2YV9A

Crystal structure of the clic homologue exc-4 from c. elegans
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
285
structure length
285
Chain Sequence
AMAEAYQIQSNGDPQSKPLLELYVKASGIDARRIGADLFCQEFWMELYALYEIGVARVEVKTVNVNSEAFKKNFLGAQPPIMIEEEKELTYTDNREIEGRIFHLAKEFNVPLFEKDPSAEKRIENLYRNFKLFLRAKVEFDKGKKEPSRVEDLPAQIKVHYNRVCEQLSNIDQLLSERKSRYLLGNSMTEYDCELMPRLHHIRIIGLSLLGFDIPHNFTHLWAYILTAYRTAAFIESCPADQDIIHHYKEQMNLFTNQRETLQSPTKTHTIPEKVLSDIRVKGLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal transport
source organism Caenorhabditis elegans
publication title Comparison of vertebrate and invertebrate CLIC proteins: The crystal structures of Caenorhabditis elegans EXC-4 and Drosophila melanogaster DmCLIC
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chloride intracellular channel exc-4
total genus 93
structure length 285
sequence length 285
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2yv9A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2yv9A01
4PGTA 2KP1A 4ZL9A 3C73A 3KGKA 2C3QA 2OADA 2MZCA 3ZFBA 4KH7A 3RHBA 20GSA 3CBUA 3ZIJA 2AJQB 3ZRDA 4HQZA 4GCIA 4KGIA 4LL4B 2DJ3A 3IC8A 2CX3A 4EDYA 4BPYA 5D9TA 4HOJA 3KM6A 3I43A 3HA9A 4XS1A 1YDKA 2AV4A 1OC9A 4DSQA 2DJ2A 4Q5FA 1GL8A 2PVOC 3A2WA 1ERWA 5J5NA 1XOAA 3K8NA 1TK8B 1ERTA 4PNGA 3ZLPA 5ECIB 4ZBAA 2GZPA 3J7Yk 3FYGA 2GT5A 4JR6A 1DE1A 3QFBC 3H8QA 2JZTA 4LL1B 2KLXA 2HSMB 2LRTA 1F37A 6GSSA 4F82A 3DMLA 1KNGA 4BWSA 4Q5RA 2MBSA 1QQ2A 3N9JA 1A8YA 1MD3A 4AGSA 4JRRA 2M46A 4GWRA 5IM9A 3GHAA 2WGRA 2YWNA 2E2MA 2H66A 5ECSA 3C1RA 2YJHA 4EO3A 5IOXA 1N2AA 3IDVA 4TXOA 3VFIA 3H1NA 2B3SA 4JBBA 1Z3EA 4OWYA 1GRXA 2AYTA 4MH2A 2P5QA 2G2QA 3IBHA 4XCSA 5D9WA 4TR1A 1YEXA 4PX1A 3H4KA 2VCVA 1YY7A 4KAEA 1Z6MA 