1YJ6A

Crystal structure of human glutathione s-transferase m1a-1a complexed with glutathionyl-zinc-trihydroxide
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
PMILGYWDIRGLAHAIRLLLEYTDSSYEEKKYTMGDAPDYDRSQWLNEKFKLGLDFPNLPYLIDGAHKITQSNAILCYIARKHNLCGETEEEKIRVDILENQTMDNHMQLGMICYNPEFEKLKPKYLEELPEKLKLYSEFLGKRPWFAGNKITFVDFLVYDVLDLHRIFEPKCLDAFPNLKDFISRFEGLEKISAYMKSSRFLPRPVFSKMAVWGNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Human Glutathione S-Transferase M1A-1A Catalyzes Formation of Gsh-Metal Complexes
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase Mu 1
total genus 77
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2005-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1yj6A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1yj6A01
3HCZA 3TJGA 3H1NA 3ZFLA 2NPBA 4GF0A 4XTSA 4N10A 3F3RA 4X43A 1GTBA 4ZXGA 4D73B 2DLXA 2VLUA 2HRKA 4GQCA 4HOJA 5D9WA 3MDKA 3KCMA 1AQXA 4MCUA 1BYEA 3ERGA 5G1LA 2E2GA 2HZEB 3QDNA 5IO0A 3VI5A 1NHOA 1R5PA 5FHIA 2AYTA 1YJ6A 5IPHA 1U6TA 1TRUA 5IMCA 5IO2A 3LFLA 4MH3A 2E2MA 2CAQA 4NHZA 2VL9A 1DSBA 2CZ3A 4IQ1A 2HRNA 1GLQA 2LS5A 1KNGA 1PN9A 2V6OA 1SKRB 3GSTA 5BMUA 3RDWA 5ECOB 3WT1A 3CSHA 2IIYA 4CDOA 1AIUA 3QAVA 3H8QA 3KTBA 3W8JA 3DKSA 5ECQB 5CRWA 17GSA 2CZ2A 1K0AA 3F3QA 3LWAA 1E2YA 5J41A 5ECHB 2LV3A 4MJAA 3ME8A 4K9ZA 4MZCA 1J08A 3IR4A 3D22A 3W8SA 3IK9A 2VIMA 3QFAC 2L5OA 4TVEA 4BPYA 2ALBA 5DQSA 4K6XA 2CVKA 3MNGA 4O5RA 1XWKA 2PMTA 1OE8A 1SJZA 3A2VA 3H79A 1QGVA 2E0QA 5GSSA 4G0LA 5J3RA 4MF5A 2JADA 1DE1A 4KAEA 3SWLA 3W6GA 4BVYA 1A23A 3L9VA 1X5EA 3WYWA 4V1Ag 1FB0A 5AIVA 4N11A 4GCIA 5L71A 2LNTA 1WE0A 3E3EA 4FQUA 2LRTA 3KZQA 5EY6A 4GSTA 3FZAA 5ECRB 1WMJA 4GWRA 3UJ1A 3BJ5A 4D73A 