1USBA

Rational design of a novel enzyme - efficient thioester hydrolysis enabled by the incorporation of a single his residue into human glutathione transferase a1-1
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
AEKPKLHYFNARGRMESTRWLLAAAGVEFEEKFIKSAEDLDKLRNDGYLMFQQVPMVEIDGMKLVQTRAILNYIASKYNLYGKDIKERALIDMYIEGIADLGEMILLLPVCPPEEKDAKLALIKEKIKNRYFPAFEKVLKSHGQDYLVGNKLSRADIHLVELLYYVEELDSSLISSFPLLKALKTRISNLPTVKKFLQPGSPRKPPMDEKSLEEHRKIF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Incorporation of a Single His Residue by Rational Design Enables Thiol-Ester Hydrolysis by Human Glutathione Transferase A1-1
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTATHIONE S-TRANSFERASE A1
total genus 76
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2003-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1usbA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1usbA01
2FWFA 3QAVA 3FKFA 1K0NA 5HFKA 4H86A 2C0FA 2CT6A 2ZUPA 3PH9A 1GH2A 5D9WA 3L9VA 2JACA 4DSRA 4RUVA 3UVHA 3FY7A 3GSSA 2B1LA 1SKWB 2V1MA 1V2AA 4FYCA 3VPTA 1I9DA 3BD2A 5F06A 3L4NA 4XCSA 4Z7XA 5DALB 4MDCA 1KBNA 1M7TA 17GSA 2VL2C 4D73B 5HFIA 2H1BA 1PX6A 3UVTA 2JL4A 4USSA 3O6TA 2L57A 2E2GA 2CVBA 4GCIA 2XC2A 9GSSA 4N11A 4MJEA 1FB0A 4XTSA 4QL9A 1AIUA 4J2FA 2LQQA 3C71A 1KNGA 1PRXA 3F3QA 4TKYA 2YJHA 3ZRDA 2PVQA 1V40A 2I4AA 4MMMA 3IA1A 4L5OA 2HFDA 5D8IA 1K0OA 3KP9A 1ZL9A 3D0ZA 3WGEA 3GH9A 2H0HA 1UA5A 1ZGNA 3KXOA 4JR6A 3GSTA 3DGQA 4WR4A 4MABA 2AHEA 2LTKA 1BJXA 2X8HA 3HD5A 4ACSA 1Y25A 1Y6EA 2C4JA 2LQOA 4O92A 2JSYA 2RM6A 3HZ8A 1X5EA 3UIWA 1VF1A 3GYKA 5CREA 5G5EA 2GSRA 5IO0A 1GNWA 1ML6A 2VAFA 1U88A 1TP9A 2TRCP 1FOVA 2NBSA 3CTFA 4FO5A 2R37A 2OACA 3F4SA 4BWQA 1UVZA 3TKSC 2VL9A 