2HSMA

Structural basis of yeast aminoacyl-trna synthetase complex formation revealed by crystal structures of two binary sub-complexes
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
178
structure length
178
Chain Sequence
MPSTLTINGKAPIVAYAELIAARIVNALAPNSIAIKLVDDKKAPAAKLDDATEDVFNKITSKFAAIFDNGDKEQVAKWVNLAQKELVIKNFAKLSQSLETLDSQLNLRTFILGGLKYSAADVACWGALRSNGMCGSIIKNKVDVNVSRWYTLLEMDPIFGEAHDFLSKSLLELKKSAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of yeast aminoacyl-tRNA synthetase complex formation revealed by crystal structures of two binary sub-complexes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ligase/rna binding protein
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule keywords Glutamyl-tRNA synthetase, cytoplasmic
total genus 57
structure length 178
sequence length 178
ec nomenclature ec 6.1.1.17: Glutamate--tRNA ligase.
pdb deposition date 2006-07-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18466 GluRS_N Glutamate--tRNA ligase N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2hsmA02
3.40.30.70 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hsmA01
4OFNA 4JEDA 1PD21 3WYWA 3SWLA 1YKCA 4HZ4A 3LXTA 1AQWA 3CRTA 3TGZA 1K0AA 3HKRA 2CA8A 1EEMA 1Y6EA 5AGYA 4G0KA 4GSTA 1FW1A 3FYGA 5ELGA 4F0BA 3FY7A 5D9TA 5A5KA 4LMWA 5FWGA 4USSA 1PKZA 3O3TA 2C3TA 4IJIA 1A0FA 18GSA 3VI5A 4EE0A 1TW9A 1AXDA 3QAGA 3IBHA 3PPUA 3ZFBA 4EXJA 4ZB9A 2A2RA 3DD3A 1GNEA 3IK7A 4L5LA 2PBJA 4G19A 3LQ7A 2GSQA 1LBKA 1M99A 2WRTA 4G9HA 2NTOA 3HJOA 2R4VA 2HRKA 2C4JA 1YJ6A 4N0VA 3NIVA 3LYKA 5FT3A 4RI6A 3IK9A 4PNFA 3P90A 4YH2A 4BL7A 2R6KA 5LD0A 2C3QA 4IBPA 3IC8A 3W8SA 1BAYA 4ZBAA 3ERFA 4IW9A 3PGTA 2X64A 1GNWA 3KMNA 4I97A 1B48A 2HQTA 22GSA 2AAWA 1GTIA 1U3IA 4KE3A 5LCZA 1UA5A 3EINA 19GSA 3PR8A 1EOGA 1HNCA 1G6YA 3QAWA 