2VAFA 2B3SA 2AV4A 1H4OA 5DCHA 2IL3A 2VD1A 2H6XA 1MDIA 2JZTA 2HZEA 4DSRA 4LL1B 4MF6A 1DE2A 1S3AA 3ZRDA 1MD4A 1XW5A 1MDKA 4LL4B 3LYPA 3A2XA 5CYYA 2XBIA 3TOTA 3FK8A 1U3AA 2LRCA 2QKEA 2YV7A 3GV1A 4HUAA 2H6ZA 1XW9A 2P5RA 1FB6A 2IMEA 5IOWA 1TI1A 5IMVA 2I4AA 2PBJA 3E9JB 4XS1A 1H75A 2X8GA 4F2IA 3KH7A 2MMAA 1JLWA 3GUSA 2EIQA 4HQZA 4ZL7A 5IMDA 4NV2A 19GSA 4IN0A 3CRTA 2YOIA 5CP1A 4OMVA 3ZTLA 1FO5A 3D0ZA 1RK4A 1MEKA 2ON5A 2O8VB 1O85A 3GX0A 2K6VA 2B7KA 2I3YA 1Z3EA 3PGTA 1OE7A 2C3NA 3H4KA 1T3BA 3KJYA 3D5JA 5J5NA 3TUEA 5EPFA 3Q74A 2L4CA 2PU9C 1WWJA 1XZOA 1GRXA 2LKUA 3FY7A 2H74A 1O6JA 1O73A 3ME7A 3WT2A 3RHCA 2HQTA 3EVIA 1WRYA 4PGTA 1EWXA 5C00A 5IMFA 3D21A 3GNJA 1GP1A 2JZRA 2HSHA 3GKXA 4MZWA 2BTOT 3VWWA 2R3XA 1ZZYA 4N0VA 2HLSA 5ECPB 2YWIA 3IRAA 3TKSE 2H66A 4JZQA 1Z7PA 3C73A 4F03A 1R5AA 1K0DA 4HJMA 1FVJA 2IWTA 1GL8A 3FRCA 2GQKA 2V6KA 4L5LA 2N5BA 5ECNB 5EL8A 4V2LA 1QK8A 2J9HA 1E6BA 2WDUA 4V2NA 4HU7A 2Z9SA 3LG6A 4BA7A 1V57A 3TKRA 5E59A 5B6NA 4RUVA 1GSDA 1YEPA 1A8YA 2PWJA 3GHAA 1IYIA 2IFQB 3F4TA 3WGEA 2FD3A 3HD5A 4LA1A 4YQMA 5DALB 2MYGA 2QC7A 2TIRA 2H19A 2RM6A 2PGTA 2CVBA 3KD0A 4MPGA 5AIXA 3IC8A 1GWCA 2OACA 1SENA 3VLNA 2CV4A 2GZPA 4BWSA 2B5XA 2QGVA 4HDEA 4TN8A 1M7TA 3VPTA 4ULXA 4OCEA 5JCWA 3M0FA 3D4TA 3VURA 1YZXA 3C8EA 2P31A 4LLRA 2WJUA 2K8VA 1VF3A 2VCZA 4KF9A 2VUPA 5CRGA 4GSSA 2NTOA 1XIYA 3F63A 1YQ1A 3IE3A 1VRSD 4O92A 2LJRA 1PMTA 2L6DA 4PQHA 2KLXA 3TGZA 1YF0A 3J7Yk 5DCGA 3NIVA 1ERWA 1JZWA 5INYA 3WGXA 2H1AA 1PKZA 5FT3A 4NXIA 2DJ2A 4K7IA 4X1UA 1UVZA 2IMDA 3C1RA 3IXRA 4O32A 1O8WA 1TP9A 2B1LA 4Q5QA 3C7MA 3RPNA 4EXJA 1FVKA 4RQRA 2N5FA 2IFQA 5HR0A 1QUWA 2EC4A 3TRXA 4Q5NA 2RIIA 2GSSA 4JBBA 5DALA 2LJKA 4L5OA 4HS1A 1S3DA 1V9WA 3P7XA 2FUG2 