2FNOA

Crystal structure of a glutathione s-transferase (atu5508) from agrobacterium tumefaciens str. c58 at 2.00 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
239
structure length
239
Chain Sequence
HHHMEDGMNTFDLYYWPVPFRGQLIRGILAHCGCSWDEHDVDAIEGLMDCGAEKQPVAFMGPPVLIDRERNFAISQMPAIAIYLGERLDILPATVEGRTLSAKIVNDANDVLDELTLNGGREMWTPEKWQEFVPRLQKWIRIFADTGARNGLSAASGFMLGTEKIGVADIVTAILWTTVADRFPAIKGIIEDTSPIIWGLSRRVVATAPLAALNSKSFEEYGNAYCGGEIEKSLRKVAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative structural analysis of a novel glutathioneS-transferase (ATU5508) from Agrobacterium tumefaciens at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Agrobacterium tumefaciens
molecule keywords AGR_pAT_752p
total genus 82
structure length 239
sequence length 239
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2fnoA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fnoA01
4POKA 3HVSA 2H76A 5DJLA 2K9FA 5IOXA 4XS4B 1MTCA 2AUVA 3AY8A 4MF5A 3VWVA 3WGDA 5CRDA 2ALBA 2DSAA 3IE3A 6GSSA 2B1LA 4AF2A 1PMTA 5ECSA 1QK8A 1ZYQB 2N5BA 1F3AA 3HVXA 3KM6A 2PU9C 1TU7A 1FW1A 1SL0B 5C04A 1ACVA 4KE3A 3ZTLA 3KMNA 3GMFA 3TKSA 1AIUA 1XWGA 3ZRDA 2XPEA 3MAKA 1AXDA 2NDOA 1XWBA 1ERUA 4MJEA 1GSYA 4V2MA 3DVWA 4BWQA 4PURA 4NPBA 1MD4A 2O8VB 3KCMA 3IPZA 2R5GA 2FGXA 4MH2A 3F4RA 4BA7A 2L5OA 1A2LA 4JRRA 4LMVA 5AGYA 3CSHA 3F0IA 5KN3A 4V2LA 4HS1A 1WMJA 4IJIA 4KX4A 5IPHA 4FYBA 2LRCA 3QOUA 4KCEA 4ZIJA 2HZFA 4OCEA 3IC8A 5J3RA 4EVMA 4CHSA 5D96A 1YJ6A 4IVFA 2IFQB 3G7JA 5FHIA 4L5LA 4GSSA 2BJXA 2X8CA 1TI1A 3PGTA 4MLYA 2GS3A 2VD0A 3CRUA 3KEBA 2E2GA 4KF9A 4IS0A 1WE0A 1B9XC 3A2WA 1MDKA 1LU4A 3L0HA 1ERWA 5HR1A 3NIVA 5G1KA 3GKNA 4KDYA 1UVZA 1WRYA 1RK4A 1BQ7A 1VF2A 1F2EA 1XW9A 1FG4A 