3DD3A

Crystal structure of the glutathione transferase pi enzyme in complex with the bifunctional inhibitor, etharapta
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
210
structure length
210
Chain Sequence
MPPYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Rational design of an organometallic glutathione transferase inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase P
total genus 77
structure length 210
sequence length 210
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2008-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3dd3A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3dd3A01
5CP1A 2R3XA 5G30A 4POLA 4X43A 2CT6A 1UC7A 2B1LA 2V1MA 20GSA 2FA8A 2V41A 1ZYEA 3L4NA 2MYGA 18GSA 1S3CA 1VF3A 1XPVA 4EE0A 4KSMA 4XS4A 2DJ2A 4V2NA 3TJJA 3QR6A 4L0UA 3HY2A 1T4YA 1GNEA 1KEBA 3F63A 1K0NA 3IC4A 1GTBA 3ZLPA 2YPMA 4ML6A 3HVXA 3UBLA 5HR2A 3D0ZA 4OD7A 4MJBA 5LCZA 1AUCA 3N5OA 3D4MA 4HDEA 4IQ1A 1PKWA 3HHVA 2FHEA 2VD0A 4G0LA 1HYUA 3O6TA 2GSQA 2DJKA 1THXA 2L4QA 4O92A 4GSSA 5ECSA 3SBCA 3L0HA 2YWNA 4JEDA 4F03A 2PWJA 2EC4A 2HFDA 2WCIA 3ZRDA 1U3IA 3CSJA 2VD1A 1OKDA 3EINA 1G0TA 4TRXA 1M9BA 3KZQA 4WBJA 11GSA 1TI1A 2EIRA 5IOWA 3C73A 1OVNA 1K0DA 2IFQB 1TOFA 1ZCPA 5DJMA 5A5KA 4BVXA 5JWRB 2PN8A 3QAGA 3IR4A 3EMXA 1KTEA 3O3TA 2GDRA 1NSWA 1C72A 4WXTA 2MMOA 4N0ZA 5ID2A 5HQPA 4OFMA 3KJYA 5GSSA 2MMAA 4XS6A 2PU9C 4IVFA 1M2DA 4HU9A 5CAXA 2VO4A 4LL4B 5KN1A 4G10A 3EU4A 3VWVA 1WMJA 5IPHA 1M0UA 2WGRA 2FWHA 4DSRA 1N8JA 1FW1A 4G9HA 4MCUA 1MDJA 1DSBA 3EU3A 5AIXA 1XOAA 2ES7A 3ZMKA 5J3RA 3U6VA 2N5AA 2YJ7A 5ECLB 2WJUA 4OCEA 4AJ8A 1OAZA 3APQA 4CDOA 2H01A 1SL2B 5B8AA 2ZCTA 5DDLA 5CRGA 1UVZA 4I97A 1X5DA 2JZTA 2YV7A 2OJLA 3D22A 3OR5A 3DYRA 3IAS2 4XHMA 3ZYWA 4QL9A 4PNFA 2HT9A 1SJ6A 4N0VA 2GT5A 4O5RA 2I4AA 4KSOA 1BG5A 2P5RA 4YQUA 1XVQA 5J4UA 1ABAA 4FH8A 3RHBA 4KCAA 2XPDA 3QFBC 4TN8A 1I5GA 4JRRA 3HKRA 5B8BA 1TRVA 3ZVJA 1HQOA 5CNWA 4TVEA 4J57E 3GHAA 1SK0A 3L9VA 1V2AA 1ST9A 1O7UA 1WIKA 4IW9A 4HQZA 1EOGA 2YN1A 2CX3A 4MZBA 4NMUA 