1Z9HA

Microsomal prostaglandin e synthase type-2
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
LQLTLYQYKTCPFCSKVRAFLDFHALPYQVVEVNPVLRAEIKFSSYRKVPILVAQEGESSQQLNDSSVIISALKTYLVSGQPLEEIITYYPAMKAVNDQGKEVTEFGNKYWLMLNEKEAQQVYSGKEARTEEMKWRQWADDWLVHLISPNVYRTPTEALASFDYIVREGKFGAVEGAVAKYMGAAAMYLISKRLKSRHRLQDNVREDLYEAADKWVAAVGKDRPFMGGQKPNLADLAVYGVLRVMEGLDAFDDLMQHTHIQPWYLRVERAITEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure and Possible Catalytic Mechanism of Microsomal Prostaglandin E Synthase Type 2 (mPGES-2).
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Macaca fascicularis
molecule keywords membrane-associated prostaglandin E synthase-2
total genus 95
structure length 274
sequence length 274
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.99.3: Prostaglandin-E synthase.
pdb deposition date 2005-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1z9hA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1z9hA01
4KW6A 1PX6A 1U88A 5AISA 1IYHA 3EU3A 2L59A 2C0FA 5HR2A 4ECCA 2VLVA 2AUVA 5JCWA 2L6DA 4HQZA 4TXOA 1XWKA 5BMUA 1FB6A 2P5RA 2GQLA 3UBKA 6GSYA 1E6BA 2PU9C 2AB6A 2R4VA 2YPMA 3FR9A 1S3CA 3APQA 5AGYA 2YN1A 3PGTA 1G7OA 2IMDA 4TXVA 2F9SA 3UL3A 2E7PA 3RDWA 4OD7A 1XOAA 1A2JA 2P0GA 2KHPA 2FA8A 2VD0A 4LL1B 4EKZA 1K0BA 4YAPA 1OKDA 4KCAA 1XWCA 5ECRB 1V9WA 1WJKA 2HZEB 4GSTA 4LL4B 2H0GA 1EEMA 3QFAC 3TJFA 3DEXA 1RQMA 3FR6A 3S9FA 3P8WA 1GUKA 4MF5A 4J2FA 1NHYA 2IL3A 1WWJA 4K2DA 5LNKe 2L4QA 2K18A 3ZIVA 1XXUA 4K8MA 2I9HA 3CSJA 3F9UA 1HNCA 4DSRA 5B7CA 4JEDA 3P2AA 1XW5A 4PQIA 3VPQA 4OWYA 3QDNA 4BVYB 1YDKA 4NV2A 3J7Yk 4OMVA 1QQ2A 2LSTA 2GS3A 3U6VA 3F3QA 2DJJA 5DCHA 3TUEA 4NV5A 4OCEA 5HR1A 3W8JA 2MMNA 2FWGA 2B7KA 8GSSA 1TRVA 3GL5A 1FHEA 