5DDLA 4ZXGA 5IO0A 1OC8A 3UARA 1WWJA 3LORA 2PMTA 2K8SA 5B6NA 5CRGA 4WBJA 4G0KA 4I6XA 2C3NA 3TKSE 5L71A 1GNEA 4POMA 3O76A 4ZBAA 4XCSA 2H66A 1JZWA 2L6CA 2N5AA 4PTSA 2NBSA 3WGEA 1C72A 3O6TA 2V6KA 5HR2A 2XBIA 1M7TA 3FKFA 5DAKB 1GSSA 2LQOA 3DWVA 3P2AA 3RPNA 2CA8A 1VF3A 4O92A 1OC9B 4N0ZA 2E0QA 2IMFA 4OCFA 3GKKA 4KNDA 4OFNA 5ECHB 2E7PA 3UVTA 3PR8A 4RI6A 3JCML 4BVYA 3UIWA 5AISA 5J9BA 5G5FA 3KTBA 1X0RA 4KSOA 2WCIA 1AC1A 4HZ2A 1WJKA 1S3DA 2E2MA 2C3TA 5E4WA 4IW9A 1B4QA 1XW6A 2VAFA 2EIQA 3Q18A 3EC3A 2O89A 2X8HA 2HRKA 4G0IA 2MBTA 3ERFA 1TW9A 2YOIA 1U88A 5GAPD 2B6MA 1XWAA 2NVLA 5IQYA 1GTUA 1DE1A 4FYCA 4PUFC 3UJ1A 5J5NA 1BG5A 3TOTA 2OADA 2CVDA 2ES7A 3VWUA 4PUAA 3FZAA 2HI7A 3LSZA 2P5RA 4HI7A 3TDGA 5J4UA 1AQWA 3GV1A 1Q98A 1YY7A 2J23A 2PBJA 1SYRA 2CX3A 4PXOA 4G9HA 3F3QA 1TRSA 3DVXA 2CAIA 1HNAA 1SENA 1K3YA 2J9HA 3EMPA 4AJ6A 2GDRA 2O85A 1O8XA 2HZEB 2AAWA 2R3XA 4GSTA 5IM9A 1TK8B 2AV4A 3FR9A 1GSQA 4ZB9A 3GA4A 1V40A 4OWYA 2HXKA 2WJUA 3CSIA 4TR3A 4EL1A 1K0NA 1KBNA 8GSSA 4Q5QA 1AQXA 1OYJA 4AJ8A 5INYA 1R5PA 4L5OA 5ENUA 1YEPA 1YZXA 4K0GA 3KH7A 3QPMA 5CNWA 5A4WA 4MZCA 3L9SA 4KW6A 6GSVA 1T1VA 4TN8A 4JEDA 1PGTA 4F0CA 5IMDA 2VL2C 1GLPA 5DQSA 2CT6A 20GSA 2Z9SA 4V1Ap 1JZDA 4DSSA 3VI5A 2GGTA 3A5WA 2LQQA 2JZRA 5ECRB 1G7EA 2FNOA 2TRCP 4ZB6A 1VGLA 5G1LA 2NPBA 3M3MA 3VFIA 1SK0A 1XPVA 3HJPA 5KEJA 3F3RA 2O7KA 3UAPA 2DJ2A 3EINA 3NZNA 4HDEA 4K9ZA 3CBUA 1CQHA 1URMA 3WD6A 2V41A 4ZL7A 1J0FA 1B4PA 2B5YA 3RHBA 1EGRA 1FB6A 4ZBDA 1JFUA 3G7YA 1Z5YE 1SU9A 1YF1A 4IP6A 3ZL5A 4J57E 5ECOB 1MEKA 5EPFA 3G9BA 1PA3A 5H5QA 1FB0A 4KDXA 1OC3A 3HA9A 4HJ2A 4TR4A 3NOFA 3ZMLA 4BL7A 1SD9A 1SK2A 2PN8A 1ERVA 5B6MA 3HJOA 3C73A 2CAQA 4X1UA 3WYWA 2XPDA 3ZVJA 2DIZA 1DUGA 2JACA 1H4OA 1KTEA 2F8AA 3PINA 