3UBKA

Crystal structure of glutathione transferase (target efi-501770) from leptospira interrogans
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
214
structure length
209
Chain Sequence
VMIKLHGASISNYVNKVKLGILEKGLEYEQIRIAPSQEEDFLKISPMGKIPVLEMDGKFIFESGAILEFLDTIFPQTPKLIPEDPWEAARVREISTIIETYLDIPARRIYLSPEIVEEVHSTLVKGIKALQRVVRFSPYIAGNVFTLADCSGFAHLSVLDEELRPFYPNNHPLDLLNGWKEYFVFMKTKAGPALVEKDKQILKKILARA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Leptospira interrogans serovar lai
publication title Crystal Structure of Glutathione S-Transferase from Leptospira Interrogans
rcsb
molecule keywords Glutathione transferase
total genus 78
structure length 209
sequence length 214
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3ubkA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ubkA01
5G5EA 4ZB9A 5G31A 5DVBA 3ZFLA 3L9VA 4TW5A 2LNTA 4MZBA 5ELAA 1BJXA 4PURA 2GZZA 2WDUA 2QC7A 4CHSA 5G5FA 14GSA 3KH7A 1WMJA 2KOKA 2QGVA 2MZCA 6GSSA 3N9JA 1A0FA 4XRDA 3ZIJA 3HKRA 4XIHA 3RDWA 1NHYA 4G10A 2XBQA 2TRXA 1YQ1A 4IVFA 3CRTA 4USSA 4WBJA 2DLXA 1HYUA 2PERA 3HVVA 3KP8A 2WRTA 1K3LA 5A4UA 1FW1A 2HRNA 5HR3A 1UA5A 1XW6A 3FZ5A 5D9XA 2DIZA 5LD0A 3D5JA 2J9HA 2V1MA 2R2JA 3F4RA 3A2VA 2M80A 4BA7A 3M9KA 1A23A 2HNLA 1KEBA 2NBSA 4K7IA 2LS5A 3QAGA 1TI1A 3O3TA 4PQ1A 2LQOA 3FZ9A 5JWRB 1A0RP 3LWAA 1BYEA 1MDIA 3QMXA 3WGEA 4DSQA 2L4QA 1TP9A 3Q19A 3KTLA 5IMFA 2YZUA 1W4VA 2X8HA 4BVYB 3ZIVA 3VURA 3IHQA 2C3TA 3UBLA 4JE1A 2F9SA 3WGDA 3J7Yk 3HCZA 3CYNA 2G2QA 2PU9C 4BVYA 2GT5A 5GAPD 4Q5QA 2H66A 3KH9A 3EURA 2KP1A 2CVBA 2CVDA 5ECSA 5G1KA 3WT1A 1DBYA 5A4WA 2B3SA 1XIYA 4IQ1A 4WR5A 5F0GA 5H5QA 1ERWA 1TRSA 2RM5A 1JZWA 3PGTA 2LNSA 2H0HA 3GRXA 2FD3A 3QFAC 4FIWA 