3LFLA

Crystal structure of human glutathione transferase omega 1, delta 155
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
236
structure length
236
Chain Sequence
SARSLGKGSAPPGPVPEGSIRIYSMRFCPFAERTRLVLKAKGIRHEVININLKNKPEWFFKKNPFGLVPVLENSQGQLIYESAITCEYLDEAYPGKKLLPDDPYEKACQKMILELFSKVPSLVGSFIRSQNKEDYAGLKEEFRKEFTKLEVLTNKKTTFFGGNSISMIDYLIWPWFERLEAMKLNECVDHTPKLKLWMAAMKEDPTVSALLTSEKDWQGFLELYLQNSPEACDYGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Novel folding and stability defects cause a deficiency of human glutathione transferase omega 1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase omega-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 236
sequence length 236
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.20.4.2: Methylarsonate reductase.
pdb deposition date 2010-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3lflA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lflA01
3UBLA 3F9UA 5KN2A 1U88A 2MZCA 4KW6A 4HZ2A 2MBSA 5ECPB 1NW2A 5JWOB 2FWGA 1OE7A 2EC4A 1GSSA 1SYRA 1JZOA 3WGDA 3TGZA 3M3MA 4WXTA 3UBKA 5G5EA 5CAXA 1TRSA 2B5EA 2FHEA 2I9HA 2VCQA 3TKQA 1SKSB 2H66A 3QDNA 3HYPA 2LKUA 2ZCTA 9GSSA 3I43A 2YANA 2GTUA 1O85A 1FO5A 4OFNA 4OCFA 4MJEA 4NHZA 5LD0A 3QCPA 2GZPA 5L71A 1E6BA 3GKXA 3HZ8A 3L9UA 5EVOA 3EU3A 5DAKB 2B6MA 2IJYA 1AXDA 3Q6OA 5J41A 2AYTA 2C3NA 2H8LA 4WKWA 1XVWA 3TKSE 3ZVJD 4FH8A 1HD2A 3BD2A 2OADA 1PKZA 3KCMA 3DVXA 4KH7A 3I6AA 4JE1A 1H4OA 1YF1A 3QAGA 4OCEA 4RQXA 5ELAA 4PQ1A 2LQOA 4IS0A 1M2DA 1T1VA 1E2YA 1FVJA 2H74A 2LJRA 1EV9A 2LQQA 4BWQA 5AIVA 2DC5A 5IO0A 4AF2A 3P8WA 3GV1A 3S9FA 3VLNA 3ZFBA 4K0NA 1JZDA 2O8VB 3IXRA 2GQLA 2ZUPA 2AHEA 1ABAA 1Y6EA 4ZXGA 3RPNA 2VLTA 2JZRA 4L0UA 4N11A 4KCEA 3EWLA 