2WB9A

Fasciola hepatica sigma class gst
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
210
structure length
210
Chain Sequence
DKQHFKLWYFQFRGRAEPIRLLLTCAGVKFEDYQFTMDQWPTIKPTLPGGRVPLLDVTGPDGKLRRYQESMAIARLLARQFKMMGETDEEYYLIERIIGECEDLYREVYTIFRTPQGEKEAKIKEFKENNGPTLLKLVSESLESSGGKHVAGNRITLGDLFLFTTLTHVMETVPGFLEQKFPKLHEFHKSLPTSCSRLSEYLKKRAKTPF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The 1.6 Angstrom Crystal Structure of the Fasciola Hepatica Sigma Class Gst
rcsb
molecule keywords GLUTATHIONE TRANSFERASE SIGMA CLASS
molecule tags Transferase
source organism Fasciola hepatica
total genus 83
structure length 210
sequence length 210
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2009-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2wb9A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2wb9A01
4KDYA 1PD21 2P31A 1KNGA 1SK2A 2V2GA 2LJRA 5G31A 3I69A 5D96A 1Z3EA 5J4UA 2GS3A 2P0GA 2XHFA 2WFCA 5AIVA 1A2JA 14GSA 2DIZA 4O5RA 3FZAA 1ZGNA 1O7UA 4RI7A 4WEYA 2CX3A 3HZ4A 2HFDA 3UEMA 1V2AA 3IAM2 2MMNA 3MAKA 2GSTA 1EV4A 3DIEA 4IQ1A 1X0RA 3KTBA 1SK0A 2IMFA 2ZCTA 4WR5A 2V41A 3RAZA 4JZQA 3N5OA 3UAPA 2BTOT 4DSQA 1J9BA 5AISA 2PPTA 4NHZA 4MPFA 3ZFBA 3TJKA 5LD0A 3UBKA 3TOTA 1NHOA 4WXTA 5ECNB 2JL4A 3C1SA 4MCUA 10GSA 1OC9A 18GSA 4POBA 5H5QA 2WJUA 2NVLA 4O7HA 4BVYB 2VCXA 3GRXA 4ECBA 4K0GA 1MDKA 1XWGA 4MABA 2YWOA 1PSQA 2HRKB 4KCEA 5DALB 2H0GA 3RPNA 2XBIA 3IC4A 1PKWA 2B7JA 1A2MA 3GIXA 1E6BA 2XBQA 4MF7A 2JADA 4IHUA 5B6MA 3DGQA 3PGTA 1SU9A 2V32A 3TRQA 2N5AA 4TR0A 3MWHA 1V9WA 3GKNA 3L0HA 1SKSB 3GYKA 1K3LA 4QQ7A 1TP9A 3M9KA 2YV7A 5DJMA 4ZIJA 3TGZA 2HQTA 2YWIA 1SKRB 3I43A 4MJBA 1TW9A 1WJKA 5IMCA 9GSSA 2LQQA 3UBLA 4TN8A 3CSIA 1ERUA 