1JZDA 5A4WA 3IC8A 4WETA 1F6MC 2GZYA 2AYTA 1G7OA 4AJ7A 3F9UA 2IL3A 2H6XA 1NW2A 5HR0A 4HI7A 2LJKA 1EWXA 2XBIA 2FY6A 1ERWA 3RPNA 3DEXA 1AAZA 5CO3A 3DGQA 1MDIA 1TTZA 2RIIA 1E2YA 4K1FA 4RI7A 2A2RA 2EIQA 2B6MA 5B6MA 2B5YA 3BOAA 3F3QA 1TK5B 1DBYA 2WS2A 4MDCA 3ISOA 2PERA 2H6YA 4ZB6A 3WGEA 2H0IA 1O73A 2XHFA 2P31A 4YAVA 2LUSA 4EC0A 3GX8A 1J9BA 1FAAA 3H1NA 1ERVA 2JZRA 2JADA 5DAKB 4WKWA 4MPFA 2VL2C 4MH2A 4BVYB 4HUAA 5DALB 4G0IA 4EDYA 1SENA 2KHPA 2HI7A 4Q5NA 5EY6A 1JFUA 1OKTA 2HNLA 1T00A 3TKRA 2IWTA 3W8JA 2LNSA 5IMCA 2OKAA 3IRAA 1A0RP 3FEUA 1O85A 2PBJA 3M8NA 2L5OA 2GVPA 3IK9A 3UOMA 2M46A 3QFAC 4BL7B 1WPIA 4PQIA 2FA4A 4XRDA 4K2DA 4OO5A 3UL3A 2M80A 3SWLA 1YF1A 3TJBA 2H1GA 3LQ7A 3CTGA 2K8VA 3GA4A 2C3TA 1FO5A 1Z6MA 2LJRA 1VGLA 1A8YA 1R5PA 2IJYA 3WGDA 1F2EA 2I9HA 3A5WA 5KN0A 1PL2A 2HZFA 2K8SA 1PQNA 1UA5A 2ALBA 1XFLA 2HRFA 1GSDA 5ELGA 3GKNA 5IMZA 2B7KA 2C0DA 3KCMA 4CHSA 4FQUA 3Q19A 2JL4A 1URMA 1K0BA 3ME7A 1X0RA 3P90A 1MDKA 1USBA 4V1Ap 4CW9A 2B1KA 2C4JA 3LXTA 3WYWA 2BJXA 3VPQA 4TR4A 1M9AA 4DVCA 1GULA 2J23A 2NBSA 3KP8A 1SU9A 2YWIA 4AGSA 4J56E 1LBKA 1R26A 1SJZA 4MZWA 1WJKA 2YOIA 3PINA 5F0GA 5J9BA 4ISDA 4OFTA 1TP9A 4OCFA 2CVBA 5AGYA 2LJAA 2VCWA 4HJMA 1YDKA 3DMLA 4GXZA 1QFNA 4IBPA 2XPEA 2H8LA 3GNJA 3TRXA 2K6VA 3QAWA 1XCCA 3PH9A 2VIMA 5DAKA 3LYPA 1Q98A 2BMXA 4LLRA 2LRCA 4ID0A 3Q6OA 3HCZA 1QXHA 4O7HA 5G1KA 4USSA 3FW2A 8GSSA 2H72A 4PX1A 3C1RA 1EEJA 2HSYA 4TR0A 4HZ4A 1AQWA 5ECOB 5FWGA 3FR3A 2B5XA 3GL5A 3I9V2 4IELA 7GSSA 3IA1A 4DSSB 2LKUA 4BL7A 2QKEA 2DJJA 3HJPA 3DD3A 1TU8A 6GSYA 3TCOA 3UBKA 3W8SA 4MZCA 2PPTA 3VI7A 1W89A 1OE7A 2QSIA 2KP2A 3EURA 1XWBA 4IHUA 3VI5A 3ERFA 1LJRA 5JCWA 2CZ3A 1K3LA 1FVKA 2E7PA 2MMZA 4X1UA 2MBTA 1AXDA 2ON5A 4POMA 2IN3A 2A4VA 3IXRA 5GAPD 1PRXA 2NTOA 4RQRA 4MF5A 2B3SA 3P2AA 5EPFA 1J08A 2VLVA 4KNDA 3GUSA 6GSXA 2VL9A 4L5LA 3I69A 2LEGA 4IN0A 4TR3A 2VM2A 1KNGA 1U6TA 5GSTA 1TRSA 3O76A 2LNTA 3UMAA 3HJMA 4KE3A 3C71A 3BD2A 5A4UA 1K3YA 3EE2A 5IOXA 4MABA 1QK8A 3FR9A 17GSA 1HNCA 2H73A 3PPUA 5G5FA 3E9JB 2L57A 5ECPB 1BAYA 