3QD9A 1ERTA 3CSJA 1XZOA 2VM1A 3NIVA 3MDKA 4POMA 4WBJA 2H75A 2R2JA 2CX3A 3D0ZA 2RIIA 3LG6A 4MF6A 1SENA 1YEPA 2YWOA 3DWVA 4ILFA 4MMMA 1XWAA 4EDYA 2IMIA 5DQYA 4TR3A 5B7CA 4GQFA 3EMPA 2B5XA 4NV5A 3IAM2 5HR0A 3FR3A 4ZB6A 5IQYA 2FUG2 1GTIA 1YQ1A 1O8WA 3KP8A 2FWEA 2FCHA 3C8EA 4EL1A 5D9WA 3Q19A 3KIJA 2L4QA 1B9YC 4ID0A 1X0RA 1HNCA 1BG5A 1R5PA 2HRNA 1BJXA 2LV3A 4F9ZA 4ECJA 3CTGA 3ZIVA 4GSTA 1AAZA 4K9ZA 3TRPA 2E7PA 1GRXA 4IQ1A 1TKDB 2KOKA 1JLWA 4ZB9A 1VRSD 4HQSA 6GSSA 1TTZA 4ZBDA 5DCHA 2YWMA 3UVHA 7GSSA 3RHBA 5ECSA 2M80A 3GKKA 2CA8A 3G7YA 5F07A 3SBCA 3FR6A 1XCCA 1UC7A 3RBTA 2V41A 3P2AA 2HQTA 1LBKA 2NBSA 2H1BA 1XW5A 3W8SA 2C3TA 3UOMA 2WCIA 1SKRB 2R3XA 1OC9B 3LXTA 4QL7A 4TR4A 1GSFA 13GSA 2AV4A 3FRCA 4O7HA 2PERA 2HYXA 2R4VA 4KDUA 1GSEA 2YV9A 2FGXA 2J9HA 2BTOT 2CX4A 4PUFC 1OKTA 4ZBBA 3D4MA 2VL2C 4MZBA 4ZBAA 4KAEA 4MK3A 4NAXA 2CZ2A 4HI7A 4G10A 1ZYQB 2HZEB 3HDCA 3L78A 3FW2A 5ECIB 3CSIA 4OFTA 1GULA 2F8AA 1N2AA 3PH9A 5DDLA 3LGCA 1DE1A 2H6XA 4G19A 4MDCA 4RI6A 3I69A 4P3YB 2DJ0A 5GAPD 2L6DA 4ZILA 3ZTLA 2BJXA 5IMVA 1LJRA 4BVYA 4AGSA 3DIEA 3LYPA 3CXGA 4OO4A 2V2GA 1YY7A 4KA0A 4FYUA 4JR4A 2HSMB 6GSYA 4IN0A 2VCZA 1GTBA 4WEYA 5J9CA 4DSSB 3G7JA 3E0UA 2H71A 1KNGA 2GQKA 3LEFA 5ID2B 1VF2A 1ERVA 2YJ7A 12GSA 4FIWA 5EY6A 4CHSA 5HR3A 4KUNA 3RAZA 1WE0A 3GFKA 2OACA 2WDUA 3E3EA 4NV2A 2RLIA 1M7TA 3ME7A 2HE3A 2IMEA 5G5FA 6GSWA 1T00A 1JHBA 3EU4A 5CRGA 4PURA 3ZFLA 3UARA 4BVXA 2HFDA 1SJIA 4OO5A 2HRKA 1ZYEA 4TN8A 2XHFA 1S3DA 1G0TA 5D9XA 3F63A 2UZ8A 3R3EA 1WPIA 4E8HA 3IC4A 2DJJA 1GUHA 4KSMA 4OMVA 2RUEA 1EP8A 2A4VA 4HS1A 1ZL9A 3GURA 2R6KA 4QQ7A 1B48A 2X8GA 1FB0A 3NOFA 3RPPA 1K3YA 2FA8A 1HNBA 3ZMLA 5HQPA 1ZGNA 1SD8A 3U5RE 2VD1A 2V6OA 5ECKB 2N5BA 4NXIA 5ECRB 1QQ2A 2F8FA 3FZAA 3GMFA 1EOHA 