0RA 3EURA 4BPYA 5D73A 3WD6A 1V98A 3KP8A 3A5WA 4LLRA 2I1UA 4X0XA 4ZB8A 1XWAA 2GQKA 4ECBA 1BJXA 2CVBA 2C3QA 3IPZA 4G0LA 3TJFA 3KM6A 4TR3A 5HQPA 2M80A 4TR1B 3ZFLA 3F4RA 4BVYB 1AIUA 3C7MA 3FK8A 5ECKB 3DWVA 2DJ2A 4N10A 3LGCA 3E9JB 3D6IA 4G0IA 3HA9A 2V1MA 2H75A 1S3DA 1EEMA 2V6KA 3HD5A 4K6XA 4F0CA 3N9JA 2OE1A 2B5XA 1WWJA 1SENA 4WF5A 2GQLA 4V2MA 4KDUA 3LG6A 2H1DA 4HJMA 2R3XA 2M46A 4JEDA 2HT9A 2VCTA 2IMFA 4PNGA 5ECLB 2I4AA 2BTOT 1G6WA 1MEKA 3TJGA 2YP6A 4K8MA 4MZWA 2PU9C 3C73A 3GNJA 1NHOA 1SKWB 4TXOA 4POKA 3DIEA 1YDKA 2GT5A 1PL1A 1A2LA 2B1LA 2YN1A 2R5GA 1TRVA 3EINA 2MMAA 1T1VA 4EXJA 2FD3A 3ZTLA 4XS6A 1H75A 5G2ZA 3ZIVA 1O7UA 3RPNA 1V58A 4HU9A 4D73B 1EOHA 1TRUA 2F3MA 1HNCA 3F63A 3ERFA 1W4VA 2GDRA 5KN1A 1K0DA 4FQUA 4OD7A 2P31A 4JBBA 2QSIA 1ERTA 3TJJA 3TGZA 1O6JA 4EC0A 4IVFA 5JWRB 4AF2A 2GZPA 2YJHA 3F6FA 1I5GA 2VD0A 5GAND 1K3YA 1EV4A 2C80A 1USBA 1KTEA 2GS3A 2HSNB 4HDEA 3ZLPA 1VF2A 2DSAA 3UVHA 1EOGA 2HSHA 5C00A 3LYPA 3CSHA 2H66A 3PPUA 3SWLA 1TU8A 1A0FA 4IHUA 4FYCA 1EP8A 3DGQA 3GRXA 3GH6A 1ABAA 3QFAC 1GL8A 3FR3A 2CV4A 2IWTA 3RBTA 4DSQA 1VRSD 3M1GA 3RAZA 1N8JA 4MLYA 3F9UA 1O81A 5D9TA 3GUSA 3S9FA 5F07A 1XWCA 4GQFA 2L59A 1YKCA 3LWAA 5AIXA 1M7TA 4IN0A 1DBYA 3QR6A 1XW9A 1M0UA 3A3TA 1B4PA 4ECIA 1F3AA 2AHEA 1F37A 1XWBA 2VM1A 3I69A 4ILFA 2AAWA 4HI7A 2CVDA 5DQSA 3ZREA 4PQIA 3ZRDA 3LQ7A 5LD0A 3VI5A 4KDYA 1R5PA 3GTUB 3UARA 4BVXA 2NBSA 4GSTA 3GURA 1QMVA 4V2NA 4YAPA 4LA1A 3VURA 5HFGA 4CW9A 3APOA 2LNSA 1PKZA 5EL8A 5B7CA 3IAS2 2X8HA 2H1AA 5ENUA 3Q18A 4KX4A 4PNFA 1XVQA 3QD9A 3W6GA 2HRKA 1K0MA 1QK8A 4MZBA 4E8EA 1MDJA 3I9V2 5B6MA 3GA4A 1BG5A 1J9BA 4MPGA 1GUHA 5DALA 2IFQB 1A8LA 4YH2A 2V2GA 2C4JA 4YAVA 1N2AA 4NHWA 2RLIA 1OAZA 4QL9A 4ML1A 3CSJA 1RK4A 