1NHYA

Crystal structure of the gst-like domain of elongation factor 1-gamma from saccharomyces cerevisiae.
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
MSQGTLYANFRIRTWVPRGLVKALKLDVKVVTPDAAAEQFARDFPLKKVPAFVGPKGYKLTEAMAINYYLVKLSQDDKMKTQLLGADDDLNAQAQIIRWQSLANSDLCIQIANTIVPLKGGAPYNKKSVDSAMDAVDKIVDIFENRLKNYTYLATENISLADLVAASIFTRYFESLFGTEWRAQHPAIVRWFNTVRASPFLKDEYKDFKFADKPLSPPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of the Glutathione S-Transferase-like Domain of Elongation Factor 1B{gamma} from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule tags Translation
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule keywords Elongation factor 1-gamma 1
total genus 59
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1nhyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nhyA01
4EKZA 1SD9A 3ZL5A 1GL8A 1QUWA 1MDIA 2GS3A 2PBJA 5DJLA 3S9FA 3J7Yk 2HRAA 4JEDA 3TCOA 2H66A 4OO4A 5DDLA 5ECHB 4EDZA 5L71A 1QQ2A 2MBSA 1CQHA 5B8AA 2PVOC 3L0HA 1ZYEA 2HI7A 3W8JA 5A4UA 1F2EA 1OC3A 4KCAA 1U88A 3TOUA 3DGQA 5IPHA 3HVVA 1QGVA 1N8JA 3VLNA 3MAKA 3HXSA 3UIWA 2WJUA 4BWQA 1EEJA 5J9CA 1V57A 2B6MA 3ISOA 3VWUA 3MNGA 5ABRA 3KTBA 1OE8A 1SK1A 2PUKC 1ERTA 1GSFA 3MDKA 5H5SA 4HUAA 4KSOA 2XHFA 4EDYA 3N5OA 5HR3A 2EIOA 3LWAA 4KW6A 2N5FA 2H71A 4ZBAA 5HFGA 2OADA 5IOWA 2IJYA 1OC9B 2YWMA 1JFUA 1H75A 5IMFA 4CHSA 1OAZA 1O6JA 1DUGA 2LSTA 5IM9A 4YQMA 5GAPD 1RW1A 3U6VA 2CT6A 1HNAA 3EU4A 2OA7A 3G7YA 2A2RA 4J56E 3TDGA 2H0HA 2FA8A 3DVXA 3ZZXA 3QR6A 1A0FA 4PTSA 19GSA 2R4VA 1EV4A 1IYHA 1XVQA 2FA4A 5F0GA 4PQ1A 3VWWA 1USBA 2QKEA 3E0UA 1TK5B 4K7OA 1PN9A 3TKSE 2GT6A 2V6KA 3GMFA 3GH9A 3ZFBA 4Z7XA 1SENA 4GTUA 4IELA 1XZOA 3ERGA 5DALA 4I6XA 5LD0A 4TR0A 