1TU8A

Structure of onchoverca volvulus pi-class glutathione s-transferase with its kompetitive inhibitor s-hexyl-gsh
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
MSYKLTYFSIRGLAEPIRLFLVDQDIKFIDDRIAKDDFSSIKSQFQFGQLPCLYDGDQQIVQSGAILRHLARKYNLNGENEMETTYIDMFCEGVRDLHVKYTRMIYMAYETEKDPYIKSILPGELAKFEKLLATRGNGRNLILGDKISYADYALFEELDVHQILDPHCLDKFPLLKVFHQRMKDRPKLKEYCEKRDAAKVPVNGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the Major Cytosolic Glutathione S-Transferase from the Parasitic Nematode Onchocerca volvulus
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Onchocerca volvulus
molecule keywords Glutathione S-transferase 2
total genus 79
structure length 208
sequence length 208
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2004-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1tu8A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1tu8A01
4PTSA 1XWGA 2VLUA 1AC1A 4MZWA 4ECIA 3U5RE 3SBCA 3HY2A 1JZDA 1QMVA 1PSQA 1TXXA 1EOHA 5ENUA 3RHCA 5ECLB 3UIWA 4MPFA 5IMZA 5JWQB 4TR1B 1OE7A 2H6ZA 2R5GA 2OE0A 3LSZA 2R6KA 5B7CA 1DE2A 3I69A 3F8UA 5CNWA 5HR0A 1YDKA 2KLXA 4JE1A 2IMIA 3UL3A 4I97A 2YV7A 2H6XA 4XS1A 3UOMA 4V2LA 4J56E 1GLPA 5ELAA 3H79A 2HYXA 1EOGA 4KGIA 2K8SA 2MBTA 5KN2A 3H93A 4KA0A 4IP1A 2HSMB 2GZYA 2DIZA 3ZMKA 1R7HA 2F3MA 2KP1A 3O3TA 2H75A 5AN1A 2MYGA 3MDKA 3L78A 1I5GA 2NVLA 1U6TA 4H86A 3LFLA 5JCWA 1RQMA 4KSOA 4XS4B 2REMA 4FO5A 3Q74A 1QQ2A 2R37A 3KIJA 4MZBA 3LORA 2HZFA 2HNLA 1GWCA 2BJXA 3G7JA 2PVOC 1DE1A 4I2UA 1UC7A 1O8XA 3VURA 3Q18A 3R3EA 1XWAA 4DSQA 2R4VA 4L0UA 7GSSA 4TRXA 1RK4A 2YZHA 1TRWA 3VK9A 5LCZA 3F0IA 1YKCA 4HQZA 3UJ1A 1WE0A 4PQHA 2V2GA 2YWNA 3EC3A 1X5DA 2H1DA 3CSJA 3WT1A 1A8YA 2YPMA 1THXA 2V32A 3UMAA 