2DMLA 2GS3A 3HJMA 3MNGA 2BJXA 3G7YA 4NAXA 5IPGA 3KEBA 5KN2A 3TRQA 2IL3A 1B8XA 4F9ZA 3KH9A 3HVSA 3UBLA 2LJKA 3F3RA 4BL7A 10GSA 3HCZA 3FKFA 2LNSA 2EC4A 2C3NA 3UVHA 1XWGA 2WDUA 1GSQA 1OE7A 2WJUA 1GSYA 1UVZA 2R37A 3US3A 13GSA 1KBNA 3GMFA 4POKA 1V57A 5LD0A 4TXVA 3LWAA 1ILOA 4N0ZA 5HR2A 2GVPA 3VK9A 3EU3A 3FZ4A 5KN0A 4N0VA 5ECKB 1O85A 4K8MA 5D8IA 3G7IA 1ZCPA 1O8XA 3GFKA 4PTSA 2LRNA 6GSWA 3RPPA 3IHQA 2ZNMA 1K0MA 3QR6A 2H70A 2BTOT 2RM6A 4V2LA 2OA7A 1A8LA 1CQHA 3KP8A 1J0FA 4WBJA 1GLQA 2VD1A 2IMIA 3VPTA 4XS4A 2E7PA 3VWWA 1GLPA 5JCGA 2HLSA 4RQRA 1TI3A 2AB6A 2VCZA 4KNDA 1AAZA 1K3OA 1M7TA 5JWRB 2NPBA 7GSSA 3I9V2 4FYUA 2H71A 1FHEA 1R5AA 5FHIA 1ERUA 1U6TA 3KZQA 3MSZA 1MDKA 3A3TA 1GUKA 2L5OA 4IN0A 2H1BA 4ZBBA 2H73A 4OD7A 5HQPA 2FHEA 2H8LA 1F9MA 3GKKA 1ZOFA 3I6AA 4V1Ap 5DAKB 2YWMA 3PR8A 3GNJA 5GZZB 4K7IA 2ON7A 3P8WA 1XIYA 3ZTLA 5AN1A 1EOGA 4WR5A 4ZL8A 1A0RP 1ZMAA 4TR3A 3TKSC 14GSA 5CP1A 5IMVA 1SJZA 3KD0A 4OFTA 1XBSA 6GSXA 4ID0A 1QK8A 4AJ7A 5ECOB 1XVQA 3KTBA 4HS1A 4DSSB 1UA5A 5GSTA 2GSQA 2OBKA 3WYWA 2PUKC 3C8EA 4EC0A 1SD8A 2M80A 4ZIJA 4MJAA 4ACSA 4TR0A 2HZEA 2ES7A 3F4SA 3ZL5A 4MPFA 1SK1A 1HD2A 5IMAA 2LS5A 1GUHA 1JHBA 3EC3A 5DDLA 4P3YB 4MZCA 2HRKB 3TB2A 1T4ZA 4G2EA 4ECBA 3G7JA 3NIVA 1HNBA 1ON4A 2LRCA 3G9BA 5GSSA 1B4QA 3CSJA 3HJPA 3O76A 2K9FA 3PINA 5HFIA 1DE2A 2H1GA 1Z5YE 3VWXA 3U5RE 2LQOA 1M9BA 4IW9A 1W4VA 1CQGA 1MEKA 5F07A 1QXHA 2JACA 3L4NA 2H6XA 2B7KA 3LYPA 3UAPA 2YJ7A 2C0GA 4POBA 5KN1A 1V9WA 2IMFA 5DQSA 1K0NA 1HNAA 1GTUA 2GLRA 2VOCA 1ZYQB 1NW2A 1VF4A 2H76A 4IS0A 1EP8A 4KA0A 1FVJA 1RK4A 4IVFA 2RIIA 2LEGA 5DCHA 2D2ZA 2FY6A 2XBIA 6GSTA 5ABRA 3ISOA 2DC5A 4K0NA 3TJBA 2YWIA 1O6JA 4KCEA 4FO5A 5LNKe 4G0LA 1B48A 3LQ7A 2GZYA 1VF2A 2GTUA 1JLVA 3IAM2 1HYUA 2H74A 3GUSA 1YZXA 2QSIA 