2O89A 1GSQA 1VF2A 2H1BA 2F3MA 2J23A 2C0GA 2CX3A 3APSA 1F3BA 2NTOA 1ERVA 3IXRA 4TRXA 2R4VA 2VOCA 2VCTA 5J5NA 4O92A 2PUKC 4ZBAA 3UBKA 3FHKA 2YWMA 1XVQA 1WWJA 3E3EA 1F37A 1YJ6A 2XC2A 5JCGA 3QFBC 4MH2A 1U3AA 1T4ZA 2UZ8A 3DRNA 2R3XA 2YNXA 3F8UA 2B6MA 5F8BA 5KN3A 1GRXA 4MJEA 3ZITA 3GKXA 4IS0A 2F8AA 1GWCA 5IPGA 1Z5YE 3PINA 2VLTA 3UL3A 5D9VA 4HI7A 3DVWA 3H93A 3C73A 3I69A 2B7JA 2O8VB 2HSNB 2H71A 5ID2B 2JL4A 2MMZA 5DJMA 1VF3A 4AJ6A 2K6VA 2KP2A 3P8WA 5ID2A 2JZRA 4N11A 2GSQA 4IQAA 1Z7PA 3J7Yb 3QAWA 2B1LA 3TKRA 4GQFA 2GQMA 4I2UA 1IYHA 3UAPA 4X1UA 3C71A 1JZDA 4P3YB 1K0CA 1QXHA 4TR1B 1DSBA 1X9MB 4F0BA 1S3DA 3GL5A 5ECRB 4I8BA 3WT2A 2VD0A 2CAIA 1GULA 4TR1A 3TKSE 1LU4A 2FA8A 3IR4A 4JBBA 4TOPA 5KEJA 1LBKA 2C3NA 3DD3A 1A24A 5DQYA 5DALB 3ZRDA 2PMTA 3GYKA 1K0OA 2C1YA 1FO5A 3HJMA 1G7OA 1V57A 3KMOA 4WXTA 3VFIA 4KF9A 2X99A 5IOXA 22GSA 2MBSA 9GSSA 1XWGA 5DALA 3A2WA 2P5RA 3TRQA 1H4OA 2YV7A 1GUHA 4O5RA 3RPNA 2DSAA 1O73A 3K8NA 1R26A 1YEXA 1SENA 4MPFA 3BOAA 4PNGA 4I6XA 1U6TA 3UMAA 4IJ3A 1OC3A 2LJKA 2L6DA 2CA8A 4CW9A 2A2SA 1F3AA 5CREA 2IPAA 1DE1A 2XHFA 2YWIA 3HDCA 3KIJA 3ZTLA 2H1DA 4HDEA 5EY6A 3P2AA 1SK0A 4ZL8A 3HJPA 4EDYA 2DMMA 1OC9B 3PPUA 4MDCA 5CYYA 3CSJA 3EVIA 2CV4A 3D4MA 4MZCA 1OC9A 1PX7A 3TJJA 4DSRA 3KTBA 2LRNA 4KDYA 2PGTA 4GWRA 1GSSA 5GSTA 1ERUA 5J9CA 3DYRA 3GX0A 1E2YA 2IMEA 1BAYA 2LTKA 2GSSA 3QPMA 3TKSC 1ZZYA 1TW9A 3GN3A 3IK7A 1HQOA 1BQ7A 1VF4A 2VM2A 1HNAA 5H5SA 4QQ7A 3HHVA 1S3AA 1XXUA 1GTUA 3EE2A 1SL2B 1R7HA 4HZ4A 4O32A 1TDIA 3CMIA 3VPQA 1FVJA 3DKSA 5ELGA 4RI7A 1XW5A 5B6MA 1K0AA 2AJQB 4QL9A 2I81A 2H01A 3DXBA 3ME7A 1K3OA 4NAXA 4Q5NA 4KX4A 2D2ZA 1E6BA 4IELA 4EL1A 4KDXA 1O8XA 2VL2A 2YANA 1F9MA 3DGQA 4PTSA 1HD2A 2H75A 5G30A 2CX4A 4KW6A 1Y25A 