2N5FA

Solution structure of the dehydroascorbate reductase 3a from populus trichocarpa
Total Genus 55

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
MALEICVKAAVGAPNILGDCPFCQRVLLSLEEKKIPYKSHLINLGDKPQWFLEISPEGKVPVVKIDDKWVADSDVIVGILEEKNPEPPLATPPEFASVGSKIFPSFVKFLKSKDPNDGTEQALLEELKALDGHLKVHGPFIAGEKITAVDLSLAPKLYHLEVALGHFKNWPIPDNLTHVLNYIKLLFSRESFKKTRAAEEHVIAGWEPKVNA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
TII1 (10-13)AH1 (21-33)AH8 (190-195)AH3 (74-83)EMPTYTI'1 (43-46)AH2 (49-54)TI1 (55-58)TIV3 (57-60)O1 (89-91)TIV5 (113-116)AH9 (199-211)AH5 (119-137)TIV6 (116-119)TI2 (140-143)TI3 (173-176)AH7 (177-187)S1 (3-6)S2 (62-65)TIV2 (13-16)AH6 (148-167)S3 (68-70)AH4 (94-111)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Populus trichocarpa
publication title Insights into ascorbate regeneration in plants: investigating the redox and structural properties of dehydroascorbate reductases from Populus trichocarpa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dehydroascorbate reductase family protein
total genus 55
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature ec 1.8.5.1: Glutathione dehydrogenase (ascorbate).
pdb deposition date 2015-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2n5fA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2n5fA01
2IIYA 4N30A 5BMUA 4EO3A 2OJLA 3QR6A 1EGRA 4POBA 3K8NA 4EXJA 4KDYA 4E8EA 5DVBA 2R4VA 5KN3A 2MMNA 2ZUPA 1OKDA 2LTKA 3L4NA 5AN1A 4D73B 2BMXA 2H73A 2LSTA 5DALB 2QKEA 2JACA 1K0OA 1A2JA 4MK3A 5ID2B 1HNCA 3UMAA 4MPFA 5DAKB 3F0IA 2C1YA 2C3TA 4I6XA 4WBRD 1AUCA 2JSYA 4L5OA 3JCML 1V98A 3GX8A 3DVXA 4TW5A 2H8LA 2LS5A 3E0UA 1IYHA 2L57A 2H76A 4OFMA 2TRXA 1WE0A 1TRUA 1O8WA 4YH2A 1GSQA 1AQXA 5G1LA 4NHZA 3DXBA 2GQLA 2FGXA 3F4TA 2B6MA 7GSSA 2I1UA 