2PBJA

Gsh-heme bound microsomal prostaglandin e synthase
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
LQLTLYQYKTCPFCSKVRAFLDFHALPYQVVEVNPVLRAEIKFSSYRKVPILVAQEGESSQQLNDSSVIISALKTYLVSGQPLEEIITYYPAMKAVNDQGKEVTEFGNKYWLMLNEKEAQQVYSGKEARTEEMKWRQWADDWLVHLISPNVYRTPTEALASFDYIVREGKFGAVEGAVAKYMGAAAMYLISKRLKSRHRLQDNVREDLYEAADKWVAAVGKDRPFMGGQKPNLADLAVYGVLRVMEGLDAFDDLMQHTHIQPWYLRVERAITEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title PGH2 degradation pathway catalyzed by GSH-heme complex bound microsomal prostaglandin E2 synthase type 2: the first example of a dual-function enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Prostaglandin E synthase 2
molecule tags Isomerase, lyase
source organism Macaca fascicularis
total genus 97
structure length 274
sequence length 274
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.99.3: Prostaglandin-E synthase.
pdb deposition date 2007-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2pbjA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2pbjA01
3TRXA 3LGCA 1A0RP 5ID2A 1PX7A 5IMDA 4MP4A 1TI3A 5CAXA 3IBHA 1X9SB 5GZZB 1PD21 3KGKA 2VLUA 2IPAA 1F3AA 3M9KA 1K0MA 4IP1A 3TOTA 3M8NA 1O81A 2G0FA 3HZ8A 3G7YA 1M9BA 1GNEA 2VL9A 3HA9A 1GSSA 3VWWA 2O85A 1TXXA 2YWIA 4E8HA 1Z6MA 2MZCA 4ZIJA 4TVEA 2TRXA 3IK7A 1SK0A 2AAWA 3IAM2 4JR6A 1MEKA 2PPTA 4AJ7A 2LEGA 2LTKA 5DAKA 3BCIA 2CAQA 5IMAA 13GSA 4YQMA 2XBQA 1MD3A 1E2YA 3LXZA 2YV9A 3Q18A 2HZFA 3QD9A 3EYTA 3US3A 1SD8A 4D73A 3O3TA 4IGJA 1K0BA 1YEPA 4RQXA 2JZRA 2A4VA 1A23A 1SL1B 2GS3A 1T1VA 1QFNA 1B9XC 2I3YA 5JWQB 1CQGA 2VD1A 4K8MA 2MMNA 3VPTA 3GSSA 2MMAA 5IMZA 4O5RA 1LU4A 5HFKA 3GKNA 1E6BA 1GTBA 4BWSA 3HD5A 4WEYA 2CVBA 4KF9A 4F82A 4JEDA 3GTUB 2CZ3A 1FG4A 1FVKA 3BOAA 