3L9VA 3TJJA 4JR6A 2CAQA 2VM1A 4K7IA 3GA4A 3IAS2 1YEPA 1R5AA 2WCIA 4FIWA 3KD0A 1Z6NA 4OCFA 1LBKA 1WIKA 1T00A 2DJJA 3QMXA 5CRWA 4GWRA 5A4WA 2VL2A 5DQYA 2J9HA 2V41A 3GSTA 1SK1A 1W89A 1XIYA 3HVXA 1OAZA 1F3BA 4POLA 3D4TA 4MH3A 2I81A 4MCUA 4GXZA 3Q19A 4I6XA 3ME7A 4X1UA 3ZMLA 3IBHA 5ECKB 5HQPA 3D4MA 1V58A 2XBIA 6GSUA 3D6IA 3P90A 1AQXA 1JLVA 5CREA 5JCUA 2I3YA 3CSIA 1PL2A 1OC9A 2CZ3A 4BVYB 5C00A 1DSBA 2DBCA 1TI3A 1K0BA 2DJ2A 4GTUA 3P8WA 1QUWA 2H6YA 1K0AA 1U87A 3N5OA 4MF7A 5JWOB 1SKRB 3GH9A 5L71A 2YOIA 1PL1A 3M8NA 1EP7A 2K18A 2OADA 1PMTA 2CV4A 1U88A 2H66A 3F63A 3TCOA 3IK9A 3QDNA 1TI1A 2PMTA 2HRNA 3EE2A 4DVCA 3A2XA 3GX8A 5AGYA 2HZEB 2FGXA 2DJ3A 3VI5A 3QPMA 4DSSA 1M9AA 1TOFA 1PX6A 2QGVA 3S9FA 1B9YC 2CX3A 6GSSA 1TU8A 3TJKA 2KOKA 3RDWA 2YJ7A 12GSA 4G19A 2H71A 3LG6A 3MAKA 2WJUA 4ZL8A 3UARA 5CO3A 3C71A 5HR3A 3L9UA 1PKWA 1R4WA 2H76A 4USSA 2C1YA 1K0MA 1O8WA 1TDIA 1SL1B 5EL8A 4EKZA 2NPBA 5H5RA 2J23A 4PXOA 4JRRA 2XC2A 1LJRA 4ILFA 1A0RP 3I9V2 1ERTA 1VRSD 3KCMA 3C7MA 3EMXA 3ZRDA 2L57A 5KN1A 5JCGA 4X43A 3ZL5A 3APOA 3LQ7A 5A4UA 3VPQA 1QK8A 2H30A 4G0KA 4F0CA 3DMLA 4IVFA 3FZ4A 2BTOT 2JADA 2H19A 5B6NA 4XS6A 4N30A 2HQTA 3C1SA 5INYA 1V2AA 4YQMA 4TXVA 2WB9A 2L6CA 2C0EA 3IHQA 3GYKA 1MD3A 1X9MB 3HZ4A 2PN8A 1FVJA 3I6AA 1A24A 1EGRA 5GAND 4KSMA 2PPTA 2PGTA 4ZBAA 2WFCA 2VIMA 4K8MA 1TK5B 3ERWA 5D9XA 1ZYEA 4IQ1A 2X8CA 2LKUA 1EEMA 4HUAA 4AJ7A 1XW6A 20GSA 3CTFA 4E8HA 4IGJA 2PERA 1KEBA 5IPHA 3W8SA 3EU4A 4MJEA 1WMJA 2NDOA 3BOAA 2MMNA 5DJLA 1T4YA 2Z9SA 3EWLA 4HZ2A 4HU9A 1ZL9A 1S3CA 22GSA 3DRNA 3GH6A 1SD8A 1YY7A 2EIRA 5GSTA 3ZREA 1OKTA 2CA8A 2M80A 2CZ2A 3IAM2 3FK8A 3GL5A 2TRXA 3VWUA 4BWSA 4HS1A 4FQUA 5ID2B 5C04A 4KNDA 2GLRA 4ULXA 5DAKA 2KP2A 5IMDA 1EV4A 3FZAA 4AF2A 10GSA 1HNBA 