1M2BA 4AF2A 4WBRD 1TRWA 4GSNA 3QPMA 3CRTA 1FVKA 2YJHA 3NZNA 2PVOC 2JSYA 3RHBA 4N30A 2JU5A 2M80A 2O85A 4RUVA 5CRDA 1K3OA 2VL3A 4EE0A 2XPEA 5JWRB 6GSWA 1VF1A 6GSYA 3EU3A 4G10A 1JZWA 1MD4A 4AJ6A 2N5FA 3TB2A 1GSQA 4FYCA 2LTKA 3HA9A 1ZL9A 1XWAA 2MZCA 4EXJA 2AV4A 3O6TA 5IMFA 2GVPA 2FGXA 1M7TA 5COHA 4F03A 4ULXA 3BCKA 3VK9A 4MH3A 5IIZA 4BL7A 3ZZXA 1OKTA 1H4OA 1NW2A 2LSTA 1O6JA 4ZBAA 1T00A 4IP1A 1ZOFA 1WRYA 2CVKA 3IV4A 2LRTA 4OCEA 5G30A 2IMEA 11GSA 2H66A 3TJJA 4PX1A 1A8YA 3CYNA 2E2GA 2HSMA 2I9HA 4LL1B 5DJLA 2OA7A 4ML6A 4GF0A 4HQSA 2CAQA 2REMA 1QGVA 4G19A 1UVZA 1R4WA 1SJZA 3RBTA 2H70A 1EOHA 3IA1A 3FY7A 3LSZA 4ECCA 4K7OA 3SBCA 4F9ZA 5CRGA 2GGTA 5EVOA 3KEBA 1IYIA 4EUYA 5DCGA 2KP1A 3D6IA 1OC9B 2WB9A 3GV1A 2O89A 4MLYA 5F8BA 5B7CA 4XIHA 1IYHA 5ECRB 1M2AA 2LNSA 1EEJA 4D73A 2I1UA 4GQFA 3IXRA 3L9UA 1ZYQB 2VCZA 1WE0A 3H8QA 4EKZA 12GSA 5JCWA 3TRXA 2VLUA 4Q5FA 2IIYA 3DVWA 2VL9A 3AY8A 2YZHA 1VF3A 2YJ7A 2VOCA 6GSUA 3VURA 4MZCA 4K7NA 1AQXA 5ECMB 1JZRA 1K0OA 4OFTA 4FYUA 5ECIB 4V1Ap 5D93A 2DSAA 3SWLA 4KDUA 2NPBA 3IK9A 3HHVA 4N0ZA 5KN0A 3WYWA 1GWCA 2F8FA 1XZOA 1NHYA 5INYA 3M8NA 1XW9A 1RW1A 2FUG2 1N2AA 2JZSA 1TJDA 1W89A 4KX4A 3L4NA 4V2LA 2HRNA 3K8NA 3WGEA 5H5SA 3FRCA 4K0NA 4LL4B 5IO2A 2HNLA 4O92A 1X9SB 4ZB6A 4EL1A 2C3QA 3P8WA 5ECLB 2EIQA 3U6VA 1XWCA 1U3AA 1XOBA 1EV9A 4GCIA 1K0BA 2I4AA 4MJEA 4ECIA 5CP1A 2CVDA 2LRNA 3DVXA 3ZITA 2J9HA 4ZBBA 2B5YA 1S3DA 1GSUA 1GSDA 3F6FA 4L0UA 4BL7B 1O81A 2H6YA 4MMMA 3FZ9A 5HR2A 3E0UA 2H19A 5EL8A 4LMWA 3VWUA 3GHAA 3KD0A 3TJGA 4E8EA 2FD3A 4NPBA 1A23A 2LEGA 3D4MA 1WMJA 4JBBA 5CAXA 1GNWA 1SD9A 1Q4JA 1X5DA 3KM6A 1R26A 2DC5A 4V1Ag 3FR9A 3PPUA 1XPVA 2RLIA 4DSRA 1F3AA 5DAKA 1UC7A 3F63A 3KH9A 2CVBA 3EURA 3LYPA 5KN1A 1PGTA 1CQGA 