3UVTA 5J4UA 3G7IA 3ZFBA 5FHIA 3SBCA 4FYUA 4IP1A 4HEA2 3IRAA 1T1VA 1M99A 1WRYA 2HYXA 2RUEA 2N5BA 1AUCA 2JSZA 4ECIA 4YAPA 1TRUA 2R37A 3PH9A 1PSQA 2JZTA 4WF4A 1O8WA 1O7UA 2C0DA 1X0RA 1WOUA 3A5WA 1V98A 2GZPA 2VL2C 3CXGA 3ERGA 5ECLB 1XOBA 2FGXA 1X5EA 4K7NA 5AIVA 3TJGA 2K8SA 2LKUA 2FWGA 1X5DA 2H1AA 2HSHA 1ZOFA 2O85A 1R5AA 2HRAA 4J56E 2M72A 3IBHA 5JWQB 2PBJA 3LSZA 3FKFA 4XS6A 4IP6A 4I97A 1V9WA 1RW1A 1T7PB 4MJAA 5D9TA 5FT3A 4MJCA 2X8GA 2B5XA 1QFNA 1KTEA 4PXOA 5KN1A 1ZGNA 2RM6A 2LV3A 1VRSD 3S9FA 4G19A 5KN2A 3QAVA 2BJXA 2HRFA 3L9SA 1TU7A 4Q5FA 1MDJA 1YF1A 1K0BA 2ALBA 4POMA 3FEUA 2MBTA 3O76A 2REMA 2WGRA 3KCMA 1AIUA 5G1LA 1EGOA 2H72A 1QK8A 2X64A 1OE8A 2GDRA 4RQXA 2EIQA 5DDLA 2HXKA 1XZOA 3R2QA 4EO3A 1SU9A 3APOA 5L71A 2BMXA 5ECPB 3G7YA 2QSIA 2XPEA 4NPBA 5LCZA 4I2TA 2FA4A 1EOHA 3GKNA 3ERWA 4AJ7A 5HQPA 3TGZA 3EMPA 3GSTA 2VCWA 1K0DA 4D73B 2PWJA 2K9FA 2JZSA 4LLRA 3IA1A 1WIKA 3C8EA 1NM3A 5B6NA 4K0GA 4RQRA 3G7JA 1EWXA 1SK1A 4D73A 4ZL7A 1Z6MA 4IW9A 5ECHB 3QCPA 4GTUA 4MLYA 4OO4A 2N5AA 2DBCA 5CRHA 2V6KA 4ECJA 3IE3A 1XFLA 4HZ2A 2PPTA 3L0HA 3TJKA 4HQSA 17GSA 5DAKB 2DJ0A 1TK0B 3M3MA 1EGRA 5GZZB 4KNDA 4GF0A 2ZUPA 5DAKA 2C4JA 2CVKA 5AISA 1UC7A 2FNOA 2I4AA 3C7MA 1HNBA 3LG6A 4BWSA 1EEMA 4ECBA 3VPTA 3L9UA 3FY7A 18GSA 4TXOB 3FR6A 4GSNA 2OACA 5J3RA 2DJ1A 3HJOA 4MA9A 3RHCA 3P7XA 4EVMA 4TXOA 4KSOA 3VLNA 3KM6A 3GTUB 4FYCA 5IMZA 3GX8A 1FHEA 3HXSA 1ZYEA 1MD4A 2MMOA 3VWXA 3GTUA 4EUYA 1THOA 5G2ZA 2WFCA 1SL0B 2LJRA 4NV5A 1EEJA 8GSSA 2A4VA 2C0FA 1O6JA 3VI7A 4KGIA 2C8UA 4H86A 2HT9A 1GTIA 3CSHA 1W89A 5DCGA 4GRFA 3QOUA 1XWKA 1SKRB 2DMLA 1JZOA 4KAEA 4N30A 3TOTA 4ML1A 3DMLA 2I9HA 1WE0A 4EKZA 1GTAA 2ES7A 4EXJA 2H30A 4ZBBA 1FVKA 1GSYA 3KEBA 2VLUA 1X9WB 4Z7XA 2DIYA 3TKPA 