2PMTA 2A2SA 1G7OA 2HRAA 4KDUA 2GSTA 3LSZA 3P8WA 4ECBA 3LXZA 2CZ3A 2GSSA 1USBA 3MDKA 2CAQA 2AB6A 2GTUA 2VCVA 1GUKA 3GUSA 5J4UA 3D0ZA 3CSHA 3F63A 1V2AA 1G6WA 4MK3A 1BG5A 1F3AA 1LJRA 4F0CA 4KF9A 4OMVA 1B4PA 1ML6A 5DDLA 1PL2A 1V40A 8GSSA 1K0DA 4PQIA 1AW9A 5ECLB 5ECRB 4MP4A 3VPQA 4E8HA 2F3MA 5ECSA 5J41A 4GF0A 1F3BA 3CBUA 4KSMA 1PGTA 4KX4A 4KDYA 2C3NA 4BVYB 4PXOA 2CZ2A 4OFMA 4HZ2A 5AN1A 3VK9A 4YAPA 16GSA 3HJMA 4ECCA 4YQMA 4KGIA 3VWXA 5J5NA 3GTUB 4PTSA 5FHIA 1M9AA 4RI7A 3LG6A 3AY8A 4BVXB 5GZZB 2J9HA 3VLNA 1JLVA 3FR9A 4MF6A 6GSXA 5JCUA 2WJUA 5ECNB 3M1GA 3DGQA 4YQUA 5DALA 1PX6A 2FHEA 1GSDA 10GSA 6GSTA 5B7CA 2WS2A 4MF7A 5D9XA 3KJYA 2ON7A 5A4WA 4J2FA 3ERGA 4G0IA 3R2QA 4EC0A 1C72A 5F8BA 5BMUA 4Q5FA 1PN9A 3H1NA 5DAKA 4IELA 1XW5A 2PVQA 4MZWA 2LJRA 1TU7A 2IMKA 5DCGA 3BBYA 6GSYA 5ECIB 1U88A 2HSMB 3F6DA 1XW6A 3MAKA 3ISOA 4E8EA 5DJLA 1BX9A 5A4VA 3IR4A 2D2ZA 2IMIA 3Q18A 5EL8A 1U87A 2F8FA 3FRCA 3KM6A 4IQAA 4ZBBA 3LFLA 3LJRA 4NHWA 2DSAA 20GSA 2N5FA 1GLPA 4JZQA 1K0BA 5ECPB 4MF5A 3C8EA 4WR5A 4GSNA 3TOTA 1EV4A 2VD1A 5AIXA 5ECHB 4AGSA 1PKWA 1GULA 4G10A 1F2EA 4NAXA 1AQXA 5ELAA 3RBTA 1GTUA 4Q5NA 3VPTA 1GLQA 4ECJA 5GSSA 1GWCA 4O7HA 3GX0A 3F6FA 4ZXGA 1EV9A 1OKTA 13GSA 4IS0A 5EY6A 2YCDA 2OADA 2PGTA 4PX1A 4IVFA 1GSQA 5EVOA 1GSFA 1GSYA 3WD6A 5AISA 6GSVA 5ECOB 1MD4A 3M0FA 4YAVA 2VO4A 6GSUA 5G5EA 6GSWA 2VCTA 5F07A 1VF1A 3FR6A 1JLWA 1IYHA 2VCZA 5DAKB 2HRKB 3ZMLA 4K0GA 4GLTA 1BYEA 1GUHA 4MDCA 5F05A 3UVHA 5ECQB 4PQHA 1IYIA 5ECKB 4BL7B 2PERA 1K0NA 2CAIA 1YDKA 3UBKA 1HNBA 4EDYA 3ZFLA 1GUMA 4HI7A 3QAVA 3I69A 3EE2A 1VF2A 4ACSA 3N5OA 1HNAA 4MPFA 4HOJA 2C80A 3CSJA 7GSSA 3Q19A 1OE8A 3U6VA 1M0UA 4PGTA 4OFTA 4ZBDA 3L0HA 4GTUA 2R3XA 2YV9A 1GSEA 4ZB6A 5F0GA 5GSTA 1B8XA 1OYJA 2VCWA 4KH7A 4FQUA 4GCIA 9GSSA 3LYPA 1K0OA 2GDRA 2HSNB 1Q4JA 2R5GA 3R3EA 4PURA 1DUGA 5ECMB 