1SKWB 3H4KA 3A3TA 4OFNA 1QGVA 4MJCA 3EYTA 2DMLA 4EL1A 3IBHA 3K8NA 2VCXA 4K0NA 1AC1A 4YQMA 2LV3A 1M99A 4EVMA 1ILOA 1GSFA 4IJ3A 3LG6A 1SJIA 4MLYA 3FZ9A 4FIWA 2C80A 3M9KA 5KN3A 3KGKA 3BJ5A 3UJ1A 3F4RA 3RPPA 6GSVA 2G2QA 3FZ5A 3LXZA 5DQSA 3UVTA 3TJGA 4JZQA 1JZWA 1U88A 1FB0A 4IGJA 16GSA 1Y25A 2VM1A 4KB3A 3DRNA 6GSSA 1PSQA 4JR4A 5ELAA 5L71A 1PA3A 2WZ9A 3ERWA 2JZSA 1T8EB 5JWOB 1ZYQB 3GSTA 2IMDA 5G2ZA 1PX6A 2WRTA 1F3BA 2H6ZA 2E2MA 4FO5A 2DC5A 1A0FA 4BPYA 2JACA 3TB2A 4ZL8A 2HQTA 1T7PB 2Z9SA 4HS1A 2H0HA 3GFKA 4MH3A 3QOUA 1K0CA 4KDUA 2O87A 5F8BA 3GL3A 5IPGA 3M1GA 5J9CA 2VL3A 2JSYA 4POBA 2VLTA 1NHYA 2AHEA 4F82A 4RQXA 1EP7A 1PL1A 2P0GA 1Z7RA 4NHZA 2YANA 2FWGA 4AJ6A 2YWOA 1GUKA 1PGTA 2B5EA 1WWJA 4JU5A 2DJ1A 3GSSA 3TJFA 3D21A 3M3MA 5F06A 2MBSA 3HZ4A 1WE0A 1GLQA 1O8WA 4TR1B 4E8HA 4PUFC 3TJKA 4MPGA 1WRYA 3WGXA 3KM6A 4KUNA 4P3YB 5GAND 5LNKe 2HZEB 2VCTA 2HXKA 4KA0A 4EF0A 1SKRB 1X9SB 2PVQA 1XW9A 3QD9A 1E6BA 1XW5A 2IMEA 2RM6A 3EC3A 4ZBAA 1ON4A 1A8LA 2HRNA 4F0BA 1YKAA 3E0UA 3F6FA 1F37A 3VPTA 3LJRA 9GSSA 1TKDB 2CZ2A 3TRPA 1VF1A 3US3A 4MF6A 1JHBA 1B4QA 3HDCA 2IFQA 2OBIA 4NV2A 2RLIA 1XWCA 1OC3A 14GSA 2DSAA 1CQGA 4Z7XA 2K18A 1RW1A 2HRAA 3ZTLA 5G5EA 2UZ8A 1S3DA 3HA9A 2GLRA 3TKSE 2OA7A 1JZRA 2IIYA 4TKYA 5D9TA 1A23A 3BBYA 1ACVA 5HFIA 3APSA 4PUAA 4LA1A 10GSA 3LWAA 1A24A 1VF4A 3CSIA 2H71A 5ECQB 4KCEA 3F6DA 3TKSA 4PXOA 4GLTA 1OC9B 4GSTA 3EMPA 2OBKA 5IM9A 3GURA 5IO0A 4L8EA 4IS0A 1FOVA 3A2WA 2E2GA 2DJ0A 5DBQA 1GP1A 2YNXA 1MEKA 2HRKB 4K7IA 1RK4A 2CAIA 2ON7A 2F8AA 2WB9A 3IHQA 2DJ3A 4NHWA 4G0KA 4D73B 5JCUA 3ZL5A 1QUWA 2PVOC 1FG4A 2X8CA 1WP0A 3KH9A 3Q74A 3H93A 3DIEA 4L5OA 2C3QA 4TXVA 3NIVA 4ZB8A 5H5SA 1PMTA 3TKSC 1XWKA 1M2AA 2YWMA 3D4TA 5DQYA 3DWVA 2V6KA 1F3AA 2OE1A 3CTFA 1GSQA 2FUG2 1Q4JA 2QC7A 2H1BA 4HU7A 2KLXA 2REMA 3N9JA 3FZ4A 3HVSA 2HSNB 1RQMA 5AIVA 2D2ZA 3D5JA 3UAPA 2FGXA 1X5EA 3IK7A 1XXUA 4IKHA 5CRDA 3MAKA 2B7JA 2OE0A 4XCSA 1EV9A 3HJOA 3KTLA 2R4VA 1M7TA 4K8MA 2OADA 2KOKA 2H1AA 4HEA2 1N2AA 2H19A 1BQ7A 1JLWA 2LSTA 4J2FA 4OWYA 6GSWA 5KEJA 