3CRTA

Structural characterization of an engineered allosteric protein
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGCEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Using affinity chromatography to engineer and characterize pH-dependent protein switches.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme
molecule tags Transferase
source organism Schistosoma japonicum
total genus 70
structure length 214
sequence length 214
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2008-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3crtA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3crtA01
4MA9A 3DWVA 2G2QA 2CV4A 1XW9A 2ZUPA 5IO2A 2PUKC 3O76A 3CRUA 2GT6A 5A4VA 4MMMA 1T8EB 1T4ZA 4OO4A 2HI7A 3F0IA 3GUSA 5FHIA 4CW9A 3VPTA 1ERWA 2HT9A 2VL2A 2RM5A 1I5GA 4YQMA 3QPMA 1FVJA 4ZL9A 2VM1A 4AF2A 4BVXA 2VL2C 4MJCA 4KCEA 2VCZA 3F4TA 3P2AA 1U87A 4PTSA 3HJMA 1CQGA 3KMNA 3CRTA 3D4TA 2P31A 1PSQA 5IMAA 4NPBA 3L4NA 3TKPA 3QCPA 2A4VA 1GSDA 2TIRA 5DAKA 2MYGA 5JCWA 5ECQB 2O89A 2FA8A 2HRFA 4E8EA 1WP0A 5ECOB 5LCZA 2H1BA 1R5PA 3FZAA 1V57A 2C8UA 3ISOA 1ZL9A 3UAPA 1THOA 4OCFA 3GKNA 1EOHA 3ZITA 2HE3A 4GLTA 3PR8A 1N2AA 4J57E 2HLSA 4FYCA 4PURA 4RQXA 2IFQA 3CTGA 3FR6A 1J0FA 3G9BA 2AV4A 5E59A 1ST9A 3DEXA 3CYNA 4LMVA 4AGSA 3WGDA 18GSA 3PINA 4N10A 2C0DA 3L78A 3DGQA 5GSSA 2EIOA 4MPFA 4ECJA 2LEGA 4JRRA 4GXZA 4OFMA 1WOUA 2YPMA 1ON4A 1SKRB 1X9WB 2EIQA 1JLVA 4G0IA 16GSA 2VLUA 1TK8B 4N0ZA 4EL1A 4KW6A 1SD9A 3IC8A 2LV3A 4LL1B 1XWGA 1EGOA 4ZL8A 1TU8A 1NHOA 4AJ7A 3TRPA 2H73A 2IJYA 8GSSA 3TRQA 1M99A 2QKEA 1TI1A 3EE2A 4ZBAA 2B7JA 3APSA 1ML6A 4X0XA 2JACA 5G1KA 5ECHB 2WULA 5CRHA 4GQCA 5HFKA 1ZMAA 1GP1A 2A2RA 3LEFA 4JBBA 1M9AA 3KXOA 4WXTA 2DMMA 5ECPB 5AGYA 1AUCA 2HNLA 5D9XA 5AN1A 1KTEA 5J3RA 2PERA 5KEJA 5DDLA 3K8NA 2CAQA 3QOUA 2TRXA 1XBSA 2DIYA 1FVKA 4IBPA 4I2TA 4H86A 1A24A 3CSJA 3ERWA 4I8BA 1V40A 1EOGA 1PD21 1GL8A 1Z5YE 5EVOA 4L8EA 2PVQA 4XHMA 5IMFA 1MDJA 1W4VA 2ON5A 6GSSA 5ECNB 2MBTA 5G30A 2DMLA 5BMUA 3D22A 2LUSA 5HR1A 2FGXA 