3KTLA 4F2IA 11GSA 1XW9A 3DMLA 1U87A 1EV9A 1EGOA 5IMAA 2M72A 3IOSA 3KD0A 3UBLA 4GRFA 1TW9A 5HFKA 1FHEA 2CVBA 1T1VA 5LNKe 3R2QA 2O85A 1FW1A 3AY8A 3U6VA 2HRAA 3L0HA 3H93A 1K0NA 2IL3A 5HR3A 3FZ4A 2BJXA 2C0FA 1XOBA 1YF0A 4ZXGA 5JWRB 5H5QA 4MA9A 3IHQA 2F51A 4LMVA 2FY6A 4X1UA 3GA4A 1X5DA 1V58A 4KW6A 4KGIA 5AIVA 2VUPA 3DEXA 2HSMA 1F37A 1TI3A 1URMA 3UBKA 2JZTA 4V2NA 1MD3A 3SWLA 1OE7A 3MSZA 5KN2A 3MWHA 1YJ6A 4I2UA 2YJHA 3LQ7A 4ZBAA 3VFIA 4MZBA 4KX4A 1UN2A 1EOHA 1V2AA 2V32A 2IMIA 2OA7A 2YOIA 4X0XA 1EP7A 2FCHA 5ECQB 2LUSA 1SK2A 1ZZYA 4TXOA 2C3NA 2M80A 2LQQA 1FVKA 3VWXA 4K1FA 1DE2A 2DJJA 1HNAA 5CNWA 1BG5A 5FWGA 17GSA 4POMA 3WGXA 2QGVA 4KE3A 1TU7A 5IOXA 5J4UA 1U3IA 3IE3A 3TB2A 1MDIA 4PX1A 6GSUA 3APQA 5F06A 2A2RA 4IKHA 3KCMA 2LQOA 1PL1A 2JZSA 4FO5A 1JHBA 4QQ7A 4ZL9A 3LYKA 4GSNA 3TUEA 3O76A 4K7IA 3D5JA 1M2BA 5GZZB 2CZ2A 2X8GA 2REMA 1TTZA 4NMUA 3M9KA 2VCVA 1N8JA 2JL4A 1XCCA 3M9JA 2FWHA 3IC8A 3KZQA 3E3EA 2VCZA 4QL7A 4MF7A 2VL2C 2HSHA 3DIEA 1JZWA 2CV4A 3TRPA 1EOGA 4D73A 3TJKA 2RM5A 1GL8A 1Z5YE 5DALA 2ALBA 4DSQA 5D9TA 1SL1B 5ID2A 1M2DA 3EINA 4N11A 1GTIA 5DAKA 2GT5A 4V2MA 5F07A 5C00A 3PPUA 2VL2A 2LJRA 3V1WA 5HR1A 3NOFA 1XWBA 3US3A 2R5GA 2OKAA 2R3XA 2GSRA 1DUGA 4ECBA 1K3YA 2WFCA 3QMXA 2VM2A 3J7Yk 1LJRA 4IGJA 3QFBC 2KHPA 3WYWA 3ZL5A 3HVSA 3FZ9A 4ML6A 2X8HA 1FG4A 2GQKA 3H4KA 4NXIA 4TN8A 3FYGA 4HQSA 4MABA 1M9AA 2E0QA 1GSDA 4GSSA 1GUKA 1OC3A 4N10A 3A2WA 1ACVA 4FYCA 4HJ2A 1JLWA 1T3BA 2HRNA 4KSMA 3TOUA 3RAZA 5F8BA 1R5PA 2TIRA 3HCZA 2B5XA 5ECSA 5JWOB 1O85A 1SL2B 1PGTA 3IR4A 4MZWA 3WT1A 1WP0A 1X9MB 2DJ0A 1JLVA 2GZZA 1AW9A 1ILOA 1A2MA 2LV3A 3HZ4A 1SK1A 4OD7A 3ZVJA 5JWQB 1GTAA 3IBHA 5IOWA 1VGLA 2VCQA 4XRDA 2VL9A 3KH9A 5IPHA 6GSSA 3L9SA 1XWGA 1KBNA 4GLTA 5D96A 2MMZA 5EPFA 3MAKA 4NV5A 1EWXA 1K0DA 1MD4A 1M7TA 2YWMA 1SKWB 1MEKA 1T00A 