2CAIA 2C3TA 1XW6A 4TKYA 1Z6NA 4I8BA 1OC9B 1G7EA 3EMXA 3UL3A 4GSNA 3LORA 3OR5A 1MDJA 4XS4B 5DVBA 3CXGA 2HFDA 2OE1A 4WETA 1X5CA 4K7NA 2OA7A 3GL3A 4G0KA 5JWRB 3GX8A 2O7KA 4F82A 4IP1A 1O8XA 5CNWA 2I9HA 1DUGA 2KP2A 7GSSA 2AAWA 3ZMKA 4OWYA 2F8FA 4I5QA 1XWCA 4FH8A 4ZBDA 12GSA 2GQMA 2DMMA 3VWUA 3HYPA 4CHSA 3UAPA 5B6MA 4WF5A 2GGTA 3O76A 2H73A 1TRWA 4J57E 3EU3A 16GSA 3QCPA 2WCIA 4EVMA 5AGYA 2X64A 4ILFA 4ZL9A 3DD3A 3RBTA 2PVQA 5KN0A 3K8NA 20GSA 4KGIA 1VF4A 1WP0A 1R26A 3CYNA 4POKA 4IGJA 2FHEA 4MDCA 4I6XA 4WEYA 3DVXA 3HJMA 2C0DA 1LU4A 1B9XC 1BEDA 2K8SA 1T4YA 14GSA 4TR1B 1PX6A 3KTLA 1XWAA 1XWBA 4RQXA 3GA4A 1FW1A 4GQFA 4O7HA 2RUFA 2JL4A 5ENUA 3DRNA 5FWGA 3IC4A 2WZ9A 4POLA 1ZOFA 2MMZA 1GSQA 4HU9A 5B8AA 2AHEA 3QFBC 2XPEA 2FA4A 5EVOA 2YWMA 1I5GA 1TDIA 1M2BA 4GTUA 2H0HA 4K1FA 4EKZA 2H76A 2R6KA 2C8UA 5DJLA 1OC9A 2YJ7A 11GSA 4EO3A 4WKWA 4ML6A 1XWGA 1TRSA 3GKKA 3EURA 4XS4A 3HVVA 3FYGA 3RPPA 5A4VA 2A2SA 4ZL8A 1URMA 1GNWA 2MBTA 3S9FA 4FYBA 5ECLB 3FHKA 3QMXA 4TR3A 5HFKA 4DSSB 1EZKA 22GSA 4BVXB 2FWHA 4ISDA 4ZB6A 1UN2A 2LSTA 1SKSB 2I1UA 1A2JA 4AF2A 4G2EA 2IMFA 1SU9A 2YZUA 4KUNA 3ZREA 4N30A 2GT5A 4DSQA 1GSSA 2VCXA 3UEMA 4KE3A 2JZSA 2YN1A 2WB9A 1F3AA 5KEJA 4F0CA 2V1MA 1T00A 1SD9A 2JSYA 1B4QA 4ZILA 5IIZA 4AJ7A 3HXSA 2ES7A 4TR1A 2AUVA 3WGDA 3I69A 3G7JA 3N5OA 3VK9A 4EDYA 2DJJA 3GN3A 4G10A 3GRXA 5D93A 1U87A 2VCVA 3KGKA 4HQSA 2LNSA 1SK1A 1XBSA 1M2DA 3DEXA 5GSTA 4IELA 1Z5YE 3CTGA 1A24A 4PQIA 1K3YA 1U88A 3E0UA 5E4WA 2YJHA 4E8HA 2LQOA 1M9AA 1J9BA 3QAGA 3WD6A 1A0RP 1AW9A 1ML6A 2GQLA 3ZIVA 5ECIB 4ACSA 1OKTA 4F9ZA 1K0NA 2P5QA 4AJ6A 1BJXA 2DBCA 3F4SA 4DSSA 2H75A 3QOUA 5D8IA 5C04A 4EC0A 1B4PA 2H1BA 5KN2A 1B48A 4BVXA 5ECSA 5DJMA 2OE3A 3A5WA 4I2TA 3ERFA 