2FWGA 5G5FA 5C04A 4OWYA 4DEJA 2DJ3A 3GH9A 1GUKA 4KDUA 5ABRA 5GSTA 1JHBA 3EURA 2CVDA 3MAKA 2GT5A 2KP1A 1SYRA 3HVSA 4IW9A 1JFUA 3TCOA 3G7IA 4KSOA 4IQ1A 4V1Ap 4F82A 2IN3A 1YJ6A 1YY7A 1S3DA 4IP1A 2B3SA 2KLXA 1T7PB 4GTUA 3QMXA 5LD0A 4BVYB 4KSMA 4TXOB 1FB6A 1SJZA 3TB2A 2XC2A 5AISA 1BEDA 2IMDA 2H8LA 4G2EA 4TKYA 4XS1A 1DE1A 4LL4B 5HFGA 2B7KA 3QFBC 3L9VA 4PQ1A 3Q74A 4I2UA 4L0WA 3TKSA 3WYWA 3DMLA 1T4YA 4PNGA 5F05A 4GSTA 1I9DA 4WETA 1OVNA 3DD3A 4ML1A 5KN3A 1YDKA 2DLXA 6GSXA 4JR4A 5EPFA 1PGTA 3NIVA 1M2AA 3GTUA 3HKRA 4G10A 4JE1A 5ECMB 2F8AA 3KH7A 4Q5RA 2IPAA 2DBCA 1BQ7A 3IAS2 1USBA 2R4VA 5A5KA 2F8FA 1K0CA 4IHUA 1F37A 3ZFBA 4WBJA 2C80A 2WZ9A 2GZYA 1SJIA 3E0UA 5E4WA 1FHEA 3GA4A 1DBYA 1CQHA 3D6IA 1WPIA 4MABA 2XHFA 2QSIA 3TJJA 3I9V2 5ELGA 2VUPA 1OYJA 4NV2A 4HZ2A 3ZZXA 3GIXA 2OACA 4BVXB 2HRNA 1A2LA 1T3BA 1SYXA 2YANA 2RM6A 3HHVA 3I69A 2IIYA 2R6KA 1OC8A 4KCAA 2Z9SA 4O5RA 4QL9A 2GZZA 5F07A 4ZXGA 2L6DA 3I6AA 2DJJA 3HXSA 4DSQA 3DXBA 1WWJA 4OFNA 2HFDA 3ED3A 1O73A 4TR1A 2V41A 4JEDA 1FOVA 3DIEA 4ZB8A 4LMWA 2JSYA 3QD9A 4EF0A 3FR9A 1JZOA 2B5EA 2GTUA 1XWAA 2WRTA 4ISDA 4F0BA 3GFKA 3PH9A 2HYXA 5ECRB 1PX6A 5KN2A 2LQQA 1XXUA 2VCXA 5ECLB 3ZIVA 2IFQB 3H93A 3FZ9A 3KP8A 5GZZB 1PMTA 2VAFA 3QAWA 3D0ZA 4KDYA 3H79A 3ERGA 3VFIA 1F3AA 3DVWA 1VF4A 2HQTA 2VM2A 4TR0A 3RHCA 1SD8A 4EUYA 2CVKA 4ECIA 4HS1A 2HSMA 1O85A 3RPNA 2XPEA 1TRVA 1BJXA 4GSSA 2G0FA 1B48A 1R4WA 1NM3A 1OC9A 2JZRA 1H75A 2KOKA 1K0AA 3TDGA 2I3YA 1MDKA 2O8VB 4MF7A 4IJIA 1GUHA 3FHKA 1AC1A 1S3AA 1XW5A 3TJBA 4XCSA 4X43A 3UBKA 2PU9C 5IO0A 6GSYA 2GQLA 2WFCA 5JCGA 4IP6A 4HDEA 1ZCPA 5G2ZA 3BCKA 1QQ2A 1ERTA 3F6FA 4YH2A 4ECCA 3EC3A 5J5NA 5CO3A 2AUVA 4V1Ag 1TXXA 3NZNA 4NXIA 1MEKA 4MH3A 5COHA 2LS5A 3GH6A 1DE2A 3DKSA 4L5LA 1EWXA 2YZUA 2V32A 3KP9A 3CTFA 2IMFA 3TJGA 2P5RA 4PNFA 3EWLA 4WBRD 3F4RA 2FD3A 3VWVA 1R26A 1C72A 3A2XA 1BG5A 3VURA 1J9BA 4ZBDA 1YKAA 2X8GA 3WD6A 4I6XA 2OJLA 3QAGA 2ALBA 19GSA 4OCEA 3US3A 1U88A 5KN1A 3KGKA 2H0IA 2L6CA 2E2MA 4NHWA 1LJRA 2LKUA 5D8IA 4G0KA 1ERUA 1KNGA 2EIRA 4IQAA 3QDNA 