1GSYA 5L71A 4YQVA 2B1KA 5C00A 3FK8A 1JZRA 4ZILA 2V2GA 4HI7A 1RW1A 1JHBA 3M9JA 4MK3A 4NXIA 2H6YA 3IHQA 2H76A 4TVEA 4MP4A 5JWOB 5IIZA 2HSYA 4KB3A 1QUWA 2N5AA 2LRNA 1DE1A 3BCKA 5D73A 4DSSA 3EMPA 2OADA 3OR5A 1Q98A 2IN3A 4MF5A 3IXRA 2PUKC 4KNDA 2HSMB 2GS3A 2CA8A 4OWYA 4GF0A 3APOA 1BG5A 3DVWA 2X64A 3L9UA 3E0UA 4IP1A 3FYGA 3FR6A 4PTSA 3TOUA 5JCGA 6GSYA 3F6DA 3HVVA 4OO5A 2EIOA 2WZ9A 3EU4A 2HZFA 1QXHA 2H6ZA 2VD0A 4TW5A 3GKMA 1EEJA 1S3CA 1XVQA 6GSXA 3EU3A 2HI7A 1PSQA 18GSA 5GSTA 2P0GA 1E6BA 4POBA 3FW2A 3IBHA 3P7XA 4XS6A 4ZB8A 2C8UA 1IYHA 2C80A 4G2EA 1V98A 1TU8A 1VF4A 4OFMA 2FLSA 2WGRA 5DAKB 2VM1A 1SL0B 3PGTA 1B9XC 3FR9A 3ERGA 3A3TA 3MSZA 2L6CA 1VRSD 3ZREA 2DIZA 1HNBA 2FWHA 4N10A 3GKKA 3P8WA 2IIYA 3FZ4A 1MD3A 3KMNA 1EGOA 2GSTA 4WF5A 3KEBA 3KH7A 6GSWA 1O7UA 3NIVA 1R26A 2GZYA 2VM2A 4CW9A 2H74A 5IMFA 1XZOA 2PN8A 3GNJA 3LQ7A 2VOCA 1V57A 1XOAA 1WOUA 1Z6MA 4EDYA 1H4OA 4FYUA 2YWIA 2OA7A 4TR0A 2RIIA 2VLTA 3GTUB 5J41A 3ZFLA 1YKCA 1TRVA 2P5RA 4BVYA 3KJYA 3W8JA 1ZYEA 5INYA 2VLVA 2AJQB 4Q5FA 1X0RA 2HRFA 3IE3A 1ZOFA 1JZWA 1CQGA 2P5QA 2HSNB 3FZ9A 1EEMA 2PPTA 4N30A 3HZ4A 4PURA 4PNGA 2VUPA 1NHOA 2LSTA 4DSQA 1OVNA 2F51A 3TGZA 4CHSA 3S9FA 4K7OA 5A4UA 2GGTA 2YPMA 3LXTA 2YV9A 4EUYA 1UN2A 5DQYA 2DJ2A 2H0IA 2L4CA 3SBCA 1W89A 5DVBA 2F9SA 1U6TA 2HRAA 3TJJA 3KM6A 3QDNA 4I97A 1LU4A 2WCIA 3TKPA 5D9VA 1USBA 1MDJA 3WT2A 3LFLA 2X8GA 4LL1B 2V41A 2F8AA 1WRYA 2TRXA 3QR6A 4I2UA 2FD3A 1FVKA 3N9JA 3D4MA 4KA0A 5IPGA 2C0GA 3CBUA 3Q6OA 1R5PA 4IS0A 2XBQA 2RUEA 4OFNA 1OC9B 19GSA 4PUAA 3ZTLA 4TR1B 4K1FA 2FA8A 4AJ7A 4ZBAA 1V9WA 1M99A 2WDUA 3TRXA 1TK8B 1GTIA 5DCGA 2TIRA 1O81A 3WYWA 1SU9A 3F63A 1THOA 5ECNB 4GSSA 3H1NA 4OFTA 4ECCA 1PGTA 4ML6A 3CRTA 4ECBA 1DUGA 1TU7A 3IV4A 3GH6A 4RI7A 1YDKA 