2TRCP 2I3YA 5J41A 2EIRA 3HVVA 4EKZA 5ID2B 2ES7A 4POBA 1WP0A 2WZ9A 1DE1A 1O85A 1AQVA 2EIQA 3KTBA 1YQ1A 4JR6A 6GSYA 2VCZA 5JCWA 2IN3A 1Z7PA 4BL7A 2HSMA 3RPPA 4BWQA 2PGTA 2Z9SA 5D9VA 1ZL9A 4AJ6A 2X64A 1OC9B 4EDYA 3VFIA 3P90A 2M72A 2IMKA 4MP4A 4F2IA 1FOVA 3KCMA 5J5NA 2H6ZA 3D21A 1PD21 4O5RA 4NXIA 3G7JA 3TDGA 3L4NA 3KMOA 1ZCPA 2F9SA 2RUEA 2WFCA 1AXDA 4IBPA 2CZ3A 1RW1A 3DRNA 1PSQA 4Q5QA 1TI1A 3TJKA 1B8XA 3U6VA 6GSUA 4TRXA 1K0CA 2H72A 4HOJA 5D8IA 1SU9A 1OYJA 3VWWA 4K9ZA 4TOPA 1GSUA 1ML6A 2E0QA 2TRXA 2OE3A 1GSYA 2REMA 1XIYA 4EVMA 2GSRA 5LNKe 4IELA 4PX1A 4TN8A 2GTUA 3MDKA 3GL5A 1SL2B 6GSWA 4RI6A 3IA1A 3TB2A 3HZ4A 3RHCA 4ZB9A 4GLTA 3GFKA 1X5CA 2HRFA 3UMAA 3GKNA 4ACSA 4JZQA 4K7IA 1XPVA 3LSZA 3QPMA 4I6XA 4CDOA 2ON7A 5KN3A 2DJKA 5JWOB 2O87A 3KH7A 4XRDA 1CQGA 4XTSA 1DSBA 1LU4A 3IE3A 2E2MA 1OC8A 2PVOC 4HZ4A 3CYNA 5J9BA 2LJRA 2HZEA 4V1Ap 5GZZB 3D4TA 3HKRA 3KMNA 3EE2A 5DAKB 4G0KA 4ZBBA 1WE0A 2VAFA 2I9HA 3FR6A 2YJ7A 3KGKA 1YF0A 3TRXA 1Z6NA 3IV4A 1BYEA 4RI7A 3D5JA 2VL9A 2LS5A 4IP6A 5ECOB 5FHIA 2V32A 5JCUA 1U88A 3H4KA 1K3LA 3CXGA 4MPFA 3Q6OA 3FZAA 1A23A 3CTFA 4GTUA 5IPGA 4J56E 2O7KA 1PX7A 4MDCA 2YOIA 1M2BA 2PN8A 2VLTA 5CO3A 3H1NA 3F4SA 2O89A 3KXOA 1R5AA 2YV9A 1SJIA 3RHBA 2MYGA 3UEMA 1GUKA 3DEXA 3OR5A 4ZB6A 2PWJA 1JZDA 4J2FA 5B6NA 1GTAA 5GAPD 4MJAA 4N30A 1B4QA 1OC3A 4MJBA 2H70A 1SD9A 3KEBA 2FLSA 1Z6MA 1PRXA 2LQQA 2VUPA 2DIYA 2JADA 4Q5FA 1HNAA 1OVNA 3BD2A 1G0TA 3E3EA 5IO2A 1XVWA 5CREA 3TOUA 4K7NA 2RIIA 1FG4A 5F05A 1GRXA 1WMJA 3QMXA 4KCAA 3UL3A 4TKYA 2TIRA 4ZL9A 2P5QA 1BX9A 3PH9A 4MCUA 1T7PB 5HR3A 3M9KA 1G6YA 1F3BA 3BBYA 2YZHA 2NTOA 4O92A 2UZ8A 1FB6A 2CZ2A 4MF5A 2VM2A 5IOWA 5IMVA 4O7HA 4TW5A 2XPDA 1V9WA 1AC1A 1EWXA 2C0EA 4K0NA 4KW6A 2C3NA 