5ECKB 2HSYA 1O85A 2NTOA 2ALBA 1GH2A 4KDXA 2LJAA 2OBKA 2VD1A 3R2QA 3EC3A 1XOAA 1JFUA 1T1VA 3RHCA 3FKFA 2MMOA 1M0UA 3A3TA 4TXVA 2WCIA 5HFKA 1XCCA 2K18A 1XVWA 3F8UA 3U5RE 2O7KA 5GAPD 2X99A 5J3RA 5CNWA 1QFNA 2GZZA 2YPMA 4ZL8A 2M72A 2B7KA 3HJPA 2C3TA 4D73B 4ECJA 4AJ7A 2WZ9A 4YQVA 5GSSA 2B1KA 2VM1A 3GSTA 3VWXA 2I3YA 2C0FA 3O3TA 3F0IA 2H8LA 4IBPA 3NOFA 4I2TA 3EYTA 2H73A 1F3BA 1T7PB 4BVXA 2GZYA 1SYXA 2P5RA 5GSTA 2QKEA 5D9TA 5IM9A 3IBHA 5HR3A 4POMA 2H30A 4Q5NA 1B4QA 4I8BA 2B5EA 2PMTA 3H4KA 1LJRA 1QMVA 3GMFA 5JWQB 3WGDA 1BX9A 1TRVA 3G9BA 1JLVA 4MF5A 3ERWA 1PL1A 3CSJA 1Z5YE 2V6KA 4F0BA 2G0FA 3GUSA 2D2ZA 2C0DA 4G0LA 3ZREA 2HYXA 4MJAA 2JSZA 3I9V2 2C3NA 4JR6A 2GSSA 2N5BA 5HR0A 3ERFA 5D9VA 2GQKA 5HQPA 2V1MA 2HLSA 4CDOA 4OMVA 4POKA 2UZ8A 1NM3A 1O73A 1MDJA 2JZTA 3P7XA 2H6XA 6GSSA 1TOFA 3FZ5A 3ZMLA 4N0VA 4DEJA 3M1GA 2A2SA 1VRSD 3LQ7A 4EC0A 4FH8A 4HDEA 1M2DA 1SK1A 4NV5A 1MEKA 2LJKA 2AUVA 2R2JA 1BG5A 2M46A 4HU9A 4JRRA 4PUAA 1HYUA 4ZL7A 1PA3A 3C8EA 1A8LA 1TU7A 2MBTA 2KLXA 2AB6A 4J2FA 3F9UA 1XVQA 3QFAC 1V98A 1FAAA 3IC8A 3QAWA 4JEDA 2TRCP 1FB6A 1PMTA 4OCFA 2WULA 1G7OA 2O8VB 4IP6A 5J41A 3ERGA 5E4WA 1S3AA 4TXOA 4WETA 1T4ZA 2YANA 5CO3A 5C04A 1ERTA 3HDCA 2MMAA 2YWNA 3HXSA 3FYGA 4TR4A 1OVNA 2H72A 2QSIA 1U88A 4I5QA 4X1UA 4CHSA 5AN1A 1ERVA 5ECQB 4NWYA 2JACA 1R5PA 2XPDA 4IGJA 1YY7A 3GURA 5DAKB 4HS1A 2E0QA 1ZCPA 4F0CA 5JCUA 5HR1A 3TKSA 4O32A 1FVJA 4K7IA 1ILOA 1GTIA 1V58A 3TKRA 4MF6A 1AAZA 3A5WA 3GKXA 4MP4A 4EO3A 5A4UA 1E2YA 1F9MA 2WGRA 4PQHA 1J08A 1AIUA 1QK8A 1TI1A 1I9DA 3LWAA 4HEA2 3DRNA 2MYGA 4USSA 1WIKA 2H6ZA 5DQYA 2CX4A 4DSSB 3LG6A 3J7Yb 3KP9A 4TR1A 6GSXA 4HJ2A 2PUKC 1THXA 5DQSA 4XS4A 3DXBA 1M9BA 2ZNMA 1FOVA 2K9FA 2AHEA 3GKKA 2LRCA 1ZMAA 1MTCA 2HRFA 