5KN3A 3GRXA 2C8UA 3PPUA 4RUVA 5IMCA 1S3AA 4KDXA 5G1LA 3QR6A 2FA4A 1A0RP 1XXUA 2LTKA 2G2QA 4JU5A 1SK1A 1TI3A 1K0CA 3UMAA 3Q74A 3F0IA 4MZCA 4YQMA 2V32A 4OFMA 3TKSA 1N8JA 4L5OA 5AGYA 2LRNA 1V40A 3O76A 1W89A 2H1AA 1TP9A 2H6YA 4X0XA 4BWSA 4JRRA 2GSTA 3TJFA 3ZMKA 2X64A 4L5LA 3TJKA 3LFLA 2IPAA 5G2ZA 3EVIA 4Q5QA 4WBRD 4J2FA 1K0MA 3APOA 2MBTA 1WMJA 1FAAA 2E0QA 3TB2A 1T8EB 4MJBA 2ZNMA 1F2EA 3O6TA 5HFIA 4KE3A 5J9BA 5IMFA 4BA7A 3UJ1A 1F3AA 2OKAA 1R7HA 1A2LA 4GF0A 4MCUA 1SKWB 1I5GA 2MMNA 1Y25A 5CP1A 1WOUA 1NHYA 4FO5A 1PN9A 3IK7A 4TKYA 4XS4B 3KMNA 2OJLA 3DXBA 1XOAA 2XPDA 3IR4A 2WB9A 3HXSA 1V58A 6GSXA 3CTFA 4HEA2 1XOBA 2IFQA 4PQIA 2N5AA 4IVFA 2O85A 2DMMA 2QGVA 3KTLA 1G7OA 5F06A 1M2AA 3MNGA 3PINA 2B1KA 4HZ4A 2FY6A 4EDZA 2DJ3A 1SL1B 2HSHA 4ZL8A 2FNOA 1X9WB 4IBPA 3TDGA 2NPBA 2M72A 5B8BA 3C7MA 2A2RA 4IP6A 4HDEA 3IA1A 1XWGA 2C0FA 1EP7A 2R37A 3ERFA 2RM5A 1J08A 2PPTA 1CQHA 3M1GA 2ES7A 5ECLB 1WRYA 1S3CA 3D22A 4EXJA 2GDRA 2VM2A 4K2DA 2YZUA 2MMZA 3F8UA 5IOXA 3LYKA 2AB6A 2F9SA 4PNGA 1KEBA 2IN3A 3FK8A 1GLPA 2PGTA 1GTAA 4N0ZA 1K0DA 1THOA 1RW1A 2GSQA 3F4SA 4TR1A 3ED3A 3TJBA 1FHEA 3HHVA 2H30A 5DALA 1YEXA 4LMWA 1GLQA 4IKHA 1OC8A 1X9SB 3GNJA 4IP1A 2MMOA 2WJUA 3ZZXA 4POLA 2LJKA 3F6FA 4F03A 1TU8A 4H86A 4IJ3A 3GL5A 1JFUA 4ZL7A 4V1Ap 2KP1A 2HNLA 1A8YA 2DIZA 3FZ5A 3J7Yk 3RDWA 1V9WA 3P7XA 4XS6A 5G30A 2XC2A 1A24A 5DCGA 4USSA 3ISOA 4L8EA 1EV4A 3TCOA 1TK8B 4Z7XA 5JWRB 2ALBA 3KM6A 2OE3A 2N5FA 2VL3A 4PNFA 2PUKC 4NWYA 2JSYA 4EE0A 4OWYA 1Z3EA 1SD9A 2HT9A 3ZYWA 1TW9A 3LSZA 5ECQB 1SJ6A 3I9V2 5COHA 3WGEA 2DLXA 2DIYA 1YJ6A 2C4JA 2DJKA 3A2VA 1TDIA 3L9SA 5D8IA 2GT6A 2LNTA 3DD3A 5ABRA 3QAWA 4WF5A 1X9MB 4IW9A 1K3OA 11GSA 4L0WA 1AQXA 4LA1A 4YQUA 1DBYA 2EIRA 2GLRA 2VCXA 2V6KA 4YH2A 1ON4A 