1M9AA

Crystal structure of the 26 kda glutathione s-transferase from schistosoma japonicum complexed with s-hexylglutathione
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGDHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Schistosoma japonicum
publication title Characterization of the electrophile binding site and substrate binding mode of the 26-kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-Transferase 26 kDa
total genus 69
structure length 216
sequence length 216
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2002-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1m9aA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1m9aA01
2H01A 2B3SA 3QCPA 4MPGA 4G2EA 1MEKA 5J41A 2L6DA 4V1Ap 4N0ZA 1MD3A 5J5NA 2IWTA 4XIHA 1FO5A 3ERWA 5EPFA 3W6GA 5DAKA 4F03A 2PPTA 4TVEA 3O3TA 3FY7A 4NAXA 1EV9A 2B6MA 4MA9A 1SKWB 2PERA 1XOBA 3HVSA 3QMXA 2K8SA 3TJBA 4O5RA 2OBIA 4Q5NA 12GSA 4AJ8A 4ECBA 4KDYA 2RM6A 2I1UA 2G0FA 4TXVA 5HQPA 2XPEA 2L4CA 3IA1A 3U6VA 5J9BA 2JZTA 3IAM2 1MDJA 2YWIA 3TRPA 2VL3A 2DLXA 2RUFA 5IPHA 4IJ3A 4I97A 4MP4A 2C0GA 4YQMA 2AYTA 3E0UA 4TR1A 4GSSA 3RPPA 5GSSA 1XCCA 5KEJA 1T4YA 2VCWA 1O7UA 20GSA 3WD6A 1PL2A 5L71A 2ES7A 1J08A 3GHAA 3GN3A 1SL1B 2DJ1A 1KTEA 2I81A 2MBSA 2YNXA 4DSSB 2MZCA 1TRSA 2IL3A 1GWCA 2HYXA 3F3QA 2LNTA 2B7KA 2GSSA 2L57A 3I69A 5HR3A 3GSSA 4GLTA 4GCIA 2QSIA 1YQ1A 3EVIA 3A5WA 4KSOA 5CRDA 2F8FA 3E9JB 1VF4A 2HRKB 1J9BA 2MYGA 1ML6A 2PGTA 4KAEA 5B8BA 2AHEA 2H76A 1X5DA 1F3AA 1ABAA 1GH2A 3D0ZA 3C73A 4KW6A 4ZILA 1AUCA 4F82A 2H75A 3OR5A 4PNGA 4EO3A 4XTSA 3CMIA 2IJYA 1GTAA 3U5RE 2H1GA 4BVYB 2YV7A 3APSA 6GSYA 3A2XA 1DBYA 2PVQA 1FVKA 2R37A 3GKKA 4N30A 4OFNA 4QQ7A 2PBJA 4XS4A 1XW9A 4FO5A 2VLVA 3QAGA 3C1SA 2EIRA 2LRCA 1URMA 1G6WA 3M9KA 2H1DA 3MNGA 2P0GA 2V1MA 2CT6A 2WFCA 3KD0A 3CYNA 3Q19A 1PA3A 5D9XA 1H4OA 3CXGA 3VI7A 2D2ZA 4NXIA 3P90A 4FYUA 4ZB6A 3R3EA 1DE2A 3EURA 4WXTA 1X9SB 17GSA 2A2SA 2GGTA 2WZ9A 2H6ZA 5IIZA 5EVOA 6GSWA 2MMNA 4J2FA 4IHUA 1U88A 5HFKA 5HR0A 1QGVA 3Q18A 4BWSA 4OO5A 3PPUA 