2BJXA 1EWXA 1BAYA 2VCVA 1GULA 1TRUA 2JZSA 2J9HA 4JZQA 4AGSA 1XWGA 1OKDA 1TRSA 3NZNA 5H5SA 3QFAC 4POKA 1K0CA 3CYNA 2IL3A 4TXOA 1MDKA 5CRDA 4BVXA 4GQCA 4L8EA 3GX8A 3VWUA 2GQMA 2ON7A 1N8JA 5G5FA 3GIXA 5DDLA 3VWXA 2B3SA 2YZHA 1WWJA 2O7KA 4HS1A 3FZAA 4BWSA 1AW9A 3KZQA 1OE8A 1B48A 1KEBA 2YNXA 2IFQA 1U87A 4WR5A 3HCZA 5IMVA 3TKRA 4TR4A 3EE2A 3A2WA 7GSSA 4WKWA 3TOTA 1YZXA 1R5AA 4G10A 2CV4A 3DRNA 2HZEA 2N5BA 1HQOA 4DSSB 2EC4A 1GWCA 5G1LA 2OBKA 2YN1A 1EOGA 2R2JA 3GN3A 2B5EA 5ECPB 5CNWA 2GT6A 5G1KA 4HEA2 5IPHA 3MDKA 2MMAA 1OC3A 3A5WA 2V6KA 1MD4A 5IQYA 3LORA 3EMXA 1Z6NA 3SWLA 2O8VB 3GHAA 3I69A 1X5CA 4QL7A 3GX0A 1JLVA 3DWVA 3EWLA 2E2MA 4L0WA 2B7JA 3LSZA 2X99A 1ERUA 1AQWA 4JEDA 3QCPA 4F03A 3CTGA 2JADA 2VL2A 1YEPA 1N2AA 2AAWA 2H1AA 2K8SA 2FCHA 4PX1A 2LEGA 3MNGA 20GSA 3Q19A 1JLWA 1SK0A 1SK1A 2DIYA 4JE1A 2OE1A 1ON4A 2MMZA 4EXJA 3M3MA 2A4VA 5FT3A 2K6VA 5A4WA 5B6MA 2FNOA 2OBIA 4L5LA 3UAPA 1SYRA 3HVXA 1PKZA 5C04A 2GDRA 4PQIA 2HSHA 2OE3A 1TRWA 2KP2A 2KUCA 1UC7A 1BEDA 4IVFA 2LKUA 2NVLA 5CP1A 1M9AA 3C8EA 5B6NA 3GKNA 2N5FA 4FQUA 4KF9A 4N0ZA 5J4UA 1A2MA 3EC3A 3L0HA 4IGJA 3DD3A 4DVCA 1GSSA 5DJLA 2F8FA 3K8NA 4P3YB 2B5XA 3GRXA 1T1VA 1B9YC 4IW9A 12GSA 3D22A 5AIVA 3VK9A 4ZL9A 4G19A 4K6XA 1QFNA 1PL1A 4BPYA 1ST9A 3GFKA 4NHZA 1GUMA 1OYJA 4GLTA 4XIHA 3RPNA 5HR2A 3IPZA 2GZZA 3TKSA 3PINA 4L0UA 3LYKA 3MWHA 1GSUA 5EY6A 3WGDA 3F8UA 1A8YA 2CAIA 3RHCA 1URMA 4G0IA 3C73A 1ACVA 2K9FA 6GSTA 2ES7A 1G0TA 3IK7A 1Z3EA 4Q5NA 1G6WA 3ME7A 5KN1A 2UZ8A 4GSNA 2RLIA 4WF4A 5GAPD 4MPGA 1TK5B 4OCFA 2DSAA 2HRKA 1XOBA 2LNSA 3ZIVA 4PQHA 2B5YA 1TI3A 2FWGA 2L4QA 2DBCA 2H01A 2WRTA 1Z5YE 5HR1A 5ENUA 3A2XA 1OC8A 2KOKA 1M2DA 2AB6A 4YQUA 4ISDA 2I81A 3APQA 2YZUA 2GQLA 3F0IA 4K7NA 4HJ2A 3APSA 4I5QA 