1QXHA 3FK8A 4IW9A 5ECKB 2OE0A 4V2LA 6GSTA 3RPNA 2H19A 1T4ZA 5G30A 4XRDA 4N10A 4I2TA 5CO3A 4WXTA 3QMXA 3ME8A 3EC3A 4X43A 4X1UA 4MF7A 4XS4B 3LSZA 2HRKA 1B48A 2MMAA 4RUVA 5ENUA 2FY6A 2FCHA 1HQOA 1G6YA 4V2NA 4BVYA 2ON5A 4ECCA 5J5NA 1R7HA 3UBKA 1TJDA 3I6AA 1G0TA 4TR1A 4MLYA 1AQVA 4GSNA 5AIXA 2ES7A 4RI7A 5DAKA 3U5RE 3M8NA 1M9BA 1EP7A 4LA1A 1T7PB 5HR1A 1MEKA 4IQAA 3D0ZA 3JCML 3GUSA 3ZLPA 4KE3A 3TJFA 2VL3A 5DCHA 4WEYA 2WCIA 1S3DA 4K0GA 4JRRA 4MDCA 4N0ZA 4NXIA 3HDCA 4O92A 4I2UA 4LL1B 3KZQA 1K3OA 2GT5A 3LQ7A 3WGEA 1X9SB 3HJPA 1O73A 3GN3A 1O7UA 4L5LA 1TOFA 4OFTA 1RQMA 4L0UA 1V58A 3LFLA 3QAWA 1R26A 1WJKA 4IJIA 3TJGA 1FHEA 2NVLA 2VD0A 3TJJA 4FYUA 3KP8A 5B6MA 2M46A 4NMUA 3IXRA 6GSYA 2ALBA 4ML6A 2VUPA 3OR5A 4DSRA 3F8UA 3ZVJA 3L9VA 1BX9A 1JZDA 4TXVA 6GSVA 4N30A 3HD5A 3QD9A 3EWLA 1T1VA 2VCWA 2GQLA 1PL1A 2HZEA 3EVIA 2B5YA 4TXOA 1A2JA 4MF5A 1OYJA 2H74A 3APQA 4QQ7A 5IMZA 3C8EA 3TJBA 5CRDA 2YWNA 3HJMA 1TRVA 2QGVA 1F6MC 5A4WA 3FZAA 2H1DA 2BJXA 5H5QA 1E2YA 3DIEA 4MCUA 2GLRA 5GAND 1A8LA 4ZIJA 4KCEA 3D4TA 3WD6A 1XW5A 1W89A 4DEJA 3H1NA 3H79A 6GSXA 1FVKA 1TU8A 5HR0A 2XBIA 4KB3A 1PGTA 1M99A 2CZ3A 2AUVA 2M72A 2A4VA 5DCGA 4ID0A 13GSA 4ISDA 1N2AA 4IBPA 1MDKA 3GTUA 5DVBA 3CBUA 1BAYA 5LCZA 5LNKe 5D9VA 2C0FA 4N0VA 4BVXA 3LJRA 1XWKA 2GQMA 3IR4A 5HQPA 3QAGA 4MP4A 1URMA 3UBLA 3TGZA 1AW9A 4G0KA 5IMAA 2Z9SA 3ZYWA 3QFAC 3F3RA 1U3IA 1GLPA 4USSA 1M2DA 3BCIA 3ERWA 1EV9A 1Z6MA 2PN8A 3ED3A 1K0CA 3ZRDA 2C3TA 2GSSA 4K8MA 3WT2A 3FYGA 1SL0B 5KN2A 1YKCA 2JADA 2ON7A 4XS1A 1F37A 4YH2A 4HZ2A 1QFNA 4MF6A 2IFQA 1XWAA 4F0BA 1EWXA 4JZQA 1XOAA 2I4AA 3EMXA 4TOPA 2VAFA 1KEBA 2VCXA 2LV3A 4MJAA 3ZVJD 2KUCA 1BQ7A 1B9XC 3QOUA 3UL3A 2VD1A 4G2EA 2FHEA 1J0FA 1SYXA 1O81A 3FHKA 3QAVA 