2IMDA 5KN0A 4KGIA 3GTUA 2OE0A 2YWNA 2B5EA 3BCKA 4PUAA 3ZITA 2CT6A 1A8YA 2IMEA 5A5KA 5INYA 2HE3A 1CQHA 1NHYA 3WT1A 2R2JA 5IM9A 2O85A 1T00A 1GLPA 1UVZA 1GSDA 2DIZA 2GVPA 1C72A 4JU5A 3ZZXA 1Z5YE 2AJQB 2GLRA 5JWQB 2B3SA 4YQUA 1FVKA 1F6MC 2HLSA 3O76A 5KEJA 1VF1A 4E8HA 3H79A 1WPIA 4PTSA 5IIZA 4RQXA 3H93A 4HJ2A 3WT2A 1S3AA 2LJAA 4KDXA 1EEJA 4MF7A 3TKPA 2L4CA 5G1LA 2NVLA 4KSMA 1A2JA 5ELAA 3F6DA 4V1Ag 1X5EA 5J4UA 1HYUA 2ALBA 5ECPB 3H8QA 4NMUA 5G5EA 4KF9A 3G7YA 4I5QA 4DSSB 16GSA 3HJOA 6GSSA 1A24A 3KD0A 1SL1B 1URMA 4K1FA 2R4VA 3W8JA 2K6VA 1ILOA 1MDKA 2X99A 4I8BA 1XBSA 1JZOA 5HFIA 5HR0A 3ERWA 2FNOA 1TOFA 4MZCA 1YKAA 2H0GA 4ML6A 2FHEA 3MAKA 5F8BA 5ABRA 3EMPA 4GSNA 4G2EA 2OA7A 2JACA 4JE1A 3DVXA 5IOXA 4FIWA 4FO5A 2PVQA 3HVSA 3F8UA 1O73A 4OO5A 4HQZA 3K8NA 5H5QA 2LEGA 5B8AA 3P8WA 1GLQA 4K0GA 4EL1A 3WGXA 1RQMA 2K8SA 2EC4A 2VOCA 3IR4A 1EZKA 2YV7A 3DKSA 1W89A 1XWGA 3TOTA 1T3BA 2H30A 3GIXA 1K0AA 1JHBA 3LJRA 2JZSA 4RUVA 5E4WA 1THXA 1MTCA 2B7JA 4YQVA 1Y6EA 4G10A 4EE0A 3LXTA 3IK9A 5IMDA 1TI3A 2PBJA 4DEJA 2VCWA 4OCEA 3VI7A 5ECSA 19GSA 2HQTA 1F2EA 4K7OA 3FEUA 4O32A 1DE2A 3FZ5A 3VWUA 3HVXA 4TXOB 4MF6A 3ZMKA 1UA5A 17GSA 2LUSA 3C71A 4LMWA 1TXXA 2H73A 3GL3A 2LNTA 1M2DA 1GP1A 2JZRA 2OBKA 3GKMA 4NV2A 4WEYA 1PA3A 2WULA 2XHFA 3BOAA 3CRUA 1YY7A 2HZFA 5H5RA 1T8EB 2X8GA 2B6MA 2FGXA 3TCOA 2XBQA 2WGRA 1U87A 4X43A 4WBRD 2FY6A 1SYXA 1G7EA 2H76A 11GSA 3UOMA 5C04A 5FWGA 1WRYA 2HNLA 1GTBA 4OFNA 2GT6A 3GYKA 2LV3A 1YZXA 3E0UA 3IXRA 4MJEA 1ST9A 1VF3A 3L0HA 3QAVA 3O6TA 1EGOA 1TW9A 2G0FA 1E6BA 5EY6A 1VGLA 5ELGA 3FKFA 1PKWA 2H6YA 5ECQB 3HY2A 4PQ1A 4ZBDA 1NM3A 4V2LA 8GSSA 2VLVA 1U3IA 1HD2A 5ECNB 2WJUA 4WETA 1QQ2A 4F9ZA 1Z3EA 5CNWA 4IP1A 4Q5RA 2VCXA 4GXZA 3FW2A 