2H70A 4XS4B 4FYCA 2DLXA 3ZREA 5FT3A 2ZUPA 3GKMA 3VWWA 1GTUA 5LD0A 4MF7A 4ZILA 5H5QA 1V58A 4GQCA 3UARA 3FHKA 1FB6A 1V98A 4JBBA 4MK3A 4PQ1A 3LGCA 4GQFA 1K0AA 2CV4A 2C0FA 5HR1A 4KX4A 1GUHA 2MMNA 1T4ZA 3LEFA 4KGIA 4I6XA 4WR5A 3C1SA 4XIHA 2ZNMA 1MD4A 1OC9A 2X8HA 1A2LA 4BVYA 5DALA 4XTSA 1SD8A 5A4VA 2H1DA 3IOSA 2FNOA 3RBTA 5DCHA 4NPBA 3RDWA 1AQXA 5J41A 1AW9A 4HZ2A 4RUVA 3GH9A 1YZXA 5ENUA 1THOA 4G2EA 2N5BA 5CREA 3AY8A 4Q5FA 3L78A 3QCPA 4BVXB 1XZOA 3TKQA 3P8WA 1O6JA 1EGOA 1NM3A 3CBUA 4KDXA 2O85A 3GIXA 2X8GA 1A2JA 2V2GA 3G7YA 4ECCA 4I8BA 2DMMA 1HD2A 3TDGA 1ML6A 3FR6A 1XIYA 3F0IA 4POKA 5ABRA 2PMTA 2XBQA 2P5QA 1GNWA 2GQKA 4K7OA 13GSA 1YEPA 1W4VA 5B6NA 4WEYA 2L4CA 3APOA 3VK9A 2PGTA 3IPZA 1QMVA 1PN9A 3QAVA 1TI3A 1Y6EA 2WULA 1X9WB 1BYEA 4MA9A 3A2VA 1SYRA 2CVKA 5KN2A 2HSHA 2L59A 3R3EA 4WR4A 1UN2A 4BWSA 5D8IA 3BCKA 2TRXA 1ZZYA 4GCIA 1S3AA 1PKZA 3F8UA 1B4PA 1TK0B 1OE8A 3ERGA 4EXJA 3GTUB 3IE3A 3RAZA 2LTKA 4O32A 2AUVA 3GYKA 4EKZA 2QGVA 2GSTA 3HZ8A 3KMNA 1B8XA 5DCGA 4EO3A 2GGTA 4DSQA 1EV4A 1GRXA 4LMWA 3LFLA 4LMVA 4KH7A 4ZBDA 1TRWA 4PNGA 1T1VA 2I81A 2AJQB 4ZIJA 3WT1A 1U87A 1TU7A 4GRFA 4WBRD 3WT2A 3J7Yb 4BA7A 1B9YC 4KF9A 1GLPA 5DJLA 2A2SA 2H76A 1XW6A 3F4SA 3NOFA 1TRUA 1Z3EA 5G1LA 5C04A 3LYKA 4ECJA 5INYA 1LU4A 3ZVJD 1G6WA 4NWYA 2O7KA 4F0CA 3DXBA 3ZFLA 2VUPA 2GQMA 1B9XC 2VAFA 1K0OA 4N10A 4PGTA 3P7XA 2FD3A 3JCML 2HLSA 2V32A 1V9WA 3GRXA 1B48A 3W6GA 1O81A 4I5QA 3HXSA 2LQQA 2H75A 2FWEA 4HJ2A 3BCIA 4V2LA 1IYHA 1R5AA 2J9HA 2H74A 3F3RA 2BTOT 1BJXA 12GSA 1GSYA 1J0FA 1EEMA 5HFKA 3KIJA 3TUEA 2MZCA 4YH2A 5BMUA 4DSSA 3DKSA 1H4OA 2HYXA 3FK8A 3CSHA 2R37A 2DIZA 1IYIA 1K3OA 3MWHA 1R7HA 2IMIA 5ECIB 1BX9A 3GKKA 2YV9A 1FVJA 1XWAA 4ULXA 3TGZA 4XRAA 4LL1B 1TDIA 19GSA 2GZPA 4MJAA 3KEBA 4IP1A 1T3BA 3ME8A 1XBSA 1DUGA 3GKXA 1ZOFA 5AN1A 5AISA 4G19A 2VLUA 3U5RE 3ZITA 3J7Yk 1F9MA 5H5RA 4NV5A 5ECHB 1PX7A 5IMFA 2L6DA 5COHA 2M72A 1TK8B 2I1UA 2YP6A 4ECIA 1MD3A 4IQAA 1TW9A 3VFIA 5D9XA 2RUFA 2CX4A 3A2XA 5E4WA 4GF0A 3PGTA 2F9SA 3G7JA 4IJIA 22GSA 3GTUA 2N5FA 4K0GA 