1XVWA 3GSTA 1U6TA 4RQRA 3LXZA 2QGVA 3A2WA 4BL7A 2VCVA 2LJAA 1OAZA 3KTLA 4O32A 1A0FA 1TK5B 4USSA 3VK9A 1ZGNA 3ERFA 4AJ6A 3GNJA 1GNWA 3MDKA 1A23A 1XVQA 5HQPA 1AQXA 1X0RA 4MJAA 3D4MA 4KB3A 1X9MB 5ELAA 2YP6A 2I1UA 2M80A 4EO3A 3DVXA 3LGCA 4TR3A 4PGTA 3IXRA 5D96A 1PA3A 3UVTA 9GSSA 1GTAA 4F9ZA 1SL1B 4MF6A 3O6TA 2YV9A 1Z7PA 1PN9A 4K0NA 1V98A 3Q19A 3FYGA 3UARA 2L4QA 2RUEA 3BOAA 1XFLA 3KEBA 4KAEA 5JCUA 1PL2A 3VI5A 5CREA 4TXVA 2GSRA 22GSA 2YWNA 5F8BA 4FO5A 1K0DA 5D9WA 4K9ZA 3RDWA 3UIWA 1BAYA 3VI7A 3GTUB 3LORA 3ZRDA 3VPQA 4KF9A 2K8VA 3I43A 1WMJA 4YAPA 5D93A 10GSA 1OE7A 4IN0A 2KUCA 1V9WA 5B6NA 5J41A 3FRCA 3MSZA 2FWEA 4RI7A 2V6OA 5HR2A 2CZ2A 1Y6EA 3ME7A 4XS6A 2WDUA 4MK3A 2KP2A 4YQUA 3F3RA 6GSVA 1X9SB 5H5SA 1FAAA 5JWQB 4NHZA 1V58A 4KE3A 4GQFA 1VRSD 1ZYEA 3DYRA 3GL5A 5AIXA 1EEJA 1A0RP 2D2ZA 4MF5A 3W8JA 1FO5A 2FLSA 4ACSA 3C73A 4WF4A 5FT3A 2V6KA 2GSSA 4TR1B 2X99A 3MNGA 4Z7XA 2R3XA 1Z6MA 2B1LA 3HVVA 2HRAA 4XRDA 3APQA 1H4OA 1B9XC 1GNEA 5DQYA 1AQWA 2HZFA 2JADA 3FZ4A 2C3QA 3F9UA 1PRXA 2XBIA 3BCIA 2BMXA 3DRNA 4E8HA 3LFLA 1RW1A 4EXJA 1PL1A 2WJUA 4G9HA 1B9YC 2HXKA 2VLTA 1QXHA 3C1SA 2LRTA 2YN1A 4POBA 2BTOT 2H74A 1EP7A 1SK0A 4PX1A 2AYTA 2H75A 1F9MA 3G7YA 2PVOC 1W89A 3J7Yk 2NVLA 2OKAA 3VWXA 2E7PA 1O7UA 5DJMA 2GQMA 2HSMB 5IMDA 4KX4A 3KMOA 1WJKA 4P3YB 4I97A 1OC9B 1XOAA 2VL9A 4WR5A 4JR6A 3BJ5A 4MLYA 3KH9A 2OBKA 3EMXA 3KZQA 2MMOA 13GSA 4ZB9A 1SK1A 1GSYA 1JZRA 2YWOA 2TRCP 2MBSA 3O3TA 4NMUA 3IC4A 1G0TA 4OMVA 4KNDA 2NDOA 2X8CA 2CT6A 2JSZA 3GV1A 2GZPA 2I4AA 3F8UA 1K0BA 2YWMA 5GAND 2OA7A 1VF3A 4BWQA 2M46A 1NHYA 2K6VA 5HR0A 5DALB 1GTUA 5D9VA 5L71A 2VCQA 5D73A 2H30A 1HNCA 1XWCA 2IMEA 2DC5A 1J08A 3LYPA 2P5QA 3GL3A 1G6YA 4IELA 4XIHA 1OKTA 4Q5QA 5DCHA 4PXOA 2E0QA 3G7JA 3ZMKA 2NTOA 4JZQA 2OE0A 4WF5A 4ZL7A 1G7EA 1DUGA 3LWAA 3KM6A 2FY6A 5B7CA 2VL3A 4MDCA 1GTBA 2LQOA 2N5AA 2AAWA 1THXA 5GAPD 3F4SA 5AIVA 1MD3A 4OO5A 2JZSA 1XIYA 3UEMA 5H5QA 3TGZA 1OE8A 1TRSA 3BBYA 3QR6A 5ID2A 4IJ3A 4IGJA 2LRCA 3ZVJD 2L4CA 1O8XA 2F3MA 3KIJA 5DAKB 2M72A 4DSSA 2QC7A 1EZKA 