3CXGA 3M9KA 2X8GA 4ULXA 5JCWA 3L9VA 1MD4A 2XC2A 4IJIA 3HDCA 3VI7A 3BOAA 2OBIA 3L0HA 1M2BA 3FZAA 3AY8A 4HQSA 1QUWA 1TTZA 3IPZA 6GSYA 3DWVA 1PSQA 8GSSA 3F8UA 3GRXA 4ISDA 4WXTA 4IQAA 2GQKA 2YNXA 5EVOA 1Z7PA 2DBCA 3BCKA 4F0CA 1OC8A 1J9BA 2CAQA 4RI6A 2CV4A 4L5LA 2FWFA 2MBTA 1XW9A 4I2UA 3R3EA 2TRXA 4O7HA 2OE0A 1GSFA 4FH8A 2FLSA 3GV1A 2C4JA 3P90A 1BYEA 1SU9A 1EGOA 3QPMA 5ENUA 4JU5A 4L5OA 2YPMA 3BD2A 1BG5A 3IR4A 3F9UA 1PL2A 3A5WA 4Q5NA 5ELGA 3CYNA 3VLNA 4JE1A 3LXZA 2I81A 4ML1A 3CRUA 4H86A 3ZZXA 2JADA 5G30A 1ZGNA 4ECIA 3EWLA 2MMZA 2C0EA 4K2DA 4PXOA 3UARA 3P7XA 5B8AA 3SBCA 1XW6A 1Y6EA 5G5EA 1GNEA 1A23A 2A2SA 2GZZA 3KMNA 1PN9A 1OC3A 3ZVJA 3CSHA 1G6YA 2HYXA 1BJXA 4QL7A 3RAZA 4EDZA 1X9MB 2PBJA 3WD6A 1SJ6A 2RLIA 3LGCA 2H30A 4IQ1A 3V1WA 2IN3A 3IRAA 5FWGA 4PURA 2CVBA 2HRFA 2I4AA 3GTUB 3PGTA 4D73A 3JCML 1WE0A 3KIJA 4G0IA 4XRAA 2DSAA 3OR5A 3IXRA 2GGTA 5IQYA 4CDOA 2OKAA 4IP6A 4NMUA 4MABA 1MTCA 4KB3A 2HT9A 2ZUPA 1U3IA 3ERFA 2DIYA 5CREA 4TRXA 2FWEA 4KDUA 1EP7A 5A5KA 4ECCA 1T4YA 4OO4A 4ILFA 3ZVJD 5G5FA 2VL2C 3FY7A 1OVNA 3GA4A 1QMVA 2H6ZA 3KH7A 22GSA 5CRGA 5A4VA 4NV2A 1LBKA 2VLUA 5LCZA 1H75A 5ECHB 4JZQA 1AW9A 3IK7A 5D73A 3FHKA 5ID2B 5G1KA 2VL9A 3UL3A 2YANA 3KCMA 3EYTA 4RI7A 1BQ7A 4ZB9A 3APOA 1SYRA 3HJOA 1X5DA 4OCEA 2KUCA 5JWOB 5AGYA 2B7JA 4TKYA 4YAVA 3LEFA 4N10A 4EVMA 1GTAA 2B5EA 4HI7A 4BVXB 4OFMA 2O8VB 2P0GA 1ACVA 3HHVA 4LMWA 4HZ2A 2YZHA 2MMOA 2L5LA 5DCGA 1SYXA 1K3LA 3RPNA 5IIZA 3C7MA 3Q74A 1E6BA 1OKDA 3GN3A 1K0AA 3BBYA 4K7OA 3GURA 2QKEA 1HQOA 4MP4A 4J2FA 5D96A 2RUEA 1F3AA 1NHYA 1TU7A 2C3TA 2CQ9A 2YZUA 1FB0A 1DUGA 3EVIA 4HZ4A 1A2MA 3QD9A 3L9UA 1I9DA 1AXDA 5HFGA 1XXUA 1LU4A 5J4UA 1PX7A 4GSTA 2C0FA 4MJEA 4ML6A 4V2MA 1G7OA 3TJJA 1O7UA 4I8BA 1F2EA 5IO0A 2F9SA 1ML6A 4PQ1A 