3FRCA 3UEMA 1GSQA 1TRUA 4KDXA 2CVKA 4CHSA 2HI7A 1MDIA 1SKWB 1AQWA 1GSDA 4IJ3A 2FWFA 4MF6A 2O85A 5G1KA 4RI7A 2IL3A 1T8EB 2VL2C 3A5WA 4KDUA 5B6MA 5CP1A 2BMXA 1XCCA 2VO4A 5CRGA 2GT5A 3D21A 5IO0A 1ON4A 3HJOA 1X0RA 1SJZA 2V6KA 1F6MC 3IOSA 2VCVA 3V1WA 5IMCA 3ZYWA 4NV5A 1FO5A 4OFMA 2IMDA 4KE3A 2PU9C 2B7JA 1XBSA 1EEJA 1GTBA 1ERVA 2K6VA 3F6FA 4WEYA 4L0WA 4JU5A 4I2TA 2YN1A 4K9ZA 2AV4A 4JZQA 2YWMA 3GN3A 3TRXA 2AB6A 1K3OA 2LRTA 1HYUA 1KNGA 3M1GA 1M0UA 2HE3A 1ZYQB 2LNSA 1TP9A 4AGSA 1PGTA 2DIYA 3TB2A 4ZIJA 1IYIA 4ZB9A 2GTUA 5D8IA 1OC9B 2RLIA 2C0FA 4BWQA 4EL1A 4Q5NA 5IOWA 3WD6A 5IQYA 2FHEA 4ECJA 3PH9A 3F4RA 1DBYA 1J0FA 3P2AA 4G0LA 1ACVA 2DLXA 2B6MA 3KTLA 3GKMA 3U6VA 3JCML 5B8BA 2IFQA 3E0UA 2HSNB 5A4VA 2V6OA 4D73B 1GTUA 6GSWA 3TGZA 4OMVA 5F06A 4OWYA 5D9VA 3KEBA 3WGEA 1HD2A 2OBIA 4ECBA 3MWHA 2NBSA 5J41A 3IRAA 1YF0A 1SKSB 2QSIA 1B48A 1NM3A 5EVOA 2XHFA 3TKPA 3GFKA 4LLRA 3GMFA 5F05A 3LJRA 3CBUA 2VUPA 4ZB6A 4GLTA 2H01A 4GRFA 1J9BA 3HKRA 1KBNA 4MJCA 2OKAA 2FA4A 3FKFA 2GGTA 1SL0B 4KCAA 1U3AA 2A4VA 3CXGA 1GSYA 3IXRA 4OFTA 5ECSA 3TDGA 4EC0A 5D73A 4EUYA 2O87A 3BCIA 3GKNA 3W8JA 4Q5QA 5ECMB 1XW5A 3FW2A 1MDJA 2GQLA 2RUFA 3HXSA 3TKQA 2RIIA 1BJXA 4EVMA 3IR4A 3EYTA 4ECCA 2JZSA 3RPPA 4IJIA 4NHZA 2KHPA 1BAYA 3UAPA 4RQXA 2WS2A 3ZLPA 1AXDA 3CMIA 2ON7A 4ZBDA 3IC8A 2AHEA 3GL3A 1SL2B 2CAIA 2DMMA 4BL7A 3EVIA 4TXOA 1EWXA 3APQA 5DCHA 4ZILA 3VWVA 1S3AA 3RBTA 2L6DA 2ALBA 4CW9A 18GSA 3HHVA 1FG4A 1WP0A 1TKDB 2JL4A 5FWGA 5J5NA 2YCDA 5H5SA 1AAZA 3D22A 2PUKC 3M3MA 4IKHA 1T1VA 1QXHA 2LS5A 2EC4A 3EU3A 4HJMA 1Y6EA 1XVWA 2CQ9A 2H8LA 4Q5RA 3FZ9A 4KUNA 1K0CA 4TN8A 2B5XA 1O85A 1O73A 5ECIB 5DALA 4WXTA 2O7KA 5J9CA 2MZCA 4MLYA 3R2QA 4YAVA 3C1RA 5EPFA 1EZKA 1V57A 4L5OA 2C4JA 3D0ZA 2JACA 