5A4VA 2MMNA 2M72A 4I6XA 3TCOA 1XBSA 2PBJA 4EE0A 1ZCPA 5ECRB 1O85A 4O5RA 2YANA 1PN9A 4X43A 4BL7B 2HLSA 6GSSA 5IMZA 4WETA 3Q74A 3MAKA 3EINA 2FWEA 2MZCA 5B8BA 4Q5RA 4KSOA 5J9BA 3DIEA 4EKZA 3HKRA 1O8WA 2AV4A 4OD7A 2DJKA 1FVJA 2CVDA 2V32A 1AAZA 2GZPA 2H19A 1F3AA 4F9ZA 4NHWA 3H79A 1GTBA 3GMFA 4ECJA 5BMUA 3TJBA 1J08A 3FR3A 3EVIA 2IPAA 4ZL8A 4HUAA 1H75A 2FGXA 1HNCA 2K8VA 4NV2A 3KD0A 1YY7A 2EIRA 5ID2B 3ME8A 4TXOB 1EGRA 1XWBA 4GXZA 3G7IA 3UOMA 2YJ7A 5DALA 2G2QA 1T7PB 1YEXA 5CRGA 3V1WA 5ELGA 1O8XA 3TRPA 3J7Yb 5J3RA 3Q18A 1Z9HA 1JZOA 3RAZA 2M80A 1SYXA 3F3RA 4HU7A 3UEMA 3I43A 1THXA 1FB6A 4HU9A 2XPEA 3UJ1A 2H71A 3HY2A 4BA7A 1EV9A 4MJBA 2A2RA 1X5DA 2B6MA 1OAZA 1PMTA 2GQKA 2JU5A 1K3OA 4O7HA 1Z7RA 1BQ7A 3KMOA 4MA9A 5JWRB 1GTAA 2FHEA 5JCUA 3HDCA 3DYRA 3KTBA 3LYPA 2H1GA 4YH2A 1EP7A 4TXVA 1KTEA 2DMLA 3ZFBA 3KGKA 1A2JA 1K3LA 1NSWA 3HVSA 4MH3A 3D6IA 2PGTA 2NDOA 2CZ2A 1M2BA 1M0UA 3GA4A 1A8LA 4ZL7A 2MBTA 4GRFA 1XFLA 3RHBA 3EURA 1RQMA 4XRDA 1A0FA 1M2AA 2VLUA 1CQHA 4GTUA 3A2VA 5E4WA 5CAXA 2C0EA 3TDGA 3ZMKA 2O87A 2YV7A 3I6AA 4J57E 1K0BA 3HJOA 2MMOA 3CRUA 4V1Ap 1XWKA 3KIJA 3D4TA 5GSSA 1DSBA 2V6OA 4JR4A 1F37A 2ZCTA 5JWQB 4E8HA 5ECSA 2GT5A 2PU9C 5F0GA 4NAXA 2XHFA 2X8CA 1XCCA 4HZ2A 2AUVA 3CSHA 3TJFA 3GKXA 2HSMA 5ECKB 5GAND 4MPFA 3LEFA 1OE7A 4XS1A 3UL3A 3J7Yk 5ECHB 3U6VA 4X1UA 1ZYQB 4XS4A 4ZB6A 5DJMA 3ZZXA 2L5OA 1S3AA 3H4KA 5IOXA 5H5QA 4IJ3A 13GSA 3CXGA 2IMEA 5D9XA 5ECLB 4JU5A 4IQAA 4IBPA 3DMLA 1BX9A 2L5LA 1NW2A 1X9MB 5D93A 5D96A 2NTOA 5DAKA 6GSVA 5LNKe 4NV5A 4X0XA 4GSTA 4IN0A 5F05A 3BBYA 2DMMA 3BCIA 3LJRA 2GSSA 3F9UA 3VPQA 3IRAA 3ZYWA 1FG4A 2FA4A 1YF0A 5ECMB 1MTCA 3TRQA 4OCEA 3HHVA 2YWOA 1QK8A 2IJYA 2VD1A 4OO4A 1YKAA 3TUEA 5E59A 2H75A 1K0AA 1J9BA 1XW9A 3CSJA 4ID0A 