3KJYA 4FYBA 3DIEA 3FRCA 4USSA 1S3DA 3S9FA 1H4OA 1GSDA 2X8HA 2FWGA 3FZ5A 1TU8A 4WF5A 2WB9A 1QFNA 3TUEA 2DMMA 3E3EA 2HNLA 5DVBA 2HQTA 2PVQA 4O5RA 2ALBA 1TK5B 4N11A 1BEDA 3FR3A 3CTFA 4F03A 1I5GA 3ZMLA 2V6KA 4EUYA 5B6MA 5DJMA 5ECQB 2VD0A 4MPGA 4NHWA 1OAZA 5CNWA 4XRDA 1TRSA 1U88A 2NVLA 4ZILA 5HR1A 5J3RA 3O3TA 2P5RA 2J9HA 3RBTA 1WIKA 4Z7XA 1Z9HA 2DJ0A 2YWOA 3P2AA 1V2AA 3F3QA 3PH9A 2VCQA 1OC9B 3HZ8A 3ZITA 3HZ4A 1TK0B 2PU9C 1K3YA 2XBQA 4YQMA 4K7NA 4XS6A 1G7EA 1XCCA 4NV5A 1NM3A 4KF9A 1O81A 2EIOA 3DD3A 3FK8A 4FQUA 2CVDA 1SKRB 3ED3A 1WP0A 4G10A 1RW1A 1EV4A 3APQA 3VWVA 4I6XA 5DQYA 2R6KA 1TP9A 4GTUA 4I5QA 2F8FA 2BMXA 2GDRA 3D6IA 1M2AA 1QGVA 1GTIA 3ZREA 5F06A 4RUVA 3QMXA 2K6VA 1TW9A 2FD3A 2OJLA 1USBA 3KP9A 2YV9A 3NZNA 3QOUA 4MLYA 4QL9A 4F0BA 2L57A 4MF7A 5J9BA 2VL2A 4TXOB 2JSZA 2LJAA 2C80A 2JSYA 4RQXA 2CT6A 3LFLA 5A4WA 2LJRA 1T00A 18GSA 2R5GA 3DVXA 5H5SA 2GQLA 1T7PB 3VPQA 4TR1B 2EIQA 2KOKA 4IBPA 3N5OA 2LTKA 3J7Yb 2IMKA 5B7CA 3H79A 1JZRA 3KXOA 3MWHA 4MF6A 1BX9A 2Z9SA 3GSSA 3GIXA 1DBYA 1EWXA 3D0ZA 5EY6A 4KCAA 1SL1B 1GUMA 1YJ6A 1XWCA 5DJLA 1GNWA 5AIVA 1URMA 3EINA 2IPAA 3O6TA 2GSRA 2L59A 1X9SB 3LORA 3Q18A 4L0UA 1UN2A 1TKDB 3GTUA 2HE3A 1YF1A 4DSRA 1Z7RA 5IMCA 2XHFA 1X9WB 2R4VA 3GX8A 5D9VA 4G9HA 4NPBA 4ZL7A 5JWQB 2XPEA 2E0QA 4GSSA 2A4VA 3HXSA 4K1FA 1GULA 2LKUA 4MH3A 2VLVA 2VCTA 3ME7A 1IYHA 1V98A 1T8EB 1FG4A 1WPIA 1SKSB 1THXA 3FW2A 5D93A 5G31A 4BVYB 2R2JA 2HSMA 3W6GA 3KMOA 1GWCA 3WGXA 1TJDA 2G0FA 1RQMA 1WWJA 5ECLB 4ZB8A 1DSBA 3BCIA 5ID2A 5KEJA 3QAWA 3GL3A 3ZIVA 1LJRA 2HSHA 5F05A 4PQIA 3TCOA 2E2GA 3W8SA 4AJ6A 1G0TA 1A2LA 2CA8A 4IHUA 4BVXA 5FT3A 2OE1A 3LXTA 4EF0A 4KDXA 2WCIA 3M8NA 4OO5A 2FA8A 5F8BA 4YQVA 3F6FA 3RDWA 2MYGA 2VCXA 1OYJA 1M2DA 4MDCA 1PKWA 5ECPB 4GQFA 1Q98A 