4H86A 3LXTA 1GSQA 5B8BA 3DXBA 4G0IA 3FZ5A 2PWJA 1V2AA 1VF2A 4KGIA 3VWXA 1EGRA 1XCCA 2IMKA 1K0MA 11GSA 4TRXA 3FR9A 3D6IA 5AISA 2NDOA 3HCZA 5JCWA 2CX3A 3TKQA 2CVBA 3D21A 1B4PA 3D22A 1PQNA 4MABA 2VLVA 4OWYA 1UN2A 22GSA 8GSSA 4WETA 2VCTA 2N5AA 4FYCA 4GQCA 1FVJA 2HE3A 5GZZB 3GNJA 3QCPA 3M1GA 1XPVA 2P0GA 4OMVA 1ZGNA 1YJ6A 3IK7A 3UOMA 2H1BA 1XWBA 3DRNA 3GKXA 4JR4A 1G7EA 1HD2A 1O8WA 2YP6A 5CYYA 3VFIA 1AC1A 3P90A 2FGXA 3F9UA 3KH7A 3TRXA 2LKUA 3GIXA 2C0DA 5ELGA 2WFCA 3RDWA 1DE1A 4HQSA 5ID2B 2OBKA 3SBCA 2AB6A 4IS0A 2PPTA 3HVXA 3Q19A 5CREA 2YV9A 1YZXA 4HI7A 3TB2A 3GRXA 2XPEA 3GSSA 3RPPA 4MK3A 1OC9A 3BCKA 3F4SA 3GHAA 1I9DA 3GX8A 5HR2A 1U6TA 2DSAA 4HJMA 5ECNB 3UMAA 1CQGA 3D5JA 1O8XA 6GSWA 2LJAA 5AN1A 3IK9A 4MZBA 2AYTA 12GSA 2F8FA 2I1UA 4AF2A 1R5PA 4PQIA 1TI1A 2IL3A 1SL2B 1VF4A 5C00A 4KUNA 1SKWB 1SKRB 1V40A 3EYTA 4ZBDA 2H0IA 5D9XA 1GNEA 3US3A 1THOA 4PQHA 4HDEA 3TOTA 2YJ7A 5D9WA 5G1LA 4L8EA 1PSQA 1SL1B 3HHVA 1WIKA 3EINA 4EF0A 4MZCA 1K0NA 1UVZA 1Y25A 2CAQA 4XHMA 3FRCA 3WYWA 3LORA 5CAXA 3ZIVA 4Q5RA 2PGTA 1LJRA 3LGCA 1THXA 3GKNA 3DWVA 2LS5A 3HZ4A 2OACA 2MBTA 3I43A 3M3MA 4POMA 1SJZA 2L59A 4GQFA 2IMEA 1Y6EA 3ERFA 3KM6A 1DBYA 1YDKA 4MPGA 3A2VA 1X5EA 5HFIA 5IO0A 1GTUA 1GWCA 4OO5A 3GV1A 1XBSA 1DSBA 2GSTA 4WBRD 3IDVA 4BL7A 3CYNA 5IMCA 2GZPA 2K6VA 2FWFA 2PERA 16GSA 4D73B 5KN0A 5JWQB 4ZL7A 3KMOA 2RM5A 4LMWA 2B1KA 2V2GA 3C71A 1ZOFA 4LMVA 4HQZA 2I81A 1ON4A 4LLRA 2XPDA 3FY7A 5D73A 1X5CA 1Z6NA 4K6XA 4WR5A 5ECPB 3R3EA 3GYKA 3KTLA 3PH9A 4IQ1A 4NV5A 1MD4A 2VM2A 1GRXA 1GUHA 5JWRB 1A23A 2UZ8A 2HSMA 3KMNA 5EPFA 2V41A 4WF5A 3ZFLA 4K2DA 1EP8A 2LRCA 2GQKA 2CV4A 3KGKA 2H6ZA 2VLTA 2KLXA 3G7IA 1NM3A 3BJ5A 4MA9A 1JZOA 2JACA 4BA7A 3BD2A 4HU9A 3I9V2 4YAPA 2P5QA 1MD3A 