3DEXA 2K18A 5DBQA 1TRVA 5DAKA 2NTOA 4TVEA 1U6TA 2FWHA 3M0FA 2K6VA 2DBCA 5ENUA 2CVKA 5D9TA 2JL4A 4PTSA 1ZMAA 3O3TA 2IWTA 4NHWA 4KX4A 4K6XA 3TRXA 2H70A 1SL0B 2MMAA 4J57E 2YCDA 3IC8A 2P31A 2B5YA 4ML6A 5H5QA 1PA3A 1CQGA 2PVQA 1DSBA 3QOUA 2O89A 3OR5A 5J5NA 2LRTA 1USBA 4ZB8A 3DGQA 2GT5A 1SJZA 3FZ9A 2Z9SA 1WIKA 3VI5A 2B3SA 3ZL5A 4ML1A 2YNXA 1TXXA 5FT3A 1B9XC 4MF5A 4TR0A 4FQUA 3HCZA 1T4ZA 3GIXA 1BEDA 5EL8A 4AJ6A 3GA4A 3GL3A 1KBNA 4G9HA 4O5RA 3HJMA 1F9MA 3QAVA 2MYGA 3KEBA 2L6CA 1GTUA 2P0GA 2L5OA 4MLYA 4D73B 4GXZA 2VO4A 4MF7A 3IAS2 4EF0A 2B1LA 16GSA 1WJKA 2BMXA 3VK9A 1EOGA 3TUEA 4Q5RA 1XPVA 1OYJA 3GHAA 1OKDA 2H6ZA 2VL2A 2L59A 4I2UA 4J56E 1XVQA 3UL3A 3SWLA 2HXKA 5E4WA 1QUWA 4DSRA 5JCWA 1A2JA 4V2MA 1XFLA 3UAPA 4F0CA 1BYEA 3MSZA 1V2AA 4MJCA 3K8NA 4BVXB 5KN0A 3FEUA 2HRKB 1ST9A 10GSA 2YWIA 4MABA 3VPQA 2F51A 1GUKA 1J9BA 4JZQA 2VCTA 4TRXA 5CO3A 4TW5A 1B4PA 1J0FA 2H1GA 4KB3A 3WGXA 2B7JA 3D21A 2QSIA 1F6MC 4IELA 2HI7A 3LWAA 2C80A 3F3RA 1XW9A 1QXHA 2OBKA 4G0KA 4G0IA 1FG4A 1TRUA 4WF4A 3CYNA 2JU5A 4WETA 1M2BA 3WT2A 1XIYA 3BCIA 2IMFA 2X99A 5CRDA 1GSDA 1GNEA 1QMVA 1A0FA 2JZTA 2C0GA 1JZRA 3RHCA 4XTSA 1PL1A 1K0NA 1FB6A 4WR5A 4MPGA 3EYTA 5J4UA 4O32A 2LEGA 5DJMA 1XBSA 4HJMA 4MH2A 3MWHA 1PX6A 1PL2A 1OC9A 3WYWA 5BMUA 2RM6A 4EKZA 2WGRA 3F6DA 4CDOA 4GRFA 1OAZA 4TXOB 5D93A 4YAPA 1MDIA 2WS2A 5KN1A 2XPEA 1XW6A 1ZZYA 5LNKe 5ECOB 2C1YA 2K8SA 3A3TA 1BAYA 5DVBA 1QFNA 1Q98A 1SK2A 4PUAA 1T7PB 3TJJA 2HZEA 3GSTA 3ERWA 3HZ4A 2LNSA 4O92A 2PWJA 2YZHA 4BL7A 5G31A 1JLVA 1TI1A 1K3LA 1X5DA 5HFKA 3CBUA 1TK0B 3JCML 5CRWA 5F0GA 3D6IA 4X43A 2IFQB 2RUFA 3IHQA 3FHKA 1MTCA 4Q5NA 18GSA 2DJ2A 2HZFA 3GTUA 4IGJA 1MD4A 3HJOA 5C00A 3ZVJA 2VCVA 2PU9C 2KUCA 19GSA 2WULA 5A4UA 1W4VA 4DSSA 2LRCA 1MDKA 1PMTA 