1T8EB 1GLPA 1XVQA 5A4UA 2N5FA 5IMFA 3PINA 6GSVA 2H0IA 4LA1A 4TR1A 3UL3A 3IRAA 1ZGNA 5ECOB 9GSSA 4F03A 1T4YA 2TRCP 3HXSA 3I43A 2I81A 2I9HA 1ABAA 4G10A 1WMJA 22GSA 1M99A 5DDLA 2CAQA 4MJAA 1CQHA 1SKSB 4RI6A 1XXUA 5J9BA 3EMXA 3P90A 3BD2A 4KA0A 3NZNA 2GZPA 4WR5A 1TDIA 2X99A 3DWVA 3GKMA 4FH8A 2GQMA 5FT3A 3ZFLA 3CRTA 3FW2A 4KB3A 3IK7A 1DBYA 3LG6A 3GFKA 2NDOA 3ED3A 4NWYA 4BWSA 4XS4B 4KCEA 1YZXA 1HNBA 1LBKA 1G6YA 2DIZA 2CZ3A 3TKPA 2RM6A 3PGTA 2Z9SA 3FR3A 3BJ5A 2L5LA 3GYKA 4MH2A 2GVPA 3E9JB 4BPYA 1IYIA 3CSIA 1H4OA 3TKSA 5CP1A 4QL9A 1JFUA 1SL0B 3GX0A 3ZVJD 2YWNA 4V2LA 2R6KA 3LYPA 1J9BA 2YP6A 2O7KA 1NW2A 1NHOA 5KN0A 2KUCA 4MLYA 4LLRA 3RHCA 3M3MA 3R3EA 4ZB6A 1O73A 3KJYA 4HS1A 3APOA 2WDUA 2XPDA 2V6KA 4NAXA 5KEJA 4ZBDA 2V41A 1WIKA 2AV4A 4PQ1A 4F0CA 5ECHB 3C71A 3IXRA 3L9VA 1CQGA 4ZL8A 1EEJA 1KNGA 2LRCA 2GS3A 4FYBA 2AB6A 4MF6A 3FHKA 2A4VA 2CT6A 2ON5A 4EVMA 4L5LA 2PN8A 3P7XA 3TOTA 4IN0A 3IV4A 3VI5A 3HDCA 1RK4A 1T7PB 1Z6MA 2CX4A 2GGTA 2JZRA 3IAM2 1Z9HA 3GMFA 3CYNA 1SJZA 5INYA 5EVOA 3TKSE 1QQ2A 4IBPA 2IFQB 1ST9A 3GL3A 5IO2A 3ZITA 4Q5RA 3CTFA 2DJ2A 3GV1A 1GH2A 3UVHA 4EDZA 1XPVA 3SBCA 2H70A 4V1Ap 1ERTA 1GLQA 2B5YA 4MF5A 2B3SA 2WGRA 2YWOA 3OR5A 4XS6A 5JCWA 3FR9A 4G0KA 2O89A 1X5EA 3ZIJA 3KP9A 2IN3A 3DGQA 1Z7RA 2HSYA 4Q5NA 1R7HA 3RDWA 3ZIVA 4POKA 4BL7B 4BA7A 2O8VB 4BVXB 5G1KA 3D4MA 2XBIA 3TJFA 3N5OA 4MMMA 3WD6A 1YKAA 1LU4A 1PKWA 2C8UA 2H01A 1OAZA 3C7MA 3HJMA 1F3BA 1M0UA 2LNTA 5ELGA 1PD21 3L9UA 5B7CA 3IPZA 2HT9A 2H6ZA 2HXKA 2VD0A 5G31A 4EDYA 2H1BA 1XIYA 3F9UA 3ME7A 3W8SA 1YKCA 1XWCA 2HZEB 3F6DA 4GCIA 2DJ3A 3KMOA 4GF0A 1A8YA 3FY7A 4ID0A 4K8MA 4KAEA 2MBTA 2UZ8A 2N5AA 4PQIA 4YAPA 5HFIA 1TK0B 2PERA 1XBSA 2FWEA 2C0GA 20GSA 5AGYA 4OWYA 1TXXA 4KDXA 2B1KA 2EC4A 4ILFA 2KP2A 2CX3A 3U5RE 5ENUA 2FLSA 3VK9A 1OKTA 1WOUA 1BQ7A 5A4WA 