2OE1A 5B8AA 3VWUA 2AAWA 3EINA 1JHBA 4ILFA 2WS2A 4G0KA 4PUAA 1A2MA 3ISOA 2FCHA 3CTGA 5AN1A 3A2XA 2IMDA 1PD21 1AQVA 4LL1B 1XWAA 2LQQA 1MTCA 3D0ZA 3LYKA 2HZEB 2Z9SA 2WJUA 3GA4A 3QDNA 6GSXA 2B7KA 2FWHA 4BL7B 4G0LA 3MNGA 2YOIA 3LFLA 3M8NA 1YF0A 1EV4A 2XBIA 2HZEA 5EPFA 4NHZA 4JRRA 4YQUA 2YWNA 1JFUA 5CP1A 4BL7A 3KP9A 1BX9A 2YPMA 3US3A 4L8EA 2B1KA 2GZYA 4JR4A 3W6GA 2JACA 3PR8A 3UOMA 1FG4A 1G7EA 5D96A 4RUVA 4KSMA 1QMVA 2LRCA 1EZKA 2IMFA 1PA3A 1V2AA 4MF5A 1TK8B 5HFGA 2GS3A 1DE2A 1ML6A 3IV4A 5E59A 3I43A 2WZ9A 3D21A 3SWLA 2YJHA 1U87A 1PKZA 2EIRA 2LUSA 2H74A 1GH2A 5HR0A 4OFNA 5GAND 3U6VA 1QGVA 5CRDA 4IBPA 4NV2A 2LRTA 4TR4A 4V2LA 5GSSA 3JCML 2GGTA 1Z9HA 5DBQA 2CT6A 1O81A 3IC4A 1N2AA 4ZBDA 1QUWA 3FYGA 4XS1A 2H1GA 1F6MC 1K0NA 3BJ5A 3GH9A 1PKWA 1PQNA 4HQZA 1GSDA 3WD6A 1SYXA 3GL3A 3F4TA 1GSFA 1NHOA 1Q4JA 1XVWA 4F03A 5IMVA 3ZZXA 3L4NA 4PQHA 1JLVA 4WR4A 1TRWA 16GSA 3RPPA 2HZFA 3W8JA 3TRXA 3CSIA 3RAZA 1UN2A 3A3TA 1OAZA 1A8LA 4XHMA 5CRGA 4L5LA 5A5KA 2CZ2A 3GH6A 3HVXA 1ZCPA 4X43A 1PL2A 5HFKA 2FLSA 4MK3A 3LORA 5HR2A 4G2EA 1ABAA 1XWBA 1T8EB 1RQMA 4IHUA 2CQ9A 3LJRA 2ZNMA 2OBIA 4WEYA 3N5OA 1XCCA 3IAS2 1J08A 3ME8A 1XWCA 3I9V2 3GHAA 4TN8A 2V2GA 4YH2A 4GSSA 3G9BA 3TCOA 2L5OA 4K2DA 4NHWA 3TDGA 2VL3A 2IFQB 4F0CA 3EYTA 5D8IA 12GSA 4QL7A 2WB9A 2ZCTA 5ECNB 1THXA 2IMIA 2O87A 1U3IA 2AHEA 1PGTA 3F3RA 5ECOB 2GLRA 2H73A 5ECKB 4LMVA 3IDVA 1M2AA 1EP7A 2HSYA 4DEJA 2L57A 2HLSA 2WCIA 3UVHA 2VD1A 3F3QA 2OADA 2LJAA 3IC8A 2L59A 3TJFA 1A2LA 4HS1A 1S3CA 2HE3A 2RLIA 3FW2A 3MAKA 5A4VA 4EF0A 1EOGA 2R6KA 1AW9A 1B4PA 1AQWA 4ACSA 4ZILA 7GSSA 4NMUA 4KDUA 2FY6A 4IN0A 4N0ZA 3BBYA 1ZYQB 1JLWA 4NWYA 2GSTA 4ID0A 2HFDA 2TRCP 1TU8A 5EVOA 2GSRA 5E4WA 3HZ4A 4OWYA 1CQGA 2E7PA 3WGXA 