4MF7A 3PH9A 4Z7XA 1TK8B 1YDKA 2R2JA 3L9SA 4KDYA 3GMFA 1WOUA 1T8EB 5JWQB 1GUMA 3TRPA 2XPDA 2H0IA 1V98A 4G9HA 1SKWB 1NW2A 1FAAA 2L6CA 2GLRA 1HQOA 5H5QA 1K3OA 1X9SB 3DGQA 1XOBA 3QD9A 4BWQA 1BAYA 1TW9A 3HVXA 3LQ7A 1HNCA 3FKFA 4POMA 3NOFA 1USBA 4G19A 3ZFBA 4BL7B 1TI3A 6GSVA 4KCAA 3P8WA 1PSQA 3D4MA 1YEXA 4AJ8A 3R3EA 1ZGNA 1PD21 2F8AA 4ECBA 1THOA 2YANA 5G2ZA 2GSRA 2FWGA 1PGTA 5JCGA 1ABAA 1LJRA 3QR6A 3I9V2 2DJ3A 1XPVA 2OKAA 2MZCA 4ZIJA 3UVTA 2CQ9A 6GSSA 1ZL9A 2MBSA 2YPMA 3APQA 3EMPA 1SL1B 9GSSA 4MJCA 2CA8A 2IMIA 2H72A 4ML1A 2REMA 3MSZA 1GULA 1EEJA 2IMKA 3TKPA 5D9TA 3Q19A 1FOVA 4TRXA 3A2WA 4HEA2 1A2LA 1ZMAA 5AN1A 3BCKA 5J9CA 1ERTA 2B6MA 2PPTA 2VD0A 4IVFA 2GSTA 3APOA 5IM9A 4K0GA 2WFCA 1ON4A 3HZ8A 4POBA 1Q4JA 1V58A 5LD0A 2LQQA 4EL1A 2NVLA 4HZ2A 1HNAA 2L59A 3HDCA 4YH2A 5DAKB 3R2QA 4TXVA 4LMVA 2VL2C 3J7Yb 4RI7A 2HSYA 5DQYA 1ILOA 5A5KA 2AJQB 3Q6OA 1TK5B 4BL7A 3EYTA 4P3YB 3LXZA 4MPFA 1I9DA 1AC1A 1QMVA 2G0FA 3HY2A 1C72A 1ERVA 1EOGA 2GDRA 5GZZB 2ZNMA 3C1SA 1DBYA 1K0OA 3L4NA 1U3IA 5DDLA 4IQAA 3LYKA 1R4WA 2NBSA 3PR8A 3L9UA 4TXOA 4ZB8A 3ERWA 3F8UA 1PA3A 4OFNA 5IOXA 3ZVJA 3GH6A 2DMLA 2PUKC 3ZVJD 5F06A 2TRXA 2XC2A 5COHA 2HSMB 3IPZA 1KEBA 1F37A 1OC8A 3FR9A 1XOAA 2C1YA 3UOMA 4FYCA 2C0FA 3M1GA 3LGCA 3QPMA 4OD7A 5DBQA 3KEBA 5F8BA 1PRXA 1F6MC 2GSQA 3NZNA 3TKQA 1NSWA 1B8XA 4YQVA 2X8HA 2ZUPA 2DIYA 5ELAA 4WBJA 3HJOA 1O81A 1O7UA 4H86A 3G7YA 3DMLA 5CREA 1SJIA 1W89A 3GIXA 1A0FA 2B5YA 3TKSA 3IA1A 1R7HA 1TU8A 2HNLA 2GZYA 1JLVA 4XCSA 5DAKA 2V41A 2H8LA 1F9MA 3HKRA 4KDXA 4OO4A 2H0GA 3P90A 3MWHA 2RUEA 3EE2A 3F6DA 2MMOA 4QL9A 4MP4A 2WULA 1ZYQB 2CVDA 4WR4A 1ZYEA 4GRFA 4PX1A 1OYJA 3TCOA 1QQ2A 3HZ4A 1GTAA 3IAM2 1VGLA 2GT6A 4V2MA 3CRUA 2UZ8A 1JZRA 3FZ9A 2C3QA 