2OACA 1PMTA 1K3OA 5JCWA 6GSSA 5A4UA 1GSSA 2FNOA 1K0CA 1YY7A 4JBBA 5AIVA 1ZGNA 3Q74A 4KAEA 3KTLA 4WR4A 2ON5A 1VF3A 1PL1A 1KBNA 3M3MA 4ISDA 2HNLA 1VF4A 12GSA 2CVDA 14GSA 5F06A 3KMOA 4BVYA 1XWGA 2WDUA 4ZB8A 3CRUA 4Q5RA 3CSIA 2GLRA 3G7JA 1MTCA 4ID0A 1PA3A 2JL4A 4DEJA 17GSA 4L5OA 4PUAA 2C8UA 3VURA 2VCXA 3GTUA 1AQVA 1K3YA 1MD3A 4BVXA 4QQ7A 3IE3A 11GSA 3GSSA 1GTBA 5DQSA 2AHEA 5DALB 1JZRA 4NHZA 3GH6A 4F03A 4EDZA 2GSRA 5G5FA 1XWKA 4IGJA 4YQVA 5IQYA 4GSSA 2UZ8A 1FHEA 3TOUA 2WB9A 3M8NA 2V6KA 4IQ1A 5KEJA 1Z9HA 2OA7A 2DC5A 1K0MA 2YV7A 3GSTA 5D9VA 3VI7A 1R5AA 4L8EA 4G0LA 1TDIA 2HSMA 3I6AA 1GSUA 3UARA 1OE7A 1K3LA 1ZL9A 5D9WA 4K0NA 4HJ2A 1GTAA 4MPGA 3UBLA 1PX7A 3GURA 3ZMKA 1YQ1A 3QR6A 1N2AA 4PNGA 2VD0A 3N9JA 4Q5QA 4CHSA 2IL3A 4ECIA 3G7IA 1NHYA 4KDXA 4IKHA 3UAPA 1EOHA 4O92A 3FR3A 5D73A 1E6BA 4LMVA 1RK4A 3KXOA 3O76A 5HFKA 2VCQA 4TOPA 5DJMA 1M9BA 1HQOA 1TU8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OFNA 4XIHA 1PD21 3WYWA 3SWLA 3SBCA 1UVZA 3CRTA 3HKRA 1EEMA 4G0KA 1FW1A 3FYGA 1EGRA 2MBSA 2O3EA 2C0EA 1PKZA 2C3TA 4IJIA 3L9VA 4X4JA 4ZIJA 3ME8A 3QAGA 3HHVA 1JFUA 2O89A 1OC8A 2I3YA 4NV2A 1HYUA 2IMDA 1LBKA 5J9BA 3HJOA 1GRXA 2WW0A 4K7NA 2C4JA 1EZKA 1OC9A 1H4OA 1V58A 4D73A 3LYKA 4RI6A 2FUG2 3P90A 3CHXC 1KNGA 4N3ZA 1YEXA 2HRNA 1ILOA 2A4HA 4I97A 2FLSA 1B9YC 2HQTA 22GSA 1F37A 4P3YB 5COHA 1Z3EA 2XPDA 1M2DA 2XHFA 2HRAA 4KDUA 3MSZA 3EYTA 3TJBA 3F0IA 2GSTA 1SYXA 4RUVA 3P8WA 3LXZA 3FW2A 2CX3A 2GTUA 2VCVA 4IJ3A 1R4WA 2PPTA 2E2GA 4TXVA 3KTBA 1F3AA 1QUWA 3O6TA 3E0UA 8GSSA 2WW1A 3KP9A 1YVLA 5HR2A 4MP4A 3VPQA 2BJXA 4D73B 3RDWA 2C3NA 3CMIA 4MJAA 2O5VA 2DIYA 3K8NA 4HJMA 2GS3A 3VK9A 1KEBA 1M2AA 1Q98A 2CT6A 4YQMA 2N5BA 3GTUB 3G7YA 3LG6A 1XXUA 3KEBA 2IWTA 1TI1A 5GZZB 3EU4A 2FHEA 1GSDA 2OKAA 3IV4A 3BOAA 4MF7A 5IPGA 5D9XA 2ON7A 2JZSA 4J2FA 4BIKA 5J40A 4G0IA 