4HQSA 2IN3A 2LQOA 3DIEA 4ML6A 4TOPA 4X0XA 4POKA 4XRDA 1F37A 1CQGA 2VOCA 2D2ZA 2HRFA 4WR4A 2IWTA 1JHBA 2M72A 4RI6A 5GSSA 2B1LA 2FY6A 1GSEA 2E2MA 4OCEA 3GTUB 2YANA 4KB3A 2FLSA 3EINA 3P7XA 1OYJA 4IS0A 3IC4A 3QR6A 3ZVJA 2IMFA 1K3YA 3O76A 1JFUA 4GCIA 1HNCA 3I43A 2IMKA 2ES7A 1JZWA 2A2SA 2VLVA 2VCZA 1Q4JA 4TR1A 3L9SA 4POMA 1WJKA 4YQVA 3GUSA 2GSSA 4K7OA 5KN0A 2HSYA 3FYGA 4QQ7A 4WR5A 4MH2A 4HDEA 1O7UA 4MZCA 1X9SB 4J2FA 5DCGA 3KZQA 2OE3A 1VF3A 5G31A 1TK8B 3WGDA 4XTSA 2VLTA 4YAPA 3LYKA 4PQ1A 3M9KA 1AQVA 3SWLA 1VF4A 1Z7RA 1VF2A 2HSMA 1OVNA 2MMZA 4LA1A 3ED3A 3LGCA 3DGQA 4FH8A 1B8XA 2F9SA 3QAGA 1PX7A 4AJ8A 4BA7A 5IOXA 3DWVA 3O6TA 2B5YA 1G7OA 2YP6A 4XS4A 3PPUA 5D96A 1U3IA 1W4VA 3C73A 5J9BA 3KJYA 5G1LA 3IE3A 1TRVA 1H75A 1BQ7A 4MJBA 1HQOA 2IMEA 5ELGA 2H0HA 3BD2A 3G7IA 5IMFA 4J57E 3GV1A 4GSTA 4ZB8A 1TRSA 5DQSA 4OFNA 5HR2A 4I8BA 4PURA 1YZXA 3TRQA 5ECOB 3KH9A 2IFQB 4AJ6A 2VL9A 1GTAA 2OJLA 5COHA 5F0GA 4O92A 3CTGA 1K0NA 3UVHA 2C0GA 1K0DA 3E9JB 2TRCP 3K8NA 2H1GA 3H1NA 1R5PA 2QKEA 4OO4A 2B3SA 4K7NA 1BG5A 1R26A 5E4WA 3GNJA 4EDZA 1YJ6A 4BPYA 2ZUPA 1FOVA 1JZOA 4N11A 1HNAA 5D9WA 1G7EA 4PX1A 3F4SA 2OA7A 4P3YB 1X5CA 3DKSA 3ISOA 2WDUA 3TKSA 2XBQA 1YF1A 3ZTLA 4FYCA 1G6WA 2FUG2 2LEGA 4WBRD 3IV4A 1ST9A 2GT6A 3TJFA 2C3QA 4PUFC 3US3A 1XZOA 3AY8A 3C8EA 2K8VA 4EF0A 3LEFA 1GSFA 2RUEA 2B7KA 3FR6A 2PWJA 5AIXA 14GSA 2FWHA 4LL1B 4K1FA 2LSTA 3GRXA 1FB6A 4XRAA 3TJGA 3VI7A 4FYBA 2JZRA 2GVPA 2O8VB 3F3QA 4XHMA 1ERUA 5H5QA 1MD4A 3M9JA 1WWJA 2VAFA 1AUCA 1E6BA 2HRKA 5DDLA 2FCHA 1XWKA 2G2QA 3FZ5A 4F2IA 2LTKA 1WOUA 3MNGA 4E8EA 1O81A 3ME8A 4JR4A 1SU9A 2JU5A 1EP8A 5EY6A 1OE8A 1TTZA 3ZIVA 1Y25A 2O89A 3KH7A 1XXUA 3M0FA 4MDCA 1GRXA 1ZGNA 2LRNA 1SYXA 2MMOA 1LU4A 1THOA 1MEKA 1ZMAA 4BVYA 