4EKZA 3QAVA 2GQLA 3IA1A 4MF6A 3DRNA 1XIYA 5ID2A 5A4VA 1M0UA 3GTUA 4KAEA 4MPFA 4V1Ag 4GXZA 3FHKA 4F9ZA 4EO3A 3GHAA 1V98A 1SYXA 3KTLA 2IIYA 3Q6OA 1PL2A 2GSQA 3IK9A 1HNCA 4TR0A 4ZILA 3A2XA 3I69A 3FR3A 1U87A 1G7OA 4TR1A 4PNFA 4MCUA 2VCXA 2YPMA 1TXXA 5B8AA 5D93A 2VM1A 2MMOA 5JWOB 2F3MA 1UC7A 2H1GA 2PWJA 2HSMB 2YWNA 4N11A 2VCZA 3BBYA 1O6JA 2CZ2A 2B5EA 3IC4A 2ZCTA 1Q4JA 4IQ1A 1HYUA 1ON4A 3IDVA 5AIVA 2L5LA 4GQCA 4DVCA 2VOCA 1EV9A 4X43A 1WIKA 2MMAA 1O73A 3APSA 1XWKA 4MZWA 4DSQA 2XBQA 2CX4A 1THOA 4OO4A 1PKZA 1SL1B 1PSQA 3GNJA 1V57A 6GSXA 2IL3A 2L59A 4BVXB 1YF0A 2L4CA 2VD1A 2PVOC 5LD0A 1PX6A 1M99A 4O7HA 4HUAA 3QMXA 4ILFA 5IMZA 5IMVA 4GTUA 4NHWA 5E59A 3MNGA 1EGOA 1ZYEA 2VCQA 2HRKB 4J56E 4I2TA 1B9YC 5DCGA 1OAZA 3ZIVA 2V32A 1EEJA 1ZGNA 5CREA 3GH6A 3ZLPA 3F4SA 1MDIA 3D6IA 3CTGA 4MPGA 5AN1A 4ML6A 4DEJA 3EMXA 3VPTA 2HRFA 4WKWA 3APOA 4PQHA 4XHMA 3ED3A 1A2JA 5HFKA 5IMCA 2I1UA 2OBIA 3PH9A 5KN1A 2C4JA 1IYHA 2DMLA 1YKAA 2OE3A 4PQIA 3VLNA 4HU9A 2K18A 4N10A 3KXOA 2GSTA 2KUCA 4Q5FA 3IR4A 4DSRA 2L6DA 6GSUA 4BPYA 4GLTA 3VWWA 2BTOT 3GN3A 1G6YA 1EOGA 9GSSA 4NXIA 2X99A 2KLXA 3I43A 3H4KA 3DEXA 1O8WA 3BD2A 2DJJA 4KA0A 3H79A 3GSTA 1M9AA 4KDUA 2HSNB 1UA5A 4RUVA 7GSSA 2HE3A 3D4TA 3I6AA 2LUSA 4TXOB 2GQKA 1HNBA 3UMAA 2YZUA 4MH3A 4EC0A 4K7IA 3OR5A 1K0DA 2WB9A 1Z7RA 3ERGA 2XHFA 1THXA 4I2UA 2IMIA 1QQ2A 1R4WA 3VWXA 1WPIA 1T00A 4D73A 2GLRA 3K8NA 5ELGA 3ZFLA 11GSA 1XW5A 3ME7A 1GULA 1X9SB 1BJXA 3GRXA 5D8IA 1ZOFA 3TJGA 2YWIA 3ISOA 1M2BA 5A5KA 3FZ4A 4K2DA 4DSSB 2IMDA 4XRDA 4ML1A 3CRTA 3W6GA 2AHEA 4YAPA 3QFAC 3G7IA 1AQVA 3EYTA 3D4MA 2FUG2 3CYNA 1K0MA 1R26A 5G30A 3ZVJD 4IP1A 2LKUA 3E3EA 5JWQB 1PL1A 5EL8A 1ZCPA 2H6YA 1JHBA 5IIZA 2VUPA 2IJYA 3LXTA 1GP1A 4RQXA 3FEUA 2WFCA 5D73A 1GUHA 