4PUFC 5KN3A 5CRWA 3E3EA 3UMAA 1XPVA 2PWJA 2VCZA 5DQSA 1GL8A 5ECQB 4MJAA 1GLQA 1GLPA 2VIMA 4ZBBA 2DJ3A 1I5GA 3GTUA 3F4TA 5GZZB 2IMKA 3RPPA 4I8BA 2DC5A 2DJ1A 5IOWA 4IELA 5HFGA 1E2YA 2OJLA 4FH8A 3KCMA 4I2TA 3P90A 3WT1A 5ABRA 4EC0A 3ZVJD 3DKSA 4K8MA 4POMA 4Q5QA 4MJCA 4V2MA 5H5RA 1ERVA 4IHUA 2CZ3A 5F8BA 2JSZA 2R4VA 3P2AA 3M0FA 3RDWA 2LJAA 1XW5A 1GSEA 2ALBA 3R2QA 3GUSA 4NMUA 8GSSA 1SENA 1WPIA 1EV4A 1GP1A 3QPMA 3HA9A 2C3TA 2MYGA 4WXTA 5IMAA 2DLXA 3CSIA 1TOFA 2QSIA 1RK4A 3NOFA 1IYIA 3UBKA 1SD8A 3LGCA 5HR0A 4PQ1A 4QQ7A 3IR4A 3DXBA 4J56E 5CYYA 1V58A 2IMDA 4DEJA 3IC8A 5HQPA 5ECOB 2LJKA 2E0QA 4MF6A 1ERTA 2H66A 1WP0A 1W4VA 5G2ZA 1VF2A 3UBLA 1OC9A 4TN8A 2XBIA 3AY8A 2JZTA 1MDIA 5EL8A 2C3QA 2KP1A 4K0NA 4TR1A 4LMWA 3TJGA 2VO4A 1F2EA 11GSA 4G0KA 3QFBC 3F6FA 2EIQA 1K0MA 3IOSA 2PMTA 2OKAA 5AISA 4BVYB 1EOHA 2XPDA 16GSA 4PNFA 2H0GA 5CRHA 1GTUA 4MZCA 4AJ6A 1AQXA 4F2IA 5CO3A 1X9WB 6GSUA 1Z7PA 3LG6A 2MBSA 2IMFA 4TOPA 3TKQA 1PA3A 1VGLA 2LRTA 5DCHA 4MLYA 2PERA 3VFIA 2HXKA 3ISOA 4ULXA 5HR3A 4JBBA 1PKWA 3C1SA 2M46A 4WEYA 2WULA 1NHYA 2H6XA 4KH7A 1XVWA 3US3A 3VURA 3ZMLA 1SJIA 1XXUA 1HD2A 4MH2A 2H1DA 3ZVJA 5IMDA 1ABAA 3IAM2 4LMVA 2IMIA 5LCZA 4AF2A 3M8NA 3ED3A 2LNTA 4EDZA 3TB2A 3VI7A 1EP8A 1EZKA 1OKTA 2RUFA 2H70A 2D2ZA 1XWCA 2F3MA 3KH9A 4RQXA 4IP6A 3KP8A 4KCAA 1GUHA 4KE3A 4WBRD 1G7EA 1FAAA 2LUSA 3L78A 4EVMA 2GLRA 4WBJA 1HNAA 1T4YA 2K18A 2CX4A 1AQVA 4MZWA 4ML1A 1WJKA 2AYTA 4FIWA 3D5JA 1B8XA 2REMA 5J5NA 2HYXA 4IKHA 2CVKA 2CX3A 2DJ0A 4EF0A 1VF3A 5B7CA 1LJRA 5B8AA 2PVOC 5JCWA 1GSQA 2HRNA 2ON5A 5J9CA 4XS4B 1U3AA 5ELAA 1G6YA 4AJ8A 4V1Ag 2WFCA 1BYEA 1C72A 5D9TA 2CAQA 4GQFA 3GV1A 2RM5A 4O32A 4MF7A 1PX7A 3TJKA 1K3YA 1TJDA 4RI6A 2A2SA 3TKSE 2WJUA 1A24A 1Q4JA 1JFUA 1A0RP 1YQ1A 