4KAEA 1GTIA 3F0IA 5INYA 1XWGA 4G0LA 2AAWA 5F8BA 1ZZYA 4AJ8A 2FLSA 2VCZA 6GSSA 1XVWA 3Q18A 3C1RA 2PVQA 4KF9A 1YF0A 3FEUA 1F9MA 4ZL8A 3FW2A 1HYUA 2R5GA 1I5GA 2IMIA 4MPFA 1SJ6A 4ECBA 1Q98A 1NW2A 1YF1A 2WDUA 1XFLA 2O89A 3FR6A 3D4MA 2R37A 1SU9A 2R3XA 2FNOA 1T4YA 1GSSA 1SK2A 4I5QA 2E7PA 1WP0A 2X8HA 3PINA 10GSA 3UARA 3RHBA 1OC8A 1AXDA 1EGOA 2J9HA 1YKAA 3O3TA 2JU5A 2FWEA 4TW5A 5CRHA 2OE1A 2H76A 4KDYA 2GTUA 4WR4A 2RM6A 1ML6A 1PD21 5C04A 2X99A 2F8AA 2H01A 1YEXA 4WBJA 5ELAA 2DJKA 2O8VB 4QL7A 2B7JA 3FR3A 4XS6A 2DIZA 4JR6A 3CTGA 3ZTLA 2JZRA 3GKMA 2CX4A 1GSDA 5KN3A 3IRAA 5DBQA 4O7HA 3HY2A 2R6KA 3C1SA 1ZYQB 2HT9A 3HZ8A 3TKSC 3TKSA 2OKAA 2HLSA 5IPGA 3W8SA 4L5OA 3GA4A 3R2QA 5J4UA 1FOVA 2O85A 1ERVA 3GSTA 1M2BA 3CXGA 1Z7PA 4DSSB 3P8WA 1WWJA 4L0WA 2VM1A 1RK4A 5JCGA 1JZRA 2TRXA 2PMTA 4FO5A 3IPZA 2FWHA 5ECOB 2YN1A 3TKRA 1E6BA 4GLTA 1F3AA 3GH6A 2RIIA 2YZUA 5DJMA 4TVEA 1ZL9A 2GGTA 1PX6A 4EL1A 1XIYA 2YOIA 2EC4A 4HJ2A 2JZTA 1ACVA 2CQ9A 1TU7A 2DC5A 3HA9A 1K0AA 2HZFA 4MMMA 5IMDA 2NPBA 1ERWA 1TK8B 3EE2A 4ZB9A 1W4VA 5KN1A 3F6FA 5KEJA 1R4WA 3VPTA 2C3NA 2HXKA 3APSA 2H8LA 4MJCA 4N11A 1HNCA 3Q6OA 1KNGA 5EVOA 1TRWA 1YY7A 2RUFA 4GCIA 3PPUA 18GSA 4TR4A 1ST9A 4PURA 2H1GA 3H4KA 2C0GA 4F03A 3O76A 3SWLA 1OKDA 3CSIA 2IIYA 1TXXA 1Q4JA 5F07A 3F4TA 4DSQA 5ECLB 2WB9A 2YZHA 2LTKA 5E4WA 3IBHA 3Q74A 1PA3A 3IAM2 4EO3A 2KP2A 1R5AA 1Z3EA 3AY8A 3FKFA 5B6NA 3IC8A 2RUEA 5AIVA 3A3TA 4XRAA 3UAPA 1PL2A 1K0BA 4HZ4A 4YQUA 4KDXA 1ABAA 4BVXB 1BJXA 4PGTA 4EC0A 2REMA 3NOFA 4YAVA 2VIMA 4G9HA 3VI5A 4NHWA 2XBQA 3TKPA 4E8EA 1B9YC 3UEMA 3L78A 4NAXA 2DJ2A 2H70A 3L9SA 4GWRA 4HOJA 1QMVA 4ZL9A 4EXJA 3MSZA 1J08A 2YANA 1TKDB 2HSHA 4PUAA 4K7NA 3CSHA 4ZILA 1ERUA 2HSNB 1GTAA 3WGDA 4IKHA 5ID2A 