1A2MA 5C00A 2V6OA 4GSNA 2OE0A 4YQMA 2CVKA 3IOSA 3APQA 1V9WA 1FOVA 1GUMA 3L4NA 2HRNA 3D0ZA 3IAS2 2H1AA 4K1FA 4WBRD 4E8EA 1GRXA 1XOBA 1DBYA 1VF1A 1I5GA 5CP1A 2MZCA 4RI7A 4O32A 1A0RP 1T4YA 1GL8A 2B1KA 4ACSA 4I8BA 4F0BA 2C1YA 5DALA 4JZQA 1BEDA 1JLWA 2YV7A 5B7CA 2VLVA 4N0VA 2DLXA 12GSA 2RIIA 1MDJA 2F51A 1CQGA 3PPUA 4XS4A 2OA7A 3ME8A 16GSA 2KP1A 4ECJA 5IPGA 4MZBA 4JR4A 5COHA 1GTBA 1YKCA 2C0FA 1EOHA 4MK3A 3M9JA 4EDYA 2YJHA 5ECIB 5GAND 1QUWA 2PPTA 2KHPA 3FYGA 1V2AA 1Z9HA 5CYYA 1K0CA 1H75A 5G2ZA 2LNSA 2WS2A 3LYKA 3VI7A 3FRCA 2G0FA 2K6VA 3RBTA 1FAAA 5ELAA 3TKPA 2MYGA 1Z3EA 2FCHA 2YNXA 3MSZA 4ECBA 3CMIA 2IPAA 3RPPA 2AJQB 4GRFA 1N2AA 1VRSD 2LV3A 5ECMB 3TB2A 5IO2A 1SJZA 3P8WA 3BCKA 3BJ5A 1BYEA 2HQTA 3DD3A 5B8BA 1S3CA 4K0NA 1SKRB 1ERTA 3FZ5A 5GSTA 2DJ0A 3WGXA 3QR6A 4HOJA 4OFMA 3KD0A 2DBCA 2TIRA 6GSYA 4CW9A 4YAVA 4MP4A 1LBKA 2EIRA 2WZ9A 1XXUA 2IFQA 3M8NA 4GWRA 3IXRA 2ON7A 4Q5NA 1M2AA 1ZL9A 2RM6A 2PVQA 3QDNA 3TJJA 4IGJA 4JU5A 3MWHA 2LRNA 3Q19A 2OKAA 5IMAA 4MMMA 1ABAA 4G19A 4H86A 1GTAA 3HCZA 2YWOA 1F9MA 2HFDA 2ZNMA 1PKWA 1GH2A 2H8LA 1XOAA 3TKSC 2YP6A 2G2QA 3V1WA 1W4VA 2VL9A 3QCPA 1SJIA 1TKDB 4L0UA 2DC5A 5F05A 4WF4A 5HQPA 6GSWA 1QXHA 1FO5A 2H72A 2P0GA 4AJ7A 4TRXA 5G31A 3GYKA 2OACA 3HKRA 4KSMA 4LLRA 1SL2B 5HFIA 3TRQA 1LJRA 4NAXA 2LEGA 2IWTA 4PX1A 3LEFA 4KGIA 3TCOA 1TRUA 3ZFBA 2YWMA 3GL5A 4HQZA 1U6TA 2HRAA 1ZMAA 4JBBA 3GL3A 5DAKA 1EWXA 3C1SA 3LYPA 2JZSA 3DYRA 2VCWA 3IHQA 3M0FA 2IN3A 3D22A 3HHVA 3FK8A 2QSIA 1GSFA 3EE2A 4MJBA 1WP0A 4XIHA 1O81A 4IJ3A 5ECQB 6GSTA 2H01A 1SD8A 1PN9A 4HJMA 3U5RE 3DIEA 2GSRA 1J08A 1T3BA 1F3BA 2VO4A 1E6BA 4MJCA 2WULA 2GZZA 1K3LA 3LXZA 1JZRA 1GSEA 3ZMKA 3DMLA 2H19A 1KNGA 4FQUA 4YQVA 2C0GA 3BOAA 3F8UA 4LL1B 3F6FA 4IN0A 4IHUA 