4EC0A 3CYNA 5F8BA 5BMUA 2ALBA 1Z6NA 2YWIA 1U3AA 2LS5A 2GZPA 2FD3A 4IELA 1TU7A 1A24A 5ECIB 1U88A 4MH2A 2XBQA 2TRXA 2K9FA 1S3CA 4E8EA 2CV4A 5DJLA 1BX9A 3FK8A 3Q18A 2KOKA 4N10A 2M46A 1U87A 5JCGA 3FRCA 2DJ3A 4ZBBA 3GIXA 2HT9A 3BCKA 2EFCA 4V1Ag 4TW5A 5J9CA 2YZHA 2PVOC 1FB6A 3IRAA 1SU9A 4TVEA 5ECPB 4Z2UA 4LL4B 2UV8G 2I1UA 2VD1A 4PHZC 5AIXA 3A5IA 4AGSA 3BJ5A 3TKRA 2NPBA 1F2EA 4NAXA 1AQXA 5ELAA 3TJKA 4ECJA 1GLQA 3TJFA 2PN8A 2AYTA 4BWSA 5DCHA 1F9MA 5EY6A 3KIJA 2YCDA 4KSOA 4IVFA 1XPVA 3PINA 1Y25A 5EVOA 1GSYA 3M0FA 2FWHA 5HR1A 4KUNA 4CY6A 2K18A 1A8LA 2LNSA 4NV5A 4K0GA 4PI2C 4MDCA 3UVHA 1IYIA 3IXRA 4CDOA 4BL7B 3UBKA 1HNBA 1FAAA 2DJ0A 3I69A 4ACSA 1HNAA 2C80A 3D6IA 3CSJA 5JWOB 5JWRB 5IIZA 4ZBDA 3GL3A 4GTUA 2O36A 2H66A 2R3XA 2YV9A 2TIRA 2JZTA 2B5EA 3US3A 3H93A 5F0GA 5ID2A 1TRWA 9GSSA 1XWCA 2KHPA 1WMJA 3QFBC 1J0FA 1O81A 2GDRA 2R5GA 2C0DA 2HE3A 1DUGA 3IAS2 2RIIA 2VKZG 2F9SA 1K3OA 3U5RE 1EP7A 4TKYA 3UEMA 1YY7A 2IJYA 4JBBA 5AIVA 3DVXA 5IMCA 2ON5A 1VF3A 2KUCA 1EWXA 1PL1A 1XW9A 2HNLA 2LJKA 5HFGA 1TK0B 2C0GA 4AKGA 3KMOA 2WDUA 3CSIA 3ZL5A 1PA3A 2JL4A 2H0IA 2YNXA 4PUAA 2H72A 2O7KA 1MD3A 1KTEA 2IIYA 3IE3A 3WGEA 2B5YA 1GTBA 4NHZA 1O85A 3QOUA 3ZLPA 4EDZA 5G5FA 2L6CA 3GH9A 3DVWA 3ZYWA 4YQVA 4GSSA 2UZ8A 3I43A 4K9ZA 5J4VA 3TDGA 4ZILA 3ZREA 3GSTA 4HU7A 3ZTLA 4ULXA 4TXOA 1U6TA 2B7KA 2F51A 1FG4A 3C71A 3HZ4A 5IMFA 2HSMA 2OJLA 3UARA 4POKA 1ZL9A 1UN2A 1SKSB 4BPYA 4HJ2A 3WT1A 1YQ1A 3QR6A 1A2JA 4K8MA 2VD0A 3N9JA 3ZIVA 3C1RA 4Q5QA 2L4QA 1X5DA 4I2UA 4KDXA 2LTKA 4IKHA 2BMXA 5A34A 4ML1A 4FO5A 2FWEA 1E6BA 2WVYA 5HFKA 3F3QA 1SJIA 2R0GA 3L9SA 1E2YA 2H73A 4JEDA 2H0HA 1SL2B 5CRDA 1AQWA 4O5QA 3ZVJD 3TGZA 2O8VB 3DEXA 4GSTA 5ELGA 4F0BA 3PH9A 5D9TA 5A5KA 2VIMA 5FWGA 2B3SA 3VI5A 1TI3A 4XRAA 4EE0A 5IOWA 3D21A 1AXDA 3ZFBA 2P31A 3PPUA 3F4TA 4HSCX 5JWQB 4EXJA 2NVLA 2FGXA 