5ENUA 3F4RA 1GTBA 1AW9A 2C0GA 1YQ1A 2DJ0A 2DMMA 3D21A 2GDRA 1H75A 4BVXB 3LEFA 2HT9A 3W8SA 2KP2A 3N9JA 3GA4A 3WT1A 4NAXA 2BJXA 4QL9A 1XW5A 5ELAA 2L5OA 4BWQA 2RUEA 1FW1A 1PRXA 2DMLA 3TJBA 3R3EA 2ZUPA 3G7JA 1SYRA 2JZRA 4NXIA 1EGOA 3QCPA 3ZTLA 3I6AA 2RM6A 4ZILA 5G1KA 4G2EA 4YH2A 3IDVA 1TI3A 1AQWA 3OR5A 2HZFA 4KSMA 1GTAA 4MA9A 1THOA 4XCSA 4YAPA 2F8AA 2OKAA 3GX0A 4TOPA 2GT6A 4J57E 1EWXA 1YF0A 4IW9A 4NMUA 2FA8A 3RPPA 4EVMA 1YDKA 4XS6A 1HNCA 1UN2A 3QAGA 3VFIA 2CZ3A 4GRFA 3LXZA 3UVTA 3NIVA 2YOIA 2C1YA 2GSQA 1GTUA 1LU4A 4K9ZA 5ECSA 1WWJA 1Z7PA 3UVHA 3IHQA 1TU8A 1PX7A 3LORA 2TRXA 3HJOA 4EDZA 2H76A 4MJCA 2FA4A 4FIWA 4OFMA 4XHMA 3TKPA 2EC4A 1S3CA 3LJRA 2KUCA 5ELGA 5E59A 3GX8A 4OO5A 1EZKA 2VO4A 1SJIA 1G6YA 16GSA 3QDNA 1FO5A 1OAZA 5ECPB 2IJYA 2YWMA 2AJQB 1XBSA 2YCDA 2L6CA 3M9JA 1XWKA 1K0NA 4KNDA 4TKYA 4PGTA 4TXOB 5FHIA 3TKSC 3UOMA 4F82A 1GSYA 1K0DA 3TCOA 4ISDA 2H1BA 3C7MA 4IELA 4PQ1A 3HKRA 4IKHA 3CTGA 2L5LA 4KGIA 2IFQA 2L4QA 2ON7A 2B3SA 3MNGA 3QAVA 1YZXA 2R3XA 4HJMA 4POLA 4ZBDA 2VM2A 3QR6A 2LKUA 2O87A 3H93A 2FWFA 5CRWA 5EPFA 5F06A 1G7EA 2L4CA 2MMZA 4HOJA 3D0ZA 3L9SA 5IMVA 4XS1A 2DLXA 3TDGA 4L5OA 3UARA 2EIRA 2GQLA 2HSNB 1TDIA 3EINA 3M3MA 1M9AA 1URMA 2Z9SA 5DDLA 2B1LA 3UIWA 3VWWA 4PTSA 2RUFA 2E2MA 4JE1A 3GH6A 1FG4A 2KOKA 2LQOA 3TJFA 1XWBA 3EMPA 3QMXA 3VI7A 5IOXA 4MH2A 4RI6A 4TR1B 3TUEA 2F9SA 5HFGA 3GTUA 4PNGA 8GSSA 3KCMA 3PR8A 1YF1A 1RQMA 1G6WA 1SL2B 2PBJA 4L0WA 6GSVA 4BWSA 3TOUA 3GSSA 2K8SA 1I5GA 4GSSA 1DSBA 3EU4A 2K6VA 2H1AA 3G7IA 2NDOA 1GNEA 1T4YA 1BYEA 2LS5A 1YJ6A 2G2QA 1QXHA 1GUHA 4RQXA 4BPYA 4MDCA 1A2LA 3M0FA 5ECOB 3PINA 5D8IA 2GQMA 7GSSA 4PNFA 3HVSA 5J5NA 1Q98A 3ME8A 3BJ5A 1Z7RA 2RM5A 4FYBA 3L78A 2FWEA 2VAFA 1UA5A 2HSMB 2FWGA 5J9BA 