5DQYA 2QKEA 1EOGA 1K0AA 4N0VA 1SJIA 2XPDA 2C8UA 2H72A 2FGXA 4XRDA 4HQZA 1JFUA 1GTUA 2HFDA 1ZZYA 2TRCP 2IFQA 4FIWA 4PQIA 3GKNA 2H6XA 2K6VA 2NPBA 1BYEA 2ALBA 14GSA 1E2YA 5DJMA 4L0UA 4LL1B 1GLQA 3GRXA 3HYPA 1LJRA 5EY6A 1KNGA 4HZ2A 2J9HA 4BVXA 1MDIA 3TKPA 1SK2A 3WT2A 2X64A 5KN2A 3QDNA 1XPVA 3BCKA 5CREA 3ZITA 2I4AA 1QMVA 1B48A 4MCUA 1BEDA 2OADA 2YPMA 2MMOA 3BCIA 2Z9SA 3GA4A 4BL7B 1B9XC 1Z5YE 1G0TA 2EIOA 2BTOT 3UARA 5ABRA 1LU4A 3QD9A 2GT6A 2V6OA 4K6XA 1FVJA 1TRVA 3HJPA 3IE3A 4TKYA 4POBA 3HVVA 4MABA 2WRTA 2YOIA 4LMWA 4HI7A 3QFBC 2XBIA 2HSNB 5ECHB 5CYYA 1AQWA 3G7JA 3QFAC 1GSEA 1A0FA 1TW9A 1SK1A 2G2QA 5DJLA 4HS1A 4HOJA 3ZIVA 2VM1A 4AF2A 1PKWA 1M7TA 3KCMA 2R3XA 3I43A 5D9WA 3UEMA 1M9BA 1WMJA 3TKRA 4ECIA 1BJXA 5GAPD 1GP1A 1OKDA 3F8UA 3CTFA 3ZTLA 1TK8B 2WULA 1THOA 1SD8A 4POKA 5G2ZA 5DDLA 1TJDA 5AISA 1OE7A 1F2EA 5ECSA 1EOHA 1XW5A 5F0GA 2BJXA 1SYRA 4G19A 2DJ2A 2WCIA 4FH8A 4XS1A 3WYWA 4BWQA 1K0OA 3EE2A 1T3BA 1K3YA 5B7CA 1K0CA 1A2LA 3D4TA 3HVXA 3RDWA 3DD3A 2RLIA 4XHMA 4XCSA 2LKUA 2PU9C 4K7IA 4BPYA 2WS2A 1RQMA 5J4UA 3GTUA 3ZVJA 2H0IA 3LWAA 4K2DA 2PN8A 4NWYA 4OMVA 1KEBA 2C1YA 1PN9A 3ERFA 2E2MA 2KOKA 4EKZA 4MDCA 4PTSA 5INYA 3MWHA 4JRRA 3I9V2 2CZ3A 3O6TA 3RBTA 2H19A 5B8AA 4JU5A 3GSTA 2V32A 1YKCA 4AJ7A 13GSA 4MK3A 5IMVA 2K8VA 3FZ9A 3UJ1A 4WBRD 3KXOA 5ECIB 3H79A 1ACVA 2GQLA 2HSMA 2VLTA 1THXA 3LFLA 3F3RA 4KSMA 4NHZA 2LS5A 3EMXA 4KCEA 3PINA 4XS4B 5HR1A 1TP9A 3GYKA 5DQSA 3DKSA 4L0WA 5IMZA 2HZFA 2H70A 3VPTA 1XVQA 2VCQA 1JZOA 3LYKA 4DSRA 3KMNA 3L4NA 2OBKA 3TGZA 1SJZA 2YWMA 1EEMA 4OCFA 3ZMKA 4KCAA 1QQ2A 1GTIA 4MH2A 3HD5A 2CZ2A 5ELGA 1FB6A 4HEA2 2LJKA 2MMZA 3ME8A 3ZZXA 1Z7RA 3EINA 4ML1A 4GSTA 2QC7A 3VPQA 4K0NA 2F51A 4ZBAA 3P7XA 4I5QA 2CAQA 3LEFA 3FR6A 3TRXA 1T4ZA 5C00A 3TDGA 4F9ZA 3HZ4A 4JEDA 2PWJA 4Q5QA 2O87A 3CBUA 1ERWA 5GSTA 1Z9HA 1TRWA 2FLSA 5D8IA 4TXOB 5IM9A 2B5YA 1WRYA 1XWKA 2N5BA 3FR9A 3GKXA 3ZMLA 1PD21 4MF7A 3HY2A 5JWOB 1SKSB 3WGDA 3IBHA 4G9HA 2IMFA 6GSSA 4ECJA 1PKZA 1OVNA 3IPZA 1HNBA 3G7IA 2IFQB 2VLUA 3D22A 4MMMA 2FUG2 1TU8A 4MF6A 2R6KA 