4XHMA 3H93A 3TJJA 1GTUA 3I43A 1V2AA 2LJAA 2OBKA 1TRVA 3IV4A 5IMZA 1BG5A 2IJYA 5ECMB 1GUKA 1GTIA 1EV4A 4Q5FA 5AISA 1XVWA 5B8BA 1GSEA 1UA5A 4IS0A 3ED3A 4I2UA 1WJKA 4KW6A 2HSMA 3F6FA 2FGXA 2VLVA 4XRDA 3TJKA 4DVCA 1LBKA 1TTZA 4MZBA 2HT9A 1OAZA 2LRNA 4OFMA 2H70A 2YWOA 1AQVA 3HA9A 1HYUA 4RI6A 2VM2A 2L57A 1YF1A 5J4UA 4NV5A 1TXXA 1F2EA 3M8NA 5H5RA 4DEJA 1TJDA 2JACA 1GUHA 1CQGA 3MAKA 1B9YC 1G7OA 2P0GA 1VF2A 4FO5A 1T7PB 2FLSA 4XIHA 4X0XA 4EF0A 5G1KA 3IHQA 1Y25A 3CMIA 3UBKA 2KUCA 1G6WA 2MMNA 5ELGA 2EIRA 2AB6A 2N5AA 4MJBA 4L0WA 2M46A 1ACVA 2OJLA 2GZZA 3US3A 1A2MA 1ERUA 1XVQA 4CW9A 1QXHA 5KN3A 1AQWA 3FW2A 2XBQA 1SJ6A 2RLIA 2FNOA 1EV9A 1FHEA 2KHPA 2H1DA 1AAZA 4KH7A 5ABRA 2HZFA 2OE0A 2CX4A 3IOSA 4JRRA 3ZYWA 1AUCA 1V40A 1MD3A 5IMAA 4MLYA 3TJFA 2VL2A 4IKHA 2VCWA 2GTUA 2EIOA 4IJ3A 2FWEA 4Q5RA 2A2RA 1K0BA 1Q98A 2HRFA 4ID0A 1YKCA 3KM6A 3L0HA 1RQMA 4MMMA 1XFLA 1G6YA 4TR4A 5D96A 1OC3A 1GSFA 3DXBA 4TW5A 3ZITA 6GSXA 4IP6A 3GFKA 6GSTA 2R37A 4PURA 2VM1A 3LXTA 2FCHA 2K9FA 1PL2A 2X99A 4WXTA 1PL1A 1XCCA 4FIWA 1NHYA 4ECJA 2KOKA 1KTEA 1HD2A 3TJBA 1N2AA 1N8JA 4HI7A 2PERA 3TB2A 3O3TA 3IDVA 5J9BA 3LSZA 3GTUB 4PTSA 3F0IA 3I6AA 2K18A 4IHUA 1CQHA 4EDZA 4GXZA 4K2DA 1ST9A 4YAPA 2JSZA 3KH9A 1UC7A 3JCML 1J0FA 4KB3A 5G30A 2IN3A 1W4VA 2KP1A 4PUFC 3TRQA 3HJPA 3TKSC 1Z6MA 2VCQA 4PUAA 1SD8A 5GAND 3FZ5A 1WIKA 2G2QA 5LCZA 2DC5A 1G0TA 3AY8A 2F9SA 3RHBA 3QAWA 3APSA 1HNBA 1EEMA 1TOFA 5F05A 4KSOA 2L5LA 3LJRA 4PNGA 2H1GA 4XRAA 5A4UA 5HFGA 2YCDA 1K0CA 3IBHA 1OKDA 3ZZXA 3FR6A 1YKAA 3SBCA 2IPAA 5HR3A 3BBYA 4YQUA 4OFTA 3GSSA 5CRHA 2DJ0A 3ZMLA 1JZOA 4NHWA 4FYUA 1TK0B 1GH2A 4WF4A 3HHVA 2O85A 1SYXA 5KN1A 2H71A 3P2AA 2YZHA 1XXUA 3GKNA 4L8EA 4J2FA 3KMOA 2HRAA 4KA0A 5H5SA 