3NIVA

The crystal structure of glutathione s-transferase from legionella pneumophila
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
210
structure length
191
Chain Sequence
ILYDYFRSTACYRVRIALNLKKIAYEKIEVHLLVPSLDINGQILSQSMAIIDYLEEIHPEMPLLPKDPFMKATLKSMALIVACDMHPLNNLRVLNRLKEQFNANEEQVLEWYHHWLKTGFDAFEEKLGALERDKPVCFGSEVGLADVCLIPQVYNAHRFHFDMASYPIINEINEYCLTLPAFHDAAPEAIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of Glutathione S-transferase from Legionella pneumophila
rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1
molecule keywords Glutathione S-transferase
total genus 59
structure length 191
sequence length 210
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.2.1.2: Maleylacetoacetate isomerase.
pdb deposition date 2010-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3nivA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3nivA01
2MYGA 3OR5A 1SKWB 1DE1A 2DJ0A 2H0IA 2DJ1A 2DJJA 3GYKA 3KD0A 3GH9A 4MH3A 3KJYA 3TKQA 2X8CA 2L6CA 4XS4B 1PKZA 2C0EA 1M2DA 3CXGA 5CO3A 4GSTA 3FEUA 4KF9A 4PQ1A 2HT9A 2WDUA 2H0GA 2YANA 2H30A 2FUG2 4PQIA 22GSA 4HOJA 2LV3A 3P8WA 2VD0A 3IBHA 4BWSA 4E8HA 3ME7A 3V1WA 2VL2C 5DALA 5JCGA 2CT6A 3HYPA 1X5CA 4IELA 1FHEA 2P5QA 5J9BA 2YCDA 3GNJA 4O5RA 3F6FA 3GTUB 5H5QA 4NHWA 2E7PA 2YP6A 3C7MA 1Q4JA 4ACSA 4TR3A 3EMPA 3LXZA 3UJ1A 4FQUA 3GFKA 1H75A 2CA8A 4ZILA 4ILFA 1X5EA 2HLSA 2H01A 3QAVA 2B7JA 1S3DA 1ZCPA 2MMOA 2CAQA 3CTFA 3GV1A 1ON4A 3LWAA 2MBTA 1PQNA 1N2AA 1MDJA 3TKSC 2ZUPA 4HEA2 4WF5A 4K9ZA 5ELGA 3P2AA 4V2NA 4EVMA 2GSSA 2AUVA 1T8EB 3TJBA 3TJFA 1SK1A 1GNEA 5ENUA 1XPVA 3KM6A 1GH2A 5B8BA 1AQVA 1VGLA 3ZZXA 1KNGA 1TRVA 3G9BA 1SL0B 3FZAA 1PGTA 3K8NA 5ECNB 2CVKA 3L9VA 2HNLA 5IOWA 4KH7A 3L9UA 4Q5NA 