3GURA 1GSSA 2V1MA 3LYKA 1U3AA 3GMFA 2WS2A 4EDZA 2MMAA 3OR5A 2H71A 4MJEA 4BL7B 4EDYA 3WT2A 2R5GA 2GSTA 4KUNA 1AXDA 3QFAC 1AIUA 2EC4A 3HD5A 5IM9A 5IIZA 1B8XA 2DJ1A 1XPVA 3Q6OA 1EEMA 4HJ2A 4JU5A 2PN8A 2WB9A 4HU9A 3TKQA 4POKA 1M9BA 2OBIA 4XRAA 4OD7A 4TRXA 3P90A 2PMTA 1M2BA 4TW5A 4HQSA 2GDRA 1GLQA 2X64A 4GSNA 3LG6A 1M2DA 3C8EA 3HDCA 2HRKA 2LRNA 2V2GA 5INYA 1Q4JA 4V2MA 4FYBA 2ON7A 1A2MA 3S9FA 2DSAA 2REMA 1ILOA 1PKWA 2PWJA 3FKFA 1RQMA 2L5OA 2UZ8A 3EYTA 5DBQA 2FWFA 3ME8A 3LXTA 4DSRA 2FA4A 2VCTA 5IMVA 1XWBA 3KJYA 5IPGA 4BVYA 2VOCA 4L0UA 4NAXA 1JLWA 5FWGA 4XTSA 2I81A 4RUVA 2FCHA 1E6BA 3LQ7A 2AJQB 2WGRA 5DCGA 1WE0A 1LU4A 4O92A 1TI3A 2HSYA 2K9FA 4BWSA 2B5YA 3R2QA 4IS0A 1JZDA 1YF0A 5CRGA 2N5BA 1VF2A 2OE1A 4HI7A 3HCZA 3F63A 1GSFA 2F9SA 4K7OA 3HYPA 2HSHA 3C7MA 5KN0A 3R3EA 1NSWA 3P7XA 1FG4A 1PKZA 20GSA 3ZMLA 1PX7A 2IMIA 4K0GA 1XOBA 2B6MA 3P8WA 1F6MC 4FYUA 4FIWA 4TOPA 2L59A 4D73A 4PQIA 5ECIB 4PUAA 1AQVA 5CYYA 2L5LA 2FNOA 3UJ1A 3APOA 3FK8A 3A3TA 1EV9A 1AAZA 2ZNMA 2ZCTA 14GSA 4HQZA 3C1RA 3AY8A 3J7Yb 1HNAA 2H6ZA 4FQUA 4OFTA 5B8BA 4YAVA 3UVHA 4HUAA 4HU7A 2FUG2 2RUFA 2H1AA 3MWHA 4X1UA 2VCWA 1WIKA 2DIZA 1VGLA 3D21A 1HD2A 1K3OA 2H0HA 4N11A 4XS4A 1Z7RA 5JWOB 2FWHA 7GSSA 4WKWA 3TKSE 1YQ1A 2YZHA 4I5QA 4HZ4A 1LBKA 2HZEA 4RI6A 1A2JA 4MZCA 1GH2A 3M0FA 3U5RE 3ZYWA 1XWKA 2C0EA 4KGIA 3RHBA 4J2FA 3EINA 2C1YA 3RBTA 3VWUA 2BJXA 1R5AA 1HQOA 3IE3A 5A4WA 4F0CA 2IL3A 4CHSA 2RIIA 1MD4A 2AHEA 1SKWB 3C71A 2DJ0A 3HVXA 4BPYA 3ZREA 5G5EA 3M3MA 2K18A 3E3EA 4F03A 4ZILA 5IOXA 4EVMA 1V2AA 2H1GA 3LJRA 2H0GA 2H1DA 17GSA 1M0UA 4Q5FA 5EY6A 3FZ5A 2C0FA 4TR4A 5HFIA 3EU4A 3HA9A 1GRXA 1VF1A 1X5CA 2CX4A 3GYKA 3FEUA 4K6XA 4K2DA 2OADA 1YEPA 4QQ7A 2DJKA 1TRWA 1MDIA 5IOWA 4POLA 5J9CA 1SL2B 3W8SA 3CMIA 4ECBA 2CA8A 2CZ3A 11GSA 4V2LA 5DVBA 3HJOA 4MZWA 3M1GA 1NW2A 3ZTLA 2LNTA 4IKHA 1TK0B 3IRAA 1B4QA 4O7HA 2YNXA 3HJPA 3GHAA 1EGRA 4GF0A 3TKRA 1K3YA 5CAXA 2GLRA 1BX9A 4ZBBA 2PBJA 2H66A 4G0LA 1O6JA 1RK4A 4NV5A 1GSEA 4KDXA 2LJKA 6GSWA 3H8QA 3IR4A 2GVPA 5JWRB 3ZFLA 1U3IA 3WGEA 