1GNWA 3QD9A 2K8VA 6GSVA 4PGTA 5BMUA 2DJJA 3GSSA 3NIVA 2H76A 4DSSB 1OVNA 5HFIA 2C0EA 3C1RA 4TR3A 2DC5A 3LXTA 4MABA 3TKQA 4DSSA 3EU3A 5IPHA 2FHEA 4POKA 3F63A 4MPGA 3NOFA 4JEDA 1WPIA 4KB3A 3C1SA 3KXOA 3ZMKA 3KMNA 5F06A 2L6CA 4MH3A 2FWEA 1JZRA 4AJ8A 2MYGA 3VI5A 1M2DA 3ZMLA 1Z7RA 4CDOA 4XS4B 2HRKB 4OFMA 3WYWA 2BTOT 2N5FA 1M2BA 1TXXA 4XS4A 4TKYA 2HRKA 2L5LA 3H8QA 2VM1A 1NSWA 2IJYA 3TOUA 2OA7A 5IM9A 4MCUA 4IGJA 1A8YA 5KN0A 4L5OA 5HR1A 1SKSB 1K0MA 2H6YA 4HU7A 4PQIA 2GQLA 2H70A 11GSA 4HUAA 1LJRA 2CZ3A 1B48A 1FB6A 1FOVA 4RI6A 4OCFA 4TR0A 1KBNA 2VIMA 1SJZA 1M9AA 1M9BA 2GQKA 1K3YA 6GSYA 2L4CA 3GUSA 1B9XC 4K9ZA 2HI7A 3KZQA 1B9YC 4MMMA 1IYIA 1SJ6A 3TUEA 1ON4A 2IL3A 1Z3EA 4V1Ag 1ILOA 3VK9A 3F9UA 2ON7A 2VCXA 4OCEA 1A2JA 5INYA 3IPZA 4FYBA 5IO2A 3DWVA 2E2GA 3GNJA 1AXDA 4DVCA 1GUKA 3DEXA 1Q98A 2OE3A 1TTZA 4GQCA 4AGSA 4AF2A 3LYPA 1Y6EA 10GSA 1V58A 1MD3A 3GMFA 2VUPA 1M0UA 2GT6A 3HZ8A 3FR3A 3FZAA 3ERFA 4ZB6A 1OKDA 19GSA 3CRUA 1Z6NA 2XPDA 4ZXGA 2YN1A 3BD2A 4POBA 1M7TA 4TVEA 3GIXA 1XPVA 4JR6A 1OKTA 4KCEA 5H5RA 2JADA 1I5GA 1SD9A 3KD0A 1EV9A 1AC1A 3M1GA 4WETA 3HA9A 4BWQA 3APQA 2H6ZA 2KLXA 3FZ4A 4ULXA 2LEGA 4I5QA 1UVZA 3ZREA 1X5CA 2I3YA 3RHBA 1WJKA 2F51A 1G6WA 3QR6A 1SD8A 1GSEA 2YWOA 3BCIA 2IMKA 4J57E 4OMVA 4KH7A 1OC8A 1NW2A 20GSA 3UARA 4LA1A 1TKDB 3CBUA 2B5YA 3HY2A 1TOFA 4K6XA 5C00A 3MWHA 1URMA 1RK4A 4ZL9A 2VCZA 3GURA 2OJLA 13GSA 2E2MA 2YZHA 1U88A 2KUCA 3ZYWA 5CRWA 3ZVJA 3HVSA 2X8CA 3M9JA 1F2EA 4ZIJA 1T3BA 2DJ3A 1TK5B 4EDZA 1HNCA 1J0FA 3F6FA 4GSTA 4K8MA 2OKAA 4E8EA 3DVXA 5ENUA 2H6XA 3U5RE 4XTSA 6GSUA 4MF7A 3F0IA 4FQUA 4K1FA 4XCSA 5FWGA 3KJYA 1VGLA 2PVQA 2LSTA 4KCAA 2H8LA 1C72A 3AY8A 5B8BA 2AB6A 4JU5A 1DUGA 4IKHA 2R5GA 2NDOA 5D9WA 4POLA 4NXIA 