3UVHA 4G19A 1S3CA 4L0UA 2AHEA 3FW2A 1PMTA 3EC3A 4GF0A 3L9SA 2YWNA 1QUWA 2VCTA 5ECMB 5AISA 2B1KA 3GL5A 1F2EA 2GSQA 4AJ6A 3IR4A 12GSA 1M9BA 1GSYA 5HR0A 3APSA 2DJ2A 1JFUA 2CVBA 2DIZA 2PMTA 1HQOA 2CZ3A 3QFBC 4NXIA 5JWQB 4WKWA 1VRSD 1ZYEA 1EGRA 4ECCA 5IQYA 3EU4A 4NAXA 4TKYA 3CMIA 2JL4A 4NHZA 5ECSA 2CZ2A 2F8FA 3TUEA 2DBCA 2K18A 2N5BA 4NV2A 3GKMA 4KA0A 2I3YA 1K3LA 3UMAA 2WZ9A 3BCKA 1QQ2A 2VL2A 3A2XA 2K8VA 5D96A 2WS2A 4ECBA 3VWWA 5F06A 2F9SA 1RK4A 4HJMA 4I2UA 2WRTA 5HR3A 1OE8A 4G0LA 4WBRD 3FR3A 3IE3A 3HKRA 3IXRA 5CRDA 2IMKA 2N5AA 4OCEA 2KOKA 2H1GA 3MNGA 1J9BA 1Y25A 4F82A 2RLIA 2HE3A 4PNFA 4EC0A 1GP1A 3RPNA 1BG5A 1EEMA 4N0ZA 4KAEA 2KUCA 1R4WA 3HY2A 3ED3A 5GSTA 1GSEA 3HCZA 4OFNA 1FOVA 3QPMA 4BVXB 5HR2A 1MDIA 1G7EA 2FHEA 1SJ6A 4DSQA 5IO2A 3TRXA 4MABA 5DAKA 3GN3A 1WIKA 4YH2A 2OE0A 5IMVA 5AIXA 1Z5YE 5CRWA 4ZL7A 5F0GA 2PVOC 1UVZA 2LEGA 1AIUA 4ZL8A 3ERFA 1ABAA 4FYUA 1HNBA 4MLYA 3F4TA 1EGOA 3FR9A 4EE0A 5JWOB 5G2ZA 4L8EA 1AW9A 2M80A 2FY6A 1T4ZA 1PD21 1U87A 4BVYA 3DXBA 2NTOA 1OC9A 1K0NA 2JZRA 1YQ1A 1PKWA 1EP7A 1A2JA 4LLRA 2H1BA 4ZBAA 1XWAA 3KH9A 3KIJA 2FWEA 2P0GA 3MSZA 3DVXA 4ML1A 4MJCA 3FZ4A 1H4OA 3ISOA 3LFLA 1YJ6A 3Q19A 4K8MA 4MJBA 3FR6A 4AJ8A 4ID0A 3GSTA 1R7HA 1YF0A 5A4WA 2E2MA 6GSTA 2IL3A 1F6MC 1K0DA 3ZFBA 2LRTA 4I6XA 3UL3A 1F3BA 2DC5A 2AB6A 2KP2A 4MPFA 1ST9A 4KUNA 2UZ8A 5A4UA 4IS0A 1GL8A 1TKDB 1I5GA 4Q5QA 3KXOA 3UIWA 2FA4A 3F4RA 3O6TA 2PGTA 2P31A 7GSSA 1J0FA 3IA1A 1V57A 4Q5FA 2XHFA 1GSDA 1GWCA 2CVDA 4ZBDA 4AGSA 2R37A 3TRQA 4TXOB 3EE2A 3HVSA 2MMZA 1B4QA 4ULXA 2GQKA 4XRAA 2OACA 4XRDA 4ZB8A 1VF1A 3GRXA 3TJKA 5IMFA 1TJDA 3ZVJD 4YAPA 5HR1A 2WFCA 5E59A 4TR1A 1UN2A 3EU3A 2IMIA 1G0TA 2RIIA 2L57A 1ERUA 2HZEA 2IMFA 3D5JA 1WMJA 3M9JA 4PX1A 3ZFLA 3SBCA 