3TKQA 2LRCA 5ECSA 1T4YA 1TTZA 2HRAA 2LKUA 3MDKA 4Q5QA 5J5NA 2H19A 3WGEA 1OC3A 1TK5B 2WGRA 1R5PA 1XW5A 3FEUA 2DC5A 2HSYA 3ZTLA 4ZB8A 1GP1A 3R3EA 4F03A 5IIZA 2BJXA 1TOFA 5A4VA 4TR1B 4HJ2A 3VLNA 3IK9A 4GLTA 4MH2A 3GYKA 1YEXA 1JZOA 2H72A 4ZB9A 3CTGA 4X43A 1XXUA 2XPEA 1JZRA 3RBTA 4KCAA 4DSRA 4OWYA 3GIXA 4IJ3A 4KNDA 2H1AA 4MCUA 2H1GA 1QUWA 4V1Ap 4GSSA 3RPNA 1GTAA 2L6CA 2L57A 3KZQA 3L78A 1QK8A 4MPFA 4PUFC 5EL8A 4L5OA 2LJAA 3GV1A 3QR6A 3RPPA 4WXTA 1G7OA 2AB6A 4G19A 1YKCA 1XW6A 1QQ2A 5HQPA 4IQAA 1XWAA 4EKZA 1YF0A 2VIMA 2OBIA 1ERTA 3FZ9A 1BX9A 4TOPA 2ON5A 2C1YA 4TKYA 4LMWA 1VF3A 4ZBDA 2ES7A 4DEJA 1Q4JA 2CVDA 2EIQA 3UMAA 4JE1A 2VL2A 4EVMA 3KP8A 4RI7A 2V2GA 3DVXA 2B6MA 4ML1A 5CRWA 4MABA 4TXOB 2VM1A 3N5OA 1R4WA 2IJYA 1GNWA 3KIJA 1WWJA 4PX1A 1GH2A 2YP6A 2H8LA 4WF4A 1TRSA 4KDUA 5IQYA 2IMEA 3H4KA 1TI1A 2DJ2A 2I9HA 4MZWA 3ZITA 2WDUA 5D73A 3IC4A 3ME7A 2CX4A 2O87A 2L5LA 2DMMA 1OC8A 3VURA 2AUVA 2N5AA 4G2EA 3GH9A 1XCCA 3EC3A 4K9ZA 4XRAA 4HU9A 1BYEA 3GTUA 4BPYA 3LWAA 4FH8A 2H1BA 3TGZA 1A2JA 4PQHA 3GMFA 1PGTA 6GSYA 2XHFA 5HR3A 3TRQA 4QL7A 2H76A 2HRNA 5AGYA 2WFCA 3EU4A 5ECMB 1SK1A 3H8QA 3HDCA 3R2QA 2OADA 2PU9C 1HNAA 2XPDA 4ECCA 2YZUA 2JL4A 4ZL9A 4RUVA 4IJIA 4NAXA 1V9WA 4MZBA 1OKDA 1EP8A 1F37A 5D8IA 1ZYQB 2GT5A 4G0IA 1T3BA 3TJFA 4KE3A 2I81A 4GCIA 4MLYA 3P2AA 2MBSA 4K0NA 4TR1A 2B1KA 2E7PA 4GWRA 3LQ7A 4O7HA 3D21A 3C71A 1XWCA 5D9VA 2I1UA 3LSZA 2CV4A 5IO2A 5E4WA 3ZMLA 2JACA 4K0GA 1XOAA 3ISOA 5F8BA 2RM6A 1EP7A 2WJUA 4TR0A 4EL1A 3IE3A 2NPBA 1VGLA 3DD3A 2H0GA 1SENA 4JBBA 2FLSA 2ZNMA 2C3TA 4NXIA 4G0LA 3P90A 3SBCA 4ZL8A 2LJKA 5DCHA 1ZCPA 4DSQA 2JADA 3ED3A 1XW9A 1B4PA 4MH3A 3TJGA 2F51A 2OBKA 3UEMA 2R4VA 4ECBA 4IHUA 2RM5A 4PXOA 3ZREA 3N9JA 2GZPA 2AJQB 2H71A 1M2BA 4ACSA 5ECKB 2L4CA 8GSSA 