4G9HA 3KEBA 1CQHA 3EYTA 4GQCA 1U6TA 2H75A 4PUFC 2X64A 1F2EA 2C3QA 1K0CA 4MMMA 3F4SA 3U5RE 3TKQA 5A5KA 4POKA 3EU4A 1USBA 4HQSA 3D21A 1KTEA 1PRXA 4O32A 4E8HA 4Q5RA 3O76A 4EXJA 4MJBA 4WKWA 4BL7A 1SL0B 2K9FA 4J56E 3MSZA 3ME7A 4K0GA 3DKSA 4NHZA 2MBTA 1O81A 4V1Ap 4GXZA 1XCCA 2MMOA 2GSRA 3P90A 3GSTA 5F0GA 1XWAA 2FWEA 1TK5B 1B4QA 2WGRA 2DIZA 5ECIB 2M72A 3DMLA 1MD3A 4IQAA 3ZFLA 3F63A 5EVOA 2H1DA 4KDXA 3I9V2 1K3LA 2I3YA 3H93A 3KP9A 3ZL5A 3H8QA 1JFUA 2B1LA 3HCZA 3W6GA 2O8VB 4K1FA 4I8BA 4MZBA 5F07A 4XS6A 1OE7A 5IMAA 1GL8A 4PUAA 5D96A 1ILOA 1T1VA 5FT3A 1A2MA 4TOPA 4PX1A 1FVKA 2LS5A 2F3MA 2HYXA 3KTBA 3A5WA 4JZQA 4EF0A 2FLSA 3UMAA 3HVVA 2HSYA 1SL1B 4N30A 4K6XA 5HQPA 3ZZXA 3QAGA 4FO5A 3HYPA 4MPFA 5ID2B 4KH7A 3VWUA 1URMA 2IJYA 1SJZA 4I6XA 2RM5A 3QPMA 1X9WB 4CDOA 1GTAA 4MA9A 3CMIA 2H1BA 2CT6A 4KDUA 3GIXA 2JACA 4YQVA 1OVNA 1MEKA 3VWXA 4XCSA 2FUG2 2RUFA 2JADA 1BJXA 4WEYA 5IPGA 1PKZA 3TCOA 1Z7PA 6GSSA 5G5EA 4CW9A 2UZ8A 3VWWA 4XS4B 1ACVA 1EV9A 3VPTA 2KUCA 5DJLA 1WRYA 2YCDA 3TKSC 4NXIA 4KE3A 1GH2A 4FYBA 4ISDA 1SJIA 4QL7A 2HRAA 1DE1A 4MZWA 4GSSA 5KN1A 2G2QA 4DEJA 2YWOA 4RI7A 1XPVA 2VL2C 4MJEA 3TJGA 5IO2A 4ECIA 3HKRA 3GX0A 2EIQA 1V40A 6GSWA 4EO3A 1IYIA 4BVYA 3IA1A 3EE2A 3KM6A 3CYNA 2H6XA 4BWSA 2HXKA 2LNTA 3KZQA 4TR3A 4KGIA 4GCIA 2WB9A 2H73A 1DBYA 1V58A 1GLQA 2JZTA 5ELAA 3C1SA 3FW2A 3HD5A 3MNGA 4ML6A 3CTFA 3FZ5A 4BVXB 4RI6A 4D73B 5B6NA 2GSTA 1XVWA 5B6MA 3GKXA 1EZKA 4GTUA 3O6TA 3WGXA 3QMXA 2M80A 2DC5A 1GRXA 2WRTA 2NDOA 1XWBA 1T4YA 4FYCA 1ABAA 3VK9A 4OO4A 2AJQB 1YEXA 1BYEA 1E2YA 3EMPA 4K7NA 4XTSA 2N5BA 4XIHA 3ZMKA 3C7MA 2ES7A 3L4NA 3TRXA 1HD2A 2DJ2A 1B48A 4ML1A 1DE2A 4MF6A 2IFQB 1EGRA 2H76A 2G0FA 2OADA 2OE3A 3V1WA 3QR6A 4KDYA 3CTGA 11GSA 3DVXA 1HYUA 3ZLPA 1N8JA 4NAXA 