2OBIA 1GSSA 5ECQB 3FZ5A 6GSXA 3WGXA 2VCZA 2O8VB 4IBPA 5LNKe 1K0AA 4NV5A 3U6VA 4XIHA 1GLPA 1ILOA 2GDRA 3IK7A 4ISDA 1GUMA 2HQTA 1U3AA 4PUAA 2J9HA 1A2MA 2JU5A 4QL9A 4MF7A 3I9V2 2GT6A 1TP9A 1BYEA 4KE3A 4KNDA 1U6TA 2RUEA 2OE3A 3IAM2 3TOUA 1ZL9A 1NHOA 2B5XA 2H6XA 3Q18A 4BL7B 4XCSA 2EIQA 5EPFA 4CHSA 3H93A 1EEJA 5GZZB 3P90A 1JZWA 4KDYA 3ZTLA 1HYUA 3ZL5A 3LYKA 4RI6A 3MWHA 2NPBA 3O76A 4GCIA 2GS3A 2G2QA 4XS4A 1XWCA 2R3XA 3JCML 1FW1A 2PWJA 1IYIA 2PN8A 3R2QA 2FD3A 2XC2A 1LJRA 1F3AA 2P5RA 2IMDA 3QD9A 1QFNA 3WGDA 1BAYA 4HJ2A 2KP1A 16GSA 4TRXA 5IPHA 5GAPD 5GAND 1Z9HA 3GX8A 5ID2B 4RQXA 2LSTA 4XHMA 2OA7A 2YV9A 4Q5RA 1EWXA 4ZBBA 2GTUA 3C8EA 1VF2A 2V41A 3FYGA 2VAFA 4ECIA 3R3EA 1FG4A 5E4WA 1T1VA 4BA7A 2HRKB 2CX3A 4KX4A 5ECRB 1A0RP 1PL2A 4ZB6A 2JACA 2PVQA 3NZNA 3GKNA 1SYRA 3RDWA 2PU9C 3H1NA 2DSAA 2XPDA 3GH6A 3TDGA 5HQPA 2GSTA 1ZYQB 4MF6A 4J2FA 1Y6EA 2WGRA 2GQLA 5ECHB 3Q74A 4I2TA 2XPEA 1S3AA 3HZ4A 3ZYWA 1CQGA 5DQSA 3L4NA 11GSA 4ZL9A 5INYA 5C00A 1TI3A 2FA8A 4MZWA 5LCZA 1NHYA 5IOXA 1TK0B 1GTUA 3IK9A 1Z7PA 18GSA 4IW9A 2LTKA 4HQZA 1ZMAA 2LRCA 4V2LA 2H0HA 1Z7RA 3ZIVA 3E3EA 1GSQA 1LBKA 1DBYA 1DUGA 1N8JA 4NPBA 4KDUA 2VIMA 3ZITA 1OKDA 3ZRDA 6GSWA 3TCOA 2HSYA 1OE7A 1V58A 4JZQA 1TU7A 5C04A 4OMVA 2ZNMA 4I97A 3SWLA 2YWOA 3IC8A 1CQHA 1OYJA 1O85A 1XWKA 1WE0A 2VL9A 2IFQB 2KLXA 1T00A 5G30A 3WT1A 1JZDA 4IP1A 4WXTA 4MH2A 5J4UA 2H71A 2H72A 4EDZA 1ML6A 1KTEA 2L6DA 4TN8A 3KGKA 4LA1A 1SD9A 3QFAC 2MZCA 3RBTA 2KHPA 2VCQA 4HDEA 2VCVA 3LJRA 2EIRA 3M1GA 1TRUA 3G7YA 4KB3A 2HZFA 2DMMA 5DJLA 1USBA 3GMFA 4GRFA 4MF5A 4WR4A 1R26A 3BCIA 3LEFA 2VO4A 4MA9A 2B6MA 4QQ7A 2IN3A 5H5RA 4X1UA 3L78A 4XTSA 5CRHA 2MBSA 1A23A 1XCCA 5ECKB 2IPAA 5EY6A 5B6NA 1YKCA 5JCWA 5G1LA 4FIWA 3UAPA 4EF0A 3GHAA 