3O76A 4FYCA 1V98A 5A5KA 1OC3A 2VD0A 3EC3A 1USBA 4MJEA 1ON4A 4GWRA 1HYUA 1K0BA 4OCEA 5ID2A 1SJ6A 2GSRA 4BVXB 1FAAA 3KJYA 3UBKA 2DIYA 2E7PA 1K0NA 2ZUPA 4RQXA 3C8EA 4PUAA 2H1BA 2NVLA 3L0HA 2ON7A 4EXJA 4G0IA 1X0RA 5ECNB 3CRUA 1WOUA 1DUGA 2VCXA 3LGCA 3GUSA 4RI7A 3D5JA 2LUSA 4YQVA 1DSBA 1XWAA 3MDKA 4F0CA 1O81A 2BMXA 1SD9A 1PX7A 2E0QA 4MJAA 4ILFA 4JBBA 2JSYA 1M99A 3ZFLA 2CQ9A 1QXHA 2FWHA 4NPBA 4TW5A 2FCHA 5JCUA 4EVMA 4WEYA 1X9MB 5HR2A 1TDIA 4F0BA 1S3DA 4ZL8A 4RUVA 1RK4A 5IOXA 2HI7A 2AB6A 4IVFA 2OE3A 1GTBA 2VAFA 1H75A 4WBJA 2B5XA 4ZIJA 4KX4A 1QK8A 5CP1A 2P5RA 1JHBA 1SENA 3D4MA 2YN1A 3DEXA 3RHCA 1AW9A 19GSA 1XFLA 5IMCA 4YQUA 1J0FA 1X5EA 3JCML 4KGIA 2N5FA 2F3MA 4XRAA 5BMUA 5IO0A 3GFKA 1JZWA 1YY7A 1K3OA 5ECKB 2LEGA 3GIXA 1XZOA 2A2RA 4J57E 4X0XA 2NBSA 2XHFA 1WJKA 4EUYA 1CQHA 2X99A 3CSJA 1HNAA 2N5AA 3FYGA 3PGTA 3FW2A 4TR0A 5CRGA 2JL4A 5DALA 3IOSA 4PGTA 4DEJA 1GSYA 2L4QA 4HQSA 3SBCA 5F05A 2CAIA 4GRFA 1PSQA 3KMOA 1OC9A 2C80A 3H8QA 2JZSA 3KTLA 5JWQB 3EU3A 1B4PA 2KLXA 2HSHA 5IMDA 4ZXGA 1F9MA 5CO3A 3IC8A 1GNEA 3PH9A 4ZBBA 2FY6A 2DIZA 4EF0A 4JE1A 1GSDA 3FEUA 2FNOA 6GSTA 2VM2A 4G0LA 3IV4A 4EC0A 2LRTA 2IMEA 5D93A 3VI5A 2H30A 3CRTA 1R5PA 4HU9A 2OACA 1M2DA 2HZEB 4X1UA 3LORA 2JSZA 3FKFA 3UMAA 4Q5RA 2L59A 1X9WB 6GSVA 4BA7A 1GLPA 4WKWA 1YKAA 1BG5A 1C72A 2KP1A 3D21A 3AY8A 2B1LA 5EL8A 2RIIA 1EWXA 2RUEA 3IC4A 1PGTA 5IPGA 5ENUA 5DBQA 3V1WA 3GKMA 1XWBA 3TRQA 1O73A 5J9CA 3UOMA 3TUEA 4ZL9A 1EGOA 1B9YC 4K7NA 2AUVA 2TIRA 4YAVA 5FT3A 3C1RA 5G5EA 3GX8A 1AC1A 2IPAA 1E6BA 3F4TA 3UVHA 1SL0B 1Z3EA 3TOUA 3KGKA 1XXUA 2VL2C 2YZHA 1GUMA 1M2AA 5DAKB 1UA5A 1O6JA 2H0GA 5H5SA 1GNWA 4KA0A 4CW9A 1U6TA 5IMAA 3TJGA 3US3A 5CRWA 2DBCA 1UC7A 1WP0A 2FWGA 3EMPA 3LYPA 3N9JA 2HLSA 2WGRA 3VWUA 1G7OA 4HUAA 5E59A 4IQAA 4HJMA 2P31A 3GH6A 4V2LA 1JLVA 3LQ7A 2DJJA 1MTCA 3TKQA 3LXZA 4KH7A 1RW1A 4IJIA 2WJUA 1OYJA 1A8YA 3W8JA 4ZBDA 2C3NA 1NSWA 3HKRA 3TOTA 2GDRA 4L5OA 1M9AA 2J23A 4TR1B 4DSSA 1XWCA 1YEPA 1PRXA 3DYRA 3TKSA 2H73A 3NIVA 4EDYA 2AJQB 1PL1A 4LMVA 4RI6A 3DIEA 5DCGA 2PVOC 