4CHSA 1A2JA 1THOA 1AC1A 3ERGA 3IA1A 4X1UA 3CRTA 2WRTA 2LV3A 2CX4A 1TRVA 1XWBA 2FGXA 2O85A 1YF0A 1EEMA 2H6YA 2DJKA 1SENA 4KSMA 3LYKA 3SWLA 1E2YA 4MMMA 4OMVA 1T1VA 1KTEA 1SD9A 2WS2A 2FUG2 3C71A 3DKSA 4L8EA 5ECRB 3M1GA 1A0FA 3HVVA 4LMVA 1XPVA 2HRAA 2IMDA 4BA7A 4WETA 1GH2A 4PUAA 1PA3A 2UZ8A 2HZEB 2OACA 2JZSA 3NOFA 5KN3A 5COHA 1GSEA 4X0XA 1FVKA 3GL5A 1XVWA 1ZYEA 3TKQA 1ZL9A 4HUAA 2YCDA 2MMNA 2C8UA 2O7KA 2PN8A 2PWJA 4KE3A 4MK3A 3UJ1A 3MAKA 3GKNA 1ZZYA 2VUPA 4TW5A 1KEBA 1TOFA 5EL8A 1AQVA 4I2TA 4EKZA 5J9CA 2VLTA 3GSTA 2HSNB 4YAPA 4KW6A 4YQUA 3FZ9A 5IPHA 3EMPA 2JZRA 3VI5A 2HI7A 5DALB 3EMXA 4POMA 3TOUA 3F6DA 4J56E 2X8CA 4OFNA 3TRPA 5H5QA 4TOPA 1R4WA 3PPUA 1G6WA 2KP2A 1XWKA 1GTBA 5DAKA 1PRXA 3HD5A 1F6MC 4IGJA 1O73A 3D4MA 4PQHA 3TKRA 2P31A 3VURA 12GSA 4K9ZA 2L4CA 2RM5A 3GYKA 1FO5A 3QFAC 4IELA 2VL3A 2O89A 4WEYA 3W8JA 17GSA 1K0BA 2DLXA 3TRXA 2GSTA 3WGDA 3UMAA 4GXZA 3LJRA 2K8VA 3F0IA 4DSSA 2KHPA 4GRFA 4WBRD 4MZWA 2OE3A 3APSA 4ZB6A 3TGZA 1ST9A 1SKWB 3C1SA 9GSSA 4J57E 5CAXA 1AQWA 3TDGA 1TDIA 1U3AA 4KDYA 4I97A 4JEDA 1PMTA 2X64A 3FR6A 1X0RA 1MDIA 2IFQB 4O32A 5GAPD 5G1LA 5CYYA 1FOVA 3TKPA 3GH9A 1YKAA 3GKXA 3A2XA 4XHMA 5GAND 2HRKA 3DVWA 2O87A 2F51A 5ECNB 3QDNA 4EL1A 4CW9A 1Y25A 3IAS2 2V41A 4TVEA 2H1DA 3IC4A 1O8WA 1T3BA 1EEJA 4HU7A 5JCUA 2AAWA 3QAVA 1NSWA 1JLWA 3LG6A 3TJGA 3HYPA 5INYA 1ABAA 2HFDA 3H93A 1EV9A 2I9HA 2HSYA 4BWQA 1X5CA 1TRWA 3M9JA 3DEXA 1J08A 4HJMA 4TN8A 5DBQA 1HNCA 5F0GA 2B5XA 3IOSA 3RHCA 2YP6A 4NXIA 3GX0A 5B8BA 4MF5A 2LNTA 2WULA 2JL4A 3I69A 2FNOA 3CTGA 3R2QA 1PKZA 1EZKA 3QCPA 3L9SA 4WF4A 19GSA 2R3XA 4WR4A 4IJ3A 3L78A 1PD21 3UIWA 6GSUA 2TRCP 1JZWA 3MDKA 4BVYA 1SL2B 1PX6A 1JZDA 5CRHA 3ERWA 2PGTA 2XPDA 1XZOA 1VF1A 3ZMKA 2YN1A 3Q6OA 1F3BA 4AF2A 1EGRA 4D73B 