2XPDA 4MJCA 2HRKB 1OC8A 2OE1A 4V2MA 4ECJA 2B6MA 2GZZA 3PR8A 2DMMA 2OKAA 3LEFA 1TOFA 1SL2B 3CBUA 4O7HA 5KEJA 2VD1A 2PVOC 3GFKA 1M99A 3TKSA 5CRHA 2L57A 2KLXA 3G7YA 4V1Ag 2CVDA 1X5DA 3G7JA 2LTKA 4JR4A 5GSTA 4WF5A 2LJAA 3WT2A 4GSNA 1V2AA 3TJBA 2C80A 5ID2A 2A4VA 2VL2A 1THXA 2CV4A 1O7UA 1K0DA 3WYWA 1FVJA 3GTUB 4MJAA 2V41A 4N10A 1TKDB 1FB0A 2H8LA 3G9BA 2DJKA 2VCTA 3WGDA 5A4UA 1EWXA 1M2AA 3C73A 4KSMA 1SD8A 2R3XA 2DJ1A 4DSSB 4MZCA 1TTZA 3N9JA 2PUKC 1RK4A 2VOCA 3GH6A 2C0EA 2JSYA 4EDYA 1Z6NA 4MABA 2NPBA 1AQXA 1OC3A 5J9BA 1DUGA 1J0FA 3KP8A 3TDGA 1OC9B 1VF2A 2IMKA 4NMUA 1H75A 3KMNA 4ZILA 5CO3A 1ERTA 2C0GA 3ZRDA 1XWGA 4F0CA 3EMXA 3KH9A 4LMVA 2MZCA 3EINA 1UC7A 1XW6A 1PA3A 4G19A 2FA4A 2RIIA 2PGTA 2CVKA 2MBSA 3QAVA 3M1GA 3GN3A 1KNGA 1YY7A 2IPAA 4MCUA 3DXBA 1C72A 1A23A 3UBLA 2I81A 5DALB 1SK2A 2H1GA 3L9SA 1PKWA 3UARA 1SU9A 1JZOA 2I1UA 4IELA 3DGQA 4PTSA 3F4TA 4HEA2 1QXHA 5AN1A 2RM6A 1TRSA 5ECMB 2B5EA 5EL8A 1N2AA 3RPPA 1AAZA 5KN0A 4I2UA 1ERUA 4IN0A 5J4UA 3ZIJA 2MMZA 2GZPA 1GULA 1T8EB 5C04A 5DDLA 2X8HA 3UVHA 2H70A 4WBJA 4GLTA 4JU5A 2CAQA 4D73A 1K0OA 4ZBDA 5D9XA 2FY6A 20GSA 3HJMA 3RAZA 2C3NA 1BAYA 3IPZA 3GH9A 3EC3A 5DBQA 1QUWA 5F06A 2FNOA 3TKRA 2JL4A 5HFKA 1Y25A 1EGOA 2CZ3A 2H19A 4ULXA 4FQUA 4IVFA 2CX4A 1BG5A 2PVQA 3E0UA 3US3A 3C8EA 3DWVA 3VWVA 1XOBA 1OAZA 4DVCA 1M2BA 2LRNA 1A2LA 5HFIA 2IIYA 4EDZA 2H1AA 4ZB9A 2MYGA 5JCUA 3IR4A 2IFQA 2HE3A 1FOVA 3KJYA 2CAIA 2FHEA 1YEPA 5ECKB 2E2MA 3DYRA 2C3TA 2FCHA 17GSA 3HVSA 3UEMA 1GNWA 14GSA 1SKSB 1AW9A 2HRKA 3UVTA 2AV4A 2V32A 2KP2A 3FRCA 1VF1A 2DMLA 2LJRA 2YANA 1K3OA 3BCKA 4FYUA 1XIYA 4GQFA 5F05A 3TOUA 1MDKA 2L5LA 3RPNA 5DQSA 1VGLA 2C8UA 4TN8A 3LG6A 5LD0A 4ZXGA 4HZ2A 2JZRA 2YWMA 5IMVA 2K6VA 3UAPA 4OFNA 1TP9A 3F6FA 2LKUA 2B3SA 2GSSA 