5G5EA 3CBUA 5ECLB 3EMXA 3RHBA 1UC7A 2R4VA 2ON7A 3LGCA 3J7Yk 2V32A 2AYTA 3D4TA 1GUKA 4XS6A 3PINA 4K6XA 1X5DA 3G7JA 5B7CA 2REMA 3TKSE 3TB2A 4BVXA 4GQFA 4MP4A 1LU4A 2QSIA 2VM2A 4WBJA 4FYBA 4GSNA 3PPUA 1PRXA 1O7UA 3DIEA 3I6AA 2PBJA 2YWIA 1RW1A 4L5OA 2N5FA 4GSSA 2V2GA 4MCUA 3KTLA 5LD0A 5DCHA 5B8AA 3N5OA 2YOIA 2B7KA 4IJIA 3DKSA 3IDVA 3KP8A 4MJAA 4DSSB 2YWMA 3NOFA 5FHIA 3CRUA 3FRCA 5AN1A 2CX4A 3A5WA 1SKRB 4V1Ag 5CNWA 2YV7A 1YDKA 3TKSA 2LNSA 4ML6A 4IP6A 2C0GA 17GSA 4ZB9A 1I9DA 2C8UA 2H74A 1TDIA 3DVWA 3EWLA 1OC8A 3EURA 4G2EA 3E9JB 4F0CA 4AJ7A 2H1DA 1XXUA 4F0BA 1K3OA 3HA9A 4X43A 5CRGA 1JZOA 3TRPA 1EOGA 4HUAA 3A2VA 2X64A 3W8SA 3VK9A 1DSBA 3DEXA 5JCUA 4F9ZA 3IV4A 1GRXA 1A8YA 2HRNA 2DLXA 2HRFA 5G1KA 3I69A 4Z7XA 2C0FA 3TKRA 5J41A 3APOA 4OD7A 3CSJA 2K6VA 1X9MB 5KEJA 2C0DA 5IPGA 9GSSA 5ECIB 1XZOA 3LYPA 3KEBA 2C3TA 1XWBA 3NIVA 4PXOA 4TXOA 1SL2B 2AV4A 3VLNA 3VWXA 4RI7A 4POKA 1NW2A 5IMCA 5DBQA 1OC3A 2BMXA 4JU5A 2EIOA 5AGYA 1K3YA 2JZTA 2V6KA 3HD5A 3L0HA 5DJMA 3HDCA 2LRNA 2DMLA 13GSA 2LNTA 3U5RE 4HU7A 3BBYA 4XS1A 3PR8A 1G6YA 2XBIA 3DRNA 5J9CA 4F2IA 2RUFA 4HU9A 4K7OA 1PN9A 3IOSA 4EUYA 3GL3A 1PL1A 2LJAA 4NMUA 1HNAA 5D93A 4MPGA 5KN2A 2GSRA 1F9MA 5GSSA 1IYHA 1G7OA 1AUCA 4AF2A 4HQSA 1ERWA 1BEDA 2OE1A 2OADA 2H76A 4L5LA 3F0IA 3D21A 3GX0A 4DSRA 4HZ4A 2XBQA 5ELAA 2O85A 1PX6A 3F9UA 1EZKA 2F8AA 1QMVA 1K0MA 1M2BA 3LORA 2HI7A 3US3A 1JLWA 4I8BA 1MD3A 3VWUA 2C3QA 4TOPA 2BTOT 4BWQA 1BX9A 3FY7A 1OAZA 3VI5A 3ZLPA 4PNGA 2C1YA 4J56E 1THOA 4LL1B 5HFKA 2L4QA 3CTGA 2QKEA 4KCAA 4V1Ap 1GTBA 1WPIA 5D73A 3W6GA 1U3IA 5FWGA 2QC7A 3WT2A 2HSMB 1WJKA 1ERTA 3QOUA 1QGVA 4JEDA 4KSOA 5DCGA 4QL7A 1M2AA 3VFIA 8GSSA 2WB9A 1TRWA 4JR4A 2WULA 2E2GA 4MZCA 1T7PB 1ZGNA 1SJIA 3RAZA 4K7IA 1TK5B 