4IQ1A 1M2AA 1KTEA 2P5RA 3HJOA 1R5AA 1QXHA 3BCKA 4XRAA 4ML1A 2VOCA 3HVXA 4L0WA 3LWAA 3BBYA 1K0BA 3HJPA 4H86A 4HUAA 5A5KA 1EEMA 2CVKA 4XS4A 5IMZA 2C80A 1SK0A 1KEBA 4I2TA 1I5GA 3UVTA 4DSSB 2PWJA 3F6FA 3QFAC 1SJIA 2H6YA 3FK8A 1U6TA 4EKZA 1A0RP 4YQMA 4G9HA 1X9SB 3C1SA 1XZOA 2AHEA 6GSWA 1FO5A 2FA8A 1NM3A 10GSA 3C8EA 4WETA 2XBQA 4PTSA 4BVYB 1EZKA 6GSXA 4HQZA 1G6WA 4OCFA 1YF1A 3CSJA 1GSEA 4KNDA 4F82A 5G30A 4ZL7A 3M0FA 3F3QA 5E59A 1MDKA 3DYRA 3IC4A 1SYXA 4ACSA 8GSSA 5G2ZA 1BX9A 3KH7A 4DSRA 1YDKA 3QPMA 1DE1A 1J0FA 5ECKB 5HR2A 5ECRB 5ECMB 1R26A 3GTUB 3KIJA 3CMIA 2VAFA 2LKUA 2IJYA 1TK8B 5ELAA 4MP4A 4ECIA 1Y6EA 2YN1A 5J5NA 3GKKA 3GUSA 2L4CA 2YANA 2JSZA 3EWLA 4K6XA 1YEXA 5CRDA 4N0VA 2IFQA 2K9FA 4XIHA 2C0DA 3F63A 2B1LA 5L71A 4JU5A 2HRKB 4E8HA 4P3YB 1TRWA 4ZILA 1USBA 2PGTA 4CW9A 2GT6A 3Q19A 1MDJA 1GULA 2QC7A 4J2FA 3ZMLA 2B5EA 1U3AA 3ERGA 2LEGA 4XTSA 3TJGA 4RQRA 3DKSA 5HQPA 2I4AA 4XHMA 3CSHA 2IWTA 4WR4A 2MBSA 5D9WA 3ZTLA 1ZYEA 3VWWA 1PX6A 1X5CA 4JE1A 4EUYA 2P0GA 4K7OA 4IP1A 3I69A 2DBCA 4AJ8A 3HD5A 1HQOA 4I5QA 4IJ3A 2HRFA 4BL7A 1PL2A 2N5BA 3HKRA 2VLUA 2QSIA 3D21A 2CA8A 1AQVA 4EF0A 2C3QA 4Q5QA 3HYPA 5DQYA 2JADA 4ZBBA 3A2XA 2HYXA 5IMCA 5JCUA 1TKDB 2VM1A 1M9BA 2H6XA 4GSTA 2V1MA 1FOVA 2VLTA 4ZB9A 1V57A 4X43A 2ZNMA 2RLIA 3HVVA 3GSSA 2DJ1A 5IQYA 2MMAA 4HOJA 5B6MA 2VIMA 3Q74A 1GUHA 2ON7A 2XPEA 1W4VA 2H71A 2BTOT 4FYUA 3GSTA 4MJCA 2ES7A 2K8VA 1NHYA 4L8EA 2DMLA 4WKWA 5HFGA 4JRRA 2RUFA 4JZQA 4DEJA 4AF2A 1F2EA 3W8JA 1AXDA 2WB9A 3LSZA 3KTBA 3F4RA 2K6VA 2C4JA 1ON4A 4KSOA 3EMPA 1QK8A 2E2GA 1YY7A 3CRUA 5B6NA 2FA4A 1V9WA 1OC8A 1BYEA 1I9DA 4BWQA 1JZRA 2DMMA 3ERFA 3GH9A 5G5FA 3TJBA 2PVOC 4O92A 4WF5A 1Z7PA 2WCIA 4GQFA 1PSQA 4DSSA 2YZHA 3FEUA 4F9ZA 3FKFA 3G7JA 4IVFA 1UA5A 3GNJA 4IELA 2HI7A 2L5OA 3UEMA 4O32A 1GP1A 3GIXA 1X0RA 5F0GA 1UC7A 