5KOXA 2A2RA 4L5LA 2VM2A 2PWJA 2PBJA 2N5AA 2WCIA 2WRTA 1Z5YE 4G9HA 5ENUA 2HYXA 2HRKA 2ZNMA 3HY2A 2EFEA 5CNWA 1JHBA 1ACVA 2MMNA 4IP1A 2LV3A 5LD0A 5HQPA 3IC8A 3W8SA 3FKFA 3ERFA 1OVNA 2X64A 1URMA 4TR4A 1GNWA 3ZVJA 4XS4A 3KMNA 2CQ9A 1XG8A 1N8JA 3I9V2 5A34B 1U3IA 4ZL8A 1WJKA 4OWYA 4KE3A 3HA9A 5LCZA 2IMEA 5J3RA 5CP1A 1HNCA 5IOXA 2PMTA 2A2SA 1RQMA 3DWVA 4POBA 3RAZA 5CREA 2GSSA 1USBA 3MDKA 4AJ8A 2AB6A 3WT2A 4JE1A 3ZZXA 3BCIA 3GUSA 5J4UA 2KLXA 4CY8A 3CWGA 3F63A 2GQLA 3UVTA 1F6MC 4PI0C 4I2TA 2B1KA 1ERTA 1BG5A 2L57A 4KF9A 1S4BP 4OMVA 1TTZA 1ML6A 5DDLA 1WOUA 2H1BA 2X49A 1K0DA 1AW9A 1TKDB 5ECLB 4E8HA 3L78A 1YKAA 3CXGA 4K2XA 4GQCA 2RLIA 3F9UA 4TR1A 5B8BA 4HEA2 5IMVA 4HZ2A 5IO0A 4F9ZA 4XS4B 3MWHA 1T1VA 2LEGA 3HJMA 2QA2A 1A2MA 3GX8A 1M9AA 2F8AA 3TCOA 4MF6A 2OBIA 2V32A 2H6YA 2MBTA 4YQUA 5DALA 3QPMA 2MMAA 2LSTA 2H75A 2HXKA 5A4WA 2R0PA 3ERGA 3HCZA 4ZL9A 2H19A 3E3EA 2WULA 4EO3A 5DAKA 3GA4A 3KGKA 2CVKA 3IHGA 3H4KA 3DRNA 4MZWA 2IMKA 4TN8A 2K6VA 3ZITA 1WE0A 4QL9A 3ISOA 5GAPD 1R7HA 4XS1A 3L9UA 1SD9A 3GN3A 2D2ZA 5IMAA 3P2AA 1W89A 2IMIA 1RW1A 5HR3A 5A1NA 3HZ8A 5EL8A 1AAZA 3RPPA 3APSA 2Z9SA 2DMMA 4O32A 4MJCA 2N5FA 3EMXA 5G1LA 4JZQA 1R26A 4X1UA 3C8EA 3J7Yb 3F8UA 1BF5A 3EWLA 1V9WA 1TRSA 1GULA 3QD9A 3RBTA 3D5JA 1QFNA 2HLSA 2HSNA 3D4MA 4ZXGA 4IS0A 2OADA 1TJDA 1ERVA 4OCFA 4OO4A 2HI7A 1ERWA 3WD6A 3M9JA 3J7Yk 2LJAA 4GQFA 2PUKC 1VF1A 3FR6A 2LRCA 5DAKB 1Z7RA 2HRFA 1OC9B 5ECKB 3IC4A 1K0NA 2CAIA 4EDYA 2NBSA 3QAVA 5D96A 1VF2A 2AJQB 1I9DA 3N5OA 3LEFA 3RHBA 1FO5A 4HOJA 3Q19A 1OE8A 4FYUA 1MEKA 4O5RA 1AUCA 3L0HA 1OKDA 2A4VA 2H6ZA 3TRXA 4MCUA 1GSEA 1FB0A 4ZB6A 1OYJA 2VCWA 3TKPA 4KH7A 2VUPA 3ME7A 1EP8A 4FQUA 5CRGA 5IPHA 3LYPA 1GP1A 1PFOA 2HSNB 1XZOA 5KN0A 1HD2A 2IFQA 2OACA 1S3DA 2DKHA 2VL2C 5A4UA 4NWYA 3D22A 1CQHA 4WXTA 1ZGNA 3RGBC 4KAEA 1SVOA 3V1WA 3M3MA 2YANA 