3IC8A 1ZOFA 3U5RE 1XW6A 3C1RA 2CX4A 2PUKC 4OFTA 3EVIA 1WJKA 2H74A 2L5LA 4ZILA 3US3A 2VLUA 5ECHB 3L9VA 5D93A 3LYKA 2D2ZA 3VWVA 2YPMA 4OCFA 5G1KA 5DCGA 1ZYEA 4MABA 3IHQA 5LCZA 2AYTA 4DSRA 1V2AA 2C0DA 2VL2C 1PL2A 3ZVJD 13GSA 3CSIA 4TR1A 5AGYA 4KH7A 4BVYA 2YWIA 2X8CA 1THOA 5AN1A 1X9WB 1H4OA 3C1SA 1YF1A 4NPBA 3UBLA 1SK0A 4CHSA 3KZQA 3VPTA 2AUVA 2G2QA 1XOAA 2J9HA 5AIVA 4F03A 1FHEA 1U3AA 2VL2A 4GRFA 1TP9A 4BVXB 3LXZA 2K18A 3TRPA 3WGDA 5F0GA 2KOKA 5CRGA 1FW1A 1GUMA 2OACA 1GNWA 2WRTA 4L0WA 5J9CA 2R6KA 2DJ3A 5DCHA 4KCEA 2FWHA 1NSWA 1GSSA 4I97A 4IW9A 2C0GA 2CA8A 2N5BA 1Z9HA 5D9WA 2A4VA 1HQOA 3AY8A 1IYHA 2N5AA 1ON4A 3A2VA 1A0RP 4JRRA 2PERA 2KLXA 4PXOA 3G7IA 1TTZA 4XS1A 2B5YA 1PMTA 4TVEA 3ZMLA 4D73A 1ZZYA 4LL4B 3VPQA 2FUG2 4X1UA 3DD3A 4PURA 2DLXA 4IS0A 2H0IA 4F82A 1FO5A 1T4ZA 2P0GA 3KP9A 2C1YA 2LRNA 1X9SB 1B9XC 4LMVA 1GWCA 3GKXA 2DMLA 2IJYA 3LEFA 5G5FA 1ERWA 1WIKA 5J3RA 1QFNA 2JL4A 2L5OA 4BL7B 1G7OA 3NZNA 4FYUA 2WDUA 1TKDB 2OJLA 1R7HA 2XC2A 1KNGA 1TK0B 1SJZA 4BWSA 5EVOA 4PGTA 1ZYQB 3G9BA 4ZL7A 3FR9A 3L9SA 1R26A 3A2WA 2QGVA 3L78A 2GZYA 4IGJA 2V41A 5B8BA 1SYRA 1SK2A 3EMXA 2VIMA 1K0OA 1Y25A 22GSA 3KIJA 4P3YB 2E2GA 2BMXA 1XZOA 1PGTA 5L71A 2YZUA 4MA9A 1TDIA 3QAGA 2FWFA 2K9FA 4QL7A 3Q74A 4ISDA 3GV1A 2DC5A 3I6AA 2YWMA 3EU4A 4NWYA 3I43A 3ZYWA 1B9YC 1JLVA 4XS4B 4IJIA 3EYTA 4I2TA 3DVWA 4PQHA 2H6XA 3HYPA 3FYGA 2GGTA 1AW9A 2YNXA 4F0BA 3A2XA 2WS2A 1XFLA 2P5RA 3R2QA 4MK3A 1OKDA 4L5OA 1DUGA 1A2MA 2MBSA 5A4VA 4Z7XA 4POLA 4USSA 2PPTA 1FVJA 2PMTA 3TKRA 1GTUA 3F3QA 3ZFBA 1HNBA 3FY7A 4OO4A 3VWXA 2QC7A 4L5LA 1GH2A 3MWHA 4KAEA 5CRHA 5IMFA 2HXKA 2WB9A 1E2YA 1OE7A 2HZEB 2R37A 5D9XA 3D0ZA 1T4YA 2H8LA 1JLWA 2OKAA 2L6DA 1SD8A 3IDVA 4HQSA 2YANA 4MJCA 2YWOA 