4J2FA 3L4NA 4O32A 4TXOA 3KH9A 4L5LA 1YDKA 2WB9A 2M72A 1GRXA 1G0TA 4KDXA 2H74A 1S3CA 1XFLA 4Q5RA 2GT6A 5CRGA 3UIWA 3V1WA 5FT3A 3U5RE 4P3YB 4HDEA 1X9WB 1KNGA 1EV9A 4YQUA 5KN2A 3EWLA 1NHYA 1PX6A 4V1Ag 5AN1A 5JCGA 3BJ5A 4N0ZA 3ERWA 5D9XA 2NTOA 5G1KA 4LL4B 2PUKC 1XPVA 2OJLA 5ECLB 4AJ8A 4NWYA 4LLRA 4MPGA 3DRNA 1SD9A 3TRPA 3IAS2 4RQRA 4EDZA 3E0UA 1SL0B 1SJZA 2WULA 1M2AA 2V41A 4IN0A 1ERUA 1PL1A 4FQUA 1ZMAA 2CA8A 3FYGA 3DYRA 4FYCA 1JLVA 4USSA 2YOIA 22GSA 1WJKA 5EVOA 1EZKA 3VFIA 3I69A 4CDOA 3KEBA 4NHZA 1DE2A 3ZFLA 3F8UA 3KTBA 1O8WA 3VWUA 4TN8A 4OFNA 2VOCA 1XVQA 1NW2A 3ZZXA 2GZZA 5GAPD 3W6GA 3C1RA 5A5KA 1DUGA 2CT6A 3L0HA 1FAAA 3ZIVA 3ZMKA 1Y6EA 10GSA 1WP0A 2PMTA 4YH2A 4Q5NA 3F0IA 1AQVA 1K0OA 1H4OA 2OE0A 2EIRA 2C0EA 1WRYA 1JHBA 5IOXA 5E59A 1VF2A 3UVHA 2OACA 2IFQB 3TKSA 5F05A 2J23A 2OE1A 4PQ1A 1B4QA 4ID0A 5D9TA 1ON4A 2X8CA 1GUHA 2GQKA 2KUCA 4N11A 2VCQA 3NOFA 4KA0A 1XWBA 1U3IA 2LS5A 4HZ4A 2DJ1A 2KP1A 4KSOA 1TDIA 2H70A 5IPGA 4N0VA 3RDWA 5D93A 5GSTA 2H30A 4ZXGA 2FGXA 1FO5A 5HR1A 3KP9A 1V2AA 4DSSB 3IA1A 2RIIA 1XVWA 3DGQA 4GXZA 5IMVA 3HVVA 5G2ZA 1AUCA 3GNJA 4F2IA 2GSQA 4OO5A 1K0NA 5J41A 2VLVA 5H5SA 6GSSA 2IMIA 1AXDA 3VI7A 2R3XA 2PVOC 4IVFA 3EU3A 4ULXA 5F06A 2YANA 4PQIA 1X9MB 3I6AA 2HSNB 3A3TA 1BEDA 5F07A 2H6YA 2X8GA 1B48A 2IIYA 3HVSA 5D9WA 2DLXA 2C0DA 2RUEA 1O73A 2VAFA 5LNKe 4KH7A 2YV7A 4ECJA 5ABRA 1AC1A 3LXTA 1TK0B 2KLXA 1VF1A 5HFIA 5DCGA 2DBCA 5CP1A 3D4TA 3FZAA 2TRCP 1S3AA 3D22A 2IMDA 3PR8A 4MJAA 1X5DA 3FZ5A 2PN8A 2HRKB 3TJKA 1Z3EA 1T8EB 2RLIA 3IV4A 5ECIB 2HT9A 2C4JA 4G10A 4ZBBA 5EPFA 2L4QA 2PGTA 2B7KA 3GFKA 3CTFA 3IOSA 5FWGA 2VCZA 4MA9A 2R37A 3TJBA 1K3OA 4ZILA 1U87A 3APSA 3M9JA 4KX4A 2Z9SA 4MK3A 2H0IA 5DDLA 5JWOB 1Z7PA 1HNCA 3EURA 4E8EA 2L6DA 4PUAA 3HXSA 5C00A 5AISA 