2GDRA 3KP9A 4IP6A 1XOBA 2FA8A 4MA9A 1WRYA 1T7PB 5LD0A 1N8JA 3GIXA 4NPBA 2HRAA 3RHBA 4WF5A 4GSSA 3J7Yb 1F3AA 1Z6MA 1GUKA 2R3XA 2LRCA 2A2RA 5FHIA 4OO5A 3QOUA 2H0IA 4DSRA 1OC3A 1V98A 4EXJA 4IN0A 5DALB 1FB0A 4RQRA 4PUAA 4RUVA 4YH2A 2FWGA 4Q5FA 1QFNA 3N9JA 1PA3A 1OC8A 4WF4A 2QC7A 4IBPA 3VWWA 5D9TA 3EURA 2X8HA 2GSTA 1JLWA 1CQHA 4HZ4A 3DVXA 3GURA 1E2YA 1PRXA 1SJIA 2K9FA 4NHWA 1I9DA 1SENA 2B5EA 2VD0A 4XIHA 2VCWA 1C72A 1TK0B 1XWBA 2VCQA 3CYNA 5G30A 4TR0A 3QFBC 4MABA 3FR9A 2L4QA 4MK3A 2C3TA 4O7HA 3DXBA 2L4CA 4NV2A 2V1MA 1QGVA 2N5BA 2ON5A 2X99A 4JEDA 5AIVA 5HFKA 2X64A 1MDKA 2NTOA 4TR4A 2GS3A 1UN2A 2XPEA 3H8QA 2H1BA 1SK2A 3NOFA 2F8AA 2CVDA 1Z9HA 4KF9A 3ZFLA 3ZFBA 3GHAA 3D5JA 4CDOA 3IK7A 4JBBA 5JWRB 4TVEA 2GZPA 4HEA2 3HVVA 4TKYA 4BVXA 1GSSA 2L5LA 4LMWA 1XVQA 3QD9A 4F03A 5G5EA 1YEXA 1GNWA 4DSSB 1GTIA 1FHEA 4WBJA 3TOUA 1S3DA 5BMUA 2C3NA 4TR3A 3Q6OA 1JZRA 4WKWA 1ZOFA 1F9MA 1BYEA 2F8FA 2YWOA 3QAVA 3QCPA 11GSA 5E59A 3WGXA 1ML6A 3QAWA 5HFIA 3W6GA 3A2WA 2C8UA 5DBQA 3L4NA 4HI7A 3QFAC 2YJHA 4G2EA 2G0FA 1V9WA 2IPAA 1SD9A 2H1AA 2E7PA 19GSA 4K6XA 3GKXA 4KX4A 1FW1A 2IIYA 3ZZXA 4MP4A 3MSZA 2VCXA 5LNKe 2P5QA 4KW6A 5G5FA 1PN9A 2GQKA 1YQ1A 1B9XC 2ZCTA 2LNTA 1FVKA 13GSA 3HA9A 5HR1A 1A0FA 4ID0A 1TW9A 4IW9A 4L8EA 3PR8A 3DD3A 1SJ6A 3G9BA 3TRPA 1SYRA 4N10A 5ID2A 4NWYA 2DMLA 5F8BA 4ACSA 5IPGA 4V2NA 5FT3A 3TKSC 2DSAA 3EMPA 1XW9A 3VLNA 4V1Ap 1VF1A 4ISDA 2AAWA 4PNGA 3LXZA 5D93A 3ZIJA 1M2AA 1TJDA 4KDYA 1VGLA 1BEDA 4MMMA 1A23A 4IQAA 5DJMA 2P5RA 2DC5A 4G9HA 4ZXGA 3LXTA 4F9ZA 1MTCA 3KM6A 1FAAA 2OE1A 2IJYA 2FWEA 5ABRA 2LJAA 8GSSA 4MF5A 4K0NA 3F3RA 3DVWA 3ZITA 3KTBA 3FHKA 3HYPA 1X5EA 3GX0A 2YV9A 2HRKB 2AUVA 3KXOA 3GSSA 2HLSA 5IIZA 1NHYA 1Z7PA 2ZNMA 3WT2A 3VWXA 5IMAA 1GP1A 