2WGRA 4POKA 4TR3A 4WKWA 2H1AA 1FW1A 9GSSA 3CSJA 1YQ1A 4IGJA 3GURA 4EUYA 2TIRA 2H6XA 4IJ3A 3F63A 3MWHA 2MZCA 1GLQA 3GKKA 1OKTA 4NWYA 1GTBA 1S3CA 17GSA 2L6DA 5F05A 1NHOA 2JSZA 4K9ZA 3RBTA 3UVHA 5GSTA 3VPQA 5GSSA 4ML1A 1A2MA 5FWGA 1PMTA 2LJRA 3IAS2 4I8BA 1XXUA 2I3YA 2AJQB 2DJ3A 2PU9C 2VCVA 1LU4A 1FB6A 2IMDA 2HYXA 2C8UA 1KTEA 4POLA 3F3QA 2B5XA 3G7JA 5J9BA 1V9WA 2DJ1A 1A8YA 2L4CA 2X64A 3IHQA 2J23A 3DMLA 3RAZA 1GH2A 1BEDA 2F9SA 4FYBA 4AJ6A 5H5RA 5JCUA 4PX1A 1M2AA 4XIHA 4JE1A 1U87A 1AQWA 2LQQA 1GUMA 4E8HA 5ECQB 1XW9A 5BMUA 1K3YA 2LEGA 2C80A 2TRCP 4IVFA 5IMVA 3ZMKA 3LYKA 4GRFA 2OE3A 3KP9A 3KEBA 4KA0A 2YNXA 2VLUA 2C3QA 2K9FA 5G2ZA 2H72A 4CW9A 1Z9HA 1C72A 2H30A 20GSA 1LBKA 1G7OA 2ZUPA 2HRNA 1AIUA 3A2XA 3WT1A 3I69A 4D73A 1M0UA 3LXZA 4Q5QA 2GVPA 2VOCA 3IA1A 3DVWA 2DJ0A 3ZIJA 2HNLA 3TRPA 2MMZA 1XW6A 3ME7A 1TI3A 4OFMA 4PNGA 3K8NA 1WE0A 1J9BA 2FUG2 2IMFA 5A4VA 2WS2A 1SKSB 3GX0A 3ZMLA 2V32A 2VO4A 4IP6A 2GDRA 5G5EA 6GSUA 2X8GA 5ECRB 2D2ZA 4JBBA 4KX4A 1TW9A 4ZB8A 2B3SA 2M80A 4BPYA 4OCFA 4XS4A 1OE7A 3NIVA 4V2MA 4PNFA 4K1FA 3A5WA 3O6TA 2F51A 2GSRA 2NBSA 4NPBA 5IIZA 4MJEA 4HU7A 2JL4A 2WRTA 2O7KA 1A2LA 1JLWA 3RHCA 2CA8A 1PRXA 4O5RA 3HVSA 2G0FA 4G19A 4TKYA 4IHUA 3A2WA 2WULA 4XTSA 1XWCA 2L6CA 1TDIA 2H6YA 1ILOA 3KXOA 1GSYA 4ZB6A 4RQXA 4NV2A 1PX7A 4MH2A 3KIJA 2JZSA 2AV4A 3FZ9A 2MMOA 3KH9A 7GSSA 2LJKA 2DJJA 4V1Ap 2ZCTA 3V1WA 5FHIA 1S3AA 5B7CA 4X0XA 2MYGA 2OJLA 3DD3A 4ZXGA 4BL7B 2V1MA 2YWOA 1WPIA 1K0DA 3DEXA 3G9BA 1GSEA 1K0OA 1GUKA 2HSYA 2P5RA 2C1YA 2B5EA 3C7MA 3CTFA 2DLXA 2K8VA 1U3AA 3HKRA 1FB0A 1B8XA 1WRYA 1MDJA 3IOSA 2IN3A 2FD3A 4AJ7A 2YJHA 2WZ9A 3VI7A 5DALB 2CAIA 4Q5FA 1H4OA 5IO2A 1AAZA 4F0CA 2HFDA 1UC7A 2EIRA 2HRFA 3QDNA 2ZNMA 1YEPA 3WGXA 4G10A 