1UVZA 3WT1A 3BBYA 3BCIA 1Y6EA 3WD6A 5INYA 3TKPA 1FAAA 3GTUA 4PGTA 2O89A 3TGZA 3C71A 4HOJA 2P31A 5E4WA 5COHA 4DSSA 4F9ZA 2B5XA 1G0TA 2X8CA 1QFNA 2R5GA 3DD3A 1NHOA 4F03A 5DQYA 4GF0A 1A8LA 1WPIA 3IBHA 1TI1A 2ZCTA 4PQHA 5IMZA 1TJDA 3CSIA 3GUSA 22GSA 1OC9A 4POLA 1GSFA 1TU8A 2VM1A 4ZBBA 2PPTA 2VL3A 3FY7A 1PSQA 1OYJA 2PN8A 1LBKA 1F6MC 5IMDA 4PQ1A 2H01A 2YJHA 4IQ1A 3LQ7A 1LU4A 1K3YA 2HZEA 1B9YC 1KEBA 3MDKA 4Q5NA 2WCIA 2CVBA 3D6IA 4N11A 4I5QA 2LNSA 3KGKA 1GTIA 4WXTA 3NIVA 3PH9A 4HI7A 3QCPA 2N5AA 3LWAA 2XPEA 2DSAA 5ECSA 4KSOA 2OBIA 1XFLA 2OBKA 4IS0A 1PQNA 2N5FA 2TIRA 1JHBA 5ECNB 3EVIA 2XBIA 5ECPB 2YWIA 2VL9A 5CRGA 5DJMA 4RUVA 5HR3A 3GMFA 5IMFA 4TR1B 3KTLA 3M9JA 2H72A 3IAM2 1TI3A 1M0UA 3Q6OA 1A8YA 1PD21 3VI5A 2GVPA 1FG4A 2IMEA 2ON5A 2V1MA 2R2JA 2QSIA 2VIMA 1B8XA 3PINA 5GZZB 4HU9A 5A4WA 2GQMA 4F2IA 3FK8A 2LUSA 2WFCA 2VO4A 1DSBA 2KP1A 4O92A 4L0WA 2WJUA 5IO0A 4IJIA 3FZ9A 2VCVA 4EUYA 3H1NA 3A2VA 19GSA 3R3EA 3ERGA 1R5AA 3DIEA 3IK9A 5ECLB 2CQ9A 5C00A 4POMA 3D4MA 2DIYA 5ECQB 3LXTA 1GTBA 1HNAA 1ZCPA 3I43A 1YF1A 4P3YB 1TXXA 1H4OA 2IMFA 2QGVA 2YZUA 4YAVA 1TU7A 5IIZA 4ILFA 3GKMA 1UN2A 3L9UA 6GSVA 1GSYA 1JZWA 5KN3A 4X1UA 4QQ7A 3VFIA 1EOGA 4AF2A 1O8XA 3IC8A 2JSZA 3M9KA 5ENUA 4EL1A 2YOIA 4DSQA 2QC7A 3IE3A 5JCGA 5J9CA 1Z6MA 1I5GA 2ZNMA 1KBNA 2XC2A 3ME8A 1FW1A 3QAWA 4ZB8A 4WETA 4IP1A 4G0IA 1AC1A 3CXGA 3LYPA 2DLXA 1EP8A 2GT6A 2VUPA 3VI7A 1YF0A 4HUAA 3GX8A 2VCXA 4IP6A 1YZXA 1ZYQB 2X99A 3IDVA 4LA1A 4POBA 3HXSA 4MDCA 4USSA 3Q74A 5CRWA 4KB3A 2VLUA 1PL2A 3LORA 2O85A 3F8UA 4K7OA 3RHBA 4K0NA 1AUCA 4N0ZA 5G31A 2F8FA 4OO5A 1JZDA 3M0FA 5HFGA 3LFLA 2L6CA 4JE1A 4F82A 1BQ7A 3OR5A 2RUEA 3KIJA 1M7TA 4Q5QA 2C1YA 6GSXA 3BD2A 4FH8A 4OFTA 3UOMA 6GSUA 5F8BA 1GNEA 4YQMA 2YV9A 2YP6A 1NW2A 