1ZOFA 1XOBA 4IN0A 1EV9A 4O92A 1SU9A 3WD6A 1PSQA 2FLSA 3KTBA 2PERA 2YNXA 2A4VA 4G9HA 3DD3A 3I43A 5D9VA 4ZXGA 4FH8A 4IVFA 2QGVA 1R5PA 2I1UA 1YY7A 2FWHA 2AJQB 2H19A 4D73B 1O8XA 1JHBA 2HRKA 2TRCP 5KN0A 3VURA 2DJKA 4EL1A 1V40A 5A4VA 2ALBA 3TGZA 1K0OA 4JR6A 5ABRA 3KZQA 3N9JA 1TW9A 2ZCTA 2I81A 4WEYA 4MDCA 2X8HA 2OJLA 2HSHA 2B3SA 1AQXA 4KW6A 2VCWA 2PUKC 1MDKA 4K2DA 2LQQA 1K0BA 1O6JA 3D4MA 4OCFA 4IQAA 2X8GA 4H86A 3GSSA 2NBSA 4J57E 3LXTA 2R5GA 1BJXA 5F05A 2C80A 1GSFA 4G0IA 3WYWA 2MMNA 4E8EA 4DVCA 3F3QA 5CP1A 2YJ7A 2BJXA 4EO3A 3GTUA 3EINA 2H6YA 5F07A 1JLVA 3M9KA 3ZREA 1UA5A 2VD1A 4IQ1A 1B9YC 1SL1B 4DEJA 4I5QA 1AC1A 3QAWA 5FT3A 1EP8A 4V2MA 3TJGA 1FB0A 3HVXA 1M0UA 1WOUA 2OBKA 2AAWA 2I4AA 4FYCA 1RQMA 1EOHA 1THXA 4YQUA 1TXXA 1SD8A 4LMVA 1GTAA 2IFQA 2ES7A 4TW5A 4WR5A 6GSUA 2MMAA 4G0KA 3DYRA 3HZ8A 3FKFA 1M99A 1O73A 3DMLA 5COHA 3F8UA 4NWYA 2CQ9A 2B5EA 2YPMA 4LMWA 5EVOA 1FB6A 3IRAA 4JBBA 2VCXA 3CRTA 2VOCA 1GTIA 3FZ9A 3CSIA 1EV4A 1BQ7A 2GZYA 1GLQA 5HFIA 3HJOA 3HJPA 2L59A 1FVKA 3LG6A 4KGIA 4IKHA 1V98A 4YAVA 2K8SA 2GZZA 2HSNB 2FCHA 2FNOA 1R5AA 3M8NA 4OFMA 4OO4A 1AQWA 2JZSA 2R6KA 3HXSA 4ZIJA 3Q6OA 5D8IA 3CSHA 5BMUA 3ME8A 2NDOA 2CV4A 3F3RA 3VPQA 4K7NA 4IGJA 3GIXA 4RQRA 4TXVA 1A0FA 2GGTA 5KN1A 5H5SA 3UBKA 4ECJA 3ERGA 3HJMA 4GLTA 3EYTA 3QAGA 1XVWA 2V6OA 4O7HA 1SK2A 2WJUA 1T3BA 5DDLA 1E2YA 2YZUA 2JSZA 3D6IA 2LJKA 1K0CA 2GT5A 2RM5A 6GSVA 4WETA 1OKTA 2H8LA 5DALB 2YN1A 3GUSA 4OWYA 3H4KA 3QDNA 1WWJA 5KN3A 2Z9SA 1XBSA 4X0XA 4PQHA 1A24A 1XOAA 6GSYA 2YZHA 4N30A 3KP9A 1X9SB 2R2JA 2IWTA 3QCPA 3LSZA 2I9HA 4JE1A 2LUSA 1AAZA 4F03A 2HYXA 3TKPA 1XW5A 4DSSA 1WP0A 3VI7A 1X0RA 19GSA 1XIYA 4GQCA 2M72A 3C1RA 2LKUA 4EDYA 1V9WA 1SENA 5CYYA 3EVIA 20GSA 3VPTA 1GSUA 5IMAA 1FAAA 