4XIHA 1NSWA 1H75A 2FA8A 4IELA 3H1NA 2ALBA 2H01A 4G9HA 1EV4A 4GQFA 3J7Yk 3GKXA 2O89A 3DIEA 1USBA 2IMKA 3VWXA 2R6KA 1BAYA 4I2TA 2IFQA 3E9JB 3ERFA 1AAZA 3PH9A 1ERVA 1EOGA 3HJPA 2YJ7A 2B3SA 2CX3A 5JCWA 2PBJA 2R5GA 2C0GA 3QCPA 4MZCA 2HLSA 4YAPA 3GA4A 1N8JA 3MWHA 2BTOT 5LD0A 2VL3A 4XS4B 5ECHB 2PWJA 3DXBA 3L9UA 4LA1A 3QOUA 4GF0A 1MD4A 5G5FA 4BVYB 5IPHA 3ZLPA 4DSSA 2NBSA 1F2EA 3WT2A 2I4AA 1GSQA 4GQCA 3QMXA 2YJHA 2VM2A 3G9BA 3MNGA 4GSTA 3F3RA 2A2SA 3HY2A 4JRRA 3AY8A 2HE3A 4OFMA 2VCWA 1JZWA 3DKSA 3JCML 2P5RA 4K7NA 6GSTA 4FYBA 2AYTA 3WD6A 1XWKA 1FVJA 3CSHA 2PERA 3FHKA 2NVLA 1YF1A 1LJRA 1K0DA 3S9FA 2OE3A 1C72A 4NPBA 1O7UA 2HYXA 2LUSA 3GL5A 1VRSD 3VK9A 5B8BA 2KOKA 3UBLA 3SWLA 3DMLA 5G5EA 2OA7A 1J9BA 2H75A 1K3LA 4POLA 5DALB 2X8HA 3DEXA 2JU5A 1FB6A 1K3YA 5IOWA 1XWGA 3ZVJA 2FWGA 1G6WA 1M0UA 2GQLA 5KN0A 2GTUA 4WETA 4I5QA 1GSEA 2HRKA 3IXRA 4HOJA 5LCZA 3BD2A 2N5FA 4EUYA 3C73A 4JR4A 2LNTA 1Z7RA 2L59A 2FA4A 6GSWA 2B5YA 3TKRA 1RW1A 2IMFA 1ST9A 1PL2A 1PQNA 5CREA 3A2XA 3FR6A 2XBIA 3A5WA 4I8BA 4QL9A 1MDKA 3HJOA 2V32A 2F9SA 2H6ZA 1LBKA 2YPMA 3HHVA 2VD0A 3GRXA 3BBYA 5J3RA 1F3BA 4X0XA 1G6YA 3F4SA 3LG6A 5IO0A 2HXKA 4NHWA 2LV3A 3G7IA 2V6KA 2KP2A 1OE7A 2DMLA 3GKKA 3IR4A 4EE0A 4V2NA 2HQTA 4NV2A 2NDOA 2HZEB 3KM6A 3Q74A 1OE8A 1SKRB 11GSA 6GSVA 4JZQA 2JZTA 2V6OA 1GWCA 5ECOB 3TDGA 4DVCA 2IN3A 3GX8A 2LRTA 4XS4A 4V2LA 2HSMB 1T7PB 2EC4A 1THOA 3VI5A 1GUMA 1M99A 3UJ1A 4BVYA 3C7MA 2B5EA 5J4UA 5H5QA 2H1DA 3H79A 2P0GA 1I5GA 2LSTA 1ZGNA 4FO5A 2HNLA 3LJRA 1CQHA 4PURA 4F9ZA 1OVNA 1EEMA 4LL1B 1U6TA 1NHOA 2YWNA 1BQ7A 2JZSA 3ZRDA 3QAGA 1V98A 4HQZA 4YQVA 4TR4A 3H93A 4WR4A 5GSSA 4EO3A 1SKWB 1OYJA 3TB2A 1ILOA 1RK4A 3QFBC 4NMUA 1ZL9A 3P7XA 1A24A 5KEJA 3LEFA 2WCIA 6GSXA 1I9DA 3VPQA 4TXVA 4MF5A 1OKTA 2DIYA 5JCUA 