2X8GA 2L5OA 2P0GA 5DAKB 1NHOA 1GH2A 5J3RA 1TU7A 3ERGA 1XPVA 3WYWA 2TIRA 4EE0A 3KP8A 5F07A 17GSA 2MMAA 3TJBA 2I1UA 2R2JA 3PINA 4FYUA 1O6JA 4MJAA 4N0ZA 1ABAA 1M2BA 4LL4B 2VCTA 4POBA 4PGTA 4L5LA 3NIVA 2LQQA 1SK0A 1EGOA 1XOAA 4YQUA 1F2EA 5KEJA 1AIUA 2RM5A 3NZNA 1AW9A 2H70A 1H4OA 4MPGA 4GQFA 3E3EA 1EV9A 2JSZA 5IM9A 4NXIA 1ZCPA 1A2MA 2N5FA 4NAXA 3BJ5A 4D73A 4EDYA 2B1KA 2YWIA 1GUMA 1M2DA 1YKAA 6GSXA 1Z3EA 2AYTA 3TKSE 2PBJA 5CRDA 1B4QA 2DJ1A 5J4UA 1DUGA 3IPZA 2XPDA 5G2ZA 2WZ9A 4O5RA 5GZZB 1X9WB 5ECPB 6GSTA 3F6DA 3FEUA 4V2MA 2E2GA 2GSRA 3FR3A 5A5KA 1OKDA 2FNOA 1ZZYA 4QL9A 4EO3A 5HFGA 3UBKA 3OR5A 1Q98A 1ERWA 4F0BA 4QL7A 1IYHA 3H4KA 1URMA 2WULA 4V1Ag 3UBLA 2JSYA 3TOTA 2H0GA 2MBSA 6GSYA 5ECHB 2GZZA 1GL8A 2LJKA 6GSVA 3HCZA 1A8LA 2M46A 2N5AA 2PVQA 4NMUA 1V40A 5ECNB 16GSA 1RW1A 3GKKA 3LWAA 3KMOA 2JZTA 1G6YA 4GF0A 2F51A 3HJPA 4XCSA 1XFLA 1M9BA 1UVZA 3F9UA 1T3BA 1GULA 3APSA 4OD7A 4KCEA 5B8AA 4BVXB 4K0GA 2H72A 2CT6A 4ZL7A 4PQIA 3FY7A 5CAXA 3RPNA 1WPIA 2CX4A 2CVBA 2HT9A 2LV3A 2YNXA 3ZVJD 3KGKA 5CRHA 4WETA 1GLQA 3J7Yk 2FD3A 3HZ8A 3TUEA 2AJQB 5GAPD 3L0HA 3HDCA 1ILOA 4K2DA 9GSSA 2DJ0A 4Z7XA 2UZ8A 1M7TA 2VD1A 1PQNA 3CRTA 3IDVA 2L59A 2P31A 5IO2A 3TKRA 1T4ZA 2VL3A 4I5QA 3VPTA 1XWCA 4KH7A 1GUHA 2C0DA 3IA1A 3HJMA 1BX9A 2OBKA 4G0IA 1M99A 4HU7A 3VFIA 1K3LA 2I9HA 4PNFA 3UVTA 1UA5A 2I4AA 2H73A 3DEXA 1J08A 4GQCA 1A2JA 2WGRA 4BL7B 5IMVA 3CSHA 5CYYA 4TXOB 2VM2A 1PKZA 3GTUA 5ECQB 2HXKA 3HVSA 3RAZA 1Z5YE 4DEJA 4O32A 1GNEA 3BCKA 2DJKA 5AISA 5KN3A 4IHUA 1NSWA 1KTEA 4LMVA 4ZBBA 2EIQA 1G0TA 3CRUA 2H74A 4HJ2A 4HOJA 4F82A 2HSHA 1PD21 2HFDA 3LYPA 4G10A 5ECRB 2LUSA 4IELA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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