1RK4A 1YF0A 2AUVA 2WZ9A 1QK8A 2HRFA 5ID2A 2KLXA 2GSSA 2PMTA 4LL1B 2EIQA 5JWQB 2EIOA 5HR1A 4FYCA 2JACA 3QFBC 3VURA 2FLSA 2VUPA 3VWWA 4MH3A 1MEKA 1TK5B 1O6JA 2AAWA 4XCSA 5AN1A 5GSTA 2YP6A 3AY8A 2DJ1A 2GSRA 1GP1A 1DUGA 1A8LA 4HU9A 1GSQA 2LS5A 3LJRA 1X5CA 3GH6A 3ZLPA 1PSQA 5HR2A 5C04A 2TRCP 4N30A 1JZWA 5CNWA 3KH7A 4TR1B 2CV4A 3IV4A 3A5WA 4HQZA 5DALB 1EWXA 5EPFA 4MP4A 2L57A 2YOIA 5JCGA 3KTBA 1YKCA 3C1RA 2XBQA 5CRHA 4WR4A 1AUCA 4I8BA 4GLTA 2YJHA 4TXVA 3Q18A 3G7IA 3U6VA 2CVBA 4KCAA 3CRTA 3M9JA 1B8XA 1R4WA 3CSHA 2H76A 3EURA 2H1DA 1ILOA 3L0HA 3FR9A 1PKWA 1HNAA 2I81A 2E2MA 2I4AA 2IMDA 3L9VA 1VF3A 1UVZA 4EO3A 2G0FA 1AQVA 1KTEA 2KP2A 4CW9A 3H1NA 3TRQA 3N9JA 1M99A 3H8QA 4LL4B 4ECCA 3GUSA 2NVLA 2D2ZA 4PXOA 3G9BA 4GWRA 1NM3A 3KZQA 1GSYA 4X1UA 2YV7A 1YDKA 4Q5FA 4HOJA 3GKNA 1GUMA 1V57A 2YN1A 1M9BA 1Q4JA 4V2LA 2O87A 1XWBA 1GSUA 1XWCA 3KXOA 3DYRA 4MJAA 5D9VA 2GVPA 4GTUA 5A5KA 2GQMA 3IRAA 5H5SA 3M9KA 4KF9A 4IHUA 4N10A 2ON5A 1VF1A 2PN8A 4AJ8A 1LU4A 4IQAA 4JR6A 4XS4A 5CYYA 1SL2B 3HJPA 1T4YA 3W8JA 2C3QA 1UA5A 2L5LA 3HVVA 3BJ5A 3VWUA 3KP9A 3NZNA 4GSSA 1OE8A 3GSSA 1GWCA 4IJIA 4I5QA 2AJQB 4TOPA 3US3A 4K7IA 4N0VA 1Z7RA 1O7UA 5B8AA 2WRTA 3VFIA 3UIWA 1YKAA 5KEJA 3ME8A 2C0EA 2VOCA 4AJ7A 2VCWA 4LMVA 3IK9A 3ERGA 3FY7A 4PX1A 2QKEA 1AC1A 2HRAA 3CRUA 3KD0A 3PGTA 2WFCA 5ECNB 5ECHB 3N5OA 4XRDA 3IDVA 2CAIA 5GZZB 3QFAC 3TOTA 1PD21 5A4VA 3HY2A 1SYXA 1IYIA 4PQHA 4JEDA 1WP0A 4ISDA 4FYBA 3A2XA 3ZREA 3FYGA 1AQWA 5HFGA 1T3BA 2JADA 3KGKA 1VF4A 4G0LA 1R26A 2OBIA 3F4TA 3ZRDA 2CT6A 1F3BA 5IPGA 1OVNA 3W6GA 4ECBA 1G6WA 4XHMA 4GSNA 2TIRA 3HD5A 3QMXA 2E2GA 3GH9A 4BPYA 4K1FA 3F3QA 1I9DA 5CREA 4I2TA 6GSTA 1K0AA 2X8CA 4KDYA 2GS3A 2K9FA 2PBJA 1PQNA 3R2QA 17GSA 1EEMA 1TJDA 5GSSA 1K0OA 4KSOA 4BVYB 