4PNFA 1A8LA 4E8EA 1ZCPA 2QSIA 4MH2A 4ZBAA 4I97A 1K3LA 1BQ7A 1EGOA 4V1Ap 4TXOB 1T4ZA 1PQNA 4USSA 1M9BA 1VF1A 4GLTA 2HSNB 3GTUA 2M72A 2RM5A 3BCIA 2V32A 1QFNA 2HXKA 1BX9A 2VCTA 3BOAA 2PN8A 3U6VA 2LTKA 4NWYA 2M80A 3CBUA 5HR2A 3GKMA 2C0GA 2O89A 4WBRD 1X9MB 1Y6EA 5IPGA 3KIJA 8GSSA 3L78A 3G9BA 3N9JA 3VI7A 5GAPD 1SYRA 3ZL5A 5HFIA 3GL5A 1X0RA 4JR4A 2GVPA 3V1WA 3PPUA 1M99A 5G5FA 4HZ4A 1GSYA 1M2AA 3ZLPA 6GSWA 2I81A 2H6YA 2VLTA 5CAXA 3GURA 4JEDA 5CO3A 4QL7A 3DIEA 2ON7A 1JFUA 2V2GA 4IJIA 4EUYA 3UMAA 2X8CA 18GSA 2F3MA 4K7OA 3UVHA 3HVSA 4JU5A 4LMWA 1AXDA 4ZBBA 2TRCP 5B7CA 3M9JA 3UIWA 2FWFA 2DSAA 1GSUA 1SK2A 1EGRA 4NPBA 1EP8A 4OCFA 3PINA 2HYXA 3FZ4A 5ID2B 2HI7A 2WGRA 1X5DA 2B1KA 2XHFA 1JZDA 2VO4A 4N0ZA 2L4QA 10GSA 5G31A 4KX4A 5F0GA 2FY6A 1MTCA 3KP9A 5JCUA 4WR5A 3O6TA 3TDGA 3Q18A 3DVWA 2OADA 4KSMA 5F07A 3G7IA 2LUSA 3GH9A 2CX3A 2NDOA 3BD2A 3ZIJA 2C4JA 2C80A 3IAS2 2E7PA 1Z9HA 2A4VA 2R5GA 4EE0A 2WRTA 1NM3A 1YY7A 1X9WB 4IBPA 2PVOC 4L0UA 1FG4A 2VOCA 1Z7RA 4KCEA 4TOPA 3VWXA 5ECKB 1S3CA 6GSUA 1TU7A 1TKDB 3F4RA 3M3MA 2J23A 4NAXA 3UARA 2WS2A 5HR1A 4ZB9A 4ECCA 1SL0B 3U5RE 3CTFA 2HE3A 4J56E 1RW1A 3A3TA 3EU4A 3M9KA 3C71A 2B5EA 5D9VA 3LEFA 4KNDA 1GLPA 5D9XA 4IW9A 2FA8A 3TOUA 4MK3A 3VWVA 1PKWA 2O87A 1K0MA 2HRKB 3FEUA 3KP8A 1OVNA 4JR6A 2C0EA 5G5EA 2DIZA 3KMNA 4NMUA 4PXOA 3CSIA 5ID2A 4XS6A 1PX7A 3FR3A 5A4WA 1T1VA 1IYHA 4F0BA 4ECIA 4PQ1A 4G0IA 3DYRA 2CT6A 2YWNA 1THXA 5D73A 1WPIA 3CSJA 3GYKA 2D2ZA 1KBNA 1EOHA 2F51A 3D6IA 2BMXA 3EWLA 2YNXA 6GSYA 3ISOA 1JHBA 2H30A 3RAZA 4TR0A 1SK0A 4QQ7A 2LEGA 2YP6A 5IQYA 4MABA 3UBLA 4AGSA 3KXOA 2ZCTA 2DJKA 2YV9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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