3TOTA 2IIYA 2V6OA 3KTLA 1WOUA 3HY2A 5ECMB 1YQ1A 2IMEA 4GQCA 2N5BA 4MA9A 1GSUA 1SJIA 2V2GA 2VO4A 2GT6A 4L0WA 2V1MA 2J23A 3D22A 4GSNA 2WFCA 3VWUA 2L6CA 2H1AA 5E4WA 1BAYA 4KX4A 5EPFA 4DEJA 1JFUA 3BJ5A 2LUSA 4IKHA 1AQXA 2I1UA 1XW5A 4MJBA 1V58A 1OE8A 4ZBDA 3QAGA 3EU4A 5G2ZA 2H0HA 4GF0A 3A2VA 1M99A 5E59A 5AIXA 5IOWA 3HVXA 1K0CA 3F4TA 1B4PA 5IMZA 1Z6NA 5C04A 3DXBA 3CSIA 2YOIA 3DRNA 2DIZA 4G0KA 4NHZA 5A4UA 3U6VA 4ECJA 5CO3A 5AISA 2PMTA 2VAFA 1B9YC 11GSA 3DGQA 2QGVA 5HFKA 4PUFC 4POLA 2H0IA 1TI1A 3TKSE 3TJKA 1NHOA 5L71A 4HDEA 2VM1A 2B6MA 2ZCTA 1YEPA 6GSVA 2HZFA 2H19A 1TXXA 2DJ1A 5IO2A 2DJJA 3GH6A 2JU5A 1S3AA 4HEA2 2L4QA 5B6NA 3M3MA 2NTOA 3ME8A 2B1LA 2FA4A 4N30A 2WZ9A 2V32A 3DYRA 2N5AA 5CRWA 1V40A 3HKRA 2PERA 3UEMA 4ZXGA 2GSSA 4BL7B 3IK9A 1EOHA 2CAIA 2FCHA 2C0DA 4OCFA 1C72A 4K0GA 5C00A 2CZ3A 2LQQA 5BMUA 2VIMA 2YV7A 1U87A 2M72A 1W89A 3Q19A 1GP1A 3WT1A 3FR9A 16GSA 1SK0A 1FAAA 3FEUA 1MDJA 4PNFA 3ZFLA 1GSSA 1K0OA 2A2RA 1B9XC 5DALA 1YKCA 3F63A 1K0DA 4KUNA 4GLTA 3M0FA 5ELAA 2I3YA 1IYIA 4MZBA 2F3MA 4G19A 1SK2A 1VGLA 2B1KA 4HU9A 2HXKA 1R5PA 2TIRA 4X43A 4XS4B 2N5FA 5H5RA 2QC7A 2REMA 4V2NA 4QQ7A 1WRYA 4XTSA 3TJFA 1R26A 5CRDA 3UVTA 3GKMA 2RUFA 1XOBA 2H75A 1PL1A 3UBKA 2K8SA 4LA1A 3WGEA 2GQMA 4XIHA 1PGTA 5D9XA 4YH2A 2C1YA 3EURA 2NDOA 4EE0A 4JR4A 1VRSD 4NWYA 3D5JA 4K6XA 4FIWA 2LSTA 4E8EA 3CMIA 3EE2A 1XWAA 4WKWA 2IFQA 1SL0B 1Q4JA 2IWTA 4TR4A 5IMDA 4E8HA 4KSOA 2H72A 1FW1A 4V1Ag 2IJYA 3IV4A 1M0UA 1ERVA 4DVCA 1A24A 2ON5A 1AUCA 4MCUA 4IP1A 1WJKA 4HJ2A 3D21A 1WMJA 3IE3A 1R7HA 1N8JA 3E0UA 2VCWA 1PQNA 4O92A 5J41A 4Q5QA 1OKTA 2K18A 2F8AA 3E9JB 4F2IA 2CZ2A 1FB6A 1UC7A 3WT2A 4AJ8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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