7GSSA 2R2JA 5KN1A 2D2ZA 3IDVA 3LORA 1XOBA 4IKHA 5DJMA 1TRUA 2H6XA 1ABAA 2MYGA 3EMPA 4KGIA 5DALA 4WR5A 2GGTA 2B1LA 4XS6A 3TKPA 1OC9B 1GSUA 1SKSB 5AIXA 1GLPA 2AHEA 3K8NA 5DQYA 4MF7A 1A2MA 1RQMA 3FY7A 2WRTA 2YCDA 4HEA2 3KJYA 3CSIA 3CMIA 3W8SA 1TU7A 4XTSA 1SL2B 2E2GA 2E2MA 2FCHA 5DQSA 3J7Yb 1WE0A 3QAWA 2YZHA 2GLRA 4OD7A 1AQWA 4WBRD 3D4MA 1MDIA 1TRWA 2J9HA 1FHEA 3Q19A 4MJEA 4I6XA 3IRAA 4N30A 2GDRA 5G31A 4CHSA 1YZXA 4ZBAA 1TP9A 2VLTA 2YWMA 2BMXA 1HNBA 1JFUA 1O8XA 2ZUPA 3QDNA 3A2WA 2CQ9A 3CBUA 4PTSA 1Z6NA 1X5EA 4GTUA 3OR5A 4HI7A 1DBYA 1KTEA 1Q98A 2HZEA 4HZ2A 1G7EA 3IHQA 5HR2A 1PKZA 3HKRA 1EEJA 1BJXA 2WS2A 4IP6A 5D96A 4EDYA 3VWVA 1X5CA 3ZFBA 5B8AA 3F63A 2WZ9A 2FD3A 1SK2A 4POMA 4GRFA 1U88A 4EC0A 2MBTA 4O92A 3FZ4A 2MMOA 2LNSA 2QSIA 2HSMA 3C1SA 1O85A 9GSSA 4OO4A 1ACVA 4L8EA 3CXGA 1ERWA 1KEBA 2F8FA 5IMCA 4ZL7A 3WYWA 1UN2A 4F0BA 4I2UA 3IC8A 1N2AA 1TU8A 3P8WA 1V58A 3KMNA 5J9CA 2XC2A 3HZ4A 1GULA 1A8YA 5J9BA 3HCZA 5B7CA 3GKMA 1GUKA 2VL2C 4Q5FA 4PNFA 3M0FA 4HU7A 4Z7XA 3EINA 2K8SA 4F0CA 2C8UA 2HSHA 5HFGA 2CZ2A 1SJIA 3PPUA 3PGTA 3IPZA 3QPMA 1M9AA 2LQQA 3HJMA 3GL3A 2ZCTA 12GSA 1J0FA 1FB0A 2X99A 1Z5YE 1T00A 5EY6A 3F9UA 2GZYA 1SJ6A 1UA5A 5L71A 3CRUA 4KB3A 1ZOFA 3F6FA 4KCEA 3FR9A 4OFTA 1OC9A 2QC7A 3F4TA 2JSZA 2PVQA 4RI6A 2VCVA 1GL8A 2P31A 5B6NA 1HYUA 3GX0A 4HS1A 5KN3A 3FW2A 4IBPA 2GVPA 3RAZA 1AQXA 3QFAC 2DJKA 2O7KA 3BCKA 3DVWA 3E3EA 5DVBA 2K18A 1BG5A 2B5XA 4J56E 3ME8A 5A4WA 3ZL5A 4K6XA 5IM9A 3LYKA 5DBQA 3APOA 3NIVA 2DJJA 2EIOA 3UOMA 2K9FA 5CNWA 3U6VA 3KD0A 4IQ1A 1QMVA 4MDCA 3EE2A 1K0CA 4V2MA 2CVKA 3NZNA 3CSJA 4ZB6A 1MDJA 1O6JA 1TKDB 2VCXA 1IYHA 1GLQA 5A4UA 4MJCA 4KDYA 4FYUA 4WKWA 1Y25A 1J08A 2DJ0A 2C0FA 1F9MA 1EWXA 4NV5A 1IYIA 1GSFA 2X64A 2REMA 4MF6A 1MTCA 2V1MA 4AGSA 5GAND 