2HSMB 1TRSA 4EVMA 2C0EA 2VL9A 5CP1A 4AGSA 4F9ZA 1V98A 3IV4A 3L4NA 2HRKB 5ECIB 3VWVA 1IYIA 4MZWA 1AUCA 3KD0A 4IP1A 1M7TA 3GL3A 5D96A 5D93A 4BVYB 2QSIA 3N9JA 3W6GA 3EMPA 5EY6A 4TR1B 2IWTA 1UA5A 1JHBA 2N5BA 5DAKB 4DSSA 3KCMA 3QFBC 1EEMA 5D8IA 1A24A 1WOUA 2A2SA 4DVCA 2DMMA 3BBYA 1NSWA 2GSQA 4O32A 1WMJA 3DKSA 3UVTA 2KOKA 2CVDA 3F6DA 1FAAA 2XC2A 2GZYA 4I97A 5D9TA 5HFKA 1SD8A 3F4RA 4F82A 3CRTA 1PKZA 1QK8A 4XCSA 1FO5A 1GNWA 4KSMA 2MMNA 3ZREA 4K0NA 3QPMA 2E2GA 5DQSA 1JLVA 1ZMAA 1AQXA 3PGTA 4GXZA 2LRNA 1B4QA 2C4JA 1G6WA 14GSA 5ECMB 3TUEA 4WF4A 5EL8A 1Z7RA 1X9WB 3EU3A 2NTOA 2K8SA 3C73A 3M9JA 1A0RP 2DMLA 2YCDA 3HJOA 1VF3A 5IQYA 4IN0A 5E59A 3CRUA 2P31A 3HYPA 4BWSA 4HEA2 5CNWA 2FWGA 1PKWA 5G31A 2L5OA 2LNSA 4POBA 4MH3A 1HNBA 1TTZA 4CDOA 5G5FA 2DIYA 2HZEB 2IPAA 3PR8A 1F3BA 4TXOB 1NHYA 2O87A 3M9KA 4ACSA 4ECIA 3H8QA 1GP1A 3E9JB 1SJIA 5ECSA 3CMIA 4LL4B 5JWOB 2LUSA 4OD7A 1GSUA 3LG6A 1FG4A 4KH7A 2DBCA 3ZITA 5G1KA 2GZZA 1DE2A 3BOAA 2H0GA 4FIWA 1EOHA 1TP9A 2LQOA 1ZCPA 2R2JA 5COHA 3LEFA 4OCEA 5J3RA 4GF0A 4ILFA 2B7KA 3APOA 1T3BA 4QL9A 1T8EB 4TN8A 1SK0A 4FH8A 1XOBA 2B1LA 1BG5A 4HS1A 3IC4A 3GTUB 2AHEA 3DYRA 2BMXA 4KDUA 4J57E 2KHPA 3FZ4A 2CZ2A 3LYPA 3GFKA 3P2AA 4ZBBA 2E2MA 2KP1A 4RQRA 4K7IA 1GULA 3EURA 2LNTA 3TRQA 4GSSA 4RI6A 2EIQA 5J41A 5IOXA 2L57A 1KBNA 2HQTA 1X5DA 2L5LA 1Z5YE 2F3MA 5CRWA 1JZWA 4KNDA 5A5KA 1SYRA 2LRTA 4JU5A 4GSTA 2L4QA 1EOGA 2IFQB 4P3YB 3M0FA 2K18A 2E0QA 1X0RA 2BTOT 1EZKA 5FT3A 5DQYA 5AGYA 4ULXA 4ECJA 3KJYA 1O85A 1TRUA 2H75A 2YWIA 2H73A 2VL2C 1T00A 2CVKA 2VL2A 1K3LA 4PUFC 3UJ1A 3GL5A 4J2FA 3P7XA 3VK9A 2G2QA 3NZNA 3H93A 2JSYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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