3QPMA 2I3YA 4G0KA 3KEBA 1YEXA 1OKTA 1FG4A 1EP8A 4AJ6A 2V41A 2CX4A 2GSTA 1AAZA 3DXBA 3M0FA 1XW6A 3DVXA 5JCWA 4ULXA 3LG6A 4JR6A 1V2AA 2YANA 22GSA 2JU5A 4WF5A 4NMUA 2HRKA 1O8WA 2K18A 3FZ4A 4IBPA 2PUKC 1ERVA 1HQOA 3M8NA 5LCZA 1AQXA 4XS6A 1FHEA 4O92A 4Q5FA 1AQVA 3QAVA 2YP6A 2HE3A 3HJOA 1A2MA 5A4VA 1TXXA 3ED3A 5CNWA 5F06A 3G9BA 5DCHA 4PURA 4BVYA 2H71A 4GXZA 1WPIA 2FWFA 1V40A 4OD7A 1UVZA 2H8LA 1K3LA 4I6XA 1K0DA 5G1LA 5DALB 1SYXA 4O7HA 1F6MC 3KZQA 1GSUA 3LXTA 4MJBA 4KF9A 1SKRB 18GSA 4KNDA 2EC4A 3BJ5A 3M3MA 3GL5A 4CHSA 1HNCA 3IDVA 2L5LA 3GH9A 3IXRA 4PUFC 2LNSA 4D73A 2EIQA 3FHKA 1TI1A 5ECOB 1HD2A 1T1VA 1Y25A 2C0EA 3VFIA 2VL2A 5FHIA 4MLYA 1F37A 2JZRA 3CSHA 1R4WA 4FQUA 2YWNA 5IOWA 1NM3A 3APQA 4GQCA 5A4UA 3SWLA 3BOAA 1GSFA 4EDZA 1XWGA 3VWXA 5ECRB 1I9DA 1LBKA 4TR3A 4POMA 3WGXA 1BQ7A 4GTUA 3DGQA 3ZLPA 3VK9A 5G5FA 1TTZA 3VWWA 3EWLA 5AIVA 3ZIJA 4K7OA 5AN1A 3F4SA 2MMAA 4ACSA 5D73A 2FA4A 1I5GA 4K1FA 4E8EA 1V57A 2IMDA 5FWGA 1A8LA 4KUNA 2HQTA 5A4WA 5IQYA 1A23A 2VO4A 1FB0A 3H4KA 4Z7XA 1FOVA 4I2UA 5IMFA 1EP7A 3R2QA 1V58A 2M72A 2HT9A 2VUPA 4KDUA 2V6KA 3TB2A 1VF2A 2H6YA 1Z6NA 1GRXA 2YCDA 1TRUA 4BL7A 5B6NA 5D9VA 2VCVA 2LJRA 1OE8A 1YF0A 3E3EA 5LD0A 5H5QA 2C4JA 1EZKA 4DSQA 3QR6A 3PR8A 5GAND 3MAKA 1R26A 3ZYWA 1Q4JA 3VURA 1TI3A 3KP8A 11GSA 3A3TA 2VCZA 3UBLA 2GTUA 1VRSD 1GUKA 1GUHA 2O8VB 1ZGNA 2CX3A 3A2WA 3IR4A 1M2BA 2IIYA 2YWOA 3S9FA 1Z6MA 2CVDA 2VD1A 2LQQA 2OA7A 1AXDA 1ERUA 4PQ1A 2IN3A 2LV3A 3TJKA 3UL3A 1SL2B 5ECPB 4GSNA 3F6DA 2X8CA 1WWJA 2GZPA 3GMFA 3VLNA 1GL8A 4PNFA 4PX1A 5KN1A 2HXKA 4OWYA 4OO4A 4ZB8A 3A2VA 4J56E 2ZCTA 5J3RA 3BBYA 2OE0A 4TN8A 2HRFA 3N5OA 3WGEA 4CDOA 3C71A 3WT1A 5D9TA 1PMTA 3LSZA 2ON5A 3HZ8A 2JACA 4MZBA 4IW9A 5H5RA 1YF1A 4X43A 10GSA 2V2GA 4USSA 3F0IA 1TU7A 1JLWA 1AIUA 2GQKA 3Q74A 5F8BA 2L6CA 2OKAA 1VGLA 2VOCA 1XIYA 3TJFA 3KIJA 4ZL7A 4L5LA 1BAYA 3H93A 2DMMA 4F2IA 5HFIA 1B8XA 1QFNA 1ZMAA 2B7JA 2WDUA 2B5EA 1UN2A 4V2MA 1WIKA 3RHBA 4WR5A 3IRAA 3DVWA 4EE0A 7GSSA 3TKSC 4G10A 3FK8A 3F9UA 3HDCA 3F4RA 1IYIA 4NV2A 3GTUB 1CQGA 1EV4A 2KP2A 