4ILFA 3RHCA 3CRTA 19GSA 5G1LA 2IL3A 4L0WA 5CRHA 5ENUA 1W89A 3TKSE 2DSAA 3GHAA 3HVXA 1THXA 2KHPA 3O76A 1HD2A 5COHA 5CO3A 1S3DA 5FHIA 2H66A 1KBNA 4KSMA 3WGXA 3M1GA 1A8LA 4ML6A 4BWQA 5F0GA 1XIYA 4PNGA 3F6DA 1UVZA 2HRFA 1V57A 1GSDA 3FKFA 4TR3A 3EVIA 3ERGA 3KTLA 4EF0A 2C3NA 4XRDA 4KUNA 4FIWA 1SYRA 2FWFA 2YN1A 3ZIJA 1PA3A 1YQ1A 1WPIA 1T4ZA 1TJDA 4TRXA 4TW5A 1HQOA 5JWRB 17GSA 1JZDA 3L9VA 5HR0A 4JU5A 3KXOA 4BL7B 2HFDA 3FRCA 1EOHA 2YWOA 4BVXB 4EXJA 3O6TA 5C04A 4ISDA 1X0RA 5CRDA 5DJLA 1DSBA 1PRXA 3FK8A 4BA7A 4X1UA 2C3QA 1YY7A 3KCMA 4IW9A 4MJBA 1WMJA 5INYA 4WBJA 2AV4A 2GSSA 1SU9A 1TRVA 3F4RA 3MSZA 2VCTA 2LRNA 3CYNA 4YAVA 2OKAA 3PINA 2TIRA 3FR3A 1FW1A 4XHMA 2CAIA 3TCOA 4AF2A 2DJ3A 18GSA 1DE1A 5AIVA 4HQSA 3G7JA 4N10A 4IS0A 2FY6A 4J57E 4KW6A 1QGVA 2MMZA 3I9V2 2K6VA 3DWVA 1R7HA 1ZYEA 3RHBA 2FHEA 1GTUA 2A2RA 16GSA 3LFLA 4OMVA 2M80A 2GSTA 1R26A 1B9YC 3W8JA 5ID2B 1UC7A 3C8EA 3QAVA 1TK8B 3D6IA 4POKA 3WT1A 2DIZA 1WIKA 1NM3A 1EGOA 4I97A 3WGDA 1ML6A 1AW9A 4MMMA 3GSTA 1W4VA 4OCEA 2L5OA 2FUG2 4K7OA 5G30A 4GSNA 2QKEA 4H86A 1PKWA 3LYPA 1XBSA 3UL3A 4POBA 2ON7A 3GURA 1M2DA 5H5RA 3TKSC 1B8XA 2E0QA 5ELGA 4XCSA 2C80A 3Q6OA 1PSQA 3TUEA 3GN3A 3GUSA 2FWHA 2VUPA 2H0HA 4HUAA 2F8AA 5DAKB 4PGTA 4OCFA 5ECRB 1M7TA 14GSA 2G2QA 1PMTA 3TOUA 4HJMA 1R5AA 5ECNB 4XS1A 3TJJA 4D73B 5ELAA 2VO4A 2M46A 2JSYA 4G0KA 2N5BA 3MAKA 1JLWA 1V40A 1A2LA 2HI7A 3D0ZA 1GTIA 1K0AA 3HYPA 4ECIA 4K1FA 1QXHA 4KAEA 5ECPB 20GSA 4K7IA 2P5QA 1EGRA 1SYXA 3M3MA 1Z9HA 2K8VA 4BL7A 1PN9A 1F6MC 2UZ8A 3EMXA 4BVXA 1XZOA 4AJ6A 2LQOA 1VF4A 5CYYA 1TW9A 4QQ7A 3UBKA 1ZZYA 2O8VB 5ECQB 3UVTA 2LJRA 1OAZA 4L0UA 2QGVA 2F3MA 2GSRA 3I43A 1URMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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