4FH8A 4L8EA 3GX8A 2A2SA 1V58A 4ZBBA 2H0HA 4HQSA 2H73A 5DBQA 2CZ3A 4F03A 2FD3A 3DGQA 1R7HA 2REMA 4N30A 4FYUA 5ECLB 2JSZA 17GSA 3TKRA 4LA1A 3L9VA 1SJ6A 3C7MA 3W8SA 5D9TA 3UOMA 2LRTA 3ERWA 2HZEA 1X9MB 2RM5A 3ZREA 4NV2A 2H74A 2OBKA 2YZHA 2AB6A 1EZKA 1ZZYA 1N8JA 1K3OA 1G0TA 3GX0A 3KJYA 5ECNB 4XS6A 4BVYB 2H0GA 3HY2A 3L78A 1BX9A 3RAZA 1B48A 4KH7A 5H5SA 2VL2A 18GSA 5KN0A 3HJMA 5DJMA 1XVQA 4NWYA 1GUKA 1NM3A 2K8VA 2JADA 3EWLA 3FZ9A 4F2IA 4KB3A 2AYTA 1MD3A 1XCCA 22GSA 3IAM2 3HD5A 2YANA 5DCHA 2GTUA 4MDCA 2R2JA 2LJAA 3QAWA 1ST9A 3EURA 3Q74A 1PX7A 2JU5A 1FVKA 3P90A 4JR6A 5FT3A 2LJKA 4WXTA 2GVPA 4V2NA 1OKTA 3HXSA 1ILOA 2B5XA 1K0OA 3D21A 1GLQA 4EE0A 3TJKA 5J9CA 4BWSA 1X5EA 13GSA 2X64A 2FA4A 1X9WB 3TJBA 2YN1A 2GZYA 2H1BA 4HZ4A 3GUSA 2RLIA 3UL3A 2IMKA 3A3TA 1JLVA 3KZQA 3GKMA 1F6MC 1O85A 1FHEA 3HVVA 3IK7A 4G10A 5ECPB 4WF5A 1U3AA 4USSA 3C1RA 5GZZB 3LGCA 3IBHA 3D5JA 4EXJA 2ON5A 5D9XA 1EP8A 4EF0A 4EUYA 5D9WA 4ULXA 4JE1A 3ZYWA 4EDZA 3BCIA 3LWAA 3GFKA 2B3SA 4FO5A 5KN2A 5FWGA 3MDKA 1X5CA 2WRTA 4OFTA 1YQ1A 1Y6EA 4ID0A 2OJLA 1M9BA 1NHOA 1IYIA 2B7KA 1NW2A 4Z7XA 1RW1A 2FWFA 3TOUA 2CV4A 4QL9A 1Z6NA 3F9UA 3I9V2 2X8GA 3CSJA 2RUEA 5CRHA 1X5DA 3HZ4A 2MMNA 2YV9A 1OE7A 2VCTA 1W89A 4MABA 2LNTA 1YDKA 4K7NA 4IBPA 4OMVA 2H70A 1TP9A 1O7UA 1M2DA 5ABRA 2I9HA 3DKSA 2FWEA 1SK1A 3KGKA 3TRPA 1GSUA 1UN2A 3RHCA 4GCIA 5EVOA 1SKWB 5LCZA 2LTKA 2O87A 3UBLA 2VLUA 1FVJA 3R2QA 2HNLA 3N5OA 10GSA 2F9SA 5JWRB 1AUCA 2HSMA 2LS5A 4K6XA 1I9DA 1OE8A 1S3AA 1R5AA 3HYPA 3FY7A 2PGTA 3FW2A 4LL4B 3SBCA 2OE1A 3IRAA 3F63A 1EEMA 3EU4A 3C71A 4BL7B 2FHEA 1AAZA 3QD9A 1EP7A 2HLSA 3KP8A 2V1MA 1T4ZA 3M1GA 1GSDA 1TI3A 5JCGA 4F82A 2H30A 4I97A 2NTOA 4IELA 4K7OA 1NHYA 5HR0A 2KP2A 4BVXA 2RUFA 2H71A 2GSSA 4YH2A 3SWLA 