5COHA 4PUFC 1GTBA 2DJKA 4N0VA 5CO3A 5JCWA 2F8FA 1SK2A 2I1UA 4OFTA 1BEDA 3V1WA 4J2FA 5IMAA 2YCDA 5IO0A 4Q5RA 1YKCA 1B4QA 3H4KA 2EIOA 3VWWA 4MF6A 1GP1A 3FR9A 1GNEA 2HSMB 2RIIA 3EMXA 4OD7A 3NZNA 4HJ2A 5B7CA 2HSMA 3HYPA 1B8XA 5JCUA 3LGCA 3D22A 3E0UA 2P5QA 3EWLA 1GLPA 2NPBA 4KA0A 2GTUA 2NVLA 4HU9A 5ECIB 1T4YA 1BG5A 4LMWA 4ECCA 5LNKe 4GLTA 5IMCA 2V41A 1MEKA 4YQVA 1YKAA 1OE7A 3RBTA 1FB0A 5ECQB 2H0IA 4X0XA 4HJMA 5AGYA 6GSTA 1WP0A 4WF5A 4TXVA 3CTFA 4V2MA 4KE3A 4E8HA 3MDKA 1KNGA 1ZMAA 2E0QA 1V40A 2EC4A 2H0GA 3HD5A 5J9BA 4G9HA 4PX1A 3ZVJD 2C3QA 2YP6A 1YZXA 3TKSA 4ML6A 4YQMA 5AIXA 5F07A 1XW9A 3L78A 1ACVA 5IIZA 1H75A 5IQYA 3O6TA 4EE0A 5C04A 3VWVA 4FH8A 3IAM2 3D6IA 3LQ7A 1QQ2A 4KUNA 3FK8A 3GV1A 2G0FA 2C80A 1PN9A 3I6AA 1PX6A 5DJLA 4MJBA 4F9ZA 2IN3A 4EC0A 1SKWB 2A2RA 4F2IA 2JSYA 3TRPA 5CAXA 2JU5A 2IFQA 3Q18A 5F05A 1FAAA 2V32A 2P0GA 1SJIA 2V6OA 1VF1A 4YAVA 2HQTA 4K0NA 1XBSA 1PL1A 5D73A 4L0UA 2AUVA 3D4TA 2TIRA 5D93A 2ON5A 1GUMA 1SYRA 4BVXB 2VCQA 4LL4B 1O85A 2IIYA 1YEPA 1PMTA 1TRVA 2WULA 1GLQA 4BVXA 4GCIA 3F4SA 4BPYA 1I9DA 2MMAA 1XOAA 3TB2A 5ABRA 3EU4A 3LXZA 4G0IA 1PRXA 1TI3A 1OYJA 3Q74A 1GL8A 3DIEA 5J41A 2VLVA 3GKKA 2AV4A 1ST9A 1AQXA 2QKEA 3FRCA 5JWOB 2B5EA 5IMDA 4ZB8A 3IOSA 2FWFA 1J9BA 3LEFA 2VAFA 1USBA 2AYTA 3M0FA 2VL9A 3H79A 2MMNA 5CNWA 3H1NA 2VCVA 4O7HA 3E9JB 1G6YA 1MDKA 4PNFA 2VO4A 4V1Ap 4IJIA 1T00A 3P90A 3ZLPA 1G0TA 1N8JA 2CAQA 3KGKA 2K18A 3OR5A 2IWTA 5DCHA 4L0WA 4WKWA 2PN8A 2PVOC 4F82A 4V2NA 3F6DA 5EL8A 1SL1B 3GFKA 3ZL5A 3IK9A 2FUG2 2KHPA 2M46A 1YY7A 4FO5A 2GVPA 6GSWA 4WBRD 4HOJA 4OO5A 4ISDA 1ZL9A 2DJ2A 5ECMB 1CQHA 2OBKA 2YV9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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