4MZBA 2KLXA 2B7KA 1GRXA 4YQMA 1YF1A 2VL3A 4E8EA 3VI5A 1ZMAA 2JZRA 1U3IA 4KDXA 4KW6A 5G30A 4HQZA 2O89A 22GSA 2VCWA 2WS2A 4HQSA 4BVXB 4D73A 2C3NA 2QKEA 1AXDA 2BMXA 1R7HA 3H8QA 4KDYA 2L59A 3FRCA 2I1UA 1AC1A 1DBYA 2IFQB 4N0VA 5EVOA 1SJ6A 1SKRB 2GVPA 3C1RA 2R6KA 1PL2A 2H8LA 14GSA 4HOJA 2IWTA 2R3XA 2HZEB 5AN1A 3VLNA 4LL4B 1GSFA 4KUNA 1QQ2A 1S3DA 1A2LA 1NM3A 4KX4A 3VWVA 1QGVA 4KGIA 1SK2A 3E9JB 2LJRA 1T3BA 2VCXA 1XIYA 1SKSB 4KCEA 1A23A 3PR8A 2J23A 4F0BA 4GWRA 4RQRA 2H72A 4TR3A 2YWNA 2E7PA 2VCQA 1T8EB 2HE3A 2LRCA 3W6GA 1F6MC 2VCTA 3QOUA 3N5OA 2KHPA 1QMVA 1O6JA 1WMJA 3JCML 1XW6A 3IAS2 3HJMA 4JRRA 1SL2B 1FHEA 2QC7A 2OE0A 4K7IA 1XWAA 3GL5A 3L9SA 1WIKA 3M1GA 1LBKA 5KEJA 3FZ5A 1T00A 3DEXA 3GL3A 3G7JA 1GNEA 1G7OA 2G0FA 2NPBA 1GUKA 4XRAA 3DVXA 5A5KA 5COHA 2C1YA 2YWMA 4ZXGA 5DBQA 5ECIB 1AUCA 4EL1A 1ILOA 1HYUA 2HT9A 1TTZA 1B4PA 2LV3A 4ILFA 1X9SB 5KN2A 4ZIJA 2C0DA 5FHIA 4YAPA 3LWAA 4LLRA 3F4RA 5F07A 3ZLPA 3O76A 2YOIA 4ECIA 3QD9A 1DE2A 2HQTA 1JZDA 4NPBA 4K9ZA 2FY6A 1PD21 3GURA 4HJMA 1TDIA 4PXOA 4FYBA 3G9BA 1TXXA 1YJ6A 3ZITA 2DJJA 1F3BA 4BL7A 4HDEA 4PGTA 3WD6A 2H30A 3ZIJA 4XHMA 4K2DA 4K0GA 3HJPA 2BTOT 3IC4A 1WE0A 3EYTA 3WGXA 4KDUA 4LA1A 3O3TA 3QMXA 4F82A 1FW1A 3LXZA 1ERWA 1R4WA 4ZB9A 5IM9A 3CMIA 3HXSA 1M9BA 1SJZA 4G9HA 1SL1B 2FUG2 4F0CA 2ZNMA 1MEKA 4G0LA 1TI1A 5IO2A 4YAVA 1TW9A 2P31A 5ID2A 5EPFA 3BJ5A 1GSDA 2Z9SA 3W8SA 10GSA 2HRKB 3R3EA 5IMCA 4OMVA 1PQNA 3U5RE 2GSQA 3UARA 1B4QA 1K0DA 3ERFA 3FHKA 3HYPA 3PPUA 2I9HA 2YCDA 4ZBDA 3M9KA 1TK0B 5AIXA 1O73A 4IQ1A 5KN0A 4KAEA 4EO3A 3ZL5A 3IDVA 4POLA 1F9MA 3KTLA 3H93A 3I9V2 1J0FA 3RBTA 5LD0A 2GTUA 3IK9A 2LS5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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