2J9HA 2WULA 2WJUA 4HDEA 3LXZA 1Q98A 4IW9A 2GDRA 1T4ZA 3A5WA 4BVYA 2RUEA 2ZCTA 3TKSC 2WZ9A 1O8XA 2YZUA 2F9SA 2IMEA 2DC5A 3GKNA 1A2LA 1PMTA 1SKRB 5G5EA 2XHFA 1VF3A 5FHIA 3TGZA 2AAWA 3O6TA 1MTCA 4HEA2 3M1GA 1PX7A 3APSA 5ECLB 2H72A 3GTUA 2HQTA 1PRXA 3DVWA 2GTUA 4MDCA 5LD0A 4WXTA 5D9VA 3GHAA 1EP8A 4ULXA 1ERVA 1XOAA 2V2GA 2O87A 4MJBA 3WT2A 1AC1A 3KMNA 4ECJA 2LJAA 5CYYA 4OO4A 1WWJA 4N0ZA 4PNGA 5ECNB 3G9BA 4IP6A 2F8FA 6GSYA 2HRKA 4XCSA 4HU7A 3MDKA 4WEYA 4AJ6A 5H5SA 1YQ1A 2H1AA 3KXOA 3TKQA 4V1Ag 4MJEA 1X9WB 5DJMA 1PA3A 5DBQA 2HLSA 1VF4A 3ZMKA 4J56E 3KP8A 5D9XA 1S3AA 3HZ8A 1QMVA 3UAPA 1WRYA 5CRGA 3D22A 5J9CA 3TRQA 2HFDA 3FRCA 2CQ9A 18GSA 4OMVA 1BEDA 2KP1A 4WF4A 1PKZA 1S3CA 5DJLA 3D6IA 2G2QA 1GUMA 5EL8A 5IMVA 4FIWA 3HY2A 4K7NA 2P5QA 4EL1A 2PVQA 1QFNA 1S3DA 1BAYA 2DLXA 4PUAA 2A2SA 2IPAA 4GQCA 5DQSA 4EE0A 2PBJA 4JEDA 1AQWA 5GSSA 2VCTA 5COHA 3QD9A 4CHSA 4KUNA 4MH3A 4PURA 3F4SA 1BJXA 3GN3A 3H79A 5CO3A 1OVNA 3BOAA 4HU9A 5CREA 1GTUA 3VLNA 4EC0A 1N2AA 2OBKA 4Q5FA 5KN1A 3I9V2 4POLA 4WBJA 1OYJA 4TR4A 2K18A 19GSA 2EIQA 4K2DA 2OBIA 4JR4A 2CVDA 1EV4A 4L0UA 3VWVA 5J41A 2C0EA 2H74A 2MMOA 4F0BA 1OC9B 3CBUA 4GWRA 2GLRA 3DRNA 1K0AA 1A8LA 3PR8A 5EY6A 3UARA 1ZCPA 4OO5A 3Q6OA 3M8NA 3P8WA 3ZZXA 3EURA 5ABRA 3RPNA 1RW1A 4K9ZA 1XWKA 2LJKA 2WRTA 2VCWA 1QUWA 3J7Yb 4LMWA 4I97A 4PNFA 2NVLA 4YAVA 2L4QA 2NPBA 5C04A 5IM9A 4OFNA 2G0FA 1SYRA 1AIUA 4KH7A 1E6BA 2L59A 2FUG2 2K8SA 5D73A 3QDNA 1F9MA 2H30A 1K3OA 3WGEA 5GAND 3IDVA 4TKYA 4TR1B 3ZFBA 3QAWA 2RIIA 2MZCA 4OFTA 2H66A 12GSA 5ECIB 2DSAA 4OCEA 3LGCA 2R2JA 3A2VA 1FAAA 4KDUA 2PU9C 2LRTA 2VCXA 1B48A 2I3YA 1FVJA 3C73A 2H0GA 2J23A 4CDOA 3VPTA 1R4WA 5D8IA 1XW6A 2AJQB 1HYUA 4PUFC 2IMKA 1THXA 1GWCA 1ML6A 1V40A 2VD1A 1GSUA 3G7IA 2MYGA 5CRWA 3TCOA 1XW5A 4PGTA 3FZAA 1TI1A 3TRXA 1G7EA 2FWGA 2WS2A 1TRVA 