3F3QA 4EDYA 2VCQA 2HXKA 3CSHA 17GSA 5G5EA 3C73A 2FCHA 1SL1B 1N8JA 3F4TA 4JR4A 5IPGA 4MZWA 1YEPA 1OC3A 5F0GA 1TTZA 2IWTA 4WKWA 1ML6A 2DJJA 3DYRA 1GSEA 1VF2A 4WF5A 2FWHA 5B8AA 4I6XA 4IVFA 4TR3A 1EGRA 5BMUA 1CQHA 3GH9A 1GL8A 2X8HA 3ISOA 1WP0A 5D73A 5DCHA 2V6OA 4WBJA 1O8WA 1FB0A 1YKAA 1NSWA 4JU5A 4MPGA 3RDWA 5JCGA 3P90A 4L5LA 1ABAA 1OC8A 3GNJA 3W8JA 1F6MC 1GLPA 3CMIA 1OYJA 1U3IA 3APOA 3CBUA 4IN0A 4EF0A 2CV4A 1ZYEA 2IFQB 2PWJA 4WR4A 4TVEA 2DJ1A 3Q19A 3APSA 5CREA 1U6TA 3UMAA 1OKDA 5CYYA 1TK8B 1XXUA 2H01A 4TRXA 2HI7A 2DJ2A 1B48A 3CTFA 4GLTA 3MDKA 3KMOA 5DBQA 5IPHA 4ML1A 1K0AA 1BAYA 1QUWA 5FT3A 3F4SA 3WD6A 1B9YC 5C00A 4ID0A 5G1LA 1SD8A 4CW9A 3LYKA 3FW2A 1JHBA 4LLRA 2H1GA 3FZ4A 2PGTA 4HI7A 4OWYA 1HNAA 2OACA 1G0TA 2FHEA 3GTUB 4PURA 2H0HA 2C0EA 4L8EA 2IPAA 4MZBA 4OD7A 1JLWA 3UL3A 4X43A 3KMNA 1B4PA 22GSA 4J56E 1ST9A 3D4TA 2NBSA 2WRTA 4F2IA 2L59A 3PH9A 2OBIA 2PERA 1GP1A 1B9XC 2C4JA 2DIYA 3DEXA 3GL5A 3F3RA 4Q5QA 2B6MA 2VL2C 4ZB9A 4BA7A 3FEUA 3HYPA 2VCTA 5F07A 1WPIA 13GSA 3UJ1A 4HU7A 2HZEA 5ECHB 3L9VA 1XW6A 5KEJA 5IMAA 5A5KA 3GFKA 4KF9A 4MK3A 4XTSA 4LA1A 3FR3A 1T3BA 1PL2A 5IO0A 3LGCA 3IAS2 1X9WB 3S9FA 2QC7A 3VI5A 1PN9A 3QD9A 3TKQA 2GTUA 1Z6MA 4P3YB 2A4VA 3ME7A 4N10A 3KXOA 4KW6A 3C71A 4GWRA 1SENA 2OE1A 3HJMA 2HSHA 1AQVA 1SJ6A 5D9XA 4FQUA 2R4VA 4OFNA 3HCZA 4G9HA 1BEDA 2DBCA 4PXOA 3D22A 3IOSA 3IR4A 5H5RA 3HD5A 4GSTA 4V2MA 1V40A 2XC2A 4NHWA 2IMKA 5G2ZA 3GN3A 3ZVJD 3ZLPA 2CT6A 2R37A 2CQ9A 1K3YA 5IOWA 2PVQA 2VLTA 3VPTA 4HZ2A 4H86A 2WDUA 3A2XA 3QOUA 4I2UA 3BOAA 2FNOA 2H1DA 4K2DA 1XFLA 2AYTA 4NV2A 4KE3A 5LCZA 4I97A 3LFLA 3ZIJA 3GKMA 2CAIA 3FR6A 1F2EA 4LMVA 1GUKA 1VF4A 2P5QA 3IRAA 5GAND 1A24A 2VCVA 3HY2A 2WS2A 2DJKA 4ACSA 2QGVA 2AAWA 5F05A 