3HJPA 4XRAA 3M3MA 1EV4A 4O5RA 2WULA 2O7KA 4ZL9A 4MH3A 1PN9A 4X43A 5IMCA 4TVEA 4EC0A 1X9MB 2ZUPA 1ERVA 3LGCA 2LQQA 1G6YA 4HJ2A 4CHSA 2KOKA 3IRAA 4IKHA 4AJ8A 1G7EA 1GSEA 4F0BA 3FKFA 4TR4A 3ZTLA 2TRCP 3IHQA 3RHCA 2H0IA 2E0QA 4G10A 3M8NA 5GAND 3UJ1A 4I2TA 4JRRA 3ZFBA 2OA7A 3KMOA 1O6JA 1M9BA 4HS1A 4XS4A 1A24A 9GSSA 1Z9HA 5GAPD 4BPYA 1TDIA 5IPHA 5GSSA 1YJ6A 3SBCA 4L5LA 3A3TA 2GTUA 1SYXA 3ERFA 3GURA 2CZ2A 5IQYA 4KNDA 5D8IA 5FWGA 3D22A 2YV7A 2H66A 1M2DA 3DVWA 12GSA 2LJKA 1XW9A 4L0UA 2GDRA 2HSMB 2YWNA 2FGXA 3MAKA 4NPBA 1S3AA 2HRNA 3IV4A 1HQOA 4LMWA 3HZ8A 3DRNA 4TW5A 5B8BA 3IAS2 4IBPA 1AIUA 3MWHA 3KD0A 5CRDA 2C4JA 4TR1A 3NOFA 3APSA 5DAKB 1ZZYA 1I9DA 2VCWA 2H74A 4WR5A 5D9VA 1U3AA 2BJXA 2IN3A 1PX7A 1TRWA 3GHAA 3H79A 2CX3A 1Q4JA 3RBTA 1BX9A 2HQTA 2HSHA 4MF7A 2LEGA 2FD3A 2IWTA 3F6DA 4YH2A 3IC4A 4BVXA 2TRXA 13GSA 3CSHA 1QK8A 3TRQA 1XBSA 5CYYA 1GSUA 2HSNB 3HZ4A 5CAXA 3KH7A 1A0FA 4EE0A 2GLRA 2K8SA 2LRCA 2HFDA 1J9BA 5D73A 3FEUA 1EEJA 2DJ3A 4OCFA 1T7PB 1V98A 1NSWA 5H5QA 5J41A 1ZL9A 1ZOFA 4G0KA 4G2EA 1GWCA 4IW9A 4KX4A 2YZHA 2BTOT 3Q18A 1ST9A 2B7JA 3L9VA 2PWJA 4XS1A 4KA0A 3EWLA 2AHEA 1THOA 2D2ZA 1S3DA 1SENA 3GV1A 3ZVJA 1O73A 1YKAA 1SD9A 2GT5A 1Z7RA 5AIVA 2OE0A 4KCEA 4AJ6A 4GWRA 2LRTA 1ERWA 4ZL8A 1SK0A 2B1KA 1T4ZA 2DBCA 1VF4A 4ZB6A 1Q98A 1SJ6A 3HDCA 4OFMA 4FIWA 3HA9A 4AJ7A 1ZGNA 4N0VA 3GKKA 5ECHB 2L5OA 2GGTA 2V2GA 4IGJA 2VM2A 3TKSE 1T00A 3GKNA 5CNWA 4IHUA 2H71A 1JZRA 2X8GA 4Z7XA 5ECOB 2E2GA 3JCML 1ZYEA 4PNFA 4K9ZA 3CRUA 3TRPA 1MTCA 1NM3A 3D0ZA 5HR0A 2FWFA 4WF4A 2VAFA 3WGEA 2VCQA 3ZYWA 4MPGA 2GQKA 1WP0A 3SWLA 2GSQA 4HZ4A 4YQUA 1FO5A 3D4TA 3F0IA 2V6KA 5ABRA 3AY8A 4L8EA 2M46A 3BOAA 3FZ4A 1PGTA 2OACA 4KAEA 4HU7A 2WS2A 1QGVA 4QL9A 1YKCA 1RW1A 3QOUA 1GSQA 1W89A 4MK3A 