1NM3A 4ISDA 4HDEA 12GSA 2GT5A 4BVYA 1XWGA 2H8LA 4MABA 2B1LA 4DSSA 3VWUA 17GSA 4Z2TA 3VURA 2VCXA 1AQVA 4BVXA 2LQOA 3APQA 2JSZA 5DQSA 1O8WA 4K7OA 2ZUPA 1XWKA 4MZCA 3FZ4A 5IQYA 1BQ7A 3HVNA 4V2NA 3TOUA 2XC2A 2WB9A 5IM9A 2V6KA 4NMUA 5BMUB 5KEJA 1Z9HA 1YZXA 4EL1A 1X9SB 3UJ1A 2OBKA 3C1SA 4EKZA 2IFQB 2DJJA 1R5AA 4G0LA 2FA4A 1QQ2A 4QMKA 1GSUA 4XRDA 5CO3A 1K3LA 5D9WA 4K0NA 4AKIA 5LNKe 3UBLA 4N30A 2I9HA 3ZMKA 4JR6A 2GQMA 4HQZA 5H5SA 4V2MA 3A5WA 3HVVA 2IL3A 1XBSA 4XCSA 1JZDA 3HMJG 4ZB7A 2R0CA 3UAPA 1EOHA 3FR3A 2OE0A 1SYRA 2G0FA 5CRHA 3KXOA 4DSRA 5HR0A 2TRCP 2LQQA 4PQ1A 3CTFA 1FVJA 3LXTA 2XBIA 2HSHA 4RQXA 1K0AA 1Y6EA 1M3JA 4WEYA 1A0FA 18GSA 2JU5A 1B4QA 1TW9A 2JSYA 5BRTA 3IBHA 1Y1UA 4ZB9A 5INYA 4K1FA 1PRXA 1GNEA 1TK5B 3IAM2 1YF1A 3LQ7A 1M99A 1S3AA 4MLYA 1FOHA 3RHCA 4FYCA 4YKFA 2LKUA 2R4VA 4GRFA 4N0VA 3QCPA 2MYGA 1B9XC 3NIVA 3GV1A 5FT3A 1PN0A 3GKNA 2H74A 3IK9A 4PNFA 4YH2A 2DLXA 2R6KA 1NW2A 1WIKA 1BAYA 5DQYA 3S9FA 4IW9A 4I6XA 3PGTA 1A2LA 1ERUA 4IHUA 1B48A 1TK8B 4GDFA 3VWVA 3TUEA 2QGVA 3EINA 19GSA 3PR8A 2FWFA 1EOGA 3HJPA 1G6YA 3QAWA 2OE3A 4K7IA 1G7OA 3BD2A 1SENA 3GKKA 3W6GA 3TKSE 3GKXA 5ID2B 3RFRC 2M80A 4LLRA 4K2DA 1XWBA 1XWAA 3CSHA 1OC3A 2YWNA 2IPAA 1V2AA 1G6WA 3G9BA 3H8QA 4CW9A 1LJRA 2O87A 4F0CA 2E2MA 4YKGA 1O73A 1PL2A 1V40A 1SK0A 4ML6A 3ED3A 3VWWA 5J41A 2A2PA 1MDJA 1F3BA 1QGVA 2EIQA 1A23A 4KX4A 1DSBA 4PXOA 2WVXA 3GFKA 1AIUA 1JZWA 5AN1A 3F4SA 4EUYA 3TU3B 1V57A 3DXBA 16GSA 4JU5A 4ECCA 3ZRDA 2AV4A 3VWXA 2EIOA 4KA0A 3WGXA 5FHIA 2X8GA 4RI7A 4W66A 1JLVA 3FR9A 2RM6A 2WJUA 5ECNB 3M1GA 1PX6A 4MJBA 10GSA 6GSTA 5B7CA 1XFLA 5KN3A 1LU4A 2DMLA 1FOVA 1T8EB 1MDKA 2L59A 2O85A 4EVMA 1R5PA 4Q5FA 1PN9A 3H1NA 2VLUA 4TXOB 3RPNA 2L6DA 2PVQA 1ZYNA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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