2LNTA 3BBYA 2LUSA 5ABRA 1OE8A 5IQYA 3H79A 4HZ4A 1MD3A 1LBKA 1O8XA 5ID2A 19GSA 3BCIA 1DBYA 2RIIA 2FLSA 2VLVA 2B5XA 3GL3A 1Y25A 5L71A 3ED3A 3ZRDA 1EOGA 2R6KA 3Q18A 1F37A 5KN3A 1VGLA 4FO5A 5HFIA 4YQUA 2H74A 3DD3A 4IS0A 5LNKe 2IMDA 2BMXA 3EE2A 4HQZA 4Q5RA 4QL7A 1QQ2A 4AJ8A 1TK5B 1AUCA 4GTUA 5IMDA 3FHKA 1HNBA 1AC1A 5CRHA 3D5JA 5B8BA 1DE1A 1TRUA 4K1FA 1Y6EA 4ZL9A 1C72A 1HD2A 2HRAA 4KA0A 3WT2A 4K6XA 4KB3A 1R7HA 3VLNA 1OE7A 4RQRA 5J9CA 4IJ3A 4ILFA 4DVCA 3IE3A 3MSZA 1BJXA 4KAEA 4V2NA 2HZEB 3LXTA 1PQNA 3CXGA 3DWVA 4KSOA 3KTLA 5A4VA 4G0KA 1TRSA 1YKCA 2YP6A 4PUFC 1SL0B 2YN1A 3C1RA 1SKWB 4K8MA 4KH7A 2H0IA 1TKDB 4ZXGA 3ZMKA 2VIMA 4X0XA 3APQA 2C80A 3Q74A 5JWOB 1GRXA 4G0IA 1V57A 2IN3A 2F3MA 2R5GA 3TRPA 1ON4A 4OO4A 2IL3A 1PKZA 2A2RA 5AGYA 4XRAA 1GLQA 4GQCA 1AXDA 3ZL5A 1KEBA 1GUMA 2J23A 3EMXA 1PX6A 2GSRA 3F6DA 3G7YA 1B8XA 1GSFA 2F51A 4HUAA 2TIRA 4WF4A 1M99A 1EEMA 1GSSA 3VWVA 2OJLA 5KN2A 1HQOA 3BD2A 3W6GA 3H1NA 4TW5A 5B6NA 1KBNA 1X5CA 4XS4B 3IPZA 3IK7A 3TKSE 1WOUA 1MDIA 4YQMA 4AGSA 1Z6NA 1KTEA 2IMIA 3V1WA 4KCAA 2PN8A 3KIJA 1BQ7A 3O76A 4Z7XA 2H75A 2ON5A 1ACVA 3WGXA 5D9WA 3ZVJA 4PQIA 2YNXA 4GXZA 1J0FA 2C8UA 2CZ2A 4BVYA 2VD0A 4KUNA 4ZB8A 2X64A 1JZDA 2I81A 2HRKA 5DALA 1EP8A 2OE0A 2L57A 2MBSA 2VCWA 3HZ8A 3HVXA 5IMZA 4IQAA 1JZOA 2DJ3A 3E3EA 3ZFLA 1K0CA 1A0FA 4YAVA 1W4VA 1K0MA 3J7Yk 3FK8A 2L6DA 3JCML 2VL2A 1FHEA 5ID2B 1TK0B 1X5EA 2KHPA 2LV3A 1TXXA 3KP8A 1USBA 1XIYA 1R5AA 5G5FA 1RK4A 3US3A 2GT5A 2H71A 3EVIA 5FWGA 2OE3A 5A4WA 1U87A 2EIOA 1ZZYA 1T8EB 20GSA 5AIXA 6GSTA 2VUPA 2OADA 1A0RP 3KH7A 2E7PA 3VPQA 4XRDA 3EWLA 1ERWA 3E9JB 2K8VA 3CRUA 3QFBC 3DMLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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