3M9JA 4IELA 1JZRA 2CVBA 2XBQA 4K0GA 1V9WA 4MZCA 1XBSA 4IP1A 4OFTA 4YH2A 4TRXA 5AIXA 1NW2A 3FRCA 2DC5A 3IK7A 3IK9A 1K0MA 3DMLA 2ZNMA 5CRHA 4LLRA 5ECLB 1MDKA 3TKSE 3KTBA 3P2AA 1W4VA 4WETA 1U87A 4FYBA 2UZ8A 1B4QA 3ZREA 5B6MA 2L5OA 1WE0A 4MZWA 1A0RP 3KH7A 1ZL9A 2HSMB 1W89A 3UIWA 2IMKA 4I2TA 3DWVA 4O32A 4HU7A 2DSAA 2XC2A 5DVBA 4GF0A 4D73B 5C04A 4HZ4A 1ILOA 1U3AA 1YDKA 1T8EB 2C3TA 1G6YA 2HNLA 3ZVJD 3RPNA 3ZL5A 5ECQB 1TKDB 1XOAA 4IP6A 5CAXA 3QAWA 1OAZA 2WB9A 4ZB9A 4N10A 4TXOA 1NHOA 9GSSA 2CV4A 1DE1A 4DVCA 4YAPA 4WF4A 2C0FA 1N8JA 5KN3A 2NTOA 2X8GA 3J7Yb 2H0HA 3IHQA 1JZDA 2R4VA 4H86A 2LSTA 3L9UA 2AV4A 1O85A 5G31A 2K9FA 1U3IA 5LNKe 1NHYA 1SU9A 3CTGA 4IS0A 4MF5A 1ST9A 16GSA 1GULA 3ZFBA 2LTKA 1IYHA 3C7MA 4AGSA 2VL9A 5F07A 2DMLA 2LJAA 3DRNA 4PQHA 2JADA 2VCTA 2R2JA 3CSIA 2REMA 2HRAA 4JZQA 2H74A 3GL3A 3EYTA 3HJMA 3J7Yk 5ID2B 4ML6A 1TK5B 2I9HA 1S3CA 2CVKA 3FZ5A 5JWRB 3Q6OA 5COHA 2LRNA 2M46A 5G1KA 5E4WA 2TRXA 5KN0A 3M1GA 3H1NA 3W8SA 5G30A 2OE1A 4LL4B 1YZXA 2FHEA 1MD4A 2RM5A 4K9ZA 2H66A 1ZYQB 2HSYA 2O89A 1R7HA 3LJRA 1EEJA 2DJ3A 2A4VA 2QGVA 4OFMA 1VF3A 4ISDA 1ZCPA 3HA9A 3GURA 3GNJA 1O8XA 2YJ7A 4HJ2A 1Y6EA 5AGYA 3FZAA 3GV1A 1SK0A 3L9VA 3MSZA 1PQNA 4GQFA 4KDXA 2X8HA 4RQRA 2LQOA 2GZYA 1G7EA 3NOFA 3HHVA 3UVTA 4EL1A 2AAWA 3ISOA 2F8AA 3P8WA 4TR4A 1TK0B 4P3YB 2FA8A 4KE3A 2GT5A 2OJLA 1Z7PA 2GQMA 8GSSA 3KM6A 2C3QA 2P5QA 2FWEA 5IO2A 1A2JA 4L8EA 1XVWA 4IGJA 2DJKA 2PMTA 2M80A 4LA1A 1R5AA 4POLA 4IKHA 2B1KA 3ERGA 1OC8A 3F63A 1QUWA 4KB3A 2KUCA 4V2NA 1ZYEA 4ID0A 2KHPA 4IN0A 2YJHA 3QOUA 3KP9A 4NV5A 3K8NA 2DJ0A 1ZOFA 2VIMA 4V1Ag 3UAPA 3ZRDA 1YJ6A 1KBNA 4MH3A 1EGRA 4JR4A 5ECMB 1TOFA 2IMIA 2C0DA 4NHWA 2H1AA 3EU4A 1PX6A 2F9SA 5GZZB 1M0UA 1OC9B 2HRNA 1N2AA 3IAS2 3F6FA 3D6IA 6GSXA 1GSQA 4MPFA 2O7KA 4IQ1A 3HCZA 1GSSA 3KH9A 1F3BA 3G7YA 4WR4A 3VWVA 1S3AA 1T7PB 2R5GA 4PXOA 2FD3A 2O85A 4I8BA 4MJCA 5JCGA 2NDOA 4HDEA 4K8MA 2HZEA 3GX0A 4QL7A 1VF1A 2E2GA 3APOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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