1YEXA 3D5JA 3U6VA 2H6XA 3BD2A 1ERVA 2C4JA 4HEA2 2LJRA 4ZB6A 1SK2A 1EV4A 1ABAA 2MZCA 3IDVA 2VIMA 3IOSA 1UVZA 4MPGA 1QGVA 5ECSA 2H70A 3EMPA 1TTZA 5ID2B 2XBQA 4K7NA 1T1VA 4DSSB 3E9JB 3JCML 4K8MA 3TOUA 4LLRA 1ZZYA 5J4UA 3IK9A 3A5WA 4L5OA 3KCMA 1ACVA 1TU7A 1O8WA 2E2GA 3EVIA 4NWYA 2C3NA 4ID0A 3UMAA 4ILFA 3HY2A 2L57A 1FW1A 3M8NA 2P0GA 3RAZA 1A8YA 2VLVA 2AB6A 2CQ9A 5ECKB 3ZLPA 3CXGA 4K7IA 1YF1A 1UN2A 2DJ2A 2H19A 5DJLA 2K8SA 3M9JA 4KA0A 1QUWA 3Q18A 1GULA 1UC7A 1Z9HA 1G7OA 5LNKe 2LSTA 2CAIA 4TVEA 2GSQA 2HRKB 1F3BA 4KH7A 3GRXA 1XW6A 1GTIA 1KEBA 3FY7A 1R7HA 4WEYA 2LTKA 3VWWA 2YOIA 1SL0B 3EU3A 4F2IA 3GSSA 2O87A 4ZIJA 3W6GA 3GN3A 2JL4A 1TKDB 3SWLA 2VD0A 3UBLA 2GQKA 1WRYA 2CVBA 1N8JA 12GSA 5B6MA 2YWIA 3GX8A 4YQVA 2J23A 2YCDA 2FHEA 5B8AA 4N0VA 4MH2A 5D9TA 3L9UA 2VD1A 5C00A 4LA1A 4GWRA 1IYIA 1TJDA 3TOTA 2WCIA 2C3TA 3GKXA 1K3LA 1JZWA 3RPPA 3TKSC 3UL3A 3CSIA 4K1FA 1TDIA 2LNSA 4EE0A 1GSUA 2CX3A 3IHQA 5IMCA 1QK8A 1X5EA 1GUMA 5ENUA 4BA7A 4HOJA 4D73B 2OE3A 1GSQA 2RLIA 3F6DA 1YZXA 3SBCA 2A2SA 3QAVA 5G1LA 1M7TA 1TP9A 2C0GA 3LSZA 3TRXA 1TRUA 3TUEA 4Q5NA 1B4PA 4IVFA 2H76A 1QFNA 3KD0A 1K0MA 1SENA 4MJBA 3IBHA 1BYEA 1YKCA 2GGTA 1AW9A 3PPUA 2N5FA 1E2YA 2PPTA 3GX0A 4G19A 3CSHA 2IMKA 4EC0A 3KTBA 3WT1A 3VLNA 4J56E 1PQNA 3ZVJA 4MCUA 5IPHA 2HSNB 2YJHA 3CBUA 4HJMA 5H5RA 2H72A 2YV7A 2KHPA 4TN8A 4XS4B 1F2EA 3H1NA 3FW2A 1GLPA 4ULXA 3HZ8A 4PQHA 2H01A 4WR4A 2HZEB 4FH8A 1Y25A 2F51A 3GKMA 5CP1A 2J9HA 3IV4A 4GCIA 3V1WA 2PGTA 1HYUA 1FB0A 5CNWA 2B5XA 1K0OA 3IPZA 3L0HA 1IYHA 3IA1A 1EP8A 3H4KA 3NOFA 3GKKA 1OKDA 1ZOFA 6GSTA 1TOFA 1QMVA 2R2JA 1SJ6A 1KBNA 2GS3A 2X8HA 1XZOA 3HZ4A 2NPBA 3TJKA 2JZTA 4QL7A 4DVCA 5IQYA 1MTCA 2VO4A 2O7KA 1Z6NA 2R37A 1URMA 3L9SA 2NBSA 3F3QA 4CDOA 1HNBA 1Z3EA 3FR3A 5EL8A 1S3CA 1XCCA 1ZYQB 4MZBA 2O85A 5IMZA 5J9BA 4TXOA 3PGTA 1X5DA 5CRDA 5CRWA 4MP4A 5HR3A 3UOMA 1UA5A 3N9JA 5F06A 1O81A 2B1KA 4GRFA 3IK7A 5DQSA 4V2NA 1T00A 4PUFC 1G6WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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