3FK8A 1A2LA 3C71A 2DJ3A 3WGEA 1V2AA 2OKAA 1GNWA 3AY8A 1O81A 1KEBA 3QMXA 3UVTA 1G6WA 3IHQA 1VF4A 2PPTA 3RHCA 1XW6A 2G0FA 4KSMA 3UOMA 3LQ7A 5F8BA 1B48A 3GKKA 1TI1A 4MJEA 5IMDA 3J7Yb 1NM3A 4K0NA 4N0VA 1ACVA 1B8XA 1OVNA 4PGTA 1W89A 1YEPA 4MK3A 1YEXA 1Z6NA 4HS1A 5JWRB 2M46A 5D9XA 5EL8A 4TR0A 1GUHA 3F63A 3PGTA 5G5FA 1YKAA 4GWRA 4TR4A 2H70A 4GXZA 4MMMA 3DGQA 4CDOA 4EXJA 3ERWA 4HI7A 3M0FA 4RUVA 4EKZA 3D0ZA 1XFLA 1Q98A 1SYXA 4USSA 3IC4A 5A5KA 4FO5A 2B5YA 1E6BA 4HZ2A 4CW9A 5L71A 2H1AA 1TTZA 5CAXA 1MD4A 4OO5A 5AIVA 2LS5A 3HVVA 1SJZA 4G10A 1O8WA 3QR6A 1TU8A 2JSYA 1HNCA 1ZZYA 3UBLA 2VUPA 2HXKA 4PTSA 5B6MA 1TRSA 4TVEA 2NVLA 1M7TA 4LL4B 4YQMA 1NSWA 1URMA 2GLRA 4JRRA 2LQOA 1KBNA 2VM1A 3P7XA 3ZVJA 2A2RA 4GTUA 3F4SA 3GKXA 5DAKB 3KMNA 1Z3EA 2LJRA 1M9AA 1XWGA 1PA3A 2L5OA 4IJ3A 1SK0A 2H73A 1XW9A 2HSMA 1YZXA 3M3MA 3A3TA 1ERVA 5IO0A 6GSSA 3ZIJA 2O87A 1MTCA 3G7IA 1YF1A 4N10A 2VLUA 2F3MA 1TOFA 4BVYB 1OC9B 2RM6A 3APQA 3TOTA 2L4CA 4OFTA 5DQYA 2CAIA 4BL7A 3TJJA 1B9XC 2FWGA 5D9TA 4PUFC 1SKSB 2GZPA 3BJ5A 4POLA 3GURA 4IHUA 1T4YA 2O7KA 2VL3A 4D73A 2TRXA 1FVJA 4POBA 1PX7A 1QXHA 5DVBA 1VF3A 4KCEA 3W8JA 3C1SA 3ZMKA 1GULA 3MDKA 2F51A 3UARA 5D9WA 4POMA 1X9WB 2H75A 1C72A 2EC4A 5J3RA 5IMZA 14GSA 2E0QA 3MAKA 2FGXA 4BPYA 2VLVA 4P3YB 1U88A 1DE2A 2IMEA 3RPPA 3C73A 3O3TA 2YJHA 1HD2A 4PURA 3IPZA 5ID2A 2HRAA 2J23A 5J5NA 3ZMLA 2DIYA 2JADA 2GVPA 3S9FA 4O32A 1XVQA 4K1FA 2GQMA 3KCMA 5G31A 1QK8A 2C3NA 2K9FA 3IAS2 1AXDA 1J08A 3DWVA 5IM9A 4TR1B 3UEMA 5ECPB 3PH9A 1TK8B 3D22A 2HZEB 3E0UA 2WCIA 2A2SA 3CYNA 2ON5A 2FWFA 2B1LA 3A2WA 3HHVA 3F6DA 2IIYA 1MEKA 4WF4A 4K0GA 3FHKA 4MZBA 2X99A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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