1Z6NA 4TOPA 5IPGA 1TP9A 4HJMA 1TU8A 1O7UA 5CAXA 4TR0A 2F3MA 4G0LA 2AUVA 4PQHA 1G0TA 3IAS2 3TKRA 2VO4A 2V6OA 5JCGA 1GSFA 1UVZA 1QGVA 2OE1A 3W6GA 2HNLA 3QCPA 2LRNA 3HHVA 2H1GA 4TXVA 4HZ2A 2B7JA 1B4PA 3QAVA 1W89A 4IHUA 1GTBA 1F3AA 3TDGA 3IK9A 1SD9A 4Z7XA 1B4QA 1SENA 1O6JA 5DCHA 4USSA 2OACA 3DD3A 4IS0A 5GAPD 2NBSA 5E4WA 2CAIA 1GNWA 6GSTA 1ZMAA 1VRSD 2X64A 3ME8A 4J57E 1GRXA 2L6DA 4NHWA 1GSSA 2E7PA 3VI7A 13GSA 5DCGA 4RQXA 1B9YC 1WJKA 2YV7A 2HZFA 4LL1B 4KF9A 3IA1A 2GSSA 4MZCA 3EVIA 2JU5A 1SD8A 5ECPB 5F05A 2DIYA 2XC2A 1Y25A 3KM6A 1B8XA 5LCZA 4TRXA 2KLXA 3PH9A 2YPMA 1YEPA 1ZYQB 14GSA 5IIZA 5J3RA 3VPQA 3RBTA 1GNEA 3KEBA 3WGDA 3RHBA 2YNXA 3QOUA 3TJJA 1THOA 4BVXA 2H0HA 4IJIA 4RUVA 3C1RA 2H19A 1Z3EA 3GH6A 3RPPA 5AIXA 3EU3A 2X8CA 2HE3A 2PUKC 3FZ5A 2F8AA 2H75A 2KOKA 2H1DA 4ZIJA 1GSYA 3L78A 1VF1A 2GSQA 4ECCA 4AGSA 3H1NA 4O7HA 2VLVA 3O3TA 3S9FA 4JR6A 1DSBA 2FNOA 2FHEA 4G2EA 2IMDA 1OC9A 1PQNA 3EYTA 3GKXA 2HZEA 4PXOA 2GZYA 2AYTA 1FB6A 2YJ7A 4DVCA 5HR0A 4ISDA 5CRHA 1XFLA 2M46A 1RQMA 2PPTA 3LORA 1H75A 3LEFA 3D0ZA 4GTUA 4I8BA 1NSWA 2GSTA 4NV2A 3UIWA 3F8UA 2HSNB 2YCDA 4AJ7A 3VURA 2L6CA 1XVWA 1G7OA 1XWAA 2OE3A 4G19A 3EE2A 2P31A 3GURA 3ISOA 3KGKA 2B7KA 2R37A 2YV9A 1ERWA 4TR3A 5IO0A 4IQAA 3GRXA 2OADA 3ERWA 5B8BA 2VL3A 1Q4JA 3EC3A 1J08A 3A3TA 5H5RA 4YQUA 2OE0A 2HSMB 1B9XC 4K0NA 4O5RA 1WPIA 4ZB8A 3ZRDA 5D93A 1O81A 1PN9A 1AAZA 3ZYWA 2EIRA 3G7YA 1TRSA 4MCUA 3LXTA 4KCAA 5A4VA 2NTOA 4NPBA 5AISA 3VWUA 1VF2A 4FQUA 1E2YA 1K0CA 3I6AA 4TVEA 1TOFA 4JBBA 2YWIA 3D4TA 5IMDA 1FB0A 3MNGA 4TXOB 1TK5B 2EIOA 1U88A 3BCIA 3EU4A 2DJKA 4YQVA 4LL4B 4MPGA 5GSTA 16GSA 3HA9A 3LJRA 2PMTA 1A24A 1C72A 4G0IA 1SJ6A 2E2MA 4K0GA 3Q18A 2D2ZA 1ZOFA 2IMFA 3CXGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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