4Q5RA 2H6ZA 1Z7PA 2DIYA 3UBKA 2PERA 5ID2B 4RQRA 3GTUB 2HSHA 4KCAA 5F07A 3US3A 1PQNA 2A2RA 2GZPA 2L4QA 4OO5A 3E0UA 2C80A 1SKSB 2I4AA 2GT6A 4L0WA 1A8YA 1TRVA 4P3YB 3TGZA 4HEA2 2C8UA 2FWGA 2CVBA 4KUNA 2ZUPA 1TU8A 3O3TA 1A8LA 5HR3A 1DE2A 3WT2A 4GQFA 4ECCA 4TR1B 1PD21 2HYXA 3ZITA 5DQYA 1VF4A 1NSWA 5D9VA 2UZ8A 2R37A 1OVNA 2EC4A 3TUEA 3VK9A 5BMUA 2DJKA 4TKYA 4YQUA 5IMFA 2A4VA 3F4TA 3KIJA 3LJRA 5ECKB 1T8EB 4WETA 2P5QA 4WR5A 3GSSA 3W8JA 4NHZA 1YEXA 5CRWA 1USBA 3LQ7A 3LFLA 2VCVA 1XVWA 3GURA 2YCDA 4GF0A 4HU7A 1J9BA 4XRAA 3U6VA 1G6WA 4TXOA 2MMZA 2VL3A 5IOWA 2QGVA 3KH9A 2VM2A 4IKHA 2XC2A 5H5RA 4I5QA 1XWCA 3GIXA 4MJAA 4ZB8A 1DSBA 1WOUA 3HDCA 1HQOA 4ZL8A 5CAXA 3F6DA 4TOPA 2I3YA 5F06A 1BAYA 4FIWA 3ZZXA 1A0FA 4K8MA 3R3EA 2DMMA 2FLSA 2GT5A 1AW9A 4NMUA 1GTIA 4AGSA 2KOKA 3TKQA 4ECIA 4QQ7A 3TJFA 1A23A 2JSYA 1TRWA 4ISDA 4O5RA 5A4UA 2L57A 5J41A 5AIXA 3J7Yk 1Z6MA 1U3IA 2B7JA 3VPQA 1QMVA 4J2FA 4TW5A 1E2YA 4ZL9A 4POBA 3HZ8A 2M72A 3TRXA 3CXGA 3GKXA 19GSA 3J7Yb 3KP9A 1K0AA 5EY6A 1K0BA 1Y25A 3QAGA 2M46A 1QGVA 4E8HA 1RQMA 2QKEA 4MF7A 2H6XA 1EV4A 2EIOA 2FA8A 3QFBC 3EU3A 2YJ7A 2F8FA 2MBSA 4OD7A 3H8QA 1OC9A 5LNKe 3S9FA 4G2EA 2FWHA 2HSYA 4XTSA 3UVHA 3H93A 2H1DA 2C0DA 4MA9A 4POLA 1TJDA 4D73B 5G5EA 1GNWA 1T7PB 2WGRA 4PNGA 4TXVA 5CO3A 2P31A 3VURA 4WEYA 4WR4A 4PGTA 1ML6A 4IQAA 1TDIA 1JZOA 1PRXA 2LJRA 4G0LA 3LG6A 2DJ3A 5JCWA 1TOFA 2R6KA 1XBSA 5HFGA 3M9KA 2D2ZA 1HD2A 2VLTA 2H75A 3GH9A 2M80A 3RDWA 2TRXA 2I81A 1F37A 14GSA 1KEBA 2GQMA 4CDOA 2CQ9A 3C8EA 3P7XA 2C0EA 3EVIA 1GWCA 2JL4A 2N5FA 1XFLA 2PUKC 2HT9A 4LMWA 2WDUA 5F0GA 2QC7A 2LSTA 3IV4A 3E9JB 3UEMA 3WT1A 3KMOA 4PQ1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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