4Q5QA 1SD9A 2I3YA 4AF2A 1DE1A 2C0GA 1XOBA 5J5NA 3CXGA 3MDKA 4EDZA 2CA8A 3UEMA 4PTSA 2F8FA 1HNAA 3QPMA 4F9ZA 5IQYA 5CRHA 3KTBA 3I6AA 4WF5A 4GWRA 1O8XA 3C8EA 3RHCA 2GQLA 1XWGA 1Z5YE 6GSTA 2GSRA 3F4TA 3GN3A 2FCHA 1JLVA 2WDUA 4GSNA 4WF4A 3GH6A 4RI6A 1BEDA 1GTIA 3QDNA 3V1WA 2X64A 5D96A 2HE3A 2VL2A 2LRNA 1GTAA 3IV4A 2JSZA 3LORA 3M9JA 4TXOB 3QMXA 2X99A 3KXOA 1XVWA 3DVXA 1GL8A 2E0QA 1EP8A 1WOUA 1GSSA 1PD21 4X0XA 1CQHA 3CYNA 2R5GA 2F3MA 2C1YA 1I9DA 5HFGA 2NPBA 5IMAA 3LSZA 5ECMB 2FWFA 5IMDA 1EGRA 2YZHA 3H8QA 3NZNA 4JR6A 3HVVA 5F05A 1JZOA 4KDYA 2AB6A 2L6CA 4K9ZA 5EL8A 3KP9A 4E8EA 1V57A 5GZZB 4BWQA 1TJDA 1V40A 2IPAA 2C3NA 1ZL9A 5JWQB 3WD6A 1YJ6A 3G9BA 1FHEA 1TXXA 3GV1A 2K9FA 4I2UA 2EIOA 4H86A 3ZIVA 4N30A 2NDOA 1GH2A 2R6KA 1SL1B 1AQVA 1R4WA 1ERUA 2G0FA 3IDVA 2HSMB 4YQVA 3DVWA 3FZAA 1VRSD 5CRWA 4NXIA 4I2TA 3L9SA 3TOUA 3ED3A 5EVOA 1QQ2A 5ECRB 1Z6NA 1G6YA 3ZMLA 2CVDA 1YEXA 4TR1A 5IMVA 2OACA 2JU5A 2IMKA 2LRTA 1X9MB 2VCZA 2H0GA 3KMOA 2GT6A 2HZEA 3TRQA 3FRCA 2YJHA 1SL0B 4EUYA 1YKCA 3EVIA 4MJEA 4QQ7A 2O89A 5E59A 5D9VA 3VWXA 1OC8A 4K7NA 4ZL7A 3C7MA 4OMVA 1X5CA 5F07A 1ZMAA 3FYGA 3M0FA 4ILFA 1EOHA 2AV4A 1GWCA 2AAWA 5IIZA 4ECBA 3VLNA 4PURA 1ERTA 1YF0A 2O8VB 5DVBA 2TRCP 4KW6A 2PUKC 3UIWA 3HD5A 4XS1A 2CQ9A 4ZL9A 1YY7A 1VF2A 4ZBBA 4QL7A 4TXOA 2F51A 3CRTA 2KP1A 3R2QA 4ZB9A 1MTCA 2GTUA 1NHOA 1HNBA 3GMFA 2GZZA 1ZGNA 5ECNB 1Z7PA 3FY7A 4N11A 4FYUA 5HR3A 1Z9HA 4DEJA 3I43A 4L0WA 3TOTA 2RM5A 4TW5A 4F2IA 4FYBA 4ML1A 1OYJA 2KUCA 2C8UA 2NVLA 5CYYA 5ECKB 3ZIJA 2VOCA 3ZZXA 4MMMA 3CRUA 3MSZA 3E3EA 4V1Ag 1YQ1A 2XC2A 5IO2A 2DBCA 2YCDA 2WFCA 4PQHA 4TOPA 1SKSB 3L9UA 4HOJA 1AIUA 1EZKA 2HRKA 6GSUA 2GS3A 3IAM2 3EWLA 2H30A 5D93A 3KH7A 2H66A 1G7EA 4MP4A 1DE2A 1GUMA 4D73A 2HSMA 5ID2B 4KAEA 1A2MA 2VCVA 3UVHA 3H79A 3S9FA 4HQSA 3ZFBA 1K0MA 2VCQA 2YZUA 3KD0A 3GX0A 2R2JA 4OO4A 4Q5RA 3FKFA 3PR8A 3VWUA 2FLSA 5D9WA 1SK2A 3HYPA 2IMFA 2LS5A 2GSSA 3TKPA 3D6IA 5C00A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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