4NPBA 1ERUA 4MPFA 1FVKA 1A2MA 3HVXA 5IMZA 2CQ9A 4HU7A 3QPMA 4K0GA 5FHIA 4MZWA 2QC7A 2ON7A 5IPHA 5IO2A 3HA9A 3WD6A 1H75A 3VPTA 1YZXA 2VLVA 3GN3A 3PR8A 3ZIJA 1G7EA 3LXZA 4JBBA 5DQSA 1Z9HA 3IBHA 1VGLA 5B6NA 1TRWA 1M9AA 3DKSA 2PVOC 4ZIJA 5LCZA 3HVSA 2CAQA 4POKA 1U3IA 1GL8A 4KNDA 3H93A 2GGTA 2JSZA 3UEMA 5INYA 3EMXA 1HQOA 1ZOFA 1NHOA 2LSTA 3TKRA 2OA7A 1GH2A 1V98A 5AIXA 5IM9A 3FKFA 4F82A 4HJ2A 1THXA 2KHPA 2CZ3A 1K0BA 2O7KA 3H79A 1ML6A 4EUYA 3APQA 1PRXA 1PX7A 2H19A 2X8HA 5J3RA 3J7Yb 4BL7B 3KH9A 2V1MA 3A2WA 2VIMA 2JZSA 4RQRA 2L4CA 3GX0A 1ERWA 3UVTA 4QL9A 5IMDA 2YPMA 2FD3A 6GSVA 3GTUB 2VAFA 5IOWA 1NSWA 2H01A 2GZZA 4PGTA 4XS1A 1PGTA 1U3AA 5E59A 3GKMA 1TOFA 5ECMB 1EZKA 1MD3A 4D73A 4MA9A 3DMLA 3DRNA 4ZL9A 4F2IA 2K8VA 8GSSA 4GQCA 3EE2A 1ACVA 3L4NA 5IMAA 1G6YA 2A2SA 2IMKA 2HSNB 1Z6MA 2J23A 4HUAA 2H0HA 4F0BA 2DSAA 1UN2A 4I6XA 3IE3A 4YAVA 1F37A 2VD0A 2IIYA 3M8NA 1DE2A 3CMIA 2DMLA 2HLSA 4XIHA 1TU7A 4EVMA 2R5GA 1BX9A 2REMA 2OE1A 3TJGA 3ZITA 1U87A 3VI7A 1SU9A 4K7OA 1R5AA 1B4QA 4ACSA 4ULXA 3KJYA 5DJLA 1IYHA 3VWXA 5B6MA 1SK0A 5H5RA 4G2EA 4OD7A 2NDOA 3D4TA 1Z7PA 1URMA 2P5QA 3TKPA 2XBIA 3FZ4A 3C1SA 5IIZA 3BBYA 2M46A 4GCIA 1AW9A 1RQMA 5F05A 2TRXA 4RI7A 3E9JB 3LQ7A 1EEJA 2GZYA 5F8BA 2HSMA 2I3YA 4V2NA 1O73A 1FOVA 2H0GA 3H4KA 1O8XA 1WWJA 4I97A 2LUSA 5GAND 3BCKA 1C72A 4ECIA 4DSQA 1EGOA 2LJAA 4XRAA 5D96A 4POBA 3MAKA 4NMUA 3APSA 3EINA 5D73A 3EC3A 1X5EA 4KGIA 4EC0A 4DVCA 2H72A 1Z6NA 6GSUA 3D5JA 1AIUA 2P5RA 2H73A 5G1KA 2B7KA 3IPZA 3GX8A 3WT1A 1OC3A 4E8EA 4DEJA 2F3MA 3C71A 3V1WA 2C0DA 1QGVA 5A4WA 4TXOA 3TKSC 3GYKA 1O81A 3LORA 4YQVA 2VL9A 3DVWA 4K7NA 3F4RA 4K8MA 2VLUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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