2CVKA 5EPFA 1GSFA 4HS1A 3GN3A 2HSYA 1QXHA 1Q4JA 2IFQA 4XIHA 2GSQA 1B48A 4G19A 4QQ7A 3IRAA 3V1WA 2L57A 4MH3A 3ED3A 2H0HA 3EWLA 1XXUA 1VF4A 2MMNA 1XOBA 1BEDA 2MMZA 5IO0A 1K0NA 2C0FA 5ID2A 3GHAA 2DBCA 2A2RA 3IK7A 3KJYA 5CYYA 5IMCA 4GQCA 1ERVA 2DJJA 5DVBA 4XRAA 3VK9A 2MBTA 5FT3A 3LFLA 1XW5A 2K8VA 5JCGA 2VCVA 3TKQA 2H19A 1YJ6A 3GH9A 1TK5B 1OC9A 1ACVA 2AB6A 3LORA 1F9MA 3QOUA 3QDNA 2O8VB 6GSXA 5CRWA 4OWYA 2V6OA 1KBNA 2KHPA 3IC4A 1FAAA 1I9DA 4XHMA 2J23A 2XPEA 3VLNA 3N5OA 6GSVA 3PINA 2DJ1A 2FA8A 3F4TA 1AQXA 5ECMB 3CMIA 5IQYA 10GSA 3JCML 3D4MA 3L9UA 2LJKA 3UBKA 1V57A 2DMMA 3CBUA 3PGTA 4MMMA 1S3CA 1SKSB 3QFBC 1X9MB 4POMA 3GX0A 2L6CA 2IMIA 1J08A 2LRCA 4G9HA 1TJDA 3F0IA 5D96A 2VD1A 2IL3A 4XCSA 4NAXA 4ID0A 4GSSA 2LTKA 5G31A 5DJMA 1TK8B 1TU7A 5GSTA 3C8EA 4ZIJA 4L8EA 3UIWA 4WKWA 1SL0B 2GSTA 2HYXA 3MNGA 1EGRA 1PN9A 3BCIA 4ZL8A 1PQNA 5KN2A 3TUEA 2N5FA 4TXVA 1SJ6A 1M99A 3HCZA 3UAPA 4KNDA 2GZZA 3ZVJA 2LQOA 1BAYA 2CX3A 3P7XA 5G30A 2FA4A 2JU5A 1JZRA 2VL3A 3HXSA 4AJ7A 5DAKA 2RM5A 4BA7A 3P2AA 3ME7A 3FHKA 2RM6A 1EV9A 2QKEA 1WOUA 2ZCTA 4ZXGA 2H01A 2C3TA 5DBQA 4OMVA 1FB0A 1GSEA 1TRWA 1YEPA 1YEXA 4KA0A 1MDIA 2IIYA 1GNEA 1JZWA 2F8AA 20GSA 5CRDA 2VO4A 2AV4A 1UC7A 2B7KA 4GWRA 2B1KA 4WR5A 1AAZA 6GSTA 1Q98A 5DQYA 4KUNA 12GSA 5HFKA 1M9AA 2ZNMA 4ECJA 3FRCA 4FH8A 3CTGA 1X5DA 2GQMA 3MSZA 5IMZA 3WGEA 5F06A 4KB3A 1EP7A 3ZIJA 2I81A 4IQ1A 5DJLA 5E59A 3TKSE 2BJXA 2L4QA 2E7PA 3J7Yk 4N11A 5H5SA 4DVCA 4EF0A 4WF4A 4WXTA 3TJBA 5IMAA 3ME8A 2WCIA 2JSYA 4H86A 4LL1B 1U6TA 4HZ2A 1TRSA 3M9JA 2FWGA 3Q19A 4ULXA 4RQRA 3RDWA 2F51A 3GMFA 2OBIA 5CP1A 2HRAA 2MMOA 1LJRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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