4G0LA 1Z5YE 5FHIA 1EOHA 4WR4A 2HZFA 3ZVJD 1ON4A 1LJRA 2BMXA 1CQGA 1F9MA 1AQVA 1K0NA 4JR6A 3EURA 4NWYA 3LSZA 4AGSA 1K0AA 1X0RA 4RQRA 2EC4A 2CA8A 1F3BA 3L78A 3I69A 1J08A 4ZBAA 2WZ9A 2PMTA 1V57A 4ACSA 1TK0B 1R4WA 2HLSA 5EY6A 3ERWA 2NVLA 4WBRD 2B5YA 3ZITA 1GUMA 4EVMA 1YQ1A 4J57E 1VRSD 5AIXA 3HHVA 1MDJA 3A2XA 5H5SA 1A0RP 3ED3A 2AYTA 1W4VA 5A4VA 1QMVA 1GP1A 2ALBA 3C1RA 7GSSA 1BEDA 1GLPA 1GSSA 1R5PA 2J23A 4TXOB 4TR0A 3W8SA 4KF9A 2OJLA 4XHMA 5D9WA 2A2SA 3IXRA 5G2ZA 4IJ3A 2EIOA 3R2QA 2JU5A 2XHFA 2HSMA 4ZIJA 1ML6A 4PNGA 1EP7A 1MD4A 2Z9SA 2C0DA 2F51A 1AXDA 5IOWA 1VF3A 4PXOA 5DALA 2A2RA 4PURA 1Z3EA 3D5JA 5JWRB 3IK7A 2HNLA 5DAKA 3NZNA 4ZL7A 5DVBA 3A2WA 3F4RA 1OE8A 3FHKA 5G1LA 1UA5A 3HY2A 4MH2A 5G30A 2H0HA 3Q19A 4TKYA 3GYKA 5CREA 1PL1A 2PERA 2JZSA 1K0MA 2YNXA 2IMIA 3TB2A 3HVXA 4XRDA 4JBBA 1AQWA 1JLVA 5LCZA 3CRTA 2H6YA 3J7Yb 3LYKA 2J9HA 2DJ0A 1F37A 5L71A 1O8WA 4BWQA 4Q5FA 5G1KA 18GSA 2HI7A 2REMA 2NBSA 1XZOA 3L0HA 3IOSA 2ON7A 2R6KA 2AAWA 4X0XA 4ID0A 3ZMLA 2VLTA 1SK1A 3FR3A 2LQOA 1SKWB 1U3IA 2NTOA 10GSA 2LV3A 5J5NA 1TRUA 2F8AA 5JWOB 4MP4A 2WDUA 1WOUA 3TJKA 3TJJA 2HRFA 1X5CA 2O87A 5IOXA 1PMTA 3HJOA 4I97A 3FYGA 3ZREA 2K8VA 1JLWA 2I4AA 3UIWA 3PPUA 5IM9A 4HDEA 4RQXA 3K8NA 4K7IA 3E3EA 6GSTA 1O85A 4BL7B 1X9SB 3KXOA 2MMAA 3ISOA 3FZAA 3GNJA 4MLYA 5CP1A 1SKRB 4NHWA 5ELGA 1GSDA 1U87A 3GL3A 5E59A 1WMJA 1MDIA 2XBQA 2FWHA 4BA7A 1R7HA 1GTUA 5D9TA 2RLIA 2YJ7A 5KN2A 3VURA 3P7XA 16GSA 3E9JB 5DCGA 3KCMA 3BJ5A 1HNBA 3GRXA 2PBJA 2GZYA 3TOTA 4L5OA 4V2LA 1TW9A 1B4PA 3VLNA 2L4CA 3I6AA 5J3RA 3QFBC 2H6ZA 2P5QA 3GSSA 4HJMA 4GRFA 1T3BA 2V6OA 4KUNA 4V2NA 3GA4A 1B9XC 2HT9A 4H86A 4ECBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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